单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 461 - 480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2024-08-05 |
A novel Oct4/Pou5f1-like non-coding RNA controls neural maturation and mediates developmental effects of ethanol
2021 Jan-Feb, Neurotoxicology and teratology
IF:2.6Q3
DOI:10.1016/j.ntt.2020.106943
PMID:33221301
|
研究论文 | 这篇文章研究了一种新的非编码RNA如何影响神经元成熟和乙醇的发育效应。 | 发现了一种新的与Oct4/Pou5f1相关的非编码RNA mOct4pg9，它在神经干细胞的自我更新和乙醇暴露的影响中扮演了重要角色。 | 在研究中未详细阐述mOct4pg9的具体机制及其在不同发展阶段的作用 | 探讨乙醇暴露如何导致神经干细胞的丧失及其相关机制 | 小鼠胚胎皮质来源的神经干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 462 | 2024-08-05 |
Comprehensive RNA analysis of CSF reveals a role for CEACAM6 in lung cancer leptomeningeal metastases
2021-Oct-08, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-021-00228-6
PMID:34625644
|
研究论文 | 本研究综合使用单细胞RNA测序和游离RNA分析，揭示了CEACAM6在肺癌脑膜转移中的作用。 | 将单细胞RNA-seq与cfRNA分析结合，为NSCLC脑膜转移的诊断和机制提供了新的视角。 | 由于CSF中的癌细胞数量稀少，样本量有限，难以全面代表所有患者情况。 | 研究CEACAM6在肺癌脑膜转移中的作用及其基因表达特征。 | 怀疑有脑膜转移的非小细胞肺癌患者的脑脊液样本。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq，qPCR | NA | 细胞学，RNA数据 | 总共21个样本（14个脑膜转移患者，7个非肿瘤对照） | NA | NA | NA | NA |
| 463 | 2024-08-05 |
Single-cell insights into the hematopoietic generation of T-lymphocyte precursors in mouse and human
2021-03, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2020.12.005
PMID:33454362
|
评论 | 该文章综述了小鼠和人类早期T细胞祖细胞的单细胞转录组研究 | 文章揭示了小鼠和人类之间在T细胞发育中的核心程序和物种间的变异 | 研究主要集中于胎儿和严格纯化的后天样本，可能缺乏其他发育阶段的全面性 | 旨在探讨T细胞潜能的分子要求及其早期发展 | 研究对象为小鼠和人类的早期T细胞祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人类的胎儿及后天严格纯化的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 464 | 2024-08-05 |
No detectable alloreactive transcriptional responses under standard sample preparation conditions during donor-multiplexed single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells
2021-01-20, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-020-00941-x
PMID:33472616
|
研究论文 | 这篇文章探讨在标准样本制备条件下，混合来自无关供体的外周血单核细胞是否会引起可检测的异体反应。 | 首次评估在标准scRNA-seq样本制备条件下，混合外周血单核细胞是否导致显著的基因表达变化。 | 未考虑在其他样本制备条件下的潜在异体反应。 | 确定在单细胞RNA测序中的样本混合是否引起异体反应。 | 外周血单核细胞（PBMCs）来自无关供体。 | 数字病理学 | NA | 10x Genomics scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 一个供体的PBMCs，与无关供体的PBMCs混合 | NA | NA | NA | NA |
| 465 | 2024-08-05 |
Preparation of single cell suspensions enriched in mouse brain vascular cells for single-cell RNA sequencing
2021-09-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100715
PMID:34401781
|
研究论文 | 本文建立了用于小鼠大脑血管细胞的单细胞RNA测序的细胞分离程序 | 创新性在于提供了一种高效的细胞分离方法以获取高质量的脑血管细胞 | 未提及具体的实验条件和样本来源的限制 | 研究目标是改善脑血管细胞的分离与表征以进行转录组分析 | 研究对象为小鼠脑血管细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 466 | 2024-08-05 |
Lentiviral vectors transduce lung stem cells without disrupting plasticity
2021-Sep-03, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2021.06.010
PMID:34458011
|
研究论文 | 本研究探讨了逆转录病毒载体在不影响气道干细胞功能的情况下转导肺干细胞。 | 该研究首次证明了逆转录病毒载体转导不会改变气道干细胞的可塑性与功能。 | 研究主要针对人类囊性纤维化和非囊性纤维化肺供者的细胞，可能不适用于其他类型的肺病。 | 探讨病毒载体转导或治疗转基因的异位表达是否会影响气道干细胞的功能。 | 研究对象为来自人类囊性纤维化和非囊性纤维化肺供者的初级气道基底细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 逆转录病毒载体 | NA | 细胞文化 | 来自囊性纤维化和非囊性纤维化肺供者的初级气道基底细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 467 | 2024-08-05 |
Intratumoral injection of caerin 1.1 and 1.9 peptides increases the efficacy of vaccinated TC-1 tumor-bearing mice with PD-1 blockade by modulating macrophage heterogeneity and the activation of CD8+ T cells in the tumor microenvironment
2021, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.1335
PMID:34429969
|
研究论文 | 本文展示了结合E7抗原特异性免疫疗法及IL-10和PD-1阻断剂，局部注射caerin 1.1/1.9肽能增强TC-1肿瘤微环境的免疫活性 | 首次展示了caerin 1.1/1.9肽在结合抗PD-1治疗下对肿瘤免疫细胞类型的影响 | 该研究未详细探讨不同剂量的caerin肽对免疫反应的影响 | 改善临床免疫疗法对肿瘤的响应 | 接种E7抗原的TC-1肿瘤小鼠 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术、单细胞转录组学与蛋白质组学 | NA | 细胞, 蛋白质 | 受试者为接种E7抗原的TC-1肿瘤小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 468 | 2024-08-05 |
Categorization of lung mesenchymal cells in development and fibrosis
2021-Jun-25, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102551
PMID:34151224
|
研究论文 | 该文章探讨了肺间充质细胞在发育和纤维化过程中的分类及其转录组特征 | 本研究识别并描绘了一种新的细胞群体，并描述了细胞亚型特异性转录因子 | 未明确提出该研究的具体局限性 | 研究肺间充质细胞的异质性及其在发育和纤维化中的作用 | 小鼠和人类的肺间充质细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人类的胚胎、出生后、成人及老年期的纤维化肺中间充质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 469 | 2024-08-05 |
The derepression of transposable elements in lung cells is associated with the inflammatory response and gene activation in idiopathic pulmonary fibrosis
2021-Jun-09, Mobile DNA
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13100-021-00241-3
PMID:34108012
|
研究论文 | 本文探讨了转座元件在特发性肺纤维化中的去抑制与炎症反应和基因激活的关联 | 研究首次展示了转座元件在特发性肺纤维化患者肺细胞中的失调与基因表达和炎症反应的关联 | 研究中仅使用了24名样本，可能无法全面代表特发性肺纤维化患者的多样性 | 确定转座元件是否与特发性肺纤维化相关 | 健康供体与特发性肺纤维化患者的肺细胞转录组 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 24名受试者（16名健康供体和8名特发性肺纤维化患者） | NA | NA | NA | NA |
| 470 | 2024-08-05 |
Uphyloplot2: visualizing phylogenetic trees from single-cell RNA-seq data
2021-Jun-05, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-021-07739-3
PMID:34090344
|
研究论文 | Uphyloplot2是一种可视化单细胞RNA测序数据的系统。 | 该工具能够直接从推断的RNA-seq数据或Newick格式的树状图文件生成系统发育图，简化了以往繁琐的手动分析。 | 目前没有提及该工具的具体限制。 | 本研究旨在提供一种简单的工具，以从单细胞RNA-seq数据及其他来源生成系统发育图，以展示肿瘤的克隆性。 | 研究对象是通过单细胞RNA测序获得的肿瘤细胞数据。 | 数字病理学 | 肿瘤 | RNA-seq | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 471 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing of mouse islets exposed to proinflammatory cytokines
2021-06, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202000949
PMID:33883217
|
研究论文 | 这篇文章探讨了小鼠胰岛在炎性细胞因子影响下的单细胞RNA测序结果 | 首次揭示了不同类型的胰岛内分泌细胞对炎性细胞因子的响应及其基因表达变化的异质性 | 主要只研究了IL-1β和IFN-γ的影响，未考虑其他可能的细胞因子 | 理解炎性细胞因子如何影响胰岛细胞的基因表达 | 小鼠胰岛的内分泌细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胰岛样本，具体样本数未提供 | NA | NA | NA | NA |
| 472 | 2024-08-05 |
XIAP Knockdown in Alcohol-Associated Liver Disease Models Exhibits Divergent in vitro and in vivo Phenotypes Owing to a Potential Zonal Inhibitory Role of SMAC
2021, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2021.664222
PMID:34025452
|
研究论文 | 研究了XIAP在酒精相关肝病模型中的功能及其相应表型差异 | 提出了SMAC在不同区域的抑制作用可能解释了XIAP缺失小鼠未出现疾病加重表型的机制 | 缺乏对XIAP缺失导致炎症反应机制的全面理解 | 探讨XIAP在酒精相关肝病发生中的作用 | 小鼠模型中XIAP基因缺失对肝脏细胞的影响 | 数字病理学 | 肝病 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 使用了多种小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 473 | 2024-08-05 |
Plasma IL-6 levels following corticosteroid therapy as an indicator of ICU length of stay in critically ill COVID-19 patients
2021-Mar-15, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-021-00429-9
PMID:33723251
|
研究论文 | 该研究探讨了在重症COVID-19患者中，皮质类固醇治疗后IL-6水平与ICU住院时长之间的关系 | 首次提出了皮质类固醇后IL-6水平可能与COVID-19严重程度相关的假设 | 样本量较小，仅涉及16名患者 | 探究皮质类固醇治疗后IL-6水平在重症COVID-19患者中的作用 | 重症COVID-19患者，特别是接受类固醇治疗的患者 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本（平行组织扫描的细胞数据） | 16名重症患者接受治疗，41名未接受治疗的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 474 | 2024-08-05 |
Investigation of Drosophila fruitless neurons that express Dpr/DIP cell adhesion molecules
2021-02-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.63101
PMID:33616528
|
研究论文 | 研究表达Dpr/DIP细胞粘附分子的果蝇fruitless神经元的功能和特征 | 通过对基因组研究的重新分析，发现对性别特异性行为的神经元形态和细胞数量存在性别二态性 | 未详细介绍实验样本和研究方法的局限性 | 探讨fruitless神经元在果蝇交配行为中的作用 | Drosophila的fruitless神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 475 | 2024-08-05 |
Single-cell damagenome profiling unveils vulnerable genes and functional pathways in human genome toward DNA damage
2021-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abf3329
PMID:34215579
|
研究论文 | 本研究报告了一种新型的单细胞全基因组扩增方法，可以有效捕获单细胞中的自发DNA损伤 | 首次引入了损伤相关的单核苷酸变异（damSNVs）及其整个基因组分布概念 | 未在其他细胞类型中验证该方法的广泛应用性 | 探讨DNA损伤在人体基因组中的脆弱基因和功能通路 | 单个人类神经元以及与阿尔茨海默病和自闭症谱系障碍相关的基因 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病，自闭症谱系障碍 | 单细胞全基因组扩增（LCS-WGA） | NA | 基因组数据 | 单个人类神经元 | NA | NA | NA | NA |
| 476 | 2024-08-05 |
CHARTS: a web application for characterizing and comparing tumor subpopulations in publicly available single-cell RNA-seq data sets
2021-Feb-23, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04021-x
PMID:33622236
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为CHARTS的网络应用程序，可用于描述和比较公开可用的单细胞RNA-seq数据集中的肿瘤亚群 | CHARTS提供了一种新的方式，以便于对单细胞肿瘤亚群的基因表达、细胞类型和癌症状态进行深入分析 | 该研究未详细讨论应用程序的使用限制和数据集的质量控制问题 | 旨在提供一种工具，以更好地理解肿瘤异质性的机制 | 公开可用的单细胞RNA-seq肿瘤数据集 | 数字病理学 | 癌症 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 477 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptional profiling of human thymic stroma uncovers novel cellular heterogeneity in the thymic medulla
2021-02-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21346-6
PMID:33597545
|
研究论文 | 该文章揭示了人类胸腺基质的细胞异质性及其在免疫耐受中的作用 | 使用单细胞RNA测序技术全面剖析胸腺基质的细胞异质性，并发现新型细胞群体和潜在的关键调节因子 | 研究局限于单细胞RNA测序数据，未涵盖更广泛的生理和病理状态 | 旨在理解人类胸腺细胞的多样性及其对免疫系统发展的影响 | 重点研究人类胸腺基质及其各个发展阶段的细胞群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 478 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals cellular and molecular immune profile in a Pembrolizumab-responsive PD-L1-negative lung cancer patient
2021-Aug, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-021-02848-0
PMID:33506299
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了一例Pembrolizumab反应的PD-L1阴性肺癌患者的细胞和分子免疫特征 | 首次在PD-L1阴性患者中识别与PD-1阻断相关的新细胞特征和潜在的预测标记 | 样本量有限，可能不足以广泛推广发现的应用 | 探索PD-L1阴性肺癌患者在Pembrolizumab治疗中的细胞及分子特征 | PD-L1阴性肺癌患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 16个细胞簇中的3423个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 479 | 2024-08-05 |
Cryopreservation of microglia enables single-cell RNA sequencing with minimal effects on disease-related gene expression patterns
2021-Apr-23, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102357
PMID:33870145
|
研究论文 | 本文研究了冷冻保存小胶质细胞对单细胞RNA测序的影响 | 探索了冷冻保存小胶质细胞的使用，证明其在单细胞RNA测序中具有良好的适用性 | 未明确指出冷冻保存对其他细胞类型的影响 | 研究冷冻保存小胶质细胞对疾病相关基因表达模式的影响 | 冷冻保存的小胶质细胞 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了配对的新鲜和冷冻保存的小胶质细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 480 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq unravels tumour heterogeneity plus M2-like tumour-associated macrophage infiltration and aggressiveness in TNBC
2021-Jan, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-020-02669-7
PMID:32681241
|
研究论文 | 本研究分析了三阴性乳腺癌中的肿瘤异质性和M2型肿瘤相关巨噬细胞浸润及其侵袭性 | 结合单细胞和整体组织转录组分析揭示了肿瘤异质性和免疫微环境与临床结果之间的关联 | 研究的局限性未在摘要中明确提及 | 探索三阴性乳腺癌中肿瘤异质性及M2型肿瘤相关巨噬细胞的作用 | 三阴性乳腺癌患者的肿瘤细胞和肿瘤浸润的免疫细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序和整体RNA测序 | 随机森林和支持向量机（SVM），深度学习神经网络 | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |