单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 2885 篇文献,本页显示第 2521 - 2540 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
2521 2024-08-09
Endothelium-derived stromal cells contribute to hematopoietic bone marrow niche formation
2021-04-01, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本文揭示了来源于内皮细胞的骨髓基质细胞在骨髓微环境形成中的作用 首次鉴定出在人类胎儿和再生骨髓中表达内皮和基质标记物的稀有LNGFR细胞,并证明这些细胞通过内皮间质转化(EndoMT)产生多能基质细胞,这些细胞在移植后能够重建骨髓微环境 NA 探讨骨髓基质细胞的起源及其在骨髓微环境形成中的作用 人类胎儿和再生骨髓中的LNGFR细胞 NA NA 单细胞转录组学和谱系追踪 NA 转录组数据 NA
2522 2024-08-09
Single-cell transcriptional analysis reveals developmental stage-dependent changes in retinal progenitors in the murine early optic vesicle
2021-03-05, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠早期视泡中视网膜前体细胞在不同发育阶段转录组的变化 首次报道了在单细胞分辨率下,视网膜初始分化阶段依赖性的转录组特征,并揭示了小鼠视泡结构在发育过程中的意外异质性 NA 研究早期视泡中细胞类型的多样性及其在视杯区域化之前的转录组变化 小鼠早期视泡中的视网膜前体细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 7989个细胞
2523 2024-08-09
Gene expression pattern of trophoblast-specific transcription factors in trophectoderm by analysis of single-cell RNA-seq data of human blastocyst
2021-Mar, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过重新分析来自两个独立组的植入后胚胎的单细胞RNA测序数据,鉴定了不同类型的滋养层细胞及其标记物,并关注了滋养层特异性转录因子在不同模型中的基因表达模式。 本研究利用单细胞测序技术,首次在人类胚胎植入后阶段对滋养层细胞的转录调控机制进行了深入分析。 研究主要依赖于体外培养的滋养层细胞模型,可能与体内实际情况存在差异。 揭示人类妊娠早期滋养层细胞分化的转录调控机制。 人类植入后胚胎的滋养层细胞及其特异性转录因子。 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 来自两个独立组的植入后胚胎样本
2524 2024-08-09
Exploring the secrets of brain transcriptional regulation: developing methodologies, recent significant findings, and perspectives
2021-Mar, Brain structure & function IF:2.7Q3
综述 本文综述了大脑转录调控的分子多样性,并讨论了非编码DNA/RNA在转录/后转录水平的分子机制,以及时空和单细胞转录组学在脑发育和疾病进展中的应用 利用最新的技术进步,深入探讨了大脑中复杂的转录网络,并尝试通过时空和单细胞转录组学获得对脑发育和疾病进展的新见解 尽管取得了显著进展,但该领域仍面临许多挑战需要解决 探索和揭示人类大脑功能的秘密,特别是大脑转录调控的分子机制 大脑的转录调控机制,包括基因表达的空间和时间变化与大脑结构和功能的关系 NA NA 时空和单细胞转录组学 NA 转录组数据 涉及啮齿动物、非人类灵长类和人类的大脑
2525 2024-08-09
Activin A promotes the development of acquired heterotopic ossification and is an effective target for disease attenuation in mice
2021-02-09, Science signaling IF:6.7Q1
研究论文 本文研究了激活素A在异位骨化(HO)发展中的作用,并探讨了其作为治疗靶点的潜力。 发现激活素A是异位骨化的关键上游信号刺激因子,并证明了通过中和抗体阻断激活素A可以减少HO的发展和骨积累。 NA 探讨激活素A在异位骨化中的作用及其作为治疗靶点的有效性。 异位骨化的发展和激活素A的作用。 NA 异位骨化 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 使用小鼠模型进行研究
2526 2024-08-09
Atypical B cells are part of an alternative lineage of B cells that participates in responses to vaccination and infection in humans
2021-02-09, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了健康个体和疟疾暴露个体中抗原特异性B细胞和总B细胞的多样性 揭示了两种B细胞谱系:经典的激活和静息记忆B细胞谱系以及包括先前描述的非典型B细胞在内的替代谱系 NA 研究人类B细胞的多样性及其在疫苗接种和感染反应中的作用 健康个体和疟疾暴露个体的B细胞 免疫学 疟疾 单细胞RNA测序 NA RNA-seq数据 健康个体和疟疾暴露个体的B细胞样本
2527 2024-08-09
Natural genetic variation determines microglia heterogeneity in wild-derived mouse models of Alzheimer's disease
2021-02-09, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了C57BL/6J和野生型小鼠的微胶质细胞,探讨了遗传多样性对阿尔茨海默病模型中微胶质细胞特征和动态变化的影响 首次展示了遗传多样性对微胶质细胞在基础神经免疫功能和淀粉样病变反应中的显著影响,并揭示了与人类阿尔茨海默病相关基因的表达差异 NA 探讨遗传多样性如何影响微胶质细胞在阿尔茨海默病模型中的异质性 C57BL/6J和野生型小鼠的微胶质细胞 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 包括C57BL/6J和三种野生型小鼠(WSB/EiJ, CAST/EiJ, PWK/PhJ)的微胶质细胞
2528 2024-08-09
Single-cell profiling identifies pre-existing CD19-negative subclones in a B-ALL patient with CD19-negative relapse after CAR-T therapy
2021-02-08, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了在接受CAR-T治疗后复发的B-ALL患者中,存在预先存在的CD19阴性亚克隆 首次通过单细胞RNA测序技术证明CAR-T治疗前已存在CD19阴性白血病细胞,这些细胞在治疗后被选择性扩增导致复发 研究样本仅为单一病例,可能限制了结果的普遍性 探究CAR-T治疗后B-ALL患者复发的原因,并评估单细胞RNA测序技术在预测靶向治疗失败风险中的应用 B-ALL患者的白血病细胞及其在CAR-T治疗前后的变化 数字病理学 急性淋巴细胞白血病 单细胞RNA测序 NA RNA 单一B-ALL患者
2529 2024-08-09
Identification and characterization of neutrophil heterogeneity in sepsis
2021-02-06, Critical care (London, England)
研究论文 本研究通过小鼠CLP模型和单细胞基因测序技术,探讨了脓毒症过程中中性粒细胞的异质性及其免疫功能 首次揭示了脓毒症晚期中性粒细胞的多种功能障碍,并通过单细胞RNA测序技术发现了中性粒细胞的多个亚群 研究主要基于小鼠模型,可能与人类脓毒症的实际情况存在差异 探讨脓毒症过程中中性粒细胞的异质性及其免疫功能 中性粒细胞在脓毒症中的异质性和功能 免疫学 脓毒症 单细胞基因测序技术 NA 基因表达数据 小鼠模型中的中性粒细胞
2530 2024-08-09
Follicular Lymphoma Microenvironment: An Intricate Network Ready for Therapeutic Intervention
2021-Feb-05, Cancers IF:4.5Q1
综述 本文综述了滤泡性淋巴瘤(FL)微环境的复杂网络及其在疾病发生、进展和异质性中的作用,并探讨了针对该微环境的新型治疗策略。 利用最新的技术如全外显子测序、单细胞RNA测序和质谱流式细胞术,精确解析了FL微环境中特定细胞表型及其在疾病中的作用。 NA 探讨滤泡性淋巴瘤微环境的主要参与者及其当前和未来的治疗策略。 滤泡性淋巴瘤的微环境及其在疾病中的作用。 NA 淋巴瘤 全外显子测序、单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 NA NA NA
2531 2024-08-09
Tumor Evolution and Therapeutic Choice Seen through a Prism of Circulating Tumor Cell Genomic Instability
2021-02-05, Cells IF:5.1Q2
综述 本文综述了通过循环肿瘤细胞(CTCs)的单细胞分析来探讨基因组不稳定性(GI)的分子机制及其对肿瘤演化和耐药克隆出现的影响 介绍了通过分子和功能特性监测CTCs以理解基因组不稳定性的分子机制,并强调了染色体不稳定性(CIN)在CTCs驱动转移进展和获得性耐药中的作用 讨论了单CTC分析中遇到的技术障碍和挑战 探讨CTCs中的基因组异常与预后之间的关系,并支持在临床风险评估和治疗选择中监测CTCs中的基因组不稳定性的潜在用途 不同类型肿瘤中的循环肿瘤细胞(CTCs) 数字病理学 NA 荧光原位杂交(FISH),单细胞测序 NA 细胞 极低数量的循环肿瘤细胞(CTCs)
2532 2024-08-09
Nitric oxide prevents aortic valve calcification by S-nitrosylation of USP9X to activate NOTCH signaling
2021-02, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本文研究了硝酸氧化物(NO)通过S-亚硝基化USP9X激活NOTCH信号通路来预防主动脉瓣钙化的机制 发现了一种新的机制,即通过S-亚硝基化依赖的泛素相关通路调节来预防钙化性主动脉瓣疾病(CAVD) NA 探讨NO如何通过S-亚硝基化USP9X激活NOTCH信号通路来预防主动脉瓣钙化 猪主动脉瓣间质细胞和单细胞RNA测序 NA 主动脉瓣疾病 单细胞RNA测序 NA 蛋白质组学数据 NA
2533 2024-08-09
Implications of liver injury in risk-stratification and management of patients with COVID-19
2021-Feb, Hepatology international IF:5.9Q1
研究论文 本研究评估了COVID-19患者中肝脏损伤对临床结果的影响 提供了预测COVID-19患者住院期间肝脏损伤风险和严重程度的模型 NA 评估肝脏损伤对COVID-19患者临床结果的影响 COVID-19患者的肝脏损伤及其对临床结果的影响 NA COVID-19 scRNA-seq, 基因表达谱分析 风险评分模型 基因表达数据 1520名严重或危重的COVID-19患者
2534 2024-08-09
Identification of Novel Population-Specific Cell Subsets in Chinese Ulcerative Colitis Patients Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术,分析了中国汉族溃疡性结肠炎患者的结肠黏膜细胞,识别出新的特定人群细胞亚群 本研究首次在中国汉族溃疡性结肠炎患者中识别出两个新的浆细胞亚群,并发现Th17激活在溃疡性结肠炎患者中表现为系统性免疫活动变化 研究样本仅来自中国汉族人群,可能限制了结果的普遍性 旨在识别溃疡性结肠炎患者结肠黏膜中的关键基因和细胞类型 中国汉族溃疡性结肠炎患者的结肠黏膜细胞 数字病理学 炎症性肠病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 12个溃疡性结肠炎患者和健康对照的结肠活检样本
2535 2024-08-09
Hematopoietic Stem Cell Niche During Homeostasis, Malignancy, and Bone Marrow Transplantation
2021, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
综述 本文综述了骨髓微环境中造血干细胞(HSC)的自我更新和多向分化如何受到严格调控,并探讨了骨髓微环境在白血病和造血干细胞移植(HSCT)后的变化 利用单细胞测序和成像技术研究骨髓微环境在血液恶性肿瘤和HSCT后的情况 NA 探讨骨髓微环境的不同组成部分如何调节正常造血,以及在白血病和HSCT后的变化 骨髓微环境中的造血干细胞及其在白血病和HSCT后的调控机制 NA 白血病 单细胞测序和成像 NA NA NA
2536 2024-08-09
Longitudinal single-cell RNA-seq of hESCs-derived retinal organoids
2021-Oct, Science China. Life sciences
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术,对由人胚胎干细胞衍生的视网膜类器官在五个不同时间点进行分析,揭示了视网膜发育过程中细胞类型和分子特征的动态变化 首次在视网膜类器官发育过程中识别出九种不同的细胞群体,并发现胰岛素受体(INSR)在光感受器生成中的特定表达作用,以及pleiothropin(PTN)-蛋白酪氨酸磷酸酶受体类型Z1(PTPRZ1)在Müller细胞和视网膜前体细胞间的新型相互作用 NA 研究人视网膜发育过程并模拟视网膜类器官中的发育障碍 人胚胎干细胞衍生的视网膜类器官 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA-seq数据 五个时间点的视网膜类器官样本
2537 2024-08-09
jSRC: a flexible and accurate joint learning algorithm for clustering of single-cell RNA-sequencing data
2021-09-02, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为jSRC的联合学习算法,用于单细胞RNA测序数据的聚类 jSRC算法将降维和聚类集成在一起,提高了算法的准确性、可扩展性和可解释性 NA 解决现有单细胞RNA测序数据聚类算法在准确性、可扩展性和可解释性方面的不足 单细胞RNA测序数据 生物信息学 COVID-19 RNA-seq 联合学习算法 基因表达数据 涉及15个不同组织和生物的单细胞RNA测序数据集,细胞数量从49到110,824不等
2538 2024-08-09
Space: the final frontier - achieving single-cell, spatially resolved transcriptomics in plants
2021-05-21, Emerging topics in life sciences IF:3.4Q1
research paper 本文综述了空间转录组学方法的发展,并强调了在实现植物组织单细胞分辨率3D空间转录组学方面的最新进展和当前挑战 本文提出了在植物中实现单细胞分辨率的空间转录组学的新方法和技术 当前方法通常需要细胞分选、转基因植物、原生质体化或其他耗时或破坏性的过程,且大多数技术在实施过程中会失去大部分或全部空间分辨率 实现植物组织中单细胞分辨率的3D空间转录组学 植物组织的空间转录组学 基因组学 NA RNA-seq NA 转录组数据 NA
2539 2024-08-09
PPARs in liver physiology
2021-05-01, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
综述 本文综述了过氧化物酶体增殖物激活受体(PPARs)在肝脏生理中的最新研究进展,特别关注了PPAR调控中先前被忽视的方面 利用单细胞RNA测序等技术揭示了PPAR表达、活性和下游信号调控的复杂性 NA 探讨PPARs在肝脏生理中的作用及其调控机制 过氧化物酶体增殖物激活受体(PPARs)及其在肝脏中的功能 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA NA
2540 2024-08-09
Flexible comparison of batch correction methods for single-cell RNA-seq using BatchBench
2021-04-19, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文介绍了一种用于比较单细胞RNA测序数据批次校正方法的模块化和灵活的管道BatchBench BatchBench提供了一种系统的方法来比较不同批次校正方法的性能和计算需求 NA 评估和比较不同批次校正方法的性能 单细胞RNA测序数据的批次校正方法 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 数据集 多个经过充分研究的数据集
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