单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 2541 - 2560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2541 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics reveal the intratumoral landscape of infiltrated T-cell subpopulations in oral squamous cell carcinoma
2021-04, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.12910
PMID:33513276
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了口腔鳞状细胞癌中的肿瘤浸润T细胞亚群的内在景观 | 首次揭示了口腔鳞状细胞癌中14种不同的T细胞亚群及其发育轨迹，并发现了与肿瘤免疫抑制相关的标志基因 | 研究样本仅来自三位患者，可能影响结果的普遍性 | 深入了解口腔鳞状细胞癌中T细胞的功能状态和异质性，以推动新型治疗策略的发展 | 口腔鳞状细胞癌中的肿瘤浸润T细胞 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11,866个单个T细胞样本来自三位患者 |
| 2542 | 2024-08-09 |
Characteristics of B lymphocyte infiltration in HPV+ head and neck squamous cell carcinoma
2021-Apr, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.14834
PMID:33529452
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研究论文 | 本研究旨在检测人乳头瘤病毒（HPV）相关头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中B淋巴细胞亚群的浸润及其与预后的相关性 | 首次详细分析了HPV阳性HNSCC中B淋巴细胞亚群的浸润情况及其与预后的关系，并探讨了CD4 T淋巴细胞通过CXCL13/CXCR5轴对B淋巴细胞及其亚群的影响 | 研究样本量相对较小，且仅使用了公开数据库中的数据，可能限制了结果的普遍性 | 探讨HPV相关HNSCC中B淋巴细胞亚群的浸润与患者预后的关系 | HPV阳性的头颈部鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 免疫组织化学、免疫荧光、单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 124个HPV阳性和513个HPV阴性的HNSCC样本 |
| 2543 | 2024-08-09 |
Skin-resident innate lymphoid cells converge on a pathogenic effector state
2021-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03188-w
PMID:33536623
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研究论文 | 本文研究了皮肤驻留的先天淋巴细胞（ILCs）在银屑病中的作用，发现IL-23或imiquimod诱导的小鼠银屑病模型中，皮肤ILCs会转变为类似病原性ILC3的状态。 | 首次展示了皮肤ILCs在银屑病诱导下会转变为病原性ILC3样状态，并通过单细胞RNA测序和单细胞染色质可及性测序验证了这一转变。 | 研究主要在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证这些发现。 | 探讨皮肤驻留的先天淋巴细胞在银屑病中的作用及其细胞状态的转变。 | 皮肤驻留的先天淋巴细胞（ILCs）及其在银屑病中的作用。 | 免疫学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞染色质可及性测序（scATAC-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠皮肤ILCs样本 |
| 2544 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomes of mouse bladder urothelium uncover novel cell type markers and urothelial differentiation characteristics
2021-Apr, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13007
PMID:33538002
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术全面表征了小鼠膀胱上皮细胞，揭示了新的细胞类型标记和上皮细胞分化特征 | 发现了由Plxna4标记的新型膀胱上皮细胞类型，可能与宿主反应和伤口愈合有关；识别出ASPM标记的基底样细胞，可能是成年膀胱上皮的祖细胞 | NA | 全面绘制膀胱上皮细胞的细胞解剖图谱 | 小鼠膀胱上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 18,917个单细胞 |
| 2545 | 2024-08-09 |
A novel CD4+ CTL subtype characterized by chemotaxis and inflammation is involved in the pathogenesis of Graves' orbitopathy
2021-03, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-020-00615-2
PMID:33514849
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、T细胞受体测序、流式细胞术、免疫荧光和混合淋巴细胞反应等方法，鉴定出一种新的CD4+细胞毒性T淋巴细胞亚型，该亚型具有趋化性和炎症特征，并参与了Graves眼病的病理过程 | 发现了一种新的Graves眼病特异性的CD4+细胞毒性T淋巴细胞亚型，该亚型具有趋化性和炎症特征，并通过克隆扩增和强细胞毒性反应证实其在疾病中的致病作用 | NA | 探索驱动Graves眼病进展的致病性CD4+ T细胞类型 | Graves眼病和Graves甲状腺功能亢进症患者的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、T细胞受体测序（TCR-Seq）、流式细胞术、免疫荧光和混合淋巴细胞反应（MLR） | NA | 细胞 | Graves眼病和Graves甲状腺功能亢进症患者的CD4+ T细胞 |
| 2546 | 2024-08-09 |
Study Offers Insights into Gastric Cancer
2021-03, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-NB2021-0305
PMID:33526445
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了转移到腹膜腔的胃癌异质性，并识别出两种与患者生存差异相关的细胞类型 | 首次通过单细胞测序技术详细描述了胃癌转移至腹膜腔的细胞异质性，并开发了新的预后基因表达特征 | NA | 探索胃癌转移至腹膜腔的细胞异质性及其对患者生存的影响 | 胃癌转移至腹膜腔的细胞类型及其对患者生存的影响 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
| 2547 | 2024-08-09 |
The Roles of T cells in Bladder Pathologies
2021-03, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2021.01.003
PMID:33536141
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研究论文 | 本文探讨了T淋巴细胞在膀胱疾病中的作用，包括细菌感染、膀胱癌和慢性炎症 | 利用单细胞RNA测序和报告小鼠等新技术，揭示了T细胞在膀胱免疫中的新角色 | NA | 研究T细胞在膀胱疾病中的作用及其潜在的免疫治疗价值 | T细胞在膀胱疾病中的作用 | 免疫学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 2548 | 2024-08-09 |
SiglecF(HI) Marks Late-Stage Neutrophils of the Infarcted Heart: A Single-Cell Transcriptomic Analysis of Neutrophil Diversification
2021-02-16, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.120.019019
PMID:33525909
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，探讨了心肌梗死（MI）后中性粒细胞的分化和动态变化 | 首次揭示了心肌梗死后中性粒细胞的多样化，特别是SiglecF标记的晚期中性粒细胞的发现和特性 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探究心肌梗死后中性粒细胞的分化和动态变化 | 心肌梗死后的中性粒细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过28,000个中性粒细胞转录组 |
| 2549 | 2024-08-09 |
SATB2 induction of a neural crest mesenchyme-like program drives melanoma invasion and drug resistance
2021-02-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.64370
PMID:33527896
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研究论文 | 本文通过过表达筛选80种表观遗传/转录调节因子，发现神经嵴间质发育调节因子SATB2能加速黑色素瘤的侵袭性发展，并诱导zebrafish肿瘤和人类黑色素瘤细胞系的侵袭和药物抗性 | 首次发现SATB2通过诱导神经嵴间质样程序，驱动黑色素瘤的侵袭和药物抗性 | NA | 测试转录适应是否能驱动黑色素瘤的进展 | SATB2在黑色素瘤侵袭和药物抗性中的作用 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 80种表观遗传/转录调节因子 |
| 2550 | 2024-08-09 |
CNS fibroblasts form a fibrotic scar in response to immune cell infiltration
2021-02, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-020-00770-9
PMID:33526922
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研究论文 | 本文研究了中枢神经系统（CNS）纤维母细胞在免疫细胞浸润后形成纤维化瘢痕的过程 | 首次确定CNS纤维化瘢痕主要来源于增殖的CNS纤维母细胞，而非周细胞或浸润的骨髓来源细胞，并通过特定细胞表达的疱疹胸苷激酶敲除增殖的纤维化细胞，观察到运动障碍的减少 | NA | 探讨CNS在免疫细胞浸润后的纤维化反应机制 | CNS纤维母细胞、纤维化瘢痕、免疫细胞浸润 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 实验使用了实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）小鼠模型 |
| 2551 | 2024-08-09 |
UMI or not UMI, that is the question for scRNA-seq zero-inflation
2021-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-00810-6
PMID:33526946
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2552 | 2024-08-09 |
Reply to: UMI or not UMI, that is the question for scRNA-seq zero-inflation
2021-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-00811-5
PMID:33526947
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2553 | 2024-08-09 |
mRNA-1273 efficacy in a severe COVID-19 model: attenuated activation of pulmonary immune cells after challenge
2021-Jan-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2021.01.25.428136
PMID:33532780
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研究论文 | 本文研究了mRNA-1273疫苗在严重COVID-19模型中的效果，发现该疫苗能减轻肺部免疫细胞的激活 | 使用单细胞RNA测序技术分析了接种mRNA-1273疫苗的仓鼠肺组织，提供了人类接种疫苗后肺部潜在反应的见解 | 研究仅限于仓鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 评估mRNA-1273疫苗在严重COVID-19模型中的效果 | mRNA-1273疫苗在仓鼠模型中的免疫反应和保护效果 | 疫苗学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 仓鼠 |
| 2554 | 2024-08-09 |
Tb3+-doped fluorescent glass for biology
2021-01, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abd2529
PMID:33523970
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研究论文 | 介绍了一种含稀土离子铽(III)的新型硼硅酸盐玻璃材料，该材料在蓝光激发下发出绿色荧光，适用于常规生物研究环境 | 开发了一种新型Tb3+掺杂荧光玻璃，可用于单细胞电穿孔、单细胞转录组分析和活体神经元在线光学定位 | NA | 探索Tb3+掺杂荧光玻璃在生物实验中的应用 | Tb3+掺杂荧光玻璃及其在生物实验中的应用 | 生物技术 | NA | 荧光显微镜控制下的单细胞电穿孔、单细胞转录组分析和膜片钳记录 | NA | 荧光信号 | NA |
| 2555 | 2024-08-09 |
Identification of the Different Gene Expression Characteristics from Liver Cirrhosis to Hepatocellular Carcinoma Using Single-Cell Sequencing Analyses
2021, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2021/6619302
PMID:33532508
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研究论文 | 利用单细胞测序技术分析从肝硬化到肝细胞癌的基因表达特征 | 首次在单细胞分辨率下分析肝细胞癌和肝硬化组织的转录组比较，并发现了与患者生存率相关的特定基因 | 研究依赖于已发表的单细胞测序数据库，可能限制了结果的全面性 | 深入理解肝细胞癌的分子生物学机制 | 肝细胞癌和肝硬化组织的基因表达特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序技术（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 2556 | 2024-08-09 |
Application of Microfluidics in Single-cell Manipulation, Omics and Drug Development
2021, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本文综述了微流控技术在单细胞操作、组学和药物开发中的应用 | 微流控技术为单细胞研究提供了一个灵活、精确的工具，能够揭示细胞异质性并应用于药物开发 | NA | 总结和介绍微流控技术在单细胞分离和操作、单细胞组学以及药物开发中的应用 | 微流控技术在单细胞层面的应用 | 生物技术 | NA | 微流控技术 | NA | 细胞 | NA |
| 2557 | 2024-08-09 |
DOCK11 and DENND2A play pivotal roles in the maintenance of hepatitis B virus in host cells
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0246313
PMID:33539396
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了DOCK11和DENND2A在维持HBV在宿主细胞中潜伏状态的关键作用 | 首次发现DOCK11和DENND2A基因在维持HBV潜伏状态中的作用 | 研究仅限于肝细胞系和初级人肝细胞，可能需要进一步在更广泛的细胞类型中验证 | 探究HBV在宿主细胞中维持潜伏状态的机制 | DOCK11和DENND2A基因在HBV感染中的作用 | NA | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 肝细胞系和初级人肝细胞 |
| 2558 | 2024-08-09 |
Single cell transcriptomic analysis identifies novel vascular smooth muscle subsets under high hydrostatic pressure
2021-Oct, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-020-1852-x
PMID:33486587
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研究论文 | 本研究构建了一个高静水压细胞培养系统，模拟持续高血压环境，并通过单细胞转录组分析鉴定了人类主动脉平滑肌细胞（HASMCs）的新型分子分类 | 发现了两种新型HASMC亚群，即炎症亚群和内皮功能抑制亚群，这些亚群在高静水压下表现出不同的基因表达模式，并参与调节内皮功能 | NA | 探究高血压进展中直接的生物力学效应 | 人类主动脉平滑肌细胞（HASMCs）在高静水压下的分子分类 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 在100-mmHg和200-mmHg静水压下培养的HASMCs，以及来自高血压患者和实验动物模型高血压的动脉中膜样本 |
| 2559 | 2024-08-09 |
DSTG: deconvoluting spatial transcriptomics data through graph-based artificial intelligence
2021-09-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa414
PMID:33480403
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研究论文 | 本文提出了一种名为DSTG的新方法，通过基于图的卷积网络对空间转录组数据进行解卷积，以揭示组织内细胞异质性的空间结构 | DSTG方法能够准确地解卷积每个spot的观察基因表达并恢复其细胞组成，实现了高水平的分割 | NA | 研究旨在通过解卷积空间转录组数据来揭示组织细胞异质性的空间结构 | 研究对象包括小鼠大脑皮层层、海马切片和胰腺肿瘤组织 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 图卷积网络 | 转录组数据 | 涉及小鼠大脑皮层层、海马切片和胰腺肿瘤组织 |
| 2560 | 2024-08-09 |
Elucidating the cellular dynamics of the brain with single-cell RNA sequencing
2021-07, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2020.1870362
PMID:33499699
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在过去十年的发展及其在神经科学领域的应用 | 介绍了多组学适应和空间转录组学工作流程的最新进展，这些技术能够从单个细胞中收集更全面的信息 | NA | 探讨scRNA-seq技术的发展及其在神经科学中的应用，特别是在健康和疾病状态下对神经系统基本细胞动态和分子机制的理解 | 单细胞RNA测序技术及其在神经科学中的应用 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |