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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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721 | 2024-08-07 |
Temporal single-cell transcriptomes of zebrafish spinal cord pMN progenitors reveal distinct neuronal and glial progenitor populations
2021-11, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2021.07.010
PMID:34303700
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析斑马鱼脊髓pMN前体细胞,揭示了神经元和少突胶质前体细胞的不同前体群体 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了斑马鱼脊髓pMN前体细胞中神经元和少突胶质前体细胞的不同前体群体,并鉴定了标记基因gsx2 | NA | 识别运动神经元和少突胶质前体细胞的发育起源和转录组特征 | 斑马鱼胚胎脊髓pMN细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
722 | 2024-08-07 |
Tissue factor expression, extracellular vesicles, and thrombosis after infection with the respiratory viruses influenza A virus and coronavirus
2021-11, Journal of thrombosis and haemostasis : JTH
IF:5.5Q1
DOI:10.1111/jth.15509
PMID:34418279
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综述 | 本文综述了组织因子(TF)在流感A病毒(IAV)和冠状病毒感染后的表达、TF阳性外泌体(EVs)的释放、凝血激活及血栓形成的研究 | 强调了TF表达在IAV和致病性冠状病毒感染患者中与血栓形成的关系 | NA | 探讨病毒感染后组织因子表达与血栓形成的关系 | 流感A病毒和冠状病毒感染后的组织因子表达及血栓形成 | NA | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及小鼠模型和COVID-19患者的样本 |
723 | 2024-08-07 |
Molecular and Cellular Dynamics of Aortic Aneurysms Revealed by Single-Cell Transcriptomics
2021-11, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.121.315852
PMID:34615376
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review | 本文综述了单细胞转录组测序在揭示主动脉瘤的分子和细胞动态方面的最新发现 | 单细胞RNA测序提供了血管细胞类型异质性、每个细胞类型的全面分子特征以及这些细胞群体之间表型相互关系的新见解 | 讨论了单细胞RNA测序在研究主动脉生物学和疾病中的挑战和未来方向 | 总结单细胞RNA测序分析在细胞异质性、细胞转换、细胞群体间通信和血管壁关键转录因子方面的发现,并探讨其对血管疾病发病机制的理解 | 主动脉瘤的分子和细胞动态 | digital pathology | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
724 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome of early hematopoiesis guides arterial endothelial-enhanced functional T cell generation from human PSCs
2021-Sep-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abi9787
PMID:34516916
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,探索了人类多能干细胞(hPSCs)向血液细胞分化的过程中细胞命运选择和基因表达模式,并发现通过在体外定向分化过程中应用低氧条件,可以有效促进具有功能性T细胞潜力的造血祖细胞(HPCs)的生成。 | 本研究首次展示了通过低氧条件在体外定向分化过程中促进动脉特异性程序的发展,从而生成具有功能性T细胞潜力的造血祖细胞。 | NA | 研究旨在深入理解人类造血起源,并指导体外生成功能性T细胞以应用于临床。 | 人类多能干细胞(hPSCs)的造血分化过程及其生成的血液细胞的功能性。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
725 | 2024-08-07 |
Single-cell molecular profiling provides a high-resolution map of basophil and mast cell development
2021-06, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.14633
PMID:33078414
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研究论文 | 本文通过单细胞分子 profiling 技术,提供了 basophil 和 mast cell 发育的高分辨率图谱 | 首次在单细胞水平上详细描绘了从造血祖细胞到 basophil 和 mast cell 的分化轨迹 | NA | 研究 basophil 和 mast cell 的分化过程 | basophil 和 mast cell 的发育 | 数字病理学 | 过敏反应 | 多色流式细胞术,高覆盖单细胞 RNA 测序分析 | NA | RNA 序列 | 小鼠样本 |
726 | 2024-08-07 |
Lung Epithelial Cell Transcriptional Regulation as a Factor in COVID-19-associated Coagulopathies
2021-06, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2020-0453OC
PMID:33740387
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研究论文 | 本研究旨在通过转录组分析,探讨SARS-CoV-2感染如何驱动与COVID-19相关的凝血功能障碍 | 首次揭示了SARS-CoV-2感染诱导的肺上皮细胞转录调控变化,及其对凝血功能的影响 | 研究主要基于已发表的RNA测序数据,未涉及临床试验 | 识别SARS-CoV-2感染驱动凝血功能障碍的转录调控网络 | 感染SARS-CoV-2的肺上皮细胞、支气管肺泡灌洗细胞及循环免疫细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括正常人支气管上皮细胞和患者来源的支气管肺泡灌洗样本 |
727 | 2024-08-07 |
Immune dysregulation and autoreactivity correlate with disease severity in SARS-CoV-2-associated multisystem inflammatory syndrome in children
2021-05-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.04.003
PMID:33891889
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序、流式细胞术、抗原受体谱分析和无偏倚血清蛋白质组学方法,分析了儿童多系统炎症综合征(MIS-C)、成人COVID-19和健康儿童及成人的免疫特征,发现MIS-C患者的疾病严重程度与免疫失调和自身反应性相关。 | 研究定义了MIS-C患者的警报素、细胞毒性、TCR谱和浆细胞样前体细胞的特征,这些特征可能用于临床诊断和早期预测疾病严重程度。 | NA | 探讨儿童多系统炎症综合征(MIS-C)的免疫特征及其与疾病严重程度的关系。 | MIS-C患者、成人COVID-19患者和健康儿童及成人。 | 免疫学 | 儿童多系统炎症综合征 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、抗原受体谱分析、血清蛋白质组学 | NA | RNA、细胞、蛋白质 | MIS-C患者、成人COVID-19患者和健康儿童及成人的样本 |
728 | 2024-08-07 |
Control of neurogenic competence in mammalian hypothalamic tanycytes
2021-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abg3777
PMID:34049878
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研究论文 | 本研究展示了特定破坏NFI转录因子家族可以显著刺激视丘下部tanycyte的增殖和神经发生 | 首次揭示了NFI因子在tanycyte中抑制Sonic hedgehog和Wnt信号通路的作用,以及这些通路的调控对tanycyte衍生神经发生的影响 | NA | 探索控制哺乳动物视丘下部tanycyte神经发生能力的分子机制 | 视丘下部tanycyte及其衍生神经元的身份和分子调控机制 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞转座酶可及染色质测序(scATAC-seq) | NA | 单细胞数据 | NA |
729 | 2024-08-07 |
Resolving cellular systems by ultra-sensitive and economical single-cell transcriptome filtering
2021-Mar-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102147
PMID:33665566
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Constellation-Seq的分子转录组过滤技术,该技术通过最大化读取利用率并减少数据稀疏性和测序成本,提高了单细胞转录组的敏感性 | Constellation-Seq技术提供了两个数量级的敏感性提升,能够可靠地测量基因表达的变化 | NA | 旨在解决单细胞转录组分析中的敏感性限制问题 | 单细胞转录组分析中的低丰度转录本识别 | 单细胞测序 | NA | Constellation-Seq | NA | 转录组数据 | 外周血单个核细胞样本 |
730 | 2024-08-07 |
The lung microenvironment shapes a dysfunctional response of alveolar macrophages in aging
2021-02-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI140299
PMID:33586677
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research paper | 研究揭示了肺部微环境如何影响老年肺泡巨噬细胞的功能障碍 | 首次通过综合分析单细胞RNA测序数据,揭示了人类和小鼠肺泡巨噬细胞转录组中与年龄相关的同质性变化,并发现肺部微环境驱动了肺泡巨噬细胞对增殖的年龄相关抵抗性 | NA | 探讨年龄相关的肺泡巨噬细胞功能障碍及其背后的机制 | 肺泡巨噬细胞及其在老年肺炎中的作用 | NA | geriatric disease | single-cell RNA-Seq | NA | RNA | 涉及人类和小鼠的样本 |
731 | 2024-08-07 |
Vascular ApoE4 Impairs Behavior by Modulating Gliovascular Function
2021-02-03, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2020.11.019
PMID:33321072
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研究论文 | 本研究探讨了血管壁细胞特异性表达的apoE4对小鼠行为和脑血管功能的影响 | 首次揭示了血管表达的apoE4通过调节神经血管功能影响行为,且这种效应是形式依赖的 | NA | 研究apoE4在血管壁细胞中的表达如何影响阿尔茨海默病和多种血管疾病的风险 | 小鼠的血管壁细胞和神经血管功能 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
732 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of Schistosoma mansoni identifies a conserved genetic program controlling germline stem cell fate
2021-01-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20794-w
PMID:33473133
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了血吸虫的生殖干细胞命运调控的遗传程序 | 首次揭示了血吸虫生殖干细胞增殖与分化的遗传调控机制,并发现该机制在扁形动物中具有保守性 | NA | 研究血吸虫生殖干细胞的分子调控机制 | 血吸虫的生殖干细胞 | 分子生物学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
733 | 2024-08-07 |
Machine learning identifies novel blood protein predictors of penetrating and stricturing complications in newly diagnosed paediatric Crohn's disease
2021-01, Alimentary pharmacology & therapeutics
IF:6.6Q1
DOI:10.1111/apt.16136
PMID:33131065
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法,识别出与新诊断的儿童克罗恩病穿透性和狭窄并发症相关的新型血液蛋白质预测因子。 | 本研究首次识别出与儿童克罗恩病进展相关的特定血液蛋白质标记物,这些标记物在肠道和血液中的细胞表达有显著差异。 | 研究样本量相对较小,且仅限于儿童克罗恩病患者,可能限制了结果的普遍性。 | 旨在识别与克罗恩病并发症相关的新型血液蛋白质生物标志物。 | 新诊断的儿童克罗恩病患者及其穿透性和狭窄并发症。 | 机器学习 | 克罗恩病 | 近端延伸分析(Olink Proteomics) | 随机生存森林(RSF) | 蛋白质 | 265名患者,平均年龄11.6岁,其中73名患者出现狭窄并发症,34名患者出现穿透并发症。 |
734 | 2024-08-07 |
Single-Cell Analysis of Hematopoietic Stem Cells
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1425-9_22
PMID:34057731
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研究论文 | 本文描述了一种全面的单细胞RNA测序(scRNA-Seq)分析小鼠骨髓的协议,使用基于板(低通量)和基于液滴(高通量)的方法 | 结合单细胞转录组分析与分子扰动,允许对基因调控网络中的单个因子进行功能分析,并更好地理解恶性转化的最早阶段 | NA | 研究造血干细胞的单细胞分析 | 小鼠骨髓中的造血干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 转录组数据 | NA |
735 | 2024-08-07 |
Exploring tissue architecture using spatial transcriptomics
2021-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03634-9
PMID:34381231
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综述 | 本文综述了空间转录组技术及其在生物学研究中的应用 | 介绍了空间转录组技术在探索组织结构中的创新应用 | NA | 探讨基因活动如何调控多细胞生物中的复杂细胞排列 | 空间转录组技术在神经科学、发育生物学、植物生物学及疾病研究中的应用 | 生物信息学 | 癌症 | 下一代测序技术 | NA | 转录组数据 | NA |
736 | 2024-08-07 |
An interactive single cell web portal identifies gene and cell networks in COVID-19 host responses
2021-Oct-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103115
PMID:34522848
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研究论文 | 本文通过整合COVID-19和其他对照条件下的血液、支气管肺泡灌洗液和组织样本的单细胞转录组数据,开发了一个交互式单细胞网络门户ToppCell,用于探索和比较细胞特征,以发现新的基因和细胞网络。 | 本文创新性地开发了一个交互式网络门户ToppCell,允许用户探索和比较不同条件下的单细胞转录组数据,从而发现新的基因和细胞网络。 | NA | 开发一个数据挖掘工具,使用户能够比较和探索细胞特征,以获得洞察并发展新的假设。 | COVID-19和其他对照条件下的血液、支气管肺泡灌洗液和组织样本的单细胞转录组数据。 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞转录组 | NA | 基因表达数据 | 多个COVID-19和其他对照条件的血液、支气管肺泡灌洗液和组织样本 |
737 | 2024-08-07 |
Single-dose intranasal vaccination elicits systemic and mucosal immunity against SARS-CoV-2
2021-Sep-24, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103037
PMID:34462731
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研究论文 | 本文报道了一种鼻内单剂次亚单位疫苗的开发,该疫苗使用冻干刺突蛋白和脂质体STING激动剂作为佐剂,能够诱导系统性中和抗体、肺和鼻腔中的IgA以及肺部T细胞反应。 | 该疫苗能够在鼻相关淋巴组织中以类似生发中心的方式协调激活T/B细胞反应,确认其作为诱导持久免疫的诱导位点的作用。 | NA | 验证针对SARS-CoV-2的疫苗平台的更广泛应用。 | SARS-CoV-2病毒的免疫反应。 | NA | 呼吸道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠 |
738 | 2024-08-07 |
Sample processing and single cell RNA-sequencing of peripheral blood immune cells from COVID-19 patients
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100582
PMID:34002169
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研究论文 | 本文描述了从COVID-19患者的外周血单核细胞(PBMCs)中进行单细胞RNA测序(scRNA-seq)的样本处理和分析协议 | 提出了针对COVID-19患者PBMCs样本的采集、处理和分析的新方法 | 血液样本可能含有传染性病毒,免疫细胞亚型的识别可能困难,分析结果的生物学解释复杂 | 深入评估COVID-19患者免疫细胞的转录变化 | COVID-19患者的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA |
739 | 2024-08-07 |
Dynamics of B cell repertoires and emergence of cross-reactive responses in patients with different severities of COVID-19
2021-05-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109173
PMID:33991510
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研究论文 | 研究分析了不同严重程度的COVID-19患者B细胞受体(BCR)库的动态变化及交叉反应性反应的出现 | 首次详细描述了COVID-19患者BCR库的特征,并识别出与疾病严重程度相关的差异性BCR特征 | 研究样本量较小,可能影响结果的普遍性 | 探究COVID-19患者BCR库的特征及其与疾病严重程度的关系 | COVID-19患者的B细胞受体库 | NA | COVID-19 | 高通量测序 | NA | 序列数据 | 19名COVID-19患者 |
740 | 2024-08-07 |
Divergent and self-reactive immune responses in the CNS of COVID-19 patients with neurological symptoms
2021-05-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100288
PMID:33969321
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和细胞因子分析,探讨了COVID-19患者中枢神经系统中神经症状的免疫反应机制 | 发现了COVID-19患者中枢神经系统中特定区域的T细胞和B细胞活化,以及与自体免疫相关的抗体反应 | NA | 揭示COVID-19患者中枢神经系统中神经症状的生物学基础 | COVID-19患者的脑脊液和血液 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 7名患者 |