单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 2781 - 2800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2781 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics of cardiac progenitors reveals functional subpopulations and their cooperative crosstalk in cardiac repair
2021-02, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-020-00788-6
PMID:33159668
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2782 | 2024-08-09 |
Clonal Hematopoiesis-Driver DNMT3A Mutations Alter Immune Cells in Heart Failure
2021-01-22, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.120.317104
PMID:33155517
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了携带DNMT3A突变的慢性心力衰竭患者的外周血单个核细胞的转录组特征 | 首次在人类中定义了由DNMT3A克隆性造血驱动突变介导的炎症免疫细胞亚群 | 样本量较小，需要进一步的大规模研究验证 | 探讨DNMT3A突变在慢性心力衰竭患者中对免疫细胞的影响 | 慢性心力衰竭患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6名携带DNMT3A突变的慢性心力衰竭患者和4名无DNMT3A突变的慢性心力衰竭患者 |
| 2783 | 2024-08-09 |
Dynamic single-cell RNA sequencing identifies immunotherapy persister cells following PD-1 blockade
2021-01-19, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI135038
PMID:33151910
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研究论文 | 本研究通过动态单细胞RNA测序技术，在PD-1阻断治疗的小鼠肿瘤球体中识别出免疫治疗持久细胞（IPCs） | 首次通过动态单细胞RNA测序技术识别出PD-1阻断后的免疫治疗持久细胞，并揭示了其特征和潜在的治疗靶点 | 研究主要在小鼠模型中进行，需要进一步在人体中验证其有效性和安全性 | 揭示PD-1阻断治疗中免疫逃逸的基本机制，并寻找新的治疗靶点 | 小鼠肿瘤球体中的免疫治疗持久细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠肿瘤球体 |
| 2784 | 2024-08-09 |
GRNdb: decoding the gene regulatory networks in diverse human and mouse conditions
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa995
PMID:33151298
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研究论文 | 本文介绍了GRNdb数据库，该数据库系统预测了人类和小鼠在184种不同生理和病理条件下涉及超过633,000个细胞和27,700个批量样本的基因调控网络（GRNs），并提供了一个用户友好的平台用于搜索、比较、浏览、可视化和下载相关信息。 | GRNdb是首个提供全面的人类和小鼠在单细胞水平上不同正常组织和疾病基因调控网络信息的数据库。 | NA | 开发一个全面的数据库，用于解析在多种条件下基因表达调控的功能和机制。 | 人类和小鼠的基因调控网络及其在不同生理和病理条件下的变化。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及超过633,000个细胞和27,700个批量样本 |
| 2785 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis in Plants: Advances and Challenges
2021-01-04, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2020.10.012
PMID:33152518
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在植物科学中的应用进展和面临的挑战 | scRNA-seq技术能够以前所未有的分辨率和规模研究植物发育和生理，揭示细胞间的异质性 | 植物科学中单细胞转录组分析仍处于早期阶段，有许多挑战需要克服 | 探讨scRNA-seq技术在植物研究中的应用，并提出未来研究方向 | 使用拟南芥根模型进行的研究，以及新的单细胞分析工具 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA |
| 2786 | 2024-08-09 |
Enhanced Efficacy of Simultaneous PD-1 and PD-L1 Immune Checkpoint Blockade in High-Grade Serous Ovarian Cancer
2021-01-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-1674
PMID:33158814
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research paper | 本研究通过免疫功能和单细胞RNA测序转录组分析，探讨了双特异性抗PD-1/PD-L1抗体在高度浆液性卵巢癌中的作用机制 | 首次揭示了双特异性抗体诱导NK细胞和部分CD8 T细胞状态转变，增强免疫检查点阻断疗法在高度浆液性卵巢癌中的疗效 | NA | 研究双特异性抗PD-1/PD-L1抗体在高度浆液性卵巢癌中的免疫治疗效果及其作用机制 | 高度浆液性卵巢癌的肿瘤细胞与免疫细胞共培养模型 | NA | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 2787 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing Reveals Clonal Architecture of Myeloid Cancers
2021-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-RW2020-163
PMID:33158845
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术揭示了髓系癌症的克隆结构 | 首次使用单细胞测序技术来解析髓系癌症的克隆结构 | NA | 探究髓系癌症的克隆结构 | 急性髓系白血病的克隆结构 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 2788 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Hematopoietic Cells
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0810-4_9
PMID:33165847
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研究论文 | 本文详细介绍了两种用于血液细胞单细胞RNA测序（scRNA-Seq）的方法：Smart-Seq2（基于板）和10× Genomics（基于液滴）。 | scRNA-Seq技术的发展为血液学领域带来了进步，增进了我们对正常和恶性造血过程的理解。 | 不同的scRNA-Seq方法各有优缺点，需要在实验设计时加以考虑。 | 探索和优化用于血液细胞的单细胞RNA测序技术。 | 血液细胞的转录状态。 | 数字病理学 | NA | scRNA-Seq | NA | RNA | NA |
| 2789 | 2024-08-09 |
Chitinase 3-like 1 and neurofilament light chain in CSF and CNS atrophy in MS
2021-01, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000000906
PMID:33172960
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研究论文 | 研究脑脊液中神经丝轻链（NfL）和新兴标记物壳多糖酶3样蛋白1（CHI3L1）与多发性硬化症（MS）患者脑和脊髓萎缩的横断面关联 | 首次探讨了CHI3L1和NfL在MS患者脑脊液中的水平与脑和脊髓萎缩的关系，并评估了CHI3L1在不同细胞类型中的表达 | 研究为单中心研究，样本量有限，可能影响结果的普遍性 | 探讨CHI3L1和NfL在MS患者中的表达与脑和脊髓萎缩的关系，以及CHI3L1在不同细胞类型中的表达 | 多发性硬化症患者（复发缓解型MS和进行性MS）及健康对照组的脑脊液中NfL和CHI3L1水平 | NA | 多发性硬化症 | MRI | NA | 脑脊液 | 131名MS患者（42名复发缓解型MS和89名进行性MS）及42名匹配的健康对照 |
| 2790 | 2024-08-09 |
Tissue disaggregation and isolation of specific cell types from transgenic Xenopus appendages for transcriptional analysis by FACS
2021-09, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.268
PMID:33137227
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研究论文 | 本文介绍了一种从转基因非洲爪蟾附肢中分离特定细胞类型并进行转录分析的方法 | 提出了一种使用荧光激活细胞分选（FACS）从复杂尾和肢芽组织中分离特定细胞群体的协议 | NA | 研究非洲爪蟾胚胎和蝌蚪中的细胞类型特异性转录分析 | 非洲爪蟾胚胎和蝌蚪的特定细胞类型 | 细胞生物学 | NA | 荧光激活细胞分选（FACS） | NA | 细胞 | NA |
| 2791 | 2024-08-09 |
Single-cell genomic profile-based analysis of tissue differentiation in colorectal cancer
2021-Aug, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-020-1811-5
PMID:33141303
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研究论文 | 本文开发了一种方法，利用正常胃肠道的单细胞转录组数据分析结直肠癌中的组织分化谱，并应用于281个肿瘤样本，识别出三种具有不同组织分化模式的结直肠癌亚型 | 本文首次直接测量了结直肠癌组织中的分化程度，并观察到分化状态与抗肿瘤免疫反应及患者预后密切相关 | NA | 研究结直肠癌进展中的组织分化状态变化 | 结直肠癌的组织分化状态及其与免疫反应和患者预后的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 281个肿瘤样本 |
| 2792 | 2024-08-09 |
scAPAtrap: identification and quantification of alternative polyadenylation sites from single-cell RNA-seq data
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa273
PMID:33142319
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研究论文 | 提出了一种名为scAPAtrap的工具，用于从基于3'标签的单细胞RNA测序数据中识别和量化选择性多聚腺苷酸化位点 | scAPAtrap能够识别低读取覆盖率的精确多聚腺苷酸化位点，并且不依赖于先验基因组注释，有助于发现先前被忽视区域的新的多聚腺苷酸化位点 | NA | 开发一种新的计算方法，用于在单细胞分辨率下识别和分析选择性多聚腺苷酸化位点 | 单细胞RNA测序数据中的选择性多聚腺苷酸化位点 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 不同实验技术和物种的单细胞RNA测序数据 |
| 2793 | 2024-08-09 |
Recent Advances in Understandings Towards Pathogenesis and Treatment for Intrauterine Adhesion and Disruptive Insights from Single-Cell Analysis
2021-07, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-020-00343-y
PMID:33125685
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综述 | 本文综述了宫腔粘连的发病机制和治疗进展，并强调了单细胞分析在该领域的重要性 | 强调了单细胞RNA测序在揭示子宫细胞异质性和细胞间相互作用中的重要性 | 干细胞相关疗法的潜力虽大，但主要基于动物研究且研究设计不标准 | 总结和评估宫腔粘连的当前治疗进展和研究方法 | 宫腔粘连的发病机制和治疗方法 | NA | 妇科疾病 | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 110篇文章 |
| 2794 | 2024-08-09 |
A data-driven dimensionality-reduction algorithm for the exploration of patterns in biomedical data
2021-06, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-020-00635-3
PMID:33139824
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研究论文 | 本文介绍了一种名为'特征增强嵌入机'（FEM）的数据驱动降维算法，用于探索生物医学数据中的模式 | 该算法能够学习数据结构和数据组件的固有特征，对数据进行去噪和组件分离，然后将数据投影到较低维度 | NA | 开发一种准确且广泛适用的数据驱动降维算法 | 生物医学数据中的模式探索 | 机器学习 | NA | 特征增强嵌入机（FEM） | NA | 蛋白质表达数据、单细胞RNA测序数据、计算机断层扫描数据、脑电图数据和可穿戴生理传感器数据 | NA |
| 2795 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals novel mitochondria-related musculoskeletal cell populations during adult axolotl limb regeneration process
2021-03, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-020-00640-8
PMID:33116295
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研究论文 | 本研究利用大规模单细胞RNA测序技术，分析了成年蝾螈肢体再生过程中的细胞分类，揭示了与再生相关的线粒体相关肌肉骨骼细胞群。 | 发现了支持再生过程的线粒体相关集群和通过细胞间相互作用信号促进再生的COL2+集群，以及支持肌肉骨骼系统再生的COL2-线粒体子集群。 | NA | 探索蝾螈肢体再生过程中的关键驱动因素，为人类肢体再生提供新见解。 | 成年蝾螈肢体再生过程中的细胞亚群和细胞外基质。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 大规模单细胞样本 |
| 2796 | 2024-08-09 |
Reshaping the Immune Microenvironment by Oncolytic Herpes Simplex Virus in Murine Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2021-02-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2020.10.027
PMID:33130310
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研究论文 | 本研究通过建立免疫活性同基因的胰腺导管腺癌模型，探讨了溶瘤单纯疱疹病毒-1（oHSV）对肿瘤微环境（TME）免疫细胞组成的影响 | oHSV通过下调肿瘤相关巨噬细胞（TAMs），尤其是抗炎性巨噬细胞，并增加肿瘤浸润淋巴细胞的比例，包括激活的细胞毒性CD8 T细胞和T辅助（Th）1细胞，从而重塑PDAC的TME，增强免疫活性 | NA | 研究oHSV在胰腺导管腺癌中的作用及其对肿瘤微环境的影响 | 胰腺导管腺癌（PDAC）及其肿瘤微环境（TME） | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），多色荧光激活细胞分选（FACS） | NA | 细胞 | 涉及携带肿瘤的小鼠 |
| 2797 | 2024-08-09 |
TransSynW: A single-cell RNA-sequencing based web application to guide cell conversion experiments
2021-02, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/sctm.20-0227
PMID:33125830
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研究论文 | 介绍了一种基于单细胞RNA测序数据的网络应用程序TransSynW，用于预测用户指定细胞群体的细胞转换转录因子（TFs） | TransSynW优先考虑预测转换TFs中的先驱因子，以促进细胞转换时常需的染色质开放，并预测标记基因以评估细胞转换实验的性能 | NA | 开发一种计算工具，帮助研究人员利用单细胞RNA测序数据生成所需的功能性细胞 | 细胞转换转录因子（TFs）和标记基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2798 | 2024-08-09 |
Exploring cardiac macrophage heterogeneity in the healthy and diseased myocardium
2021-02, Current opinion in immunology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.coi.2020.09.005
PMID:33128959
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研究论文 | 本文探讨了健康和病变心肌中心脏巨噬细胞的异质性，利用遗传命运图谱和单细胞RNA测序技术，提供了一个概念框架来评估心脏巨噬细胞的复杂性。 | 本文采用了遗传命运图谱和单细胞RNA测序技术，超越了传统的M1/M2分类，更细致地解析了巨噬细胞的异质性。 | 文章讨论了当前对心脏巨噬细胞多样性理解的局限性，特别是在缺血性损伤、高血压和心肌炎中的应用。 | 提供一个起点，帮助研究人员解析已知心脏巨噬细胞亚群的功能。 | 心脏巨噬细胞的异质性和其在健康及病变心肌中的作用。 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2799 | 2024-08-09 |
ARHGAP36 regulates proliferation and migration in papillary thyroid carcinoma cells
2021-01, Journal of molecular endocrinology
IF:3.6Q2
DOI:10.1530/JME-20-0230
PMID:33112823
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了甲状腺乳头状癌（PTC）患者原发肿瘤、淋巴结转移及邻近正常组织的细胞表达谱，发现ARHGAP36在恶性细胞中高表达，并调控其增殖和迁移 | 首次揭示ARHGAP36在甲状腺乳头状癌恶性细胞中的特异性表达，并证实其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 | 研究样本量较小，需进一步扩大样本验证ARHGAP36的临床应用价值 | 探索甲状腺乳头状癌复发和转移的诊断标志物及治疗靶点 | 甲状腺乳头状癌患者的原发肿瘤、淋巴结转移及邻近正常组织细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11,805个单细胞样本 |
| 2800 | 2024-08-09 |
Combining Whole-Cell Patch-Clamp Recordings with Single-Cell RNA Sequencing
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0818-0_9
PMID:33119852
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研究论文 | 本文详细描述了如何结合全细胞膜片钳记录和单细胞RNA测序技术来研究脑切片中的神经元 | 本文首次详细介绍了将全细胞膜片钳记录与单细胞RNA测序技术相结合的方法 | NA | 理解大脑功能及其组成细胞的特性 | 神经元的内在电特性及其在神经回路中的突触连接 | NA | NA | 全细胞膜片钳记录, 单细胞RNA测序 | NA | 电生理数据, 转录组数据 | 脑切片中的神经元 |