单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
2681	2024-08-09	Cross-Comparison of Human iPSC Motor Neuron Models of Familial and Sporadic ALS Reveals Early and Convergent Transcriptomic Disease Signatures 2021-02-17, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2020.10.010 PMID:33382996	研究论文	本文通过单细胞RNA测序分析，研究了来自健康、家族性和散发性肌萎缩侧索硬化症（ALS）患者的诱导多能干细胞（iPSC）衍生的运动神经元（MNs），以识别统一的、可重复的ALS特征	本文采用单细胞RNA测序技术，通过多次分化和跨平台分析，考虑了遗传和实验变异性，以识别早期、汇聚和运动神经元解析的ALS特征	文章指出，遗传和实验变异性限制了iPSC衍生神经培养物的实用性，影响可重复性和追踪发病机制的细胞起源	研究目的是通过iPSC衍生的神经培养物模型，识别肌萎缩侧索硬化症（ALS）的早期和汇聚的转录组疾病特征	研究对象包括健康、家族性和散发性ALS患者的iPSC衍生的运动神经元	数字病理学	肌萎缩侧索硬化症	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	涉及多个患者的iPSC衍生的运动神经元
2682	2024-08-09	Cetuximab enhances the anti-tumor function of macrophages in an IL-6 dependent manner 2021-Feb-15, Life sciences IF:5.2Q1 DOI:10.1016/j.lfs.2020.118953 PMID:33359746	研究论文	本研究探讨了西妥昔单抗通过抑制EGFR/IL-6通路抑制肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的促肿瘤功能	发现西妥昔单抗通过抑制IL-6表达，将TAMs从M2样表型转变为M1样表型，从而减轻肿瘤负担	NA	研究西妥昔单抗对肿瘤微环境的影响及其分子机制	肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）和结直肠癌（CRC）患者	NA	结直肠癌	流式细胞术，Western blotting，RT-qPCR，ELISA	NA	scRNA-seq数据，转录组数据	使用AOM/DSS和肿瘤异种移植小鼠模型进行实验，分析公共CRC患者数据集
2683	2024-08-09	Distinct developmental pathways from blood monocytes generate human lung macrophage diversity 2021-02-09, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2020.12.003 PMID:33382972	研究论文	本研究利用表达人细胞因子的转基因小鼠模型，在体内解析了人造血干细胞和祖细胞（HSPCs）向肺泡巨噬细胞的分化途径	本研究首次揭示了从循环单核细胞到肺泡巨噬细胞的不同发育途径，并阐明了细胞起源如何影响人巨噬细胞的身份、多样性和体内定位	NA	研究人巨噬细胞及其发育途径	人肺泡巨噬细胞的分化途径	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	细胞	三种巨噬细胞群体
2684	2024-08-09	Maternal immune activation in mice disrupts proteostasis in the fetal brain 2021-02, Nature neuroscience IF:21.2Q1 DOI:10.1038/s41593-020-00762-9 PMID:33361822	研究论文	本文利用单细胞RNA测序技术研究了母体免疫激活对小鼠胎儿大脑蛋白质稳态的影响	首次揭示了母体免疫激活通过激活整合应激反应在雄性后代中引发神经发育障碍的分子机制	研究仅限于小鼠模型，且未探讨雌性后代中未观察到相同效应的原因	探讨母体感染和炎症导致后代神经发育障碍的分子机制	小鼠胎儿大脑在母体免疫激活后的转录变化	NA	神经发育障碍	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
2685	2024-08-09	STING agonist promotes CAR T cell trafficking and persistence in breast cancer 2021-02-01, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1 DOI:10.1084/jem.20200844 PMID:33382402	研究论文	本研究通过使用STING激动剂DMXAA或cGAMP增强CAR T细胞在乳腺癌中的活性和持久性	开发了新的方法来增强CAR T细胞在实体瘤中的治疗效果，特别是在乳腺癌中	持续的肿瘤消退仅在使用STING激动剂的同时添加anti-PD-1和anti-GR-1 mAb时实现	增强CAR T细胞在实体瘤中的渗透和持久性	CAR T细胞在乳腺癌中的活性和持久性	免疫疗法	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	具体样本数量未在摘要中提及
2686	2024-08-09	Allele-specific expression: applications in cancer and technical considerations 2021-02, Current opinion in genetics & development IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.gde.2020.10.007 PMID:33383480	综述	本文综述了等位基因特异性表达在癌症易感性和进展中的普遍存在现象，并强调了实验设计和计算分析在准确量化等位基因表达和避免假阳性中的重要性	NA	NA	探讨等位基因特异性表达在癌症研究中的应用及技术考虑	等位基因特异性基因表达及其在癌症中的作用	NA	癌症	NA	NA	NA	NA
2687	2024-08-09	Neurological Manifestations of COVID-19 Feature T Cell Exhaustion and Dedifferentiated Monocytes in Cerebrospinal Fluid 2021-01-12, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2020.12.011 PMID:33382973	研究论文	研究COVID-19患者的神经后遗症，特别是通过单细胞测序分析脑脊液中的免疫细胞特征	首次详细描述了COVID-19患者脑脊液中分化程度降低的单核细胞和耗竭的CD4 T细胞的扩增	研究仅限于特定的患者群体，可能无法完全代表所有COVID-19患者的神经后遗症情况	探究COVID-19患者神经后遗症的病因	COVID-19患者的脑脊液免疫细胞	NA	COVID-19	单细胞测序	NA	免疫细胞数据	涉及COVID-19患者与其他神经系统疾病患者的脑脊液样本
2688	2024-08-09	Cell-Type-Specific Immune Dysregulation in Severely Ill COVID-19 Patients 2021-01-05, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2020.108590 PMID:33357411	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了健康个体和不同程度COVID-19患者的外周血单个核细胞的转录组，揭示了ARDS患者中免疫调节失调的细胞类型特异性特征	首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了COVID-19患者中ARDS相关的免疫失调机制	样本量较小，可能影响结果的普遍性	探究COVID-19患者中ARDS相关的免疫失调机制	健康个体和不同程度COVID-19患者的外周血单个核细胞	NA	COVID-19	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	健康个体3例，中度COVID-19患者5例，ARDS患者6例，恢复期ARDS患者6例
2689	2024-08-09	QRICH1 dictates the outcome of ER stress through transcriptional control of proteostasis 2021-01-01, Science (New York, N.Y.) DOI:10.1126/science.abb6896 PMID:33384352	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和基因组规模的CRISPR筛选，研究了QRICH1在ER应激反应中的作用及其对细胞命运的影响	首次揭示了QRICH1作为PERK-eIF2α轴的关键效应因子，调控ER应激下的转录程序	NA	探讨QRICH1在ER应激反应中的功能及其对细胞命运的影响	QRICH1在ER应激反应中的作用	NA	炎症病理	单细胞RNA测序, CRISPR筛选	NA	RNA	小鼠肠道上皮细胞
2690	2024-08-09	Cannabinoid Receptor Activation on Haematopoietic Cells and Enterocytes Protects against Colitis 2021-Jun-22, Journal of Crohn's & colitis DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaa253 PMID:33331878	研究论文	研究了大麻素受体激活在造血细胞和肠上皮细胞中对结肠炎的保护作用	首次探讨了大麻素受体激活对结肠炎的保护作用中微生物组、代谢组以及造血和非造血细胞各自贡献的角色	研究主要集中在实验模型和动物实验上，尚未在人类群体中进行验证	探讨大麻素受体激活在减轻炎症性肠病中的作用及其机制	C57BL/6雌性小鼠在化学诱导的结肠炎模型中的反应	NA	炎症性肠病	单细胞RNA测序和qRT-PCR	NA	RNA	C57BL/6雌性小鼠
2691	2024-08-09	Acoel Single-Cell Transcriptomics: Cell Type Analysis of a Deep Branching Bilaterian 2021-05-04, Molecular biology and evolution IF:11.0Q1 DOI:10.1093/molbev/msaa333 PMID:33355655	研究论文	本研究利用单细胞转录组学技术对acoel扁虫Isodiametra pulchra进行细胞类型分析	发现了acoel扁虫中十种主要的细胞类型，并描述了大量特定类群的标记基因，表明存在特定类群的共同分子机制	NA	探索双边对称动物细胞类型的进化及其身体结构的起源	acoel扁虫Isodiametra pulchra的细胞类型	数字病理学	NA	单细胞转录组学	NA	转录组	NA
2692	2024-08-09	CRISPR Screening of CAR T Cells and Cancer Stem Cells Reveals Critical Dependencies for Cell-Based Therapies 2021-05, Cancer discovery IF:29.7Q1 DOI:10.1158/2159-8290.CD-20-1243 PMID:33328215	研究论文	本文通过全基因组CRISPR筛选技术，研究了CAR T细胞和胶质母细胞瘤干细胞（GSC）中影响CAR介导的肿瘤杀伤的关键分子决定因素	通过相互CRISPR筛选，识别了CAR T细胞和肿瘤细胞中调控CAR T细胞细胞毒性的基因，为增强CAR T细胞的抗肿瘤疗效提供了分子靶向策略	NA	探索增强CAR T细胞疗法对胶质母细胞瘤疗效的方法	CAR T细胞和胶质母细胞瘤干细胞（GSC）	免疫疗法	胶质母细胞瘤	CRISPR筛选	NA	基因组数据	患者来源的GSCs和编辑的CAR T细胞
2693	2024-08-09	Decoding Human Megakaryocyte Development 2021-03-04, Cell stem cell IF:19.8Q1 DOI:10.1016/j.stem.2020.11.006 PMID:33340451	研究论文	本文利用单细胞RNA测序技术研究了人类胚胎卵黄囊和胎肝中的巨核细胞发育过程	首次详细描述了早期巨核细胞的转录组、细胞异质性和发育轨迹，并发现了一种具有免疫反应相关基因高表达的CD42bCD14巨核细胞亚群	NA	揭示早期人类巨核细胞发育的分子和细胞机制	人类胚胎卵黄囊和胎肝中的巨核细胞	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	来自胚胎卵黄囊和胎肝的巨核细胞样本
2694	2024-08-09	Single-cell profiles of human bone marrow-derived mesenchymal stromal cells after IFN-γ and TNF-α licensing 2021-Mar-01, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2020.145347 PMID:33333228	研究论文	研究分析了IFN-γ和TNF-α预处理后的人骨髓来源间充质干细胞的单细胞表达谱	首次在单细胞分辨率下展示了未经和经过IFN-γ和TNF-α预处理的间充质干细胞在细胞周期、干性、分化潜能和免疫调节能力方面的表达谱	细胞异质性限制了对炎症预处理效应的全面理解	探讨IFN-γ和TNF-α预处理对间充质干细胞免疫命运和免疫调节能力的影响	人骨髓来源的间充质干细胞	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	使用了公开的Gene Expression Omnibus数据库中的单细胞RNA测序数据
2695	2024-08-09	Novel biomarkers of intervertebral disc cells and evidence of stem cells in the intervertebral disc 2021-03, Osteoarthritis and cartilage IF:7.2Q1 DOI:10.1016/j.joca.2020.12.005 PMID:33338640	研究论文	本研究使用10X Genomics技术分析了野生型大鼠椎间盘的单细胞转录组，识别了新的椎间盘细胞基因标记，并提供了椎间盘细胞的单细胞基因表达图谱	本研究首次在单细胞水平上提供了椎间盘细胞的表型和标记基因，并提出了新的标记基因，包括多能干细胞（MSC）标记基因	NA	旨在深入了解健康成熟椎间盘细胞的标记基因和细胞表型	大鼠椎间盘细胞及其异质性细胞群	数字病理学	NA	10X Genomics技术	NA	单细胞转录组	13,578个单细胞转录本
2696	2024-08-09	Mesenchymal Niches for Digestive Organ Development, Homeostasis, and Disease 2021-03, Trends in cell biology IF:13.0Q1 DOI:10.1016/j.tcb.2020.11.010 PMID:33349527	研究论文	本文探讨了间质细胞在消化器官发育、稳态及疾病中的作用	利用单细胞转录组学和多组学分析，揭示了间质细胞的异质性及其在器官发育和疾病中的调控机制	NA	研究间质细胞在消化器官发育和疾病中的作用及其调控机制	消化器官的间质细胞及其在器官发育和疾病中的作用	数字病理学	消化系统疾病	单细胞转录组学	NA	多组学数据	NA
2697	2024-08-09	Microbial single-cell RNA sequencing by split-pool barcoding 2021-02-19, Science (New York, N.Y.) DOI:10.1126/science.aba5257 PMID:33335020	研究论文	本文介绍了一种名为microSPLiT的高通量单细胞RNA测序方法，用于分析革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌的转录状态	microSPLiT方法能够解析细菌中异质的转录状态，并为无法进行单细胞分析的自然微生物群落提供高通量基因表达分析	NA	开发一种适用于细菌的高通量单细胞RNA测序方法	革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌的转录状态	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	超过25,000个细胞
2698	2024-08-09	Systemic transcriptome comparison between early- And late-onset pre-eclampsia shows distinct pathology and novel biomarkers 2021-Feb, Cell proliferation IF:5.9Q2 DOI:10.1111/cpr.12968 PMID:33332660	研究论文	本研究通过比较早期和晚期发作的先兆子痫的系统转录组，揭示了其不同的病理机制并发现了新的生物标志物	本研究首次系统比较了早期和晚期发作的先兆子痫的胎盘和外周血转录组，并结合单细胞转录组学，发现了新的特定生物标志物	NA	旨在揭示早期和晚期发作的先兆子痫之间的差异，并识别新的生物标志物	早期和晚期发作的先兆子痫的胎盘和外周血转录组	数字病理学	妊娠相关疾病	单细胞转录组学	NA	转录组数据	使用患者血液样本进行实验验证
2699	2024-08-09	Hepatobiliary acid-base homeostasis: Insights from analogous secretory epithelia 2021-02, Journal of hepatology IF:26.8Q1 DOI:10.1016/j.jhep.2020.10.010 PMID:33342564	综述	本文综述了从类似分泌上皮中获得的关于肝胆酸碱稳态的见解	利用公开的单细胞RNA测序数据集分析了人类胆管细胞的表达，提供了关于pH稳态及其在胆道系统中失调的分子基础的见解	NA	探讨在类似分泌上皮中发现的保守原则，并结合当前对胆管细胞生理学的认识	肝胆酸碱稳态及其在类似分泌上皮中的机制	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
2700	2024-08-09	Long-term self-renewing stem cells in the adult mouse hippocampus identified by intravital imaging 2021-02, Nature neuroscience IF:21.2Q1 DOI:10.1038/s41593-020-00759-4 PMID:33349709	研究论文	本研究通过活体成像技术，识别出在小鼠成年海马体中具有长期自我更新能力的神经干细胞（NSCs）。	首次通过活体成像技术识别出在小鼠成年海马体中具有长期自我更新能力的Gli1靶向NSCs，并比较了Gli1和Ascl1靶向细胞的转录组特征。	研究仅限于小鼠模型，且依赖于特定的基因标记技术。	旨在揭示成年小鼠海马体中神经干细胞的长期自我更新能力及其潜在机制。	研究对象为成年小鼠海马体中的神经干细胞及其子代细胞。	NA	NA	双光子显微镜、单细胞RNA测序	NA	图像、转录组数据	研究涉及多个基因标记的神经干细胞及其子代细胞。