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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2741 | 2024-08-09 |
Cyclophosphamide and Vinorelbine Activate Stem-Like CD8+ T Cells and Improve Anti-PD-1 Efficacy in Triple-Negative Breast Cancer
2021-02-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-1818
PMID:33268528
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研究论文 | 研究通过使用三阴性乳腺癌模型,探讨了环磷酰胺、检查点抑制剂和长春瑞滨联合治疗对肿瘤内免疫环境的影响 | 该研究首次展示了环磷酰胺、检查点抑制剂和长春瑞滨联合治疗能够激活抗原呈递细胞,增加肿瘤内Tcf1干细胞样CD8 T细胞,并促进前体耗竭CD8 T细胞的增加 | 研究主要在动物模型中进行,需要进一步的临床试验验证其疗效 | 探讨环磷酰胺、检查点抑制剂和长春瑞滨联合治疗在三阴性乳腺癌中的免疫调节作用 | 三阴性乳腺癌模型中的免疫细胞和肿瘤生长 | 肿瘤学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 超过50,000个肿瘤内免疫细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2742 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-Seq revealed profound immune alteration in the peripheral blood of patients with bacterial infection
2021-Feb, International journal of infectious diseases : IJID : official publication of the International Society for Infectious Diseases
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.ijid.2020.11.205
PMID:33278616
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了细菌感染患者外周血中免疫细胞的变化 | 开发了名为PBMCode的条形码分析框架,揭示了细菌感染下外周血中免疫细胞群和细胞状态的详细变化 | 需要在未来研究中进一步关注宿主对细菌感染反应的复杂性 | 更好地理解人类宿主对细菌感染的反应,以改善人类健康 | 细菌感染患者外周血中的免疫细胞 | NA | 细菌感染 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | RNA测序数据 | 外周血单个核细胞(PBMCs) | NA | NA | NA | NA |
| 2743 | 2024-08-09 |
Gene Regulatory Network Analysis and Engineering Directs Development and Vascularization of Multilineage Human Liver Organoids
2021-01-20, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2020.11.002
PMID:33290741
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研究论文 | 本文展示了通过整合分析和工程化基因调控网络(GRNs)在多谱系人肝类器官中指导成熟和血管形态发生的方法 | 通过过表达PROX1和ATF5,结合靶向CRISPR介导的转录激活内源性CYP3A4,重新编程组织GRN,改善了原生肝功能 | NA | 研究如何通过基因调控网络的分析和工程化促进人肝类器官的发育和血管化 | 多谱系人肝类器官 | NA | NA | CRISPR | NA | RNA-seq | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2744 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing of human breast tumour-infiltrating immune cells reveals a γδ T-cell subtype associated with good clinical outcome
2021-01, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202000680
PMID:33268347
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人类乳腺癌肿瘤浸润性免疫细胞中的γδ T细胞亚型,发现一种与良好临床结果相关的γδ T细胞亚型 | 本研究首次在乳腺癌肿瘤中鉴定出一种与改善总体癌症生存率相关的γδ T细胞亚型 | NA | 探索γδ T细胞在癌症免疫治疗中的潜在应用 | 人类乳腺癌肿瘤浸润性γδ T细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 健康成人供体的外周血γδ T细胞和乳腺癌患者的肿瘤活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2745 | 2024-08-09 |
Analysis of canine myeloid-derived suppressor cells (MDSCs) utilizing fluorescence-activated cell sorting, RNA protection mediums to yield quality RNA for single-cell RNA sequencing
2021-Jan, Veterinary immunology and immunopathology
IF:1.4Q2
DOI:10.1016/j.vetimm.2020.110144
PMID:33278779
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研究论文 | 本研究通过荧光激活细胞分选(FACS)和RNA保护介质优化犬类髓源抑制细胞(MDSC)的单细胞RNA测序 | 本研究优化了MDSC的FACS分选策略,并使用了RiboLock™和RNAlater™来保护RNA质量,提高了RNA完整性,从而改善了单细胞RNA测序的数据质量 | 由于正常样本中细胞数量较少,未进行进一步的通路分析 | 优化犬类MDSC的FACS分选和RNA保护方法,以提高单细胞RNA测序的数据质量 | 犬类髓源抑制细胞(MDSC) | 数字病理学 | 口腔黑色素瘤 | 荧光激活细胞分选(FACS),单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 两个样本,一个来自正常犬,另一个来自未治疗的口腔黑色素瘤犬 | NA | NA | NA | NA |
| 2746 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis reveals the purification and maturation effects of glucose starvation in hiPSC-CMs
2021-01-01, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2020.11.076
PMID:33279112
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了葡萄糖饥饿对人类诱导多能干细胞衍生的心肌细胞(hiPSC-CMs)纯化和成熟的影响。 | 首次全面评估了葡萄糖饥饿对hiPSC-CMs转录异质性的影响,并揭示了其对心肌细胞纯化和成熟的作用。 | NA | 探讨葡萄糖饥饿处理对hiPSC-CMs纯化和成熟的影响。 | 人类诱导多能干细胞衍生的心肌细胞(hiPSC-CMs)。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2747 | 2024-08-09 |
Tutorial: guidelines for the computational analysis of single-cell RNA sequencing data
2021-01, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-020-00409-w
PMID:33288955
|
教程 | 本文介绍了单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据的计算分析流程 | 提供了最佳实践指南和实用指南 | NA | 为实验人员提供数据分析指南,为生物信息学家提供新计算方法的概述 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 大量单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2748 | 2024-08-09 |
Ultra-fast scalable estimation of single-cell differentiation potency from scRNA-Seq data
2021-07-12, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa987
PMID:33244588
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Correlation of Connectome and Transcriptome (CCAT)的单细胞分化潜能评估方法,该方法能够快速准确地处理大规模scRNA-Seq数据 | CCAT方法在处理大规模数据时比现有最先进方法快100倍,且具有更高的鲁棒性和较低的计算成本 | NA | 开发一种快速且准确的算法来评估单细胞RNA-Seq数据中的分化潜能 | 单细胞RNA-Seq数据中的分化潜能 | 生物信息学 | NA | scRNA-Seq | CCAT | RNA-Seq数据 | 超过200万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2749 | 2024-08-09 |
Transcriptional dynamics of induced pluripotent stem cell differentiation into β cells reveals full endodermal commitment and homology with human islets
2021-04, Cytotherapy
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.jcyt.2020.10.004
PMID:33246884
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了诱导多能干细胞(iPSCs)向β细胞分化的转录动力学,揭示了其完全的内胚层承诺及与人类胰岛的高度同源性 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了iPSCs向β细胞分化的转录动态过程,并发现了内分泌/非内分泌细胞命运的分叉 | 研究指出,未来的工作需要改进生成的内分泌细胞,并避免分化为非胰腺内胚层细胞 | 研究iPSCs向β细胞分化的转录动力学,并确定最终分化产物的身份 | 诱导多能干细胞(iPSCs)及其向β细胞的分化过程 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从iPSCs向β细胞分化的四个阶段及人类供体胰岛中获取的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2750 | 2024-08-09 |
Schistosoma mansoni venom allergen-like protein 6 (SmVAL6) maintains tegumental barrier function
2021-03, International journal for parasitology
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.ijpara.2020.09.004
PMID:33253697
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研究论文 | 本文研究了曼氏血吸虫毒液过敏原样蛋白6(SmVAL6)在维持体表屏障功能中的作用 | 首次提供了Group 2 SmVAL在血吸虫生物学中具有基本功能的证据 | 目前缺乏对Group 2 SmVAL其他功能的研究支持 | 探讨SmVAL6在血吸虫生物学中的功能 | 曼氏血吸虫毒液过敏原样蛋白6(SmVAL6)及其在血吸虫体表屏障功能中的作用 | NA | NA | 原位杂交(WISH)、小干扰RNA(siRNA)、酵母双杂交筛选、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、计算机模拟 | NA | RNA | 涉及成年血吸虫的细胞和组织 | NA | NA | NA | NA |
| 2751 | 2024-08-09 |
A Single-Cell Transcriptomic Atlas of Human Skin Aging
2021-02-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.11.002
PMID:33238152
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了不同年龄段健康人眼睑皮肤的细胞类型及其分子和功能特性,揭示了皮肤老化过程中细胞类型和分子变化的模式 | 首次构建了人类皮肤老化的单细胞转录组图谱,揭示了光老化相关变化和慢性炎症随年龄的累积,以及关键转录因子在皮肤老化中的作用 | NA | 深入理解人类皮肤老化的分子和功能特性 | 人类眼睑皮肤的细胞类型及其在老化过程中的变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自不同年龄段的健康个体 | NA | NA | NA | NA |
| 2752 | 2024-08-09 |
The Application of Single-Cell RNA Sequencing in Studies of Autoimmune Diseases: a Comprehensive Review
2021-Feb, Clinical reviews in allergy & immunology
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s12016-020-08813-6
PMID:33236283
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在自身免疫疾病研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术能够揭示细胞异质性的复杂机制,发现新的细胞亚群,并有助于揭示发病机制、疾病演变和药物抗性的分子机制 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在自身免疫疾病研究中的应用及其对诊断和治疗策略的贡献 | 自身免疫疾病及其相关免疫细胞 | 生命科学研究 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2753 | 2024-08-09 |
Kidney Single-cell Transcriptomes Predict Spatial Corticomedullary Gene Expression and Tissue Osmolality Gradients
2021-02, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020070930
PMID:33239393
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术,预测和量化了小鼠肾脏皮质和髓质轴上的空间基因表达和组织渗透压梯度 | 首次通过单细胞转录组数据重建了肾脏细胞的空间位置,并预测了皮质和髓质轴上的基因表达 | NA | 探索单细胞转录组数据在预测肾脏细胞空间位置和基因表达中的应用 | 小鼠肾脏细胞及其基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞或单核mRNA测序 | NA | 转录组数据 | 野生型小鼠和Grhl2CD-/-小鼠的肾脏组织 | NA | NA | NA | NA |
| 2754 | 2024-08-09 |
Directed induction of alveolar type I cells derived from pluripotent stem cells via Wnt signaling inhibition
2021-02, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.3302
PMID:33241896
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了人诱导多能干细胞衍生的肺泡器官模型中肺泡I型细胞的分化机制 | 首次通过抑制Wnt信号通路成功诱导人诱导多能干细胞衍生的肺泡I型细胞分化,并利用单细胞RNA测序技术定义了这些细胞的转录组特征 | NA | 探究人肺泡I型细胞从肺泡II型细胞分化过程中的机制 | 人诱导多能干细胞衍生的肺泡I型细胞及其分化机制 | 干细胞研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括人诱导多能干细胞衍生的上皮细胞和胎儿肺成纤维细胞的肺泡器官模型 | NA | NA | NA | NA |
| 2755 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Workflow for Splenic Myeloid-Derived Suppressor Cells from Murine Breast Cancer Models
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1060-2_14
PMID:33237548
|
研究论文 | 本文提供了一种使用单细胞RNA测序(scRNAseq)探索乳腺癌模型中脾脏髓系来源抑制细胞(MDSCs)的详细流程 | 利用单细胞转录组学技术,深入研究了以往未被充分认识的细胞异质性,特别是免疫细胞亚群中的MDSCs | NA | 定义乳腺癌模型中脾脏髓系细胞的独特分子特征 | 乳腺癌模型中的脾脏髓系来源抑制细胞(MDSCs) | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 转录组 | 涉及乳腺癌模型小鼠和野生型对照小鼠的脾脏髓系细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2756 | 2024-08-09 |
Identification and characterization of distinct brown adipocyte subtypes in C57BL/6J mice
2021-01, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202000924
PMID:33257475
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析C57BL/6J小鼠棕色脂肪组织中的基质血管部分,鉴定并表征了不同的棕色脂肪细胞亚型 | 首次研究了棕色脂肪细胞亚型的发育起源,并确认了区分棕色脂肪细胞亚型的标记物 | NA | 深入了解棕色前脂肪细胞的异质性 | C57BL/6J小鼠的棕色脂肪组织 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | C57/BL6小鼠的棕色脂肪组织基质血管部分 | NA | NA | NA | NA |
| 2757 | 2024-08-09 |
Guidelines for Setting Up a mRNA Sequencing Experiment and Best Practices for Bioinformatic Data Analysis
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1201-9_10
PMID:33263908
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研究论文 | 本文回顾了转录组分析的关键发展,并详细介绍了mRNA测序实验设计和数据处理的工作流程,以及基于Illumina技术的最佳实践建议 | 讨论了单细胞RNA测序和长读长技术测序的新前沿 | NA | 提供mRNA测序实验设置和生物信息学数据分析的最佳实践指南 | mRNA测序实验和数据分析 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2758 | 2024-08-09 |
Systems analysis of hematopoiesis using single-cell lineage tracing
2021-01, Current opinion in hematology
IF:3.1Q2
DOI:10.1097/MOH.0000000000000624
PMID:33264223
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研究论文 | 本文综述了单细胞谱系追踪技术在血液生成系统分析中的应用及其最新发现 | 结合单细胞基因组学分析,这些研究允许对小鼠和人类的血液生成进行系统级描述 | 需要进一步研究以完全理解这些技术在人类生物学和疾病中的应用 | 探讨单细胞谱系追踪技术在血液生成研究中的优势、不足以及未来的发展方向 | 血液生成过程中的细胞行为和动态发展过程 | 数字病理学 | NA | 下一代测序 | NA | 单细胞RNA测序 | 数千个造血祖细胞在单个小鼠中 | NA | NA | NA | NA |
| 2759 | 2024-08-09 |
Defining HPV-specific B cell responses in patients with head and neck cancer
2021-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2931-3
PMID:33208941
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研究论文 | 本文研究了人乳头瘤病毒(HPV)阳性头颈癌患者肿瘤微环境中HPV特异性B细胞反应的存在及其特征 | 首次展示了HPV特异性B细胞反应在HPV阳性头颈癌患者中的存在,并详细描述了这些反应的特征,包括HPV特异性抗体的产生和定位 | NA | 探讨HPV阳性头颈癌患者肿瘤微环境中HPV特异性B细胞反应的特征及其在免疫治疗中的潜在应用 | HPV阳性头颈癌患者的肿瘤样本 | NA | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 多个患者的肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2760 | 2024-08-09 |
Deep feature extraction of single-cell transcriptomes by generative adversarial network
2021-06-16, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa976
PMID:33226074
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研究论文 | 本文介绍了一种单细胞生成对抗网络(scGAN),用于从原始数据中同时获取模式并最小化由技术伪影或其他数据固有因素引起的混杂效应 | scGAN通过将每个细胞投影到潜在嵌入来建模数据似然性,并尝试最小化潜在嵌入与批次标签之间的相关性 | NA | 解决单细胞RNA测序(scRNA-seq)中的批次效应问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 生成对抗网络(GAN) | 基因表达数据 | 三个公共scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |