单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2025-10-07 |
The molecular landscape of neural differentiation in the developing Drosophila brain revealed by targeted scRNA-seq and multi-informatic analysis
2021-04-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109039
PMID:33909998
|
研究论文 | 通过靶向单细胞RNA测序和多信息学分析揭示果蝇大脑发育过程中的神经分化分子图谱 | 首次在果蝇II型神经母细胞谱系中应用靶向scRNA-seq技术，结合计算分析和原位验证，从单一发育时间点解析分子景观 | 研究仅基于三龄幼虫大脑的单一发育时间点，缺乏时间序列动态观察 | 研究果蝇大脑发育过程中的神经分化分子机制 | 果蝇三龄幼虫大脑中的II型神经母细胞谱系 | 单细胞基因组学 | NA | 靶向单细胞mRNA测序, 多信息学分析, 原位验证 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 果蝇三龄幼虫大脑细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 342 | 2025-10-07 |
Rapid microfluidic isolation of virally infected primary bronchial epithelial cells for single-cell RNA sequencing
2021-07-16, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.2144/btn-2021-0020
PMID:34269076
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研究论文 | 介绍了一种使用微流控设备快速分离病毒感染的原代支气管上皮细胞用于单细胞RNA测序的优化方法 | 开发了可在生物安全柜内操作、使用常规实验室设备即可快速分离病毒感染细胞的微流控方法 | NA | 建立病毒感染支气管上皮细胞的高效分离方法以促进单细胞RNA测序研究 | 病毒感染的原代支气管上皮细胞和细胞系 | 单细胞测序技术 | 呼吸道病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 343 | 2025-10-07 |
Deep learning and alignment of spatially resolved single-cell transcriptomes with Tangram
2021-11, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01264-7
PMID:34711971
|
研究论文 | 提出Tangram方法，将单细胞转录组数据与空间数据对齐，构建全基因组单细胞分辨率空间图谱 | 开发了能够将多种单细胞RNA测序数据与不同形式空间数据（包括MERFISH、STARmap、smFISH、空间转录组学和组织学图像）对齐的首个通用方法 | NA | 解决单细胞测序技术丢失空间信息与空间转录组技术分辨率有限的问题 | 健康小鼠脑组织视觉和体感运动区域 | 空间转录组学 | NA | scRNA-seq, snRNA-seq, MERFISH, STARmap, smFISH, SHARE-seq | 深度学习 | 单细胞转录组数据，空间转录组数据，多模态数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | 10x Visium | 空间转录组学技术 |
| 344 | 2025-10-07 |
A comprehensive survey of regulatory network inference methods using single cell RNA sequencing data
2021-05-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa190
PMID:34020546
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综述 | 本文系统回顾了15种利用单细胞RNA测序数据推断基因调控网络的计算方法 | 首次对单细胞RNA测序数据下的调控网络推断方法进行全面比较分析，包括模拟评估方法的性能、对dropout的敏感性和时间复杂性 | 仅涵盖15种方法，可能未包含该领域所有最新进展；基于模拟数据的评估可能与真实生物系统存在差异 | 帮助生命科学家选择适合其数据和分析目的的方法，并为计算科学家开发新方法提供参考 | 基因调控网络推断方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 345 | 2025-10-07 |
The Nuclear Receptor ESRRA Protects from Kidney Disease by Coupling Metabolism and Differentiation
2021-02-02, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2020.11.011
PMID:33301705
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示肾脏疾病中细胞多样性变化，发现近端小管细胞是易感细胞类型，并阐明代谢与细胞分化通过核受体ESRRA和PPARA耦合的机制 | 首次在单细胞水平系统揭示肾脏疾病中细胞特异性变化轨迹，发现代谢与细胞分化的耦合机制及核受体ESRRA的保护作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证尚不充分 | 探究肾脏疾病的细胞分子机制及保护性因子 | 小鼠肾脏疾病模型和患者样本 | 单细胞生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 细胞轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 小鼠疾病模型和患者样本（具体数量未明确） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 346 | 2025-10-07 |
Neurodevelopmental disorders: 2021 update
2021-Jan, Free neuropathology
|
综述 | 本文总结了2021年神经发育障碍研究领域的最新进展，重点关注遗传学发现和新兴研究技术 | 揭示了神经发育障碍的遗传结构特征，包括独特的基因组DNA甲基化模式和体细胞突变的作用，并介绍了多基因编辑与单细胞RNA测序相结合的新研究范式 | 从遗传学发现到神经病理学机制的转化研究仍面临挑战 | 探讨神经发育障碍的病因学和风险因素 | 神经发育障碍，包括自闭症谱系障碍、发育迟缓、智力残疾和注意力缺陷多动障碍 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序，基因组DNA甲基化分析，多基因编辑 | NA | 基因组数据，表观遗传数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 347 | 2025-10-07 |
Single-cell profiling reveals the trajectories of natural killer cell differentiation in bone marrow and a stress signature induced by acute myeloid leukemia
2021-05, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-020-00574-8
PMID:33239726
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示骨髓中自然杀伤细胞的分化轨迹及急性髓系白血病诱导的应激特征 | 首次在人类骨髓中发现NK0细胞作为NK1样和NK2样细胞的前体，并揭示AML对NK细胞异质性的深远影响 | 样本来源仅限于人类骨髓和脾脏，未涉及其他组织或更大规模验证 | 探究骨髓中自然杀伤细胞的分化轨迹及急性髓系白血病对其功能的影响 | 人类骨髓和脾脏中的自然杀伤细胞，包括健康个体和急性髓系白血病患者 | 单细胞生物学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 人类骨髓和脾脏NK细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 348 | 2025-10-07 |
Multiomics: unraveling the panoramic landscapes of SARS-CoV-2 infection
2021-10, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-021-00754-0
PMID:34471261
|
综述 | 本文系统回顾了通过多组学技术研究SARS-CoV-2感染在病毒学、免疫学和致病机制方面的主要进展 | 整合多种组学技术（基因组学、蛋白质组学、代谢组学、单细胞转录组学）实现对病原体和疾病的全景式快速解析 | 基于已建立队列的研究，需要更多验证性研究支持 | 快速识别和理解新兴传染病的病原体、风险因素、宿主免疫反应和致病机制 | SARS-CoV-2病毒及其引起的COVID-19疾病 | 多组学分析 | COVID-19 | 多组学技术，包括基因组学、蛋白质组学、代谢组学、单细胞转录组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 349 | 2025-10-07 |
Natural genetic variation determines microglia heterogeneity in wild-derived mouse models of Alzheimer's disease
2021-02-09, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.108739
PMID:33567283
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究野生来源小鼠品系中小胶质细胞在阿尔茨海默病模型中的遗传变异影响 | 首次在野生来源小鼠品系中系统分析遗传多样性对小胶质细胞异质性和阿尔茨海默病反应的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探索遗传变异如何影响阿尔茨海默病中小胶质细胞的异质性和功能 | C57BL/6J和野生来源小鼠品系（WSB/EiJ、CAST/EiJ、PWK/PhJ）的小胶质细胞 | 单细胞基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | APP/PS1小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 四个小鼠品系（包括APP/PS1转基因和对照） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 350 | 2025-10-07 |
An N-Cadherin 2 expressing epithelial cell subpopulation predicts response to surgery, chemotherapy and immunotherapy in bladder cancer
2021-08-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25103-7
PMID:34385456
|
研究论文 | 通过单细胞多组学技术鉴定膀胱癌中表达N-Cadherin 2的上皮细胞亚群及其对治疗反应的预测价值 | 首次发现CDH12富集肿瘤对手术/化疗与免疫治疗呈现相反疗效反应，提供优于现有分型的预测标志物 | 需进一步验证临床实用性及机制研究 | 开发膀胱癌治疗反应预测生物标志物 | 人类膀胱癌组织样本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单核RNA测序, 空间转录组, 单细胞空间蛋白质组 | NA | 单细胞RNA序列, 空间转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 351 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA transcriptome landscape of hepatocytes and non-parenchymal cells in healthy and NAFLD mouse liver
2021-Nov-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103233
PMID:34755088
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了健康和非酒精性脂肪肝小鼠肝脏中肝细胞及非实质细胞的转录组景观 | 发现了肝星状细胞在基因表达调控和向肌成纤维细胞转分化中的双重作用，识别了三种嵌合型非实质细胞 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究非酒精性脂肪肝发病机制的细胞分子基础 | 健康和非酒精性脂肪肝小鼠肝脏中的肝细胞及非实质细胞 | 单细胞组学 | 非酒精性脂肪肝 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 82,168个单细胞转录组，涵盖不同NAFLD阶段 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 352 | 2025-10-07 |
Cobolt: integrative analysis of multimodal single-cell sequencing data
2021-12-28, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02556-z
PMID:34963480
|
研究论文 | 提出Cobolt方法用于整合分析多模态单细胞测序数据 | 不仅能分析联合模态平台的数据，还提供了整合不同模态测量的多个数据集的一致框架 | NA | 开发多模态单细胞测序数据的整合分析方法 | 单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 多组学单细胞测序 | NA | NA |
| 353 | 2025-10-07 |
Ex vivo mass cytometry analysis reveals a profound myeloid proinflammatory signature in psoriatic arthritis synovial fluid
2021-12, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-220280
PMID:34226188
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研究论文 | 本研究通过质谱流式细胞术和多组学分析揭示了银屑病关节炎滑液中髓系细胞的显著促炎特征 | 首次在无体外刺激条件下发现银屑病关节炎滑液中的经典单核细胞、中间单核细胞和巨噬细胞自发产生高水平骨桥蛋白和CCL2等促炎介质 | 研究样本量有限，且主要关注髓系细胞而T细胞自发细胞因子产生较少 | 识别银屑病关节炎滑液和血液中淋巴细胞和髓系细胞在无刺激条件下的细胞因子产生情况 | 银屑病关节炎患者的滑液和配对血液白细胞 | 免疫学 | 银屑病关节炎 | 质谱流式细胞术, 转录组分析, 单细胞RNA测序, ELISA, LEGENDplex分析 | NA | 细胞表型数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 | 银屑病关节炎患者的滑液和配对血液样本 | NA | 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序, 基因芯片, 蛋白质检测 | NA | NA |
| 354 | 2024-08-09 |
Single cell and spatial transcriptomics in human tendon disease indicate dysregulated immune homeostasis
2021-11, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-220256
PMID:34001518
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 355 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis identifies skin-specific T-cell responses in systemic sclerosis
2021-11, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-220209
PMID:34031030
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析鉴定系统性硬化症皮肤特异性T细胞反应 | 首次在系统性硬化症患者皮肤中鉴定出表达CXCL13的再循环T细胞亚群，该细胞群具有滤泡辅助T细胞样基因表达特征 | 样本量相对有限，仅包含27名患者和10名健康供体 | 解析系统性硬化症皮肤中T细胞介导的免疫反应机制 | 系统性硬化症患者和健康供体的皮肤活检样本 | 单细胞转录组学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序，共聚焦免疫荧光显微镜 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 3729个CD3+淋巴细胞（867个来自正常皮肤，2862个来自SSc皮肤），来自27名活动性SSc患者和10名健康供体 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 液滴式单细胞测序技术 |
| 356 | 2025-10-07 |
Tenascin-C-mediated suppression of extracellular matrix adhesion force promotes entheseal new bone formation through activation of Hippo signalling in ankylosing spondylitis
2021-07, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-220002
PMID:33858850
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研究论文 | 本研究揭示了肌腱蛋白C通过抑制细胞外基质粘附力激活Hippo信号通路，从而促进强直性脊柱炎附着点新骨形成的分子机制 | 首次发现FSP1+成纤维细胞来源的TNC通过调控ECM机械特性激活Hippo/YAP信号通路促进软骨内成骨 | 动物模型与人类疾病存在差异，临床样本数量有限 | 探究TNC在强直性脊柱炎附着点新骨形成中的作用及分子机制 | 强直性脊柱炎患者韧带组织、胶原抗体诱导关节炎模型、DBA/1小鼠模型 | 病理机制研究 | 强直性脊柱炎 | 免疫组化染色、原子力显微镜、RNA测序、单细胞RNA测序、免疫荧光染色 | NA | 组织样本、基因表达数据、机械特性数据 | 患者手术获取的韧带组织样本及动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 357 | 2025-10-07 |
Monocyte and bone marrow macrophage transcriptional phenotypes in systemic juvenile idiopathic arthritis reveal TRIM8 as a mediator of IFN-γ hyper-responsiveness and risk for macrophage activation syndrome
2021-05, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2020-217470
PMID:33277241
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析发现系统性幼年特发性关节炎中单核细胞和骨髓巨噬细胞的TRIM8过表达是IFN-γ超反应性的分子机制 | 首次发现TRIM8在SJIA单核细胞中上调并通过体外实验证实其增强巨噬细胞IFN-γ反应性 | 骨髓巨噬细胞样本量较小（仅1例患者），需要更大规模验证 | 探究系统性幼年特发性关节炎中单核细胞和巨噬细胞的极化表型及IFN反应分子特征 | 系统性幼年特发性关节炎患者的外周血单核细胞和骨髓巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 幼年特发性关节炎 | RNA-seq, scRNA-seq, 基因敲低 | NA | 转录组数据 | 26例SJIA患者外周血单核细胞，1例SJIA合并MAS患者骨髓巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 358 | 2025-10-07 |
Regulatory eosinophils induce the resolution of experimental arthritis and appear in remission state of human rheumatoid arthritis
2021-04, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2020-218902
PMID:33148700
|
研究论文 | 本研究发现了调节性嗜酸性粒细胞在关节炎消退中的作用机制 | 首次揭示嗜酸性粒细胞在关节炎中具有促消退功能，并鉴定出与肺部炎性嗜酸性粒细胞不同的关节调节性嗜酸性粒细胞亚群 | 机制研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究嗜酸性粒细胞在类风湿关节炎消退过程中的作用机制 | 小鼠模型和人类类风湿关节炎患者 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 359 | 2025-10-07 |
Costimulation of γδTCR and TLR7/8 promotes Vδ2 T-cell antitumor activity by modulating mTOR pathway and APC function
2021-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003339
PMID:34937742
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研究论文 | 本研究开发了一种通过共刺激γδTCR和TLR7/8来扩增Vδ2 T细胞的新方法，并验证其抗肿瘤活性 | 首次发现γδTCR和TLR7/8共刺激可增强Vδ2 T细胞抗肿瘤功能，并揭示其通过调节mTOR通路和APC功能的作用机制 | 研究主要基于体外和动物模型，尚未进行临床试验验证 | 开发更有效的γδ T细胞癌症免疫治疗方法 | Vδ2 T细胞、抗原呈递细胞、肿瘤细胞 | 免疫学、癌症免疫治疗 | 癌症 | 单细胞测序、反相蛋白阵列、体外共培养、动物模型 | NA | 蛋白质表达数据、基因表达数据、细胞功能数据 | 人PBMCs、人脾细胞、人源化NSG小鼠 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 360 | 2025-10-07 |
A scoping review on the potentiality of PD-L1-inhibiting microRNAs in treating colorectal cancer: Toward single-cell sequencing-guided biocompatible-based delivery
2021-Nov, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2021.112213
PMID:34560556
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综述 | 本文探讨了PD-L1抑制性microRNAs在结直肠癌治疗中的潜力及单细胞测序指导的生物相容性递送策略 | 首次系统综述了多种PD-L1抑制性miRNAs在结直肠癌治疗中的作用，并提出了单细胞测序指导的生物相容性递送新策略 | 仅纳入了2021年3月17日前的文献，未进行定量meta分析 | 评估PD-L1抑制性miRNAs在结直肠癌治疗中的潜力及递送策略 | 结直肠癌细胞及PD-L1抑制性microRNAs | 生物医学 | 结直肠癌 | 单细胞测序，文献系统检索 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |