单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 461 - 480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2024-08-07 |
Deciphering transcriptional and functional heterogeneity in hematopoiesis with single-cell genomics
2021-07-01, Current opinion in hematology
IF:3.1Q2
DOI:10.1097/MOH.0000000000000657
PMID:33901135
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研究论文 | 本文探讨了单细胞基因组学在解析造血过程中的转录和功能异质性中的应用 | 本文提出了使用单细胞系追踪和功能验证研究来揭示转录上不同的造血干细胞和祖细胞亚群中的细胞命运偏倚，并提出了新的标记物来前瞻性地分离功能上不同的亚群 | 标准单细胞转录组学存在高采样噪声，特别是对于低表达基因如转录因子，这可能阻碍识别定义细胞身份和细胞命运偏倚的稀有转录本 | 理解单细胞基因组学方法及其后续功能 assay 的局限性，以区分技术噪声和生物学贡献，识别稀有基因表达状态，并揭示造血过程中功能上不同的亚群 | 造血过程中的转录和功能异质性 | 基因组学 | NA | 单细胞基因组学 | NA | 基因表达数据 | 多个造血干细胞和祖细胞亚群 |
| 462 | 2024-08-07 |
Discrete limbal epithelial stem cell populations mediate corneal homeostasis and wound healing
2021-07-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.04.003
PMID:33984282
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和高级定量谱系追踪技术，深入分析了小鼠角膜缘上皮细胞，揭示了两种位于不同亚区的角膜缘上皮干细胞（LSCs）群体的存在及其在角膜稳态和伤口愈合中的作用 | 本文首次揭示了角膜缘上皮干细胞存在两种不同的群体，分别位于外缘和内缘，各自在伤口愈合和角膜上皮稳态维持中发挥作用 | NA | 研究角膜缘上皮干细胞在角膜稳态和伤口愈合中的作用机制 | 小鼠角膜缘上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序，定量谱系追踪 | NA | RNA | 小鼠角膜缘上皮细胞 |
| 463 | 2024-08-07 |
Dissecting the single-cell transcriptome network underlying esophagus non-malignant tissues and esophageal squamous cell carcinoma
2021-Jul, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2021.103459
PMID:34192657
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了食管非恶性组织和食管鳞状细胞癌的转录组网络，揭示了肿瘤微环境中的细胞异质性和相互作用。 | 研究首次识别了食管鳞状细胞癌的四个恶性特征，并构建了细胞间通信图谱，为食管鳞状细胞癌的治疗提供了新的潜在标记和靶点。 | 研究仅使用了五个肿瘤样本和五个非恶性样本，样本量相对较小，可能影响结果的普遍性。 | 探究食管鳞状细胞癌的肿瘤微环境及其异质性，为临床管理提供新的治疗靶点。 | 食管非恶性组织和食管鳞状细胞癌的单细胞转录组。 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 128,688个细胞 |
| 464 | 2024-08-07 |
Single-cell spatial transcriptomic analysis reveals common and divergent features of developing postnatal granule cerebellar cells and medulloblastoma
2021-07-01, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-021-01071-8
PMID:34210306
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研究论文 | 本研究通过单细胞空间转录组学分析，揭示了发育中的小脑颗粒细胞与髓母细胞瘤之间的共同特征和差异 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，详细分析了小脑颗粒细胞的发育状态及其与髓母细胞瘤的关系 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探究小脑颗粒细胞发育过程中的转录调控及其与髓母细胞瘤的关系 | 小脑颗粒细胞和髓母细胞瘤细胞 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 24,919个小鼠小脑细胞和18,372个Patched+/-突变小鼠细胞 |
| 465 | 2024-08-07 |
Mammalian tracheal development and reconstruction: insights from in vivo and in vitro studies
2021-07-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.198192
PMID:34228796
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综述 | 本文综述了哺乳动物气管发育及从多能干细胞生成气管组织的最新进展 | 采用单细胞测序技术和定量分析方法，从细胞到组织层面解析了气管形态发生的细胞基础 | NA | 探讨气管发育异常的原因及开发从干细胞重建三维气管的技术 | 哺乳动物的气管发育和重建 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞和组织数据 | NA |
| 466 | 2024-08-07 |
Fxr signaling and microbial metabolism of bile salts in the zebrafish intestine
2021-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abg1371
PMID:34301599
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研究论文 | 研究了斑马鱼肠道中胆盐的微生物代谢及其对法尼醇X受体（Fxr）信号传导的影响 | 首次展示了斑马鱼中肝脏胆盐合成和回肠运输途径的关键成分的保守性，并揭示了胆盐微生物修饰对Fxr活性的增强作用 | NA | 探讨非哺乳脊椎动物中胆盐代谢和Fxr信号传导的机制 | 斑马鱼肠道中的胆盐合成、分泌、吸收及其对Fxr信号的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 467 | 2024-08-07 |
Integrated single-cell RNA sequencing analyses suggest developmental paths of cancer-associated fibroblasts with gene expression dynamics
2021-07, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.487
PMID:34323427
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 468 | 2024-08-07 |
Optimizing expression quantitative trait locus mapping workflows for single-cell studies
2021-06-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02407-x
PMID:34167583
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研究论文 | 本文探讨了优化单细胞表达数量性状位点（sc-eQTL）映射工作流程的方法 | 提出了针对单细胞RNA测序数据的不同归一化和聚合策略、协变量调整技术以及多重检验校正方法的最佳实践指南 | NA | 优化单细胞eQTL研究，以提高eQTL发现的效率 | 单细胞RNA测序数据及其在eQTL映射中的应用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用真实和模拟数据集进行评估 |
| 469 | 2024-08-07 |
Single-cell immunophenotyping of the skin lesion erythema migrans identifies IgM memory B cells
2021-06-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.148035
PMID:34061047
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序与B细胞受体（BCR）测序技术，对莱姆病早期皮肤病变红斑游走（EM）中的B细胞及其BCR库进行了免疫表型分析 | 首次揭示了莱姆病早期皮肤感染部位B细胞的表型，表明这些细胞具有局部抗原呈递和抗体产生的能力 | NA | 探讨B细胞在莱姆病早期皮肤免疫反应中的作用 | 红斑游走（EM）皮肤病变中的B细胞及其BCR库 | 数字病理学 | 莱姆病 | 单细胞RNA测序，B细胞受体（BCR）测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 470 | 2024-08-07 |
Interleukin-6 is an activator of pituitary stem cells upon local damage, a competence quenched in the aging gland
2021-06-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2100052118
PMID:34161279
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，探讨了垂体干细胞在局部损伤后的急性激活过程，并对比了衰老垂体的反应 | 首次揭示了白细胞介素-6（IL-6）在年轻垂体中损伤后激活干细胞的作用，并发现衰老垂体中这种能力被抑制 | 研究主要集中在实验小鼠模型上，未来需要进一步在人类样本中验证这些发现 | 探究垂体干细胞在损伤后的激活机制及其在衰老过程中的变化 | 垂体干细胞在损伤和衰老过程中的反应 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及年轻和中年小鼠的垂体组织 |
| 471 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics defines heterogeneity of epicardial cells and fibroblasts within the infarcted murine heart
2021-06-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.65921
PMID:34152268
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、RNA原位杂交和Wilms肿瘤蛋白1阳性细胞的谱系追踪，分析了心肌梗死小鼠心脏中心外膜基质细胞与激活的心肌成纤维细胞/基质细胞的细胞组成、位置和层次结构。 | 本研究首次识别了11种转录上不同的EpiSC群体，并发现其中两组表达心脏特异性标志物和肌节蛋白，提示具有心肌生成潜力。 | NA | 研究心外膜基质细胞在心肌梗死后的细胞异质性和其在心脏修复中的作用。 | 心外膜基质细胞和心肌成纤维细胞在心肌梗死小鼠心脏中的特性。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 心肌梗死小鼠心脏样本 |
| 472 | 2024-08-07 |
SARS-CoV-2-mediated dysregulation of metabolism and autophagy uncovers host-targeting antivirals
2021-06-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24007-w
PMID:34155207
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研究论文 | 本文研究了SARS-CoV-2如何通过调节细胞代谢和自噬过程来影响宿主，并探讨了通过诱导自噬来抑制病毒传播的可能性 | 首次展示了SARS-CoV-2通过调节细胞代谢和自噬来影响宿主，并验证了通过外源性给药诱导自噬可以有效抑制病毒传播 | 研究主要集中在体外实验和动物模型，需要进一步的人体临床试验来验证其治疗效果 | 探讨SARS-CoV-2如何影响宿主细胞的代谢和自噬，并寻找可能的抗病毒治疗策略 | SARS-CoV-2感染的细胞、COVID-19患者的肺样本以及肺和黏膜样本 | NA | COVID-19 | 单核和单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 包括COVID-19患者的肺样本和肺及黏膜样本 |
| 473 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing shows the immunosuppressive landscape and tumor heterogeneity of HBV-associated hepatocellular carcinoma
2021-06-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24010-1
PMID:34140495
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序分析了HBV相关肝细胞癌患者的免疫景观和肿瘤异质性 | 发现了肿瘤相关巨噬细胞抑制肿瘤T细胞浸润以及TIGIT-NECTIN2相互作用调控免疫抑制环境 | NA | 揭示HBV相关肝细胞癌中的免疫抑制景观和细胞间相互作用 | HBV相关肝细胞癌患者的肿瘤细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 一批HBV相关肝细胞癌患者 |
| 474 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-seq reveals fibroblast heterogeneity and increased mesenchymal fibroblasts in human fibrotic skin diseases
2021-06-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24110-y
PMID:34140509
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索了瘢痕疙瘩中的成纤维细胞异质性 | 首次详细描述了瘢痕疙瘩中成纤维细胞的四种亚群，并发现间充质成纤维细胞亚群在瘢痕疙瘩中的比例显著增加 | 研究仅限于瘢痕疙瘩和硬皮病两种纤维化皮肤病，可能需要进一步研究以验证这些发现是否适用于其他纤维化皮肤病 | 探索纤维化皮肤病中成纤维细胞的异质性及其在疾病发展中的作用 | 瘢痕疙瘩和硬皮病中的成纤维细胞 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 475 | 2024-08-07 |
Promotion of cholangiocarcinoma growth by diverse cancer-associated fibroblast subpopulations
2021-06-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2021.03.012
PMID:33930309
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研究论文 | 研究探讨了癌症相关成纤维细胞（CAF）在肝内胆管癌（ICC）中的功能，发现肝星状细胞（HSC）是CAF的主要来源，并且HSC衍生的CAF在肿瘤细胞相互作用中占主导地位 | 首次揭示了HSC作为CAF的主要来源，并通过单细胞RNA测序和配体-受体分析，区分了CAF的亚型及其在ICC生长中的不同作用 | 研究主要集中在小鼠模型和患者样本的分析上，可能需要更多临床试验来验证这些发现 | 研究CAF在肝内胆管癌中的作用及其对肿瘤生长的影响 | 癌症相关成纤维细胞（CAF）及其在肝内胆管癌（ICC）中的功能 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及小鼠模型和患者样本 |
| 476 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the mechanism of sonodynamic therapy combined with a RAS inhibitor in the setting of hepatocellular carcinoma
2021-Jun-12, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-021-00923-3
PMID:34118951
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了声动力疗法结合RAS抑制剂在肝细胞癌治疗中的机制 | 首次报道了IR820纳米胶囊增强的声动力疗法与RAS抑制剂farnesyl-thiosalicylic acid (FTS)的联合应用，并利用单细胞RNA测序分析了其对肝细胞癌的治疗效果 | NA | 探讨声动力疗法与RAS抑制剂联合治疗肝细胞癌的机制 | 肝细胞癌及其治疗效果 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 肝细胞癌异种移植模型 |
| 477 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of human femoral head in vivo
2021-06-10, Aging
DOI:10.18632/aging.203124
PMID:34111027
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人体股骨头组织细胞的细胞组成和细胞间相互作用 | 首次在单细胞水平上揭示了人体股骨头组织细胞的细胞类型及其在骨代谢中的相互作用 | NA | 探究骨组织中细胞的细胞组成及其在骨代谢中的相互作用 | 人体股骨头组织细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 26,574个主要人体股骨头组织细胞 |
| 478 | 2024-08-07 |
Challenges for Cryptosporidium Population Studies
2021-06-10, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12060894
PMID:34200631
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综述 | 本文综述了隐孢子虫种群研究的现状、挑战及潜在解决方案 | 介绍了隐孢子虫基因组序列的增加及其对种群研究的影响 | 隐孢子虫缺乏理想的体外培养系统，难以克隆分离株，导致序列分析可能存在偏差 | 探讨隐孢子虫种群研究的挑战与解决方案 | 隐孢子虫及其在人类疾病中的作用 | NA | NA | 基因组测序 | NA | 基因组序列 | 多数序列来自隐孢子虫的种群研究 |
| 479 | 2024-08-07 |
BUTTERFLY: addressing the pooled amplification paradox with unique molecular identifiers in single-cell RNA-seq
2021-06-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02386-z
PMID:34103073
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研究论文 | 本文探讨了在单细胞RNA测序中使用唯一分子标识符（UMIs）时遇到的“池化扩增悖论”问题，并提出了一种改进的定量方法BUTTERFLY来解决这一问题 | 提出了基于未见物种模型的改进定量方法BUTTERFLY，使用零截断负二项估计器，并在kallisto bustools工作流程中实现 | NA | 解决单细胞RNA测序中由于池化扩增悖论导致的重复去除偏差问题 | 单细胞RNA测序中的UMIs处理方法 | 测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | 零截断负二项估计器 | RNA序列 | 跨细胞类型和基因的多个样本 |
| 480 | 2024-08-07 |
Spatio-temporal mRNA tracking in the early zebrafish embryo
2021-06-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-23834-1
PMID:34099733
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研究论文 | 本研究结合空间解析转录组学和单细胞RNA标记技术，对斑马鱼早期发育阶段的转录组进行了时空分析 | 首次实现了对斑马鱼早期胚胎中mRNA分子的空间定位测量，并建立了一种高通量的单细胞RNA标记方法 | NA | 探究早期胚胎发育过程中母源mRNA的亚细胞定位和运输 | 斑马鱼早期胚胎中的mRNA分子 | 数字病理学 | NA | 空间解析转录组学，单细胞RNA标记 | NA | 转录组数据 | 涉及斑马鱼和两种非洲爪蟾的早期胚胎 |