单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-09-30 |
Single-cell multi-omics sequencing: application trends, COVID-19, data analysis issues and prospects
2021-11-05, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab229
PMID:34111889
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综述 | 本文综述了单细胞多组学测序技术的最新进展及其在理解复杂疾病（特别是COVID-19）中的应用，并总结了用于分析多层异质数据的相关机器学习和生物信息学技术 | 本文介绍了变分推断和基于图的学习方法在单细胞多组学数据分析中的应用，并讨论了Seurat V3等常用工具在处理缺失变量和标签中的作用 | 本文主要讨论了数据一致性和多样性问题，以及数据对错误校正和数据插补方法的关注，但未深入探讨具体的解决方案 | 综述单细胞多组学测序技术的发展及其在复杂疾病研究中的应用，并探讨相关的数据分析问题和未来展望 | 单细胞多组学测序技术及其在COVID-19等复杂疾病中的应用 | 生物信息学 | 传染病 | 单细胞多组学测序 | NA | 多层异质数据 | NA |
| 42 | 2024-09-30 |
Integration of Transformative Platforms for the Discovery of Causative Genes in Cardiovascular Diseases
2021-06, Cardiovascular drugs and therapy
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10557-021-07175-1
PMID:33856594
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综述 | 本文综述了利用基因组关联研究（GWAS）和其他多学科技术平台整合，以发现心血管疾病致病基因的最新进展 | 本文强调了通过多学科团队整合遗传发现与多种技术平台，展示了这种方法的变革潜力 | NA | 探讨心血管疾病致病基因的发现及其机制 | 心血管疾病及其相关基因和变异 | 基因组学 | 心血管疾病 | 基因组关联研究（GWAS）、RNA测序、代谢组学、表观基因组学 | NA | 基因数据、RNA数据、代谢数据 | NA |
| 43 | 2024-09-30 |
Longitudinal proteomic analysis of severe COVID-19 reveals survival-associated signatures, tissue-specific cell death, and cell-cell interactions
2021-05-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100287
PMID:33969320
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研究论文 | 本文通过纵向蛋白质组分析严重COVID-19患者，揭示了与生存相关的蛋白质特征、组织特异性细胞死亡和细胞间相互作用 | 本文首次通过大规模蛋白质组数据和单细胞RNA测序数据的联合分析，揭示了严重COVID-19患者的免疫和非免疫蛋白质特征，并提出了细胞间相互作用驱动组织损伤的模型 | 本文的样本量相对较小，且仅限于COVID-19患者和症状性对照组，可能限制了结果的普适性 | 揭示严重COVID-19疾病的潜在机制 | COVID-19患者的血浆蛋白质组和细胞间相互作用 | NA | COVID-19 | 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质数据、单细胞RNA测序数据 | 306名COVID-19患者和78名症状性对照组 |
| 44 | 2024-09-30 |
Cellular Complexity of Hemochorial Placenta: Stem Cell Populations, Insights from scRNA-seq, and SARS-CoV-2 Susceptibility
2021, Current stem cell reports
IF:2.3Q4
DOI:10.1007/s40778-021-00194-6
PMID:34697582
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在研究胎盘细胞类型特异性基因表达模式中的应用，并探讨了SARS-CoV-2感染的潜在性 | 利用单细胞RNA测序技术深入研究了胎盘细胞的基因表达模式，并结合人类胎盘数据探讨了SARS-CoV-2感染的可能性 | 需要进一步研究评估胎盘干细胞在开发新疗法中的应用 | 探讨胎盘发育及其在母胎医学中的重要性 | 胎盘的祖细胞群体及其基因表达模式 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及从胚胎第7天到第12.5天的多个小鼠胎盘样本及部分人类胎盘样本 |
| 45 | 2024-09-28 |
Discovering Cellular Mitochondrial Heteroplasmy Heterogeneity with Single Cell RNA and ATAC Sequencing
2021-Jun-05, Biology
DOI:10.3390/biology10060503
PMID:34198745
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序技术研究细胞线粒体异质性的方法 | 本文首次系统性地综述了单细胞测序技术在研究细胞线粒体异质性方面的应用 | 当前方法在研究线粒体异质性方面存在局限性，未来需要进一步解决 | 探讨单细胞测序技术在研究细胞线粒体异质性中的应用 | 细胞线粒体异质性 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | 基因组数据 | 数千个细胞 |
| 46 | 2024-09-27 |
Embryonic Origin and Subclonal Evolution of Tumor-Associated Macrophages Imply Preventive Care for Cancer
2021-04-14, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10040903
PMID:33919979
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研究论文 | 研究肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的起源和亚克隆进化，并探讨其在癌症预防中的潜在作用 | 提出了TAMs的胚胎起源和亚克隆进化模型，揭示了TAMs的功能异质性与微环境提示和代谢重塑的关系 | NA | 探讨TAMs的起源和功能异质性，以及其在癌症发展中的作用 | 肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）及其在癌症中的作用 | 生物医学 | 癌症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 47 | 2024-09-25 |
Epithelial cell plasticity drives endoderm formation during gastrulation
2021-07, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-021-00694-x
PMID:34168324
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研究论文 | 本文研究了在原肠胚形成过程中，上皮细胞可塑性驱动内胚层形成的过程 | 本文首次揭示了内胚层的形成独立于经典的EMT过程，而是通过上皮细胞可塑性机制实现的，并发现Foxa2作为上皮门控因子抑制EMT | NA | 揭示原肠胚形成过程中内胚层形成的分子机制 | 胚胎干细胞和鼠胚胎 | NA | NA | 高分辨率单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 48 | 2024-09-25 |
The Dynamic Counterbalance of RAC1-YAP/OB-Cadherin Coordinates Tissue Spreading with Stem Cell Fate Patterning
2021-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202004000
PMID:34026448
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研究论文 | 研究了RAC1-YAP与OB-cadherin之间的动态平衡在协调组织扩散与干细胞命运模式中的作用 | 揭示了RAC1-YAP与OB-cadherin之间的动态平衡在协调组织扩散与干细胞命运模式中的关键作用，并通过单细胞测序和体内伤口愈合实验验证了这一机制 | NA | 探讨分子信号如何在多细胞组织的扩散动态和细胞命运承诺中起作用 | 胚胎发育和再生医学中的组织扩散 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞迁移轨迹分析 | NA |
| 49 | 2024-09-21 |
The current landscape of single-cell transcriptomics for cancer immunotherapy
2021-01-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20201574
PMID:33601414
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在癌症免疫治疗中的最新进展 | 单细胞RNA测序揭示了新的关键因素和细胞亚群，这些因素和亚群要么促进肿瘤进展，要么使肿瘤对免疫治疗敏感 | NA | 探讨单细胞转录组学在癌症免疫治疗中的应用 | 肿瘤微环境和免疫系统 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 50 | 2024-09-19 |
Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat
2021-02-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21246-9
PMID:33597522
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CellChat的工具，用于从单细胞RNA测序数据中推断和分析细胞间通信网络 | 开发了CellChat工具，能够准确表示细胞间信号连接并进行系统级分析，预测细胞的主要信号输入和输出，并通过网络分析和模式识别方法协调细胞和信号的功能 | NA | 理解和分析细胞间的全局通信 | 细胞间信号连接和通信网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括小鼠和人类皮肤数据集 |
| 51 | 2024-09-16 |
Whole-animal multiplexed single-cell RNA-seq reveals transcriptional shifts across Clytia medusa cell types
2021-Nov-26, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abh1683
PMID:34826233
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研究论文 | 本文介绍了水螅水母的整个生物体的转录组细胞图谱，并描述了其组成细胞类型对扰动的响应 | 本文引入了高分辨率、全生物体、多重单细胞基因组学的工作流程，适用于其他传统或非传统模式生物 | NA | 研究水螅水母细胞类型对扰动的响应 | 水螅水母的细胞类型及其对扰动的响应 | 基因组学 | NA | 多重单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 多个水螅水母样本，包括对照和扰动条件 |
| 52 | 2024-09-16 |
Macrophages orchestrate the expansion of a proangiogenic perivascular niche during cancer progression
2021-Nov-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abg9518
PMID:34730997
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研究论文 | 研究肿瘤相关巨噬细胞在癌症进展中调控血管周围微环境的作用 | 首次揭示了Lyve-1阳性巨噬细胞在维持血管周围间充质细胞群体中的关键作用，并阐明了其通过调控血小板衍生生长因子-CC依赖的血管周围间充质细胞扩增，促进血管生成微环境的形成 | 研究基于自发的小鼠乳腺腺癌模型，结果的临床转化性有待进一步验证 | 探讨肿瘤相关巨噬细胞在癌症进展中的作用机制 | 肿瘤相关巨噬细胞及其在血管生成中的作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自自发小鼠乳腺腺癌模型的肿瘤相关巨噬细胞样本 |
| 53 | 2024-09-13 |
The co-chaperone Fkbp5 shapes the acute stress response in the paraventricular nucleus of the hypothalamus of male mice
2021-07, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-021-01044-x
PMID:33649453
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研究论文 | 研究探讨了FKBP5在雄性小鼠下丘脑室旁核中对急性应激反应的调节作用 | 首次揭示了Fkbp5在下丘脑室旁核中对HPA轴活性的细胞类型特异性影响 | 研究仅限于雄性小鼠，未探讨雌性小鼠的情况 | 阐明Fkbp5在下丘脑室旁核中对HPA轴和急性应激反应的调节机制 | 雄性小鼠的下丘脑室旁核中的Fkbp5表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 雄性小鼠样本 |
| 54 | 2024-09-10 |
Early IFN-α signatures and persistent dysfunction are distinguishing features of NK cells in severe COVID-19
2021-11-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.09.002
PMID:34592166
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研究论文 | 研究分析了205名COVID-19患者中自然杀伤细胞（NK细胞）的单细胞转录组和蛋白质组学特征，发现早期严重COVID-19中IFN-α水平升高与NK细胞功能障碍相关 | 首次详细描述了严重COVID-19中NK细胞的早期IFN-α信号特征及其与疾病结果的关联 | 研究样本量有限，且未涵盖所有可能的COVID-19病例类型 | 探讨COVID-19中先天免疫系统的动态变化及其与疾病严重程度的关系 | COVID-19患者的自然杀伤细胞（NK细胞） | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组学和蛋白质组学 | NA | 基因表达数据和蛋白质数据 | 205名患者，403个样本 |
| 55 | 2024-09-10 |
Protective heterologous T cell immunity in COVID-19 induced by the trivalent MMR and Tdap vaccine antigens
2021-09-10, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2021.08.004
PMID:34414383
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研究论文 | 研究MMR和Tdap疫苗抗原是否通过诱导交叉反应性T细胞来减轻COVID-19的严重程度 | 发现MMR和Tdap疫苗诱导的记忆T细胞可以被SARS-CoV-2重新激活，从而提供对严重COVID-19的保护 | NA | 研究MMR和Tdap疫苗是否通过诱导交叉反应性T细胞来减轻COVID-19的严重程度 | COVID-19康复者、未感染者和COVID-19 mRNA疫苗接种者的T细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 酶联免疫吸附试验（ELISA）、酶联免疫斑点试验（ELISpot）、流式细胞术、TCR克隆型分析、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | T细胞、细胞因子 | COVID-19康复者、未感染者和COVID-19 mRNA疫苗接种者的T细胞样本 |
| 56 | 2024-09-10 |
A modified vaccinia Ankara vector-based vaccine protects macaques from SARS-CoV-2 infection, immune pathology, and dysfunction in the lungs
2021-03-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.02.001
PMID:33631118
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研究论文 | 研究了基于改良安卡拉痘苗（MVA）载体的疫苗对SARS-CoV-2感染的保护作用 | 首次展示了MVA/S疫苗在非人灵长类动物中诱导强效中和抗体和CD8 T细胞反应，并有效保护免受SARS-CoV-2感染和肺部病理损伤 | 研究仅限于非人灵长类动物模型，尚未在人类中进行验证 | 评估基于MVA载体的疫苗对SARS-CoV-2感染的保护效果 | SARS-CoV-2感染的非人灵长类动物 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 研究涉及小鼠和非人灵长类动物 |
| 57 | 2024-09-10 |
Embryonic lethality and defective mammary gland development of activator-function impaired conditional knock-in Erbb3 V943R mice
2021-Mar, Advanced genetics (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/ggn2.10036
PMID:36618440
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研究论文 | 研究了ERBB3 V943R条件性敲入小鼠模型的胚胎致死性和乳腺发育缺陷 | 首次报道了ERBB3 V943R条件性敲入小鼠模型，并研究了其对胚胎发育和乳腺发育的影响 | 仅限于小鼠模型，未涉及人类或其他物种的研究 | 研究ERBB3 V943R突变对小鼠胚胎发育和乳腺发育的影响 | ERBB3 V943R条件性敲入小鼠 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及多个小鼠样本，具体数量未明确 |
| 58 | 2024-09-08 |
Cell-type specific analysis of physiological action of estrogen in mouse oviducts
2021-05, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202002747R
PMID:33818810
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研究论文 | 研究评估了雌激素对小鼠输卵管中不同细胞类型的生理作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析雌激素对小鼠输卵管中不同细胞类型的影响 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未完全验证在人类中的适用性 | 探讨雌激素在体内对输卵管环境的具体调控机制 | 小鼠输卵管中的不同细胞类型 | 生殖生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用卵巢切除-激素替代小鼠模型进行研究 |
| 59 | 2024-09-07 |
Lymph nodes are innervated by a unique population of sensory neurons with immunomodulatory potential
2021-01-21, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.11.028
PMID:33333021
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研究论文 | 研究揭示了淋巴结中存在一种独特的具有免疫调节潜力的感觉神经元群体，并探讨了其功能和机制 | 首次发现并验证了淋巴结中存在一种独特的感觉神经元群体，这些神经元能够响应淋巴中的炎症信号，并通过神经-免疫回路调节淋巴结功能 | 研究主要集中在体外实验和单细胞转录组分析，缺乏体内功能验证和长期效应的研究 | 探讨感觉神经元在淋巴结功能调节中的机制和重要性 | 淋巴结中的感觉神经元及其与免疫细胞的相互作用 | NA | NA | 高分辨率成像、病毒示踪、单细胞转录组学、光遗传学 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个感觉神经元亚群和淋巴结中的多种细胞类型 |
| 60 | 2024-09-07 |
Intracellular and Intercellular Gene Regulatory Network Inference From Time-Course Individual RNA-Seq
2021, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2021.777299
PMID:36303726
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研究论文 | 本文研究了从时间序列单个RNA-Seq数据中推断细胞内和细胞间基因调控网络的方法 | 本文提出了一种基于时间序列批量RNA-Seq数据推断基因调控网络的方法，能够揭示多细胞生物中的细胞间调控关系 | 本文仅使用了小鼠早期发育阶段的RNA-Seq数据，未来研究可以扩展到其他物种和发育阶段 | 研究多细胞生物中细胞内和细胞间基因调控网络的推断方法 | 小鼠早期发育阶段的基因调控网络 | 基因组学 | NA | RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠胚胎 |