单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 681 - 700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of mouse neural stem cell differentiation reveals adverse effects of cadmium on neurogenesis
2021-Feb, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association
IF:3.9Q1
DOI:10.1016/j.fct.2020.111936
PMID:33387572
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了暴露于镉的幼鼠神经干细胞分化过程中的影响 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了镉暴露对神经干细胞分化的具体影响，并探讨了其分子机制 | 研究仅限于24小时镉暴露和7天分化的时间点，可能需要更长时间的研究来全面理解镉的长期影响 | 探讨镉暴露对神经干细胞分化过程的影响及其分子机制 | 幼鼠神经干细胞在镉暴露后的分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 幼鼠神经干细胞 |
| 682 | 2024-08-07 |
Opposing Wnt signals regulate cervical squamocolumnar homeostasis and emergence of metaplasia
2021-02, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-020-00619-0
PMID:33462395
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了鳞状和柱状上皮过渡区的上皮亚群及其基质成分，揭示了两种上皮由不同的宫颈驻留干细胞群通过对抗性的Wnt信号调控产生，并探讨了宫颈化生过程中基质重塑的机制 | 首次揭示了宫颈鳞状和柱状上皮由不同的干细胞群通过对抗性的Wnt信号调控产生，并展示了化生过程中基质重塑的详细机制 | NA | 探讨宫颈鳞状和柱状上皮过渡区的上皮组织维持机制及化生过程中的基质重塑 | 宫颈鳞状和柱状上皮过渡区的上皮亚群及其基质成分 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 683 | 2024-08-07 |
Gut CD4+ T cell phenotypes are a continuum molded by microbes, not by TH archetypes
2021-02, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-00836-7
PMID:33462454
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和染色质分析，探讨了在无菌或有菌小鼠以及感染不同微生物后的小鼠结肠中CD4效应淋巴细胞（T细胞）的实际状态 | 研究发现T细胞的转录组和染色质结构无法解析出符合经典辅助T细胞（T）亚群的离散簇，而是呈现连续分布，且这种分布与感染的微生物有关，而非传统的细胞因子产生 | NA | 确定T细胞在活体前线组织中实际采用的状态 | CD4效应淋巴细胞（T细胞）在不同微生物环境下的状态 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组分析，染色质分析 | NA | 转录组数据 | 无菌或有菌小鼠以及感染不同微生物后的小鼠的结肠T细胞 |
| 684 | 2024-08-07 |
Differential encoding in prefrontal cortex projection neuron classes across cognitive tasks
2021-01-21, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.11.046
PMID:33338423
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研究论文 | 本文研究了小鼠前额叶皮层（PFC）投射神经元的特定转录组类型如何与轴突投射和编码特性在多个认知任务中的关系 | 首次将单细胞转录组学与系统神经科学结合，分析了特定分子-解剖特征的细胞在认知任务中的编码特性 | 仅限于小鼠模型，且研究集中在特定的神经元类型和任务上 | 探讨前额叶皮层投射神经元的不同转录组类型在认知任务中的编码特性 | 小鼠前额叶皮层投射神经元的转录组类型及其在认知任务中的行为 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个小鼠样本 |
| 685 | 2024-08-07 |
Co-stimulation with opposing macrophage polarization cues leads to orthogonal secretion programs in individual cells
2021-01-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20540-2
PMID:33436596
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research paper | 本研究使用单细胞RNA测序探索在同时刺激炎症因子LPS和IFN-γ以及解决性细胞因子IL-4的情况下，单个巨噬细胞的响应机制 | 研究发现，负交叉调控导致单个共刺激巨噬细胞中T细胞极化细胞因子基因Il6和Il12b与IL-4相关因子Arg1和Chil3的互斥表达 | NA | 探讨巨噬细胞在同时接受不同刺激信号时的转录响应和功能多样性 | 巨噬细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个单个巨噬细胞 |
| 686 | 2024-08-07 |
The order and logic of CD4 versus CD8 lineage choice and differentiation in mouse thymus
2021-01-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20306-w
PMID:33397934
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研究论文 | 本文使用单细胞RNA测序技术研究小鼠胸腺中CD4与CD8谱系选择和分化的顺序与逻辑 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析胸腺细胞选择中间体的核心受体基因表达，揭示了信号强度对核心受体基因活动时间的影响 | NA | 探讨CD4/CD8谱系选择的核心受体表达与TCR特异性匹配的机制 | 小鼠胸腺中的CD4和CD8 T细胞谱系 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 多个胸腺细胞样本 |
| 687 | 2024-08-07 |
Cardiomyocytes stimulate angiogenesis after ischemic injury in a ZEB2-dependent manner
2021-01-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20361-3
PMID:33398012
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研究论文 | 本文研究了转录因子ZEB2在心肌细胞中的作用，特别是在缺血损伤后促进血管生成的能力 | 首次揭示了ZEB2在心肌细胞中的增加及其通过调节心肌细胞与内皮细胞间的对话来增强缺血后血管生成的机制 | NA | 探索增强心脏修复和恢复血管网络的因素 | 心肌细胞中的转录因子ZEB2及其在缺血损伤后的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 688 | 2024-08-07 |
Cholesterol-Induced Phenotypic Modulation of Smooth Muscle Cells to Macrophage/Fibroblast-like Cells Is Driven by an Unfolded Protein Response
2021-01, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.120.315164
PMID:33028096
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research paper | 研究胆固醇诱导的血管平滑肌细胞向巨噬细胞/成纤维细胞样细胞表型转变的分子途径 | 揭示了未折叠蛋白反应（UPR）在胆固醇诱导的血管平滑肌细胞表型转变中的必要性和充分性 | NA | 探究胆固醇诱导血管平滑肌细胞表型转变的分子机制 | 血管平滑肌细胞（SMCs）及其在胆固醇暴露下的表型变化 | NA | 心血管疾病 | NA | NA | RNA sequencing | NA |
| 689 | 2024-08-07 |
The T-box transcription factor Eomesodermin governs haemogenic competence of yolk sac mesodermal progenitors
2021-01, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-020-00611-8
PMID:33420489
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研究论文 | 本文通过胚胎干细胞模型研究了T-box转录因子Eomesodermin（Eomes）在调控卵黄囊中胚层前体细胞造血能力中的作用 | 本研究发现Eomes在早期血液形成中的转录调控层次中处于顶端，并表明造血能力在胚胎发育早期就已赋予，这一发现比先前认识的更早 | NA | 探究特定外胚层中胚层子集如何被赋予造血命运 | Eomesodermin在胚胎干细胞中的表达及其对造血前体细胞形成的影响 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 690 | 2024-08-07 |
Ndufs1 Deficiency Aggravates the Mitochondrial Membrane Potential Dysfunction in Pressure Overload-Induced Myocardial Hypertrophy
2021, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2021/5545261
PMID:33763166
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析scRNA-seq和微阵列数据，探讨了Ndufs1缺乏在压力超负荷诱导的心肌肥大中的作用及其机制。 | 首次揭示了Ndufs1在压力超负荷诱导的心肌肥大中的关键作用，并通过动物实验和细胞模型验证了其对线粒体功能的影响。 | 研究主要集中在细胞和动物模型上，尚未在人体中进行验证。 | 探讨Ndufs1缺乏在压力超负荷诱导的心肌肥大中的作用及其机制。 | Ndufs1在心肌肥大中的作用及其对线粒体功能的影响。 | NA | 心血管疾病 | scRNA-seq, 微阵列 | NA | 基因表达数据 | 使用TAC小鼠模型和Ang II诱导的心肌细胞模型进行研究。 |
| 691 | 2024-08-07 |
Loss of Claudin-3 Impairs Hepatic Metabolism, Biliary Barrier Function, and Cell Proliferation in the Murine Liver
2021, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.04.003
PMID:33866021
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研究论文 | 本文研究了紧密连接蛋白claudin-3在小鼠肝脏中的细胞类型特异性表达及其对肝脏代谢、屏障功能和细胞增殖的影响 | 首次探讨了claudin-3在肝脏代谢、屏障功能和细胞增殖中的具体作用 | NA | 探究紧密连接蛋白claudin-3在肝脏中的功能及其对代谢和屏障功能的影响 | 小鼠肝脏中的紧密连接蛋白claudin-3及其相关代谢和屏障功能 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | Cldn3-/-和Cldn3+/+小鼠的肝脏样本 |
| 692 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Immunological Profiles of Renal Allograft Rejection in Mice
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.693608
PMID:34367152
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了小鼠肾移植排斥模型中的免疫细胞特征 | 首次揭示了从小鼠急性排斥到慢性排斥过程中免疫细胞类型的变化及其对排斥过程的影响 | NA | 研究肾移植排斥过程中的免疫细胞特征及其变化 | 小鼠肾移植排斥模型中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10,921个白细胞 |
| 693 | 2024-08-07 |
Integrated Systems Analysis of the Murine and Human Pancreatic Cancer Glycomes Reveals a Tumor-Promoting Role for ST6GAL1
2021, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2021.100160
PMID:34634466
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研究论文 | 本文通过系统方法整合了KC小鼠和人类胰腺癌患者的糖组分析，识别了在癌症形成中可能起作用的糖类 | 创建了一种新型小鼠模型，通过胰腺特异性遗传删除ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 1酶，研究其对胰腺癌的影响 | 某些人类糖组变化在KC小鼠模型中未观察到 | 识别在胰腺癌形成中起作用的糖类，并开发针对这些糖类的治疗方法 | 小鼠和人类胰腺癌样本的糖组 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 糖组分析 | NA | 序列数据 | 包括KC小鼠模型和人类胰腺癌患者样本 |
| 694 | 2024-08-07 |
Deep Parallel Characterization of AAV Tropism and AAV-Mediated Transcriptional Changes via Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.730825
PMID:34759919
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研究论文 | 本文开发了一种实验和计算相结合的单细胞RNA测序（scRNA-seq）流程，用于高分辨率地表征编码rAAV池的趋向性和响应 | 首次采用scRNA-seq技术并行表征AAV的趋向性和转录变化，发现了未被识别的AAV衣壳靶向偏差和细胞类型特异性的短暂反应 | NA | 旨在开发安全且精确的基因递送载体，并展示在单细胞水平上理解基因疗法响应的重要性 | 重组腺相关病毒（rAAV）的趋向性和转录变化 | 基因疗法 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及多种细胞和组织类型 |
| 695 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Identifies Phagocytosis-Related Dual-Feature Cells in A Model of Acute Otitis Media in Rats
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.760954
PMID:34759932
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，在急性中耳炎的大鼠模型中识别出与吞噬作用相关的双特征细胞 | 首次在急性中耳炎模型中发现具有吞噬作用相关双特征的稀有细胞群，并揭示了巨噬细胞在炎症反应中的关键作用 | NA | 探究急性中耳炎发展的分子机制及多细胞生态系统中的细胞间对话 | 大鼠急性中耳炎模型中的中耳黏膜细胞 | 数字病理学 | 耳部疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 共测序了来自炎症中耳黏膜的7023个细胞和健康中耳黏膜的5258个细胞 |
| 696 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals B Cells Are Important Regulators in Fracture Healing
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.666140
PMID:34819916
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，揭示了B细胞在骨折愈合过程中的重要作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了骨折愈合过程中B细胞的数量变化及其对骨形成和吸收活动的影响 | 研究主要集中在小鼠模型上，对人类骨折愈合过程中B细胞的作用描述较少 | 探讨B细胞在骨折愈合中的作用及其机制 | 骨折组织中的免疫细胞，特别是B细胞 | 数字病理学 | 骨折 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括中性粒细胞、单核细胞、T细胞、B细胞和浆细胞等多种免疫细胞 |
| 697 | 2024-08-07 |
Cellinker: a platform of ligand-receptor interactions for intercellular communication analysis
2021-Jan-20, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab036
PMID:33471060
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研究论文 | 本文开发了Cellinker平台，一个用于细胞间通信分析的配体-受体相互作用资源 | Cellinker提供了超过3,700个人类和3,200个鼠类配体-受体蛋白-蛋白相互作用以及400多个内源性小分子相关的配体-受体相互作用，并特别收集了与冠状病毒感染相关的16个配体-受体相互作用信息 | NA | 提供一个全面的、高可信度的资源，用于检索配体-受体相互作用，以研究细胞间通信的功能效应 | 配体-受体相互作用及其在细胞间通信中的作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质-蛋白相互作用数据 | 超过3,700个人类和3,200个鼠类配体-受体相互作用，以及400多个内源性小分子相关的相互作用 |
| 698 | 2024-08-07 |
The epigenetic basis of cellular heterogeneity
2021-04, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-020-00300-0
PMID:33244170
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序方法揭示的细胞间基因表达水平的异质性，并分析了表观遗传信息如染色质可及性、核小体定位、组蛋白尾部修饰和增强子-启动子相互作用对基因表达调控的影响。 | 本文介绍了单细胞表观基因组分析方法的最新进展，这些方法能够高分辨率地映射单个细胞中的染色质状态。 | NA | 研究细胞间基因表达异质性的表观遗传基础。 | 研究对象包括单细胞测序数据、染色质状态及其对基因表达的影响。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
| 699 | 2024-08-07 |
XIAP restrains TNF-driven intestinal inflammation and dysbiosis by promoting innate immune responses of Paneth and dendritic cells
2021-Nov-05, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abf7235
PMID:34739338
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研究论文 | 本文研究了XIAP蛋白在抑制TNF驱动的肠道炎症和菌群失调中的作用，通过促进潘氏细胞和树突状细胞的先天免疫反应 | 首次揭示了XIAP通过调节TLR5和TNFR2信号通路，维持潘氏细胞和树突状细胞的功能，从而防止肠道炎症和菌群失调 | NA | 探究XIAP在肠道炎症和菌群失调中的作用机制 | XIAP缺陷小鼠和XLP2患者样本 | 免疫学 | 炎症性肠病 | scRNA-seq, RNA-seq | NA | 基因表达数据 | XIAP缺陷小鼠和XLP2患者样本 |
| 700 | 2024-08-07 |
GLP-1 receptor signaling increases PCSK1 and β cell features in human α cells
2021-02-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.141851
PMID:33554958
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研究论文 | 研究探讨了GLP-1受体信号如何增加人α细胞中的PCSK1表达及β细胞特征 | 首次展示了GLP-1受体激动剂liraglutide在人胰岛中通过DART-Seq技术增加α细胞PC1/3 mRNA表达的效果，并发现这一过程与β细胞样基因表达增加相关 | 研究主要集中在α细胞的特定亚群，可能未涵盖所有α细胞的反应 | 揭示α细胞PC1/3表达激活的机制，为糖尿病治疗提供新靶点 | 人胰岛中的α细胞和β细胞 | NA | 糖尿病 | scRNA-seq | NA | RNA | 研究涉及人胰岛和小鼠模型 |