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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2761 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals developmental plasticity with coexisting oncogenic states and immune evasion programs in ETP-ALL
2021-05-06, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2019004547
PMID:33227818
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研究论文 | 本研究通过全长单细胞RNA测序技术,探讨了早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病(ETP-ALL)中的治疗抵抗机制,揭示了细胞发育可塑性与共存致癌状态及免疫逃避程序的关系 | 研究发现两种高度不同的干细胞样状态,这些状态在细胞周期和致癌信号传导方面存在关键差异,并且能够分化为具有显著免疫调节功能的更成熟白血病状态 | NA | 探讨ETP-ALL中的治疗抵抗机制及其与细胞发育可塑性和免疫逃避程序的关系 | ETP-ALL中的恶性细胞和微环境细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2762 | 2024-08-09 |
Looking at the developing lung in single-cell resolution
2021-05-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00385.2020
PMID:33205990
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在胎儿和新生儿肺发育研究中的主要发现,并探讨了其面临的挑战和未来发展方向 | 单细胞RNA测序技术为研究肺发育过程中的复杂细胞动态提供了无偏见且强有力的评估方法 | 目前关于健康或异常发育肺的单细胞转录组研究仍较少 | 探讨单细胞RNA测序技术在肺发育疾病研究中的应用 | 肺发育过程中的细胞类型及其基因表达变化 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2763 | 2024-08-09 |
Elucidating memory in the brain via single-cell transcriptomics
2021-05, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.15250
PMID:33230878
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研究论文 | 本文讨论了单细胞转录组学方法在揭示大脑记忆神经机制中的应用 | 利用单细胞转录组学技术,以空前的分辨率和通量深入理解记忆机制 | NA | 阐明大脑中记忆的神经机制 | 海马体和杏仁核区域的记忆机制 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2764 | 2024-08-09 |
Single-Nucleus and In Situ RNA-Sequencing Reveal Cell Topographies in the Human Pancreas
2021-03, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2020.11.010
PMID:33212097
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研究论文 | 本文通过单核RNA测序和原位RNA测序技术,揭示了人类胰腺中的细胞拓扑结构。 | 创新性地开发了单核RNA测序协议,并首次创建了全面的人类胰腺细胞图谱。 | NA | 旨在更好地理解健康和疾病状态下新生儿和成人胰腺的异质性和细胞组成。 | 人类胰腺细胞的异质性和组成。 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 | NA | 细胞 | 超过120,000个细胞来自成人和新生儿的胰腺捐赠者。 | NA | NA | NA | NA |
| 2765 | 2024-08-09 |
Vascular neutrophilic inflammation and immunothrombosis distinguish severe COVID-19 from influenza pneumonia
2021-02, Journal of thrombosis and haemostasis : JTH
IF:5.5Q1
DOI:10.1111/jth.15179
PMID:33217134
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研究论文 | 本研究通过比较SARS-CoV-2感染和流感感染的肺部组织病理学样本,揭示了血管中性粒细胞招募、NETosis和随后的免疫血栓形成是严重COVID-19的典型特征,而在流感肺炎中这些特征不明显。 | 本研究首次详细描述了严重COVID-19中血管中性粒细胞炎症和免疫血栓形成的路径机制,并探讨了其上游调控。 | NA | 研究免疫血栓形成是否为COVID-19的特异性病理因素,以及其上游调控机制。 | SARS-CoV-2感染和流感感染的肺部组织病理学样本。 | 数字病理学 | COVID-19 | scRNA-seq | NA | 组织样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2766 | 2024-08-09 |
A High-Content Screen Identifies Drugs That Restrict Tumor Cell Extravasation across the Endothelial Barrier
2021-02-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-19-3911
PMID:33218969
|
研究论文 | 本文通过高内涵筛选方法识别了限制肿瘤细胞跨内皮屏障外渗的药物 | 首次发现尼克酰胺作为一种有效药物,通过调节信号通路、趋化因子和肿瘤-内皮细胞相互作用来增强内皮屏障稳定性 | NA | 识别限制肿瘤细胞跨内皮屏障外渗的药物 | 3,520种化合物、斑马鱼模型和肺转移小鼠模型 | 数字病理学 | 肿瘤 | 高内涵筛选、单细胞RNA测序、蛋白质组分析 | NA | 图像 | 3,520种化合物、斑马鱼和小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 2767 | 2024-08-09 |
A Microfluidic Chip for Efficient Circulating Tumor Cells Enrichment, Screening, and Single-Cell RNA Sequencing
2021-02, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202000060
PMID:33219587
|
研究论文 | 本文开发了一种集成微流控芯片,用于循环肿瘤细胞(CTCs)的高效富集、筛选和单细胞RNA测序 | 该芯片集成了CTCs的连续富集、分离和单细胞水平表征,并在同一芯片上实现了单CTC裂解 | NA | 研究肿瘤异质性、转移和药物耐药性的机制 | 循环肿瘤细胞(CTCs) | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 通过将肿瘤细胞加入全血中进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 2768 | 2024-08-09 |
Intraoperative opioids are associated with improved recurrence-free survival in triple-negative breast cancer
2021-02, British journal of anaesthesia
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.bja.2020.10.021
PMID:33220939
|
研究论文 | 本文评估了手术中使用阿片类药物与三阴性乳腺癌(TNBC)患者肿瘤学结果之间的关联,并探讨了TNBC中阿片类受体的表达模式 | 发现手术中使用阿片类药物对TNBC患者的无复发生存期有保护作用,且阿片类受体的表达与阿片类激动剂的净保护作用一致 | 研究未发现手术中使用阿片类药物与总体生存期之间有显著关联 | 评估手术中使用阿片类药物与三阴性乳腺癌患者肿瘤学结果之间的关联 | 三阴性乳腺癌患者 | NA | 乳腺癌 | RNA测序 | NA | RNA | 1143例三阴性乳腺癌病例 | NA | NA | NA | NA |
| 2769 | 2024-08-09 |
Next-Generation Lineage Tracing and Fate Mapping to Interrogate Development
2021-01-11, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.10.021
PMID:33217333
|
review | 本文广泛回顾了命运图谱和谱系追踪方法的起源,并重点介绍了单细胞基因组学进展所允许的谱系追踪的最新发展 | 本文探讨了利用新技术合成高分辨率命运图谱的当前潜力,并讨论了它们在深入探究发育过程中的潜力 | NA | 回顾并探讨命运图谱和谱系追踪技术在发育生物学中的应用 | 命运图谱和谱系追踪技术 | NA | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2770 | 2024-08-09 |
CSEA-DB: an omnibus for human complex trait and cell type associations
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa1064
PMID:33211888
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为CSEA-DB的数据库,用于分析人类复杂性状和细胞类型之间的关联 | 首次提供了一个包含5120个GWAS总结统计数据和超过90万个细胞的综合数据库,通过deTS算法进行了10,250,480次性状-细胞类型关联分析 | NA | 构建一个用于研究人类复杂性状及其潜在细胞类型关联的参考数据库 | 人类复杂性状和细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞技术 | deTS算法 | 基因组数据 | 5120个GWAS总结统计数据,超过90万个细胞,包括752种组织细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 2771 | 2024-08-09 |
Lnc2Cancer 3.0: an updated resource for experimentally supported lncRNA/circRNA cancer associations and web tools based on RNA-seq and scRNA-seq data
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa1006
PMID:33219685
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研究论文 | 本文介绍了Lnc2Cancer 3.0数据库的更新,该数据库包含与人类癌症相关的实验支持的长非编码RNA(lncRNA)和环状RNA(circRNA)的全面数据,并描述了基于RNA测序和单细胞RNA测序的lncRNA表达分析的网络工具。 | Lnc2Cancer 3.0新增了多个功能,包括增加癌症相关lncRNA条目、新增实验支持的circRNA-癌症关联、包含癌症相关lncRNA和circRNA的实验支持的调控机制和生物学功能,以及实验支持的临床相关性。此外,还开发了两个灵活的在线工具,用于快速和自定义分析及可视化癌症中的lncRNA。 | NA | 旨在阐明lncRNA、circRNA与癌症之间的关联 | 长非编码RNA(lncRNA)和环状RNA(circRNA)与人类癌症的关联 | 生物信息学 | 癌症 | RNA测序(RNA-seq)和单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 文本 | 当前版本包括9254个lncRNA-癌症关联,涉及2659个lncRNA和216个癌症亚型;新增1049个实验支持的circRNA-癌症关联,涉及743个circRNA和70个癌症亚型 | NA | NA | NA | NA |
| 2772 | 2024-08-09 |
A `one-two punch' therapy strategy to target chemoresistance in estrogen receptor positive breast cancer
2021-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2020.100946
PMID:33221681
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研究论文 | 本研究探讨了在雌激素受体阳性(ER+)转移性乳腺癌中,化疗后出现的耐药亚克隆中癌症干细胞样(CSL)细胞的增加情况,并研究了组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂在逆转这种耐药性中的作用 | 本研究首次展示了HDAC抑制剂在阻止化疗诱导的耐药性表型中的作用,并提出了‘一石二鸟’的治疗策略 | NA | 研究HDAC抑制剂在逆转ER+乳腺癌化疗耐药性中的作用 | 雌激素受体阳性(ER+)转移性乳腺癌细胞 | NA | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2773 | 2024-08-09 |
FunRes: resolving tissue-specific functional cell states based on a cell-cell communication network model
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa283
PMID:33179736
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FunRes的计算方法,用于识别组织特异性的功能细胞状态,该方法基于单细胞RNA测序数据重建细胞间通信网络,进而划分细胞类型为功能细胞状态 | FunRes能够识别现有计算工具无法再现的各种细胞类型的已知功能细胞状态 | NA | 开发一种新的计算方法来识别组织特异性的功能细胞状态 | 177种细胞类型在10种不同组织中的功能细胞状态 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 细胞间通信网络模型 | 单细胞RNA测序数据 | 177种细胞类型在10种不同组织中 | NA | NA | NA | NA |
| 2774 | 2024-08-09 |
Are dropout imputation methods for scRNA-seq effective for scHi-C data?
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa289
PMID:33201180
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研究论文 | 本文探讨了将单细胞RNA测序(scRNA-seq)的缺失值插补方法应用于单细胞Hi-C(scHiC)数据的有效性 | 本文首次将scRNA-seq的插补方法应用于scHiC数据,并评估了其在识别结构零和插补缺失值方面的效果 | 文章未提及具体的局限性 | 研究目的是评估scRNA-seq插补方法在scHiC数据中的应用效果 | 研究对象是scHiC数据中的缺失值和结构零 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq, scHiC | NA | 基因组数据 | 文章未提及具体的样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 2775 | 2024-08-09 |
An extracellular vesicle-related gene expression signature identifies high-risk patients in medulloblastoma
2021-04-12, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaa254
PMID:33175161
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研究论文 | 本研究旨在通过单细胞转录组学、细胞培养模型和生物物理方法等技术,探索髓母细胞瘤(MB)中的细胞间通讯,并识别与高风险患者相关的基因表达特征。 | 本研究发现了与髓母细胞瘤高风险患者相关的新型基因表达特征EVS,具有较高的预后意义。 | NA | 研究髓母细胞瘤的转录组景观,并识别高风险患者的基因表达特征。 | 髓母细胞瘤及其亚组的肿瘤细胞和患者样本。 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞转录组学、纳米粒子跟踪分析、电子显微镜 | NA | 基因表达数据 | 大规模患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2776 | 2024-08-09 |
A Hierarchy of Proliferative and Migratory Keratinocytes Maintains the Tympanic Membrane
2021-02-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.10.006
PMID:33181078
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、谱系追踪、全器官移植和活细胞成像技术,揭示了鼓膜表皮与其他表皮部位不同的稳态机制,并展示了鼓膜表皮中多个角质形成细胞群体的三维层次结构。 | 首次揭示了鼓膜表皮的稳态机制,包括其独特的三维层次结构和角质形成细胞的定向侧向迁移。 | NA | 研究鼓膜表皮的稳态机制及其在鼓膜疾病中的作用。 | 鼓膜表皮中的角质形成细胞及其稳态机制。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2777 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analyses reveal heterogeneity in suspension cultures and clonal markers of CHO-K1 cells
2021-02, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.27624
PMID:33179258
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研究论文 | 本研究探讨了高细胞密度悬浮培养中CHO-K1细胞转录组的异质性及其与细胞周期的关系 | 首次揭示了高细胞密度悬浮培养中CHO-K1细胞转录组的异质性,并开发了一种线粒体全基因组单细胞测序方法用于验证细胞克隆性 | 研究未发现细胞周期依赖性亚群和细胞簇,且观察到的细胞异质性增加未见减弱 | 探究高细胞密度悬浮培养中细胞转录组的异质性及其与细胞周期的关系 | CHO-K1细胞在高细胞密度悬浮培养中的转录组异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序,线粒体全基因组单细胞测序 | NA | 转录组数据,线粒体基因组数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 2778 | 2024-08-09 |
Characterization of sheep spermatogenesis through single-cell RNA sequencing
2021-02, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202001035RRR
PMID:33197070
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术全面无偏地分析了绵羊精子发生过程中的细胞转录水平变化 | 首次对绵羊精子发生进行了全面的单细胞转录组研究,并意外发现了一种含有白细胞的体细胞 | NA | 探索绵羊精子发生过程中不同细胞类型的转录水平变化 | 绵羊的精子发生过程及其细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从成年绵羊睾丸中收集了11,772个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2779 | 2024-08-09 |
Molecular detection of maturation stages in the developing kidney
2021-02, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2020.11.002
PMID:33197428
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了小鼠发育中肾脏的不同阶段,以确定肾脏发育阶段的分子标志 | 首次使用单细胞RNA测序技术来确定肾脏发育阶段的分子标志,并应用于体外培养的肾脏类器官 | 当前的类器官仍然不成熟,且其精确的成熟阶段难以确定 | 建立与肾脏发育阶段相关的分子坐标 | 小鼠发育中肾脏的不同阶段 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 不同发育阶段的小鼠肾脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2780 | 2024-08-09 |
TISCH: a comprehensive web resource enabling interactive single-cell transcriptome visualization of tumor microenvironment
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa1020
PMID:33179754
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research paper | 本文介绍了Tumor Immune Single Cell Hub (TISCH),一个大规模的单细胞转录组数据库,整合了来自27种癌症类型的近200万个细胞的单细胞转录组数据。 | TISCH提供了一个用户友好的界面,用于系统地可视化、搜索和下载肿瘤微环境中的基因表达图谱,支持跨多个数据集的单细胞或集群级别的交互式基因表达可视化。 | NA | 旨在通过整合和利用大量已发表的单细胞RNA-seq数据集,为免疫治疗提供信息支持。 | 肿瘤微环境中的免疫系统异质性。 | digital pathology | NA | single-cell RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 近200万个细胞,来自76个高质量肿瘤数据集 | NA | NA | NA | NA |