单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-05-29 |
Sequential regulation of hemogenic fate and hematopoietic stem and progenitor cell formation from arterial endothelium by Ezh1/2
2021-07-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.05.014
PMID:34143974
|
研究论文 | 该研究揭示了Ezh1/2通过顺序调控动脉内皮细胞中的血液生成命运和造血干祖细胞形成的机制 | 首次阐明Ezh1在脊椎动物造血干祖细胞产生中的表观遗传调控作用及其与Ezh2的非冗余顺序功能 | 主要在斑马鱼胚胎中进行研究，未在哺乳动物模型中验证，且单细胞RNA测序分析的样本量有限 | 探究Ezh1/2在动脉内皮细胞向血液生成命运转变和造血干祖细胞形成中的调控机制 | 斑马鱼胚胎和诱导多能干细胞来源的体外分化体系 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼胚胎中ezh1不同基因型的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2026-05-29 |
Single-cell RNA-Seq reveals a highly coordinated transcriptional program in mouse germ cells during primordial follicle formation
2021-07, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13424
PMID:34174788
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示小鼠原始卵泡形成过程中生殖细胞的协调转录程序 | 首次通过单细胞RNA测序构建了新生小鼠卵巢生殖细胞发育轨迹，并利用SCENIC算法识别出可能调控卵泡形成的关键转录因子 | 未明确说明 | 阐明原始卵泡形成过程中卵母细胞的发育轨迹和调控机制 | 新生小鼠卵巢中的单个生殖细胞 | 机器学习 | 原发性卵巢功能不全 | RNA-seq | Monocle, SCENIC | 单细胞转录组数据 | 新生（P0.5）小鼠卵巢中的单个生殖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2026-05-29 |
Genome stabilization by RAD51-stimulatory compound 1 enhances efficiency of somatic cell nuclear transfer-mediated reprogramming and full-term development of cloned mouse embryos
2021-Jul, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13059
PMID:34021643
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研究论文 | 发现通过RAD51激活剂RS-1稳定基因组可提高体细胞核移植重编程效率及克隆小鼠胚胎全程发育能力 | 首次揭示RAD51活性在体细胞核移植胚胎中低于IVF，并通过RS-1激活RAD51增强DNA损伤修复，克服发育阻滞，提高克隆胚胎生产效率 | 未提及具体局限性，可能涉及RS-1的长期安全性或机制中组蛋白去甲基化酶独立通路的细节未完全阐明 | 研究修复遗传不稳定性或DNA双链断裂在体细胞核移植重编程中的作用，以提高胚胎发育效率 | 体外受精胚胎和体细胞核移植来源的小鼠胚胎 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（single-cell RNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 包括体细胞核移植胚胎和IVF胚胎，具体数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2026-05-29 |
The relationship between the gut microbiome and host gene expression: a review
2021-May, Human genetics
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s00439-020-02237-0
PMID:33221945
|
综述 | 探讨肠道微生物组与宿主基因表达之间的相互影响关系 | 系统总结肠道微生物如何通过重塑染色质、差异剪接、表观遗传改变和信号级联干扰来调节宿主基因表达 | 未提及具体局限性 | 理解肠道微生物与宿主基因表达的交互机制及其对疾病和健康的重要性 | 模式生物、人体活检样本和细胞培养物 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2026-05-29 |
Single cell RNA sequencing identifies IGFBP5 and QKI as ciliated epithelial cell genes associated with severe COPD
2021-Apr-06, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-021-01675-2
PMID:33823868
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别与严重COPD相关的纤毛上皮细胞基因IGFBP5和QKI | 首次在单细胞水平上确定与严重COPD相关的纤毛上皮细胞特异性基因表达变化，并验证了IGFBP5和QKI蛋白水平在COPD肺组织中的改变 | 样本量较小（各3例），可能限制发现的普遍性；未进行功能验证实验以确认基因与COPD病理机制的因果关系 | 确定严重慢性阻塞性肺疾病（COPD）中细胞特异性的转录组变化 | 严重COPD患者和健康非吸烟者的外周肺实质组织细胞 | 单细胞转录组学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例严重COPD患者和3例健康非吸烟者，共29,961个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 26 | 2026-05-29 |
Schistosoma mansoni venom allergen-like protein 6 (SmVAL6) maintains tegumental barrier function
2021-03, International journal for parasitology
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.ijpara.2020.09.004
PMID:33253697
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研究论文 | 本研究首次揭示了曼氏血吸虫毒液过敏原样蛋白6 (SmVAL6) 在维持表皮屏障功能中的关键作用 | 首次提供第二组SmVAL在血吸虫生物学中具有必要功能的实验证据，并鉴定出与其直接相互作用的蛋白伴侣 | 未进行体内功能验证，且对其他第二组SmVAL家族成员的功能研究仍缺乏 | 探究第二组SmVAL家族成员SmVAL6在血吸虫生物学中的具体功能 | 曼氏血吸虫成虫及其卵细胞 | NA | 寄生虫病 | RNA干扰、酵母双杂交、单细胞RNA测序、原位杂交 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 未具体说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2026-05-29 |
Loss of Claudin-3 Impairs Hepatic Metabolism, Biliary Barrier Function, and Cell Proliferation in the Murine Liver
2021, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.04.003
PMID:33866021
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研究论文 | 研究Claudin-3缺失对小鼠肝脏代谢、胆道屏障功能及细胞增殖的影响 | 首次揭示紧密连接蛋白Claudin-3在肝脏代谢稳态、胆汁酸保留和肝再生中肝细胞增殖中的必要性 | 未明确Claudin-3缺失导致代谢途径下调的分子机制，且仅在小鼠模型中验证 | 探索Claudin-3在肝脏代谢、屏障功能和细胞增殖中的调控及功能重要性 | 小鼠肝脏组织及肝细胞、胆管细胞 | 机器学习 | 肝脏疾病 | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年Cldn3-/-与Cldn3+/+小鼠肝脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-05-28 |
Categorization of lung mesenchymal cells in development and fibrosis
2021-Jun-25, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102551
PMID:34151224
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，对小鼠和人类肺发育及纤维化过程中的间充质细胞进行分类 | 首次系统鉴定并描绘了胚胎、出生后、成年及老化纤维化肺中间充质细胞的转录组特征，发现了一种表达特定基因的新细胞亚群，并描述了亚型选择性转录因子及发育过程中的分化路径 | 未明确说明局限性 | 阐明肺间充质细胞在发育和纤维化过程中的异质性 | 小鼠和人类肺间充质细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种发育阶段（胚胎、出生后、成年、老化）及纤维化状态的小鼠和人类肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2026-05-28 |
Obtaining purified human intestinal epithelia for single-cell analysis and organoid culture
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100597
PMID:34169291
|
研究论文 | 描述从人类胎儿和儿童肠道组织制备高活性上皮单细胞悬液并用于单细胞RNA测序和类器官培养的协议 | 提供了从人类胎儿和儿童肠道组织中高效分离纯化上皮细胞以进行单细胞分析和类器官培养的详细方案 | 未明确说明 | 开发从人类肠道组织获得纯化上皮单细胞用于单细胞分析和类器官培养的标准化协议 | 人类胎儿和儿童肠道组织及由该组织产生的肠道类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、类器官培养 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人类胎儿和儿童肠道组织样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2026-05-28 |
Collection and preprocessing of fine needle aspirate patient samples for single cell profiling and data analysis
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100581
PMID:34151301
|
研究论文 | 本文描述了对皮肤细针穿刺样本进行采集、预处理以用于单细胞RNA测序和数据分析的协议 | 提出了一种从细针穿刺样本中获取高质量单细胞测序数据的系统方法，包括活细胞生物库建立和预处理流程 | 未提及具体的局限性 | 建立细针穿刺样本的单细胞分析方法，实现临床样本中细胞异质性的高通量检测 | 皮肤细针穿刺样本中的单细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2026-05-28 |
Charting human development using a multi-endodermal organ atlas and organoid models
2021-06-10, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.04.028
PMID:34019796
|
研究论文 | 通过构建多内胚层器官图谱和类器官模型，描绘人类发育过程中的细胞动态和分子机制 | 首次整合多器官单细胞转录组图谱与类器官模型，系统揭示呼吸和胃肠道内胚层器官发育的细胞状态、转录因子及间质-上皮互作，并利用图谱作为高维搜索空间评估类器官培养条件 | 未提及具体限制，可能包括样本数量有限、类器官模型无法完全模拟体内复杂环境等 | 利用单细胞图谱和类器官技术解析人类内胚层器官发育的细胞多样性和分子调控 | 内胚层器官的细胞状态、转录因子及器官特异性上皮干细胞和间充质相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个发育中的人体呼吸和胃肠道内胚层器官样本 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 32 | 2026-05-28 |
Naive stem cell blastocyst model captures human embryo lineage segregation
2021-06-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.04.031
PMID:33957081
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研究论文 | 通过自我组织生成人类胚胎模型（囊胚样结构），模拟自然囊胚的谱系分离 | 首次通过短暂诱导滋养外胚层在3天内形成具有三种组织层的囊胚样结构，且单细胞转录组分析证实其高保真度模拟人类胚胎 | 未在摘要中提及模型在长期发育或植入后阶段的适用性及潜在局限性 | 建立可扩展的体外人类胚胎模型以研究早期谱系分离 | 人类原始多能细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未在摘要中明确样本数量，但涉及多批次囊胚样结构 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2026-05-28 |
Dissecting the microenvironment around biosynthetic scaffolds in murine skin wound healing
2021-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abf0787
PMID:34039601
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析生物合成支架周围微环境在小鼠皮肤伤口愈合中的作用 | 首次利用单细胞RNA测序全面解析不同表面形貌的静电纺丝支架周围的免疫细胞异质性，并发现定向支架促进适应性免疫主导阶段、揭示T细胞调节毛囊再生的新机制 | 仅在小鼠和大鼠模型中验证，缺乏临床人体数据验证 | 研究生物材料表面形貌对伤口愈合和免疫调节特性的影响 | 小鼠和大鼠的背部皮肤全层伤口 | 数字病理学 | 皮肤创伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠和大鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞测序系统 |
| 34 | 2026-05-27 |
Integrated single-cell transcriptome analysis reveals heterogeneity of esophageal squamous cell carcinoma microenvironment
2021-12-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27599-5
PMID:34921160
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研究论文 | 对食管鳞状细胞癌微环境进行单细胞转录组测序分析，揭示其细胞异质性和免疫抑制特征 | 首次鉴定出具有预后价值的肿瘤特异性CST1肌成纤维细胞亚群，并在其他癌症类型中验证其高肿瘤特异性；发现并验证了抗原呈递成纤维细胞亚群 | 样本量相对有限（11例患者），可能需要更大规模研究验证发现的普遍性 | 揭示食管鳞状细胞癌微环境的细胞异质性和免疫特性 | 食管鳞状细胞癌患者的血液、癌旁正常组织和肿瘤组织样本 | 机器学习 | 食管癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 11例食管鳞状细胞癌患者的62,161个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2026-05-27 |
Retinal Organoids Long-Term Functional Characterization Using Two-Photon Fluorescence Lifetime and Hyperspectral Microscopy
2021, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2021.796903
PMID:34955757
|
研究论文 | 采用双光子荧光寿命和超光谱显微技术对视网膜类器官进行长期功能表征 | 首次引入基于双光子显微镜的活体成像技术，结合荧光寿命成像（FLIM）和超光谱成像，无损监测和表征视网膜类器官的长期发育过程，发现代谢从糖酵解向氧化磷酸化的转变及光感受器基因表达的时序规律 | 研究未明确提及局限性，但可能包括样本量有限、技术依赖复杂设备、结果外推至临床需进一步验证 | 改进视网膜类器官的质量控制，通过活体成像技术无损监测其长期发育过程 | 人诱导多能干细胞来源的视网膜类器官 | 计算机视觉 | NA | 双光子荧光寿命成像, 超光谱成像, 定量PCR, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 定量PCR | NA | NA |
| 36 | 2026-05-25 |
Processing single-cell RNA-seq data for dimension reduction-based analyses using open-source tools
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100450
PMID:33982010
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研究论文 | 演示使用开源软件构建模块化单细胞RNA测序数据分析流程 | 提供模块化、灵活的开源数据分析流程，克服商业平台的固定性限制 | 未提及通用解决方案区分信息性或非信息性包裹细胞材料，流程灵活性优先但无特定创新方法 | 构建并展示单细胞RNA测序数据的完整分析流程 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | RNA-seq | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2026-05-25 |
Cell population analysis of the adult murine subependymal neurogenic lineage by flow cytometry
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100425
PMID:33899012
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protocol | 本文提供了一个基于流式细胞术的协议，用于成体小鼠室管膜下神经源性谱系的细胞群体分析 | 无需报告小鼠即可将成体啮齿类动物室膜下区神经源性谱系的所有细胞分类和分离为不同细胞群体，包括三个具有与单细胞转录组学一致的分子特征的神经干细胞组分 | NA | 提供一种基于流式细胞术的分类和分离方法，用于研究成体神经干细胞群体的循环异质性和静止-激活转换 | 成体小鼠室膜下区神经源性谱系细胞，包括三个神经干细胞组分 | machine learning | NA | 流式细胞术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2026-05-25 |
Spatial transcriptomics of the nematode Caenorhabditis elegans using RNA tomography
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100411
PMID:33870220
|
protocol | 本文介绍了一种结合mRNA测序与冷冻切片技术的RNA断层扫描方法，用于在秀丽隐杆线虫中生成近乎细胞分辨率的前后轴基因表达图谱 | 将该技术适配到线虫模型，并提供了两种实验方案：一种最大化灵敏度，另一种适用于部分自动化以节省时间 | 未明确说明局限性信息 | 提供详细的RNA tomography实验协议，用于线虫空间转录组分析 | 秀丽隐杆线虫（Caenorhabditis elegans） | NA | NA | RNA tomography (tomo-seq), mRNA sequencing, cryo-sectioning | NA | gene expression data | NA | NA | spatial transcriptomics | NA | NA |
| 39 | 2026-05-25 |
Single-cell RNA sequencing of human liver reveals hepatic stellate cell heterogeneity
2021-Jun, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2021.100278
PMID:34027339
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类肝脏中肝星状细胞的异质性 | 首次在人类肝脏中描绘出肝星状细胞存在两种具有独特基因表达特征和不同小叶内定位的亚群 | 未提及具体局限性 | 利用单细胞RNA测序揭示人类肝细胞尤其是肝细胞和肝星状细胞的异质性 | 新鲜分离的人类肝脏细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约25,000个新鲜分离的人类肝脏细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用基于液滴的RNA测序技术 |
| 40 | 2026-05-25 |
TCF7 is not essential for glucose homeostasis in mice
2021-06, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2021.101213
PMID:33741532
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研究论文 | 在小鼠中研究转录因子7在肝细胞和胰岛β细胞中对葡萄糖稳态的代谢重要性 | 通过条件性基因敲除和单细胞RNA-seq分析，首次明确TCF7主要在胰岛免疫细胞中表达，而非β细胞，且对葡萄糖稳态并非必需 | 主要基于小鼠模型，结论可能不完全适用于人类；未涉及TCF7在胰腺发育或其他代谢条件下的潜在作用 | 探讨TCF7在肝细胞和胰岛β细胞中对葡萄糖稳态的相对代谢重要性 | 成年小鼠 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA-seq, 腺病毒Cre重组, 基因敲除 | NA | 基因表达数据, 组织学数据 | 包括野生型小鼠、Tcf7β细胞特异性敲除小鼠、全身Tcf7敲除小鼠和免疫缺陷Rag2-/-Il2rg-/-小鼠的数量未明确指定 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |