单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 2861 - 2880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2861 | 2024-08-09 |
Defining the Skin Cellular Community Using Single-Cell Genomics to Advance Precision Medicine
2021-02, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2020.05.104
PMID:32713511
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研究论文 | 本文探讨了单细胞基因组学在皮肤细胞群研究中的应用，特别是通过单细胞RNA测序技术，以推动精准医学的发展 | 单细胞基因组学技术使得对人类组织中不同细胞类型的角色和功能进行高分辨率分析成为可能，为理解细胞通路和相互作用提供了新的视角 | 文章指出，尽管单细胞RNA测序技术具有显著优势，但在实际应用中仍面临实现有意义结果的挑战 | 研究旨在通过单细胞基因组学技术深入理解皮肤细胞群，推动精准医学的进步 | 研究对象为皮肤细胞，包括健康和疾病状态下的皮肤细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 2862 | 2024-08-09 |
Cell Surface Protein mRNAs Show Differential Transcription in Pyramidal and Fast-Spiking Cells as Revealed by Single-Cell Sequencing
2021-01-05, Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991)
DOI:10.1093/cercor/bhaa195
PMID:32710103
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研究论文 | 本研究通过单细胞mRNA测序技术，揭示了前额叶皮层中锥体细胞和快速放电细胞表面蛋白mRNA的差异转录 | 首次通过单细胞测序技术，识别了前额叶皮层中锥体细胞和快速放电细胞的特定表达转录本，并将其与精神疾病相关的细胞机制联系起来 | 研究仅限于小鼠前额叶皮层的急性脑切片，未来研究需扩展到更多物种和更广泛的脑区 | 扩展药物治疗的可能性，并更好地理解临床使用药物的细胞和网络效应 | 前额叶皮层中的锥体细胞和快速放电细胞 | 神经科学 | 精神疾病 | 单细胞mRNA测序 | NA | mRNA | 19,685个转录本 |
| 2863 | 2024-08-09 |
"Zooming in" on Glioblastoma: Understanding Tumor Heterogeneity and its Clinical Implications in the Era of Single-Cell Ribonucleic Acid Sequencing
2021-02-16, Neurosurgery
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/neuros/nyaa305
PMID:32674143
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术深入探讨了胶质母细胞瘤的异质性及其临床意义 | 引入了单细胞RNA测序技术，以更详细地理解胶质母细胞瘤的异质性 | NA | 探讨胶质母细胞瘤的异质性及其对个性化医疗的影响 | 胶质母细胞瘤的基因组和转录组异质性 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2864 | 2024-08-09 |
Immune cell infiltration features and related marker genes in lung cancer based on single-cell RNA-seq
2021-Feb, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-020-02435-2
PMID:32656582
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了肺癌中的免疫细胞浸润特征及相关标记基因 | 揭示了肺癌组织与正常组织中免疫细胞类型的显著差异 | NA | 分析肺癌免疫微环境中免疫细胞的浸润特征及相关标记基因 | 肺癌细胞及其免疫微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11,485个肺癌细胞 |
| 2865 | 2024-08-09 |
Weighted gene co-expression network analysis can sort cancer-associated fibroblast-specific markers promoting bladder cancer progression
2021-02, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.29939
PMID:32657439
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研究论文 | 本文通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）研究了膀胱尿路上皮癌（BLCA）中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的特定基因表达模块，这些基因与癌症进展和生存状态相关 | 首次在膀胱尿路上皮癌中应用WGCNA分析CAFs的特定基因表达模块，并确定了15个关键基因作为BLCA特异性CAF标记 | NA | 探讨CAFs在膀胱尿路上皮癌进展中的作用及其特定基因标记 | 膀胱尿路上皮癌中的癌症相关成纤维细胞及其基因表达 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2866 | 2024-08-09 |
Loss of function of the mitochondrial peptidase PITRM1 induces proteotoxic stress and Alzheimer's disease-like pathology in human cerebral organoids
2021-10, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-020-0807-4
PMID:32632204
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研究论文 | 研究PITRM1基因缺失对人类大脑类器官的影响及其与阿尔茨海默病样病理的关系 | 首次揭示了PITRM1基因缺失通过激活线粒体未折叠蛋白反应和增强线粒体清除，影响线粒体前序列处理和蛋白质毒性应激，进而导致阿尔茨海默病样病理特征的形成 | 仅在体外模型中进行研究，未涉及临床患者 | 探讨线粒体前序列处理缺陷的致病机制及其与神经退行性疾病的关系 | PITRM1基因敲除的人类诱导多能干细胞衍生的皮质神经元和大脑类器官 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | PITRM1基因敲除的人类诱导多能干细胞衍生的皮质神经元和大脑类器官 |
| 2867 | 2024-08-09 |
Cell Type-Specific Expression Analysis of the Inner Ear: A Technical Report
2021-09, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.28765
PMID:32579737
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技术报告 | 本文比较了三种主要的细胞类型特异性分析方法在耳部研究中的应用 | 介绍了新的可视化和分析复杂表达数据的平台gEAR | 需要根据组织来源、细胞类型和生物学问题选择合适的实验方法 | 描述和比较现有的耳部细胞类型特异性分析工具，以支持研究设计中的决策 | 耳部细胞的多样性及其在发育和功能中的分子机制 | NA | 听力损失 | 荧光激活细胞分选(FACS)、核糖体和RNA下拉技术、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用已发表和原始数据进行比较 |
| 2868 | 2024-08-09 |
SMNN: batch effect correction for single-cell RNA-seq data via supervised mutual nearest neighbor detection
2021-05-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa097
PMID:32591778
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SMNN的方法，用于通过监督互最近邻检测来校正单细胞RNA测序数据的批次效应 | SMNN方法利用单细胞聚类标签信息，提高了批次效应校正的有效性，特别是在生物差异与批次效应不正交的现实场景中 | NA | 解决在整合来自多个批次的单细胞RNA测序数据时批次效应校正的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | SMNN | 基因表达数据 | NA |
| 2869 | 2024-08-09 |
Dissecting transcriptional heterogeneity in primary gastric adenocarcinoma by single cell RNA sequencing
2021-03, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2019-320368
PMID:32532891
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，系统地描绘了胃腺癌的转录组异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了胃腺癌的细胞亚群及其转录特征，并验证了其在公共数据集中的存在 | 仅基于转录组数据进行分析，未涉及其他类型的分子数据 | 揭示胃腺癌的分子和细胞异质性，为精准诊断和预后提供帮助 | 胃腺癌细胞及其转录组 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 27677个细胞，来自9个肿瘤和3个非肿瘤样本 |
| 2870 | 2024-08-09 |
Interactions of Hematopoietic Stem Cells with Bone Marrow Niche
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2020_298
PMID:32504296
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研究论文 | 本文探讨了造血干细胞（HSCs）与骨髓微环境（niche）的相互作用 | 应用小鼠模型、高级成像技术、高通量单细胞RNA测序和单细胞质谱流式技术深入研究了HSCs与niche细胞的通信 | NA | 研究HSCs与骨髓微环境中三种重要细胞类型的相互作用 | 造血干细胞（HSCs）与骨髓微环境中的间充质干细胞（MSCs）、成骨细胞（OBs）和内皮细胞（ECs） | NA | NA | 流式细胞术、单细胞RNA测序、单细胞质谱流式技术 | NA | 细胞 | 使用C57BL/6小鼠的股骨和胫骨中的骨髓 |
| 2871 | 2024-08-09 |
Targeting dual signalling pathways in concert with immune checkpoints for the treatment of pancreatic cancer
2021-01, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2020-321000
PMID:32424005
|
研究论文 | 本研究利用分子靶向治疗与免疫检查点抑制的交叉点，探索治疗胰腺癌的新方法 | 发现MEK和CDK4/6抑制剂联合治疗在多种PDX模型中有效延缓肿瘤进展，并能增强T细胞浸润和改变骨髓细胞群，与免疫检查点抑制剂协同作用 | NA | 定义治疗胰腺癌的新方法 | 患者来源的细胞系和异种移植模型 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序和多光谱成像 | NA | 细胞系和异种移植模型 | 多种PDX模型 |
| 2872 | 2024-08-09 |
Neuronal activity increases translocator protein (TSPO) levels
2021-06, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-020-0745-1
PMID:32398717
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研究论文 | 本研究探讨了神经活动对成年中枢神经系统中转运蛋白（TSPO）水平的影响 | 本研究挑战了TSPO表达或结合变化必然反映正在进行神经炎症的普遍假设，强调在某些生理或病理情况下需要考虑非炎症性解释 | NA | 研究神经活动是否能改变成年中枢神经系统中的TSPO水平 | 成年C57BL6/N小鼠的海马体中的TSPO基因和蛋白水平 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序，共聚焦激光扫描显微镜 | NA | 基因表达数据，蛋白质表达数据 | 12周龄的C57BL6/N小鼠 |
| 2873 | 2024-08-09 |
Activation of the 15-lipoxygenase pathway in aspirin-exacerbated respiratory disease
2021-02, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2020.04.031
PMID:32371071
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研究论文 | 本文研究了阿司匹林加重呼吸疾病（AERD）中15-脂氧合酶途径的激活 | 首次采用单细胞RNA测序技术研究AERD中花生四烯酸代谢途径，并发现15-脂氧合酶（15-LO）基因在AERD患者鼻息肉细胞中显著上调 | NA | 利用无偏倚方法研究AERD中花生四烯酸代谢途径 | AERD患者和慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）患者的鼻息肉细胞 | NA | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | AERD和CRSwNP患者的鼻息肉细胞 |
| 2874 | 2024-08-09 |
SCCLRR: A Robust Computational Method for Accurate Clustering Single Cell RNA-Seq Data
2021-01, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2020.2991172
PMID:32356764
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研究论文 | 本文提出了一种名为SCCLRR的新型细胞类型检测方法，通过学习一个稳健且准确的相似矩阵来识别单细胞RNA测序数据中的子群体 | SCCLRR方法结合了低秩表示框架，同时捕捉数据的全局和局部内在属性，并使用归一化欧氏距离和余弦相似度来平衡数据的线性和非线性流形 | NA | 开发一种新的计算方法，用于准确和稳健地聚类单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 低秩表示框架 | RNA测序数据 | 九个真实的单细胞RNA测序数据集 |
| 2875 | 2024-08-09 |
YAP1 mediates gastric adenocarcinoma peritoneal metastases that are attenuated by YAP1 inhibition
2021-01, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2019-319748
PMID:32345613
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研究论文 | 本研究探讨了YAP1在胃腺癌腹膜转移中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次揭示了YAP1在腹膜癌病中的重要作用，并证明了YAP1抑制剂在治疗中的有效性 | NA | 研究YAP1在胃腺癌腹膜转移中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 患者来源的腹膜癌细胞、患者来源的异种移植模型和患者来源的原位模型 | 数字病理学 | 胃癌 | 免疫荧光染色、免疫组织化学染色、RNA测序（RNA-Seq）和单细胞RNA测序（sc-RNA-Seq） | NA | 细胞 | 约45%的晚期胃腺癌患者 |
| 2876 | 2024-08-09 |
An Effective Biclustering-Based Framework for Identifying Cell Subpopulations From scRNA-seq Data
2021 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2020.2979717
PMID:32167906
|
研究论文 | 本文提出了一种基于双聚类的框架DivBiclust，用于从高维噪声的单细胞RNA测序数据中有效识别细胞亚群 | DivBiclust框架在识别细胞亚群方面比九种最先进的方法具有更高的准确性 | NA | 研究如何从单细胞RNA测序数据中识别具有不同功能的细胞亚群 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 双聚类 | 转录组数据 | 十组不同大小和不同丢失率的实际单细胞RNA测序数据 |
| 2877 | 2024-08-09 |
Glial cell diversity and methamphetamine-induced neuroinflammation in human cerebral organoids
2021-04, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-020-0676-x
PMID:32051547
|
研究论文 | 本研究使用人脑类器官和单细胞RNA测序技术，探讨了甲基苯丙胺（METH）对胎儿脑发育的影响 | 首次在单细胞分辨率下研究METH诱导的神经炎症，并识别了转录上不同的星形胶质细胞和少突胶质细胞亚群 | NA | 探究METH如何通过分子机制导致神经发育缺陷 | 人脑类器官中的胶质细胞多样性和METH诱导的神经炎症 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 分析了来自八个未处理和六个METH处理的人脑类器官的20,758个细胞 |
| 2878 | 2024-08-09 |
Evolving Transcriptomic Profiles From Single-Cell RNA-Seq Data Using Nature-Inspired Multiobjective Optimization
2021 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2020.2971993
PMID:32031947
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研究论文 | 本文提出了一种基于自然启发多目标优化的进化多目标盲压缩感知（EMOBCS）方法，用于从单细胞RNA-seq数据中提取转录组谱 | 引入了基于人工蜂群的多目标盲压缩感知，通过提出秩概率模型和两种新的搜索策略，优化了两个目标函数，以无偏的方式合作卷积框架 | NA | 解决现有算法在处理单细胞RNA-seq数据时遇到的高维度和过早收敛问题 | 单细胞RNA-seq数据中的转录组谱 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | EMOBCS | RNA-seq数据 | 10个单细胞RNA-seq数据集及一个案例研究 |
| 2879 | 2024-08-09 |
The quiescent fraction of chronic myeloid leukemic stem cells depends on BMPR1B, Stat3 and BMP4-niche signals to persist in patients in remission
2021-01-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2019.232793
PMID:32001529
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研究论文 | 本文研究了BMP信号通路在慢性髓性白血病（CML）患者骨髓中残留白血病干细胞持续存在中的作用 | 首次揭示了BMPR1B+细胞在粘附于基质细胞时表现出静止状态，并且这种静止状态是由治疗诱导的 | NA | 探讨BMP信号通路在CML患者治疗后残留白血病干细胞持续存在中的作用 | 慢性髓性白血病患者的白血病干细胞 | NA | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 2880 | 2024-08-09 |
Evaluating genetic causes of azoospermia: What can we learn from a complex cellular structure and single-cell transcriptomics of the human testis?
2021-Jan, Human genetics
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s00439-020-02116-8
PMID:31950241
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综述 | 本文综述了无精症的遗传原因，并探讨了人类睾丸的复杂细胞结构和单细胞转录组学在不同类型无精症中的应用 | 利用下一代测序技术，通过单细胞RNA测序获得了详细的细胞类型特异性表达模式，并结合现有数据集进行综合分析 | 需要对高度复杂的数据处理和可视化方法有深入了解才能正确解读单细胞RNA测序数据 | 探讨无精症的遗传原因及其对睾丸病理的影响 | 人类睾丸的细胞结构和单细胞转录组学 | 数字病理学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 62,751个睾丸细胞，每个细胞中位数为2637个转录本 |