单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 2701 - 2720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2701 | 2024-08-09 |
Differences in TCR repertoire and T cell activation underlie the divergent outcomes of antitumor immune responses in tumor-eradicating versus tumor-progressing hosts
2021-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2020-001615
PMID:33414263
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研究论文 | 本文开发了一种独特的HNSCC小鼠模型，通过单细胞TCR测序和单细胞RNA测序，研究了TCR谱和T细胞活化状态在肿瘤清除与肿瘤进展宿主中的差异，揭示了异质性抗肿瘤免疫反应的潜在机制。 | 首次通过单细胞TCR测序和单细胞RNA测序技术，揭示了TCR谱和T细胞活化状态在不同宿主抗肿瘤免疫反应中的差异。 | NA | 研究抗肿瘤免疫反应在不同宿主中的异质性机制，为个性化癌症免疫治疗提供理论基础。 | HNSCC小鼠模型中的TCR谱和T细胞活化状态。 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞TCR测序，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 100%的受体小鼠中肿瘤初始生长，约25%的小鼠无干预下肿瘤清除 | NA | NA | NA | NA |
| 2702 | 2024-08-09 |
Improving gene network inference with graph wavelets and making insights about ageing-associated regulatory changes in lungs
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa360
PMID:33381809
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研究论文 | 本文提出了一种使用图小波滤波器的方法，用于改进基于基因网络（GWNet）的转录组分析，特别是在单细胞表达谱中提高基因网络推断的性能和一致性 | 本文创新性地使用了图小波滤波器来改进基因网络推断方法，特别是在处理含有批次效应的稀疏单细胞表达谱时，提高了预测基因调控网络的一致性 | NA | 旨在改进基因网络推断方法，并探索肺部细胞老化相关的调控变化 | 单细胞转录组表达谱和基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 图小波滤波器 | 基因网络（GWNet） | 单细胞转录组表达谱 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2703 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis reveals that maternal obesity affects DNA repair, histone methylation, and autophagy level in mouse embryos
2021-07, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.30201
PMID:33368268
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA转录组测序技术，探讨了母体肥胖对小鼠胚胎发育的影响及其潜在机制 | 首次揭示了母体肥胖通过影响DNA修复、组蛋白甲基化和自噬水平，从而影响小鼠胚胎早期发育 | 研究仅限于小鼠模型，未来需在人类胚胎中验证这些发现 | 探究母体肥胖对小鼠胚胎发育的影响及其分子机制 | 小鼠胚胎在母体肥胖条件下的发育情况 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA转录组测序 | NA | 转录组数据 | 涉及肥胖小鼠的2细胞胚胎及其他发育阶段的胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 2704 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing in vision research: Insights into human retinal health and disease
2021-07, Progress in retinal and eye research
IF:18.6Q1
DOI:10.1016/j.preteyeres.2020.100934
PMID:33383180
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在视觉研究中的应用，特别是在人类视网膜健康和疾病研究中的进展 | 单细胞RNA测序技术提供了前所未有的信息分辨率，能够将RNA映射到单个细胞，从而促进视网膜和脉络膜细胞类型的分组和进一步研究 | NA | 总结单细胞RNA测序在视觉研究领域的应用，并探讨其在视网膜疾病研究中的未来方向 | 视网膜、视网膜色素上皮、脉络膜以及视网膜类器官的生物学特性 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及动物模型、视网膜类器官和人类原代视网膜、视网膜色素上皮及脉络膜样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2705 | 2024-08-09 |
Niche-specific functional heterogeneity of intestinal resident macrophages
2021-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2020-323121
PMID:33384336
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综述 | 本文综述了肠道常驻巨噬细胞在黏膜屏障中的特定功能异质性 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了肠道各部位常驻巨噬细胞的功能特化，增进了对这些细胞异质性和潜在生物学功能的理解 | NA | 整合新发现与现有知识，更新对胃肠道巨噬细胞功能的理解，并推测特定亚群在稳态和疾病中的作用 | 肠道常驻巨噬细胞的功能特化和生物学作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2706 | 2024-08-09 |
Hypertension delays viral clearance and exacerbates airway hyperinflammation in patients with COVID-19
2021-06, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-00796-1
PMID:33361824
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研究论文 | 研究探讨了高血压对COVID-19患者病毒清除和气道过度炎症的影响，以及ACEI和ARB治疗的效果 | 首次结合临床数据和单细胞测序数据，探讨高血压患者在COVID-19中的免疫细胞炎症倾向及其与治疗药物的关系 | 研究样本量有限，无法确定临床疗效 | 探究高血压对COVID-19患者病情进展的影响及抗高血压药物的治疗效果 | COVID-19患者中的高血压患者及其免疫细胞 | NA | 高血压 | 单细胞测序 | NA | 临床数据 | 144名临床数据样本和48个气道样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2707 | 2024-08-09 |
scLM: Automatic Detection of Consensus Gene Clusters Across Multiple Single-cell Datasets
2021-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.09.002
PMID:33359676
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scLM的单细胞隐变量模型算法，用于在多个单细胞数据集中自动检测共识基因簇 | scLM算法能够同时对多个单细胞数据集进行共识聚类，提高了检测基因簇的准确性，并能有效避免批次效应的影响 | NA | 开发一种新的算法来提高单细胞RNA测序数据中基因共表达聚类的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的基因共表达簇 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 隐变量模型 | 单细胞数据 | 多个单细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2708 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals a Heterogeneous Cellular Response to BK Virus Infection
2021-02-24, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/JVI.02237-20
PMID:33361432
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了BK病毒感染后细胞的异质性反应 | 首次通过单细胞转录组学揭示了BK病毒感染后细胞的异质性反应，并发现了先前未被识别的被BK病毒下调的通路 | 研究主要集中在体外培养的肾近端小管上皮细胞，可能与体内实际情况存在差异 | 探究BK病毒感染后细胞的异质性反应及其对细胞基因表达模式的影响 | BK病毒感染的肾近端小管上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 数千个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2709 | 2024-08-09 |
Cross-Comparison of Human iPSC Motor Neuron Models of Familial and Sporadic ALS Reveals Early and Convergent Transcriptomic Disease Signatures
2021-02-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2020.10.010
PMID:33382996
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，研究了来自健康、家族性和散发性肌萎缩侧索硬化症（ALS）患者的诱导多能干细胞（iPSC）衍生的运动神经元（MNs），以识别统一的、可重复的ALS特征 | 本文采用单细胞RNA测序技术，通过多次分化和跨平台分析，考虑了遗传和实验变异性，以识别早期、汇聚和运动神经元解析的ALS特征 | 文章指出，遗传和实验变异性限制了iPSC衍生神经培养物的实用性，影响可重复性和追踪发病机制的细胞起源 | 研究目的是通过iPSC衍生的神经培养物模型，识别肌萎缩侧索硬化症（ALS）的早期和汇聚的转录组疾病特征 | 研究对象包括健康、家族性和散发性ALS患者的iPSC衍生的运动神经元 | 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及多个患者的iPSC衍生的运动神经元 | NA | NA | NA | NA |
| 2710 | 2024-08-09 |
Cetuximab enhances the anti-tumor function of macrophages in an IL-6 dependent manner
2021-Feb-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2020.118953
PMID:33359746
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研究论文 | 本研究探讨了西妥昔单抗通过抑制EGFR/IL-6通路抑制肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的促肿瘤功能 | 发现西妥昔单抗通过抑制IL-6表达，将TAMs从M2样表型转变为M1样表型，从而减轻肿瘤负担 | NA | 研究西妥昔单抗对肿瘤微环境的影响及其分子机制 | 肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）和结直肠癌（CRC）患者 | NA | 结直肠癌 | 流式细胞术，Western blotting，RT-qPCR，ELISA | NA | scRNA-seq数据，转录组数据 | 使用AOM/DSS和肿瘤异种移植小鼠模型进行实验，分析公共CRC患者数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2711 | 2024-08-09 |
Distinct developmental pathways from blood monocytes generate human lung macrophage diversity
2021-02-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.12.003
PMID:33382972
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研究论文 | 本研究利用表达人细胞因子的转基因小鼠模型，在体内解析了人造血干细胞和祖细胞（HSPCs）向肺泡巨噬细胞的分化途径 | 本研究首次揭示了从循环单核细胞到肺泡巨噬细胞的不同发育途径，并阐明了细胞起源如何影响人巨噬细胞的身份、多样性和体内定位 | NA | 研究人巨噬细胞及其发育途径 | 人肺泡巨噬细胞的分化途径 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 三种巨噬细胞群体 | NA | NA | NA | NA |
| 2712 | 2024-08-09 |
Maternal immune activation in mice disrupts proteostasis in the fetal brain
2021-02, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-020-00762-9
PMID:33361822
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了母体免疫激活对小鼠胎儿大脑蛋白质稳态的影响 | 首次揭示了母体免疫激活通过激活整合应激反应在雄性后代中引发神经发育障碍的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型，且未探讨雌性后代中未观察到相同效应的原因 | 探讨母体感染和炎症导致后代神经发育障碍的分子机制 | 小鼠胎儿大脑在母体免疫激活后的转录变化 | NA | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2713 | 2024-08-09 |
STING agonist promotes CAR T cell trafficking and persistence in breast cancer
2021-02-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20200844
PMID:33382402
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研究论文 | 本研究通过使用STING激动剂DMXAA或cGAMP增强CAR T细胞在乳腺癌中的活性和持久性 | 开发了新的方法来增强CAR T细胞在实体瘤中的治疗效果，特别是在乳腺癌中 | 持续的肿瘤消退仅在使用STING激动剂的同时添加anti-PD-1和anti-GR-1 mAb时实现 | 增强CAR T细胞在实体瘤中的渗透和持久性 | CAR T细胞在乳腺癌中的活性和持久性 | 免疫疗法 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 2714 | 2024-08-09 |
Allele-specific expression: applications in cancer and technical considerations
2021-02, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2020.10.007
PMID:33383480
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综述 | 本文综述了等位基因特异性表达在癌症易感性和进展中的普遍存在现象，并强调了实验设计和计算分析在准确量化等位基因表达和避免假阳性中的重要性 | NA | NA | 探讨等位基因特异性表达在癌症研究中的应用及技术考虑 | 等位基因特异性基因表达及其在癌症中的作用 | NA | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2715 | 2024-08-09 |
QRICH1 dictates the outcome of ER stress through transcriptional control of proteostasis
2021-01-01, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abb6896
PMID:33384352
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和基因组规模的CRISPR筛选，研究了QRICH1在ER应激反应中的作用及其对细胞命运的影响 | 首次揭示了QRICH1作为PERK-eIF2α轴的关键效应因子，调控ER应激下的转录程序 | NA | 探讨QRICH1在ER应激反应中的功能及其对细胞命运的影响 | QRICH1在ER应激反应中的作用 | NA | 炎症病理 | 单细胞RNA测序, CRISPR筛选 | NA | RNA | 小鼠肠道上皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2716 | 2024-08-09 |
CRISPR Screening of CAR T Cells and Cancer Stem Cells Reveals Critical Dependencies for Cell-Based Therapies
2021-05, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-20-1243
PMID:33328215
|
研究论文 | 本文通过全基因组CRISPR筛选技术，研究了CAR T细胞和胶质母细胞瘤干细胞（GSC）中影响CAR介导的肿瘤杀伤的关键分子决定因素 | 通过相互CRISPR筛选，识别了CAR T细胞和肿瘤细胞中调控CAR T细胞细胞毒性的基因，为增强CAR T细胞的抗肿瘤疗效提供了分子靶向策略 | NA | 探索增强CAR T细胞疗法对胶质母细胞瘤疗效的方法 | CAR T细胞和胶质母细胞瘤干细胞（GSC） | 免疫疗法 | 胶质母细胞瘤 | CRISPR筛选 | NA | 基因组数据 | 患者来源的GSCs和编辑的CAR T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2717 | 2024-08-09 |
Decoding Human Megakaryocyte Development
2021-03-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.11.006
PMID:33340451
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了人类胚胎卵黄囊和胎肝中的巨核细胞发育过程 | 首次详细描述了早期巨核细胞的转录组、细胞异质性和发育轨迹，并发现了一种具有免疫反应相关基因高表达的CD42bCD14巨核细胞亚群 | NA | 揭示早期人类巨核细胞发育的分子和细胞机制 | 人类胚胎卵黄囊和胎肝中的巨核细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自胚胎卵黄囊和胎肝的巨核细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2718 | 2024-08-09 |
Single-cell profiles of human bone marrow-derived mesenchymal stromal cells after IFN-γ and TNF-α licensing
2021-Mar-01, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2020.145347
PMID:33333228
|
研究论文 | 研究分析了IFN-γ和TNF-α预处理后的人骨髓来源间充质干细胞的单细胞表达谱 | 首次在单细胞分辨率下展示了未经和经过IFN-γ和TNF-α预处理的间充质干细胞在细胞周期、干性、分化潜能和免疫调节能力方面的表达谱 | 细胞异质性限制了对炎症预处理效应的全面理解 | 探讨IFN-γ和TNF-α预处理对间充质干细胞免疫命运和免疫调节能力的影响 | 人骨髓来源的间充质干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了公开的Gene Expression Omnibus数据库中的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2719 | 2024-08-09 |
Novel biomarkers of intervertebral disc cells and evidence of stem cells in the intervertebral disc
2021-03, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2020.12.005
PMID:33338640
|
研究论文 | 本研究使用10X Genomics技术分析了野生型大鼠椎间盘的单细胞转录组，识别了新的椎间盘细胞基因标记，并提供了椎间盘细胞的单细胞基因表达图谱 | 本研究首次在单细胞水平上提供了椎间盘细胞的表型和标记基因，并提出了新的标记基因，包括多能干细胞（MSC）标记基因 | NA | 旨在深入了解健康成熟椎间盘细胞的标记基因和细胞表型 | 大鼠椎间盘细胞及其异质性细胞群 | 数字病理学 | NA | 10X Genomics技术 | NA | 单细胞转录组 | 13,578个单细胞转录本 | NA | NA | NA | NA |
| 2720 | 2024-08-09 |
Mesenchymal Niches for Digestive Organ Development, Homeostasis, and Disease
2021-03, Trends in cell biology
IF:13.0Q1
DOI:10.1016/j.tcb.2020.11.010
PMID:33349527
|
研究论文 | 本文探讨了间质细胞在消化器官发育、稳态及疾病中的作用 | 利用单细胞转录组学和多组学分析，揭示了间质细胞的异质性及其在器官发育和疾病中的调控机制 | NA | 研究间质细胞在消化器官发育和疾病中的作用及其调控机制 | 消化器官的间质细胞及其在器官发育和疾病中的作用 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |