单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2024-08-05 |
Single Cell Analysis of Blood Mononuclear Cells Stimulated Through Either LPS or Anti-CD3 and Anti-CD28
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.636720
PMID:33815388
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研究论文 | 本研究开发了一种成本效益高的多重单细胞RNA测序方法，以研究不同激活因子对人类外周血单核细胞的影响 | 首次通过CITE-seq方法系统研究了不同激活因子对外周血单核细胞组成和转录特征的影响 | 本研究的范围可能受到样本数量和来源的限制 | 探讨经典T细胞和单核细胞激活因子如何改变外周血单核细胞的组成和转录谱 | 健康人供体的外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | CITE-seq | NA | RNA测序 | 来自健康人供体的外周血单核细胞 |
| 242 | 2024-08-05 |
An update on the phenotypic switching of vascular smooth muscle cells in the pathogenesis of atherosclerosis
2021-Dec-22, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-021-04079-z
PMID:34936041
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综述 | 该文章综述了血管平滑肌细胞在动脉粥样硬化中的表型转变 | 文章强调了血管平滑肌细胞在动脉粥样硬化表型转变中的新发现，包括对转录标志物的下调及多种其他表型的采纳 | 文章未明确阐述血管平滑肌细胞转变的分子机制和过程 | 综述动脉粥样硬化中血管平滑肌细胞表型转变的挑战和需进一步研究的问题 | 血管平滑肌细胞在动脉粥样硬化过程中的表型转变 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 243 | 2024-08-05 |
Deciphering neural heterogeneity through cell lineage tracing
2021-Mar, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-020-03689-3
PMID:33151389
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综述 | 本文综述了神经细胞谱系追踪的策略及其对理解神经细胞功能克隆关系的作用 | 结合不同的报告蛋白和转基因小鼠，利用新型基因组编辑工具和单细胞测序技术，显著提高了谱系追踪能力 | 对于谱系追踪的复杂性和挑战性仍未提供明确的解决方案 | 探讨细胞谱系在成人大脑发育中的重要性 | 围绕大脑中的细胞谱系和它们的功能克隆关系进行研究 | 发育神经生物学 | NA | 基因组编辑工具、单细胞测序 | 转基因小鼠 | NA | NA |
| 244 | 2024-08-05 |
Human airway mast cells proliferate and acquire distinct inflammation-driven phenotypes during type 2 inflammation
2021-02-26, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abb7221
PMID:33637594
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研究论文 | 本研究分析了人类气道肥大细胞在2型炎症过程中的增殖及其特异的以炎症驱动的表型 | 本研究链接了肥大细胞表面表型与其不同转录组之间的关系，揭示了肥大细胞在CRSwNP中的特异性增殖 | 对肥大细胞异质性的机制及其扩展的转录程序尚不完全理解 | 研究肥大细胞在2型过敏性炎症疾病中的作用及其增殖机制 | 人类气道中的肥大细胞，尤其是在慢性鼻窦炎伴有鼻息肉症中的肥大细胞 | 数字病理 | 呼吸道疾病 | 流式细胞术及单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 245 | 2024-08-05 |
Dissecting the initiation of female meiosis in the mouse at single-cell resolution
2021-Jan, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-020-03533-8
PMID:32367190
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研究论文 | 本文详细分析了小鼠雌性减数分裂的起始过程及其转录组特征 | 本研究通过单细胞RNA测序首次揭示了小鼠雌性减数分裂起始过程中的细胞群体及其转录组动力学，提供了重要的新资源 | 该研究集中于小鼠模型，可能不完全适用于其他物种的生殖生物学 | 揭示小鼠雌性减数分裂的分子机制及细胞群体的转录组特征 | 小鼠胎儿卵巢和生殖脊中的细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 研究中涉及13个转录群体和7个生殖细胞亚群 |
| 246 | 2024-08-05 |
The immune landscape of common CNS malignancies: implications for immunotherapy
2021-11, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/s41571-021-00518-9
PMID:34117475
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评论 | 本文回顾了中央神经系统恶性肿瘤的免疫景观及其对免疫治疗的影响 | 本文揭示了免疫组成和免疫生物学的基本差异，为胶质瘤的免疫治疗策略奠定基础 | 关于脑瘤对免疫检查点抑制剂反应的患者子集的研究限制了总体结果的推广 | 探讨中央神经系统恶性肿瘤中的免疫细胞组成和功能差异以及这些差异对免疫疗法的影响 | 对患有中央神经系统恶性肿瘤的患者样本进行免疫分析 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 质谱细胞术和单细胞测序 | 基因工程小鼠模型 | 样本 | NA |
| 247 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analysis of Blood-Brain Barrier Response to Pericyte Loss
2021-02-19, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.120.317473
PMID:33375813
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研究论文 | 本研究揭示了缺失周细胞对脑内皮细胞转录变化的影响 | 首次从单细胞层面揭示了缺失周细胞对血脑屏障的复杂影响及其分子机制 | 研究中使用的是基因诱导的周细胞缺失小鼠模型，可能不完全反映人类病理状态 | 映射缺失周细胞接触对脑内皮细胞转录变化的影响，并与血脑屏障功能和血管表型的区域异质性进行关联 | 缺失周细胞接触的脑内皮细胞 | 数字病理学 | 脑部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用了成年Pdgfbret/ret小鼠进行研究 |
| 248 | 2024-08-05 |
Virally encoded connectivity transgenic overlay RNA sequencing (VECTORseq) defines projection neurons involved in sensorimotor integration
2021-12-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.110131
PMID:34936877
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研究论文 | 本研究开发了一种新的RNA测序方法，用于定义参与感觉运动整合的投射神经元 | 提出了一种简便的、多重的RNA测序方法VECTORseq，能够高通量确定神经元亚型 | 现有的测序方法通量较低，操作复杂且成本高 | 定义不同脑区间连接的投射神经元的生理和行为角色 | 参与感觉运动整合的投射神经元 | 神经科学 | NA | RNA测序 | NA | 单细胞数据集 | NA |
| 249 | 2024-08-05 |
Heterogeneity of human anti-viral immunity shaped by virus, tissue, age, and sex
2021-11-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.110071
PMID:34852222
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研究论文 | 本文揭示了病毒、组织、年龄和性别如何影响抗病毒T细胞免疫的维持和功能 | 通过综合分析病毒特异性T细胞，首次揭示了多种因素对抗病毒免疫的异质性影响 | 研究主要基于器官捐献者的样本，可能未能全面代表所有人群 | 探讨影响抗病毒免疫的多种因素及其相互作用 | 针对流感和巨细胞病毒的特异性CD8 T细胞 | 免疫学 | NA | 流式细胞术、T细胞受体测序、单细胞转录组学和细胞因子分析 | NA | 血液、淋巴器官和粘膜组织的细胞样本 | 基于器官捐献者的综合样本 |
| 250 | 2024-08-05 |
A novel Oct4/Pou5f1-like non-coding RNA controls neural maturation and mediates developmental effects of ethanol
2021 Jan-Feb, Neurotoxicology and teratology
IF:2.6Q3
DOI:10.1016/j.ntt.2020.106943
PMID:33221301
|
研究论文 | 这篇文章研究了一种新的非编码RNA如何影响神经元成熟和乙醇的发育效应。 | 发现了一种新的与Oct4/Pou5f1相关的非编码RNA mOct4pg9，它在神经干细胞的自我更新和乙醇暴露的影响中扮演了重要角色。 | 在研究中未详细阐述mOct4pg9的具体机制及其在不同发展阶段的作用 | 探讨乙醇暴露如何导致神经干细胞的丧失及其相关机制 | 小鼠胚胎皮质来源的神经干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | RNA | NA |
| 251 | 2024-08-05 |
Comprehensive RNA analysis of CSF reveals a role for CEACAM6 in lung cancer leptomeningeal metastases
2021-Oct-08, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-021-00228-6
PMID:34625644
|
研究论文 | 本研究综合使用单细胞RNA测序和游离RNA分析，揭示了CEACAM6在肺癌脑膜转移中的作用。 | 将单细胞RNA-seq与cfRNA分析结合，为NSCLC脑膜转移的诊断和机制提供了新的视角。 | 由于CSF中的癌细胞数量稀少，样本量有限，难以全面代表所有患者情况。 | 研究CEACAM6在肺癌脑膜转移中的作用及其基因表达特征。 | 怀疑有脑膜转移的非小细胞肺癌患者的脑脊液样本。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq，qPCR | NA | 细胞学，RNA数据 | 总共21个样本（14个脑膜转移患者，7个非肿瘤对照） |
| 252 | 2024-08-05 |
Single-cell insights into the hematopoietic generation of T-lymphocyte precursors in mouse and human
2021-03, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2020.12.005
PMID:33454362
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评论 | 该文章综述了小鼠和人类早期T细胞祖细胞的单细胞转录组研究 | 文章揭示了小鼠和人类之间在T细胞发育中的核心程序和物种间的变异 | 研究主要集中于胎儿和严格纯化的后天样本，可能缺乏其他发育阶段的全面性 | 旨在探讨T细胞潜能的分子要求及其早期发展 | 研究对象为小鼠和人类的早期T细胞祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人类的胎儿及后天严格纯化的样本 |
| 253 | 2024-08-05 |
No detectable alloreactive transcriptional responses under standard sample preparation conditions during donor-multiplexed single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells
2021-01-20, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-020-00941-x
PMID:33472616
|
研究论文 | 这篇文章探讨在标准样本制备条件下，混合来自无关供体的外周血单核细胞是否会引起可检测的异体反应。 | 首次评估在标准scRNA-seq样本制备条件下，混合外周血单核细胞是否导致显著的基因表达变化。 | 未考虑在其他样本制备条件下的潜在异体反应。 | 确定在单细胞RNA测序中的样本混合是否引起异体反应。 | 外周血单核细胞（PBMCs）来自无关供体。 | 数字病理学 | NA | 10x Genomics scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 一个供体的PBMCs，与无关供体的PBMCs混合 |
| 254 | 2024-08-05 |
Preparation of single cell suspensions enriched in mouse brain vascular cells for single-cell RNA sequencing
2021-09-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100715
PMID:34401781
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研究论文 | 本文建立了用于小鼠大脑血管细胞的单细胞RNA测序的细胞分离程序 | 创新性在于提供了一种高效的细胞分离方法以获取高质量的脑血管细胞 | 未提及具体的实验条件和样本来源的限制 | 研究目标是改善脑血管细胞的分离与表征以进行转录组分析 | 研究对象为小鼠脑血管细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 255 | 2024-08-05 |
Lentiviral vectors transduce lung stem cells without disrupting plasticity
2021-Sep-03, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2021.06.010
PMID:34458011
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研究论文 | 本研究探讨了逆转录病毒载体在不影响气道干细胞功能的情况下转导肺干细胞。 | 该研究首次证明了逆转录病毒载体转导不会改变气道干细胞的可塑性与功能。 | 研究主要针对人类囊性纤维化和非囊性纤维化肺供者的细胞，可能不适用于其他类型的肺病。 | 探讨病毒载体转导或治疗转基因的异位表达是否会影响气道干细胞的功能。 | 研究对象为来自人类囊性纤维化和非囊性纤维化肺供者的初级气道基底细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 逆转录病毒载体 | NA | 细胞文化 | 来自囊性纤维化和非囊性纤维化肺供者的初级气道基底细胞 |
| 256 | 2024-08-05 |
Intratumoral injection of caerin 1.1 and 1.9 peptides increases the efficacy of vaccinated TC-1 tumor-bearing mice with PD-1 blockade by modulating macrophage heterogeneity and the activation of CD8+ T cells in the tumor microenvironment
2021, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.1335
PMID:34429969
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研究论文 | 本文展示了结合E7抗原特异性免疫疗法及IL-10和PD-1阻断剂，局部注射caerin 1.1/1.9肽能增强TC-1肿瘤微环境的免疫活性 | 首次展示了caerin 1.1/1.9肽在结合抗PD-1治疗下对肿瘤免疫细胞类型的影响 | 该研究未详细探讨不同剂量的caerin肽对免疫反应的影响 | 改善临床免疫疗法对肿瘤的响应 | 接种E7抗原的TC-1肿瘤小鼠 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术、单细胞转录组学与蛋白质组学 | NA | 细胞, 蛋白质 | 受试者为接种E7抗原的TC-1肿瘤小鼠 |
| 257 | 2024-08-05 |
Categorization of lung mesenchymal cells in development and fibrosis
2021-Jun-25, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102551
PMID:34151224
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研究论文 | 该文章探讨了肺间充质细胞在发育和纤维化过程中的分类及其转录组特征 | 本研究识别并描绘了一种新的细胞群体，并描述了细胞亚型特异性转录因子 | 未明确提出该研究的具体局限性 | 研究肺间充质细胞的异质性及其在发育和纤维化中的作用 | 小鼠和人类的肺间充质细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人类的胚胎、出生后、成人及老年期的纤维化肺中间充质细胞 |
| 258 | 2024-08-05 |
The derepression of transposable elements in lung cells is associated with the inflammatory response and gene activation in idiopathic pulmonary fibrosis
2021-Jun-09, Mobile DNA
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13100-021-00241-3
PMID:34108012
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研究论文 | 本文探讨了转座元件在特发性肺纤维化中的去抑制与炎症反应和基因激活的关联 | 研究首次展示了转座元件在特发性肺纤维化患者肺细胞中的失调与基因表达和炎症反应的关联 | 研究中仅使用了24名样本，可能无法全面代表特发性肺纤维化患者的多样性 | 确定转座元件是否与特发性肺纤维化相关 | 健康供体与特发性肺纤维化患者的肺细胞转录组 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 24名受试者（16名健康供体和8名特发性肺纤维化患者） |
| 259 | 2024-08-05 |
Uphyloplot2: visualizing phylogenetic trees from single-cell RNA-seq data
2021-Jun-05, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-021-07739-3
PMID:34090344
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研究论文 | Uphyloplot2是一种可视化单细胞RNA测序数据的系统。 | 该工具能够直接从推断的RNA-seq数据或Newick格式的树状图文件生成系统发育图，简化了以往繁琐的手动分析。 | 目前没有提及该工具的具体限制。 | 本研究旨在提供一种简单的工具，以从单细胞RNA-seq数据及其他来源生成系统发育图，以展示肿瘤的克隆性。 | 研究对象是通过单细胞RNA测序获得的肿瘤细胞数据。 | 数字病理学 | 肿瘤 | RNA-seq | NA | RNA测序数据 | NA |
| 260 | 2024-08-05 |
Naive stem cell blastocyst model captures human embryo lineage segregation
2021-06-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.04.031
PMID:33957081
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研究论文 | 本研究描述了一种通过自组织生成的人类胚胎模型（blastoids），模拟了自然的囊胚。 | 该文章创新地提出了一种灵活且可扩展的系统，为人类胚胎研究提供了稳定的实验模型。 | NA | 研究人类胚胎的发育过程及其细胞系分离机制。 | 人类天真多能细胞及其分化成囊胚的过程。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | NA | NA |