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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-04-09 |
Visual Genomics Analysis Studio as a Tool to Analyze Multiomic Data
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.642012
PMID:34220932
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综述 | 本文介绍了Visual Genomics Analysis Studio (VGAS)这一集成应用，用于分析和可视化多组学单细胞数据，旨在帮助研究者无需高级生物信息学技能即可进行数据分析 | VGAS是一个用户友好的Windows图形界面应用，无需用户编程或高性能计算机，整合了性能优化的隐藏代码，提供快速直观的数据分析工具和高分辨率图形输出 | 本文作为综述，主要介绍VGAS的功能和应用，未涉及具体实验验证或性能对比数据 | 开发并推广一个集成工具，以降低多组学单细胞数据分析的技术门槛，促进免疫介导药物不良反应的研究 | 多组学单细胞数据，特别是单细胞TCR-RNA-CITE-seq数据，用于分析免疫细胞群 | 生物信息学 | 药物不良反应 | 单细胞TCR测序, 单细胞RNA测序, CITE-seq | NA | 多组学单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 42 | 2026-04-08 |
Uphyloplot2: visualizing phylogenetic trees from single-cell RNA-seq data
2021-Jun-05, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-021-07739-3
PMID:34090344
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研究论文 | 本文介绍了Uphyloplot2，一个用于从单细胞RNA-seq数据推断的CNV信息生成系统发育图的Python脚本工具 | 开发了一个自动化工具，直接从RNA-seq推断数据或Newick格式的树文件生成系统发育图，简化了肿瘤克隆性可视化的流程 | 工具依赖于外部CNV推断工具（如inferCNV、CaSpER、HoneyBADGER）的准确性，且未在多种肿瘤类型或大规模数据集上进行广泛验证 | 开发一个可视化工具，用于从单细胞RNA-seq数据中推断的染色体拷贝数变异（CNV）信息生成系统发育图，以展示肿瘤克隆性 | 单细胞RNA-seq数据推断的CNV信息或Newick格式的树文件 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA-seq（scRNA-seq）、染色体拷贝数变异（CNV）推断 | NA | 基因表达数据、CNV推断数据、树文件 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2026-04-08 |
Genetic pathways regulating hematopoietic lineage speciation: Factorial latent variable model analysis of single cell transcriptome
2021-Jun, Data in brief
IF:1.0Q3
DOI:10.1016/j.dib.2021.107080
PMID:34026977
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研究论文 | 本研究应用因子单细胞潜变量模型分析小鼠造血干细胞和祖细胞的单细胞转录组数据，以解析造血谱系分化的遗传调控通路 | 首次采用因子单细胞潜变量模型分解单细胞转录组异质性为可解释的生物学因子，动态揭示细胞命运调控机制 | 研究仅基于12周龄雌性小鼠的造血干细胞和祖细胞数据，样本来源和年龄性别范围有限 | 解析稳态造血过程中调控细胞谱系分化的遗传通路 | 小鼠造血干细胞和祖细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 因子单细胞潜变量模型 | 单细胞转录组测序数据 | 1,920个造血干细胞和祖细胞，来自12周龄雌性小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2026-04-08 |
Single cell RNA-seq analysis of the flexor digitorum brevis mouse myofibers
2021-05-17, Skeletal muscle
IF:5.3Q2
DOI:10.1186/s13395-021-00269-2
PMID:34001262
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研究论文 | 本研究开发并验证了一种通过流式分选分离完整骨骼肌肌纤维进行单细胞RNA测序的方法，以分析小鼠快肌纤维的基因表达模式 | 首次应用全细胞流式分选方法对单一肌肉类型（小鼠快肌屈趾短肌）进行单细胞RNA测序，而非基于单核RNA，扩展了纤维类型特异性基因的已知库 | 在763个肌纤维中，仅有171个细胞达到质量控制最优标准，样本利用率较低，可能影响统计效力 | 探索全细胞流式分选方法在单一肌肉类型单细胞RNA测序中的应用，以生成深度表达谱并识别纤维类型特异性基因 | 小鼠快肌屈趾短肌的完整和碎片化骨骼肌肌纤维 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式分选 | NA | RNA测序数据 | 763个完整和碎片化肌纤维，其中171个通过质量控制 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2026-04-07 |
Single-cell characterization of a model of poly I:C-stimulated peripheral blood mononuclear cells in severe asthma
2021-Apr-26, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-021-01709-9
PMID:33902571
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和质谱流式细胞术，表征了重症哮喘患者外周血单个核细胞在Poly I:C刺激下的免疫反应模型 | 首次结合两种互补的单细胞技术（DropSeq scRNA-Seq和CyTOF）来表征重症哮喘患者PBMCs对TLR3激动剂Poly I:C的反应，揭示了基线状态下的促炎特征和刺激后强烈的干扰素通路诱导 | 样本量相对较小（5名SA患者和3名健康对照），且为体外模型，可能无法完全反映体内复杂的免疫微环境 | 表征重症哮喘患者外周血单个核细胞对TLR3激动剂Poly I:C刺激的免疫反应，以评估哮喘相关的干扰素反应缺陷 | 重症哮喘患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 8名个体（5名重症哮喘患者，3名健康对照）的PBMCs；scRNA-Seq分析9414个细胞，CyTOF分析160,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | DropSeq | NA |
| 46 | 2026-04-07 |
Flexible comparison of batch correction methods for single-cell RNA-seq using BatchBench
2021-04-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab004
PMID:33524142
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研究论文 | 本文介绍了BatchBench，一个用于比较单细胞RNA-seq数据批次校正方法的模块化灵活流程 | 提出了一个系统化评估和比较批次校正方法的开源工具，通过整合多个数据集进行性能分析 | 仅评估了八种方法，可能未涵盖所有现有技术，且依赖于特定数据集 | 比较和评估单细胞RNA-seq数据批次校正方法的性能 | 单细胞RNA-seq数据集和批次校正算法 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 多个已研究的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2026-04-07 |
A flexible microfluidic system for single-cell transcriptome profiling elucidates phased transcriptional regulators of cell cycle
2021-04-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-86070-z
PMID:33846365
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Nadia Instrument的灵活、经济高效且用户友好的基于液滴的微流控系统，用于单细胞转录组分析，并展示了其在细胞周期研究中的应用 | 开发了一种新型微流控系统，具有高重现性液滴大小、低双联体率和高mRNA捕获效率，且可通过Nadia Innovate模块实现灵活配置，支持不同缓冲液和条形码珠设置 | 未明确提及系统在更大规模样本或更复杂组织类型中的验证，以及与其他现有平台的直接比较数据 | 开发并验证一种用于单细胞转录组分析的微流控系统，以促进细胞分辨率下的转录组学研究 | 异步人类和小鼠细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA序列数据 | 约50,000个单细胞或细胞核 | NA | 单细胞RNA-seq | Nadia Instrument | 基于液滴的微流控系统，支持3' mRNA捕获，可与Nadia Innovate模块结合使用 |
| 48 | 2026-04-07 |
CD11c+CD88+CD317+ myeloid cells are critical mediators of persistent CNS autoimmunity
2021-04-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2014492118
PMID:33785592
|
研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型和单细胞RNA测序技术，揭示了CD11c+CD88+CD317+髓系细胞在持续性中枢神经系统自身免疫中的关键作用 | 首次鉴定出CD11c+CD88+CD317+髓系细胞亚群是中枢神经系统自身免疫的关键介质，并证明抗CD317治疗能显著改善实验性自身免疫性脑脊髓炎 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；单细胞测序样本量相对较小 | 探究α4-整合素在CD11c+细胞中的特异性缺失对实验性自身免疫性脑脊髓炎的影响，并鉴定关键致病细胞亚群 | CD11c.Cre C57BL/6基因工程小鼠、野生型对照小鼠、人类脑脊液样本 | 免疫学 | 多发性硬化症/实验性自身免疫性脑脊髓炎 | 单细胞RNA测序、多参数流式细胞术、基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 | 基因工程小鼠模型（具体数量未明确）、人类脑脊液样本（数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2026-04-07 |
Targeted Single-Cell RNA-seq Identifies Minority Cell Types of Kidney Distal Nephron
2021-Apr, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020101407
PMID:33769948
|
研究论文 | 本研究通过结合FACS富集与单细胞RNA-seq技术，分析了小鼠肾脏远端肾单位中9099个细胞的转录组，揭示了DCT和CTAL细胞亚型的多样性 | 首次在单细胞水平上系统识别了肾脏远端肾单位中的少数细胞类型，包括DCT1和DCT2的异质性以及三种不同的CTAL亚型，并发现了新的转录因子表达模式 | 研究仅基于小鼠模型，未涉及人类样本；单细胞RNA-seq可能无法完全捕获低丰度转录本；功能验证实验有限 | 探索肾脏远端肾单位中少数细胞类型的转录组多样性及其在水分和电解质平衡中的作用 | 小鼠肾脏厚壁升支（CTAL）和远端曲小管（DCT）区域的细胞 | 单细胞转录组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA-seq，FACS（荧光激活细胞分选） | 无监督聚类分析 | 转录组数据 | 9099个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 50 | 2026-04-06 |
Estrogen receptor alpha in the brain mediates tamoxifen-induced changes in physiology in mice
2021-03-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.63333
PMID:33647234
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了雌激素受体α（ERα）在小鼠下丘脑和前视区介导他莫昔芬治疗引起的生理变化 | 首次利用单细胞RNA测序技术揭示他莫昔芬对下丘脑-前视区基因表达的影响，并证明ERα在此过程中的关键介导作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探究他莫昔芬治疗引起的副作用机制 | 小鼠 | 单细胞测序 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 51 | 2026-04-06 |
Whole-body senescent cell clearance alleviates age-related brain inflammation and cognitive impairment in mice
2021-02, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13296
PMID:33470505
|
研究论文 | 本研究通过清除老年小鼠体内的衰老细胞，减轻了大脑炎症并改善了认知功能 | 首次证明在正常衰老过程中清除衰老细胞可以改善认知功能障碍，并发现衰老细胞在小胶质细胞和少突胶质前体细胞中显著增加 | 研究仅在INK-ATTAC转基因小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探究清除衰老细胞是否能缓解衰老过程中的认知功能障碍 | 年轻和老年小鼠的海马体组织 | 单细胞组学 | 老年疾病 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | INK-ATTAC转基因小鼠模型 | RNA测序数据 | 年轻和老年小鼠的海马体组织 | NA | 单核RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2026-04-04 |
No detectable alloreactive transcriptional responses under standard sample preparation conditions during donor-multiplexed single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells
2021-01-20, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-020-00941-x
PMID:33472616
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研究论文 | 本研究评估了在标准单细胞RNA测序样本制备条件下，混合来自无关供体的外周血单个核细胞是否会引起同种异体反应性转录响应 | 首次系统评估了在标准scRNA-seq样本制备条件下混合无关供体PBMCs是否会引起同种异体反应性基因表达变化，并识别了与PBMC制备方法和样本多重标记技术相关的技术假象 | 研究仅评估了30分钟4°C共孵育条件，未测试更长时间或不同温度条件；主要关注CD4+ T细胞中的同种异体反应性标记 | 评估样本多重技术在单细胞RNA测序中混合无关供体PBMCs时是否引入同种异体反应性假象，为横向免疫学研究建立基准 | 外周血单个核细胞（PBMCs） | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 单个供体PBMCs与无关供体PBMCs混合实验，并分析了公开可用的scRNA-seq数据集 | 10x Genomics, BD Biosciences | 单细胞RNA-seq, 样本多重技术 | 10x Genomics scRNA-seq平台, BD单细胞多重试剂盒（SCMK） | 10x Genomics单细胞RNA测序平台结合MULTI-seq和/或BD SCMK标记技术 |
| 53 | 2026-04-04 |
CSEA-DB: an omnibus for human complex trait and cell type associations
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa1064
PMID:33211888
|
研究论文 | 本文介绍了CSEA-DB数据库，一个用于人类复杂性状与细胞类型关联的综合性资源库 | 整合了5120个GWAS汇总统计数据与超过90万个单细胞转录组数据，通过deTS算法进行了超过1000万次性状-细胞类型关联分析，首次构建了大规模的人类复杂性状与细胞类型特异性关联图谱 | 数据库依赖现有GWAS和单细胞数据的质量和覆盖范围，可能未涵盖所有组织或细胞类型 | 构建一个参考数据库，用于解析人类复杂性状与细胞类型特异性之间的遗传关联 | 人类复杂性状和疾病相关的遗传变异及细胞类型 | 生物信息学 | 复杂疾病 | GWAS, 单细胞转录组测序 | deTS算法 | GWAS汇总统计数据, 单细胞RNA-seq数据 | 超过900,000个细胞，涵盖71个成人和胎儿组织的752种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 54 | 2026-04-03 |
A Role for Protease Activated Receptor Type 3 (PAR3) in Nociception Demonstrated Through Development of a Novel Peptide Agonist
2021-06, The journal of pain
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jpain.2020.12.006
PMID:33429107
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研究论文 | 本研究通过开发一种新型肽激动剂C660，探讨了蛋白酶激活受体3（PAR3）在痛觉感知中的作用 | 开发了选择性激活PAR3的脂质锚定激动剂C660，并首次在体内证明了PAR3对机械超敏和痛觉可塑性的贡献 | 研究主要基于小鼠模型，PAR3在人类痛觉中的具体作用仍需进一步验证 | 探究PAR3在外周感觉神经系统中的功能及其在痛觉调节中的作用 | 小鼠背根神经节神经元和三叉神经神经元 | 神经科学 | 疼痛相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠背根神经节神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2026-03-15 |
Barcoded viral tracing of single-cell interactions in central nervous system inflammation
2021-04-23, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abf1230
PMID:33888612
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研究论文 | 本研究开发了RABID-seq技术，结合条形码病毒追踪和单细胞RNA测序，以研究中枢神经系统炎症中的单细胞相互作用 | 开发了RABID-seq技术，首次将条形码病毒追踪与单细胞RNA测序结合，用于在体内研究星形胶质细胞相互作用，并识别了介导小胶质细胞-星形胶质细胞相互作用的候选分子 | NA | 研究中枢神经系统炎症中细胞间相互作用，特别是小胶质细胞与星形胶质细胞之间的互作机制 | 星形胶质细胞、小胶质细胞及其在中枢神经系统炎症模型中的相互作用 | 数字病理学 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 56 | 2026-03-10 |
Single-cell RNA sequencing in human lung cancer: Applications, challenges, and pathway towards personalized therapy
2021-06-01, Journal of the Chinese Medical Association : JCMA
IF:1.9Q2
DOI:10.1097/JCMA.0000000000000535
PMID:33883467
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在人类肺癌研究中的应用、挑战及其在推动个性化治疗发展中的潜力 | 填补了现有综述的空白，全面总结了scRNA-seq在肺癌研究中的广泛应用，并探讨了其在个性化癌症治疗中的未来应用与挑战 | NA | 总结scRNA-seq在人类肺癌研究中的各种应用，并探讨其在促进未来个性化癌症治疗发展中的潜力与挑战 | 人类肺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 57 | 2026-03-06 |
A Spatial Quantitative Systems Pharmacology Platform spQSP-IO for Simulations of Tumor-Immune Interactions and Effects of Checkpoint Inhibitor Immunotherapy
2021-Jul-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13153751
PMID:34359653
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研究论文 | 本文介绍了一个名为spQSP-IO的混合计算模型平台，用于模拟肿瘤-免疫相互作用及检查点抑制剂免疫疗法的效果 | 开发了结合定量系统药理学模型和基于代理的空间模型的新平台，以整合空间数据并增强预测能力 | 未明确提及具体数据限制或模型验证的局限性 | 研究肿瘤微环境和癌症-免疫细胞相互作用在肿瘤发展中的作用，并评估抗PD-1治疗的效果 | 非小细胞肺癌的虚拟患者模型 | 机器学习 | 肺癌 | 定量系统药理学模型、基于代理的模型、空间转录组学 | 混合计算模型 | 空间数据、成像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 58 | 2026-03-06 |
Fxr signaling and microbial metabolism of bile salts in the zebrafish intestine
2021-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abg1371
PMID:34301599
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研究论文 | 本研究通过斑马鱼模型，揭示了胆汁盐代谢和Fxr信号通路在非哺乳类脊椎动物中的保守性及微生物修饰作用 | 首次在斑马鱼中系统解析了胆汁盐合成、转运及微生物修饰的全过程，并利用单细胞RNA测序构建了肠道上皮细胞图谱，明确了Fxr在回肠及其他细胞类型中的转录调控功能 | 研究主要基于斑马鱼模型，结果向哺乳动物的直接推演可能存在物种差异，且微生物修饰的具体机制仍需进一步探索 | 探究非哺乳类脊椎动物中胆汁盐代谢和Fxr信号通路的保守性与调控机制 | 斑马鱼的肝脏、肠道及肠道微生物 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 59 | 2026-03-06 |
Testicular germ cell tumors arise in the absence of sex-specific differentiation
2021-05-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.197111
PMID:33912935
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研究论文 | 本研究探讨了睾丸生殖细胞肿瘤的起源机制，发现NANOS2缺失导致生殖细胞无法进行性别特异性分化，从而驱动肿瘤发生 | 揭示了NANOS2作为关键内在因子，在连接遗传风险因素与肿瘤易感性中的核心作用，并首次通过单细胞RNA测序和谱系追踪证明胚胎癌细胞仅来源于NANOS2缺失的生殖细胞 | 研究基于小鼠模型（129.MOLF-Chr19），可能不完全反映人类睾丸生殖细胞肿瘤的复杂性 | 探究睾丸生殖细胞肿瘤的起始机制，特别是性别特异性分化失败在肿瘤发生中的作用 | 小鼠睾丸生殖细胞，包括NANOS2缺失的生殖细胞和胚胎癌细胞 | 生殖生物学与肿瘤学 | 睾丸生殖细胞肿瘤 | 单细胞RNA测序，谱系追踪实验 | NA | RNA测序数据 | 使用129.MOLF-Chr19小鼠模型和NANOS2报告等位基因 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2026-03-05 |
SARS-CoV-2 infection of the pancreas promotes thrombofibrosis and is associated with new-onset diabetes
2021-08-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.151551
PMID:34241597
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研究论文 | 本文研究了SARS-CoV-2感染胰腺与血栓纤维化及新发糖尿病之间的关联 | 首次通过单细胞RNA测序和免疫定位技术，在非人灵长类动物和人类中证实SARS-CoV-2可直接感染胰腺细胞，并揭示其与血栓纤维化及新发糖尿病的潜在机制 | 样本量较小（8只非人灵长类动物和5名COVID-19患者），且为观察性研究，因果关系需进一步验证 | 探究SARS-CoV-2感染是否直接导致胰腺功能障碍及新发糖尿病 | 非人灵长类动物和人类胰腺组织 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序，免疫定位 | NA | RNA测序数据，组织图像 | 8只非人灵长类动物和5名COVID-19患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |