单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 781 - 800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 781 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals key immune cell phenotypes in the lungs of patients with asthma exacerbation
2021-03, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2020.09.032
PMID:33039479
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了哮喘急性发作患者肺部关键免疫细胞表型 | 本研究首次在单细胞水平上识别了与哮喘急性发作强烈相关的候选基因，并揭示了多个细胞簇中共享的复杂分子框架 | NA | 旨在识别与哮喘急性发作在细胞水平上强烈相关的候选基因 | 哮喘急性发作患者及健康对照者的支气管肺泡灌洗液中的细胞 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 哮喘急性发作患者和健康对照者 | NA | NA | NA | NA |
| 782 | 2024-08-07 |
RNA-Scoop: interactive visualization of transcripts in single-cell transcriptomes
2021-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab105
PMID:34859209
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研究论文 | 本文介绍了RNA-Scoop，一个用于分析单细胞转录组中转录本使用情况的交互式细胞簇和转录组可视化工具 | RNA-Scoop允许用户检查不同簇之间的差异转录本表达，并研究特定转录本表达机制在细胞组中的变化 | NA | 开发一个工具来分析单细胞转录组中的转录本使用情况 | 单细胞转录组中的转录本使用情况 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 783 | 2024-08-07 |
ATR Inhibition Induces CDK1-SPOP Signaling and Enhances Anti-PD-L1 Cytotoxicity in Prostate Cancer
2021-09-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-1010
PMID:34168048
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研究论文 | 本研究探讨了ATR抑制剂与免疫检查点阻断疗法联合使用在去势抵抗性前列腺癌（CRPC）中的分子机制 | 发现ATR抑制剂直接抑制ATR-CHK1信号通路，激活CDK1-SPOP轴，导致PD-L1蛋白不稳定，从而增强免疫检查点阻断疗法的疗效 | NA | 揭示ATR抑制剂与免疫检查点阻断疗法在CRPC中的相互作用机制，为临床试验提供依据 | 去势抵抗性前列腺癌细胞和模型 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了前列腺癌细胞系和同基因的雄激素不敏感前列腺癌模型 | NA | NA | NA | NA |
| 784 | 2024-08-07 |
Tmem100- and Acta2-Lineage Cells Contribute to Implant Osseointegration in a Mouse Model
2021-05, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1002/jbmr.4264
PMID:33528844
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研究论文 | 本文研究了在小鼠模型中，Tmem100和Acta2谱系细胞如何促进金属植入物的骨整合 | 首次发现Pdgfra和Ly6a/Sca1表达的基质细胞（PαS细胞）在植入物周围骨形成中的作用 | NA | 确定参与金属植入物周围骨形成的特定骨髓基质细胞群 | Tmem100和Acta2谱系细胞在植入物骨整合中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠胫骨植入模型 | NA | NA | NA | NA |
| 785 | 2024-08-07 |
Multi-resolution characterization of molecular taxonomies in bulk and single-cell transcriptomics data
2021-09-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab552
PMID:34226941
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研究论文 | 本文介绍了一种名为K2Taxonomer的新型无监督递归分区算法及其相关的R包，该算法利用集成学习在类似分类结构的层次中识别稳健的子组 | K2Taxonomer算法能够适应不同的数据范式，适用于批量和单细胞转录组学以及其他‘组学’数据的分析 | NA | 开发一种新算法以在大型生物医学项目中高效识别分子亚型 | 批量和单细胞转录组学数据 | 组学 | 乳腺癌 | 转录组学 | 集成学习 | 转录组数据 | 包括模拟数据和人类组织数据，具体样本数量未明确 | NA | NA | NA | NA |
| 786 | 2024-08-07 |
Inhibitory CD161 receptor identified in glioma-infiltrating T cells by single-cell analysis
2021-03-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.01.022
PMID:33592174
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了31名IDH野生型胶质母细胞瘤和IDH突变型胶质瘤患者的肿瘤浸润T细胞的基因表达和克隆景观 | 首次揭示了胶质瘤浸润T细胞中CD161作为候选抑制性受体的表达，并证明了其作为免疫治疗靶点的潜力 | NA | 探索胶质瘤中T细胞的基因表达模式及其在癌症免疫治疗中的作用 | 胶质瘤浸润T细胞的基因表达和克隆景观 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 31名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 787 | 2024-08-07 |
Inhibition of the renin-angiotensin system causes concentric hypertrophy of renal arterioles in mice and humans
2021-12-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.154337
PMID:34762601
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研究论文 | 研究通过使用携带荧光细胞谱系示踪剂的小鼠、单细胞RNA测序以及在人和小鼠中长期抑制肾素-血管紧张素系统(RAS)，发现肾素缺失或RAS抑制导致肾内动脉和 arterioles 向心性增厚 | 首次揭示了肾素细胞的多克隆扩张和转化，从经典内分泌表型转变为基质分泌表型，导致血管疾病 | 需要对人类进行前瞻性形态学研究，以确定广泛使用RAS抑制剂导致的肾血管损伤程度 | 探讨肾素-血管紧张素系统抑制对肾血管结构的影响 | 小鼠和人类的肾内动脉和 arterioles | NA | 高血压 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 小鼠和人类样本 | NA | NA | NA | NA |
| 788 | 2024-08-07 |
Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex
2021-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2907-3
PMID:33184512
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研究论文 | 本研究使用Patch-seq技术结合膜片钳记录、生物素染色和单细胞RNA测序，分析了成年小鼠初级运动皮层中超过1,300个神经元的转录组和形态电生理特性 | 首次在同一组细胞中同时研究了神经元的转录组和形态电生理多样性，揭示了神经元类型在皮层中并非总是形成离散实体，而是在家族级别上形成连续且相关的转录组和形态电生理景观 | 研究仅限于成年小鼠的初级运动皮层，可能需要进一步研究其他脑区和不同发育阶段的神经元类型 | 探讨神经元类型的转录组和形态电生理多样性及其在皮层中的组织方式 | 成年小鼠初级运动皮层中的神经元 | 神经科学 | NA | Patch-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 超过1,300个神经元 | NA | NA | NA | NA |
| 789 | 2024-08-07 |
A multimodal cell census and atlas of the mammalian primary motor cortex
2021-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03950-0
PMID:34616075
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研究论文 | 本文报道了通过BRAIN Initiative Cell Census Network (BICCN)生成的哺乳动物初级运动皮层的多模态细胞普查和图谱 | 研究首次整合了单细胞转录组、染色质可及性、DNA甲基化图谱、空间解析的单细胞转录组、形态学和电生理特性以及细胞分辨率的输入-输出映射，并通过跨模态计算分析进行整合 | NA | 推进对大脑细胞类型组织的集体知识和理解 | 哺乳动物初级运动皮层的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学、染色质可及性分析、DNA甲基化分析、空间解析的单细胞转录组学 | 跨模态计算分析 | 转录组、染色质可及性、DNA甲基化、形态学和电生理数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 790 | 2024-08-07 |
Dysbalance of ACE2 levels - a possible cause for severe COVID-19 outcome in COPD
2021-09, The journal of pathology. Clinical research
DOI:10.1002/cjp2.224
PMID:33978304
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研究论文 | 研究探讨了慢性阻塞性肺病（COPD）患者中ACE2及其相关辅助因子的表达水平，以及这些变化如何影响SARS-CoV-2感染的风险 | 首次揭示了COPD患者肺组织中ACE2和TMPRSS2表达增加，同时循环sACE2水平降低，这些变化可能增加COPD患者对SARS-CoV-2感染的易感性 | 研究未涉及这些变化与肺部血流动力学变化之间的关联 | 探究COPD患者中ACE2及其相关辅助因子的表达变化及其对SARS-CoV-2感染的影响 | COPD、特发性肺动脉高压（IPAH）和肺纤维化（PF）患者的肺组织样本及健康对照组样本 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | 定量PCR、酶联免疫吸附试验、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | COPD患者28例，IPAH患者10例，PF患者10例，健康对照组10例 | NA | NA | NA | NA |
| 791 | 2024-08-07 |
A Role for Protease Activated Receptor Type 3 (PAR3) in Nociception Demonstrated Through Development of a Novel Peptide Agonist
2021-06, The journal of pain
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jpain.2020.12.006
PMID:33429107
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研究论文 | 研究通过开发一种新的肽激动剂，探讨了蛋白酶活化受体3（PAR3）在痛觉中的作用 | 开发了一种脂质连接的PAR3激动剂C660，该激动剂能特异性地激活PAR3并引起DRG和三叉神经元中的钙反应 | NA | 更好地理解PAR3在外周感觉神经系统中的潜在功能 | PAR3在痛觉中的作用及其与其他PARs的相互作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | G蛋白偶联受体（GPCRs） | RNA序列数据 | 使用了野生型和PAR3敲除的小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 792 | 2024-08-07 |
The alx3 gene shapes the zebrafish neurocranium by regulating frontonasal neural crest cell differentiation timing
2021-04-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.197483
PMID:33741714
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，揭示了alx3基因在调控前鼻神经嵴细胞分化时间和细胞形态中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细定义了颅神经嵴细胞的不同群体，并发现Alx转录因子基因家族在前鼻神经嵴细胞中的富集 | NA | 深入理解控制发育时序的基因如何塑造颅面骨骼元素 | alx3基因在前鼻神经嵴细胞分化中的作用 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 793 | 2024-08-07 |
Comprehensive single-cell sequencing reveals the stromal dynamics and tumor-specific characteristics in the microenvironment of nasopharyngeal carcinoma
2021-03-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21795-z
PMID:33750785
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了鼻咽癌肿瘤微环境中的基质细胞动态和肿瘤特异性特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了鼻咽癌肿瘤微环境中的基质细胞群及其亚群，并揭示了其对患者预后和治疗结果的影响 | 研究仅基于14名患者的样本，可能需要更多样本以增强结果的普遍性 | 深入理解鼻咽癌肿瘤微环境中的基质细胞动态，以促进癌症诊断、治疗和预后 | 鼻咽癌肿瘤微环境中的基质细胞及其亚群 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 66,627个细胞来自14名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 794 | 2024-08-07 |
SwarnSeq: An improved statistical approach for differential expression analysis of single-cell RNA-seq data
2021-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2021.02.014
PMID:33662531
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SwarnSeq的改进统计方法，用于单细胞RNA测序数据的差异表达分析 | SwarnSeq方法在模型中考虑了单细胞RNA测序数据中的分子捕获过程，这是现有差异表达方法中较少考虑的 | NA | 开发一种改进的差异表达分析方法，以解决单细胞RNA测序数据中的dropout事件问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计模型 | 基因表达数据 | 10个不同的真实单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 795 | 2024-08-07 |
EASI-FISH for thick tissue defines lateral hypothalamus spatio-molecular organization
2021-12-22, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.11.024
PMID:34875226
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研究论文 | 本文开发了EASI-FISH技术用于厚脑组织切片中基因表达的调查，并建立了一个计算流程来快速处理大量的EASI-FISH图像数据集 | EASI-FISH技术优化用于300μm厚的脑组织切片，有助于重建跨脑的分子空间域，并促进了分子定义细胞类型的迭代再分析 | NA | 确定分子定义细胞类型的空间组织和形态特征，以揭示支撑脑功能的结构 | 侧下丘脑区域（LHA）的分子定义细胞类型的空间分布 | 数字病理学 | NA | EASI-FISH | NA | 图像 | 数十种分子定义的细胞类型在侧下丘脑区域（LHA）的空间分布 | NA | NA | NA | NA |
| 796 | 2024-08-07 |
HER3 Is an Actionable Target in Advanced Prostate Cancer
2021-12-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-3360
PMID:34753775
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研究论文 | 本文研究了HER3蛋白在晚期前列腺癌中的表达及其作为治疗靶点的潜力 | 首次展示了HER3在致命性前列腺癌中的高表达，并证实了HER3靶向治疗策略的有效性 | NA | 探讨HER3在前列腺癌中的作用及其作为治疗靶点的可行性 | HER3蛋白在前列腺癌中的表达及其对肿瘤生长和生存的影响 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 多重免疫荧光技术，单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 人类前列腺癌活检样本及小鼠转基因前列腺癌模型 | NA | NA | NA | NA |
| 797 | 2024-08-07 |
YTHDF2 is essential for spermatogenesis and fertility by mediating a wave of transcriptional transition in spermatogenic cells
2021-Dec-08, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.1093/abbs/gmab148
PMID:34664060
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研究论文 | 研究探讨了YTHDF2在哺乳动物精子发生中的作用，通过生成特定基因突变体，揭示了YTHDF2对小鼠精子发生和生育能力的重要性 | 首次证明了YTHDF2在哺乳动物精子发生中的关键作用，并揭示了其在转录后水平调控精子发生过程中的具体机制 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在其他哺乳动物中验证YTHDF2的作用 | 探讨YTHDF2在哺乳动物精子发生中的作用及其对生育能力的影响 | YTHDF2在小鼠精子发生中的功能及其对生育能力的影响 | NA | 男性不育 | RNA-seq, MeRIP-qPCR, 荧光激活细胞分选 | NA | 转录组数据 | 特定基因突变体Ythdf2-vKO小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 798 | 2024-08-07 |
Neurexin-3 defines synapse- and sex-dependent diversity of GABAergic inhibition in ventral subiculum
2021-12-07, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.110098
PMID:34879268
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研究论文 | 研究通过电生理切片、成像和单细胞RNA测序技术，探讨了Neurexin-3在腹下托GABA能抑制性神经元中的作用及其与性别的关系 | 首次揭示了Neurexin-3在腹下托抑制性突触中的多重作用，并发现了其在性别上的差异性表现 | NA | 探究腹下托抑制性局部回路的内在连接和突触特性 | Neurexin-3在腹下托GABA能抑制性神经元中的功能 | 神经科学 | NA | 电生理切片、成像、单细胞RNA测序 | NA | 电生理数据、图像、RNA序列 | 雄性和雌性小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 799 | 2024-08-07 |
Parity-induced changes to mammary epithelial cells control NKT cell expansion and mammary oncogenesis
2021-12-07, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.110099
PMID:34879282
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了未产和已产雌性小鼠乳腺组织中上皮和非上皮细胞的组成，发现妊娠后乳腺上皮细胞（MECs）中γδ自然杀伤T样免疫细胞（NKTs）的扩张和免疫信号分子的上调，揭示了妊娠如何调节MECs与免疫微环境之间的交流，并建立了妊娠、免疫微环境和乳腺肿瘤发生之间的因果关系。 | 首次揭示了妊娠后乳腺上皮细胞中CD1d分子的上调导致NKTs细胞扩张，进而影响乳腺肿瘤的发生。 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证这些发现。 | 探讨妊娠对乳腺微环境的影响及其与乳腺肿瘤发生的关系。 | 乳腺上皮细胞（MECs）和γδ自然杀伤T样免疫细胞（NKTs）。 | 数字病理学 | 乳腺肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 未产和已产雌性小鼠的乳腺组织 | NA | NA | NA | NA |
| 800 | 2024-08-07 |
Vascular Smooth Muscle Cell Subpopulations and Neointimal Formation in Mouse Models of Elastin Insufficiency
2021-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.120.315681
PMID:34587758
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研究论文 | 本研究利用缺乏弹性蛋白（Eln）的小鼠模型，研究了血管平滑肌细胞（SMCs）的来源和表型异质性，以及它们在升主动脉中新内膜形成中的作用 | 首次通过单细胞测序和细胞系标记技术，识别了新内膜细胞群，并揭示了这些细胞独特的发育来源和转录特征 | NA | 探讨弹性蛋白不足情况下，血管平滑肌细胞的适应性变化及其在新内膜形成中的作用 | 血管平滑肌细胞及其在新内膜形成中的作用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | SMC-Eln敲除小鼠中的两个独特的SMC群体 | NA | NA | NA | NA |