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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2024-08-07 |
STAB: a spatio-temporal cell atlas of the human brain
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa762
PMID:32976581
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为STAB的时空细胞图谱数据库，该数据库包含人类大脑多个区域和发育时期的单细胞转录组数据 | STAB数据库提供了人类大脑在生命周期中动态细胞组成和分子特征的全面数据，填补了现有研究的空白 | NA | 旨在阐明大脑的细胞和转录组结构，以理解大脑功能和脑部疾病 | 人类大脑的细胞组成和转录组结构 | 数字病理学 | 神经精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包含42种细胞亚型，跨越20个大脑区域和11个发育时期 | NA | NA | NA | NA |
| 522 | 2024-08-07 |
Bi-FoRe: an efficient bidirectional knockin strategy to generate pairwise conditional alleles with fluorescent indicators
2021-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-020-00747-1
PMID:32681448
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Bi-FoRe的高效双向敲入策略，用于生成带有荧光指示器的成对条件性等位基因 | 首次报道了通过单一供体生成具有条件性和基因标记双重功能的成对双功能敲入等位基因 | NA | 开发一种新的策略，用于基因表达标记和基因功能的条件性调控 | zebrafish中的sox10和isl1基因座 | 基因工程 | NA | CRISPR/Cas系统 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 523 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling and the use of AID deficient mice reveal that B cell activation combined with antibody class switch recombination and somatic hypermutation do not benefit the control of experimental trypanosomosis
2021-11, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1010026
PMID:34762705
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研究论文 | 本文研究了在AID缺失小鼠中B细胞活化与抗体类别转换和体细胞高突变对实验性锥虫病控制的影响 | 首次在锥虫感染小鼠的脾细胞上应用scRNA-seq分析，揭示了自然IgM在抗锥虫感染中的独特作用 | 研究主要集中在鼠模型中，可能无法完全反映人类感染的复杂性 | 探讨锥虫感染中B细胞的作用及其对宿主免疫反应的影响 | 锥虫感染的小鼠脾细胞及其B细胞反应 | 数字病理学 | 锥虫病 | scRNA-seq、流式细胞术、ELISA | NA | 细胞 | 锥虫感染的老鼠脾细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 524 | 2024-08-05 |
In silico analysis suggests disruption of interactions between HAMP from hepatocytes and SLC40A1 from macrophages in hepatocellular carcinoma
2021-May-17, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-021-00977-0
PMID:34001107
|
研究论文 | 本研究通过分析HCC微环境中的细胞之间的相互作用，探讨肝癌的增殖机制 | 首次揭示了HAMP与SLC40A1之间的相互作用在肝细胞癌异常增殖中的重要性 | 尚需通过湿实验进行进一步验证 | 识别肝细胞癌及其旁癌组织中的增殖性肝细胞，并探讨其异常增殖的潜在作用 | 增殖性肝细胞及其在HCC和旁癌组织中的基因表达特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了来自HCC及其旁癌组织的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 525 | 2024-08-05 |
Taming human brain organoids one cell at a time
2021-03, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2020.05.022
PMID:32718852
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review | 本综述总结了单细胞转录组技术在解析人脑类器官复杂性方面的最新方法、进展和挑战 | 文章创新在于整合了单细胞转录组学和新兴技术，以深入研究人脑发展和疾病特征 | 文章没有讨论具体的应用案例和局限性 | 研究人脑类器官的复杂性及其在发育过程中的基因调控 | 人脑类器官，特别是它们的细胞组成和发育起源 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 526 | 2024-08-05 |
Novel method to repair articular cartilage by direct reprograming of prechondrogenic mesenchymal stem cells
2021-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2021.174416
PMID:34606836
|
研究论文 | 本研究提出了一种通过直接重编程前软骨源间充质干细胞来修复关节软骨的新方法 | 本研究创新性地利用外部电场促进前软骨形成，而无需基因修饰或外源性因子 | 本研究未提到对动物模型的长期应用效果 | 旨在提高用于修复软骨缺损的软骨细胞的生成效率 | 使用犬的脂肪来源间充质干细胞（ADSCs）作为研究对象 | 数字病理学 | NA | 电刺激（ES） | NA | 单细胞RNA测序分析 | 犬的ADSC微团 | NA | NA | NA | NA |
| 527 | 2024-08-05 |
Significance and limitations of the use of next-generation sequencing technologies for detecting mutational signatures
2021-Nov, DNA repair
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.dnarep.2021.103200
PMID:34411908
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综述 | 本文探讨了不同的下一代测序技术在检测突变特征中的重要性和限制 | 文章总结了多种下一代测序技术的应用及其固有的测序偏见与技术伪影 | 每种测序技术都有其固有的偏见和可能产生的技术伪影，这可能影响突变特征的可靠提取 | 研究不同下一代测序技术检测突变模式及解读突变特征的相关性和前景 | 聚焦于人类癌症的突变特征及其与环境因素和DNA修复通路的关系 | 数字病理学 | 肿瘤 | 下一代测序技术（NGS） | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 528 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome atlas of the leaf and root of rice seedlings
2021-Oct-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2021.06.001
PMID:34340913
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了水稻幼苗的叶子和根部的转录组特征 | 首次构建了水稻幼苗的单细胞转录组图谱，并揭示了细胞类型特异的转录响应与环境刺激之间的关系 | 目前的研究仅关注于特定的环境胁迫下的转录组特征，可能未涵盖所有可能的应激条件 | 研究水稻幼苗在不同环境刺激下的单细胞转录组特征及其细胞特异性响应 | 水稻幼苗的237,431个个体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 237,431个个体细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 529 | 2024-08-05 |
Tissue-specific smooth muscle cell subtypes identified by transcriptional profiling
2021-Oct, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2021.106055
PMID:34411694
|
研究论文 | 本文研究了不同组织中特定平滑肌细胞(SMCs)的转录组特征 | 识别了平滑肌细胞的新亚型并揭示其在不同组织内的功能多样性 | 研究基于小鼠数据，可能不完全适用于人类 | 探讨特定平滑肌细胞的转录组特征及其适应性 | 提取了来源于八种小鼠组织的平滑肌细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 八种小鼠组织的平滑肌细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 530 | 2024-08-05 |
Implication of specific retinal cell-type involvement and gene expression changes in AMD progression using integrative analysis of single-cell and bulk RNA-seq profiling
2021-Aug-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-95122-3
PMID:34341398
|
研究论文 | 本研究分析了与年龄相关性黄斑变性（AMD）进展相关的特定视网膜细胞类型及基因表达变化 | 本研究首次结合单细胞RNA测序和大量RNA测序深入探讨了视网膜疾病的分子机制，识别了267个细胞类型特异基因 | 研究对象仅包括两名成人供体的视网膜细胞，样本限制可能影响结果的广泛适用性 | 探讨AMD进展过程中的细胞类型组成和基因表达变化 | 来自两名成人供体的视网膜细胞及十五名成人供体的RNA样本 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序和大规模RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约93,000个细胞和15名成人供体的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 531 | 2024-08-05 |
XenoCell: classification of cellular barcodes in single cell experiments from xenograft samples
2021-Jan-29, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-021-00872-8
PMID:33514375
|
研究论文 | 本文开发了XenoCell，一个用于单细胞实验的细胞条形码分类工具 | XenoCell是第一个独立的预处理工具，能够快速可靠地分类来自宿主和移植物的细胞条形码 | 在处理混合物种细胞实验时可能仍存在一定的挑战，尤其在高复杂性的样本中 | 研究旨在提高在异种移植样本中准确区分宿主与移植物的细胞序列读取的能力 | 研究对象为来自患者衍生活检的异种移植样本的单细胞序列数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | 在10× Genomics平台的混合物种50:50细胞系实验和公开的PDX数据集中使用 | NA | NA | NA | NA |
| 532 | 2024-08-05 |
A multicenter study benchmarking single-cell RNA sequencing technologies using reference samples
2021-09, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-00748-9
PMID:33349700
|
研究论文 | 本文比较了不同技术和实验室生成的单细胞RNA测序数据集 | 提出了在选择算法以实现准确生物解释方面的指导 | 尽管结果具有较高的可重复性，但可能在不同平台的算法选择上仍存在挑战 | 旨在优化单细胞RNA测序研究中的平台和软件选择 | 使用乳腺癌细胞和B细胞作为参考样本进行比较 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个来源的细胞样本，包括乳腺癌细胞和B细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 533 | 2024-08-05 |
Gene Deconvolution Reveals Aberrant Liver Regeneration and Immune Cell Infiltration in Alcohol-Associated Hepatitis
2021-08, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.31759
PMID:33619773
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研究论文 | 本文通过基因解卷积揭示了与酒精相关性肝炎中异常的肝脏再生和免疫细胞浸润 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了慢性肝病中细胞组成的显著变化，尤其是在严重急性肝炎患者中 | 样本数量有限，可能影响结果的广泛性和适用性 | 探讨慢性肝病中肝细胞再生和免疫细胞浸润的差异性贡献 | 健康肝脏和慢性肝病患者的肝细胞及免疫细胞 | 数字病理学 | 酒精相关性肝炎 | RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 有限数量的慢性肝病患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 534 | 2024-08-05 |
Impaired immune signaling and changes in the lung microbiome precede secondary bacterial pneumonia in COVID-19
2021-Nov-30, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2021.03.23.21253487
PMID:33791731
|
研究论文 | 本文评估了COVID-19患者肺部免疫反应和微生物组动态，特别是与继发性细菌肺炎的关系 | 研究发现COVID-19患者在继发性细菌感染前的免疫信号受损，以及微生物组组成的变化 | 样本量相对较小，仅包括23名COVID-19患者 | 探讨COVID-19患者免疫信号失调如何导致继发性细菌肺炎 | 23名COVID-19患者及8名重症未感染对照 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 23名COVID-19患者和8名重症未感染对照 | NA | NA | NA | NA |
| 535 | 2024-08-07 |
Author Correction: A yeast-optimized single-cell transcriptomics platform elucidates how mycophenolic acid and guanine alter global mRNA levels
2021-Jul-13, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02420-7
PMID:34257405
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 536 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA Sequencing Reveals Sexually Dimorphic Transcriptome and Type 2 Diabetes Genes in Mouse Islet β Cells
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2021.07.004
PMID:34571259
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研究论文 | 本文探讨了小鼠胰腺β细胞中的性别差异转录组和2型糖尿病基因 | 首次揭示了小鼠β细胞中的性别差异转录组，并识别出与性别相关的2型糖尿病基因 | 研究局限于小鼠模型，结果可能无法直接应用于人类 | 探究性别在2型糖尿病发病机制中的作用 | 小鼠胰腺β细胞和与高脂饮食诱导的2型糖尿病相关的基因 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用高脂饮食诱导的2型糖尿病小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 537 | 2024-08-05 |
C5aR1-positive neutrophils promote breast cancer glycolysis through WTAP-dependent m6A methylation of ENO1
2021-07-26, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-021-04028-5
PMID:34312368
|
研究论文 | 本文探讨了C5aR1阳性中性粒细胞如何通过WTAP依赖性m6A甲基化促进乳腺癌的糖酵解。 | 识别出一种新类型的C5aR1阳性中性粒细胞，与乳腺癌进展和不良预后相关。 | 当前对中性粒细胞在乳腺癌进展中的作用尚不明确，仍需进一步研究。 | 研究C5aR1阳性中性粒细胞在乳腺癌进展中的作用及其机制。 | C5aR1阳性中性粒细胞及其在乳腺癌中的作用。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 临床乳腺癌样本及单细胞数据 | NA | NA | NA | NA |
| 538 | 2024-08-05 |
Phospholipids of APOE lipoproteins activate microglia in an isoform-specific manner in preclinical models of Alzheimer's disease
2021-06-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-23762-0
PMID:34099706
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研究论文 | 本研究探讨了APOE脂蛋白的磷脂如何以同种型特异性影响阿尔茨海默病中微胶质细胞的反应。 | 发现人类APOEε3和APOEε4在阿尔茨海默病大脑中存在特异性的磷脂特征，并揭示了APOE3脂蛋白与APOE4在微胶质细胞响应Aβ方面的显著差异 | 尚需进一步研究以明确APOE和TREM2在真实生物体中的复杂相互作用 | 阐明APOE同种型在阿尔茨海默病微胶质细胞反应中的作用 | 使用预临床阿尔茨海默病鼠模型研究APOE3和APOE4对微胶质细胞的影响 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | RNA-seq | NA | RNA数据 | 使用APOE3和APOE4小鼠的脂蛋白和微胶质细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 539 | 2024-08-05 |
People critically ill with COVID-19 exhibit peripheral immune profiles predictive of mortality and reflective of SARS-CoV-2 lung viral burden
2021-12-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100476
PMID:34873589
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研究论文 | 本文研究了COVID-19重症患者的外周免疫状态与死亡率之间的关联 | 采用单细胞RNA测序对免疫状态进行高维剖析，揭示了与COVID-19死亡率相关的细胞分子特征 | 可能未能考虑所有潜在的免疫细胞状态和不同的临床变量 | 旨在阐明重症COVID-19患者的免疫细胞状态与死亡的关系 | 重症COVID-19患者的血液和呼吸样本 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA-seq | NA | 血液和呼吸样本 | 重症COVID-19患者的高维样本 | NA | NA | NA | NA |
| 540 | 2024-08-05 |
Identification of cell-type-specific marker genes from co-expression patterns in tissue samples
2021-Oct-11, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab257
PMID:33904573
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研究论文 | 本文提出了一种新算法，通过分析组织样本中的共表达模式来识别细胞特异性标志基因 | 提出了一种半监督算法，结合已知标志基因的信息和大规模转录组数据来精确识别标志基因 | 研究依赖于已发表的可能标志基因的信息，可能影响算法的准确性 | 识别组织样本中特定细胞类型的标志基因 | 组织样本中的细胞类型标志基因 | 数字病理学 | NA | 转录组测序 | 半监督算法 | 大规模转录组数据 | 多个组织样本 | NA | NA | NA | NA |