单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 2741 - 2760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2741 | 2024-08-09 |
Kidney Single-cell Transcriptomes Predict Spatial Corticomedullary Gene Expression and Tissue Osmolality Gradients
2021-02, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020070930
PMID:33239393
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术，预测和量化了小鼠肾脏皮质和髓质轴上的空间基因表达和组织渗透压梯度 | 首次通过单细胞转录组数据重建了肾脏细胞的空间位置，并预测了皮质和髓质轴上的基因表达 | NA | 探索单细胞转录组数据在预测肾脏细胞空间位置和基因表达中的应用 | 小鼠肾脏细胞及其基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞或单核mRNA测序 | NA | 转录组数据 | 野生型小鼠和Grhl2CD-/-小鼠的肾脏组织 |
| 2742 | 2024-08-09 |
Directed induction of alveolar type I cells derived from pluripotent stem cells via Wnt signaling inhibition
2021-02, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.3302
PMID:33241896
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了人诱导多能干细胞衍生的肺泡器官模型中肺泡I型细胞的分化机制 | 首次通过抑制Wnt信号通路成功诱导人诱导多能干细胞衍生的肺泡I型细胞分化，并利用单细胞RNA测序技术定义了这些细胞的转录组特征 | NA | 探究人肺泡I型细胞从肺泡II型细胞分化过程中的机制 | 人诱导多能干细胞衍生的肺泡I型细胞及其分化机制 | 干细胞研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括人诱导多能干细胞衍生的上皮细胞和胎儿肺成纤维细胞的肺泡器官模型 |
| 2743 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Workflow for Splenic Myeloid-Derived Suppressor Cells from Murine Breast Cancer Models
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1060-2_14
PMID:33237548
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研究论文 | 本文提供了一种使用单细胞RNA测序（scRNAseq）探索乳腺癌模型中脾脏髓系来源抑制细胞（MDSCs）的详细流程 | 利用单细胞转录组学技术，深入研究了以往未被充分认识的细胞异质性，特别是免疫细胞亚群中的MDSCs | NA | 定义乳腺癌模型中脾脏髓系细胞的独特分子特征 | 乳腺癌模型中的脾脏髓系来源抑制细胞（MDSCs） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组 | 涉及乳腺癌模型小鼠和野生型对照小鼠的脾脏髓系细胞 |
| 2744 | 2024-08-09 |
Identification and characterization of distinct brown adipocyte subtypes in C57BL/6J mice
2021-01, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202000924
PMID:33257475
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析C57BL/6J小鼠棕色脂肪组织中的基质血管部分，鉴定并表征了不同的棕色脂肪细胞亚型 | 首次研究了棕色脂肪细胞亚型的发育起源，并确认了区分棕色脂肪细胞亚型的标记物 | NA | 深入了解棕色前脂肪细胞的异质性 | C57BL/6J小鼠的棕色脂肪组织 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | C57/BL6小鼠的棕色脂肪组织基质血管部分 |
| 2745 | 2024-08-09 |
Guidelines for Setting Up a mRNA Sequencing Experiment and Best Practices for Bioinformatic Data Analysis
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1201-9_10
PMID:33263908
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研究论文 | 本文回顾了转录组分析的关键发展，并详细介绍了mRNA测序实验设计和数据处理的工作流程，以及基于Illumina技术的最佳实践建议 | 讨论了单细胞RNA测序和长读长技术测序的新前沿 | NA | 提供mRNA测序实验设置和生物信息学数据分析的最佳实践指南 | mRNA测序实验和数据分析 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 文本 | NA |
| 2746 | 2024-08-09 |
Systems analysis of hematopoiesis using single-cell lineage tracing
2021-01, Current opinion in hematology
IF:3.1Q2
DOI:10.1097/MOH.0000000000000624
PMID:33264223
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研究论文 | 本文综述了单细胞谱系追踪技术在血液生成系统分析中的应用及其最新发现 | 结合单细胞基因组学分析，这些研究允许对小鼠和人类的血液生成进行系统级描述 | 需要进一步研究以完全理解这些技术在人类生物学和疾病中的应用 | 探讨单细胞谱系追踪技术在血液生成研究中的优势、不足以及未来的发展方向 | 血液生成过程中的细胞行为和动态发展过程 | 数字病理学 | NA | 下一代测序 | NA | 单细胞RNA测序 | 数千个造血祖细胞在单个小鼠中 |
| 2747 | 2024-08-09 |
Defining HPV-specific B cell responses in patients with head and neck cancer
2021-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2931-3
PMID:33208941
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研究论文 | 本文研究了人乳头瘤病毒（HPV）阳性头颈癌患者肿瘤微环境中HPV特异性B细胞反应的存在及其特征 | 首次展示了HPV特异性B细胞反应在HPV阳性头颈癌患者中的存在，并详细描述了这些反应的特征，包括HPV特异性抗体的产生和定位 | NA | 探讨HPV阳性头颈癌患者肿瘤微环境中HPV特异性B细胞反应的特征及其在免疫治疗中的潜在应用 | HPV阳性头颈癌患者的肿瘤样本 | NA | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 多个患者的肿瘤样本 |
| 2748 | 2024-08-09 |
Deep feature extraction of single-cell transcriptomes by generative adversarial network
2021-06-16, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa976
PMID:33226074
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研究论文 | 本文介绍了一种单细胞生成对抗网络（scGAN），用于从原始数据中同时获取模式并最小化由技术伪影或其他数据固有因素引起的混杂效应 | scGAN通过将每个细胞投影到潜在嵌入来建模数据似然性，并尝试最小化潜在嵌入与批次标签之间的相关性 | NA | 解决单细胞RNA测序（scRNA-seq）中的批次效应问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 生成对抗网络（GAN） | 基因表达数据 | 三个公共scRNA-seq数据集 |
| 2749 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals developmental plasticity with coexisting oncogenic states and immune evasion programs in ETP-ALL
2021-05-06, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2019004547
PMID:33227818
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研究论文 | 本研究通过全长单细胞RNA测序技术，探讨了早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病（ETP-ALL）中的治疗抵抗机制，揭示了细胞发育可塑性与共存致癌状态及免疫逃避程序的关系 | 研究发现两种高度不同的干细胞样状态，这些状态在细胞周期和致癌信号传导方面存在关键差异，并且能够分化为具有显著免疫调节功能的更成熟白血病状态 | NA | 探讨ETP-ALL中的治疗抵抗机制及其与细胞发育可塑性和免疫逃避程序的关系 | ETP-ALL中的恶性细胞和微环境细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 2750 | 2024-08-09 |
Ileal Transcriptomic Analysis in Paediatric Crohn's Disease Reveals IL17- and NOD-signalling Expression Signatures in Treatment-naïve Patients and Identifies Epithelial Cells Driving Differentially Expressed Genes
2021-May-04, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaa236
PMID:33232439
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研究论文 | 本研究通过靶向自身免疫RNA测序和单细胞测序技术，分析了未经治疗的儿科克罗恩病患者的回肠组织，揭示了IL17和NOD信号通路的表达特征，并识别了驱动差异表达基因的特定上皮细胞。 | 本研究首次在未经治疗的儿科克罗恩病患者中发现了IL17、NOD和Oncostatin-M信号通路的显著上调，并确定了驱动这些信号通路的特定上皮细胞。 | 研究样本量相对较小，且仅限于未经治疗的儿科克罗恩病患者，可能限制了结果的普遍性。 | 旨在确定儿科克罗恩病中激活的信号通路和驱动细胞类型。 | 儿科克罗恩病患者的回肠组织及其与对照组的比较。 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 靶向自身免疫RNA测序、单细胞测序 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | RNA序列数据 | 27名未经治疗的克罗恩病患者、26名已确诊的克罗恩病患者和17名对照组 |
| 2751 | 2024-08-09 |
Looking at the developing lung in single-cell resolution
2021-05-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00385.2020
PMID:33205990
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在胎儿和新生儿肺发育研究中的主要发现，并探讨了其面临的挑战和未来发展方向 | 单细胞RNA测序技术为研究肺发育过程中的复杂细胞动态提供了无偏见且强有力的评估方法 | 目前关于健康或异常发育肺的单细胞转录组研究仍较少 | 探讨单细胞RNA测序技术在肺发育疾病研究中的应用 | 肺发育过程中的细胞类型及其基因表达变化 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 2752 | 2024-08-09 |
Elucidating memory in the brain via single-cell transcriptomics
2021-05, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.15250
PMID:33230878
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研究论文 | 本文讨论了单细胞转录组学方法在揭示大脑记忆神经机制中的应用 | 利用单细胞转录组学技术，以空前的分辨率和通量深入理解记忆机制 | NA | 阐明大脑中记忆的神经机制 | 海马体和杏仁核区域的记忆机制 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2753 | 2024-08-09 |
Single-Nucleus and In Situ RNA-Sequencing Reveal Cell Topographies in the Human Pancreas
2021-03, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2020.11.010
PMID:33212097
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研究论文 | 本文通过单核RNA测序和原位RNA测序技术，揭示了人类胰腺中的细胞拓扑结构。 | 创新性地开发了单核RNA测序协议，并首次创建了全面的人类胰腺细胞图谱。 | NA | 旨在更好地理解健康和疾病状态下新生儿和成人胰腺的异质性和细胞组成。 | 人类胰腺细胞的异质性和组成。 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 | NA | 细胞 | 超过120,000个细胞来自成人和新生儿的胰腺捐赠者。 |
| 2754 | 2024-08-09 |
Vascular neutrophilic inflammation and immunothrombosis distinguish severe COVID-19 from influenza pneumonia
2021-02, Journal of thrombosis and haemostasis : JTH
IF:5.5Q1
DOI:10.1111/jth.15179
PMID:33217134
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研究论文 | 本研究通过比较SARS-CoV-2感染和流感感染的肺部组织病理学样本，揭示了血管中性粒细胞招募、NETosis和随后的免疫血栓形成是严重COVID-19的典型特征，而在流感肺炎中这些特征不明显。 | 本研究首次详细描述了严重COVID-19中血管中性粒细胞炎症和免疫血栓形成的路径机制，并探讨了其上游调控。 | NA | 研究免疫血栓形成是否为COVID-19的特异性病理因素，以及其上游调控机制。 | SARS-CoV-2感染和流感感染的肺部组织病理学样本。 | 数字病理学 | COVID-19 | scRNA-seq | NA | 组织样本 | NA |
| 2755 | 2024-08-09 |
A High-Content Screen Identifies Drugs That Restrict Tumor Cell Extravasation across the Endothelial Barrier
2021-02-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-19-3911
PMID:33218969
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研究论文 | 本文通过高内涵筛选方法识别了限制肿瘤细胞跨内皮屏障外渗的药物 | 首次发现尼克酰胺作为一种有效药物，通过调节信号通路、趋化因子和肿瘤-内皮细胞相互作用来增强内皮屏障稳定性 | NA | 识别限制肿瘤细胞跨内皮屏障外渗的药物 | 3,520种化合物、斑马鱼模型和肺转移小鼠模型 | 数字病理学 | 肿瘤 | 高内涵筛选、单细胞RNA测序、蛋白质组分析 | NA | 图像 | 3,520种化合物、斑马鱼和小鼠模型 |
| 2756 | 2024-08-09 |
A Microfluidic Chip for Efficient Circulating Tumor Cells Enrichment, Screening, and Single-Cell RNA Sequencing
2021-02, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202000060
PMID:33219587
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研究论文 | 本文开发了一种集成微流控芯片，用于循环肿瘤细胞（CTCs）的高效富集、筛选和单细胞RNA测序 | 该芯片集成了CTCs的连续富集、分离和单细胞水平表征，并在同一芯片上实现了单CTC裂解 | NA | 研究肿瘤异质性、转移和药物耐药性的机制 | 循环肿瘤细胞（CTCs） | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 通过将肿瘤细胞加入全血中进行验证 |
| 2757 | 2024-08-09 |
Intraoperative opioids are associated with improved recurrence-free survival in triple-negative breast cancer
2021-02, British journal of anaesthesia
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.bja.2020.10.021
PMID:33220939
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研究论文 | 本文评估了手术中使用阿片类药物与三阴性乳腺癌（TNBC）患者肿瘤学结果之间的关联，并探讨了TNBC中阿片类受体的表达模式 | 发现手术中使用阿片类药物对TNBC患者的无复发生存期有保护作用，且阿片类受体的表达与阿片类激动剂的净保护作用一致 | 研究未发现手术中使用阿片类药物与总体生存期之间有显著关联 | 评估手术中使用阿片类药物与三阴性乳腺癌患者肿瘤学结果之间的关联 | 三阴性乳腺癌患者 | NA | 乳腺癌 | RNA测序 | NA | RNA | 1143例三阴性乳腺癌病例 |
| 2758 | 2024-08-09 |
Next-Generation Lineage Tracing and Fate Mapping to Interrogate Development
2021-01-11, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.10.021
PMID:33217333
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review | 本文广泛回顾了命运图谱和谱系追踪方法的起源，并重点介绍了单细胞基因组学进展所允许的谱系追踪的最新发展 | 本文探讨了利用新技术合成高分辨率命运图谱的当前潜力，并讨论了它们在深入探究发育过程中的潜力 | NA | 回顾并探讨命运图谱和谱系追踪技术在发育生物学中的应用 | 命运图谱和谱系追踪技术 | NA | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 2759 | 2024-08-09 |
CSEA-DB: an omnibus for human complex trait and cell type associations
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa1064
PMID:33211888
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研究论文 | 本文介绍了一个名为CSEA-DB的数据库，用于分析人类复杂性状和细胞类型之间的关联 | 首次提供了一个包含5120个GWAS总结统计数据和超过90万个细胞的综合数据库，通过deTS算法进行了10,250,480次性状-细胞类型关联分析 | NA | 构建一个用于研究人类复杂性状及其潜在细胞类型关联的参考数据库 | 人类复杂性状和细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞技术 | deTS算法 | 基因组数据 | 5120个GWAS总结统计数据，超过90万个细胞，包括752种组织细胞类型 |
| 2760 | 2024-08-09 |
Lnc2Cancer 3.0: an updated resource for experimentally supported lncRNA/circRNA cancer associations and web tools based on RNA-seq and scRNA-seq data
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa1006
PMID:33219685
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研究论文 | 本文介绍了Lnc2Cancer 3.0数据库的更新，该数据库包含与人类癌症相关的实验支持的长非编码RNA（lncRNA）和环状RNA（circRNA）的全面数据，并描述了基于RNA测序和单细胞RNA测序的lncRNA表达分析的网络工具。 | Lnc2Cancer 3.0新增了多个功能，包括增加癌症相关lncRNA条目、新增实验支持的circRNA-癌症关联、包含癌症相关lncRNA和circRNA的实验支持的调控机制和生物学功能，以及实验支持的临床相关性。此外，还开发了两个灵活的在线工具，用于快速和自定义分析及可视化癌症中的lncRNA。 | NA | 旨在阐明lncRNA、circRNA与癌症之间的关联 | 长非编码RNA（lncRNA）和环状RNA（circRNA）与人类癌症的关联 | 生物信息学 | 癌症 | RNA测序（RNA-seq）和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 文本 | 当前版本包括9254个lncRNA-癌症关联，涉及2659个lncRNA和216个癌症亚型；新增1049个实验支持的circRNA-癌症关联，涉及743个circRNA和70个癌症亚型 |