单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 801 - 820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 801 | 2024-08-08 |
Single Cell Technologies: Beyond Microfluidics
2021-07-29, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0001822021
PMID:35368355
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research paper | 本文探讨了不依赖微流控技术的单细胞RNA测序（scRNA-seq）新方法 | 介绍了不依赖微流控技术的新型scRNA-seq方法，这些方法成本低、高度可定制，适用于具备分子生物学知识的实验室 | 目前广泛采用的10× Genomics解决方案存在高成本、中等通量和固定试剂盒组件导致的不可定制性 | 研究不依赖微流控技术的单细胞RNA测序新方法 | 单细胞RNA测序技术 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | NA | NA |
| 802 | 2024-08-08 |
An Overview of Algorithms and Associated Applications for Single Cell RNA-Seq Data Imputation
2021-Dec-30, Current genomics
IF:1.8Q3
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综述 | 本文综述了单细胞RNA-Seq数据插补算法的现状及其相关应用 | 介绍了使用深度学习方法开发插补技术的必要性，以解决未来大规模和异质数据集的挑战 | NA | 为进行单细胞RNA-Seq数据分析的科学社区提供可用的插补算法/工作流程和相关软件的目录 | 单细胞RNA-Seq数据插补算法及其软件 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-Seq数据 | NA |
| 803 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis Reveals Macrophage Involved in the Progression of Human Intervertebral Disc Degeneration
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.833420
PMID:35295968
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了不同程度椎间盘退变患者髓核细胞的分子程序、谱系进展模式和细胞间通讯路径 | 发现了新的细胞亚型和细胞类型特异性基因签名，并揭示了免疫细胞与髓核细胞之间的显著细胞间相互作用 | NA | 理解人类椎间盘退变的分子机制，为治疗相关疾病制定策略 | 椎间盘退变患者的髓核细胞 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同程度椎间盘退变患者的髓核细胞 |
| 804 | 2024-08-08 |
Non-parametric Vignetting Correction for Sparse Spatial Transcriptomics Images
2021 Sep-Oct, Medical image computing and computer-assisted intervention : MICCAI ... International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention
DOI:10.1007/978-3-030-87237-3_45
PMID:35274110
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研究论文 | 本文介绍了一种新颖的非参数渐晕校正工具，用于空间转录组图像，通过高效的迭代切片直方图归一化程序估计光照场和背景 | 提出了一种非参数渐晕校正方法，该方法在光照和背景场估计方面优于现有技术，并且需要更少的输入图像进行充分估计 | NA | 开发一种新的渐晕校正工具，以提高空间转录组图像的分析质量 | 空间转录组图像中的渐晕效应 | 数字病理学 | NA | 迭代切片直方图归一化 | NA | 图像 | NA |
| 805 | 2024-08-08 |
Investigation of an FGFR-Signaling-Related Prognostic Model and Immune Landscape in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.801715
PMID:35237609
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研究论文 | 本文研究了头颈鳞状细胞癌（HNSCC）中与FGFR信号相关的预后模型和免疫景观 | 首次系统地研究了基于纤维化信号、缺氧和糖酵解的可靠预后标志物 | NA | 建立一个与纤维化-缺氧-糖酵解相关的预测模型，用于HNSCC的预后和相关免疫浸润 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC） | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 微阵列数据分析，ssGSEA算法，LASSO方法，免疫组化（IHC），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据，免疫细胞浸润数据 | 发现队列来自TCGA数据库，独立验证队列来自GEO数据库，单细胞RNA测序数据集用于澄清相关免疫浸润 |
| 806 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Unveils the Heterogeneity of Nonimmune Cells in Chronic Apical Periodontitis
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.820274
PMID:35237614
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research paper | 本研究通过单细胞测序技术揭示了慢性根尖周炎中非免疫细胞的异质性 | 首次构建了慢性根尖周炎的单细胞图谱，并揭示了非免疫细胞的多样性和异质性 | NA | 帮助理解根尖周组织的病理生理学 | 慢性根尖周炎中的非免疫细胞 | digital pathology | 口腔疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 26,737个高质量细胞 |
| 807 | 2024-08-08 |
IL-17 Receptor C Signaling Controls CD4+ TH17 Immune Responses and Tissue Injury in Immune-Mediated Kidney Diseases
2021-12, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2021030426
PMID:35167487
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研究论文 | 本文研究了IL-17受体C信号在CD4+ TH17免疫反应和免疫介导的肾脏疾病中的组织损伤控制作用 | 发现了IL-17受体C信号在调节CD4+ TH17细胞和控制器官特异性自身免疫中的新功能 | NA | 探讨IL-17受体C信号在CD4+ TH17细胞中的功能及其在肾脏疾病中的作用 | IL-17A、IFNγ和Foxp3三重报告小鼠的肾CD4+ T细胞亚群 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | IL-17A、IFNγ和Foxp3三重报告小鼠用于分选肾CD4+ T细胞亚群 |
| 808 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Human Pluripotent Stem Cell-Derived Macrophages for Quality Control of The Cell Therapy Product
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.658862
PMID:35173760
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术评估了人多能干细胞衍生的巨噬细胞（iMACs）的生物学均一性，以用于细胞治疗产品的质量控制 | 首次使用单细胞RNA测序技术评估人多能干细胞衍生的巨噬细胞的生物学均一性，为细胞治疗产品的质量控制提供了新的方法 | 研究仅限于评估iMACs的转录组均一性，未涉及其他可能影响细胞治疗产品质量的因素 | 评估人多能干细胞衍生的巨噬细胞的生物学均一性，以确保细胞治疗产品的质量 | 人多能干细胞衍生的巨噬细胞（iMACs） | 细胞治疗 | 炎症性疾病和癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6,230个iMACs |
| 809 | 2024-08-08 |
Applications of Single-Cell RNA Sequencing in Cardiovascular Research
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.810232
PMID:35174168
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在心血管研究中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序技术如何帮助识别心血管疾病治疗的新靶点 | NA | 总结单细胞RNA测序技术在心血管系统胚胎发育和疾病发病机制及治疗中的最新发现 | 心血管系统的胚胎发育、心血管疾病的发病机制及治疗 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 810 | 2024-08-08 |
Complex Involvement of the Extracellular Matrix, Immune Effect, and Lipid Metabolism in the Development of Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2021, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2021.800747
PMID:35174208
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研究论文 | 本研究通过mRNA测序和其他技术分析了特发性肺纤维化（IPF）患者肺组织中的基因表达，揭示了细胞外基质（ECM）重塑、脂质代谢和免疫效应在IPF早期发展中的复杂作用 | 首次全面揭示了IPF中涉及的380个差异表达转录本（DETs），并验证了其中21个基因的表达，通过单细胞RNA测序追踪了这些基因的细胞来源 | 研究样本量较小，且仅包括早期和移植阶段的IPF患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨特发性肺纤维化（IPF）的病理机制，特别是细胞外基质重塑、脂质代谢和免疫效应的作用 | 特发性肺纤维化（IPF）患者的肺组织 | 数字病理学 | 肺纤维化 | mRNA测序, 实时定量PCR (RT-qPCR), 免疫组化, 蛋白质印迹, 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | 7例早期IPF患者, 2例移植阶段IPF患者, 6例健康对照 |
| 811 | 2024-08-08 |
Loss of Foxd4 Impacts Neurulation and Cranial Neural Crest Specification During Early Head Development
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.777652
PMID:35178396
|
研究论文 | 本研究探讨了Foxd4基因在早期头部发育中的作用，特别是在神经管闭合和颅神经嵴分化中的作用 | 通过CRISPR-Cas9基因编辑技术在胚胎干细胞中生成Foxd4的双等位基因移码突变，揭示了Foxd4在早期神经上皮发育中的关键作用 | NA | 研究Foxd4基因在早期头部发育中的功能和机制 | Foxd4基因在胚胎干细胞中的功能及其对头部发育的影响 | NA | NA | CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 单细胞RNA测序数据 | E7.75和E8.25的小鼠胚胎 |
| 812 | 2024-08-08 |
Single-Cell Differential Network Analysis with Sparse Bayesian Factor Models
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.810816
PMID:35186014
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研究论文 | 本文提出了一种稀疏分层贝叶斯因子模型，用于在不同生物条件下从单细胞RNA测序数据中识别网络结构的差异 | 利用潜在因子影响每个细胞的基因表达值，以解释单细胞RNA测序数据特有的零膨胀、细胞间变异增加和过度分散问题 | NA | 探索在不同生物条件下基因相互作用的变化 | 单细胞RNA测序数据中的基因-基因相互作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 稀疏分层贝叶斯因子模型 | 基因表达数据 | NA |
| 813 | 2024-08-08 |
CD44-Mediated Poor Prognosis in Glioma Is Associated With M2-Polarization of Tumor-Associated Macrophages and Immunosuppression
2021, Frontiers in surgery
IF:1.6Q2
DOI:10.3389/fsurg.2021.775194
PMID:35187044
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研究论文 | 本研究探讨了CD44在胶质瘤中的作用，通过大规模转录组、空间和单细胞转录组水平分析，发现CD44与胶质瘤的恶性程度和预后负相关，并与肿瘤相关巨噬细胞的M2极化和免疫抑制有关。 | 本研究首次揭示了CD44作为新的M2型肿瘤相关巨噬细胞标志物，在胶质瘤微环境中促进肿瘤进展和免疫抑制的作用。 | NA | 阐明CD44在胶质瘤中的作用及其与预后的关系。 | 胶质瘤及其相关基因CD44。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 研究包括来自TCGA、CGGA、Ivy Glioblastoma Atlas Project和GSE103224的多种胶质瘤样本。 |
| 814 | 2024-08-08 |
Lipid-related protein NECTIN2 is an important marker in the progression of carotid atherosclerosis: An intersection of clinical and basic studies
2021-Dec-01, Journal of translational internal medicine
IF:4.7Q1
DOI:10.2478/jtim-2021-0044
PMID:35136728
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研究论文 | 本研究探讨了脂质相关蛋白NECTIN2在颈动脉粥样硬化进展中的作用 | NECTIN2被识别为影响颈动脉粥样硬化的关键因素，并可能成为新的临床预防治疗靶点 | NA | 探索NECTIN2在颈动脉粥样硬化中的潜在作用 | 颈动脉粥样硬化患者和APOE-/-大鼠 | NA | 心血管疾病 | NA | NA | 单细胞转录组和微阵列数据 | 108名患者和APOE-/-大鼠 |
| 815 | 2024-08-08 |
Discoveries in Pancreatic Physiology and Disease Biology Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.732776
PMID:35141228
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在胰腺生理和疾病生物学中的应用及其对糖尿病和胰腺癌治疗策略优化的潜在影响 | 单细胞RNA测序技术揭示了正常和疾病状态下胰腺中先前未知的细胞亚型，并研究了罕见胰岛细胞的功能角色以及糖尿病和癌症中各种细胞类型的作用 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在胰腺生理和病理学中的应用，以优化糖尿病和胰腺癌的治疗策略 | 胰腺生理功能、胰腺肿瘤基因表达、糖尿病和胰腺癌中的细胞类型 | 数字病理学 | 糖尿病、胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 816 | 2024-08-08 |
Immune Infiltration of CD8+ T Cells in Patients With Diabetic Pancreatic Cancer Reduces the Malignancy of Cancer Tissues: An In Silico Study
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.826667
PMID:35145483
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研究论文 | 本文通过计算研究探讨了糖尿病胰腺癌患者中CD8+ T细胞的免疫浸润如何降低癌细胞的恶性程度 | 首次揭示了糖尿病胰腺癌患者中炎症相关信号通路的激活增加CD8+ T细胞的免疫浸润，并减少恶性肿瘤组织的发展 | 研究基于数据库中的现有数据，未进行实验验证 | 探讨糖尿病胰腺癌患者中免疫浸润与肿瘤恶性程度的关系 | 糖尿病胰腺癌患者与非糖尿病胰腺癌患者的免疫浸润及肿瘤恶性程度 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞表达谱测序 | NA | mRNA表达数据 | 141例糖尿病胰腺癌患者和51例非糖尿病胰腺癌患者的mRNA表达数据 |
| 817 | 2024-08-08 |
Single Cell Transcriptomic and Chromatin Profiles Suggest Layer Vb Is the Only Layer With Shared Excitatory Cell Types in the Medial and Lateral Entorhinal Cortex
2021, Frontiers in neural circuits
IF:3.4Q2
DOI:10.3389/fncir.2021.806154
PMID:35153682
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研究论文 | 本文通过单细胞分析技术研究了内侧和外侧内嗅皮质的染色质可及性和转录组特征，发现Vb层是唯一具有共享兴奋性细胞类型的层 | 首次在两个相似但不同的皮质区域应用单细胞染色质可及性分析，并结合scRNA-seq数据集进行整合分析 | 研究仅限于内侧和外侧内嗅皮质，未涉及所有脑区域 | 阐明内嗅皮质电路中的细胞类型及其功能基础 | 内侧和外侧内嗅皮质的神经细胞类型 | 神经科学 | NA | 单细胞分析 | NA | 转录组和染色质可及性数据 | 4,136个细胞 |
| 818 | 2024-08-08 |
CA9-Related Acidic Microenvironment Mediates CD8+ T Cell Related Immunosuppression in Pancreatic Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.832315
PMID:35155218
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研究论文 | 本研究整合了胰腺癌TCGA、GEO和单细胞RNA测序数据集，通过生物信息学方法、体外和体内实验探索胰腺癌免疫微环境的潜在预后标志物和潜在机制。 | 研究揭示了胰腺癌细胞通过CA9抑制CD8+ T细胞浸润的机制，为胰腺癌的免疫逃逸途径和免疫靶向治疗提供了新的视角。 | NA | 探索胰腺癌免疫微环境的潜在预后标志物和潜在机制。 | 胰腺癌的免疫微环境及其对CD8+ T细胞的影响。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了TCGA、GEO和单细胞测序数据集，具体样本数量未详细说明。 |
| 819 | 2024-08-08 |
Interpreting Functional Impact of Genetic Variations by Network QTL for Genotype-Phenotype Association Study
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.720321
PMID:35155440
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研究论文 | 本文提出了一种新的网络QTL框架，用于解析遗传变异对表型的功能影响，通过识别基因型与表型之间的网络关联，而非传统的表达QTL方法。 | 本文创新性地提出了网络QTL（nQTL）框架，通过识别基因型与表型之间的网络关联，能够更全面地解析遗传变异对表型的影响，特别是在复杂生物过程中。 | 本文未明确提及具体的研究局限性。 | 研究旨在通过网络QTL框架，解析遗传变异对表型的功能影响，特别是在疾病亚型、疾病预后、药物反应和病原因子关联中的应用。 | 研究对象包括遗传变异、基因网络、表型及其在生物医学数据中的应用。 | 基因组学 | NA | 网络QTL分析 | 网络QTL框架 | 基因表达数据 | 研究中使用了多种生物医学数据集，但具体样本数量未明确提及。 |
| 820 | 2024-08-08 |
Prudent application of single-cell RNA sequencing in understanding cellular features and functional phenotypes in cancer studies
2021-Dec-31, Chinese journal of cancer research = Chung-kuo yen cheng yen chiu
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在癌症研究中理解细胞特征和功能表型的应用 | scRNA-seq提供了一种无偏见的方法来揭示不同细胞子集的特征，并有助于揭示复杂系统中的异质性 | 研究者需要注意组织解离、细胞捕获和转录物测量中的潜在缺陷，这些可能影响细胞组成评估和细胞功能注释 | 提高对组织稳态和癌症生物学的理解 | 单细胞RNA测序技术在癌症研究中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |