单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 2881 - 2885 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2881 | 2024-08-09 |
A single-cell map for the transcriptomic signatures of peripheral blood mononuclear cells in end-stage renal disease
2021-03-29, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
DOI:10.1093/ndt/gfz227
PMID:31883338
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，生成了来自健康志愿者和终末期肾病患者的单核细胞转录组图谱，并进行了无监督聚类和注释分析。 | 本研究首次生成了终末期肾病患者外周血单核细胞的高分辨率转录组图谱，并揭示了细胞类型特异性的终末期肾病相关通路和转录因子。 | 由于使用的是混合样本分析，结果的普遍性受到限制。 | 旨在深入了解终末期肾病中免疫异常的机制。 | 终末期肾病患者和健康志愿者的外周血单核细胞。 | 数字病理学 | 终末期肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 10名健康志愿者和10名终末期肾病患者的外周血单核细胞，共生成12,981和9,578个单细胞转录组。 |
| 2882 | 2024-08-09 |
Nature-Inspired Compressed Sensing for Transcriptomic Profiling From Random Composite Measurements
2021-Sep, IEEE transactions on cybernetics
IF:9.4Q1
DOI:10.1109/TCYB.2019.2951402
PMID:31751263
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研究论文 | 本文提出了一种基于差分进化和压缩感知的数学框架DECS，用于从低维随机复合测量中重建高维基因表达数据 | DECS方法利用基因表达数据的固有稀疏性，能够从低维随机复合测量中学习稀疏模块字典和水平，以显著的量级（例如200倍）重建高维基因表达数据 | NA | 解决基因表达数据与随机复合测量之间关系的长期挑战 | 基因表达数据 | 生物信息学 | NA | RNA-Seq | 差分进化（DE） | 基因表达数据 | 九个GSE数据集 |
| 2883 | 2024-08-09 |
EPGA-SC : A Framework for de novo Assembly of Single-Cell Sequencing Reads
2021 Jul-Aug, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2019.2945761
PMID:31603794
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研究论文 | 本文介绍了一种名为EPGA-SC的新框架，用于单细胞测序读取数据的从头组装 | EPGA-SC通过分类读取、使用多组高精度配对末端读取以及开发新的算法来去除嵌合错误和扩展连续片段，以解决单细胞测序数据中的错误和偏差问题 | EPGA-SC在处理极度不平衡和丰富错误类型的单细胞测序数据时，性能仍有提升空间 | 开发一种新的框架，用于提高单细胞测序数据组装的准确性和效率 | 单细胞测序读取数据的从头组装 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | 七个数据集 |
| 2884 | 2024-08-09 |
A Gene Rank Based Approach for Single Cell Similarity Assessment and Clustering
2021 Mar-Apr, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2019.2931582
PMID:31369384
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研究论文 | 本文介绍了一种基于基因排序的单细胞相似性评估和聚类方法BioRank | BioRank是一种新的细胞相似性评估方法，基于注释基因集和基因排序，能够更好地进行单细胞聚类 | scRNA-seq数据分析面临高噪声、高维度和稀疏性的挑战，且多个潜在因素对基因表达异质性和细胞类型识别能力的影响尚不明确 | 旨在克服scRNA-seq数据分析中的挑战，准确识别不同的细胞类型 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 12个公共scRNA-seq数据集 |
| 2885 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing of In Vitro Expanded Chondrocytes: MSC-Like Cells With No Evidence of Distinct Subsets
2021-12, Cartilage
IF:2.7Q1
DOI:10.1177/1947603519847746
PMID:31072202
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨体外扩增软骨细胞的异质性 | 发现体外扩增的软骨细胞没有明显的亚群区分，且大多数细胞表达间充质干细胞的所有标志物 | NA | 研究体外扩增软骨细胞的异质性，用于自体软骨细胞移植 | 人关节软骨细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 86个单细胞 |