单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 2481 - 2500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2481 | 2024-08-09 |
Transcriptional characterization of human megakaryocyte polyploidization and lineage commitment
2021-05, Journal of thrombosis and haemostasis : JTH
IF:5.5Q1
DOI:10.1111/jth.15271
PMID:33587817
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对人类骨髓中的巨核细胞（MKs）及其从造血干细胞（HSCs）的分化过程进行了转录组水平的特征分析 | 首次使用单细胞测序技术对人类骨髓中不同多倍体水平的巨核细胞转录组进行特征分析，并揭示了巨核细胞分化过程中的转录变化 | NA | 研究巨核细胞的转录特征及其从造血干细胞的分化过程 | 人类骨髓中的巨核细胞及其从造血干细胞的分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2482 | 2024-08-09 |
Intratumoral Plasmid IL12 Expands CD8+ T Cells and Induces a CXCR3 Gene Signature in Triple-negative Breast Tumors that Sensitizes Patients to Anti-PD-1 Therapy
2021-05-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-20-3944
PMID:33593880
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研究论文 | 研究通过在三阴性乳腺癌肿瘤中使用IL12质粒进行免疫激活，评估其对CD8+ T细胞扩增和CXCR3基因特征的影响，以及对PD-1疗法的敏感性 | 首次展示了IL12质粒治疗后CXCR3基因特征的增强，以及这种特征与CD8+ T细胞浸润和PD-1/PD-L1表达的关联 | 研究主要基于小鼠模型和有限的临床试验数据，需要更多临床验证 | 探索增强三阴性乳腺癌免疫原性和T细胞浸润的方法，以提高PD-1疗法的疗效 | 三阴性乳腺癌患者和肿瘤模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括小鼠模型和少量三阴性乳腺癌患者 |
| 2483 | 2024-08-09 |
Targeting PIM1-Mediated Metabolism in Myeloid Suppressor Cells to Treat Cancer
2021-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-20-0433
PMID:33579728
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析双侧肿瘤模型，发现免疫抑制性髓系细胞在免疫检查点阻断（ICB）耐药个体中占主导地位，并揭示了PIM1激酶通过PPARγ介导的活性调节脂质氧化代谢的新作用。 | 本文首次揭示了PIM1激酶在调节髓源抑制细胞（MDSC）脂质氧化代谢中的作用，并证明了PIM1抑制剂AZD1208在临床前癌症模型中增强PD-L1阻断的效果。 | NA | 研究PIM1激酶在髓源抑制细胞中的代谢调节作用及其在免疫检查点阻断耐药中的治疗潜力。 | 髓源抑制细胞（MDSC）、PIM1激酶、免疫检查点阻断（ICB）耐药机制。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 双侧肿瘤模型中的免疫细胞 |
| 2484 | 2024-08-09 |
High expression of SARS-CoV-2 entry factors in human conjunctival goblet cells
2021-04, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2021.108501
PMID:33600811
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了人结膜中SARS-CoV-2进入因子的高表达情况，特别是在杯状细胞中的ACE2和TMPRSS2的共表达 | 首次揭示了人结膜杯状细胞中ACE2和TMPRSS2的高共表达，以及这些细胞在免疫过程中的基因表达 | NA | 探讨SARS-CoV-2感染建立过程中结膜细胞类型的识别 | 人结膜中的ACE2和TMPRSS2表达 | NA | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
| 2485 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-sequencing analyses identify heterogeneity of CD8+ T cell subpopulations and novel therapy targets in melanoma
2021-Mar-26, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2020.12.003
PMID:33575475
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析了黑色素瘤中CD8+ T细胞亚群的异质性，并识别了新的治疗靶点 | 发现了7种主要的CD8 T细胞亚群，并揭示了它们在黑色素瘤中的不同作用和预后影响 | 研究基于已发表的单细胞RNA测序数据，可能存在样本选择偏倚 | 探索黑色素瘤中CD8 T细胞亚群的异质性及其在治疗中的潜在靶点 | CD8 T细胞亚群及其在黑色素瘤中的作用 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 2486 | 2024-08-09 |
APOBEC3B is preferentially expressed at the G2/M phase of cell cycle
2021-03-26, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2021.02.008
PMID:33592502
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了1276个原发性骨髓瘤细胞，发现APOBEC3B在G2/M期优先表达，并验证了其在骨髓瘤细胞和正常骨髓单个核细胞中的表达模式。 | 首次揭示了APOBEC3B在G2/M期优先表达的特性，并探讨了其在正常血液细胞中的表达模式及其在防御病毒中的潜在作用。 | NA | 探究APOBEC3B在癌细胞和正常细胞中的表达调控机制及其在癌症发生和异质性中的作用。 | APOBEC3B在骨髓瘤细胞和正常骨髓单个核细胞中的表达模式。 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 1276个原发性骨髓瘤细胞和86,493个正常骨髓单个核细胞 |
| 2487 | 2024-08-09 |
Chromosome 8 gain is associated with high-grade transformation in MPNST
2021-03-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.146351
PMID:33591953
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研究论文 | 本研究通过开发NF1-MPNST患者来源的异种移植模型（PDX），分析了MPNST的基因组异质性，并发现染色体8的增益与MPNST的高级别转化和不良预后相关 | 首次在MPNST中发现染色体8增益的复发性基因组事件，并通过多种技术手段验证了其存在 | NA | 进一步理解MPNST的基因组异质性，并为临床前研究提供平台 | 恶性周围神经鞘瘤（MPNST） | 数字病理学 | 神经纤维瘤病 | 拷贝数分析，全外显子测序，RNA测序，荧光原位杂交（FISH），单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NF1-MPNST患者来源的异种移植模型（PDX）及原始肿瘤样本 |
| 2488 | 2024-08-09 |
TAMEP are brain tumor parenchymal cells controlling neoplastic angiogenesis and progression
2021-03-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2021.01.002
PMID:33592194
|
研究论文 | 研究探讨了胶质母细胞瘤微环境中的一种新型肿瘤相关细胞群TAMEP，及其对肿瘤血管生成和进展的影响 | 首次鉴定并描述了TAMEP这一新型肿瘤相关细胞群，它们由CNS-resident、SOX2阳性前体细胞产生，而非来自小胶质细胞或外周单核细胞 | NA | 研究胶质母细胞瘤微环境中的肿瘤相关细胞群及其对疾病进展的影响 | 胶质母细胞瘤微环境中的TAMEP细胞群 | NA | 脑肿瘤 | 转基因谱系追踪模型、活体成像、单细胞转录组学、免疫荧光分析以及组织病理学 | NA | 图像 | 涉及小鼠和人类样本 |
| 2489 | 2024-08-09 |
The power to "di-sc-seq-t"
2021-03-08, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2021.02.001
PMID:33577786
|
research paper | 本文研究了T-VEC在皮肤B细胞淋巴瘤中的活性，并使用scRNA-seq技术证明了病毒复制不仅发生在肿瘤细胞中 | 首次展示了T-VEC在皮肤B细胞淋巴瘤中的活性，并揭示了病毒复制在非肿瘤细胞中的发生 | NA | 研究T-VEC在皮肤B细胞淋巴瘤中的作用机制 | T-VEC在皮肤B细胞淋巴瘤中的活性及病毒复制机制 | NA | 皮肤B细胞淋巴瘤 | scRNA-seq | NA | RNA | NA |
| 2490 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq dissects the intratumoral heterogeneity of triple-negative breast cancer based on gene regulatory networks
2021-Mar-05, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2020.12.018
PMID:33575114
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了三阴性乳腺癌的基因调控网络，以解析其肿瘤内异质性 | 首次通过单细胞RNA测序数据构建基因调控网络，揭示了三阴性乳腺癌的关键调控基因及其在不同亚型中的不同作用 | NA | 解析三阴性乳腺癌的肿瘤内异质性并识别关键基因 | 三阴性乳腺癌的基因调控网络及其关键基因 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 基因调控网络 | 基因表达数据 | 545个恶性细胞 |
| 2491 | 2024-08-09 |
A new graph-based clustering method with application to single-cell RNA-seq data from human pancreatic islets
2021-Mar, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaa087
PMID:33575647
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研究论文 | 本文提出了一种基于图模型的新的聚类框架，用于处理单细胞RNA测序数据中的异质性，并应用于人类胰岛细胞的分析 | 引入了基于图模型的聚类方法，并考虑了单细胞RNA测序数据组成的特性，采用对数比变换 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的细胞类型和亚型检测问题 | 人类胰岛细胞的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图模型 | 单细胞RNA测序数据 | 人类胰岛细胞 |
| 2492 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing of early-relapse hepatocellular carcinoma
2021-Mar, Nature reviews. Gastroenterology & hepatology
DOI:10.1038/s41575-021-00428-2
PMID:33594272
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2493 | 2024-08-09 |
Tumor Functional Heterogeneity Unraveled by scRNA-seq Technologies: (Trends in Cancer 6, 13-19, 2020)
2021-Mar, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2021.02.001
PMID:33596415
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2494 | 2024-08-09 |
Cell-specific network analysis of human folliculogenesis reveals network rewiring in antral stage oocytes
2021-03, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.16315
PMID:33599396
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了人类卵泡发育过程中卵母细胞和颗粒细胞的动态调控网络，揭示了卵泡腔阶段卵母细胞的基因网络结构及其重构过程 | 首次在单细胞网络层面探索卵泡发育过程中的基因功能，发现了两个潜在的基因子网络，这些子网络可能在卵母细胞功能中起重要作用 | NA | 探索卵泡发育过程中单细胞分辨率的动态调控网络 | 人类卵母细胞和颗粒细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | WGCNA, MCODE | 基因表达数据 | NA |
| 2495 | 2024-08-09 |
Potential therapeutic targets in the tumor microenvironment of hepatocellular carcinoma: reversing the protumor effect of tumor-associated macrophages
2021-Feb-17, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-021-01873-2
PMID:33596985
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综述 | 本文综述了肝细胞癌患者中肿瘤微环境的治疗靶点，特别是针对肿瘤相关巨噬细胞的肿瘤促进效应的逆转 | 利用单细胞测序技术揭示了肿瘤微环境中细胞间的相互作用网络，并识别出肿瘤相关巨噬细胞作为关键节点 | NA | 探讨如何通过重塑肿瘤微环境和重新编程肿瘤相关巨噬细胞表型来提高肝细胞癌患者的免疫治疗效果 | 肝细胞癌患者的肿瘤微环境和肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 2496 | 2024-08-09 |
Dissection of intercellular communication using the transcriptome-based framework ICELLNET
2021-02-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21244-x
PMID:33597528
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研究论文 | 本文开发了基于转录组的框架ICELLNET，用于解析细胞间通信 | ICELLNET集成了专家 curated的配体-受体相互作用数据库、通信分数量化、与31种参考人类细胞类型的连接以及三种可视化模式 | NA | 开发一个全面的、多功能的、生物学验证的、易于使用的框架，用于从单个或多个基于细胞的转录组数据中解析细胞通信 | 细胞间通信的解析 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | 转录组数据 | 涉及31种参考人类细胞类型 |
| 2497 | 2024-08-09 |
Molecular Signatures of Inflammatory Profile and B-Cell Function in Patients with Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome
2021-02-16, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.02583-20
PMID:33593977
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研究论文 | 本研究利用靶向蛋白质组学和单细胞转录组学技术，分析了SFTS患者血液中的免疫景观变化，并揭示了B细胞功能改变与SFTSV感染致死性的关联 | 首次揭示了SFTSV感染导致B细胞亚群改变及干扰素途径下调，以及这些变化与疾病严重程度和致死性的关系 | NA | 探究SFTSV感染的临床表现机制及其与免疫反应的关系 | SFTS患者的血液样本，特别是外周血单个核细胞（PBMCs） | NA | NA | 靶向蛋白质组学，单细胞转录组学 | NA | 蛋白质，RNA | NA |
| 2498 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic landscape reveals the differences in cell differentiation and immune microenvironment of papillary thyroid carcinoma between genders
2021-Feb-15, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-021-00549-w
PMID:33588924
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了甲状腺乳头状癌（PTC）在不同性别间的细胞分化和免疫微环境的差异 | 首次揭示了性别对PTC中单细胞转录组景观的影响，包括细胞簇和免疫微环境的详细差异 | NA | 旨在阐明性别对甲状腺乳头状癌中细胞簇和免疫微环境的影响 | 甲状腺乳头状癌（PTC）在不同性别间的细胞分化和免疫微环境 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 共生成6720、14666和33373个单细胞转录组，分别来自4名男性PTC患者、7名女性PTC患者和3名结节性甲状腺肿患者 |
| 2499 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing reveals the potential oncogenic expression atlas of human iPSC-derived cardiomyocytes
2021-02-15, Biology open
IF:1.8Q3
DOI:10.1242/bio.053348
PMID:33589441
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了人类诱导多能干细胞（iPSCs）衍生的心肌细胞的致癌表达图谱 | 发现了与致癌相关的动态表达事件，以及Yamanaka因子基因的动态表达和共表达模式 | NA | 理解iPSC衍生的心肌细胞在单细胞分辨率下的特性 | 人类iPSC衍生的心肌细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 32,365个细胞 |
| 2500 | 2024-08-09 |
Fast and precise single-cell data analysis using a hierarchical autoencoder
2021-02-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21312-2
PMID:33589635
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scDHA的分析框架，用于从单细胞RNA测序数据中提取代表性信息 | scDHA框架包括一个非负核自动编码器和一个堆叠的贝叶斯自动编码器，能够有效去除不重要的基因或成分，并通过在压缩空间中反复扰动来学习更通用的数据表示 | NA | 解决单细胞RNA测序研究中数据量大和噪声水平高的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自动编码器 | 基因表达数据 | NA |