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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2801 | 2024-08-09 |
A data-driven dimensionality-reduction algorithm for the exploration of patterns in biomedical data
2021-06, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-020-00635-3
PMID:33139824
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研究论文 | 本文介绍了一种名为'特征增强嵌入机'(FEM)的数据驱动降维算法,用于探索生物医学数据中的模式 | 该算法能够学习数据结构和数据组件的固有特征,对数据进行去噪和组件分离,然后将数据投影到较低维度 | NA | 开发一种准确且广泛适用的数据驱动降维算法 | 生物医学数据中的模式探索 | 机器学习 | NA | 特征增强嵌入机(FEM) | NA | 蛋白质表达数据、单细胞RNA测序数据、计算机断层扫描数据、脑电图数据和可穿戴生理传感器数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2802 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals novel mitochondria-related musculoskeletal cell populations during adult axolotl limb regeneration process
2021-03, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-020-00640-8
PMID:33116295
|
研究论文 | 本研究利用大规模单细胞RNA测序技术,分析了成年蝾螈肢体再生过程中的细胞分类,揭示了与再生相关的线粒体相关肌肉骨骼细胞群。 | 发现了支持再生过程的线粒体相关集群和通过细胞间相互作用信号促进再生的COL2+集群,以及支持肌肉骨骼系统再生的COL2-线粒体子集群。 | NA | 探索蝾螈肢体再生过程中的关键驱动因素,为人类肢体再生提供新见解。 | 成年蝾螈肢体再生过程中的细胞亚群和细胞外基质。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 大规模单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2803 | 2024-08-09 |
Reshaping the Immune Microenvironment by Oncolytic Herpes Simplex Virus in Murine Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2021-02-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2020.10.027
PMID:33130310
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研究论文 | 本研究通过建立免疫活性同基因的胰腺导管腺癌模型,探讨了溶瘤单纯疱疹病毒-1(oHSV)对肿瘤微环境(TME)免疫细胞组成的影响 | oHSV通过下调肿瘤相关巨噬细胞(TAMs),尤其是抗炎性巨噬细胞,并增加肿瘤浸润淋巴细胞的比例,包括激活的细胞毒性CD8 T细胞和T辅助(Th)1细胞,从而重塑PDAC的TME,增强免疫活性 | NA | 研究oHSV在胰腺导管腺癌中的作用及其对肿瘤微环境的影响 | 胰腺导管腺癌(PDAC)及其肿瘤微环境(TME) | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),多色荧光激活细胞分选(FACS) | NA | 细胞 | 涉及携带肿瘤的小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 2804 | 2024-08-09 |
TransSynW: A single-cell RNA-sequencing based web application to guide cell conversion experiments
2021-02, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/sctm.20-0227
PMID:33125830
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研究论文 | 介绍了一种基于单细胞RNA测序数据的网络应用程序TransSynW,用于预测用户指定细胞群体的细胞转换转录因子(TFs) | TransSynW优先考虑预测转换TFs中的先驱因子,以促进细胞转换时常需的染色质开放,并预测标记基因以评估细胞转换实验的性能 | NA | 开发一种计算工具,帮助研究人员利用单细胞RNA测序数据生成所需的功能性细胞 | 细胞转换转录因子(TFs)和标记基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2805 | 2024-08-09 |
Exploring cardiac macrophage heterogeneity in the healthy and diseased myocardium
2021-02, Current opinion in immunology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.coi.2020.09.005
PMID:33128959
|
研究论文 | 本文探讨了健康和病变心肌中心脏巨噬细胞的异质性,利用遗传命运图谱和单细胞RNA测序技术,提供了一个概念框架来评估心脏巨噬细胞的复杂性。 | 本文采用了遗传命运图谱和单细胞RNA测序技术,超越了传统的M1/M2分类,更细致地解析了巨噬细胞的异质性。 | 文章讨论了当前对心脏巨噬细胞多样性理解的局限性,特别是在缺血性损伤、高血压和心肌炎中的应用。 | 提供一个起点,帮助研究人员解析已知心脏巨噬细胞亚群的功能。 | 心脏巨噬细胞的异质性和其在健康及病变心肌中的作用。 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2806 | 2024-08-09 |
ARHGAP36 regulates proliferation and migration in papillary thyroid carcinoma cells
2021-01, Journal of molecular endocrinology
IF:3.6Q2
DOI:10.1530/JME-20-0230
PMID:33112823
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了甲状腺乳头状癌(PTC)患者原发肿瘤、淋巴结转移及邻近正常组织的细胞表达谱,发现ARHGAP36在恶性细胞中高表达,并调控其增殖和迁移 | 首次揭示ARHGAP36在甲状腺乳头状癌恶性细胞中的特异性表达,并证实其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 | 研究样本量较小,需进一步扩大样本验证ARHGAP36的临床应用价值 | 探索甲状腺乳头状癌复发和转移的诊断标志物及治疗靶点 | 甲状腺乳头状癌患者的原发肿瘤、淋巴结转移及邻近正常组织细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11,805个单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2807 | 2024-08-09 |
Combining Whole-Cell Patch-Clamp Recordings with Single-Cell RNA Sequencing
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0818-0_9
PMID:33119852
|
研究论文 | 本文详细描述了如何结合全细胞膜片钳记录和单细胞RNA测序技术来研究脑切片中的神经元 | 本文首次详细介绍了将全细胞膜片钳记录与单细胞RNA测序技术相结合的方法 | NA | 理解大脑功能及其组成细胞的特性 | 神经元的内在电特性及其在神经回路中的突触连接 | NA | NA | 全细胞膜片钳记录, 单细胞RNA测序 | NA | 电生理数据, 转录组数据 | 脑切片中的神经元 | NA | NA | NA | NA |
| 2808 | 2024-08-09 |
Toxicity in hematopoietic stem cells from bone marrow and peripheral blood in mice after benzene exposure: Single-cell transcriptome sequencing analysis
2021-Jan-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2020.111490
PMID:33120278
|
研究论文 | 本研究使用Smart-seq2单细胞转录组测序技术,分析了苯暴露后小鼠骨髓和外周血造血干细胞的转录组变化 | 首次报道了苯暴露后造血干细胞的转录组特征,并通过加权基因共表达网络分析揭示了关键的生物学途径 | NA | 探究苯暴露对造血干细胞的毒性作用及其分子机制 | 小鼠骨髓和外周血中的造血干细胞 | 数字病理学 | 白血病 | Smart-seq2单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 使用了苯处理的C57B/6雄性小鼠的骨髓和外周血造血干细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2809 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis of tumor-infiltrating B cells reveals their clinical implications in non-small cell lung cancer
2021-01, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.13719
PMID:33124202
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2810 | 2024-08-09 |
New insights into macrophage heterogeneity in rheumatoid arthritis
2021-01, Joint bone spine
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jbspin.2020.105091
PMID:33130232
|
综述 | 本文综述了类风湿性关节炎中巨噬细胞异质性的最新研究进展 | 应用单细胞RNA测序技术深入研究了巨噬细胞亚群及其在人和小鼠滑膜关节组织中的潜在功能 | NA | 旨在识别可能放大炎症反应或促进组织稳态恢复的滑膜巨噬细胞亚群 | 类风湿性关节炎中的巨噬细胞亚群及其功能 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2811 | 2024-08-09 |
There and back again: The mechanisms of differentiation and transdifferentiation in Drosophila blood cells
2021-01-01, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2020.10.006
PMID:33131706
|
研究论文 | 本文总结了果蝇血细胞中浆细胞向包囊细胞转分化的现有数据,并尝试将其与基于转录组的血细胞聚类相结合,以更好地理解果蝇中转分化的机制。 | 利用最新的单细胞测序方法对果蝇幼虫中的吞噬血细胞进行聚类分析,以研究转分化的机制。 | NA | 研究果蝇血细胞中转分化的机制。 | 果蝇血细胞中的浆细胞和包囊细胞。 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2812 | 2024-08-09 |
In silico analysis of inner ear development using public whole embryonic body single-cell RNA-sequencing data
2021-01-01, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2020.10.009
PMID:33131705
|
研究论文 | 本研究利用公共的全胚胎单细胞RNA测序数据,通过计算机模拟分析早期内耳发育中的谱系特异性基因 | 本研究首次利用单细胞RNA测序数据,识别并分类了内耳早期发育中的15个细胞簇,并鉴定了多个谱系特异性基因候选 | NA | 旨在识别早期内耳发育中的谱系特异性基因 | 内耳的四个上皮域及其亚区域 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 5000个单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2813 | 2024-08-09 |
PlacentaCellEnrich: A tool to characterize gene sets using placenta cell-specific gene enrichment analysis
2021-01-01, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2020.10.029
PMID:33137644
|
研究论文 | 开发了一个名为PlacentaCellEnrich的工具,用于分析基因集在胎盘细胞特异性表达模式中的富集情况 | 利用单细胞RNA测序(scRNA-Seq)数据,开发了一个新的工具PlacentaCellEnrich,用于分析基因集在胎盘细胞特异性表达模式中的富集情况 | NA | 旨在开发一个工具,帮助理解模型系统中的表达模式与人类胎盘早期表达模式的对应关系 | 人类胎盘的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2814 | 2024-08-09 |
Neuroblastoma and Stem Cell Therapy: An Updated Review
2021, CNS & neurological disorders drug targets
|
综述 | 本文综述了神经母细胞瘤的发病机制及干细胞疗法在治疗神经母细胞瘤中的应用 | 探讨了通过单细胞RNA测序技术和计算方法揭示神经母细胞瘤异质性的新途径 | 目前研究主要基于大量细胞分析,对细胞群体信息提供有限 | 讨论神经母细胞瘤的发病机制及干细胞疗法的应用 | 神经母细胞瘤及其治疗 | NA | 儿童癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2815 | 2024-08-09 |
Different Roles of Stem/Progenitor Cells in Vascular Remodeling
2021-07-20, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1089/ars.2020.8199
PMID:33107320
|
综述 | 本文综述了血管干细胞在心血管研究领域的最新进展,并展望了干细胞在再生医学中的未来前景 | 使用遗传谱系追踪小鼠模型,提供了关于血管干细胞本质的解决方案,并监测了细胞迁移和分化过程 | 尽管取得了进展,但血管干细胞的本质和细胞命运仍不明确 | 阐明血管干细胞的行为及其机制,为干细胞的临床治疗应用设计提供新机会 | 血管干细胞及其在血管重塑中的作用 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 遗传细胞谱系追踪和单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2816 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq data semi-supervised clustering and annotation via structural regularized domain adaptation
2021-05-05, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa908
PMID:33098418
|
研究论文 | 本文提出了一种基于结构正则化域适应的单细胞RNA测序数据半监督聚类和注释框架scSemiCluster | 首次在单细胞领域同时使用深度判别聚类和深度生成聚类技术,无需显式域对齐和批次效应校正 | NA | 旨在解决大规模单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的劳动和资源成本问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 深度判别聚类和深度生成聚类 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2817 | 2024-08-09 |
Single-cell patterning and axis characterization in the murine and human definitive endoderm
2021-03, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-020-00426-0
PMID:33106598
|
research paper | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了小鼠和人类早期体节形成阶段的内胚层细胞,定义了四个主要内胚层区域及其发育路径。 | 本研究首次详细描述了人类内胚层前体的区域化模式,并揭示了背侧和腹侧胰腺前体从中间肠群落起源并沿不同路径发育为相同细胞类型的过程。 | NA | 理解呼吸和消化器官生成和再生的机制 | 小鼠和人类早期体节形成阶段的内胚层细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2818 | 2024-08-09 |
Holistic characterization of single-hepatocyte transcriptome responses to high-fat diet
2021-02-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00391.2020
PMID:33103450
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研究论文 | 本研究使用基于液滴的单细胞RNA测序技术,分析了在高脂饮食下,单个肝细胞的转录组变化,特别是在非酒精性脂肪肝病(NAFLD)中的响应 | 首次详细描述了肝细胞在高脂饮食和NAFLD中的转录组变化,包括区域依赖性和非依赖性的效应 | 研究仅限于肝细胞,未涉及其他非实质细胞类型 | 探讨肝细胞在高脂饮食和NAFLD中的转录组响应 | 肝细胞在高脂饮食和NAFLD中的转录组变化 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 基于液滴的单细胞RNA测序(Drop-seq) | NA | 转录组数据 | 多个肝细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2819 | 2024-08-09 |
CKS2 modulates cell-cycle progression of tongue squamous cell carcinoma cells partly via modulating the cellular distribution of DUTPase
2021-Feb, Journal of oral pathology & medicine : official publication of the International Association of Oral Pathologists and the American Academy of Oral Pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1111/jop.13116
PMID:33107644
|
研究论文 | 本文探讨了CKS2基因在舌鳞状细胞癌中的表达及其对细胞周期进程的调控作用,特别是通过调节DUTPase的细胞分布。 | 首次研究了CKS2在舌鳞状细胞癌中的表达模式及其对疾病特异性生存和无进展生存的影响。 | 研究主要基于体外细胞模型和生物信息学分析,缺乏临床干预实验。 | 探究CKS2在舌鳞状细胞癌中的表达及其对细胞周期和患者生存的影响。 | 舌鳞状细胞癌组织和细胞。 | 数字病理学 | 口腔癌 | bulk-seq, single-cell RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 舌鳞状细胞癌组织样本128例,正常组织样本13例。 | NA | NA | NA | NA |
| 2820 | 2024-08-09 |
Isolation of high-yield and -quality RNA from human precision-cut lung slices for RNA-sequencing and computational integration with larger patient cohorts
2021-02-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00401.2020
PMID:33112185
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研究论文 | 本研究介绍了一种从人类精确切割肺切片中提取高质量RNA的新方法,适用于RNA测序和计算分析。 | 提出了一种从少量组织中提取高质量RNA的新方法,适用于疾病组织如特发性肺纤维化,并展示了其适用于RNA-seq分析和计算管道。 | NA | 开发一种从人类精确切割肺切片中提取高质量RNA的方法,以支持下一代测序技术在非偏倚和高通量分析中的应用。 | 人类精确切割肺切片中的高质量RNA提取。 | 数字病理学 | 肺疾病 | RNA测序 | NA | RNA | 少量组织,包括疾病组织如特发性肺纤维化 | NA | NA | NA | NA |