单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 601 - 620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2024-08-07 |
KLF4 (Kruppel-Like Factor 4)-Dependent Perivascular Plasticity Contributes to Adipose Tissue inflammation
2021-01, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.120.314703
PMID:33054397
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研究论文 | 研究探讨了KLF4依赖的周围血管可塑性对脂肪组织炎症的贡献 | 首次揭示了KLF4在周围血管细胞中的作用，及其对饮食诱导肥胖相关脂肪组织炎症和代谢功能障碍的影响 | 研究使用了特定的转基因小鼠模型，结果的普遍性和适用性可能受限 | 验证周围血管细胞在KLF4依赖性条件下转化为类似巨噬细胞的细胞，从而加剧脂肪组织炎症和代谢功能障碍的假设 | 周围血管细胞、脂肪组织炎症、代谢功能障碍 | NA | 肥胖 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用了Myh11-CreERT2 eYFP小鼠和Myh11-DreERT2tdTomato小鼠进行实验 |
| 602 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneous tumor and immune cell populations in early-stage lung adenocarcinomas harboring EGFR mutations
2021-01, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-020-01528-0
PMID:33144684
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了携带EGFR突变的早期肺腺癌中的肿瘤和免疫细胞异质性 | 首次在单细胞分辨率下探讨了携带EGFR突变的早期肺腺癌的肿瘤内和肿瘤间异质性 | NA | 揭示早期肺腺癌中肿瘤细胞、基质细胞和免疫浸润细胞之间的复杂相互作用 | 携带EGFR突变的早期肺腺癌样本及其邻近肺组织 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 125,674个细胞，来自7个早期肺腺癌样本和5个肿瘤邻近肺组织 |
| 603 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis of small and large wounds reveals the distinct spatial organization of regenerative fibroblasts
2021-01, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.14244
PMID:33237598
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研究论文 | 本文通过比较小疤痕伤口和大再生伤口的单细胞转录组数据，揭示了再生纤维母细胞在伤口诱导的毛囊新生中的不同空间组织。 | 发现了在再生伤口条件下过度表达Crabp1蛋白的新型上部伤口纤维母细胞，并提供了计算测试来映射这些细胞在大伤口中的空间位置。 | NA | 研究大伤口中更具再生能力的真皮细胞和分子成分，以及纤维母细胞系在伤口诱导的毛囊新生中的作用。 | 小疤痕伤口和大再生伤口的单细胞转录组数据。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个样本 |
| 604 | 2024-08-07 |
Transcript assembly improves expression quantification of transposable elements in single-cell RNA-seq data
2021-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.265173.120
PMID:33355230
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研究论文 | 本文建立了一个适用于多种技术平台生成的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的转座元件（TE）表达定量流程 | 首次开发了针对TE的scRNA-seq定量工具，提高了TE表达量测定的准确性 | NA | 解决目前缺乏针对TE的scRNA-seq定量工具的问题，以解析单细胞分辨率的TE表达动态 | 转座元件（TE）及其在单细胞RNA测序数据中的表达 | RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 包括小鼠胚胎干细胞和早期胚胎发育阶段的scRNA-seq数据 |
| 605 | 2024-08-07 |
Longitudinal Single-Cell Transcriptomics Reveals a Role for Serpina3n-Mediated Resolution of Inflammation in a Mouse Colitis Model
2021, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.04.004
PMID:33862275
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，探讨了在小鼠化学诱导的结肠炎模型中，Serpina3n在炎症消退中的作用 | 首次揭示了Serpina3n在结肠炎消退中的特定表达及其与弹性酶的相互作用，为炎症消退提供了新的治疗靶点 | NA | 探究炎症消退过程中细胞间相互作用及潜在治疗靶点 | 小鼠化学诱导的结肠炎模型中的细胞类型及其相互作用 | NA | 结肠炎 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 606 | 2024-08-07 |
Persistence of mature dendritic cells, TH2A, and Tc2 cells characterize clinically resolved atopic dermatitis under IL-4Rα blockade
2021-01-22, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abe2749
PMID:33483337
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研究论文 | 研究探讨了使用IL-4Rα阻断剂dupilumab治疗后，特应性皮炎（AD）患者皮肤中持久存在的特定免疫细胞群 | 首次发现即使在临床缓解后，特应性皮炎患者皮肤中仍存在成熟的树突状细胞、TH2A细胞和Tc2细胞，这些细胞可能与疾病的复发有关 | 研究仅限于短期和长期使用dupilumab治疗的患者，未涵盖其他治疗方案 | 探讨特应性皮炎治疗后皮肤中免疫记忆的持久性及其对疾病复发的影响 | 特应性皮炎患者和健康对照者的皮肤免疫细胞 | 免疫学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序和多重蛋白质组学 | NA | RNA和蛋白质 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 607 | 2024-08-07 |
Non-parametric modelling of temporal and spatial counts data from RNA-seq experiments
2021-11-05, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab486
PMID:34213536
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research paper | 本文介绍了GPcounts包，它使用负二项似然函数的GP回归方法来建模计数数据，通过变分贝叶斯推断提高计算效率。 | GPcounts包通过使用负二项似然函数和变分贝叶斯推断，能够处理大规模的单细胞和空间转录组数据，并能更好地识别过度分散的计数数据中的变化。 | NA | 开发一种能够有效处理大规模单细胞和空间转录组数据的非参数模型。 | 单细胞和空间转录组数据中的计数数据。 | machine learning | NA | RNA-seq | Gaussian process (GP) regression | counts data | NA |
| 608 | 2024-08-07 |
Congenital heart disease risk loci identified by genome-wide association study in European patients
2021-01-19, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI141837
PMID:33201861
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研究论文 | 本文通过全基因组关联研究（GWAS）在欧洲患者中识别与先天性心脏病（CHD）相关的遗传风险位点，并进行功能分析。 | 首次在欧洲患者群体中通过GWAS识别出与CHD相关的多个遗传风险位点，并通过体外和单细胞RNA测序分析揭示这些基因在心脏发育中的功能作用。 | 研究样本主要集中在欧洲患者，可能限制了结果的普遍性。 | 识别与先天性心脏病相关的遗传风险因素，并进行功能分析。 | 先天性心脏病患者和健康对照组的遗传变异。 | 遗传学 | 先天性心脏病 | 全基因组关联研究（GWAS） | NA | 基因数据 | 4034名白人CHD患者和8486名健康对照 |
| 609 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptional profiling reveals the heterogeneity in embryonal rhabdomyosarcoma
2021-Aug-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000026775
PMID:34397824
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术分析胚胎型横纹肌肉瘤的转录组异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了胚胎型横纹肌肉瘤的细胞异质性和进化轨迹 | NA | 探究胚胎型横纹肌肉瘤的异质性、起源和病因 | 胚胎型横纹肌肉瘤的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 儿童软组织肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个肿瘤组织细胞 |
| 610 | 2024-08-07 |
Deconvolution of cell type-specific drug responses in human tumor tissue with single-cell RNA-seq
2021-05-11, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-021-00894-y
PMID:33975634
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研究论文 | 本文通过结合急性切片培养中的多重药物扰动与单细胞RNA测序（scRNA-seq），研究了人类肿瘤组织中细胞类型特异性药物反应 | 首次使用scRNA-seq技术在单细胞水平上分析肿瘤组织中细胞类型特异性的药物敏感性 | 研究仅限于胶质母细胞瘤（GBM），可能需要进一步研究以验证其他类型肿瘤的适用性 | 旨在开发一种能够在患者肿瘤组织中直接快速筛选细胞类型特异性药物敏感性的平台 | 胶质母细胞瘤（GBM）患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 7个胶质母细胞瘤（GBM）切除样本 |
| 611 | 2024-08-07 |
Delayed induction of type I and III interferons mediates nasal epithelial cell permissiveness to SARS-CoV-2
2021-12-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27318-0
PMID:34876592
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析，探讨了SARS-CoV-2在人类鼻上皮细胞中的感染及其引发的I型和III型干扰素反应 | 首次详细描述了SARS-CoV-2感染鼻上皮细胞后I型和III型干扰素的延迟诱导现象，并探讨了重组干扰素作为化学预防策略的可能性 | NA | 研究SARS-CoV-2在鼻上皮细胞中的感染机制及其引发的免疫反应 | 人类鼻上皮细胞及其对SARS-CoV-2的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | RNA, 蛋白质 | NA |
| 612 | 2024-08-07 |
Application of Single-Cell Approaches to Study Myeloproliferative Neoplasm Biology
2021-04, Hematology/oncology clinics of North America
DOI:10.1016/j.hoc.2021.01.002
PMID:33641869
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综述 | 本文综述了利用多种新型单细胞技术研究人类疾病，特别是费城阴性骨髓增生性肿瘤（MPN）生物学的最新见解 | 应用单细胞基因组学、单细胞转录组学和数字病理学等新技术深入研究MPN生物学 | NA | 探讨MPN生物学的新见解 | 费城阴性骨髓增生性肿瘤（MPN） | 数字病理学 | 骨髓增生性肿瘤 | 单细胞技术 | NA | 基因组学数据、转录组学数据 | NA |
| 613 | 2024-08-07 |
Fibrinolysis influences SARS-CoV-2 infection in ciliated cells
2021-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2021.01.07.425801
PMID:33442688
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研究论文 | 研究分析了单细胞RNA测序数据，探讨了纤溶酶在SARS-CoV-2感染纤毛细胞中的作用及其与ENaC蛋白的相互作用 | 首次揭示了SARS-CoV-2通过与ENaC纤溶酶网络相互作用，加速病毒侵入易感细胞，并可能导致与ENaC相关的肺水肿呼吸状况 | NA | 探讨SARS-CoV-2感染纤毛细胞的机制及其与ENaC蛋白的相互作用 | 纤溶酶、ENaC蛋白、SARS-CoV-2受体ACE2在不同细胞类型中的表达 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及不同类型的上皮细胞和白细胞 |
| 614 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals key immune cell phenotypes in the lungs of patients with asthma exacerbation
2021-03, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2020.09.032
PMID:33039479
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了哮喘急性发作患者肺部关键免疫细胞表型 | 本研究首次在单细胞水平上识别了与哮喘急性发作强烈相关的候选基因，并揭示了多个细胞簇中共享的复杂分子框架 | NA | 旨在识别与哮喘急性发作在细胞水平上强烈相关的候选基因 | 哮喘急性发作患者及健康对照者的支气管肺泡灌洗液中的细胞 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 哮喘急性发作患者和健康对照者 |
| 615 | 2024-08-07 |
RNA-Scoop: interactive visualization of transcripts in single-cell transcriptomes
2021-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab105
PMID:34859209
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研究论文 | 本文介绍了RNA-Scoop，一个用于分析单细胞转录组中转录本使用情况的交互式细胞簇和转录组可视化工具 | RNA-Scoop允许用户检查不同簇之间的差异转录本表达，并研究特定转录本表达机制在细胞组中的变化 | NA | 开发一个工具来分析单细胞转录组中的转录本使用情况 | 单细胞转录组中的转录本使用情况 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 616 | 2024-08-07 |
ATR Inhibition Induces CDK1-SPOP Signaling and Enhances Anti-PD-L1 Cytotoxicity in Prostate Cancer
2021-09-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-1010
PMID:34168048
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研究论文 | 本研究探讨了ATR抑制剂与免疫检查点阻断疗法联合使用在去势抵抗性前列腺癌（CRPC）中的分子机制 | 发现ATR抑制剂直接抑制ATR-CHK1信号通路，激活CDK1-SPOP轴，导致PD-L1蛋白不稳定，从而增强免疫检查点阻断疗法的疗效 | NA | 揭示ATR抑制剂与免疫检查点阻断疗法在CRPC中的相互作用机制，为临床试验提供依据 | 去势抵抗性前列腺癌细胞和模型 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了前列腺癌细胞系和同基因的雄激素不敏感前列腺癌模型 |
| 617 | 2024-08-07 |
DIAPH1 Variants in Non-East Asian Patients With Sporadic Moyamoya Disease
2021-08-01, JAMA neurology
IF:20.4Q1
DOI:10.1001/jamaneurol.2021.1681
PMID:34125151
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研究论文 | 本研究通过全外显子测序分析了非东亚人群中散发的烟雾病（MMD）患者中的DIAPH1基因变异，以评估这些变异与MMD风险的相关性 | 发现了非东亚人群中散发的烟雾病患者中的DIAPH1基因致病变异，表明DIAPH1是MMD的一个新的风险基因 | 研究样本量较小，且主要集中在非东亚人群 | 评估超罕见的新发和罕见、有害的遗传变异是否与MMD风险相关 | 烟雾病患者及其父母 | 遗传学 | 脑血管疾病 | 全外显子测序 | NA | 基因组数据 | 发现队列包括24名患者（22个三联体和2名单体），验证队列包括84名患者（29个三联体和55名单体） |
| 618 | 2024-08-07 |
Tmem100- and Acta2-Lineage Cells Contribute to Implant Osseointegration in a Mouse Model
2021-05, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1002/jbmr.4264
PMID:33528844
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研究论文 | 本文研究了在小鼠模型中，Tmem100和Acta2谱系细胞如何促进金属植入物的骨整合 | 首次发现Pdgfra和Ly6a/Sca1表达的基质细胞（PαS细胞）在植入物周围骨形成中的作用 | NA | 确定参与金属植入物周围骨形成的特定骨髓基质细胞群 | Tmem100和Acta2谱系细胞在植入物骨整合中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠胫骨植入模型 |
| 619 | 2024-08-07 |
Multi-resolution characterization of molecular taxonomies in bulk and single-cell transcriptomics data
2021-09-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab552
PMID:34226941
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研究论文 | 本文介绍了一种名为K2Taxonomer的新型无监督递归分区算法及其相关的R包，该算法利用集成学习在类似分类结构的层次中识别稳健的子组 | K2Taxonomer算法能够适应不同的数据范式，适用于批量和单细胞转录组学以及其他‘组学’数据的分析 | NA | 开发一种新算法以在大型生物医学项目中高效识别分子亚型 | 批量和单细胞转录组学数据 | 组学 | 乳腺癌 | 转录组学 | 集成学习 | 转录组数据 | 包括模拟数据和人类组织数据，具体样本数量未明确 |
| 620 | 2024-08-07 |
Inhibitory CD161 receptor identified in glioma-infiltrating T cells by single-cell analysis
2021-03-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.01.022
PMID:33592174
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了31名IDH野生型胶质母细胞瘤和IDH突变型胶质瘤患者的肿瘤浸润T细胞的基因表达和克隆景观 | 首次揭示了胶质瘤浸润T细胞中CD161作为候选抑制性受体的表达，并证明了其作为免疫治疗靶点的潜力 | NA | 探索胶质瘤中T细胞的基因表达模式及其在癌症免疫治疗中的作用 | 胶质瘤浸润T细胞的基因表达和克隆景观 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 31名患者 |