单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2024-08-05 |
TWO-SIGMA: A novel two-component single cell model-based association method for single-cell RNA-seq data
2021-03, Genetic epidemiology
IF:1.7Q3
DOI:10.1002/gepi.22361
PMID:32989764
|
研究论文 | 本文开发了TWO-SIGMA，一种基于单细胞模型的关联方法，用于单细胞RNA-seq数据的差异表达分析 | TWO-SIGMA是唯一一种能够同时具备多项灵活特性的scRNA-seq数据分析方法 | NA | 旨在改进单细胞RNA-seq数据的差异表达分析方法 | 单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 混合效应回归模型 | 数据计数 | 使用胰腺胰岛单细胞的实证分析 |
| 242 | 2024-08-05 |
Identification and Characterization of Antigen-Specific CD8+ T Cells Using Surface-Trapped TNF-α and Single-Cell Sequencing
2021-12-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100535
PMID:34810222
|
研究论文 | 本研究介绍了一种快速识别和表征抗原特异性CD8 T细胞的新系统 | 该系统利用表面捕获的TNF-α和单细胞测序的重大进展，构建了几乎无限的实验试剂 | 实验方法依然受到初级细胞数量的限制，且MHC结合肽/TCR相互作用的高度变异性仍然是挑战 | 研究抗原特异性CD8 T细胞的识别和表征，促进疾病研究和治疗开发 | 来自猕猴和HIV感染供体的抗原特异性CD8 T细胞 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 来自猕猴的CMV特异性CD8 T细胞和HIV感染供体的样本 |
| 243 | 2024-08-05 |
TNF plays a crucial role in inflammation by signaling via T cell TNFR2
2021-12-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2109972118
PMID:34873037
|
研究论文 | 这篇文章探讨了TNF在炎症中的关键角色及其通过T细胞TNFR2信号传导的机制 | 该研究首次阐明了TNF不仅作为效应因子，还作为炎症Th分化的启动因子 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类疾病状态中验证 | 研究TNF在调节炎症和Th细胞分化中的作用 | 小鼠CD4 T细胞及其在实验性自体免疫性脑脊髓炎中的表现 | 免疫学 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠CD4 T细胞和来自多发性硬化患者的脑脊液浸润CD4 T细胞 |
| 244 | 2024-08-05 |
Alternative poly-adenylation modulates α1-antitrypsin expression in chronic obstructive pulmonary disease
2021-11, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009912
PMID:34784346
|
研究论文 | 该研究探讨了α1-抗胰蛋白酶在慢性阻塞性肺病（COPD）中的表达与选择性聚腺苷酸化之间的关系 | 本研究揭示了影响SERPINA1 mRNA翻译的多种RNA结合蛋白，并确定了QKI作为一种调节剂的作用 | 本研究的局限性在于只在特定样本中进行观察，无法广泛推广这些发现 | 研究α1-抗胰蛋白酶在非缺乏个体中的作用及其在COPD中的调控机制 | 该研究对象包括82例COPD患者和64名对照组，以及独立验证的376例COPD患者和267名对照组 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | RNA-seq | NA | RNA | 82例COPD患者和64名对照组，及独立研究中的376例COPD患者和267名对照组 |
| 245 | 2024-08-05 |
Identification of cell-type-specific marker genes from co-expression patterns in tissue samples
2021-Oct-11, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab257
PMID:33904573
|
研究论文 | 本文提出了一种新算法，通过分析组织样本中的共表达模式来识别细胞特异性标志基因 | 提出了一种半监督算法，结合已知标志基因的信息和大规模转录组数据来精确识别标志基因 | 研究依赖于已发表的可能标志基因的信息，可能影响算法的准确性 | 识别组织样本中特定细胞类型的标志基因 | 组织样本中的细胞类型标志基因 | 数字病理学 | NA | 转录组测序 | 半监督算法 | 大规模转录组数据 | 多个组织样本 |
| 246 | 2024-08-05 |
Improved integration of single-cell transcriptome and surface protein expression by LinQ-View
2021-08-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2021.100056
PMID:35475142
|
研究论文 | 提出了一种名为LinQ-View的工具包，用于单细胞数据的多模态可视化和分析 | LinQ-View能够整合转录组和细胞表面蛋白表达数据，提供量化的群体纯度评估指标 | 目前数据的应用主要集中在CITE-seq数据上，可能限制了其广泛适用性 | 研究单细胞转录组与表面蛋白表达的集成分析 | 针对受SARS-CoV-2感染患者的单细胞转录组和蛋白表达数据 | 数字病理学 | NA | CITE-seq | NA | 单细胞转录组与蛋白表达数据 | 多个公共CITE-seq数据集 |
| 247 | 2024-08-05 |
Distinct populations of antigen-specific tissue-resident CD8+ T cells in human cervix mucosa
2021-08-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.149950
PMID:34156975
|
研究论文 | 研究了人类宫颈黏膜中抗原特异性组织驻留CD8+ T细胞的不同群体 | 首次通过单细胞RNA测序定义了人类宫颈中组织驻留记忆T细胞的表型和TCR克隆型 | 缺乏广泛关于人类FRT中T细胞受体库的全面知识 | 研究人类宫颈中组织驻留记忆T细胞的特征及其与特定病毒抗原的关系 | 主要研究人类宫颈黏膜中的CD8+ T细胞亚群 | 数字病理学 | 性传播感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | HSV-2血清阳性个体中的Cervical CD8+ TRM克隆型，具体数量未提供 |
| 248 | 2024-08-05 |
Mucosal-associated invariant T cell responses differ by sex in COVID-19
2021-06-11, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2021.04.008
PMID:33870241
|
研究论文 | 该研究探讨了COVID-19中粘膜相关不变T细胞反应在性别上的差异 | 揭示了女性特有的保护性MAIT细胞特征，可能解释了女性在COVID-19中的低感染率 | 尚未完全了解导致免疫反应性别差异的机制 | 研究性别对COVID-19免疫反应的影响 | 医院和非医院COVID-19感染者的外周血单核细胞样本 | 数字病理学 | COVID-19 | 36色流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 血液样本 | 包括住院和未住院的COVID-19感染者、未感染的密切接触者和健康对照个体的样本 |
| 249 | 2024-08-05 |
Profiling B cell immunodominance after SARS-CoV-2 infection reveals antibody evolution to non-neutralizing viral targets
2021-06-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.05.001
PMID:34022127
|
研究论文 | 这篇文章解析了SARS-CoV-2感染后记忆B细胞的演变，揭示了抗体对非中和病毒靶点的进化 | 首次通过单细胞测序分析COVID-19患者的SARS-CoV-2反应性B细胞，并揭示了抗体对非中和内源性抗原的适应性 | 研究样本仅限于38名COVID-19患者，可能限制了结果的普适性 | 了解SARS-CoV-2感染后记忆B细胞的演变及其对二次暴露时抗体的重要性 | 研究对象为38名COVID-19患者的记忆B细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 38名COVID-19患者 |
| 250 | 2024-08-05 |
Ubiquitination of MHC Class II by March-I Regulates Dendritic Cell Fitness
2021-02-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2000975
PMID:33318291
|
研究论文 | 本研究显示，MHC类II的泛素化通过March-I调节树突状细胞的功能和生存 | 揭示了MHC类II的泛素化在树突状细胞功能中的重要性，并发现其缺失会影响到T细胞的激活能力 | 研究主要集中在小鼠模型中，未探讨人类树突状细胞的类似机制 | 探索MHC类II泛素化对树突状细胞及其激活CD4 T细胞能力的影响 | MHC类II泛素化缺失的小鼠树突状细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠树突状细胞 |
| 251 | 2024-08-05 |
Glycolytic metabolism of pathogenic T cells enables early detection of GVHD by 13C-MRI
2021-01-07, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020005770
PMID:32785680
|
研究论文 | 本研究探讨了糖酵解代谢在早期检测移植物抗宿主病(GVHD)中的应用 | 提出了一种利用磁共振成像技术检测活化CD4+ T细胞糖酵解代谢，以实现GVHD的非侵入性早期检测的方法 | 该研究的IV型数据尚不完善，缺乏足够临床研究验证所述结果的有效性 | 旨在通过代谢成像技术，提供一种非侵入性方式早期检测GVHD | 主要研究活化的CD4+ T细胞与糖酵解过程在GVHD发病机制中的作用 | 数字病理学 | 移植物抗宿主病 | 超极化13C-丙酮酸磁共振成像 | 动物模型 | 代谢成像数据和转录组数据 | 在小鼠模型中进行，临床样本数据来源于接受AHSCT的患者 |
| 252 | 2024-08-05 |
The NF-κB regulator Bcl-3 restricts terminal differentiation and promotes memory cell formation of CD8+ T cells during viral infection
2021-01, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1009249
PMID:33508001
|
研究论文 | 本研究记录了Bcl-3在CD8+ T细胞分化中的细胞自主作用 | 首次明确了Bcl-3在CD8+ T细胞分化过程中对记忆细胞和终末效应细胞平衡的自主决定作用 | 尚未清晰定义Bcl-3在各免疫细胞类型中的直接作用 | 探讨Bcl-3在病毒感染中CD8+ T细胞的分化角色 | Bcl-3缺失的CD8+ T细胞在病毒感染过程中的分化 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞类型 | 使用了Bcl3-/-小鼠的CD8+ T细胞进行分析 |
| 253 | 2024-08-05 |
B-cells are abnormal in psychosocial stress and regulate meningeal myeloid cell activation
2021-10, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2021.08.002
PMID:34371135
|
研究论文 | 该文章研究了心理社会压力下B细胞的异常表现及其对脑膜髓系细胞激活的调控作用 | 首次揭示了心理社会压力下B细胞的活化及其对脑膜免疫细胞功能的影响 | 主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类的情况 | 探究B细胞在心理社会压力下对脑功能的影响 | 小鼠模型中的B细胞和脑膜髓系细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠样本 |
| 254 | 2024-08-05 |
Automated quality control and cell identification of droplet-based single-cell data using dropkick
2021-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.271908.120
PMID:33837131
|
研究论文 | 开发了一种名为dropkick的全自动软件工具，用于单细胞RNA测序数据的质量控制和细胞识别 | dropkick能够自动确定数据集特定的训练标签，并学习真实细胞和环境噪声的基因表示，从而提高细胞识别的准确性和效率 | 在特定情况下，dropkick的性能可能受到数据集的技术噪声和背景变化的影响 | 研究单细胞RNA测序数据的质量控制和细胞筛选方法 | 主要研究单细胞RNA测序数据中的真正细胞与非信息条形码的区分 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 弱监督模型 | 模拟和真实的单细胞RNA测序数据 | NA |
| 255 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptional mapping of the human nephrogenic program
2021-08-23, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2021.07.017
PMID:34428401
|
研究论文 | 本文建立了人类肾小管发育的空间转录组图谱 | 首次通过空间解析手段揭示了人类肾小管发育的过程，并构建了蛋白质三维图谱 | 样本数量和来源可能影响结果的普遍性 | 旨在建立人类肾小管发育的框架，以促进对肾脏发展和疾病的理解 | 人类肾小管的前体细胞及其发育 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 三维蛋白质图谱 | 一百万个肾小管前体细胞 |
| 256 | 2024-08-05 |
Genome-wide CRISPRi/a screens in human neurons link lysosomal failure to ferroptosis
2021-07, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-021-00862-0
PMID:34031600
|
研究论文 | 本文展示了在人类神经元中进行的首个全基因组CRISPR干扰和激活筛选。 | 揭示了溶酶体蛋白prosaposin的下调如何选择性地增强神经元对氧化压力的敏感性，从而引发铁死亡的机制。 | 研究主要集中在神经元类型，其他细胞类型的反应未全面阐述。 | 系统理解不同人类细胞类型的基因功能。 | 人类神经元及其对慢性氧化压力的响应机制。 | 功能基因组学 | 神经退行性疾病 | CRISPR干扰和激活 | NA | 转录组数据 | NA |
| 257 | 2024-08-05 |
Regulation of Immune Responses by Nonhematopoietic Cells in Asthma
2021-01-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2000885
PMID:33397743
|
研究论文 | 非造血细胞在哮喘中调节免疫反应的重要性 | 本研究揭示了不同肺驻留非造血细胞群体中的单个基因如何影响哮喘的发起和维持 | 本研究未详细探讨所有非造血细胞的免疫功能和相互作用 | 研究非造血细胞在哮喘中的作用及其对免疫反应的调节 | 不同肺驻留非造血细胞和传统免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 过敏性哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 258 | 2024-08-05 |
Matters of the heart: Cellular sex differences
2021-11, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2021.04.010
PMID:34166708
|
研究论文 | 本文探讨了心脏中男性和女性细胞的差异，特别是非肌肉细胞类型 | 探讨了细胞性别在心脏健康和疾病中的差异，强调了微环境对细胞表型的影响 | 许多研究未报告细胞的性别，且多数研究使用的细胞来自男性 | 研究心脏中细胞性别差异及其对心脏健康和疾病的影响 | 哺乳动物心脏的男性和女性细胞，包括非肌肉细胞族群 | 数字病理 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 259 | 2024-08-05 |
Unfolded Protein Response as a Compensatory Mechanism and Potential Therapeutic Target in PLN R14del Cardiomyopathy
2021-08-03, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究探讨了PLN R14del心肌病中的未折叠蛋白反应（UPR）作为补偿机制和潜在的治疗靶点 | 揭示了PLN R14del患者心脏中的UPR通路的激活，以及通过小分子激活剂改善心肌收缩缺陷的治疗潜力 | 该研究未提及使用人类临床数据验证治疗效果的局限性 | 探讨PLN R14del心肌病的机制和潜在的治疗方法 | 使用人源诱导多能干细胞的心肌细胞（hiPSC-CMs）作为研究对象 | 数字病理学 | 心肌病 | 单细胞RNA测序 | 同源异基因hiPSC-CMs | 细胞生物数据 | 使用的样本数量和种类未具体指明 |
| 260 | 2024-08-05 |
Cis P-tau underlies vascular contribution to cognitive impairment and dementia and can be effectively targeted by immunotherapy in mice
2021-06-02, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aaz7615
PMID:34078745
|
研究论文 | 该研究探讨了Cis P-tau在血管性认知障碍和痴呆中的作用及其免疫治疗潜力 | 本研究首次明确了Cis P-tau在血管性认知障碍和阿尔茨海默病中的关键作用，并提出了针对它的免疫治疗策略 | 本研究主要基于小鼠模型，尚需在临床人群中验证 | 研究Cis P-tau在血管性认知障碍和阿尔茨海默病中的作用及其治疗潜力 | 小鼠模型和血管性认知障碍及阿尔茨海默病患者 | 数字病理学 | 血管性认知障碍，阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，免疫治疗 | 小鼠模型 | 文本，RNA测序数据 | 小鼠模型及患者样本 |