单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-08-05 |
Automated quality control and cell identification of droplet-based single-cell data using dropkick
2021-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.271908.120
PMID:33837131
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研究论文 | 开发了一种名为dropkick的全自动软件工具，用于单细胞RNA测序数据的质量控制和细胞识别 | dropkick能够自动确定数据集特定的训练标签，并学习真实细胞和环境噪声的基因表示，从而提高细胞识别的准确性和效率 | 在特定情况下，dropkick的性能可能受到数据集的技术噪声和背景变化的影响 | 研究单细胞RNA测序数据的质量控制和细胞筛选方法 | 主要研究单细胞RNA测序数据中的真正细胞与非信息条形码的区分 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 弱监督模型 | 模拟和真实的单细胞RNA测序数据 | NA |
| 262 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptional mapping of the human nephrogenic program
2021-08-23, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2021.07.017
PMID:34428401
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研究论文 | 本文建立了人类肾小管发育的空间转录组图谱 | 首次通过空间解析手段揭示了人类肾小管发育的过程，并构建了蛋白质三维图谱 | 样本数量和来源可能影响结果的普遍性 | 旨在建立人类肾小管发育的框架，以促进对肾脏发展和疾病的理解 | 人类肾小管的前体细胞及其发育 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 三维蛋白质图谱 | 一百万个肾小管前体细胞 |
| 263 | 2024-08-05 |
Genome-wide CRISPRi/a screens in human neurons link lysosomal failure to ferroptosis
2021-07, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-021-00862-0
PMID:34031600
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研究论文 | 本文展示了在人类神经元中进行的首个全基因组CRISPR干扰和激活筛选。 | 揭示了溶酶体蛋白prosaposin的下调如何选择性地增强神经元对氧化压力的敏感性，从而引发铁死亡的机制。 | 研究主要集中在神经元类型，其他细胞类型的反应未全面阐述。 | 系统理解不同人类细胞类型的基因功能。 | 人类神经元及其对慢性氧化压力的响应机制。 | 功能基因组学 | 神经退行性疾病 | CRISPR干扰和激活 | NA | 转录组数据 | NA |
| 264 | 2024-08-05 |
Regulation of Immune Responses by Nonhematopoietic Cells in Asthma
2021-01-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2000885
PMID:33397743
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研究论文 | 非造血细胞在哮喘中调节免疫反应的重要性 | 本研究揭示了不同肺驻留非造血细胞群体中的单个基因如何影响哮喘的发起和维持 | 本研究未详细探讨所有非造血细胞的免疫功能和相互作用 | 研究非造血细胞在哮喘中的作用及其对免疫反应的调节 | 不同肺驻留非造血细胞和传统免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 过敏性哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 265 | 2024-08-05 |
Matters of the heart: Cellular sex differences
2021-11, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2021.04.010
PMID:34166708
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研究论文 | 本文探讨了心脏中男性和女性细胞的差异，特别是非肌肉细胞类型 | 探讨了细胞性别在心脏健康和疾病中的差异，强调了微环境对细胞表型的影响 | 许多研究未报告细胞的性别，且多数研究使用的细胞来自男性 | 研究心脏中细胞性别差异及其对心脏健康和疾病的影响 | 哺乳动物心脏的男性和女性细胞，包括非肌肉细胞族群 | 数字病理 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 266 | 2024-08-05 |
Unfolded Protein Response as a Compensatory Mechanism and Potential Therapeutic Target in PLN R14del Cardiomyopathy
2021-08-03, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究探讨了PLN R14del心肌病中的未折叠蛋白反应（UPR）作为补偿机制和潜在的治疗靶点 | 揭示了PLN R14del患者心脏中的UPR通路的激活，以及通过小分子激活剂改善心肌收缩缺陷的治疗潜力 | 该研究未提及使用人类临床数据验证治疗效果的局限性 | 探讨PLN R14del心肌病的机制和潜在的治疗方法 | 使用人源诱导多能干细胞的心肌细胞（hiPSC-CMs）作为研究对象 | 数字病理学 | 心肌病 | 单细胞RNA测序 | 同源异基因hiPSC-CMs | 细胞生物数据 | 使用的样本数量和种类未具体指明 |
| 267 | 2024-08-05 |
Cis P-tau underlies vascular contribution to cognitive impairment and dementia and can be effectively targeted by immunotherapy in mice
2021-06-02, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aaz7615
PMID:34078745
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研究论文 | 该研究探讨了Cis P-tau在血管性认知障碍和痴呆中的作用及其免疫治疗潜力 | 本研究首次明确了Cis P-tau在血管性认知障碍和阿尔茨海默病中的关键作用，并提出了针对它的免疫治疗策略 | 本研究主要基于小鼠模型，尚需在临床人群中验证 | 研究Cis P-tau在血管性认知障碍和阿尔茨海默病中的作用及其治疗潜力 | 小鼠模型和血管性认知障碍及阿尔茨海默病患者 | 数字病理学 | 血管性认知障碍，阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，免疫治疗 | 小鼠模型 | 文本，RNA测序数据 | 小鼠模型及患者样本 |
| 268 | 2024-08-05 |
Resident and circulating memory T cells persist for years in melanoma patients with durable responses to immunotherapy
2021-03, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-021-00180-1
PMID:34179824
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研究论文 | 研究了黑色素瘤患者在免疫治疗后持久存在的记忆T细胞。 | 发现了长期存活的记忆T细胞在肿瘤和皮肤中的共享亚群，并且不同部位的克隆型存在相互关系。 | 本研究主要集中在黑色素瘤患者，可能不适用于其他类型癌症的记忆T细胞研究。 | 探讨免疫治疗后黑色素瘤患者的记忆T细胞的持久性 | 多发性黑色素瘤存活者的CD8 T细胞反应 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序和成对T细胞受体测序 | NA | RNA数据 | 研究涉及的样本数量和类型未明确提及 |
| 269 | 2024-08-05 |
Myeloid Cell-associated Resistance to PD-1/PD-L1 Blockade in Urothelial Cancer Revealed Through Bulk and Single-cell RNA Sequencing
2021-08-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-20-4574
PMID:33837006
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研究论文 | 本研究旨在确定与转移性尿路上皮癌中PD-1/PD-L1阻滞耐药性相关的主要分子和细胞特征 | 通过利用大规模和单细胞RNA测序，揭示了与PD-1/PD-L1阻滞耐药性相关的适应性免疫反应和促肿瘤性炎症基因特征之间的平衡 | 未讨论其他类型的细胞在抵抗机制中的作用 | 探讨转移性尿路上皮癌对PD-1/PD-L1阻滞的耐药机制 | 重点研究转移性尿路上皮癌患者及其肿瘤微环境中的免疫细胞特征 | 数字病理学 | 尿路上皮癌 | RNA测序 | NA | RNA数据 | 来自两项临床试验的样本数据以及肌肉浸润性膀胱癌标本 |
| 270 | 2024-08-05 |
Differential dynamics of peripheral immune responses to acute SARS-CoV-2 infection in older adults
2021-11, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-021-00127-2
PMID:37118336
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研究论文 | 本研究考察了COVID-19患者外周血单核细胞的表型、转录组和功能特征，以揭示年龄、时间和疾病严重程度的特定适应性 | 提出了年龄对COVID-19免疫反应影响的新见解，特别是在老年患者中观察到的B细胞和T细胞反应的特征 | 研究未提及样本的地理和种族多样性以及潜在变量的控制 | 研究老年人群体在急性SARS-CoV-2感染中外周免疫反应的动态变化 | 年轻和老年的COVID-19患者 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 免疫细胞类型相关数据 | 年轻和老年COVID-19患者的外周血样本 |
| 271 | 2024-08-05 |
Diverse alterations associated with resistance to KRAS(G12C) inhibition
2021-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-04065-2
PMID:34759319
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研究论文 | 本研究评估了肺癌患者对KRAS(G12C)抑制剂的抵抗性及其相关的多样性改变 | 揭示了与KRAS(G12C)抑制剂治疗相关的多种基因改变及其抵抗机制 | 研究主要集中在少量样本，限制了结果的普遍适用性 | 探讨肺癌患者对KRAS(G12C)抑制剂的抵抗性及其遗传基础 | 评估43名接受sotorasib治疗的肺癌患者的前后处理样本 | 计算机视觉 | 肺癌 | NA | NA | 样本 | 43名患者的前后处理样本 |
| 272 | 2024-08-05 |
Single Cell Analysis of Blood Mononuclear Cells Stimulated Through Either LPS or Anti-CD3 and Anti-CD28
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.636720
PMID:33815388
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研究论文 | 本研究开发了一种成本效益高的多重单细胞RNA测序方法，以研究不同激活因子对人类外周血单核细胞的影响 | 首次通过CITE-seq方法系统研究了不同激活因子对外周血单核细胞组成和转录特征的影响 | 本研究的范围可能受到样本数量和来源的限制 | 探讨经典T细胞和单核细胞激活因子如何改变外周血单核细胞的组成和转录谱 | 健康人供体的外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | CITE-seq | NA | RNA测序 | 来自健康人供体的外周血单核细胞 |
| 273 | 2024-08-05 |
An update on the phenotypic switching of vascular smooth muscle cells in the pathogenesis of atherosclerosis
2021-Dec-22, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-021-04079-z
PMID:34936041
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综述 | 该文章综述了血管平滑肌细胞在动脉粥样硬化中的表型转变 | 文章强调了血管平滑肌细胞在动脉粥样硬化表型转变中的新发现，包括对转录标志物的下调及多种其他表型的采纳 | 文章未明确阐述血管平滑肌细胞转变的分子机制和过程 | 综述动脉粥样硬化中血管平滑肌细胞表型转变的挑战和需进一步研究的问题 | 血管平滑肌细胞在动脉粥样硬化过程中的表型转变 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 274 | 2024-08-05 |
Deciphering neural heterogeneity through cell lineage tracing
2021-Mar, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-020-03689-3
PMID:33151389
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综述 | 本文综述了神经细胞谱系追踪的策略及其对理解神经细胞功能克隆关系的作用 | 结合不同的报告蛋白和转基因小鼠，利用新型基因组编辑工具和单细胞测序技术，显著提高了谱系追踪能力 | 对于谱系追踪的复杂性和挑战性仍未提供明确的解决方案 | 探讨细胞谱系在成人大脑发育中的重要性 | 围绕大脑中的细胞谱系和它们的功能克隆关系进行研究 | 发育神经生物学 | NA | 基因组编辑工具、单细胞测序 | 转基因小鼠 | NA | NA |
| 275 | 2024-08-05 |
Human airway mast cells proliferate and acquire distinct inflammation-driven phenotypes during type 2 inflammation
2021-02-26, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abb7221
PMID:33637594
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研究论文 | 本研究分析了人类气道肥大细胞在2型炎症过程中的增殖及其特异的以炎症驱动的表型 | 本研究链接了肥大细胞表面表型与其不同转录组之间的关系，揭示了肥大细胞在CRSwNP中的特异性增殖 | 对肥大细胞异质性的机制及其扩展的转录程序尚不完全理解 | 研究肥大细胞在2型过敏性炎症疾病中的作用及其增殖机制 | 人类气道中的肥大细胞，尤其是在慢性鼻窦炎伴有鼻息肉症中的肥大细胞 | 数字病理 | 呼吸道疾病 | 流式细胞术及单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 276 | 2024-08-05 |
Dissecting the initiation of female meiosis in the mouse at single-cell resolution
2021-Jan, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-020-03533-8
PMID:32367190
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研究论文 | 本文详细分析了小鼠雌性减数分裂的起始过程及其转录组特征 | 本研究通过单细胞RNA测序首次揭示了小鼠雌性减数分裂起始过程中的细胞群体及其转录组动力学，提供了重要的新资源 | 该研究集中于小鼠模型，可能不完全适用于其他物种的生殖生物学 | 揭示小鼠雌性减数分裂的分子机制及细胞群体的转录组特征 | 小鼠胎儿卵巢和生殖脊中的细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 研究中涉及13个转录群体和7个生殖细胞亚群 |
| 277 | 2024-08-05 |
The immune landscape of common CNS malignancies: implications for immunotherapy
2021-11, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/s41571-021-00518-9
PMID:34117475
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评论 | 本文回顾了中央神经系统恶性肿瘤的免疫景观及其对免疫治疗的影响 | 本文揭示了免疫组成和免疫生物学的基本差异，为胶质瘤的免疫治疗策略奠定基础 | 关于脑瘤对免疫检查点抑制剂反应的患者子集的研究限制了总体结果的推广 | 探讨中央神经系统恶性肿瘤中的免疫细胞组成和功能差异以及这些差异对免疫疗法的影响 | 对患有中央神经系统恶性肿瘤的患者样本进行免疫分析 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 质谱细胞术和单细胞测序 | 基因工程小鼠模型 | 样本 | NA |
| 278 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analysis of Blood-Brain Barrier Response to Pericyte Loss
2021-02-19, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.120.317473
PMID:33375813
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研究论文 | 本研究揭示了缺失周细胞对脑内皮细胞转录变化的影响 | 首次从单细胞层面揭示了缺失周细胞对血脑屏障的复杂影响及其分子机制 | 研究中使用的是基因诱导的周细胞缺失小鼠模型，可能不完全反映人类病理状态 | 映射缺失周细胞接触对脑内皮细胞转录变化的影响，并与血脑屏障功能和血管表型的区域异质性进行关联 | 缺失周细胞接触的脑内皮细胞 | 数字病理学 | 脑部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用了成年Pdgfbret/ret小鼠进行研究 |
| 279 | 2024-08-05 |
Virally encoded connectivity transgenic overlay RNA sequencing (VECTORseq) defines projection neurons involved in sensorimotor integration
2021-12-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.110131
PMID:34936877
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研究论文 | 本研究开发了一种新的RNA测序方法，用于定义参与感觉运动整合的投射神经元 | 提出了一种简便的、多重的RNA测序方法VECTORseq，能够高通量确定神经元亚型 | 现有的测序方法通量较低，操作复杂且成本高 | 定义不同脑区间连接的投射神经元的生理和行为角色 | 参与感觉运动整合的投射神经元 | 神经科学 | NA | RNA测序 | NA | 单细胞数据集 | NA |
| 280 | 2024-08-05 |
Heterogeneity of human anti-viral immunity shaped by virus, tissue, age, and sex
2021-11-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.110071
PMID:34852222
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研究论文 | 本文揭示了病毒、组织、年龄和性别如何影响抗病毒T细胞免疫的维持和功能 | 通过综合分析病毒特异性T细胞，首次揭示了多种因素对抗病毒免疫的异质性影响 | 研究主要基于器官捐献者的样本，可能未能全面代表所有人群 | 探讨影响抗病毒免疫的多种因素及其相互作用 | 针对流感和巨细胞病毒的特异性CD8 T细胞 | 免疫学 | NA | 流式细胞术、T细胞受体测序、单细胞转录组学和细胞因子分析 | NA | 血液、淋巴器官和粘膜组织的细胞样本 | 基于器官捐献者的综合样本 |