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当前共找到 2886 篇文献，本页显示第 781 - 800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 781 | 2024-08-07 |
scMC learns biological variation through the alignment of multiple single-cell genomics datasets
2021-01-04, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02238-2
PMID:33397454
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scMC的方法，用于在整合和比较不同实验的单细胞基因组数据集时，区分并保留生物学变异，同时去除技术变异 | scMC方法通过方差分析学习生物学变异，以无监督方式推断并去除技术变异，从而能够准确对齐并检测共享和特定上下文的生物信号 | NA | 开发一种方法，能够在整合单细胞基因组数据时，有效区分并保留生物学变异，去除技术变异 | 单细胞RNA测序和ATAC测序实验的数据集 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq）和ATAC测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 782 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome profiling of the vaginal wall in women with severe anterior vaginal prolapse
2021-01-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20358-y
PMID:33397933
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术构建了前阴道壁的转录组图谱，并分析了前阴道脱垂（AVP）中的细胞类型和基因表达异常 | 首次构建了前阴道壁的单细胞转录组图谱，并揭示了AVP中的细胞异质性和分子机制 | NA | 揭示前阴道脱垂（AVP）的细胞异质性和分子机制 | 前阴道壁的单细胞转录组 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 81,026个单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 783 | 2024-08-07 |
Transcriptional and morphological profiling of parvalbumin interneuron subpopulations in the mouse hippocampus
2021-01-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20328-4
PMID:33398060
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对形态学上已鉴定的小鼠海马体中的parvalbumin中间神经元（PV-INs）进行了转录组状态的分析 | 研究首次结合形态学信息和转录组数据，探讨了PV-INs在形态学、生理学和发展领域的转录组状态 | 研究主要集中在PV-INs的转录组分析，未涉及其他神经元类型的比较 | 探讨神经元身份是否可以从遗传信息中推断出来，并分析PV-INs的转录组和形态学特征 | 小鼠海马体中的parvalbumin中间神经元（PV-INs） | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 784 | 2024-08-07 |
The scRNA-seq Expression Profiling of the Receptor ACE2 and the Cellular Protease TMPRSS2 Reveals Human Organs Susceptible to SARS-CoV-2 Infection
2021-01-02, International journal of environmental research and public health
DOI:10.3390/ijerph18010284
PMID:33401657
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析了31个器官中ACE2和TMPRSS2的表达水平，评估了SARS-CoV-2感染的风险 | 首次发现胆囊和输卵管易受SARS-CoV-2感染，并对易感器官进行了风险分级 | NA | 深入理解SARS-CoV-2的病理机制 | 31个器官中ACE2和TMPRSS2的表达水平 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 31个器官的细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 785 | 2024-08-07 |
Statistical and Bioinformatics Analysis of Data from Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Experiments
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0849-4_9
PMID:32926366
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review | 本文综述了在处理、质量控制和分析批量及单细胞RNA测序数据时使用的各种生物信息学和统计方法 | NA | NA | 探讨高吞吐量测序技术在研究人类转录组，特别是与癌症相关的应用 | 批量和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 癌症 | RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 786 | 2024-08-07 |
KLF4 (Kruppel-Like Factor 4)-Dependent Perivascular Plasticity Contributes to Adipose Tissue inflammation
2021-01, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.120.314703
PMID:33054397
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研究论文 | 研究探讨了KLF4依赖的周围血管可塑性对脂肪组织炎症的贡献 | 首次揭示了KLF4在周围血管细胞中的作用，及其对饮食诱导肥胖相关脂肪组织炎症和代谢功能障碍的影响 | 研究使用了特定的转基因小鼠模型，结果的普遍性和适用性可能受限 | 验证周围血管细胞在KLF4依赖性条件下转化为类似巨噬细胞的细胞，从而加剧脂肪组织炎症和代谢功能障碍的假设 | 周围血管细胞、脂肪组织炎症、代谢功能障碍 | NA | 肥胖 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用了Myh11-CreERT2 eYFP小鼠和Myh11-DreERT2tdTomato小鼠进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 787 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis of small and large wounds reveals the distinct spatial organization of regenerative fibroblasts
2021-01, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.14244
PMID:33237598
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研究论文 | 本文通过比较小疤痕伤口和大再生伤口的单细胞转录组数据，揭示了再生纤维母细胞在伤口诱导的毛囊新生中的不同空间组织。 | 发现了在再生伤口条件下过度表达Crabp1蛋白的新型上部伤口纤维母细胞，并提供了计算测试来映射这些细胞在大伤口中的空间位置。 | NA | 研究大伤口中更具再生能力的真皮细胞和分子成分，以及纤维母细胞系在伤口诱导的毛囊新生中的作用。 | 小疤痕伤口和大再生伤口的单细胞转录组数据。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 788 | 2024-08-07 |
Transcript assembly improves expression quantification of transposable elements in single-cell RNA-seq data
2021-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.265173.120
PMID:33355230
|
研究论文 | 本文建立了一个适用于多种技术平台生成的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的转座元件（TE）表达定量流程 | 首次开发了针对TE的scRNA-seq定量工具，提高了TE表达量测定的准确性 | NA | 解决目前缺乏针对TE的scRNA-seq定量工具的问题，以解析单细胞分辨率的TE表达动态 | 转座元件（TE）及其在单细胞RNA测序数据中的表达 | RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 包括小鼠胚胎干细胞和早期胚胎发育阶段的scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 789 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptional profiling reveals the heterogeneity in embryonal rhabdomyosarcoma
2021-Aug-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000026775
PMID:34397824
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术分析胚胎型横纹肌肉瘤的转录组异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了胚胎型横纹肌肉瘤的细胞异质性和进化轨迹 | NA | 探究胚胎型横纹肌肉瘤的异质性、起源和病因 | 胚胎型横纹肌肉瘤的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 儿童软组织肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个肿瘤组织细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 790 | 2024-08-07 |
Deconvolution of cell type-specific drug responses in human tumor tissue with single-cell RNA-seq
2021-05-11, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-021-00894-y
PMID:33975634
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研究论文 | 本文通过结合急性切片培养中的多重药物扰动与单细胞RNA测序（scRNA-seq），研究了人类肿瘤组织中细胞类型特异性药物反应 | 首次使用scRNA-seq技术在单细胞水平上分析肿瘤组织中细胞类型特异性的药物敏感性 | 研究仅限于胶质母细胞瘤（GBM），可能需要进一步研究以验证其他类型肿瘤的适用性 | 旨在开发一种能够在患者肿瘤组织中直接快速筛选细胞类型特异性药物敏感性的平台 | 胶质母细胞瘤（GBM）患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 7个胶质母细胞瘤（GBM）切除样本 | NA | NA | NA | NA |
| 791 | 2024-08-07 |
Fibrinolysis influences SARS-CoV-2 infection in ciliated cells
2021-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2021.01.07.425801
PMID:33442688
|
研究论文 | 研究分析了单细胞RNA测序数据，探讨了纤溶酶在SARS-CoV-2感染纤毛细胞中的作用及其与ENaC蛋白的相互作用 | 首次揭示了SARS-CoV-2通过与ENaC纤溶酶网络相互作用，加速病毒侵入易感细胞，并可能导致与ENaC相关的肺水肿呼吸状况 | NA | 探讨SARS-CoV-2感染纤毛细胞的机制及其与ENaC蛋白的相互作用 | 纤溶酶、ENaC蛋白、SARS-CoV-2受体ACE2在不同细胞类型中的表达 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及不同类型的上皮细胞和白细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 792 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals key immune cell phenotypes in the lungs of patients with asthma exacerbation
2021-03, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2020.09.032
PMID:33039479
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了哮喘急性发作患者肺部关键免疫细胞表型 | 本研究首次在单细胞水平上识别了与哮喘急性发作强烈相关的候选基因，并揭示了多个细胞簇中共享的复杂分子框架 | NA | 旨在识别与哮喘急性发作在细胞水平上强烈相关的候选基因 | 哮喘急性发作患者及健康对照者的支气管肺泡灌洗液中的细胞 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 哮喘急性发作患者和健康对照者 | NA | NA | NA | NA |
| 793 | 2024-08-07 |
RNA-Scoop: interactive visualization of transcripts in single-cell transcriptomes
2021-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab105
PMID:34859209
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研究论文 | 本文介绍了RNA-Scoop，一个用于分析单细胞转录组中转录本使用情况的交互式细胞簇和转录组可视化工具 | RNA-Scoop允许用户检查不同簇之间的差异转录本表达，并研究特定转录本表达机制在细胞组中的变化 | NA | 开发一个工具来分析单细胞转录组中的转录本使用情况 | 单细胞转录组中的转录本使用情况 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 794 | 2024-08-07 |
ATR Inhibition Induces CDK1-SPOP Signaling and Enhances Anti-PD-L1 Cytotoxicity in Prostate Cancer
2021-09-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-1010
PMID:34168048
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研究论文 | 本研究探讨了ATR抑制剂与免疫检查点阻断疗法联合使用在去势抵抗性前列腺癌（CRPC）中的分子机制 | 发现ATR抑制剂直接抑制ATR-CHK1信号通路，激活CDK1-SPOP轴，导致PD-L1蛋白不稳定，从而增强免疫检查点阻断疗法的疗效 | NA | 揭示ATR抑制剂与免疫检查点阻断疗法在CRPC中的相互作用机制，为临床试验提供依据 | 去势抵抗性前列腺癌细胞和模型 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了前列腺癌细胞系和同基因的雄激素不敏感前列腺癌模型 | NA | NA | NA | NA |
| 795 | 2024-08-07 |
Tmem100- and Acta2-Lineage Cells Contribute to Implant Osseointegration in a Mouse Model
2021-05, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1002/jbmr.4264
PMID:33528844
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研究论文 | 本文研究了在小鼠模型中，Tmem100和Acta2谱系细胞如何促进金属植入物的骨整合 | 首次发现Pdgfra和Ly6a/Sca1表达的基质细胞（PαS细胞）在植入物周围骨形成中的作用 | NA | 确定参与金属植入物周围骨形成的特定骨髓基质细胞群 | Tmem100和Acta2谱系细胞在植入物骨整合中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠胫骨植入模型 | NA | NA | NA | NA |
| 796 | 2024-08-07 |
Multi-resolution characterization of molecular taxonomies in bulk and single-cell transcriptomics data
2021-09-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab552
PMID:34226941
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研究论文 | 本文介绍了一种名为K2Taxonomer的新型无监督递归分区算法及其相关的R包，该算法利用集成学习在类似分类结构的层次中识别稳健的子组 | K2Taxonomer算法能够适应不同的数据范式，适用于批量和单细胞转录组学以及其他‘组学’数据的分析 | NA | 开发一种新算法以在大型生物医学项目中高效识别分子亚型 | 批量和单细胞转录组学数据 | 组学 | 乳腺癌 | 转录组学 | 集成学习 | 转录组数据 | 包括模拟数据和人类组织数据，具体样本数量未明确 | NA | NA | NA | NA |
| 797 | 2024-08-07 |
Inhibitory CD161 receptor identified in glioma-infiltrating T cells by single-cell analysis
2021-03-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.01.022
PMID:33592174
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了31名IDH野生型胶质母细胞瘤和IDH突变型胶质瘤患者的肿瘤浸润T细胞的基因表达和克隆景观 | 首次揭示了胶质瘤浸润T细胞中CD161作为候选抑制性受体的表达，并证明了其作为免疫治疗靶点的潜力 | NA | 探索胶质瘤中T细胞的基因表达模式及其在癌症免疫治疗中的作用 | 胶质瘤浸润T细胞的基因表达和克隆景观 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 31名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 798 | 2024-08-07 |
Inhibition of the renin-angiotensin system causes concentric hypertrophy of renal arterioles in mice and humans
2021-12-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.154337
PMID:34762601
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研究论文 | 研究通过使用携带荧光细胞谱系示踪剂的小鼠、单细胞RNA测序以及在人和小鼠中长期抑制肾素-血管紧张素系统(RAS)，发现肾素缺失或RAS抑制导致肾内动脉和 arterioles 向心性增厚 | 首次揭示了肾素细胞的多克隆扩张和转化，从经典内分泌表型转变为基质分泌表型，导致血管疾病 | 需要对人类进行前瞻性形态学研究，以确定广泛使用RAS抑制剂导致的肾血管损伤程度 | 探讨肾素-血管紧张素系统抑制对肾血管结构的影响 | 小鼠和人类的肾内动脉和 arterioles | NA | 高血压 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 小鼠和人类样本 | NA | NA | NA | NA |
| 799 | 2024-08-07 |
Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex
2021-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2907-3
PMID:33184512
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研究论文 | 本研究使用Patch-seq技术结合膜片钳记录、生物素染色和单细胞RNA测序，分析了成年小鼠初级运动皮层中超过1,300个神经元的转录组和形态电生理特性 | 首次在同一组细胞中同时研究了神经元的转录组和形态电生理多样性，揭示了神经元类型在皮层中并非总是形成离散实体，而是在家族级别上形成连续且相关的转录组和形态电生理景观 | 研究仅限于成年小鼠的初级运动皮层，可能需要进一步研究其他脑区和不同发育阶段的神经元类型 | 探讨神经元类型的转录组和形态电生理多样性及其在皮层中的组织方式 | 成年小鼠初级运动皮层中的神经元 | 神经科学 | NA | Patch-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 超过1,300个神经元 | NA | NA | NA | NA |
| 800 | 2024-08-07 |
A multimodal cell census and atlas of the mammalian primary motor cortex
2021-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03950-0
PMID:34616075
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研究论文 | 本文报道了通过BRAIN Initiative Cell Census Network (BICCN)生成的哺乳动物初级运动皮层的多模态细胞普查和图谱 | 研究首次整合了单细胞转录组、染色质可及性、DNA甲基化图谱、空间解析的单细胞转录组、形态学和电生理特性以及细胞分辨率的输入-输出映射，并通过跨模态计算分析进行整合 | NA | 推进对大脑细胞类型组织的集体知识和理解 | 哺乳动物初级运动皮层的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学、染色质可及性分析、DNA甲基化分析、空间解析的单细胞转录组学 | 跨模态计算分析 | 转录组、染色质可及性、DNA甲基化、形态学和电生理数据 | NA | NA | NA | NA | NA |