单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 2661 - 2680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2661 | 2024-08-09 |
Targeting Lymphotoxin Beta and Paired Box 5: a potential therapeutic strategy for soft tissue sarcoma metastasis
2021-Jan-04, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-020-01632-x
PMID:33397394
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研究论文 | 本研究旨在揭示软组织肉瘤（STS）中潜在的转移机制及相关信号通路，通过分析差异表达基因和肿瘤浸润细胞 | 本研究通过RNA测序和Pearson相关性分析，构建了转移相关预测模型，并验证了LTB和PAX5的转录调控模式 | NA | 探索软组织肉瘤的转移机制及相关信号通路 | 软组织肉瘤中的差异表达基因和肿瘤浸润细胞 | 数字病理学 | 软组织肉瘤 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 261个软组织肉瘤样本 |
| 2662 | 2024-08-09 |
Molecular Mechanisms of Renal Progenitor Regulation: How Many Pieces in the Puzzle?
2021-01-02, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10010059
PMID:33401654
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综述 | 本文综述了肾脏祖细胞在维持日常稳态和损伤后内源性再生过程中的分子机制 | 探讨了单细胞RNA测序技术在肾脏祖细胞特性研究中的应用前景 | NA | 总结指导肾脏祖细胞在稳态和肾损伤后反应的分子机制 | 肾脏祖细胞及其在生理和病理条件下的再生响应 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 2663 | 2024-08-09 |
The prospects of tumor chemosensitivity testing at the single-cell level
2021-01, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2020.100741
PMID:33387814
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综述 | 本文综述了单细胞水平肿瘤化疗敏感性测试（SCC-DST）的发展及其在克服传统药物筛选方法障碍中的应用 | SCC-DST通过微流控芯片技术集成多种分析方法，提高了对个体患者药物敏感性测试的预测能力 | NA | 探讨SCC-DST如何克服传统药物筛选方法的障碍，并展望其与单细胞RNA测序和人工智能结合的可能性 | 单细胞水平肿瘤化疗敏感性测试技术及其应用 | NA | 癌症 | 微流控芯片技术 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 2664 | 2024-08-09 |
Specific MiRNAs in naïve T cells associated with Hepatitis C Virus-induced Hepatocellular Carcinoma
2021, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.49594
PMID:33391397
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研究论文 | 本研究通过结合HCV诱导的肝细胞癌（HCC）组织中的bulk mRNA和miRNA测序数据以及T细胞的单细胞RNA测序数据，探讨了T细胞与miRNAs在HCV-HCC中的关联 | 本研究利用去卷积的bulk RNA-seq数据和miRNA图谱，识别了与幼稚CD4+ T细胞相关的miRNAs，有助于阐明抗HCV免疫反应的潜在机制 | NA | 确定T细胞与miRNAs在HCV诱导的肝细胞癌（HCC）中的关联 | HCV诱导的肝细胞癌（HCC）组织中的T细胞和miRNAs | NA | 肝细胞癌 | RNA测序 | NA | mRNA和miRNA数据 | NA |
| 2665 | 2024-08-09 |
Macrophage imaging and subset analysis using single-cell RNA sequencing
2021, Nanotheranostics
DOI:10.7150/ntno.50185
PMID:33391974
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术进行巨噬细胞成像和亚群分析，以支持个性化患者治疗策略的可能性 | 介绍了纳米颗粒基对比剂在巨噬细胞成像中的应用，以及单细胞RNA测序技术在解析特定细胞亚群及其在药物反应或抗药性中的机制作用 | 当前临床成像技术在量化广泛分子程序方面的能力有限，无法解释特定成像剂标记的细胞亚群及其在药物反应或抗药性中的作用 | 探讨巨噬细胞成像作为伴随诊断工具，以指导个性化患者治疗策略 | 巨噬细胞及其在药物反应和抗药性中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | NA |
| 2666 | 2024-08-09 |
Integrative single-cell transcriptome analysis reveals a subpopulation of fibroblasts associated with favorable prognosis of liver cancer patients
2021-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2020.100981
PMID:33395744
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研究论文 | 本文通过综合单细胞转录组分析，揭示了与肝癌患者良好预后相关的成纤维细胞亚群 | 首次在单细胞水平上描述了肝癌与正常肝脏在细胞和分子成分上的变化，并发现了一种与减少血管侵袭和延长肝癌患者生存期相关的成纤维细胞亚群 | NA | 研究肝癌发展中的细胞类型特异性分子改变，并探索与肝癌预后相关的成纤维细胞亚群 | 肝癌和正常肝脏组织的单细胞转录组 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组分析 | 主成分分析 | 转录组数据 | 肝癌和正常肝脏组织的多个样本 |
| 2667 | 2024-08-09 |
Single-cell dissection of intratumoral heterogeneity and lineage diversity in metastatic gastric adenocarcinoma
2021-01, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-1125-8
PMID:33398161
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术，分析了15名胃腺癌患者的腹膜癌病（PC）细胞，构建了45,048个PC细胞的地图，并探讨了肿瘤细胞群体的转录组状态及其与患者生存的关系 | 本文首次揭示了肿瘤细胞系/状态组成的多样性是腹膜癌病（PC）细胞内异质性的关键贡献因素，并开发了一个12基因的预后标志物，用于胃腺癌的预后评估和患者分层 | NA | 探索胃腺癌腹膜癌病（PC）细胞的内异质性及其与患者生存的关系 | 胃腺癌患者的腹膜癌病（PC）细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 15名胃腺癌患者 |
| 2668 | 2024-08-09 |
Six Novel Biomarkers for Diagnosis and Prognosis of Esophageal squamous cell carcinoma: validated by scRNA-seq and qPCR
2021, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.50443
PMID:33403046
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研究论文 | 本研究通过分析六个GEO和TCGA的ESCC数据集，筛选出六个新的生物标志物，并通过scRNA-seq和qPCR验证其在食管鳞状细胞癌中的表达和预后价值 | 首次鉴定并验证了PBK, KIF2C, NUF2, KIF20A, RAD51AP1和DEPDC1作为食管鳞状细胞癌的诊断和预后生物标志物 | NA | 鉴定新的食管鳞状细胞癌生物标志物 | 食管鳞状细胞癌的生物标志物 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | scRNA-seq, qPCR | NA | 基因表达数据 | 六个GEO和TCGA的ESCC数据集 |
| 2669 | 2024-08-09 |
Imaging atherosclerotic plaques by targeting Galectin-3 and activated macrophages using (89Zr)-DFO- Galectin3-F(ab')2 mAb
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.50247
PMID:33408786
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研究论文 | 本研究探索了通过靶向Galectin-3（Gal3）在斑块中的表达来追踪动脉粥样硬化的可行性，使用(89Zr)-DFO-Galectin3-F(ab')2 mAb进行PET成像。 | 本研究首次使用(89Zr)-DFO-Galectin3-F(ab')2 mAb进行PET/CT成像，以追踪动脉粥样硬化斑块，为个体化干预提供了新的工具。 | NA | 探索通过靶向Galectin-3在斑块中的表达来追踪动脉粥样硬化的可行性。 | 动脉粥样硬化斑块中的Galectin-3表达。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | PET/CT成像 | NA | 图像 | 使用了ApoE-KO小鼠和人类斑块样本。 |
| 2670 | 2024-08-09 |
Transcriptional profiling of pediatric cholestatic livers identifies three distinct macrophage populations
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0244743
PMID:33411796
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光技术，对患有胆汁淤积性肝病的儿童肝脏中的巨噬细胞进行了转录组特征分析，并识别出三种不同的巨噬细胞亚群 | 首次在人类儿童胆汁淤积性肝病中进行单细胞RNA测序，并识别出三种具有独特转录特征的巨噬细胞亚群 | NA | 进一步阐明儿童胆汁淤积性肝病中巨噬细胞的转录组特征 | 儿童胆汁淤积性肝病中的巨噬细胞 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 胆道闭锁（BA）患者6例，Alagille综合征（ALGS）患者6例 |
| 2671 | 2024-08-09 |
Differences in TCR repertoire and T cell activation underlie the divergent outcomes of antitumor immune responses in tumor-eradicating versus tumor-progressing hosts
2021-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2020-001615
PMID:33414263
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研究论文 | 本文开发了一种独特的HNSCC小鼠模型，通过单细胞TCR测序和单细胞RNA测序，研究了TCR谱和T细胞活化状态在肿瘤清除与肿瘤进展宿主中的差异，揭示了异质性抗肿瘤免疫反应的潜在机制。 | 首次通过单细胞TCR测序和单细胞RNA测序技术，揭示了TCR谱和T细胞活化状态在不同宿主抗肿瘤免疫反应中的差异。 | NA | 研究抗肿瘤免疫反应在不同宿主中的异质性机制，为个性化癌症免疫治疗提供理论基础。 | HNSCC小鼠模型中的TCR谱和T细胞活化状态。 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞TCR测序，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 100%的受体小鼠中肿瘤初始生长，约25%的小鼠无干预下肿瘤清除 |
| 2672 | 2024-08-09 |
Improving gene network inference with graph wavelets and making insights about ageing-associated regulatory changes in lungs
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa360
PMID:33381809
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研究论文 | 本文提出了一种使用图小波滤波器的方法，用于改进基于基因网络（GWNet）的转录组分析，特别是在单细胞表达谱中提高基因网络推断的性能和一致性 | 本文创新性地使用了图小波滤波器来改进基因网络推断方法，特别是在处理含有批次效应的稀疏单细胞表达谱时，提高了预测基因调控网络的一致性 | NA | 旨在改进基因网络推断方法，并探索肺部细胞老化相关的调控变化 | 单细胞转录组表达谱和基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 图小波滤波器 | 基因网络（GWNet） | 单细胞转录组表达谱 | NA |
| 2673 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis reveals that maternal obesity affects DNA repair, histone methylation, and autophagy level in mouse embryos
2021-07, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.30201
PMID:33368268
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA转录组测序技术，探讨了母体肥胖对小鼠胚胎发育的影响及其潜在机制 | 首次揭示了母体肥胖通过影响DNA修复、组蛋白甲基化和自噬水平，从而影响小鼠胚胎早期发育 | 研究仅限于小鼠模型，未来需在人类胚胎中验证这些发现 | 探究母体肥胖对小鼠胚胎发育的影响及其分子机制 | 小鼠胚胎在母体肥胖条件下的发育情况 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA转录组测序 | NA | 转录组数据 | 涉及肥胖小鼠的2细胞胚胎及其他发育阶段的胚胎 |
| 2674 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing in vision research: Insights into human retinal health and disease
2021-07, Progress in retinal and eye research
IF:18.6Q1
DOI:10.1016/j.preteyeres.2020.100934
PMID:33383180
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在视觉研究中的应用，特别是在人类视网膜健康和疾病研究中的进展 | 单细胞RNA测序技术提供了前所未有的信息分辨率，能够将RNA映射到单个细胞，从而促进视网膜和脉络膜细胞类型的分组和进一步研究 | NA | 总结单细胞RNA测序在视觉研究领域的应用，并探讨其在视网膜疾病研究中的未来方向 | 视网膜、视网膜色素上皮、脉络膜以及视网膜类器官的生物学特性 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及动物模型、视网膜类器官和人类原代视网膜、视网膜色素上皮及脉络膜样本 |
| 2675 | 2024-08-09 |
Niche-specific functional heterogeneity of intestinal resident macrophages
2021-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2020-323121
PMID:33384336
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综述 | 本文综述了肠道常驻巨噬细胞在黏膜屏障中的特定功能异质性 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了肠道各部位常驻巨噬细胞的功能特化，增进了对这些细胞异质性和潜在生物学功能的理解 | NA | 整合新发现与现有知识，更新对胃肠道巨噬细胞功能的理解，并推测特定亚群在稳态和疾病中的作用 | 肠道常驻巨噬细胞的功能特化和生物学作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 2676 | 2024-08-09 |
Human Dermal Fibroblast Subpopulations Are Conserved across Single-Cell RNA Sequencing Studies
2021-07, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2020.11.028
PMID:33385399
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研究论文 | 本文通过对13,823个人类成年皮肤成纤维细胞的转录组数据进行重新评估，展示了成纤维细胞可以被分为三个主要类型及其下的十个亚型，这些类型和亚型在不同数据集中具有一致性 | 本文通过重新评估单细胞RNA测序数据，揭示了成纤维细胞的三个主要类型及其下的十个亚型，这些类型和亚型在不同数据集中具有一致性 | 目前单细胞RNA测序研究的结果尚不明确，成纤维细胞亚群在不同数据集中的重叠性很低，数量和组成也各不相同 | 旨在通过单细胞RNA测序技术，提高对皮肤稳态和细胞功能的转录组水平理解 | 人类皮肤成纤维细胞的转录组异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 13,823个人类成年皮肤成纤维细胞 |
| 2677 | 2024-08-09 |
Hypertension delays viral clearance and exacerbates airway hyperinflammation in patients with COVID-19
2021-06, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-00796-1
PMID:33361824
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研究论文 | 研究探讨了高血压对COVID-19患者病毒清除和气道过度炎症的影响，以及ACEI和ARB治疗的效果 | 首次结合临床数据和单细胞测序数据，探讨高血压患者在COVID-19中的免疫细胞炎症倾向及其与治疗药物的关系 | 研究样本量有限，无法确定临床疗效 | 探究高血压对COVID-19患者病情进展的影响及抗高血压药物的治疗效果 | COVID-19患者中的高血压患者及其免疫细胞 | NA | 高血压 | 单细胞测序 | NA | 临床数据 | 144名临床数据样本和48个气道样本 |
| 2678 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptional Survey of Ileal-Anal Pouch Immune Cells From Ulcerative Colitis Patients
2021-04, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2020.12.030
PMID:33359089
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了溃疡性结肠炎患者回肠储袋-肛管吻合术后的免疫细胞，以探讨储袋炎的免疫组织特征 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了储袋炎和溃疡性结肠炎中肠道炎症的相似性，并识别了特定的免疫细胞亚群及其转录标志物 | 原始序列数据未公开，受患者隐私保护限制 | 探讨回肠储袋-肛管吻合术后储袋炎的免疫组织特征，并寻找个性化治疗溃疡性结肠炎的生物标志物 | 溃疡性结肠炎患者回肠储袋-肛管吻合术后的免疫细胞 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 15名有回肠储袋-肛管吻合术的溃疡性结肠炎患者和11名无此手术的患者 |
| 2679 | 2024-08-09 |
scLM: Automatic Detection of Consensus Gene Clusters Across Multiple Single-cell Datasets
2021-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.09.002
PMID:33359676
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scLM的单细胞隐变量模型算法，用于在多个单细胞数据集中自动检测共识基因簇 | scLM算法能够同时对多个单细胞数据集进行共识聚类，提高了检测基因簇的准确性，并能有效避免批次效应的影响 | NA | 开发一种新的算法来提高单细胞RNA测序数据中基因共表达聚类的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的基因共表达簇 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 隐变量模型 | 单细胞数据 | 多个单细胞数据集 |
| 2680 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals a Heterogeneous Cellular Response to BK Virus Infection
2021-02-24, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/JVI.02237-20
PMID:33361432
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了BK病毒感染后细胞的异质性反应 | 首次通过单细胞转录组学揭示了BK病毒感染后细胞的异质性反应，并发现了先前未被识别的被BK病毒下调的通路 | 研究主要集中在体外培养的肾近端小管上皮细胞，可能与体内实际情况存在差异 | 探究BK病毒感染后细胞的异质性反应及其对细胞基因表达模式的影响 | BK病毒感染的肾近端小管上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 数千个细胞 |