单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 2701 - 2720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2701 | 2024-08-09 |
Maternal immune activation in mice disrupts proteostasis in the fetal brain
2021-02, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-020-00762-9
PMID:33361822
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了母体免疫激活对小鼠胎儿大脑蛋白质稳态的影响 | 首次揭示了母体免疫激活通过激活整合应激反应在雄性后代中引发神经发育障碍的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型，且未探讨雌性后代中未观察到相同效应的原因 | 探讨母体感染和炎症导致后代神经发育障碍的分子机制 | 小鼠胎儿大脑在母体免疫激活后的转录变化 | NA | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2702 | 2024-08-09 |
STING agonist promotes CAR T cell trafficking and persistence in breast cancer
2021-02-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20200844
PMID:33382402
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研究论文 | 本研究通过使用STING激动剂DMXAA或cGAMP增强CAR T细胞在乳腺癌中的活性和持久性 | 开发了新的方法来增强CAR T细胞在实体瘤中的治疗效果，特别是在乳腺癌中 | 持续的肿瘤消退仅在使用STING激动剂的同时添加anti-PD-1和anti-GR-1 mAb时实现 | 增强CAR T细胞在实体瘤中的渗透和持久性 | CAR T细胞在乳腺癌中的活性和持久性 | 免疫疗法 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 2703 | 2024-08-09 |
Allele-specific expression: applications in cancer and technical considerations
2021-02, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2020.10.007
PMID:33383480
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综述 | 本文综述了等位基因特异性表达在癌症易感性和进展中的普遍存在现象，并强调了实验设计和计算分析在准确量化等位基因表达和避免假阳性中的重要性 | NA | NA | 探讨等位基因特异性表达在癌症研究中的应用及技术考虑 | 等位基因特异性基因表达及其在癌症中的作用 | NA | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2704 | 2024-08-09 |
Neurological Manifestations of COVID-19 Feature T Cell Exhaustion and Dedifferentiated Monocytes in Cerebrospinal Fluid
2021-01-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.12.011
PMID:33382973
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研究论文 | 研究COVID-19患者的神经后遗症，特别是通过单细胞测序分析脑脊液中的免疫细胞特征 | 首次详细描述了COVID-19患者脑脊液中分化程度降低的单核细胞和耗竭的CD4 T细胞的扩增 | 研究仅限于特定的患者群体，可能无法完全代表所有COVID-19患者的神经后遗症情况 | 探究COVID-19患者神经后遗症的病因 | COVID-19患者的脑脊液免疫细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | 免疫细胞数据 | 涉及COVID-19患者与其他神经系统疾病患者的脑脊液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2705 | 2024-08-09 |
Cell-Type-Specific Immune Dysregulation in Severely Ill COVID-19 Patients
2021-01-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108590
PMID:33357411
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了健康个体和不同程度COVID-19患者的外周血单个核细胞的转录组，揭示了ARDS患者中免疫调节失调的细胞类型特异性特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了COVID-19患者中ARDS相关的免疫失调机制 | 样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探究COVID-19患者中ARDS相关的免疫失调机制 | 健康个体和不同程度COVID-19患者的外周血单个核细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康个体3例，中度COVID-19患者5例，ARDS患者6例，恢复期ARDS患者6例 | NA | NA | NA | NA |
| 2706 | 2024-08-09 |
QRICH1 dictates the outcome of ER stress through transcriptional control of proteostasis
2021-01-01, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abb6896
PMID:33384352
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和基因组规模的CRISPR筛选，研究了QRICH1在ER应激反应中的作用及其对细胞命运的影响 | 首次揭示了QRICH1作为PERK-eIF2α轴的关键效应因子，调控ER应激下的转录程序 | NA | 探讨QRICH1在ER应激反应中的功能及其对细胞命运的影响 | QRICH1在ER应激反应中的作用 | NA | 炎症病理 | 单细胞RNA测序, CRISPR筛选 | NA | RNA | 小鼠肠道上皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2707 | 2024-08-09 |
Cannabinoid Receptor Activation on Haematopoietic Cells and Enterocytes Protects against Colitis
2021-Jun-22, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaa253
PMID:33331878
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研究论文 | 研究了大麻素受体激活在造血细胞和肠上皮细胞中对结肠炎的保护作用 | 首次探讨了大麻素受体激活对结肠炎的保护作用中微生物组、代谢组以及造血和非造血细胞各自贡献的角色 | 研究主要集中在实验模型和动物实验上，尚未在人类群体中进行验证 | 探讨大麻素受体激活在减轻炎症性肠病中的作用及其机制 | C57BL/6雌性小鼠在化学诱导的结肠炎模型中的反应 | NA | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序和qRT-PCR | NA | RNA | C57BL/6雌性小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 2708 | 2024-08-09 |
CRISPR Screening of CAR T Cells and Cancer Stem Cells Reveals Critical Dependencies for Cell-Based Therapies
2021-05, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-20-1243
PMID:33328215
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研究论文 | 本文通过全基因组CRISPR筛选技术，研究了CAR T细胞和胶质母细胞瘤干细胞（GSC）中影响CAR介导的肿瘤杀伤的关键分子决定因素 | 通过相互CRISPR筛选，识别了CAR T细胞和肿瘤细胞中调控CAR T细胞细胞毒性的基因，为增强CAR T细胞的抗肿瘤疗效提供了分子靶向策略 | NA | 探索增强CAR T细胞疗法对胶质母细胞瘤疗效的方法 | CAR T细胞和胶质母细胞瘤干细胞（GSC） | 免疫疗法 | 胶质母细胞瘤 | CRISPR筛选 | NA | 基因组数据 | 患者来源的GSCs和编辑的CAR T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2709 | 2024-08-09 |
Decoding Human Megakaryocyte Development
2021-03-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.11.006
PMID:33340451
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了人类胚胎卵黄囊和胎肝中的巨核细胞发育过程 | 首次详细描述了早期巨核细胞的转录组、细胞异质性和发育轨迹，并发现了一种具有免疫反应相关基因高表达的CD42bCD14巨核细胞亚群 | NA | 揭示早期人类巨核细胞发育的分子和细胞机制 | 人类胚胎卵黄囊和胎肝中的巨核细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自胚胎卵黄囊和胎肝的巨核细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2710 | 2024-08-09 |
Single-cell profiles of human bone marrow-derived mesenchymal stromal cells after IFN-γ and TNF-α licensing
2021-Mar-01, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2020.145347
PMID:33333228
|
研究论文 | 研究分析了IFN-γ和TNF-α预处理后的人骨髓来源间充质干细胞的单细胞表达谱 | 首次在单细胞分辨率下展示了未经和经过IFN-γ和TNF-α预处理的间充质干细胞在细胞周期、干性、分化潜能和免疫调节能力方面的表达谱 | 细胞异质性限制了对炎症预处理效应的全面理解 | 探讨IFN-γ和TNF-α预处理对间充质干细胞免疫命运和免疫调节能力的影响 | 人骨髓来源的间充质干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了公开的Gene Expression Omnibus数据库中的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2711 | 2024-08-09 |
Novel biomarkers of intervertebral disc cells and evidence of stem cells in the intervertebral disc
2021-03, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2020.12.005
PMID:33338640
|
研究论文 | 本研究使用10X Genomics技术分析了野生型大鼠椎间盘的单细胞转录组，识别了新的椎间盘细胞基因标记，并提供了椎间盘细胞的单细胞基因表达图谱 | 本研究首次在单细胞水平上提供了椎间盘细胞的表型和标记基因，并提出了新的标记基因，包括多能干细胞（MSC）标记基因 | NA | 旨在深入了解健康成熟椎间盘细胞的标记基因和细胞表型 | 大鼠椎间盘细胞及其异质性细胞群 | 数字病理学 | NA | 10X Genomics技术 | NA | 单细胞转录组 | 13,578个单细胞转录本 | NA | NA | NA | NA |
| 2712 | 2024-08-09 |
Mesenchymal Niches for Digestive Organ Development, Homeostasis, and Disease
2021-03, Trends in cell biology
IF:13.0Q1
DOI:10.1016/j.tcb.2020.11.010
PMID:33349527
|
研究论文 | 本文探讨了间质细胞在消化器官发育、稳态及疾病中的作用 | 利用单细胞转录组学和多组学分析，揭示了间质细胞的异质性及其在器官发育和疾病中的调控机制 | NA | 研究间质细胞在消化器官发育和疾病中的作用及其调控机制 | 消化器官的间质细胞及其在器官发育和疾病中的作用 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2713 | 2024-08-09 |
Microbial single-cell RNA sequencing by split-pool barcoding
2021-02-19, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aba5257
PMID:33335020
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为microSPLiT的高通量单细胞RNA测序方法，用于分析革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌的转录状态 | microSPLiT方法能够解析细菌中异质的转录状态，并为无法进行单细胞分析的自然微生物群落提供高通量基因表达分析 | NA | 开发一种适用于细菌的高通量单细胞RNA测序方法 | 革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌的转录状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过25,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2714 | 2024-08-09 |
Systemic transcriptome comparison between early- And late-onset pre-eclampsia shows distinct pathology and novel biomarkers
2021-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.12968
PMID:33332660
|
研究论文 | 本研究通过比较早期和晚期发作的先兆子痫的系统转录组，揭示了其不同的病理机制并发现了新的生物标志物 | 本研究首次系统比较了早期和晚期发作的先兆子痫的胎盘和外周血转录组，并结合单细胞转录组学，发现了新的特定生物标志物 | NA | 旨在揭示早期和晚期发作的先兆子痫之间的差异，并识别新的生物标志物 | 早期和晚期发作的先兆子痫的胎盘和外周血转录组 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用患者血液样本进行实验验证 | NA | NA | NA | NA |
| 2715 | 2024-08-09 |
Hepatobiliary acid-base homeostasis: Insights from analogous secretory epithelia
2021-02, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2020.10.010
PMID:33342564
|
综述 | 本文综述了从类似分泌上皮中获得的关于肝胆酸碱稳态的见解 | 利用公开的单细胞RNA测序数据集分析了人类胆管细胞的表达，提供了关于pH稳态及其在胆道系统中失调的分子基础的见解 | NA | 探讨在类似分泌上皮中发现的保守原则，并结合当前对胆管细胞生理学的认识 | 肝胆酸碱稳态及其在类似分泌上皮中的机制 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2716 | 2024-08-09 |
MS4A1 expression and function in T cells in the colorectal cancer tumor microenvironment
2021-02, Cellular immunology
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cellimm.2020.104260
PMID:33352466
|
研究论文 | 本文研究了MS4A1基因在结直肠癌肿瘤微环境中T细胞的表达和功能 | 首次报道MS4A1基因在结直肠癌中的表达与患者生存率正相关，并发现CD8CD20 T细胞亚群在肿瘤微环境中的作用 | NA | 探讨MS4A1基因在结直肠癌免疫治疗中的作用机制 | MS4A1基因在结直肠癌中的表达及其对T细胞功能的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-Seq | NA | RNA序列 | 来自公共数据库的scRNA-Seq数据集及已发表的nivolumab治疗数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2717 | 2024-08-09 |
PD-1 blockade restores helper activity of tumor-infiltrating, exhausted PD-1hiCD39+ CD4 T cells
2021-01-25, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.142513
PMID:33332284
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研究论文 | 本文通过表型、转录组和功能方法研究了头颈、宫颈和卵巢癌患者的CD4 T细胞耗竭情况，并探讨了PD-1阻断对这些细胞辅助活性的恢复作用 | 首次详细描述了CD4 T细胞在肿瘤微环境中的耗竭状态，并证明了PD-1阻断可以恢复其辅助活性 | NA | 研究CD4 T细胞在肿瘤微环境中的耗竭状态及其对免疫检查点阻断的响应 | 头颈、宫颈和卵巢癌患者的CD4 T细胞 | 免疫学 | 头颈癌、宫颈癌、卵巢癌 | scRNA-Seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2718 | 2024-08-09 |
The autotaxin-lysophosphatidic acid pathway mediates mesenchymal cell recruitment and fibrotic contraction in lung transplant fibrosis
2021-01, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2020.10.005
PMID:33339555
|
研究论文 | 本文研究了自噬素-溶血磷脂酸途径在肺移植纤维化中的间充质细胞招募和纤维化收缩的作用 | 首次展示了肺移植受者BAL液对人类肺组织衍生MSC的强烈趋化作用，并诱导收缩表型，通过LPA阻断完全消除了BAL介导的MSC趋化和胶原凝胶收缩 | NA | 识别诱导肺组织间充质干细胞迁移和收缩分化的介质 | 肺移植受者的间充质干细胞和肺移植纤维化机制 | NA | 肺纤维化 | 酶联免疫吸附试验，液相色谱-串联质谱法，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 7名健康对照和21名肺移植受者的BAL液，7名健康对照和31名肺移植受者的BAL液，1名CLAD肺移植受者的BAL细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2719 | 2024-08-09 |
Circulating tumor cell detection and single-cell analysis using an integrated workflow based on ChimeraX® -i120 Platform: A prospective study
2021-09, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.12876
PMID:33301640
|
研究论文 | 本文开发了一种基于ChimeraX -i120平台的综合工作流程，用于循环肿瘤细胞（CTC）的检测和单细胞分子分析，并通过477名参与者的前瞻性研究验证了其临床可行性。 | 该研究首次整合了CTC检测和单细胞分子分析，使用ChimeraX -i120平台进行负富集、免疫荧光标记和基于机器学习的CTC识别，具有高灵敏度、准确性和可重复性。 | NA | 开发和验证一种新的综合工作流程，用于非侵入性临床癌症管理中的循环肿瘤细胞检测和单细胞分子分析。 | 循环肿瘤细胞（CTC）的检测和单细胞分子分析，以及其在临床癌症管理中的应用。 | 数字病理学 | 肝癌、胆管癌、乳腺癌、结直肠癌、肺癌 | 免疫荧光标记、机器学习 | 机器学习模型 | 单细胞测序数据 | 477名参与者 | NA | NA | NA | NA |
| 2720 | 2024-08-09 |
scGMAI: a Gaussian mixture model for clustering single-cell RNA-Seq data based on deep autoencoder
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa316
PMID:33300547
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研究论文 | 提出了一种基于自动编码器和高斯混合模型的单细胞RNA测序数据聚类方法scGMAI | scGMAI结合了自动编码器网络和快速独立成分分析(FastICA)，在17个公共单细胞RNA测序数据集上优于现有工具，如Seurat | NA | 开发一种有效的单细胞RNA测序数据聚类和细胞类型识别工具 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | 高斯混合模型 | 基因表达数据 | 17个公共单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |