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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-03-03 |
A Comprehensive Survey of Statistical Approaches for Differential Expression Analysis in Single-Cell RNA Sequencing Studies
2021-12-02, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12121947
PMID:34946896
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综述 | 本文全面综述了单细胞RNA测序研究中差异表达分析的统计方法，并对19种广泛使用的方法在11个真实数据集上进行了性能评估 | 首次系统分类和评估了从批量RNA-seq借鉴的方法及专为scRNA-seq设计的方法，通过多标准分析推荐了最佳工具 | 评估基于特定数据集和性能指标，可能无法完全覆盖所有实验条件或新兴方法 | 为单细胞RNA测序数据中的差异表达分析提供方法选择指南和性能评估 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达分析方法 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 11个真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2026-03-02 |
Metabolic modeling of single Th17 cells reveals regulators of autoimmunity
2021-08-05, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.05.045
PMID:34216539
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研究论文 | 本研究开发了Compass算法，通过单细胞RNA测序和通量平衡分析，揭示了Th17细胞代谢状态与其自身免疫致病性之间的关联，并验证了多胺代谢在调控Th17细胞功能中的关键作用 | 开发了Compass算法，首次将单细胞RNA测序与通量平衡分析结合，实现了单细胞代谢状态的表征，并发现了多胺代谢在Th17细胞致病性中的新调控机制 | 算法基于RNA测序数据推断代谢状态，可能无法完全反映实际的代谢通量变化，且体内验证主要集中于中枢神经系统自身免疫模型 | 研究Th17细胞的代谢状态如何调控其自身免疫致病性 | Th17细胞（T辅助17细胞） | 计算生物学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序，通量平衡分析，代谢测定 | Compass算法（基于通量平衡分析） | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2026-03-02 |
Multifunctional barcoding with ClonMapper enables high-resolution study of clonal dynamics during tumor evolution and treatment
2021-07, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-021-00222-8
PMID:34939038
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ClonMapper的功能化谱系追踪系统，该系统整合了DNA条形码、单细胞RNA测序和克隆分离技术，用于全面表征异质群体中的数千个克隆 | 开发了ClonMapper系统，首次将DNA条形码与单细胞RNA测序及克隆分离相结合，实现了对特定克隆的活细胞操作和基因组、表观组、转录组测量的整合 | NA | 研究肿瘤进化与治疗过程中的克隆动态 | 慢性淋巴细胞白血病细胞系及原代人类慢性淋巴细胞白血病样本 | 数字病理学 | 慢性淋巴细胞白血病 | DNA条形码，单细胞RNA测序，克隆分离 | NA | 单细胞转录组数据 | 数千个克隆 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 64 | 2026-03-02 |
Categorization of lung mesenchymal cells in development and fibrosis
2021-Jun-25, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102551
PMID:34151224
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，系统描绘了小鼠和人类在发育、衰老及纤维化过程中肺间充质细胞的异质性，并鉴定了一个新的细胞亚群 | 首次在胚胎、出生后、成年及衰老纤维化肺中，对小鼠和人类的间充质细胞进行跨物种、跨发育阶段的单细胞转录组比较分析，鉴定了一个新的细胞亚群，并揭示了各亚群在纤维化中均参与基质基因表达 | 未明确提及新细胞亚群的具体功能验证，且分析主要基于转录组数据，缺乏蛋白水平或功能实验的深入验证 | 阐明肺间充质细胞在发育和纤维化疾病中的异质性、亚群分类及其转录特征 | 小鼠和人类在胚胎期、出生后、成年期及衰老纤维化肺组织中的间充质细胞 | 单细胞组学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涵盖小鼠和人类多个发育阶段（胚胎、出生后、成年、衰老）及纤维化状态的肺组织样本，具体样本数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2026-03-02 |
Identification of EMT signaling cross-talk and gene regulatory networks by single-cell RNA sequencing
2021-05-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2102050118
PMID:33941680
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了TGF-β1诱导的MCF10A细胞上皮-间质转化过程，揭示了EMT信号通路的交叉调控和基因调控网络 | 利用单细胞RNA测序和伪时间聚类重建，首次在单细胞水平上揭示了EMT过程中信号通路的顺序和并行激活模式，并识别了关键的NOTCH信号通路作为TGF-β诱导EMT的主要驱动因素 | 研究仅基于MCF10A细胞系模型，未在体内或更多细胞类型中验证，且单细胞测序技术本身存在技术噪音和批次效应等局限性 | 探究上皮-间质转化过程中的信号通路交叉调控机制和基因调控网络 | MCF10A细胞系在TGF-β1刺激下经历EMT的过程 | 单细胞组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 伪时间聚类分析、随机电路扰动方法 | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，但基于MCF10A细胞系进行单细胞测序 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 66 | 2026-03-02 |
Single Molecule-Based fliFISH Validates Radial and Heterogeneous Gene Expression Patterns in Pancreatic Islet β-Cells
2021-05, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db20-0802
PMID:33685924
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研究论文 | 本研究利用fliFISH技术在单个细胞水平上量化小鼠胰岛切片中的转录本，验证了胰岛β细胞中基因表达的径向和异质性模式 | 采用fliFISH技术克服了scRNA-Seq在检测低丰度转录本和空间组织信息方面的局限性，首次在完整胰岛的空间背景下评估转录异质性 | 研究仅聚焦于小鼠胰岛，未涉及人类样本或其他物种；分析的基因数量有限，可能未全面覆盖胰岛β细胞的异质性 | 验证胰岛β细胞中基因表达的异质性模式，并探索其空间组织与细胞成熟状态的关系 | 小鼠胰岛β细胞 | 数字病理学 | NA | fliFISH（基于波动定位成像的荧光原位杂交） | NA | 图像 | 未明确指定样本数量，但涉及单个胰岛的多个细胞 | NA | 单细胞RNA测序（作为比较技术提及），但主要使用fliFISH | NA | NA |
| 67 | 2026-03-02 |
SCDC: bulk gene expression deconvolution by multiple single-cell RNA sequencing references
2021-01-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbz166
PMID:31925417
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研究论文 | 本文提出了一种名为SCDC的批量基因表达去卷积方法，该方法利用多个单细胞RNA测序参考数据集中的细胞类型特异性基因表达谱，通过集成方法整合不同实验室和时间产生的数据，以解决批次效应问题，并在模拟和实验混合细胞系中验证了其优于现有方法的准确性 | SCDC采用集成方法整合多个scRNA-seq参考数据集，隐式处理批次效应混淆问题，提高了细胞类型分解的准确性 | NA | 开发一种基于多个单细胞RNA测序参考数据集的批量RNA测序去卷积方法，以更准确地分解细胞类型比例 | 批量RNA测序数据，包括模拟生成的伪批量样本和实验混合细胞系，以及人类胰岛和小鼠乳腺组织数据集 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 集成方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2026-03-02 |
A `one-two punch' therapy strategy to target chemoresistance in estrogen receptor positive breast cancer
2021-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2020.100946
PMID:33221681
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研究论文 | 本研究探讨了通过HDAC抑制剂靶向化疗诱导的癌症干细胞样细胞，以克服雌激素受体阳性乳腺癌的化疗耐药性 | 提出“一打二击”治疗策略，利用HDAC抑制剂阻断化疗诱导的癌症干细胞样细胞富集，并揭示IIa类和IIb类HDAC在逆转化疗耐药状态中的关键作用 | 研究主要基于体外实验和患者样本分析，缺乏大规模临床试验验证，且对HDAC抑制剂的具体作用机制仍需进一步探索 | 开发针对雌激素受体阳性乳腺癌化疗耐药性的新型治疗策略 | 雌激素受体阳性转移性乳腺癌肿瘤细胞及患者来源的癌症细胞 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 69 | 2026-02-24 |
Review of multi-omics data resources and integrative analysis for human brain disorders
2021-07-17, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elab024
PMID:33969380
|
综述 | 本文综述了人类脑部疾病的多组学数据资源及整合分析方法 | 及时更新了快速发展的多组学数据资源，并涵盖了单细胞组学和空间转录组学等新兴技术 | NA | 总结人类脑部健康与疾病的多组学数据资源及整合分析方法 | 人类大脑，包括健康对照和神经精神疾病患者 | 生物信息学 | 神经精神疾病 | 多组学数据整合分析 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 70 | 2026-02-22 |
Pluripotent stem cell-derived models of neurological diseases reveal early transcriptional heterogeneity
2021-03-04, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02301-6
PMID:33663567
|
研究论文 | 本研究通过分析神经退行性疾病患者的单细胞RNA测序数据，揭示了疾病状态下神经元转录异质性的增加，并利用诱导多能干细胞模型验证了这一早期现象 | 首次在神经退行性疾病模型中系统性地展示了转录异质性在疾病早期阶段的增加，并关联到具体的基因功能类别如自噬和能量代谢 | 研究主要基于体外诱导多能干细胞模型，可能无法完全模拟体内复杂的神经退行过程 | 探究神经退行性疾病早期阶段的转录调控变化及其诊断价值 | 阿尔茨海默病和亨廷顿病患者的神经元细胞，以及诱导多能干细胞分化的神经元祖细胞 | 单细胞组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | 诱导多能干细胞分化模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 71 | 2026-02-13 |
Single-cell transcriptomic analysis of bloodstream Trypanosoma brucei reconstructs cell cycle progression and developmental quorum sensing
2021-09-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25607-2
PMID:34489460
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学分析布氏锥虫血液阶段从增殖型'细长体'向传播型'粗短体'的发育过程，重构了细胞周期进展和发育群体感应 | 首次通过单细胞转录组学在体外模型中系统解析了布氏锥虫异步发育过程中的转录动态和调控因子，并定位了粗短体细胞周期退出的精确阶段 | 研究基于体外诱导分化模型，可能无法完全模拟宿主体内的自然发育环境 | 解析布氏锥虫血液阶段发育分化的转录调控机制和细胞周期动态 | 布氏锥虫（Trypanosoma brucei） | 单细胞组学 | 寄生虫感染（锥虫病） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 8,599个寄生虫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 72 | 2026-02-13 |
Application of single-cell transcriptomics to kinetoplastid research
2021-09, Parasitology
IF:2.1Q2
DOI:10.1017/S003118202100041X
PMID:33678213
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学在动质体寄生虫研究中的应用，包括技术选择、样本制备和数据分析挑战 | 首次系统性地总结了单细胞转录组学在动质体寄生虫研究中的潜力，并提供了实验设计和数据分析的实用指导 | 主要基于现有文献综述，缺乏原创实验数据，且技术应用仍处于早期阶段 | 探讨单细胞转录组学技术在动质体寄生虫研究中的应用潜力和方法学 | 动质体寄生虫（包括利什曼原虫、锥虫等）及其宿主相互作用 | 单细胞组学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2026-02-02 |
Insights Into Systemic Sclerosis from Gene Expression Profiling
2021-Sep, Current treatment options in rheumatology
IF:1.7Q3
DOI:10.1007/s40674-021-00183-0
PMID:41614080
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综述 | 本文综述了基因表达谱分析在系统性硬化症研究中的应用，特别是通过转录组学揭示疾病异质性、病因及治疗靶点 | 利用转录组学（包括bulk和单细胞技术）量化系统性硬化症的分子异质性，为个性化治疗提供数据驱动见解 | 疾病轨迹预测仍具挑战性，需进一步研究靶组织中的细胞和分子动态 | 通过基因表达谱分析提升对系统性硬化症分子异质性和治疗策略的理解 | 系统性硬化症患者 | 自然语言处理 | 系统性硬化症 | 转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 74 | 2026-01-22 |
The MURAL collection of prostate cancer patient-derived xenografts enables discovery through preclinical models of uro-oncology
2021-08-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25175-5
PMID:34413304
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研究论文 | 本文介绍了一个前列腺癌患者来源异种移植（PDX）模型的集合，用于加速临床前药物测试和候选疗法的系统评估 | 建立了包含59个肿瘤样本的PDX资源库，覆盖了从初治原发性肿瘤到去势抵抗性转移的临床病理和基因组谱，并利用单细胞RNA测序揭示了肿瘤异质性 | 样本量相对有限（59个肿瘤来自30名患者），且时间跨度可能影响治疗反应的普遍性 | 建立前列腺癌PDX模型资源，以促进临床前药物测试和有效治疗方案的优先筛选 | 前列腺癌患者来源的肿瘤样本及衍生的PDX模型和类器官 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | PDX模型，类器官模型 | 基因组数据，转录组数据 | 59个肿瘤样本来自30名患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2026-01-16 |
Selective loss of resident macrophage-derived insulin-like growth factor-1 abolishes adaptive cardiac growth to stress
2021-09-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.07.006
PMID:34363749
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研究论文 | 本文揭示了心脏驻留巨噬细胞通过产生胰岛素样生长因子-1在高血压应激下促进心肌细胞适应性生长和心脏功能维持的关键作用 | 首次明确了心脏驻留巨噬细胞来源的IGF-1在高血压诱导的心脏适应性生长中的绝对必要性，并识别了人类心肌病中保守的IGF-1表达巨噬细胞亚群 | 研究主要基于动物模型，人类数据仅通过单细胞转录组学识别相关巨噬细胞亚群，未进行功能验证 | 探究免疫细胞在高血压应激下心脏适应性生长中的作用机制 | 心脏驻留巨噬细胞和心肌细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 76 | 2026-01-01 |
High-Throughput Monitoring of Bacterial Cell Density in Nanoliter Droplets: Label-Free Detection of Unmodified Gram-Positive and Gram-Negative Bacteria
2021-01-19, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.0c03408
PMID:33301291
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研究论文 | 本文介绍了一种基于纳米液滴散射光的高通量、无标记细菌检测方法，适用于革兰氏阳性和阴性细菌 | 开发了无需基因修饰或化学标记的高通量无标记细菌检测技术，利用纳米液滴散射光测量实现细菌增殖的可靠检测 | 未在摘要中明确说明具体局限性 | 开发适用于临床、研究和工业领域多种细菌菌株的高通量微液滴分析技术 | 未修饰的革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌 | 微生物分析技术 | NA | 液滴微流控技术、散射光测量 | NA | 光学信号数据（散射光、荧光） | NA | NA | 液滴微流控 | NA | 纳米液滴封装系统 |
| 77 | 2025-12-23 |
Isolation of Endothelial Cells from the Lumen of Mouse Carotid Arteries for Single-cell Multi-omics Experiments
2021-10-04, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/63128
PMID:34661575
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研究论文 | 本文介绍了一种从小鼠颈动脉内腔分离内皮细胞的方法，用于单细胞多组学实验，以研究动脉粥样硬化中血流扰动对内皮细胞的影响 | 开发了一种内腔消化方法，从动脉壁中富集内皮细胞，解决了内皮细胞在总细胞群中占比较低的问题，从而在单细胞分辨率下更有效地研究血流对转录组和染色质可及性的影响 | 方法可能无法完全排除其他细胞类型的污染，如平滑肌细胞、成纤维细胞和免疫细胞，且在小鼠模型中的结果需进一步验证才能应用于人类动脉样本 | 研究动脉粥样硬化中血流扰动对内皮细胞转录组和表观基因组的影响，开发内皮细胞富集方法以促进单细胞多组学研究 | 小鼠颈动脉内皮细胞，通过部分颈动脉结扎手术诱导血流扰动，使用右颈动脉作为对照 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞RNA和染色质可及性数据 | 小鼠颈动脉样本，具体数量未在摘要中明确说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 10x Chromium | 10x Genomics微流控设置，用于单细胞和单核条形码标记，后续进行RNA制备、文库生成和高通量DNA测序 |
| 78 | 2025-10-16 |
Mouse and human share conserved transcriptional programs for interneuron development
2021-Dec-10, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abj6641
PMID:34882453
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人类与小鼠在中间神经元发育过程中共享保守的转录调控程序 | 首次在人类胚胎脑组织中系统表征神经节隆起区域的细胞多样性，并发现与啮齿类动物相似的转录调控机制 | 研究仅关注胚胎发育阶段，未涉及成年期神经元功能验证 | 探究人类GABA能神经元发育的转录调控机制及其进化保守性 | 人类胚胎脑组织中的神经节隆起区域细胞 | 神经科学 | 自闭症、精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类胚胎脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2025-10-05 |
Decoding molecular and cellular heterogeneity of mouse nucleus accumbens
2021-12, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-021-00938-x
PMID:34663959
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重错误鲁棒荧光原位杂交技术，构建了小鼠伏隔核的细胞图谱，揭示了其细胞异质性 | 首次结合单细胞转录组和空间信息构建小鼠伏隔核的细胞分类系统，揭示了神经元亚型的转录和空间多样性 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类或其他物种中验证 | 解析小鼠伏隔核的分子、细胞和解剖异质性 | 小鼠伏隔核脑区 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 多重错误鲁棒荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 80 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA-sequencing atlas of bovine caudal intervertebral discs: Discovery of heterogeneous cell populations with distinct roles in homeostasis
2021-11, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202101149R
PMID:34591994
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建牛尾椎间盘细胞图谱，发现具有不同稳态功能的异质性细胞群体 | 首次创建牛尾椎间盘单细胞转录组图谱，识别出15个独特细胞簇并发现新型细胞标记物 | 研究仅基于牛模型，结果向人类转化需要进一步验证 | 解析椎间盘的细胞异质性以促进再生治疗发展 | 牛尾椎间盘组织 | 单细胞生物学 | 椎间盘疾病 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |