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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2801 | 2024-08-09 |
Toxicity in hematopoietic stem cells from bone marrow and peripheral blood in mice after benzene exposure: Single-cell transcriptome sequencing analysis
2021-Jan-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2020.111490
PMID:33120278
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研究论文 | 本研究使用Smart-seq2单细胞转录组测序技术,分析了苯暴露后小鼠骨髓和外周血造血干细胞的转录组变化 | 首次报道了苯暴露后造血干细胞的转录组特征,并通过加权基因共表达网络分析揭示了关键的生物学途径 | NA | 探究苯暴露对造血干细胞的毒性作用及其分子机制 | 小鼠骨髓和外周血中的造血干细胞 | 数字病理学 | 白血病 | Smart-seq2单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 使用了苯处理的C57B/6雄性小鼠的骨髓和外周血造血干细胞样本 |
2802 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis of tumor-infiltrating B cells reveals their clinical implications in non-small cell lung cancer
2021-01, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.13719
PMID:33124202
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2803 | 2024-08-09 |
New insights into macrophage heterogeneity in rheumatoid arthritis
2021-01, Joint bone spine
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jbspin.2020.105091
PMID:33130232
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综述 | 本文综述了类风湿性关节炎中巨噬细胞异质性的最新研究进展 | 应用单细胞RNA测序技术深入研究了巨噬细胞亚群及其在人和小鼠滑膜关节组织中的潜在功能 | NA | 旨在识别可能放大炎症反应或促进组织稳态恢复的滑膜巨噬细胞亚群 | 类风湿性关节炎中的巨噬细胞亚群及其功能 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
2804 | 2024-08-09 |
There and back again: The mechanisms of differentiation and transdifferentiation in Drosophila blood cells
2021-01-01, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2020.10.006
PMID:33131706
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研究论文 | 本文总结了果蝇血细胞中浆细胞向包囊细胞转分化的现有数据,并尝试将其与基于转录组的血细胞聚类相结合,以更好地理解果蝇中转分化的机制。 | 利用最新的单细胞测序方法对果蝇幼虫中的吞噬血细胞进行聚类分析,以研究转分化的机制。 | NA | 研究果蝇血细胞中转分化的机制。 | 果蝇血细胞中的浆细胞和包囊细胞。 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |
2805 | 2024-08-09 |
In silico analysis of inner ear development using public whole embryonic body single-cell RNA-sequencing data
2021-01-01, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2020.10.009
PMID:33131705
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研究论文 | 本研究利用公共的全胚胎单细胞RNA测序数据,通过计算机模拟分析早期内耳发育中的谱系特异性基因 | 本研究首次利用单细胞RNA测序数据,识别并分类了内耳早期发育中的15个细胞簇,并鉴定了多个谱系特异性基因候选 | NA | 旨在识别早期内耳发育中的谱系特异性基因 | 内耳的四个上皮域及其亚区域 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 5000个单细胞转录组数据 |
2806 | 2024-08-09 |
PlacentaCellEnrich: A tool to characterize gene sets using placenta cell-specific gene enrichment analysis
2021-01-01, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2020.10.029
PMID:33137644
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研究论文 | 开发了一个名为PlacentaCellEnrich的工具,用于分析基因集在胎盘细胞特异性表达模式中的富集情况 | 利用单细胞RNA测序(scRNA-Seq)数据,开发了一个新的工具PlacentaCellEnrich,用于分析基因集在胎盘细胞特异性表达模式中的富集情况 | NA | 旨在开发一个工具,帮助理解模型系统中的表达模式与人类胎盘早期表达模式的对应关系 | 人类胎盘的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | NA |
2807 | 2024-08-09 |
Neuroblastoma and Stem Cell Therapy: An Updated Review
2021, CNS & neurological disorders drug targets
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综述 | 本文综述了神经母细胞瘤的发病机制及干细胞疗法在治疗神经母细胞瘤中的应用 | 探讨了通过单细胞RNA测序技术和计算方法揭示神经母细胞瘤异质性的新途径 | 目前研究主要基于大量细胞分析,对细胞群体信息提供有限 | 讨论神经母细胞瘤的发病机制及干细胞疗法的应用 | 神经母细胞瘤及其治疗 | NA | 儿童癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
2808 | 2024-08-09 |
Intravenous nanoparticle vaccination generates stem-like TCF1+ neoantigen-specific CD8+ T cells
2021-01, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-00810-3
PMID:33139915
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研究论文 | 研究通过静脉注射纳米颗粒疫苗诱导肿瘤新抗原特异性CD8+ T细胞,并探讨了不同接种途径对T细胞数量和质量的影响 | 首次展示了静脉注射纳米颗粒疫苗能诱导产生干细胞样TCF1+新抗原特异性CD8+ T细胞,并在治疗模型中显示出优越的抗肿瘤反应 | NA | 优化抗肿瘤免疫反应,通过调节疫苗参数生成特定类型的CD8 T细胞 | 肿瘤新抗原特异性CD8+ T细胞的生成和功能 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
2809 | 2024-08-09 |
Different Roles of Stem/Progenitor Cells in Vascular Remodeling
2021-07-20, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1089/ars.2020.8199
PMID:33107320
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综述 | 本文综述了血管干细胞在心血管研究领域的最新进展,并展望了干细胞在再生医学中的未来前景 | 使用遗传谱系追踪小鼠模型,提供了关于血管干细胞本质的解决方案,并监测了细胞迁移和分化过程 | 尽管取得了进展,但血管干细胞的本质和细胞命运仍不明确 | 阐明血管干细胞的行为及其机制,为干细胞的临床治疗应用设计提供新机会 | 血管干细胞及其在血管重塑中的作用 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 遗传细胞谱系追踪和单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
2810 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq data semi-supervised clustering and annotation via structural regularized domain adaptation
2021-05-05, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa908
PMID:33098418
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研究论文 | 本文提出了一种基于结构正则化域适应的单细胞RNA测序数据半监督聚类和注释框架scSemiCluster | 首次在单细胞领域同时使用深度判别聚类和深度生成聚类技术,无需显式域对齐和批次效应校正 | NA | 旨在解决大规模单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的劳动和资源成本问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 深度判别聚类和深度生成聚类 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
2811 | 2024-08-09 |
Single-cell patterning and axis characterization in the murine and human definitive endoderm
2021-03, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-020-00426-0
PMID:33106598
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了小鼠和人类早期体节形成阶段的内胚层细胞,定义了四个主要内胚层区域及其发育路径。 | 本研究首次详细描述了人类内胚层前体的区域化模式,并揭示了背侧和腹侧胰腺前体从中间肠群落起源并沿不同路径发育为相同细胞类型的过程。 | NA | 理解呼吸和消化器官生成和再生的机制 | 小鼠和人类早期体节形成阶段的内胚层细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
2812 | 2024-08-09 |
Holistic characterization of single-hepatocyte transcriptome responses to high-fat diet
2021-02-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00391.2020
PMID:33103450
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研究论文 | 本研究使用基于液滴的单细胞RNA测序技术,分析了在高脂饮食下,单个肝细胞的转录组变化,特别是在非酒精性脂肪肝病(NAFLD)中的响应 | 首次详细描述了肝细胞在高脂饮食和NAFLD中的转录组变化,包括区域依赖性和非依赖性的效应 | 研究仅限于肝细胞,未涉及其他非实质细胞类型 | 探讨肝细胞在高脂饮食和NAFLD中的转录组响应 | 肝细胞在高脂饮食和NAFLD中的转录组变化 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 基于液滴的单细胞RNA测序(Drop-seq) | NA | 转录组数据 | 多个肝细胞样本 |
2813 | 2024-08-09 |
CKS2 modulates cell-cycle progression of tongue squamous cell carcinoma cells partly via modulating the cellular distribution of DUTPase
2021-Feb, Journal of oral pathology & medicine : official publication of the International Association of Oral Pathologists and the American Academy of Oral Pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1111/jop.13116
PMID:33107644
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研究论文 | 本文探讨了CKS2基因在舌鳞状细胞癌中的表达及其对细胞周期进程的调控作用,特别是通过调节DUTPase的细胞分布。 | 首次研究了CKS2在舌鳞状细胞癌中的表达模式及其对疾病特异性生存和无进展生存的影响。 | 研究主要基于体外细胞模型和生物信息学分析,缺乏临床干预实验。 | 探究CKS2在舌鳞状细胞癌中的表达及其对细胞周期和患者生存的影响。 | 舌鳞状细胞癌组织和细胞。 | 数字病理学 | 口腔癌 | bulk-seq, single-cell RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 舌鳞状细胞癌组织样本128例,正常组织样本13例。 |
2814 | 2024-08-09 |
Isolation of high-yield and -quality RNA from human precision-cut lung slices for RNA-sequencing and computational integration with larger patient cohorts
2021-02-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00401.2020
PMID:33112185
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研究论文 | 本研究介绍了一种从人类精确切割肺切片中提取高质量RNA的新方法,适用于RNA测序和计算分析。 | 提出了一种从少量组织中提取高质量RNA的新方法,适用于疾病组织如特发性肺纤维化,并展示了其适用于RNA-seq分析和计算管道。 | NA | 开发一种从人类精确切割肺切片中提取高质量RNA的方法,以支持下一代测序技术在非偏倚和高通量分析中的应用。 | 人类精确切割肺切片中的高质量RNA提取。 | 数字病理学 | 肺疾病 | RNA测序 | NA | RNA | 少量组织,包括疾病组织如特发性肺纤维化 |
2815 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics: a novel precision medicine technique in nephrology
2021-05, The Korean journal of internal medicine
DOI:10.3904/kjim.2020.415
PMID:33076636
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综述 | 本文综述了单细胞分析技术及其在肾脏学领域中的单细胞转录组学研究,并讨论了基于单细胞分析的精准医学在肾脏学中的未来展望 | 单细胞分析技术能够克服传统批量水平转录组学方法的局限,区分疾病发展的主要自主反应和次要非自主细胞反应 | NA | 探讨单细胞分析技术在肾脏学中的应用及其在精准医学中的未来前景 | 肾脏疾病的机制及相关的生物标志物和通路 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
2816 | 2024-08-09 |
Angiogenesis after acute myocardial infarction
2021-04-23, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaa287
PMID:33063086
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研究论文 | 本文探讨了急性心肌梗死后血管生成机制及其潜在治疗策略 | 利用细胞系追踪和单细胞RNA测序技术,揭示了心肌梗死区域新生毛细血管结构的形成机制,并发现具有干细胞特性的组织驻留内皮细胞在心肌梗死后血管生成中的作用 | 目前对心肌梗死后细胞间通讯的复杂性理解尚处于初级阶段,且临床转化需要谨慎选择适合的患者 | 研究急性心肌梗死后血管生成的机制,并探索其治疗潜力 | 急性心肌梗死后的血管生成过程及参与的细胞类型 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 细胞系追踪、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种细胞类型,包括内皮细胞、巨噬细胞和成纤维细胞 |
2817 | 2024-08-09 |
Cell populations in neonatal rat peripheral nerves identified by single-cell transcriptomics
2021-03, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.23928
PMID:33079428
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研究论文 | 通过单细胞转录组学技术,研究了新生大鼠外周神经中的细胞群体多样性,特别是施万细胞的异质性 | 首次通过高覆盖率的单细胞测序技术,对新生大鼠的外周神经和背根神经节中的细胞群体进行了分类,并揭示了施万细胞的亚型及其基因特征和功能富集 | NA | 探究新生大鼠外周神经中细胞群体的多样性和复杂性 | 新生大鼠的坐骨神经和背根神经节中的细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 来自新生(1天龄)大鼠的坐骨神经和背根神经节样本 |
2818 | 2024-08-09 |
Lung megakaryocytes are immune modulatory cells
2021-01-04, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI137377
PMID:33079726
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研究论文 | 本文研究了肺巨核细胞(MkL)的免疫调节功能 | 首次发现肺巨核细胞具有类似于抗原呈递细胞的基因表达模式,并能内化和处理抗原蛋白及细菌病原体 | NA | 探讨肺巨核细胞的免疫功能 | 肺巨核细胞(MkL)及其免疫调节作用 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
2819 | 2024-08-09 |
Deconvolution of monocyte responses in inflammatory bowel disease reveals an IL-1 cytokine network that regulates IL-23 in genetic and acquired IL-10 resistance
2021-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2020-321731
PMID:33037057
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研究论文 | 研究炎症性肠病中IL-23表达的调控机制,并探讨其在个性化治疗中的应用 | 识别了IL-10和IL-1作为单核细胞IL-23产生的关键调节因子,并区分了稳态和超炎症相关的IL-23产生 | NA | 探讨IL-23在炎症性肠病中的调控机制,为个性化治疗提供依据 | 人类单核细胞和外周血单核细胞中的IL-23表达 | NA | 炎症性肠病 | 转录组分析,单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康个体和炎症性肠病患者的单核细胞样本 |
2820 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-seq of Human Myeloid-Derived Suppressor Cells in Late Sepsis Reveals Multiple Subsets With Unique Transcriptional Responses: A Pilot Study
2021-05-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000001671
PMID:33021571
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了晚期脓毒症患者中的髓源抑制细胞(MDSCs)的转录组特征 | 首次揭示了晚期脓毒症中MDSCs的多个亚群及其独特的转录反应 | 研究样本量较小,仅为两名晚期脓毒症患者和两名对照受试者 | 探究晚期脓毒症中髓源抑制细胞的转录组特征及其在免疫抑制中的作用 | 晚期脓毒症患者的髓源抑制细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 两名晚期脓毒症患者和两名对照受试者的血液样本 |