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当前共找到 2886 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of the cellular heterogeneity and interactions in the injured mouse spinal cord
2021-08-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20210040
PMID:34132743
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠脊髓损伤部位的细胞异质性和相互作用 | 发现新的细胞亚群，并通过受体-配体对表达值识别调控血管生成、胶质增生和纤维化过程中特定细胞相互作用的信号通路 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本验证 | 理解脊髓损伤后细胞异质性和相互作用的分子机制 | 小鼠脊髓损伤部位的所有细胞类型 | 单细胞组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量的小鼠脊髓损伤细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell transcriptomics and epigenomics reveals strong germinal center-associated etiology of autoimmune risk loci
2021-Oct-15, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abh3768
PMID:34623901
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组学和表观基因组学分析人类扁桃体免疫细胞，揭示自身免疫风险位点与生发中心的强相关性 | 首次构建人类扁桃体单细胞转录组和表观基因组图谱，揭示自身免疫遗传变异在生发中心相关细胞群体中具有最强调控潜力 | 研究仅基于扁桃体组织，未验证其他淋巴组织或自身免疫疾病患者样本 | 解析生发中心反应的基因调控原理及其在自身免疫疾病中的作用机制 | 人类扁桃体中的免疫细胞亚群 | 单细胞组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞表观基因组学 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 人类扁桃体组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞表观基因组学 | NA | NA |
| 23 | 2025-10-06 |
A joint deep learning model enables simultaneous batch effect correction, denoising, and clustering in single-cell transcriptomics
2021-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.271874.120
PMID:34035047
|
研究论文 | 提出一种联合深度学习模型CarDEC，可同时实现单细胞转录组数据的批次效应校正、去噪和聚类 | 首次在基因表达空间和嵌入空间同时校正批次效应，且能同时进行去噪和聚类分析 | 未提及模型在特定细胞类型或实验条件下的性能限制 | 开发单细胞RNA-seq数据分析方法，解决批次效应问题 | 单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2025-10-06 |
Generation of Pulmonary Endothelial Progenitor Cells for Cell-based Therapy Using Interspecies Mouse-Rat Chimeras
2021-08-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202003-0758OC
PMID:33705684
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定肺内皮祖细胞异质性，并利用种间嵌合体技术从多能干细胞生成功能性内皮祖细胞用于细胞治疗 | 首次鉴定FOXF1cKIT内皮祖细胞亚群，开发通过小鼠-大鼠种间嵌合体从多能干细胞生成功能性内皮祖细胞的新方法 | 研究主要基于动物模型，尚未在人类患者中进行验证 | 研究肺内皮祖细胞的异质性并开发基于干细胞的细胞治疗方法 | 新生人类和小鼠肺组织、小鼠肺内皮祖细胞、ACDMPV疾病模型小鼠 | 细胞生物学 | 新生儿肺疾病 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因编辑, 种间嵌合体技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 新生人类和小鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2025-10-06 |
Detecting cell-type-specific allelic expression imbalance by integrative analysis of bulk and single-cell RNA sequencing data
2021-03, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009080
PMID:33661921
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研究论文 | 开发了BSCET方法，通过整合单细胞和bulk RNA-seq数据检测细胞类型特异性等位基因表达失衡 | 首次提出通过整合少量scRNA-seq数据来从大量bulk RNA-seq数据中推断细胞类型特异性AEI的方法 | 依赖外部scRNA-seq数据集的质量和代表性，且需要准确的细胞类型组成推断 | 开发检测细胞类型特异性等位基因表达失衡的计算方法 | 等位基因表达失衡与人类疾病的关系 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 统计模型 | 基因表达数据 | 两个胰岛bulk RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2025-10-06 |
mDrop-Seq: Massively Parallel Single-Cell RNA-Seq of Saccharomyces cerevisiae and Candida albicans
2021-Dec-27, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines10010030
PMID:35062691
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研究论文 | 开发了一种名为mDrop-seq的高通量单细胞RNA测序技术，用于酵母菌的转录组分析 | 针对微生物物种开发了首个高通量单细胞RNA测序技术，解决了细胞壁坚硬和RNA量低的技术挑战 | 仅应用于两种酵母菌物种，尚未在其他微生物中验证 | 开发适用于微生物的高通量单细胞RNA测序技术并验证其应用价值 | 酿酒酵母和白色念珠菌 | 单细胞测序技术 | 真菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 酿酒酵母35,109个细胞，白色念珠菌39,705个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | mDrop-seq | 微生物Drop-seq技术，专门针对酵母菌优化 |
| 27 | 2025-10-06 |
MUC1-C integrates activation of the IFN-γ pathway with suppression of the tumor immune microenvironment in triple-negative breast cancer
2021-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2020-002115
PMID:33495298
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研究论文 | 本研究揭示MUC1-C通过激活IFN-γ通路诱导免疫抑制并导致三阴性乳腺癌肿瘤免疫微环境中CD8+ T细胞耗竭的机制 | 首次发现MUC1-C是TNBC转录组的主调控因子，通过STAT1和IRF1驱动基因表达，并整合免疫抑制性IFN-γ通路激活与肿瘤免疫微环境改变 | 机制研究主要基于细胞系和数据库分析，需要更多体内实验验证；人类TNBC样本的直接实验证据有限 | 探究MUC1-C在三阴性乳腺癌免疫逃避中的作用机制 | 三阴性乳腺癌细胞系、TCGA-BRCA和METABRIC数据库、TNBC单细胞RNA-seq数据集 | 癌症免疫学 | 三阴性乳腺癌 | shRNA基因沉默、转录组分析、基因集富集分析、qRT-PCR、免疫印迹、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据、转录组数据、单细胞RNA-seq数据 | 多个TNBC细胞系、TCGA-BRCA和METABRIC数据库样本、单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2025-10-06 |
Loss of Mir146b with aging contributes to inflammation and mitochondrial dysfunction in thioglycollate-elicited peritoneal macrophages
2021-08-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.66703
PMID:34423778
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研究论文 | 本研究通过RNA测序发现Mir146b随年龄增长在巨噬细胞中表达下降，并揭示其缺失导致炎症和线粒体功能障碍 | 首次发现Mir146b在巨噬细胞衰老过程中的单向性表达下降及其对炎症和线粒体功能的调控作用 | 研究仅基于硫乙醇酸盐诱导的小鼠腹腔巨噬细胞模型，未在人类样本或其他巨噬细胞类型中验证 | 探索巨噬细胞衰老的分子机制及其与免疫功能障碍的关系 | 小鼠硫乙醇酸盐诱导的腹腔巨噬细胞 | 免疫学 | 老年疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2025-10-06 |
Deficiency of histone lysine methyltransferase SETDB2 in hematopoietic cells promotes vascular inflammation and accelerates atherosclerosis
2021-06-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.147984
PMID:34003795
|
研究论文 | 本研究揭示了组蛋白赖氨酸甲基转移酶SETDB2在造血细胞中通过调控巨噬细胞活化抑制血管炎症和动脉粥样硬化进展的新机制 | 首次发现SETDB2在动脉粥样硬化病变中表达上调，并证明其在造血细胞中缺失会促进血管炎症和加速动脉粥样硬化 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究SETDB2在动脉粥样硬化发病机制中的作用 | 人类和小鼠动脉粥样硬化病变、造血细胞、巨噬细胞 | 表观遗传学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、骨髓移植、基因敲除 | Ldlr基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2025-10-06 |
TWO-SIGMA: A novel two-component single cell model-based association method for single-cell RNA-seq data
2021-03, Genetic epidemiology
IF:1.7Q3
DOI:10.1002/gepi.22361
PMID:32989764
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研究论文 | 开发了一种名为TWO-SIGMA的新型双组分单细胞模型关联方法，用于单细胞RNA-seq数据的差异表达分析 | 首个能同时处理零膨胀计数、样本内相关性、非平衡设计、多层级协变量并支持广义差异表达检验的单细胞RNA-seq分析方法 | 未明确说明对计算资源的要求和在大规模数据集上的可扩展性 | 开发更灵活准确的单细胞RNA-seq差异表达分析方法 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 混合效应逻辑回归模型, 混合效应负二项回归模型 | 基因表达计数数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2025-10-06 |
Multiomic analysis reveals decidual-specific transcriptional programing of MAIT cells
2021-12, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.13495
PMID:34411378
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了子宫蜕膜中MAIT细胞的独特转录编程特征 | 首次在单细胞分辨率下系统比较了子宫蜕膜与匹配外周血MAIT细胞的转录组差异，并证实了蜕膜APCs表达MR1分子 | 样本来源仅限于子宫蜕膜组织，未涉及其他妊娠相关组织；功能验证主要基于体外刺激实验 | 探究妊娠期子宫蜕膜中MAIT细胞的转录编程特征和功能特性 | 子宫蜕膜基底層和壁層的单核细胞及匹配的外周血单个核细胞 | 免疫学 | 妊娠相关疾病 | 多组学分析，流式细胞术，CITE-seq，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据 | 子宫蜕膜组织和匹配的外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq，表位测序 | NA | CITE-seq结合单细胞RNA测序基因表达分析 |
| 32 | 2025-10-06 |
Integration of spatial and single-cell transcriptomics localizes epithelial cell-immune cross-talk in kidney injury
2021-06-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.147703
PMID:34003797
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞测序技术，揭示了肾脏损伤中上皮细胞与免疫细胞相互作用的时空分布特征 | 首次优化了空间转录组学与单核测序数据的协调分析，将30种主要细胞类型定位到人类肾切除标本中，并在两种小鼠AKI模型中发现了免疫细胞浸润的空间特异性机制 | 研究仅基于人类肾切除标本和两种小鼠AKI模型，需要进一步验证其在其他肾脏疾病中的普适性 | 探索急性肾损伤中细胞类型空间分布特征及免疫细胞浸润机制 | 人类肾切除标本、小鼠缺血/再灌注损伤模型、盲肠结扎穿刺模型 | 空间转录组学 | 急性肾损伤 | 空间转录组学, 单核RNA测序, 单细胞测序, CODEX免疫荧光 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 | 人类肾切除标本1例，两种小鼠AKI模型 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 多重免疫荧光 | NA | NA |
| 33 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals lasting changes in the lung cellular landscape into adulthood after neonatal hyperoxic exposure
2021-12, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2021.102091
PMID:34417156
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示新生期高氧暴露对成年后肺细胞景观的持久性改变 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统揭示新生期高氧暴露导致成年期肺细胞组成持续改变，特别是五类II型细胞状态的独特特征和功能变化 | 研究基于小鼠模型，人类样本验证有限；仅观察了两个时间点（pnd7和pnd60） | 探究早期高氧暴露对后期生命阶段肺细胞景观的长期影响及其与肺损伤的关系 | 新生小鼠肺组织细胞 | 单细胞组学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过10,000个细胞，45个细胞簇，32种细胞状态 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2025-10-06 |
Kdm6a deficiency restricted to mouse hematopoietic cells causes an age- and sex-dependent myelodysplastic syndrome-like phenotype
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0255706
PMID:34780480
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研究论文 | 本研究揭示了Kdm6a基因缺陷在小鼠造血细胞中导致年龄和性别依赖的骨髓增生异常综合征样表型 | 首次证明Kdm6a缺陷在造血细胞中会导致年龄和性别依赖的MDS样表型，并利用单细胞RNA-seq技术揭示了其对造血细胞命运决定基因的调控机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，未在人类样本中验证；Kdm6a缺陷小鼠未发展为明显白血病 | 探究Kdm6a基因在正常造血过程中的功能及其在白血病发病机制中的作用 | 雌性Kdm6a条件性敲除小鼠的造血干细胞和祖细胞 | 表观遗传学 | 白血病 | ChIP-seq, ATAC-seq, scRNA-seq | 基因敲除小鼠模型 | 基因组学数据，表观基因组学数据，单细胞转录组数据 | Kdm6a-WT和Kdm6a-KO小鼠样本 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 35 | 2025-10-06 |
CCR2 Signaling Restricts SARS-CoV-2 Infection
2021-12-21, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.02749-21
PMID:34749524
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了CCR2信号通路在限制SARS-CoV-2感染中的保护作用机制 | 首次在小鼠模型中证明CCR2信号通过促进单核细胞肺内浸润限制SARS-CoV-2病毒载量 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明COVID-19先天免疫保护机制 | SARS-CoV-2感染小鼠模型 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 活体抗体标记 | 小鼠感染模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2025-10-06 |
NK and CD8+ T cell phenotypes predict onset and control of CMV viremia after kidney transplant
2021-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.153175
PMID:34609965
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研究论文 | 本研究通过分析肾移植受者中NK细胞和CD8+ T细胞的表型特征，预测巨细胞病毒病毒血症的发生和控制 | 首次在肾移植受者中纵向表征CMV特异性免疫反应，发现未成熟CD56bright NK细胞与病毒血症发生相关，而记忆NK细胞和NK样CD28-CD8+ T细胞与病毒控制相关 | 样本量较小（31例患者），仅针对肾移植受者，结果可能不适用于其他器官移植类型 | 研究肾移植后CMV病毒血症的免疫预测因子和控制机制 | 31例肾移植受者（包括CMV病毒血症患者和匹配的非病毒血症患者） | 免疫学 | 巨细胞病毒感染 | RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, Luminex多重蛋白检测, 流式细胞术 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 细胞表型数据 | 31例肾移植受者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 多重蛋白检测 | NA | NA |
| 37 | 2025-10-06 |
Adenine base editing reduces misfolded protein accumulation and toxicity in alpha-1 antitrypsin deficient patient iPSC-hepatocytes
2021-11-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2021.06.021
PMID:34217893
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研究论文 | 本研究应用腺嘌呤碱基编辑器纠正AATD患者iPSC和肝细胞中的Z突变，减少错误折叠蛋白积累 | 首次在AATD患者iPSC来源的肝细胞中应用腺嘌呤碱基编辑技术纠正致病突变 | 研究未通过全基因组测序发现脱靶突变，但可能存在其他未知限制 | 探索碱基编辑技术纠正α-1抗胰蛋白酶缺乏症致病突变的可行性 | AATD患者诱导多能干细胞及其分化的肝细胞 | 基因编辑 | α-1抗胰蛋白酶缺乏症 | 腺嘌呤碱基编辑,单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 患者来源的iPSC和分化肝细胞 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | NA |
| 38 | 2025-10-06 |
The hepatocyte growth factor/c-met pathway is a key determinant of the fibrotic kidney local microenvironment
2021-Oct-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103112
PMID:34622165
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研究论文 | 本研究通过多学科方法揭示了肝细胞生长因子/c-met信号通路在调控纤维化肾脏局部微环境形成中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序和数学建模结合条件性基因敲除小鼠验证，系统阐明了c-met信号通路在肾脏纤维化微环境调控中的核心机制 | 研究主要基于小鼠模型，在人类慢性肾脏病中的直接适用性需要进一步验证 | 探索肝细胞生长因子/c-met信号通路在肾脏纤维化微环境形成中的调控作用 | 慢性肾脏病模型中的肾小管上皮细胞和巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序，数学建模，条件性基因敲除 | 数学预测模型，基因敲除动物模型 | 单细胞转录组数据 | 多种慢性肾脏病模型小鼠的回顾性单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2025-10-06 |
Characterizing spatial gene expression heterogeneity in spatially resolved single-cell transcriptomic data with nonuniform cellular densities
2021-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.271288.120
PMID:34035045
|
研究论文 | 开发了一种名为MERINGUE的计算框架，用于分析空间分辨单细胞转录组数据中的空间基因表达异质性 | 首个能够考虑组织内细胞类型固有3D空间组织和非均匀细胞密度的可扩展计算方法 | NA | 识别空间异质性表达基因、推断细胞间通讯、进行空间感知的细胞聚类 | 空间分辨转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间自相关和互相关分析 | 计算框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学,多重误差稳健荧光原位杂交,Slide-seq,原位杂交 | MERFISH,空间转录组学,Slide-seq,ISH | NA |
| 40 | 2025-10-06 |
Combinatorial transcription factor profiles predict mature and functional human islet α and β cells
2021-09-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.151621
PMID:34428183
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类胰岛α和β细胞中转录因子组合表达模式，预测高功能成熟细胞亚群 | 首次基于组合转录因子表达谱对人类胰岛细胞进行分层，发现ARX/MAFB（α细胞）和MAFA/MAFB（β细胞）共表达亚群具有更强的葡萄糖感知和激素分泌功能 | 研究仅限于正常人类胰岛细胞，未涉及糖尿病病理状态下的变化 | 定义胰岛细胞中转录因子异质性及其对细胞功能的影响 | 人类胰岛α和β细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, Patch-Seq | NA | 单细胞转录组数据, 电生理数据 | 超过40,000个正常人类胰岛细胞，来自多个供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |