单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 2781 - 2800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2781 | 2024-08-09 |
Spatiotemporal sequence of mesoderm and endoderm lineage segregation during mouse gastrulation
2021-01-07, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.193789
PMID:33199445
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研究论文 | 本文研究了小鼠原条期间中胚层和内胚层谱系分离的时空序列 | 结合遗传命运标记和成像方法与单细胞RNA测序(scRNA-seq)来追踪转录身份并定义细胞类型的谱系轨迹 | NA | 探索小鼠胚胎原条期间中胚层和内胚层谱系分离的精确时空模式和分子细节 | 小鼠胚胎中的中胚层和内胚层谱系 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2782 | 2024-08-09 |
VEGF-B Promotes Endocardium-Derived Coronary Vessel Development and Cardiac Regeneration
2021-01-05, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文研究了血管内皮生长因子B（VEGF-B）在心脏中促进源自心内膜的冠状血管发育和心脏再生的作用。 | VEGF-B在心脏发育期间促进源自心内膜的冠状血管形成，并在成年小鼠中促进心内膜下心肌的血管内皮细胞增殖，以及心肌梗死后心脏组织的结构和功能恢复。 | NA | 研究VEGF-B在心脏中对冠状血管发育和心脏再生的影响。 | VEGF-B在心脏中的作用及其对冠状血管发育和心脏再生的影响。 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 基因转移，细胞周期标记，流式细胞术，组织学，免疫组织化学，生物化学方法，单细胞RNA测序，生物信息学分析，微型计算机断层扫描，荧光和示踪剂介导的血管灌注成像分析。 | NA | 图像 | 使用表达VEGF-B转基因的小鼠和大鼠，VEGF-B基因敲除的小鼠和大鼠，以及成年小鼠中的病毒载体介导的VEGF-B基因转移。 | NA | NA | NA | NA |
| 2783 | 2024-08-09 |
Sharing and Helping: Regularity and Characteristics of Pathogenesis of a Widely Used Transgene Initiated Murine Acute Promyelocytic Leukemia Model
2021-01-01, Stem cells and development
IF:2.5Q2
DOI:10.1089/scd.2020.0125
PMID:33176587
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研究论文 | 本文通过改进的急性早幼粒细胞白血病（APL）小鼠模型，补充了该模型发病规律和特征的数据 | 本文填补了现有文献中关于该模型发病规律和特征数据的空白 | NA | 旨在补充和完善APL小鼠模型的发病规律和特征数据 | APL小鼠模型的发病时间、潜伏期、发病率、寿命及APL细胞在外周血、脾脏、骨髓中的比例等 | NA | 急性早幼粒细胞白血病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2784 | 2024-08-09 |
Evaluating single-cell cluster stability using the Jaccard similarity index
2021-08-09, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa956
PMID:33165513
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研究论文 | 本文介绍了一套工具，通过子采样方法评估单细胞聚类的稳定性，以指导参数选择和辅助生物学解释 | 提出了使用Jaccard相似性指数来评估单细胞聚类稳定性的方法，并开发了相应的R包和Snakemake工作流程 | 未提及 | 旨在提高单细胞RNA测序实验中聚类结果的稳定性和可解释性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNAseq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2785 | 2024-08-09 |
CellTalkDB: a manually curated database of ligand-receptor interactions in humans and mice
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa269
PMID:33147626
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研究论文 | 本文介绍了一个名为CellTalkDB的手动 curated 数据库，该数据库包含了人类和小鼠中的配体-受体相互作用对 | CellTalkDB数据库不仅包含了2033对小鼠的配体-受体相互作用，还额外包含了377对人类的配体-受体相互作用，相比于现有的SingleCellSignalR资源，提供了更全面的数据 | NA | 构建一个全面的手动 curated 数据库，以帮助进一步推断和理解基于配体-受体相互作用的细胞间通信 | 人类和小鼠中的配体-受体相互作用对 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 数据库 | 3398对人类配体-受体相互作用和2033对小鼠配体-受体相互作用 | NA | NA | NA | NA |
| 2786 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics of murine mural cells reveals cellular heterogeneity
2021-Jul, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-020-1823-2
PMID:33165809
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研究论文 | 本研究利用公开的单细胞数据集GSE109774，展示了小鼠壁细胞（MCs）的转录异质性 | 首次详细研究了壁细胞的转录异质性，并通过重新聚类识别了五个不同的亚群 | NA | 揭示壁细胞的转录异质性及其在组织中的分布和相互作用 | 小鼠壁细胞（MCs） | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 使用公开数据集GSE109774 | NA | NA | NA | NA |
| 2787 | 2024-08-09 |
The Whey Acidic Protein WFDC12 Is Specifically Expressed in Terminally Differentiated Keratinocytes and Regulates Epidermal Serine Protease Activity
2021-05, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2020.09.025
PMID:33157095
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研究论文 | 本研究探讨了WFDC12蛋白在表皮角质形成细胞终末分化中的表达及其对表皮丝氨酸蛋白酶活性的调控作用 | 首次发现WFDC12在表皮角质形成细胞终末分化阶段的特异性表达，并揭示了其在调控角质层蛋白酶活性中的作用 | NA | 研究WFDC蛋白家族成员在表皮稳态中的作用 | WFDC12蛋白在人类表皮中的表达及其功能 | NA | 皮肤病 | 单细胞RNA测序，免疫金-电子显微镜 | NA | RNA | 涉及银屑病、特应性皮炎、Darier病和Netherton综合征患者的皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2788 | 2024-08-09 |
Targeting fibroblast growth factor 23-responsive pathways uncovers controlling genes in kidney mineral metabolism
2021-03, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2020.10.024
PMID:33159963
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研究论文 | 本研究通过基因阵列和单细胞RNA测序技术，探索了FGF23响应途径中的调控基因，特别是在肾脏矿物质代谢中的作用 | 发现HBEGF作为FGF23下游调控基因的新角色，并通过靶向共同信号途径发挥作用 | NA | 识别可作为控制FGF23介导的矿物质代谢目标的新基因 | FGF23响应途径中的调控基因及肾脏矿物质代谢 | NA | NA | 基因阵列，单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 野生型小鼠肾脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2789 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics of cardiac progenitors reveals functional subpopulations and their cooperative crosstalk in cardiac repair
2021-02, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-020-00788-6
PMID:33159668
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2790 | 2024-08-09 |
Clonal Hematopoiesis-Driver DNMT3A Mutations Alter Immune Cells in Heart Failure
2021-01-22, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.120.317104
PMID:33155517
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了携带DNMT3A突变的慢性心力衰竭患者的外周血单个核细胞的转录组特征 | 首次在人类中定义了由DNMT3A克隆性造血驱动突变介导的炎症免疫细胞亚群 | 样本量较小，需要进一步的大规模研究验证 | 探讨DNMT3A突变在慢性心力衰竭患者中对免疫细胞的影响 | 慢性心力衰竭患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6名携带DNMT3A突变的慢性心力衰竭患者和4名无DNMT3A突变的慢性心力衰竭患者 | NA | NA | NA | NA |
| 2791 | 2024-08-09 |
Dynamic single-cell RNA sequencing identifies immunotherapy persister cells following PD-1 blockade
2021-01-19, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI135038
PMID:33151910
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研究论文 | 本研究通过动态单细胞RNA测序技术，在PD-1阻断治疗的小鼠肿瘤球体中识别出免疫治疗持久细胞（IPCs） | 首次通过动态单细胞RNA测序技术识别出PD-1阻断后的免疫治疗持久细胞，并揭示了其特征和潜在的治疗靶点 | 研究主要在小鼠模型中进行，需要进一步在人体中验证其有效性和安全性 | 揭示PD-1阻断治疗中免疫逃逸的基本机制，并寻找新的治疗靶点 | 小鼠肿瘤球体中的免疫治疗持久细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠肿瘤球体 | NA | NA | NA | NA |
| 2792 | 2024-08-09 |
GRNdb: decoding the gene regulatory networks in diverse human and mouse conditions
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa995
PMID:33151298
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研究论文 | 本文介绍了GRNdb数据库，该数据库系统预测了人类和小鼠在184种不同生理和病理条件下涉及超过633,000个细胞和27,700个批量样本的基因调控网络（GRNs），并提供了一个用户友好的平台用于搜索、比较、浏览、可视化和下载相关信息。 | GRNdb是首个提供全面的人类和小鼠在单细胞水平上不同正常组织和疾病基因调控网络信息的数据库。 | NA | 开发一个全面的数据库，用于解析在多种条件下基因表达调控的功能和机制。 | 人类和小鼠的基因调控网络及其在不同生理和病理条件下的变化。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及超过633,000个细胞和27,700个批量样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2793 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis in Plants: Advances and Challenges
2021-01-04, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2020.10.012
PMID:33152518
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在植物科学中的应用进展和面临的挑战 | scRNA-seq技术能够以前所未有的分辨率和规模研究植物发育和生理，揭示细胞间的异质性 | 植物科学中单细胞转录组分析仍处于早期阶段，有许多挑战需要克服 | 探讨scRNA-seq技术在植物研究中的应用，并提出未来研究方向 | 使用拟南芥根模型进行的研究，以及新的单细胞分析工具 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2794 | 2024-08-09 |
Enhanced Efficacy of Simultaneous PD-1 and PD-L1 Immune Checkpoint Blockade in High-Grade Serous Ovarian Cancer
2021-01-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-1674
PMID:33158814
|
research paper | 本研究通过免疫功能和单细胞RNA测序转录组分析，探讨了双特异性抗PD-1/PD-L1抗体在高度浆液性卵巢癌中的作用机制 | 首次揭示了双特异性抗体诱导NK细胞和部分CD8 T细胞状态转变，增强免疫检查点阻断疗法在高度浆液性卵巢癌中的疗效 | NA | 研究双特异性抗PD-1/PD-L1抗体在高度浆液性卵巢癌中的免疫治疗效果及其作用机制 | 高度浆液性卵巢癌的肿瘤细胞与免疫细胞共培养模型 | NA | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2795 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing Reveals Clonal Architecture of Myeloid Cancers
2021-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-RW2020-163
PMID:33158845
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术揭示了髓系癌症的克隆结构 | 首次使用单细胞测序技术来解析髓系癌症的克隆结构 | NA | 探究髓系癌症的克隆结构 | 急性髓系白血病的克隆结构 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 2796 | 2024-08-09 |
Chitinase 3-like 1 and neurofilament light chain in CSF and CNS atrophy in MS
2021-01, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000000906
PMID:33172960
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研究论文 | 研究脑脊液中神经丝轻链（NfL）和新兴标记物壳多糖酶3样蛋白1（CHI3L1）与多发性硬化症（MS）患者脑和脊髓萎缩的横断面关联 | 首次探讨了CHI3L1和NfL在MS患者脑脊液中的水平与脑和脊髓萎缩的关系，并评估了CHI3L1在不同细胞类型中的表达 | 研究为单中心研究，样本量有限，可能影响结果的普遍性 | 探讨CHI3L1和NfL在MS患者中的表达与脑和脊髓萎缩的关系，以及CHI3L1在不同细胞类型中的表达 | 多发性硬化症患者（复发缓解型MS和进行性MS）及健康对照组的脑脊液中NfL和CHI3L1水平 | NA | 多发性硬化症 | MRI | NA | 脑脊液 | 131名MS患者（42名复发缓解型MS和89名进行性MS）及42名匹配的健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 2797 | 2024-08-09 |
Tissue disaggregation and isolation of specific cell types from transgenic Xenopus appendages for transcriptional analysis by FACS
2021-09, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.268
PMID:33137227
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研究论文 | 本文介绍了一种从转基因非洲爪蟾附肢中分离特定细胞类型并进行转录分析的方法 | 提出了一种使用荧光激活细胞分选（FACS）从复杂尾和肢芽组织中分离特定细胞群体的协议 | NA | 研究非洲爪蟾胚胎和蝌蚪中的细胞类型特异性转录分析 | 非洲爪蟾胚胎和蝌蚪的特定细胞类型 | 细胞生物学 | NA | 荧光激活细胞分选（FACS） | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2798 | 2024-08-09 |
Single-cell genomic profile-based analysis of tissue differentiation in colorectal cancer
2021-Aug, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-020-1811-5
PMID:33141303
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研究论文 | 本文开发了一种方法，利用正常胃肠道的单细胞转录组数据分析结直肠癌中的组织分化谱，并应用于281个肿瘤样本，识别出三种具有不同组织分化模式的结直肠癌亚型 | 本文首次直接测量了结直肠癌组织中的分化程度，并观察到分化状态与抗肿瘤免疫反应及患者预后密切相关 | NA | 研究结直肠癌进展中的组织分化状态变化 | 结直肠癌的组织分化状态及其与免疫反应和患者预后的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 281个肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2799 | 2024-08-09 |
scAPAtrap: identification and quantification of alternative polyadenylation sites from single-cell RNA-seq data
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa273
PMID:33142319
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研究论文 | 提出了一种名为scAPAtrap的工具，用于从基于3'标签的单细胞RNA测序数据中识别和量化选择性多聚腺苷酸化位点 | scAPAtrap能够识别低读取覆盖率的精确多聚腺苷酸化位点，并且不依赖于先验基因组注释，有助于发现先前被忽视区域的新的多聚腺苷酸化位点 | NA | 开发一种新的计算方法，用于在单细胞分辨率下识别和分析选择性多聚腺苷酸化位点 | 单细胞RNA测序数据中的选择性多聚腺苷酸化位点 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 不同实验技术和物种的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2800 | 2024-08-09 |
Recent Advances in Understandings Towards Pathogenesis and Treatment for Intrauterine Adhesion and Disruptive Insights from Single-Cell Analysis
2021-07, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-020-00343-y
PMID:33125685
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综述 | 本文综述了宫腔粘连的发病机制和治疗进展，并强调了单细胞分析在该领域的重要性 | 强调了单细胞RNA测序在揭示子宫细胞异质性和细胞间相互作用中的重要性 | 干细胞相关疗法的潜力虽大，但主要基于动物研究且研究设计不标准 | 总结和评估宫腔粘连的当前治疗进展和研究方法 | 宫腔粘连的发病机制和治疗方法 | NA | 妇科疾病 | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 110篇文章 | NA | NA | NA | NA |