单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 2721 - 2740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2721 | 2024-08-09 |
ColorCells: a database of expression, classification and functions of lncRNAs in single cells
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa325
PMID:33313674
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研究论文 | 本文开发了ColorCells数据库，用于比较分析单细胞RNA-Seq数据中lncRNA的表达、分类和功能 | 首次识别出一批细胞特异性的lncRNA，并验证了其在细胞分类中的能力与已知标记基因相当 | NA | 揭示lncRNA在单细胞水平上的表达特异性和功能 | lncRNA在单细胞中的表达和功能 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-Seq数据 | 167,913个来自六种物种的公开单细胞RNA-Seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2722 | 2024-08-09 |
Goals and approaches for each processing step for single-cell RNA sequencing data
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa314
PMID:33316046
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序数据处理各步骤的目标和最流行的计算分析工具 | 提供了对单细胞RNA测序数据质量控制、归一化、插补、特征选择和降维等步骤的全面概述 | 尚未形成适用于所有数据集的金标准分析流程 | 帮助研究者根据特定数据集选择合适的分析工具 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2723 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing of psoriatic skin identifies pathogenic Tc17 cell subsets and reveals distinctions between CD8+ T cells in autoimmunity and cancer
2021-06, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2020.11.028
PMID:33309739
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，全面分析了银屑病皮肤病变中CD8+ T细胞的表型变异 | 发现了11种转录上多样化的CD8+ T细胞亚群，其中包括两种与疾病严重程度相关的非耗竭性Tc17细胞亚群 | NA | 旨在全面表征银屑病病变中CD8+ T细胞的表型变异 | 银屑病和健康皮肤的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | 支持向量机分类器 | 转录组 | 银屑病和健康皮肤的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2724 | 2024-08-09 |
Secretory Cells Dominate Airway CFTR Expression and Function in Human Airway Superficial Epithelia
2021-05-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202008-3198OC
PMID:33321047
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了正常人肺部气道上皮细胞中CFTR表达的细胞类型特异性 | 首次全面描述了正常人肺部气道上皮细胞中CFTR表达的细胞类型特异性，并验证了其在囊性纤维化治疗中的应用 | NA | 确定表达CFTR的特定细胞类型，为囊性纤维化的精准医疗治疗提供依据 | 正常人肺部气道上皮细胞中CFTR的表达和功能 | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA数据 | 新鲜分离的人类大和小气道上皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2725 | 2024-08-09 |
Treatment of granuloma annulare and suppression of proinflammatory cytokine activity with tofacitinib
2021-05, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2020.10.012
PMID:33317858
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序和临床试验评估托法替尼治疗环状肉芽肿的效果 | 首次使用单细胞RNA测序研究环状肉芽肿的免疫发病机制，并评估托法替尼的治疗效果 | 研究样本量较小，仅涉及5名患者 | 深入理解环状肉芽肿的发病机制并评估分子靶向治疗的有效性 | 环状肉芽肿及其治疗 | NA | 环状肉芽肿 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 5名患有严重、长期环状肉芽肿的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 2726 | 2024-08-09 |
Post-infectious inflammatory disease in MIS-C features elevated cytotoxicity signatures and autoreactivity that correlates with severity
2021-Apr-03, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2020.12.01.20241364
PMID:33300011
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、抗原受体谱分析、无偏倚血清蛋白质组学和实验方法，定义了儿童多系统炎症综合征（MIS-C）与成人COVID-19及健康对照组的免疫异常 | 揭示了MIS-C患者中升高的S100A家族警报素、血清蛋白富集以及NK和CD8 T细胞毒性基因的升高，以及与严重程度相关的自身反应性 | NA | 定义MIS-C的免疫病理特征，为预测和管理由SARS-CoV2引起的儿童危重疾病提供依据 | 儿童多系统炎症综合征（MIS-C）患者的免疫异常 | NA | 儿童多系统炎症综合征 | 单细胞RNA测序、抗原受体谱分析、血清蛋白质组学 | NA | RNA序列、血清蛋白 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2727 | 2024-08-09 |
Antigen-driven PD-1+ TOX+ BHLHE40+ and PD-1+ TOX+ EOMES+ T lymphocytes regulate juvenile idiopathic arthritis in situ
2021-04, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202048797
PMID:33296081
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序结合T细胞受体分析，研究了幼年特发性关节炎（JIA）患者滑膜T淋巴细胞的转录和克隆异质性 | 首次鉴定出在原位通过抗原激活的克隆扩增T淋巴细胞亚群，并揭示了这些细胞在JIA中的功能 | NA | 探讨T淋巴细胞在幼年特发性关节炎（JIA）中的功能 | JIA患者的滑膜T淋巴细胞 | 免疫学 | 幼年特发性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2728 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneity and differential expression of decidual tissues during the peripartum period
2021-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.12967
PMID:33300223
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了分娩前后蜕膜组织的转录组，揭示了其异质性和差异表达。 | 本研究首次在单细胞分辨率下揭示了分娩前后蜕膜组织的异质性和差异表达，为研究分娩期蜕膜提供了新的视角。 | NA | 研究分娩期蜕膜组织的异质性和差异表达。 | 分娩前后蜕膜组织的转录组。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 29,231个蜕膜细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2729 | 2024-08-09 |
Combined BRAF, MEK, and CDK4/6 Inhibition Depletes Intratumoral Immune-Potentiating Myeloid Populations in Melanoma
2021-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-20-0401
PMID:33303574
|
研究论文 | 本文通过同源黑色素瘤模型研究了BRAF、MEK和CDK4/6联合抑制对肿瘤内免疫增强骨髓细胞的影响 | 首次探讨了BRAF、MEK和CDK4/6三联疗法对黑色素瘤患者抗肿瘤免疫的影响 | 研究仅限于同源黑色素瘤模型，需要进一步的临床试验验证 | 探讨BRAF、MEK和CDK4/6联合抑制对黑色素瘤抗肿瘤免疫的影响 | 黑色素瘤中的免疫增强骨髓细胞 | NA | 黑色素瘤 | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2730 | 2024-08-09 |
ScGSLC: An unsupervised graph similarity learning framework for single-cell RNA-seq data clustering
2021-Feb, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 提出了一种基于图相似学习的单细胞RNA测序数据聚类框架ScGSLC | 将单细胞RNA测序数据与蛋白质-蛋白质相互作用网络整合到图中，并利用图卷积网络进行图嵌入和细胞聚类 | NA | 提高单细胞RNA测序数据聚类的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞聚类 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图卷积网络 | 图数据 | 九个公共数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2731 | 2024-08-09 |
Dissecting the human kidney allograft transcriptome: single-cell RNA sequencing
2021-02-01, Current opinion in organ transplantation
IF:1.8Q3
DOI:10.1097/MOT.0000000000000840
PMID:33315769
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在人类肾脏同种异体移植转录组研究中的应用 | scRNA-seq技术使得能够研究单个细胞的转录组，并评估细胞群体中的转录差异和相似性 | 传统的RNA测序无法提供关于个体细胞类型和细胞状态的信息 | 深入理解scRNA-seq技术，并总结其在人类肾脏同种异体移植转录组研究中的应用 | 人类肾脏同种异体移植组织 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2732 | 2024-08-09 |
A road map from single-cell transcriptome to patient classification for the immune response to trauma
2021-01-25, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.145108
PMID:33320841
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了创伤后小鼠和创伤患者的循环及骨髓单核细胞，揭示了创伤诱导的免疫反应及其对患者分类的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细解析了创伤后免疫反应的细胞层面变化，并据此定义了两种创伤患者亚型 | 研究主要集中在小鼠模型和创伤患者，未来研究需要扩展到其他类型的炎症疾病和危重病患 | 解析创伤后的免疫反应，并基于此进行患者分类 | 创伤后的小鼠和创伤患者的循环及骨髓单核细胞 | 数字病理学 | 创伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及受伤小鼠和创伤患者的循环单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2733 | 2024-08-09 |
High-Throughput Monitoring of Bacterial Cell Density in Nanoliter Droplets: Label-Free Detection of Unmodified Gram-Positive and Gram-Negative Bacteria
2021-01-19, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.0c03408
PMID:33301291
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研究论文 | 本文介绍了一种高吞吐量、无标记的方法，用于在纳升液滴中检测未修饰的革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌的细胞密度 | 该方法利用纳升液滴中散射光的快速测量，实现了对细菌增殖的可靠检测，无需基因改造或添加化学代谢标记 | NA | 开发一种高吞吐量、无标记的细菌检测方法，以促进微流控液滴技术在分析微生物学中的广泛应用 | 革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌 | 分析生物学 | NA | 微流控液滴技术 | NA | 散射光信号 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2734 | 2024-08-09 |
A microfluidics-based stem cell model of early post-implantation human development
2021-01, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-020-00417-w
PMID:33311712
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研究论文 | 本文详细介绍了设计和实现一种基于微流控技术的设备，用于模拟人类胚胎植入后早期发育过程 | 该研究开发了一种微流控设备，能够模拟人类胚胎植入后早期的分子和细胞特征，这在技术上是一个创新 | NA | 研究目的是为不孕症和毒理学研究提供一个合适的人类胚胎发育模型 | 研究对象是人类多能干细胞（hPSCs）及其在微流控设备中的发育过程 | 生物技术 | 不孕症 | 微流控技术 | 微流控人类胚胎模型 | 细胞 | 使用人类多能干细胞（hPSCs）进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 2735 | 2024-08-09 |
Coupled co-clustering-based unsupervised transfer learning for the integrative analysis of single-cell genomic data
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa347
PMID:33279962
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研究论文 | 本文提出了一种基于耦合协同聚类的无监督迁移学习算法（coupleCoC），用于多模态单细胞基因组数据的整合分析 | coupleCoC算法基于信息理论的协同聚类框架，能够同时对细胞和基因组特征进行聚类，减少单细胞数据的噪声，并促进单细胞数据集之间的知识转移 | NA | 开发一种新的无监督迁移学习算法，用于整合分析多模态单细胞基因组数据 | 多模态单细胞基因组数据，包括单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞ATAC测序（scATAC-seq）和单细胞甲基化数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞ATAC测序（scATAC-seq）、单细胞甲基化数据 | 协同聚类 | 基因组数据 | 涉及多种单细胞基因组数据集，包括scATAC-seq和scRNA-seq数据、单细胞甲基化和scRNA-seq数据以及来自小鼠和人类的scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2736 | 2024-08-09 |
FEATS: feature selection-based clustering of single-cell RNA-seq data
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa306
PMID:33285568
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研究论文 | 本文介绍了一种基于特征选择的单细胞RNA测序数据聚类工具FEATS | FEATS采用单变量特征选择方法进行聚类，通过选择最具有信息量的特征来提高聚类性能 | NA | 提高单细胞RNA测序数据分析的准确性和效率 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多种单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2737 | 2024-08-09 |
Stem cell-intrinsic mechanisms regulating adult hair follicle homeostasis
2021-04, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.14251
PMID:33278851
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研究论文 | 本文聚焦于成体毛囊干细胞（HFSCs）内在机制在毛囊稳态中的调节作用 | 讨论了单细胞RNA测序和活体成像等技术进步，揭示了HFSC及其前体细胞的异质性，并增进了对HFSC与微环境间交流的理解 | NA | 探讨HFSC内在机制在成体皮肤稳态中的作用 | 成体毛囊干细胞及其在毛发生长和皮肤伤口愈合中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序，活体成像 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2738 | 2024-08-09 |
Melatonin improves the effect of cryopreservation on human oocytes by suppressing oxidative stress and maintaining the permeability of the oolemma
2021-Mar, Journal of pineal research
IF:8.3Q1
DOI:10.1111/jpi.12707
PMID:33274466
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research paper | 本研究探讨了褪黑素（MLT）通过抑制氧化应激和维持卵母细胞膜通透性来改善人类卵子冷冻保存效果的作用 | 首次报道了褪黑素在人类卵子冷冻保存中的应用，通过抑制氧化应激和维持卵母细胞膜通透性来提高卵子的发育能力 | 研究仅限于体外成熟的卵子，未涉及体内环境的影响 | 研究褪黑素对人类卵子冷冻保存效果的影响 | 体外成熟的卵子 | NA | NA | 荧光染色、单细胞RNA测序、免疫荧光 | NA | 卵子 | 随机分为新鲜组、MLT处理冷冻保存组（MC组）和无MLT处理冷冻保存组（NC组），每组包含10 μM、100 μM、1 mM和10 mM的MLT处理子组 | NA | NA | NA | NA |
| 2739 | 2024-08-09 |
Similarities between bovine and human germline development revealed by single-cell RNA sequencing
2021-03, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-20-0313
PMID:33275120
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、定量实时PCR和免疫荧光分析，研究了牛和人类原始生殖细胞在生殖腺发育初期的分子特征 | 揭示了牛和人类原始生殖细胞在基因表达和分化模式上的相似性 | NA | 评估牛原始生殖细胞在生殖腺发育初期的分子特征 | 牛和人类的原始生殖细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 40至90天胎龄的牛胎儿生殖腺 | NA | NA | NA | NA |
| 2740 | 2024-08-09 |
Highly sensitive spatial transcriptomics at near-cellular resolution with Slide-seqV2
2021-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0739-1
PMID:33288904
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研究论文 | 本文介绍了Slide-seqV2技术，该技术通过改进文库生成、珠子合成和阵列索引，实现了接近单细胞分辨率的高灵敏度空间转录组学分析 | Slide-seqV2的RNA捕获效率提高了约50%，接近基于液滴的单细胞RNA-seq技术的检测效率 | NA | 旨在提高空间转录组学技术的灵敏度和分辨率，以更好地理解组织形成和功能 | 研究对象包括小鼠海马体中的神经元和新生小鼠大脑皮层的时空发育 | 空间转录组学 | NA | Slide-seqV2 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠海马体和新生小鼠大脑皮层的样本 | NA | NA | NA | NA |