单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2886 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-01-16 |
Selective loss of resident macrophage-derived insulin-like growth factor-1 abolishes adaptive cardiac growth to stress
2021-09-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.07.006
PMID:34363749
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研究论文 | 本文揭示了心脏驻留巨噬细胞通过产生胰岛素样生长因子-1在高血压应激下促进心肌细胞适应性生长和心脏功能维持的关键作用 | 首次明确了心脏驻留巨噬细胞来源的IGF-1在高血压诱导的心脏适应性生长中的绝对必要性，并识别了人类心肌病中保守的IGF-1表达巨噬细胞亚群 | 研究主要基于动物模型，人类数据仅通过单细胞转录组学识别相关巨噬细胞亚群，未进行功能验证 | 探究免疫细胞在高血压应激下心脏适应性生长中的作用机制 | 心脏驻留巨噬细胞和心肌细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2026-01-01 |
High-Throughput Monitoring of Bacterial Cell Density in Nanoliter Droplets: Label-Free Detection of Unmodified Gram-Positive and Gram-Negative Bacteria
2021-01-19, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.0c03408
PMID:33301291
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研究论文 | 本文介绍了一种基于纳米液滴散射光的高通量、无标记细菌检测方法，适用于革兰氏阳性和阴性细菌 | 开发了无需基因修饰或化学标记的高通量无标记细菌检测技术，利用纳米液滴散射光测量实现细菌增殖的可靠检测 | 未在摘要中明确说明具体局限性 | 开发适用于临床、研究和工业领域多种细菌菌株的高通量微液滴分析技术 | 未修饰的革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌 | 微生物分析技术 | NA | 液滴微流控技术、散射光测量 | NA | 光学信号数据（散射光、荧光） | NA | NA | 液滴微流控 | NA | 纳米液滴封装系统 |
| 23 | 2025-12-23 |
Isolation of Endothelial Cells from the Lumen of Mouse Carotid Arteries for Single-cell Multi-omics Experiments
2021-10-04, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/63128
PMID:34661575
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研究论文 | 本文介绍了一种从小鼠颈动脉内腔分离内皮细胞的方法，用于单细胞多组学实验，以研究动脉粥样硬化中血流扰动对内皮细胞的影响 | 开发了一种内腔消化方法，从动脉壁中富集内皮细胞，解决了内皮细胞在总细胞群中占比较低的问题，从而在单细胞分辨率下更有效地研究血流对转录组和染色质可及性的影响 | 方法可能无法完全排除其他细胞类型的污染，如平滑肌细胞、成纤维细胞和免疫细胞，且在小鼠模型中的结果需进一步验证才能应用于人类动脉样本 | 研究动脉粥样硬化中血流扰动对内皮细胞转录组和表观基因组的影响，开发内皮细胞富集方法以促进单细胞多组学研究 | 小鼠颈动脉内皮细胞，通过部分颈动脉结扎手术诱导血流扰动，使用右颈动脉作为对照 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞RNA和染色质可及性数据 | 小鼠颈动脉样本，具体数量未在摘要中明确说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 10x Chromium | 10x Genomics微流控设置，用于单细胞和单核条形码标记，后续进行RNA制备、文库生成和高通量DNA测序 |
| 24 | 2025-10-16 |
Mouse and human share conserved transcriptional programs for interneuron development
2021-Dec-10, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abj6641
PMID:34882453
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人类与小鼠在中间神经元发育过程中共享保守的转录调控程序 | 首次在人类胚胎脑组织中系统表征神经节隆起区域的细胞多样性，并发现与啮齿类动物相似的转录调控机制 | 研究仅关注胚胎发育阶段，未涉及成年期神经元功能验证 | 探究人类GABA能神经元发育的转录调控机制及其进化保守性 | 人类胚胎脑组织中的神经节隆起区域细胞 | 神经科学 | 自闭症、精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类胚胎脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2025-10-05 |
Decoding molecular and cellular heterogeneity of mouse nucleus accumbens
2021-12, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-021-00938-x
PMID:34663959
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重错误鲁棒荧光原位杂交技术，构建了小鼠伏隔核的细胞图谱，揭示了其细胞异质性 | 首次结合单细胞转录组和空间信息构建小鼠伏隔核的细胞分类系统，揭示了神经元亚型的转录和空间多样性 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类或其他物种中验证 | 解析小鼠伏隔核的分子、细胞和解剖异质性 | 小鼠伏隔核脑区 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 多重错误鲁棒荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 26 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA-sequencing atlas of bovine caudal intervertebral discs: Discovery of heterogeneous cell populations with distinct roles in homeostasis
2021-11, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202101149R
PMID:34591994
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建牛尾椎间盘细胞图谱，发现具有不同稳态功能的异质性细胞群体 | 首次创建牛尾椎间盘单细胞转录组图谱，识别出15个独特细胞簇并发现新型细胞标记物 | 研究仅基于牛模型，结果向人类转化需要进一步验证 | 解析椎间盘的细胞异质性以促进再生治疗发展 | 牛尾椎间盘组织 | 单细胞生物学 | 椎间盘疾病 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomics analysis of mild cognitive impairment in World Trade Center disaster responders
2021, Alzheimer's & dementia (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1002/dad2.12154
PMID:33665344
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究世贸中心救援人员轻度认知障碍的分子机制 | 首次在世贸中心救援人员群体中应用单细胞分辨率CITE-Seq技术分析轻度认知障碍的血液转录组特征 | 样本量相对较小(40名男性)，仅包含男性受试者 | 探索轻度认知障碍的分子复杂性及其血液生物标志物 | 世贸中心灾难救援人员 | 单细胞组学 | 轻度认知障碍 | CITE-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | 40名男性救援人员(发现队列:9名MCI和9名对照;验证队列:11名MCI和11名对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2025-10-05 |
Systems vaccinology of the BNT162b2 mRNA vaccine in humans
2021-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03791-x
PMID:34252919
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研究论文 | 本研究采用系统疫苗学方法分析BNT162b2 mRNA疫苗在人体内引发的免疫反应 | 首次通过系统疫苗学方法全面描绘mRNA疫苗的免疫应答机制，揭示加强免疫显著增强先天免疫反应的特征 | 样本量相对有限（56名健康志愿者），未涵盖不同年龄组或免疫功能低下人群 | 阐明mRNA疫苗如何刺激免疫系统产生保护性免疫应答 | 56名接种辉瑞-BioNTech mRNA疫苗（BNT162b2）的健康志愿者 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组学，系统疫苗学方法 | NA | 转录组数据，免疫细胞表型数据 | 56名健康志愿者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2025-10-05 |
Single cell RNA sequencing of AML initiating cells reveals RNA-based evolution during disease progression
2021-10, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-021-01338-7
PMID:34244611
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究AML起始细胞在疾病进展过程中的RNA克隆进化 | 首次在AML起始细胞中发现RNA克隆进化现象，而非传统的DNA突变进化 | 研究样本量有限，需要更大队列验证发现 | 探索AML疾病复发过程中白血病起始细胞的转录组变化机制 | 急性髓系白血病患者的匹配诊断和复发样本中的白血病起始细胞 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 匹配的诊断和复发AML患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2025-10-05 |
Examining heterogeneity of stromal cells in tumor microenvironment based on pan-cancer single-cell RNA sequencing data
2021-Aug-17, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
|
综述 | 基于泛癌单细胞RNA测序数据研究肿瘤微环境中基质细胞的异质性 | 通过整合多种癌症类型的单细胞RNA测序数据，发现内皮细胞和成纤维细胞/肌成纤维细胞在不同癌症中可划分为共同亚型，且亚型组成与癌症特征和疗法响应相关 | NA | 研究肿瘤微环境中基质细胞的异质性 | 多种癌症类型的单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | 泛癌研究 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2025-10-05 |
Hypoxic microenvironment induced spatial transcriptome changes in pancreatic cancer
2021-Jun-04, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
|
研究论文 | 本研究首次描述了胰腺癌中缺氧微环境诱导的空间转录组变化，并识别了潜在治疗靶点 | 首次利用空间转录组技术揭示胰腺癌缺氧微环境的空间异质性特征 | 研究基于小鼠移植瘤模型，临床相关性需进一步验证 | 探究胰腺癌缺氧微环境的空间转录组特征及其临床意义 | 人胰腺导管腺癌（PDAC）在小鼠缺血后肢中的移植瘤 | 空间转录组学 | 胰腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠移植瘤模型（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 32 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome sequencing on the Nanopore platform with ScNapBar
2021-Jun-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.078154.120
PMID:33906975
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研究论文 | 提出ScNapBar软件解决Nanopore平台单细胞转录组测序中细胞条形码分配准确性问题 | 开发了混合测序方法结合Nanopore和Illumina平台优势，通过UMI或朴素贝叶斯概率方法提高细胞条形码分配准确性 | 未明确说明样本规模和技术适用范围 | 解决单细胞全长RNA测序中细胞条形码分配的技术挑战 | 单细胞转录组 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，长读长测序，混合测序 | 朴素贝叶斯 | 测序数据 | NA | Oxford Nanopore, Illumina, 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，长读长测序 | Nanopore平台，Illumina平台，10x Chromium | Nanopore长读长测序平台与10x Chromium单细胞测序平台整合 |
| 33 | 2025-10-06 |
Retinoic acid signaling is critical during the totipotency window in early mammalian development
2021-06, Nature structural & molecular biology
IF:12.5Q1
DOI:10.1038/s41594-021-00590-w
PMID:34045724
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研究论文 | 本研究通过小分子筛选发现视黄酸信号通路是调控哺乳动物早期发育全能性的关键机制 | 首次发现视黄酸信号通路在胚胎全能性细胞调控中的核心作用，并利用单细胞RNA-seq揭示细胞重编程的转录动态 | 研究主要基于小鼠胚胎干细胞模型，尚未在人类系统中验证 | 探索调控哺乳动物早期发育全能性阶段的关键信号通路 | 小鼠胚胎干细胞和2细胞样细胞(2CLCs) | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，小分子筛选 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2025-10-06 |
Cell type hierarchy reconstruction via reconciliation of multi-resolution cluster tree
2021-09-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab481
PMID:34125905
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研究论文 | 开发了一种名为MRtree的算法，用于从单细胞RNA测序数据构建细胞类型层次结构 | 提出了一种高度灵活的树构建算法，能够从多个分辨率的平面聚类结果生成聚类层次结构 | 需要依赖现有的平面聚类算法，可能受到这些算法固有局限性的影响 | 解决单细胞RNA测序数据分析中分辨率参数选择困难和细胞簇演化特征难以比较的问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 树构建算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2025-10-06 |
Single-cell trajectories of melanoma cell resistance to targeted treatment
2021-Oct-01, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析黑色素瘤细胞对靶向治疗的耐药性发展轨迹 | 首次在单细胞水平揭示黑色素瘤对单药和双药治疗的耐药发展轨迹，发现不同耐药机制的特异性基因程序 | 研究仅基于细胞系模型，未涉及体内肿瘤微环境的影响 | 探索黑色素瘤细胞对靶向治疗的耐药机制 | BRAFV600E突变黑色素瘤细胞系 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | t-SNE, 自组织映射 | 单细胞转录组数据 | 黑色素瘤细胞系在不同处理条件下的单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2025-10-06 |
EZH2 identifies the precursors of human natural killer cells with trained immunity
2021-Sep-24, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别了具有训练免疫能力的人类自然杀伤细胞前体，并发现EZH2是其关键表观遗传标志物 | 首次使用单细胞RNA测序结合TotalSeq™技术追踪训练免疫诱导过程中NK细胞的异质性，识别出CD57-NKG2A+EZH2+IFNG+MKI67+IL12R+IL15R+IL18R+ NK细胞独特亚群作为训练免疫前体 | 传统发育标记无法识别训练免疫前体细胞，需要依赖更先进的单细胞测序技术 | 识别产生训练免疫的人类NK细胞亚群，探索药物干预的潜在调控靶点 | 人类自然杀伤细胞 | 单细胞生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, TotalSeq™技术, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of the cellular heterogeneity and interactions in the injured mouse spinal cord
2021-08-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20210040
PMID:34132743
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠脊髓损伤部位的细胞异质性和相互作用 | 发现新的细胞亚群，并通过受体-配体对表达值识别调控血管生成、胶质增生和纤维化过程中特定细胞相互作用的信号通路 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本验证 | 理解脊髓损伤后细胞异质性和相互作用的分子机制 | 小鼠脊髓损伤部位的所有细胞类型 | 单细胞组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量的小鼠脊髓损伤细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell transcriptomics and epigenomics reveals strong germinal center-associated etiology of autoimmune risk loci
2021-Oct-15, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abh3768
PMID:34623901
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组学和表观基因组学分析人类扁桃体免疫细胞，揭示自身免疫风险位点与生发中心的强相关性 | 首次构建人类扁桃体单细胞转录组和表观基因组图谱，揭示自身免疫遗传变异在生发中心相关细胞群体中具有最强调控潜力 | 研究仅基于扁桃体组织，未验证其他淋巴组织或自身免疫疾病患者样本 | 解析生发中心反应的基因调控原理及其在自身免疫疾病中的作用机制 | 人类扁桃体中的免疫细胞亚群 | 单细胞组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞表观基因组学 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 人类扁桃体组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞表观基因组学 | NA | NA |
| 39 | 2025-10-06 |
A joint deep learning model enables simultaneous batch effect correction, denoising, and clustering in single-cell transcriptomics
2021-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.271874.120
PMID:34035047
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研究论文 | 提出一种联合深度学习模型CarDEC，可同时实现单细胞转录组数据的批次效应校正、去噪和聚类 | 首次在基因表达空间和嵌入空间同时校正批次效应，且能同时进行去噪和聚类分析 | 未提及模型在特定细胞类型或实验条件下的性能限制 | 开发单细胞RNA-seq数据分析方法，解决批次效应问题 | 单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2025-10-06 |
Generation of Pulmonary Endothelial Progenitor Cells for Cell-based Therapy Using Interspecies Mouse-Rat Chimeras
2021-08-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202003-0758OC
PMID:33705684
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定肺内皮祖细胞异质性，并利用种间嵌合体技术从多能干细胞生成功能性内皮祖细胞用于细胞治疗 | 首次鉴定FOXF1cKIT内皮祖细胞亚群，开发通过小鼠-大鼠种间嵌合体从多能干细胞生成功能性内皮祖细胞的新方法 | 研究主要基于动物模型，尚未在人类患者中进行验证 | 研究肺内皮祖细胞的异质性并开发基于干细胞的细胞治疗方法 | 新生人类和小鼠肺组织、小鼠肺内皮祖细胞、ACDMPV疾病模型小鼠 | 细胞生物学 | 新生儿肺疾病 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因编辑, 种间嵌合体技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 新生人类和小鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |