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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis identifies skin-specific T-cell responses in systemic sclerosis
2021-11, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-220209
PMID:34031030
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析鉴定系统性硬化症皮肤特异性T细胞反应 | 首次在系统性硬化症患者皮肤中鉴定出表达CXCL13的再循环T细胞亚群,该细胞群具有滤泡辅助T细胞样基因表达特征 | 样本量相对有限,仅包含27名患者和10名健康供体 | 解析系统性硬化症皮肤中T细胞介导的免疫反应机制 | 系统性硬化症患者和健康供体的皮肤活检样本 | 单细胞转录组学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序,共聚焦免疫荧光显微镜 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 3729个CD3+淋巴细胞(867个来自正常皮肤,2862个来自SSc皮肤),来自27名活动性SSc患者和10名健康供体 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 液滴式单细胞测序技术 |
| 242 | 2025-10-07 |
Tenascin-C-mediated suppression of extracellular matrix adhesion force promotes entheseal new bone formation through activation of Hippo signalling in ankylosing spondylitis
2021-07, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-220002
PMID:33858850
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研究论文 | 本研究揭示了肌腱蛋白C通过抑制细胞外基质粘附力激活Hippo信号通路,从而促进强直性脊柱炎附着点新骨形成的分子机制 | 首次发现FSP1+成纤维细胞来源的TNC通过调控ECM机械特性激活Hippo/YAP信号通路促进软骨内成骨 | 动物模型与人类疾病存在差异,临床样本数量有限 | 探究TNC在强直性脊柱炎附着点新骨形成中的作用及分子机制 | 强直性脊柱炎患者韧带组织、胶原抗体诱导关节炎模型、DBA/1小鼠模型 | 病理机制研究 | 强直性脊柱炎 | 免疫组化染色、原子力显微镜、RNA测序、单细胞RNA测序、免疫荧光染色 | NA | 组织样本、基因表达数据、机械特性数据 | 患者手术获取的韧带组织样本及动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 243 | 2025-10-07 |
Monocyte and bone marrow macrophage transcriptional phenotypes in systemic juvenile idiopathic arthritis reveal TRIM8 as a mediator of IFN-γ hyper-responsiveness and risk for macrophage activation syndrome
2021-05, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2020-217470
PMID:33277241
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研究论文 | 本研究通过转录组分析发现系统性幼年特发性关节炎中单核细胞和骨髓巨噬细胞的TRIM8过表达是IFN-γ超反应性的分子机制 | 首次发现TRIM8在SJIA单核细胞中上调并通过体外实验证实其增强巨噬细胞IFN-γ反应性 | 骨髓巨噬细胞样本量较小(仅1例患者),需要更大规模验证 | 探究系统性幼年特发性关节炎中单核细胞和巨噬细胞的极化表型及IFN反应分子特征 | 系统性幼年特发性关节炎患者的外周血单核细胞和骨髓巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 幼年特发性关节炎 | RNA-seq, scRNA-seq, 基因敲低 | NA | 转录组数据 | 26例SJIA患者外周血单核细胞,1例SJIA合并MAS患者骨髓巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 244 | 2025-10-07 |
Regulatory eosinophils induce the resolution of experimental arthritis and appear in remission state of human rheumatoid arthritis
2021-04, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2020-218902
PMID:33148700
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研究论文 | 本研究发现了调节性嗜酸性粒细胞在关节炎消退中的作用机制 | 首次揭示嗜酸性粒细胞在关节炎中具有促消退功能,并鉴定出与肺部炎性嗜酸性粒细胞不同的关节调节性嗜酸性粒细胞亚群 | 机制研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究嗜酸性粒细胞在类风湿关节炎消退过程中的作用机制 | 小鼠模型和人类类风湿关节炎患者 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 245 | 2025-10-07 |
Costimulation of γδTCR and TLR7/8 promotes Vδ2 T-cell antitumor activity by modulating mTOR pathway and APC function
2021-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003339
PMID:34937742
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研究论文 | 本研究开发了一种通过共刺激γδTCR和TLR7/8来扩增Vδ2 T细胞的新方法,并验证其抗肿瘤活性 | 首次发现γδTCR和TLR7/8共刺激可增强Vδ2 T细胞抗肿瘤功能,并揭示其通过调节mTOR通路和APC功能的作用机制 | 研究主要基于体外和动物模型,尚未进行临床试验验证 | 开发更有效的γδ T细胞癌症免疫治疗方法 | Vδ2 T细胞、抗原呈递细胞、肿瘤细胞 | 免疫学、癌症免疫治疗 | 癌症 | 单细胞测序、反相蛋白阵列、体外共培养、动物模型 | NA | 蛋白质表达数据、基因表达数据、细胞功能数据 | 人PBMCs、人脾细胞、人源化NSG小鼠 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 246 | 2025-10-07 |
A scoping review on the potentiality of PD-L1-inhibiting microRNAs in treating colorectal cancer: Toward single-cell sequencing-guided biocompatible-based delivery
2021-Nov, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2021.112213
PMID:34560556
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综述 | 本文探讨了PD-L1抑制性microRNAs在结直肠癌治疗中的潜力及单细胞测序指导的生物相容性递送策略 | 首次系统综述了多种PD-L1抑制性miRNAs在结直肠癌治疗中的作用,并提出了单细胞测序指导的生物相容性递送新策略 | 仅纳入了2021年3月17日前的文献,未进行定量meta分析 | 评估PD-L1抑制性miRNAs在结直肠癌治疗中的潜力及递送策略 | 结直肠癌细胞及PD-L1抑制性microRNAs | 生物医学 | 结直肠癌 | 单细胞测序,文献系统检索 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 247 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneous tumor and immune cell populations in early-stage lung adenocarcinomas harboring EGFR mutations
2021-01, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-020-01528-0
PMID:33144684
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示早期EGFR突变肺腺癌中肿瘤和免疫细胞群体的异质性 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘早期EGFR突变肺腺癌的肿瘤微环境异质性,发现ELF3基因在肿瘤进展中的关键作用 | 样本量相对较小(7个肿瘤样本),仅针对早期EGFR突变肺腺癌 | 解析EGFR突变肺腺癌的肿瘤微环境异质性 | 早期肺腺癌患者肿瘤组织和癌旁组织 | 单细胞组学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 125,674个细胞(来自7个I/II期肺腺癌样本和5个癌旁组织) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 248 | 2025-10-07 |
Distinct human Langerhans cell subsets orchestrate reciprocal functions and require different developmental regulation
2021-10-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.08.012
PMID:34508661
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和质谱流式技术鉴定人类皮肤中两种稳态和两种激活状态的朗格汉斯细胞亚群 | 首次发现人类朗格汉斯细胞存在功能迥异的LC1和LC2亚群,并揭示其不同的发育调控机制 | NA | 探究人类朗格汉斯细胞的异质性及其发育调控机制 | 人类皮肤表皮中的朗格汉斯细胞和CD34造血干细胞来源的朗格汉斯细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式技术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 249 | 2025-10-07 |
Isolation of myeloid cells from mouse brain tumors for single-cell RNA-seq analysis
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100957
PMID:34825218
|
研究论文 | 开发从小鼠脑肿瘤中分离髓系细胞用于单细胞RNA测序分析的实验方案 | 无需细胞分选即可快速分离小鼠小脑肿瘤中的髓系细胞,最大限度减少细胞损伤 | 未提及样本量限制或技术局限性 | 建立优化的单细胞RNA测序样本制备流程 | 小鼠脑肿瘤中的髓系细胞 | 单细胞测序 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 250 | 2025-10-07 |
Multi-omic evaluation of metabolic alterations in multiple sclerosis identifies shifts in aromatic amino acid metabolism
2021-10-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100424
PMID:34755135
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法评估多发性硬化症中的代谢改变,重点分析了芳香族氨基酸代谢的变化 | 首次在多发性硬化症患者中发现芳香族氨基酸代谢的显著异常,并揭示了这些代谢变化与疾病残疾程度的相关性 | 样本量相对有限,需要更大规模的研究验证 | 探究多发性硬化症的代谢组学特征及其与疾病病理生理的关系 | 多发性硬化症患者和健康对照者的血液样本 | 代谢组学 | 多发性硬化症 | 代谢组学分析,单细胞RNA测序 | NA | 代谢组数据,单细胞RNA测序数据 | 多发性硬化症患者637个样本,健康对照317个样本 | NA | 单细胞RNA-seq,代谢组学分析 | NA | NA |
| 251 | 2025-10-07 |
Single cell RNA-seq analysis of the flexor digitorum brevis mouse myofibers
2021-05-17, Skeletal muscle
IF:5.3Q2
DOI:10.1186/s13395-021-00269-2
PMID:34001262
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研究论文 | 本研究开发并验证了一种通过流式分选分离完整骨骼肌肌纤维进行单细胞RNA测序的方法 | 首次在单一肌肉类型中应用全细胞流式分选方法进行单细胞RNA测序,而非传统的单核RNA测序 | 763个细胞中仅有171个达到质量控制标准,样本利用率较低 | 探索在单一肌肉类型中应用全细胞流式分选方法进行单细胞RNA测序的可行性 | 小鼠快肌趾短屈肌的完整和碎片化骨骼肌肌纤维 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 流式分选, RNA原位杂交(RISH) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 763个小鼠趾短屈肌肌纤维(171个通过质量控制) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 252 | 2025-10-07 |
Single-cell protein activity analysis identifies recurrence-associated renal tumor macrophages
2021-05-27, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.04.038
PMID:34019793
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研究论文 | 通过单细胞蛋白活性分析鉴定与肾癌复发相关的肿瘤巨噬细胞亚群 | 首次应用VIPER算法量化单细胞蛋白活性,发现传统基因表达分析无法检测的TREM2/APOE/C1Q阳性巨噬细胞亚群与肾癌复发相关 | 研究基于治疗初期的肾癌切除样本,未涉及治疗后的肿瘤微环境变化 | 构建透明细胞肾癌肿瘤微环境图谱并鉴定预后相关细胞亚群 | 透明细胞肾癌患者的肿瘤和癌旁组织中的造血和非造血细胞亚群 | 单细胞生物学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 空间分辨定量多光谱免疫荧光 | VIPER算法 | 单细胞转录组数据, 蛋白活性数据, 影像数据 | 治疗初期肾癌切除样本的肿瘤和癌旁组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 253 | 2025-10-07 |
Targeting In Vivo Metabolic Vulnerabilities of Th2 and Th17 Cells Reduces Airway Inflammation
2021-03-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2001029
PMID:33558372
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研究论文 | 本研究通过靶向Th2和Th17细胞的代谢脆弱性来减轻气道炎症 | 首次揭示Th2和Th17细胞在气道炎症中的代谢依赖性,并证明靶向葡萄糖和谷氨酰胺代谢可增强糖皮质激素疗效 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探索Th2和Th17细胞的代谢特性及其在气道炎症中的作用 | 哮喘患者外周血T细胞、小鼠肺部T细胞 | 免疫代谢 | 哮喘 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据 | 哮喘患者和健康对照的外周血T细胞,两种小鼠气道炎症模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 254 | 2025-10-07 |
Defining the nature of human pluripotent stem cell-derived interneurons via single-cell analysis
2021-10-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.08.006
PMID:34506726
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研究论文 | 通过单细胞分析比较人类多能干细胞来源的中间神经元与体内中间神经元的异同 | 首次应用单核和单细胞转录组学直接比较体外培养与体内来源的人类中间神经元 | 干细胞来源的中间神经元仅能模拟妊娠中期前的发育阶段,且仅代表脑内潜在亚型的一小部分 | 评估体外培养方法生成人类中间神经元的完整性和相似性 | 人类皮质中间神经元和多能干细胞来源的中间神经元 | 单细胞分析 | NA | 单核转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 255 | 2025-10-07 |
Transcriptome analysis of heterogeneity in mouse model of metastatic breast cancer
2021-09-27, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-021-01468-x
PMID:34579762
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研究论文 | 通过MMTV-PyMT小鼠模型研究转移性乳腺癌细胞转录组异质性 | 结合批量RNA测序和单细胞RNA测序分析转移性乳腺癌的器官趋向性和克隆异质性 | 研究仅使用小鼠模型,结果向人类临床转化的适用性需要进一步验证 | 研究乳腺癌转移过程中肿瘤异质性和器官趋向性的分子机制 | MMTV-PyMT转基因小鼠模型的转移性乳腺癌细胞 | 转录组学 | 乳腺癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | Monocle2, Seurat | RNA测序数据 | 10只雌性MMTV-PyMT小鼠的器官来源转移细胞系 | Illumina, BioRad | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NextSeq 500, ddSeq | Illumina NextSeq 500平台用于批量RNA测序,BioRad ddSeq平台用于单细胞RNA测序 |
| 256 | 2024-12-17 |
Single-Cell Transcriptomic Heterogeneity in Invasive Ductal and Lobular Breast Cancer Cells
2021-01-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-0696
PMID:33148662
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了浸润性导管癌和浸润性小叶癌细胞的转录组异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了浸润性小叶癌与浸润性导管癌在转录组水平上的异质性,并探讨了E-钙粘蛋白缺失对浸润性小叶癌分子特征的影响 | 研究主要基于细胞系,可能无法完全反映患者体内的复杂情况 | 揭示乳腺癌细胞的单细胞转录组异质性,并探讨E-钙粘蛋白缺失对浸润性小叶癌分子特征的影响 | 浸润性导管癌和浸润性小叶癌细胞系,以及通过CRISPR-Cas9技术敲除E-钙粘蛋白的T47D细胞系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个浸润性导管癌和浸润性小叶癌细胞系,以及一个E-钙粘蛋白敲除的T47D细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 257 | 2024-12-12 |
Maternal respiratory SARS-CoV-2 infection in pregnancy is associated with a robust inflammatory response at the maternal-fetal interface
2021-05-14, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2021.04.016
PMID:33969332
|
研究论文 | 研究了孕妇在妊娠晚期感染SARS-CoV-2后,母胎界面发生的炎症反应 | 首次揭示了妊娠晚期SARS-CoV-2感染在母胎界面引起的免疫激活,即使在没有检测到局部病毒入侵的情况下 | 研究样本量较小,且仅限于妊娠晚期的孕妇 | 探讨孕妇感染SARS-CoV-2后母胎界面的病理生理机制及其对胎儿的潜在影响 | 妊娠晚期感染SARS-CoV-2的孕妇及其胎盘组织 | NA | COVID-19 | 免疫组织化学、单细胞转录组学 | NA | 组织、细胞 | 15例妊娠晚期孕妇的胎盘组织 | NA | NA | NA | NA |
| 258 | 2024-12-11 |
SARS-CoV-2 exacerbates proinflammatory responses in myeloid cells through C-type lectin receptors and Tweety family member 2
2021-06-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.05.006
PMID:34048708
|
研究论文 | 研究探讨了SARS-CoV-2通过C型凝集素受体和Tweety家族成员2在髓系细胞中加剧促炎反应的机制 | 首次识别出SARS-CoV-2刺突蛋白的多个C型凝集素受体和TTYH2作为糖依赖性结合伙伴,并发现这些受体在髓系细胞中的表达与COVID-19严重程度相关 | 研究主要集中在髓系细胞的受体上,未涵盖其他免疫细胞类型 | 探讨SARS-CoV-2如何通过特定受体在髓系细胞中引发促炎反应,并寻找潜在的治疗靶点 | SARS-CoV-2刺突蛋白与髓系细胞受体的相互作用及其引发的炎症反应 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自COVID-19患者的肺部细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 259 | 2024-12-08 |
Gut-licensed IFNγ+ NK cells drive LAMP1+TRAIL+ anti-inflammatory astrocytes
2021-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-03116-4
PMID:33408417
|
研究论文 | 研究通过高通量流式细胞术筛选、单细胞RNA测序和CRISPR-Cas9介导的细胞特异性体内遗传扰动,鉴定出表达LAMP1和TRAIL的星形胶质细胞亚群,并探讨其在中枢神经系统炎症中的作用 | 首次揭示了LAMP1TRAIL星形胶质细胞通过TRAIL-DR5信号诱导T细胞凋亡来限制中枢神经系统炎症,并发现这种星形胶质细胞亚群由肠道微生物群调节的IFNγ NK细胞维持 | 研究主要在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 | 探讨星形胶质细胞在中枢神经系统炎症中的抗炎作用及其调控机制 | 星形胶质细胞、NK细胞、肠道微生物群 | 神经科学 | NA | 高通量流式细胞术、单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9 | NA | RNA | 小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 260 | 2024-12-06 |
Single-cell RNA sequencing of blood antigen-presenting cells in severe COVID-19 reveals multi-process defects in antiviral immunity
2021-05, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-021-00681-2
PMID:33972731
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了重症COVID-19患者血液抗原呈递细胞的免疫缺陷 | 揭示了重症COVID-19患者抗原呈递细胞中抗病毒免疫防御的多重缺陷机制 | 研究样本量较小,仅包括15名患者和4名健康对照 | 探讨重症COVID-19患者抗原呈递细胞的免疫缺陷机制 | 重症COVID-19患者的血液抗原呈递细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 15名重症COVID-19患者和4名健康对照 | NA | NA | NA | NA |