单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 821 - 840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 821 | 2024-08-08 |
ZERO-INFLATED QUANTILE RANK-SCORE BASED TEST (ZIQRANK) WITH APPLICATION TO SCRNA-SEQ DIFFERENTIAL GENE EXPRESSION ANALYSIS
2021-Dec, The annals of applied statistics
DOI:10.1214/21-aoas1442
PMID:35116085
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研究论文 | 本文提出了一种基于零膨胀分位数秩得分检验（ZIQRank）的方法，用于单细胞RNA测序数据中的差异基因表达分析 | ZIQRank方法同时处理了单细胞RNA测序数据的多模态和零膨胀特性，通过两部分分位数回归模型进行零计数的逻辑建模和多个预设分位数的秩得分检验，提高了检测差异表达基因的准确性 | NA | 开发一种新的统计方法，用于提高单细胞RNA测序数据中差异基因表达分析的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的差异基因表达 | 生物信息学 | 脑瘤 | scRNA-seq | 两部分分位数回归模型 | 基因表达数据 | 涉及人类胶质母细胞瘤肿瘤和鼠肠道类器官细胞的数据 |
| 822 | 2024-08-08 |
Mitochondrial inhibitors circumvent adaptive resistance to venetoclax and cytarabine combination therapy in acute myeloid leukemia
2021-11, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-021-00264-y
PMID:35122057
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研究论文 | 本文定义了一个'MitoScore'特征，识别AML患者体内高线粒体氧化磷酸化，并研究了线粒体抑制剂如何克服AML对venetoclax和cytarabine联合治疗的适应性抗药性 | 发现了AML细胞对venetoclax和cytarabine联合治疗的适应性抗药性与线粒体氧化磷酸化、电子传递链复合体及TP53通路的变化有关，并提出了使用线粒体抑制剂来延迟复发的新策略 | NA | 研究如何克服AML对venetoclax和cytarabine联合治疗的适应性抗药性 | 急性髓系白血病（AML）细胞及其对特定治疗的抗药性 | NA | 急性髓系白血病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 823 | 2024-08-08 |
Gradient of Developmental and Injury Response transcriptional states defines functional vulnerabilities underpinning glioblastoma heterogeneity
2021-02, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-020-00154-9
PMID:35122077
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了来自26名患者的69,000多个胶质母细胞瘤干细胞（GSCs），揭示了GSCs在转录水平上的高度异质性，并发现这种异质性可能与正常神经发育和炎症伤口反应的转录状态有关。 | 首次通过单细胞RNA测序和CRISPR-Cas9基因敲除筛选，揭示了胶质母细胞瘤干细胞的转录异质性与其功能脆弱性之间的关系。 | 研究主要集中在细胞培养和基因敲除筛选上，可能未能完全反映肿瘤在体内的复杂环境。 | 探究胶质母细胞瘤干细胞的转录异质性及其对肿瘤功能的影响。 | 胶质母细胞瘤干细胞（GSCs）及其转录状态。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序，CRISPR-Cas9 | NA | 转录组数据 | 69,000多个GSCs来自26名患者 |
| 824 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of Chronic Antibody-Mediated Rejection After Renal Transplantation
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.767618
PMID:35111153
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了慢性抗体介导的排斥反应（cABMR）患者外周血单核细胞的转录组图谱 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细揭示了cABMR中T细胞和B细胞的基因表达变化及其与炎症反应的关系 | 研究仅限于外周血单核细胞的分析，未涉及肾脏组织中的细胞 | 探讨慢性抗体介导的排斥反应后肾移植患者免疫细胞的转录组变化及其机制 | 慢性抗体介导的排斥反应患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | cABMR患者和对照组的外周血单核细胞样本 |
| 825 | 2024-08-08 |
High Throughput scRNA-Seq Provides Insights Into Leydig Cell Senescence Induced by Experimental Autoimmune Orchitis: A Prominent Role of Interstitial Fibrosis and Complement Activation
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.771373
PMID:35111154
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研究论文 | 本文通过高通量单细胞RNA测序研究了实验性自身免疫性睾丸炎（EAO）诱导的莱迪细胞衰老，并探讨了间质纤维化和补体激活在其中的作用 | 首次揭示了EAO环境下莱迪细胞衰老的机制，特别是补体激活和间质纤维化在其中的重要作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨慢性炎症环境下莱迪细胞的衰老机制 | 莱迪细胞在实验性自身免疫性睾丸炎中的衰老过程 | 数字病理学 | NA | scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 826 | 2024-08-08 |
The ALDH Family Contributes to Immunocyte Infiltration, Proliferation and Epithelial-Mesenchymal Transformation in Glioma
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.756606
PMID:35116021
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研究论文 | 本研究探讨了醛脱氢酶家族在胶质瘤中的作用，通过大量RNA测序和单细胞RNA测序分析，发现该家族与肿瘤细胞增殖、迁移及免疫环境调控有关。 | 首次深入研究了醛脱氢酶家族在胶质瘤中的具体作用，特别是在肿瘤细胞增殖、迁移和免疫环境调控方面。 | 研究主要基于数据分析，缺乏体内外实验验证。 | 探讨醛脱氢酶家族在胶质瘤中的作用及其对患者预后的影响。 | 醛脱氢酶家族在胶质瘤中的作用及其对肿瘤细胞增殖、迁移的影响。 | 数字病理学 | 脑瘤 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 训练集包含癌症基因组图谱数据，验证集包括中国胶质瘤基因组图谱和基因表达综合数据库的数据。 |
| 827 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Reveals Neutrophil Heterogeneity and Functional Multiplicity in the Early Stage of Severe Burn Patients
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.792122
PMID:35116026
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康捐赠者和早期烧伤患者循环中性粒细胞（PMNs）的转录组图谱，揭示了PMNs的异质性和功能多样性 | 首次详细分析了早期严重烧伤阶段PMNs的异质性和功能多样性，并发现了先前未描述的转录因子 | NA | 旨在阐明早期严重烧伤阶段PMNs异质性对病理生理学及相关机制的影响 | 健康捐赠者和早期烧伤患者的循环中性粒细胞 | 数字病理学 | 烧伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 健康捐赠者和早期烧伤患者的循环中性粒细胞被分为五个亚群 |
| 828 | 2024-08-08 |
Single Cell RNA Sequencing in Autoimmune Inflammatory Rheumatic Diseases: Current Applications, Challenges and a Step Toward Precision Medicine
2021, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2021.822804
PMID:35118101
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在自身免疫性炎症性风湿病研究中的当前应用、挑战及其在精准医学发展中的潜在作用 | scRNA-seq技术能够分析单个细胞的整个转录组，揭示复杂的细胞网络，为开发更精准和个性化的治疗方法提供指标 | 自身免疫性炎症性风湿病的复杂性和患者的高度异质性使得完全理解其病理机制变得困难，且现有的治疗选择有限，长期效果不佳甚至有毒性 | 深入研究风湿病和药物抵抗的细胞和分子机制，识别新的治疗靶点，并推动基于分层和知情治疗决策的使用 | 自身免疫性炎症性风湿病 | 数字病理学 | 风湿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 829 | 2024-08-08 |
A Systematic Review on PD-1 Blockade and PD-1 Gene-Editing of CAR-T Cells for Glioma Therapy: From Deciphering to Personalized Medicine
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.788211
PMID:35126356
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综述 | 本文综述了PD-1阻断和PD-1基因编辑的CAR-T细胞在胶质瘤治疗中的应用，旨在探讨这两种方法的优缺点，并提出改善胶质瘤患者预后的新策略。 | 提出了基于单细胞测序的第四代CAR-T细胞，能够覆盖患者来源的新抗原，并抑制相关的抑制性免疫检查点分子，从而改善抗肿瘤免疫反应。 | NA | 探讨PD-1阻断和PD-1基因编辑的CAR-T细胞在胶质瘤治疗中的应用，提出改善胶质瘤患者预后的新策略。 | 胶质瘤治疗中的PD-1阻断和PD-1基因编辑的CAR-T细胞。 | 免疫疗法 | 胶质瘤 | 单细胞测序 | CAR-T细胞 | 基因编辑 | 动物模型 |
| 830 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing in Lung Cancer: Revealing Phenotype Shaping of Stromal Cells in the Microenvironment
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.802080
PMID:35126365
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在肺癌肿瘤微环境中基质细胞研究中的最新进展 | 单细胞RNA测序技术提供了前所未有的基因表达谱分辨率，使得能够在单细胞水平上进行基因表达的定量分析 | NA | 深入理解肿瘤微环境中的基质成分，以促进肺癌的诊断和治疗 | 肺癌肿瘤微环境中的基质细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 831 | 2024-08-08 |
Comprehensive Analysis of Immune-Related Prognosis of TK1 in Hepatocellular Carcinoma
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.786873
PMID:35127491
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研究论文 | 本研究利用TCGA数据库分析了TK1在肝细胞癌中的表达及其对患者生存的影响，并探讨了TK1与免疫细胞浸润的关系及其在肝细胞癌中的预后价值 | 首次揭示了TK1表达与肝细胞癌中免疫细胞浸润的关联，并建立了基于TK1相关免疫基因的预后风险评分模型 | 研究主要基于TCGA数据库，可能存在样本量和临床数据的局限性 | 探讨TK1在肝细胞癌中的免疫相关预后价值及其与免疫细胞浸润的关系 | 肝细胞癌患者及HepG2细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序分析 | COX回归分析 | mRNA和蛋白质 | TCGA数据库中的肝细胞癌患者样本 |
| 832 | 2024-08-08 |
Properties and Roles of γδT Cells in Plasmodium yoelii nigeriensis NSM Infected C57BL/6 Mice
2021, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2021.788546
PMID:35127555
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研究论文 | 本研究探讨了γδT细胞在感染Plasmodium yoelii nigeriensis NSM的C57BL/6小鼠中的性质和作用 | 通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析了γδT细胞的多样性，并揭示了其在感染后的动态变化和激活状态 | NA | 研究γδT细胞在抗疟疾感染中的作用及其对免疫反应的影响 | 感染Plasmodium yoelii nigeriensis NSM的C57BL/6小鼠的γδT细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 流式细胞术，单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 感染和未感染的C57BL/6小鼠的脾脏γδT细胞 |
| 833 | 2024-08-08 |
Regeneration of Jaw Joint Cartilage in Adult Zebrafish
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.777787
PMID:35127702
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研究论文 | 研究探讨成年斑马鱼下颌关节软骨的再生能力及其机制 | 首次展示了成年斑马鱼能够再生受损的下颌关节软骨，并揭示了参与再生的细胞类型和分子标记 | NA | 探索斑马鱼下颌关节软骨的再生能力及其潜在的细胞和分子机制 | 成年斑马鱼的下颌关节软骨 | NA | 关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 1年龄的斑马鱼 |
| 834 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals the Promoting Role of Ferroptosis Tendency During Lung Adenocarcinoma EMT Progression
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.822315
PMID:35127731
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探讨了肺腺癌中上皮-间质转化（EMT）与铁死亡倾向之间的调控关系 | 发现了EMT与铁死亡倾向之间的正相关关系，并构建了分子调控的有向网络 | NA | 探究肺腺癌中EMT与铁死亡倾向的关联及其对肿瘤转移和免疫治疗反应的影响 | 肺腺癌细胞中的上皮细胞 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GEO数据库中的GSE131907数据集 |
| 835 | 2024-08-08 |
NonLoss: a novel analytical method for differential biological module identification from single-cell transcriptome
2021-Dec, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-21-6401
PMID:35071482
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研究论文 | 本文介绍了一种名为NonLoss的新型计算分析方法和桌面应用程序，用于从单细胞转录组数据中识别差异生物模块 | NonLoss方法通过处理特定功能模块中所有基因的表达水平数据，进行降维和功能识别的可靠性分析，避免了单个基因的随机干扰 | NA | 开发一种更稳健的计算分析方法，以从单细胞转录组数据中提取真实的生物学差异 | 单细胞转录组数据中的差异生物模块 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 836 | 2024-08-08 |
Targeting TIGIT Inhibits Bladder Cancer Metastasis Through Suppressing IL-32
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.801493
PMID:35069212
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序探索肿瘤细胞组成，发现高表达TIGIT和IL-32的Treg细胞亚群，并探讨了靶向TIGIT通过抑制IL-32来抑制膀胱癌转移的机制 | 首次揭示了TIGIT作为膀胱癌免疫治疗新靶点的双重效应，并阐明了IL-32在膀胱癌转移中的促进作用 | NA | 开发新的免疫治疗靶点以改善膀胱癌的治疗效果 | 膀胱癌及其转移机制 | NA | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 837 | 2024-08-08 |
Granulocyte Macrophage-Colony Stimulating Factor Produces a Splenic Subset of Monocyte-Derived Dendritic Cells That Efficiently Polarize T Helper Type 2 Cells in Response to Blood-Borne Antigen
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.767037
PMID:35069539
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研究论文 | 研究探讨了粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子（GM-CSF）诱导的脾脏树突状细胞（GMiDCs）在血液抗原刺激下促进T辅助细胞2型（Th2）极化和过敏反应的能力 | 首次详细分析了GM-CSF注射后在脾脏中形成的特定树突状细胞亚群，并揭示了其在Th2细胞极化和过敏反应中的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人类中验证这些发现 | 探究GM-CSF对树突状细胞亚群的影响及其在免疫反应中的作用 | 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子（GM-CSF）诱导的树突状细胞（GMiDCs）及其在脾脏中的功能 | 免疫学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序分析，细胞转移实验 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 838 | 2024-08-08 |
Cardiovascular Risk After SARS-CoV-2 Infection Is Mediated by IL18/IL18R1/HIF-1 Signaling Pathway Axis
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.780804
PMID:35069552
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研究论文 | 本研究旨在阐明基于多组学数据的COVID-19相关心血管风险机制 | 发现HIF-1信号通路是动脉瘤、动脉粥样硬化和SARS-CoV-2感染的共同关键通路，并通过细胞间通讯分析揭示了巨噬细胞衍生的IL-18通过IL18R1激活HIF-1信号通路 | NA | 阐明COVID-19相关心血管风险的机制 | COVID-19感染后的心血管风险机制 | NA | 心血管疾病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、蛋白质组分析、表观遗传分析 | NA | 多组学数据 | NA |
| 839 | 2024-08-08 |
Immune Dysfunctions of CD56neg NK Cells Are Associated With HIV-1 Disease Progression
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.811091
PMID:35069597
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研究论文 | 本研究分析了CD56neg自然杀伤细胞在HIV-1感染中的表型和功能特征，并探讨了其与疾病进展的关系 | 首次系统分析了CD56neg自然杀伤细胞的表型和功能特征，并揭示了其与HIV-1疾病进展的关联 | 研究样本量有限，且未涵盖所有可能的HIV-1感染阶段 | 探讨CD56neg自然杀伤细胞在HIV-1感染中的作用及其与疾病进展的关系 | CD56neg自然杀伤细胞的表型和功能特征 | 免疫学 | HIV-1感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和流式细胞术 | NA | 细胞 | 84名捐赠者，包括34名未治疗的HIV-1感染患者、29名接受抗逆转录病毒治疗成功的HIV-1感染患者和21名健康对照 |
| 840 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Profiling of Human Skin Reveals Age-Related Loss of Dermal Sheath Cells and Their Contribution to a Juvenile Phenotype
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.797747
PMID:35069694
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了来自不同年龄捐赠者的人类皮肤活检样本中的72,048个细胞的转录组，揭示了随着年龄增长，真皮鞘细胞的丢失及其对年轻皮肤表型的贡献。 | 首次详细描述了人类真皮鞘细胞在单细胞水平上的身份、衰老过程中的丢失、干细胞特性及其对年轻皮肤表型的贡献。 | 研究主要集中在人类皮肤样本上，未涉及动物模型或其他细胞类型的比较。 | 探究人类皮肤中真皮鞘细胞的年龄相关变化及其对皮肤稳态的影响。 | 人类皮肤中的真皮鞘细胞及其在衰老过程中的变化。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 72,048个细胞，包括50,149个成纤维细胞 |