单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202101-202112] [清除筛选条件]
当前共找到 2886 篇文献,本页显示第 241 - 260 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
241 2025-10-07
Processing single-cell RNA-seq data for dimension reduction-based analyses using open-source tools
2021-06-18, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 介绍使用开源工具构建单细胞RNA测序数据处理流程,用于降维分析 提出模块化开源软件构建的完整数据分析流程,强调流程灵活性优于商业平台 未提及具体性能指标或与其他方法的对比验证 开发灵活的单细胞RNA测序数据处理流程 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
242 2025-10-07
Cobolt: integrative analysis of multimodal single-cell sequencing data
2021-12-28, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 提出Cobolt方法用于整合分析多模态单细胞测序数据 不仅能分析联合模态平台的数据,还提供了整合不同模态测量的多个数据集的一致框架 NA 开发多模态单细胞测序数据的整合分析方法 单细胞测序数据 生物信息学 NA 单细胞测序 NA 基因表达数据、染色质可及性数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 多组学单细胞测序 NA NA
243 2025-10-07
Ex vivo mass cytometry analysis reveals a profound myeloid proinflammatory signature in psoriatic arthritis synovial fluid
2021-12, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 本研究通过质谱流式细胞术和多组学分析揭示了银屑病关节炎滑液中髓系细胞的显著促炎特征 首次在无体外刺激条件下发现银屑病关节炎滑液中的经典单核细胞、中间单核细胞和巨噬细胞自发产生高水平骨桥蛋白和CCL2等促炎介质 研究样本量有限,且主要关注髓系细胞而T细胞自发细胞因子产生较少 识别银屑病关节炎滑液和血液中淋巴细胞和髓系细胞在无刺激条件下的细胞因子产生情况 银屑病关节炎患者的滑液和配对血液白细胞 免疫学 银屑病关节炎 质谱流式细胞术, 转录组分析, 单细胞RNA测序, ELISA, LEGENDplex分析 NA 细胞表型数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 银屑病关节炎患者的滑液和配对血液样本 NA 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序, 基因芯片, 蛋白质检测 NA NA
244 2024-08-09
Single cell and spatial transcriptomics in human tendon disease indicate dysregulated immune homeostasis
2021-11, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
245 2025-10-07
Single-cell transcriptome analysis identifies skin-specific T-cell responses in systemic sclerosis
2021-11, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析鉴定系统性硬化症皮肤特异性T细胞反应 首次在系统性硬化症患者皮肤中鉴定出表达CXCL13的再循环T细胞亚群,该细胞群具有滤泡辅助T细胞样基因表达特征 样本量相对有限,仅包含27名患者和10名健康供体 解析系统性硬化症皮肤中T细胞介导的免疫反应机制 系统性硬化症患者和健康供体的皮肤活检样本 单细胞转录组学 系统性硬化症 单细胞RNA测序,共聚焦免疫荧光显微镜 NA 单细胞转录组数据,图像数据 3729个CD3+淋巴细胞(867个来自正常皮肤,2862个来自SSc皮肤),来自27名活动性SSc患者和10名健康供体 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 液滴式单细胞测序技术
246 2025-10-07
Tenascin-C-mediated suppression of extracellular matrix adhesion force promotes entheseal new bone formation through activation of Hippo signalling in ankylosing spondylitis
2021-07, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 本研究揭示了肌腱蛋白C通过抑制细胞外基质粘附力激活Hippo信号通路,从而促进强直性脊柱炎附着点新骨形成的分子机制 首次发现FSP1+成纤维细胞来源的TNC通过调控ECM机械特性激活Hippo/YAP信号通路促进软骨内成骨 动物模型与人类疾病存在差异,临床样本数量有限 探究TNC在强直性脊柱炎附着点新骨形成中的作用及分子机制 强直性脊柱炎患者韧带组织、胶原抗体诱导关节炎模型、DBA/1小鼠模型 病理机制研究 强直性脊柱炎 免疫组化染色、原子力显微镜、RNA测序、单细胞RNA测序、免疫荧光染色 NA 组织样本、基因表达数据、机械特性数据 患者手术获取的韧带组织样本及动物模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
247 2025-10-07
Monocyte and bone marrow macrophage transcriptional phenotypes in systemic juvenile idiopathic arthritis reveal TRIM8 as a mediator of IFN-γ hyper-responsiveness and risk for macrophage activation syndrome
2021-05, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 本研究通过转录组分析发现系统性幼年特发性关节炎中单核细胞和骨髓巨噬细胞的TRIM8过表达是IFN-γ超反应性的分子机制 首次发现TRIM8在SJIA单核细胞中上调并通过体外实验证实其增强巨噬细胞IFN-γ反应性 骨髓巨噬细胞样本量较小(仅1例患者),需要更大规模验证 探究系统性幼年特发性关节炎中单核细胞和巨噬细胞的极化表型及IFN反应分子特征 系统性幼年特发性关节炎患者的外周血单核细胞和骨髓巨噬细胞 单细胞转录组学 幼年特发性关节炎 RNA-seq, scRNA-seq, 基因敲低 NA 转录组数据 26例SJIA患者外周血单核细胞,1例SJIA合并MAS患者骨髓巨噬细胞 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
248 2025-10-07
Regulatory eosinophils induce the resolution of experimental arthritis and appear in remission state of human rheumatoid arthritis
2021-04, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 本研究发现了调节性嗜酸性粒细胞在关节炎消退中的作用机制 首次揭示嗜酸性粒细胞在关节炎中具有促消退功能,并鉴定出与肺部炎性嗜酸性粒细胞不同的关节调节性嗜酸性粒细胞亚群 机制研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 探究嗜酸性粒细胞在类风湿关节炎消退过程中的作用机制 小鼠模型和人类类风湿关节炎患者 免疫学 类风湿关节炎 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
249 2025-10-07
Costimulation of γδTCR and TLR7/8 promotes Vδ2 T-cell antitumor activity by modulating mTOR pathway and APC function
2021-12, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究开发了一种通过共刺激γδTCR和TLR7/8来扩增Vδ2 T细胞的新方法,并验证其抗肿瘤活性 首次发现γδTCR和TLR7/8共刺激可增强Vδ2 T细胞抗肿瘤功能,并揭示其通过调节mTOR通路和APC功能的作用机制 研究主要基于体外和动物模型,尚未进行临床试验验证 开发更有效的γδ T细胞癌症免疫治疗方法 Vδ2 T细胞、抗原呈递细胞、肿瘤细胞 免疫学、癌症免疫治疗 癌症 单细胞测序、反相蛋白阵列、体外共培养、动物模型 NA 蛋白质表达数据、基因表达数据、细胞功能数据 人PBMCs、人脾细胞、人源化NSG小鼠 NA 单细胞测序 NA NA
250 2025-10-07
A scoping review on the potentiality of PD-L1-inhibiting microRNAs in treating colorectal cancer: Toward single-cell sequencing-guided biocompatible-based delivery
2021-Nov, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
综述 本文探讨了PD-L1抑制性microRNAs在结直肠癌治疗中的潜力及单细胞测序指导的生物相容性递送策略 首次系统综述了多种PD-L1抑制性miRNAs在结直肠癌治疗中的作用,并提出了单细胞测序指导的生物相容性递送新策略 仅纳入了2021年3月17日前的文献,未进行定量meta分析 评估PD-L1抑制性miRNAs在结直肠癌治疗中的潜力及递送策略 结直肠癌细胞及PD-L1抑制性microRNAs 生物医学 结直肠癌 单细胞测序,文献系统检索 NA 文献数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
251 2025-10-07
Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneous tumor and immune cell populations in early-stage lung adenocarcinomas harboring EGFR mutations
2021-01, Oncogene IF:6.9Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示早期EGFR突变肺腺癌中肿瘤和免疫细胞群体的异质性 首次在单细胞分辨率下系统描绘早期EGFR突变肺腺癌的肿瘤微环境异质性,发现ELF3基因在肿瘤进展中的关键作用 样本量相对较小(7个肿瘤样本),仅针对早期EGFR突变肺腺癌 解析EGFR突变肺腺癌的肿瘤微环境异质性 早期肺腺癌患者肿瘤组织和癌旁组织 单细胞组学 肺腺癌 单细胞RNA测序 伪时间轨迹分析 单细胞转录组数据 125,674个细胞(来自7个I/II期肺腺癌样本和5个癌旁组织) NA 单细胞RNA测序 NA NA
252 2025-10-07
Distinct human Langerhans cell subsets orchestrate reciprocal functions and require different developmental regulation
2021-10-12, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和质谱流式技术鉴定人类皮肤中两种稳态和两种激活状态的朗格汉斯细胞亚群 首次发现人类朗格汉斯细胞存在功能迥异的LC1和LC2亚群,并揭示其不同的发育调控机制 NA 探究人类朗格汉斯细胞的异质性及其发育调控机制 人类皮肤表皮中的朗格汉斯细胞和CD34造血干细胞来源的朗格汉斯细胞 单细胞生物学 NA 单细胞RNA测序, 质谱流式技术 NA 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
253 2025-10-07
Isolation of myeloid cells from mouse brain tumors for single-cell RNA-seq analysis
2021-12-17, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 开发从小鼠脑肿瘤中分离髓系细胞用于单细胞RNA测序分析的实验方案 无需细胞分选即可快速分离小鼠小脑肿瘤中的髓系细胞,最大限度减少细胞损伤 未提及样本量限制或技术局限性 建立优化的单细胞RNA测序样本制备流程 小鼠脑肿瘤中的髓系细胞 单细胞测序 脑肿瘤 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
254 2025-10-07
Multi-omic evaluation of metabolic alterations in multiple sclerosis identifies shifts in aromatic amino acid metabolism
2021-10-19, Cell reports. Medicine
研究论文 本研究通过多组学方法评估多发性硬化症中的代谢改变,重点分析了芳香族氨基酸代谢的变化 首次在多发性硬化症患者中发现芳香族氨基酸代谢的显著异常,并揭示了这些代谢变化与疾病残疾程度的相关性 样本量相对有限,需要更大规模的研究验证 探究多发性硬化症的代谢组学特征及其与疾病病理生理的关系 多发性硬化症患者和健康对照者的血液样本 代谢组学 多发性硬化症 代谢组学分析,单细胞RNA测序 NA 代谢组数据,单细胞RNA测序数据 多发性硬化症患者637个样本,健康对照317个样本 NA 单细胞RNA-seq,代谢组学分析 NA NA
255 2025-10-07
Single cell RNA-seq analysis of the flexor digitorum brevis mouse myofibers
2021-05-17, Skeletal muscle IF:5.3Q2
研究论文 本研究开发并验证了一种通过流式分选分离完整骨骼肌肌纤维进行单细胞RNA测序的方法 首次在单一肌肉类型中应用全细胞流式分选方法进行单细胞RNA测序,而非传统的单核RNA测序 763个细胞中仅有171个达到质量控制标准,样本利用率较低 探索在单一肌肉类型中应用全细胞流式分选方法进行单细胞RNA测序的可行性 小鼠快肌趾短屈肌的完整和碎片化骨骼肌肌纤维 单细胞测序 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 流式分选, RNA原位杂交(RISH) NA 单细胞RNA测序数据 763个小鼠趾短屈肌肌纤维(171个通过质量控制) NA 单细胞RNA测序 NA NA
256 2025-10-07
Single-cell protein activity analysis identifies recurrence-associated renal tumor macrophages
2021-05-27, Cell IF:45.5Q1
研究论文 通过单细胞蛋白活性分析鉴定与肾癌复发相关的肿瘤巨噬细胞亚群 首次应用VIPER算法量化单细胞蛋白活性,发现传统基因表达分析无法检测的TREM2/APOE/C1Q阳性巨噬细胞亚群与肾癌复发相关 研究基于治疗初期的肾癌切除样本,未涉及治疗后的肿瘤微环境变化 构建透明细胞肾癌肿瘤微环境图谱并鉴定预后相关细胞亚群 透明细胞肾癌患者的肿瘤和癌旁组织中的造血和非造血细胞亚群 单细胞生物学 肾癌 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 空间分辨定量多光谱免疫荧光 VIPER算法 单细胞转录组数据, 蛋白活性数据, 影像数据 治疗初期肾癌切除样本的肿瘤和癌旁组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
257 2025-10-07
Targeting In Vivo Metabolic Vulnerabilities of Th2 and Th17 Cells Reduces Airway Inflammation
2021-03-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本研究通过靶向Th2和Th17细胞的代谢脆弱性来减轻气道炎症 首次揭示Th2和Th17细胞在气道炎症中的代谢依赖性,并证明靶向葡萄糖和谷氨酰胺代谢可增强糖皮质激素疗效 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 探索Th2和Th17细胞的代谢特性及其在气道炎症中的作用 哮喘患者外周血T细胞、小鼠肺部T细胞 免疫代谢 哮喘 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据 哮喘患者和健康对照的外周血T细胞,两种小鼠气道炎症模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
258 2025-10-07
Defining the nature of human pluripotent stem cell-derived interneurons via single-cell analysis
2021-10-12, Stem cell reports IF:5.9Q2
研究论文 通过单细胞分析比较人类多能干细胞来源的中间神经元与体内中间神经元的异同 首次应用单核和单细胞转录组学直接比较体外培养与体内来源的人类中间神经元 干细胞来源的中间神经元仅能模拟妊娠中期前的发育阶段,且仅代表脑内潜在亚型的一小部分 评估体外培养方法生成人类中间神经元的完整性和相似性 人类皮质中间神经元和多能干细胞来源的中间神经元 单细胞分析 NA 单核转录组学, 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
259 2025-10-07
Transcriptome analysis of heterogeneity in mouse model of metastatic breast cancer
2021-09-27, Breast cancer research : BCR IF:6.1Q1
研究论文 通过MMTV-PyMT小鼠模型研究转移性乳腺癌细胞转录组异质性 结合批量RNA测序和单细胞RNA测序分析转移性乳腺癌的器官趋向性和克隆异质性 研究仅使用小鼠模型,结果向人类临床转化的适用性需要进一步验证 研究乳腺癌转移过程中肿瘤异质性和器官趋向性的分子机制 MMTV-PyMT转基因小鼠模型的转移性乳腺癌细胞 转录组学 乳腺癌 RNA测序,单细胞RNA测序 Monocle2, Seurat RNA测序数据 10只雌性MMTV-PyMT小鼠的器官来源转移细胞系 Illumina, BioRad 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NextSeq 500, ddSeq Illumina NextSeq 500平台用于批量RNA测序,BioRad ddSeq平台用于单细胞RNA测序
260 2024-12-17
Single-Cell Transcriptomic Heterogeneity in Invasive Ductal and Lobular Breast Cancer Cells
2021-01-15, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 研究通过单细胞RNA测序分析了浸润性导管癌和浸润性小叶癌细胞的转录组异质性 首次通过单细胞RNA测序揭示了浸润性小叶癌与浸润性导管癌在转录组水平上的异质性,并探讨了E-钙粘蛋白缺失对浸润性小叶癌分子特征的影响 研究主要基于细胞系,可能无法完全反映患者体内的复杂情况 揭示乳腺癌细胞的单细胞转录组异质性,并探讨E-钙粘蛋白缺失对浸润性小叶癌分子特征的影响 浸润性导管癌和浸润性小叶癌细胞系,以及通过CRISPR-Cas9技术敲除E-钙粘蛋白的T47D细胞系 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 多个浸润性导管癌和浸润性小叶癌细胞系,以及一个E-钙粘蛋白敲除的T47D细胞系 NA NA NA NA
回到顶部