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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 2821 - 2840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 2821 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics: a novel precision medicine technique in nephrology
2021-05, The Korean journal of internal medicine
DOI:10.3904/kjim.2020.415
PMID:33076636
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综述 | 本文综述了单细胞分析技术及其在肾脏学领域中的单细胞转录组学研究，并讨论了基于单细胞分析的精准医学在肾脏学中的未来展望 | 单细胞分析技术能够克服传统批量水平转录组学方法的局限，区分疾病发展的主要自主反应和次要非自主细胞反应 | NA | 探讨单细胞分析技术在肾脏学中的应用及其在精准医学中的未来前景 | 肾脏疾病的机制及相关的生物标志物和通路 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2822 | 2024-08-09 |
Angiogenesis after acute myocardial infarction
2021-04-23, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaa287
PMID:33063086
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研究论文 | 本文探讨了急性心肌梗死后血管生成机制及其潜在治疗策略 | 利用细胞系追踪和单细胞RNA测序技术，揭示了心肌梗死区域新生毛细血管结构的形成机制，并发现具有干细胞特性的组织驻留内皮细胞在心肌梗死后血管生成中的作用 | 目前对心肌梗死后细胞间通讯的复杂性理解尚处于初级阶段，且临床转化需要谨慎选择适合的患者 | 研究急性心肌梗死后血管生成的机制，并探索其治疗潜力 | 急性心肌梗死后的血管生成过程及参与的细胞类型 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 细胞系追踪、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种细胞类型，包括内皮细胞、巨噬细胞和成纤维细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2823 | 2024-08-09 |
Cell populations in neonatal rat peripheral nerves identified by single-cell transcriptomics
2021-03, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.23928
PMID:33079428
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研究论文 | 通过单细胞转录组学技术，研究了新生大鼠外周神经中的细胞群体多样性，特别是施万细胞的异质性 | 首次通过高覆盖率的单细胞测序技术，对新生大鼠的外周神经和背根神经节中的细胞群体进行了分类，并揭示了施万细胞的亚型及其基因特征和功能富集 | NA | 探究新生大鼠外周神经中细胞群体的多样性和复杂性 | 新生大鼠的坐骨神经和背根神经节中的细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 来自新生（1天龄）大鼠的坐骨神经和背根神经节样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2824 | 2024-08-09 |
Lung megakaryocytes are immune modulatory cells
2021-01-04, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI137377
PMID:33079726
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研究论文 | 本文研究了肺巨核细胞（MkL）的免疫调节功能 | 首次发现肺巨核细胞具有类似于抗原呈递细胞的基因表达模式，并能内化和处理抗原蛋白及细菌病原体 | NA | 探讨肺巨核细胞的免疫功能 | 肺巨核细胞（MkL）及其免疫调节作用 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2825 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-seq of Human Myeloid-Derived Suppressor Cells in Late Sepsis Reveals Multiple Subsets With Unique Transcriptional Responses: A Pilot Study
2021-05-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000001671
PMID:33021571
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了晚期脓毒症患者中的髓源抑制细胞（MDSCs）的转录组特征 | 首次揭示了晚期脓毒症中MDSCs的多个亚群及其独特的转录反应 | 研究样本量较小，仅为两名晚期脓毒症患者和两名对照受试者 | 探究晚期脓毒症中髓源抑制细胞的转录组特征及其在免疫抑制中的作用 | 晚期脓毒症患者的髓源抑制细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 两名晚期脓毒症患者和两名对照受试者的血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2826 | 2024-08-09 |
Ensemble learning models that predict surface protein abundance from single-cell multimodal omics data
2021-05, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2020.10.001
PMID:33039573
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研究论文 | 本文比较了几种基于树的集成学习方法与神经网络模型，发现集成学习通常优于神经网络，特别是随机森林（RF）表现最佳 | 首次系统比较了集成学习方法与神经网络在预测单细胞多模态组学数据中表面蛋白丰度的效果，并发现集成学习方法更为有效 | 文章未明确提及具体的局限性 | 探索并改进从单细胞多模态组学数据中预测蛋白质丰度的机器学习模型性能 | 单细胞多模态组学数据中的RNA和蛋白质丰度 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 集成学习模型，随机森林（RF） | 单细胞多模态组学数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 2827 | 2024-08-09 |
STARCH: copy number and clone inference from spatial transcriptomics data
2021-03-09, Physical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1088/1478-3975/abbe99
PMID:33022659
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STARCH的新方法，用于从空间转录组数据中推断拷贝数变异和克隆信息 | STARCH方法利用肿瘤中相邻细胞可能共享相似拷贝数变异的观察结果，克服了从RNA测序数据中推断拷贝数变异的挑战 | NA | 开发一种新的方法来从空间转录组数据中推断肿瘤细胞的拷贝数变异 | 肿瘤细胞的拷贝数变异和克隆信息 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | 每个点包含少量细胞的网格 | NA | NA | NA | NA |
| 2828 | 2024-08-09 |
The mononuclear phagocyte system contributes to fibrosis in post-transplant obliterans bronchiolitis
2021-03, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00344-2020
PMID:33033147
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research paper | 本研究使用谱系追踪工具追踪或清除异位气管移植模型中潜在的肌成纤维细胞来源，以识别移植后气道纤维闭塞的间充质细胞前体 | 发现受体来源的髓系祖细胞是同种异体移植后气道浸润的间充质细胞的临床相关来源，并提出针对单核吞噬细胞系统的治疗可能改善肺移植后的长期结果 | NA | 识别移植后气道纤维闭塞的间充质细胞前体 | 肌成纤维细胞的来源及其在移植后纤维化过程中的作用 | NA | 肺移植后闭塞性细支气管炎综合征 | 谱系追踪、组织学分析、共聚焦显微镜、流式细胞术、单细胞转录组分析 | NA | 组织样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2829 | 2024-08-09 |
Transcriptional heterogeneity of clonal plasma cells and immune evasion in immunoglobulin light chain amyloidosis
2021-Feb, International journal of hematology
IF:1.7Q3
DOI:10.1007/s12185-020-03016-3
PMID:33040275
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析了免疫球蛋白轻链淀粉样变性（AL淀粉样变性）患者的浆细胞（PCs）的转录异质性和免疫逃避机制 | 发现了AL淀粉样变性患者克隆浆细胞中MHC I类分子的过度表达和自然杀伤（NK）细胞频率的显著降低 | 研究样本量较小，仅包括四名AL淀粉样变性患者、一名治疗后的AL患者和六名健康对照 | 探讨AL淀粉样变性患者浆细胞的转录异质性和免疫逃避机制 | AL淀粉样变性患者的浆细胞和免疫系统 | 数字病理学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 四名AL淀粉样变性患者、一名治疗后的AL患者和六名健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 2830 | 2024-08-09 |
Defining circulating mononuclear cells in heart failure through single-cell RNA sequencing: new insights for an old disease
2021-01-21, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaa156
PMID:33049776
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2831 | 2024-08-09 |
Integrated bulk and single-cell RNA-sequencing identified disease-relevant monocytes and a gene network module underlying systemic sclerosis
2021-01, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2020.102547
PMID:33039247
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研究论文 | 本研究通过综合分析批量和单细胞RNA测序数据，识别了与系统性硬化症（SSc）相关的单核细胞群和一个基因网络模块 | 首次通过综合批量和单细胞RNA测序分析，揭示了与SSc病理生理相关的炎症基因模块和单核细胞群 | 研究样本仅限于日本SSc患者，可能限制了结果的普遍性 | 评估系统性硬化症中免疫细胞亚群的转录组扰动，并鉴定与疾病相关的基因网络模块和免疫细胞簇 | 系统性硬化症患者和健康对照者的免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | RNA测序 | 随机森林分析 | RNA | 21名系统性硬化症患者和13名年龄性别匹配的健康对照者 | NA | NA | NA | NA |
| 2832 | 2024-08-09 |
A spectral clustering with self-weighted multiple kernel learning method for single-cell RNA-seq data
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa216
PMID:33003206
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研究论文 | 提出了一种基于自加权多核学习的光谱聚类方法，用于单细胞RNA测序数据 | 引入自加权多核学习模型，自动选择最适合单细胞RNA测序数据的核函数，并通过多核组合直接发现数据中的分组 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的距离度量方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | SVM | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2833 | 2024-08-09 |
A new bioinformatics tool to recover missing gene expression in single-cell RNA sequencing data
2021-04-10, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjaa053
PMID:32997747
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2834 | 2024-08-09 |
Imputing single-cell RNA-seq data by considering cell heterogeneity and prior expression of dropouts
2021-04-10, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjaa052
PMID:33002136
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研究论文 | 本文提出了一种基于细胞亚群的有界低秩（PBLR）方法，用于填补单细胞RNA测序数据中的缺失值（dropout） | PBLR方法考虑了细胞异质性和dropout率与预期表达水平之间的关系，能够有效恢复dropout事件，并提高低维表示和基因间关系的恢复 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据分析中的计算挑战，特别是由于技术噪声导致的dropout问题 | 单细胞RNA测序数据中的dropout事件 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 有界低秩（PBLR）方法 | 单细胞RNA测序数据 | 涉及模拟和真实单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2835 | 2024-08-09 |
The HDAC Inhibitor Domatinostat Promotes Cell-Cycle Arrest, Induces Apoptosis, and Increases Immunogenicity of Merkel Cell Carcinoma Cells
2021-04, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2020.08.023
PMID:33002502
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研究论文 | 研究了HDAC抑制剂Domatinostat在Merkel细胞癌中的作用，包括细胞周期阻滞、诱导凋亡和增强免疫原性 | Domatinostat不仅能直接抑制肿瘤生长，还能恢复MCC细胞表面的HLA I类分子表达，增强其被细胞毒性T细胞识别和清除的能力 | NA | 探讨Domatinostat在Merkel细胞癌中的疗效和作用机制 | Merkel细胞癌 | NA | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2836 | 2024-08-09 |
Senescence of Alveolar Type 2 Cells Drives Progressive Pulmonary Fibrosis
2021-03-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202004-1274OC
PMID:32991815
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研究论文 | 研究探讨了肺泡类型2细胞衰老在特发性肺纤维化（IPF）的启动和进展中的作用，并评估了针对衰老相关通路和衰老细胞的治疗潜力。 | 开发了一种新型的小鼠模型，用于研究条件性肺泡类型2细胞衰老在肺纤维化中的作用，并展示了通过遗传或药物干预靶向p53激活或衰老可以阻止纤维化生成。 | NA | 研究肺泡类型2细胞衰老在特发性肺纤维化中的作用及其治疗潜力。 | 肺泡类型2细胞，特发性肺纤维化患者和对照组的肺组织。 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | RNA | 9份对照组近端和远端肺组织，11份IPF纤维化肺组织 | NA | NA | NA | NA |
| 2837 | 2024-08-09 |
Fixed single-cell RNA sequencing for understanding virus infection and host response
2021-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2020.09.17.302232
PMID:32995793
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FD-seq的高通量方法，用于对甲醛固定的、染色和分选的单细胞进行基于液滴的RNA测序，以理解病毒感染和宿主反应 | FD-seq方法在固定和随后的细胞回收过程中保持了mRNA的完整性和相对丰度，并且检测到的基因和转录本数量比甲醇固定更多 | NA | 研究病毒感染和宿主反应 | 单细胞RNA测序技术 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2838 | 2024-08-09 |
SC2disease: a manually curated database of single-cell transcriptome for human diseases
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa838
PMID:33010177
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research paper | SC2disease是一个人工 curated 的数据库，旨在为不同疾病提供各种细胞类型的基因表达谱的综合和准确资源 | SC2disease数据库汇总了使用scRNA-seq技术研究人类疾病的文献数据，提供了系统性、层次化和大规模的细胞水平基因表达谱 | NA | 开发一个全面且准确的数据库，用于汇总和比较不同疾病、组织和细胞类型的基因表达谱 | 人类疾病的细胞类型特异性基因表达谱 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达矩阵 | 946,481个条目，对应341种细胞类型、29种组织和25种疾病 | NA | NA | NA | NA |
| 2839 | 2024-08-09 |
Model-based autoencoders for imputing discrete single-cell RNA-seq data
2021-08, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2020.09.010
PMID:32971193
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研究论文 | 本文提出了一种基于零膨胀负二项（ZINB）模型的自编码器，用于填补离散的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中的缺失值 | 该方法的创新点在于除了优化ZINB似然外，还通过使用Gumbel-Softmax分布显式建模导致缺失值的丢失事件，并对原始计数矩阵进行零膨胀重建优化 | NA | 提高离散scRNA-seq数据中缺失值的填补准确性，并增强下游分析的有效性 | 离散的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 自编码器 | 离散数据 | 大量 | NA | NA | NA | NA |
| 2840 | 2024-08-09 |
BP4RNAseq: a babysitter package for retrospective and newly generated RNA-seq data analyses using both alignment-based and alignment-free quantification method
2021-06-09, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa832
PMID:32976573
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研究论文 | 本文开发了一个名为BP4RNAseq的R包，用于回顾性和新产生的RNA-seq数据分析，结合了基于比对和无比对量化的先进工具 | BP4RNAseq包通过优化流程提高了RNA-seq分析的敏感性和准确性，仅需两个非技术参数即可输出六种格式的基因表达量化结果 | NA | 开发一个高度自动化的工具，简化RNA-seq数据分析流程 | RNA-seq数据分析 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |