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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2401 | 2024-08-09 |
Time-Resolved scRNA-Seq Tracks the Adaptation of a Sensitive MCL Cell Line to Ibrutinib Treatment
2021-Feb-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22052276
PMID:33668876
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研究论文 | 本研究使用时间分辨的单细胞RNA测序技术,追踪了敏感的套细胞淋巴瘤(MCL)细胞系对伊布替尼治疗的适应过程 | 揭示了五个亚群及其对治疗的个体反应,并发现了B细胞受体信号通路的激活、与微环境的相互作用、代谢重编程等与伊布替尼耐药相关的机制 | NA | 旨在解析敏感的套细胞淋巴瘤细胞系对伊布替尼治疗的反应 | 套细胞淋巴瘤(MCL)细胞系 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五个亚群的单细胞 |
2402 | 2024-08-09 |
Ex uno, plures-From One Tissue to Many Cells: A Review of Single-Cell Transcriptomics in Cardiovascular Biology
2021-Feb-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22042071
PMID:33669808
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在心血管生物学中的应用,探讨了其在心脏发育、心肌稳态及心血管系统应激与损伤中的作用 | 单细胞分析提供了比传统整体方法更精确的组织组成、细胞分化轨迹和细胞间通讯的定义 | NA | 旨在回顾单细胞多组学研究如何改变我们对心脏发育及健康与疾病状态下成年心肌细胞动力学的理解 | 心脏发育、心肌稳态及心血管系统应激与损伤 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
2403 | 2024-08-09 |
Guide Cells Support Muscle Regeneration and Affect Neuro-Muscular Junction Organization
2021-Feb-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22041939
PMID:33669272
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序识别并分离了一类能够促进肌源性分化的血管相关细胞亚群,称为'引导'细胞,并研究了它们在肌肉再生中对神经肌肉接头形成的影响。 | 首次识别并分离出能够促进肌源性分化的'引导'细胞,并探讨了其在肌肉再生中对神经肌肉接头形成的作用。 | 需要进一步研究这些细胞的起源及其在再生肌纤维终末分化中的必要性。 | 研究肌肉再生过程中神经肌肉接头的形成机制。 | 肌肉再生过程中的'引导'细胞及其对神经肌肉接头形成的影响。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 在小鼠急性肌肉损伤和再生模型中进行了实验。 |
2404 | 2024-08-09 |
Case Report: Transformation From Cold to Hot Tumor in a Case of NSCLC Neoadjuvant Immunochemotherapy Pseudoprogression
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.633534
PMID:33679783
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病例报告 | 本文报告了一例非小细胞肺癌患者在接受新辅助免疫化疗后,从冷肿瘤转变为热肿瘤的病例 | 首次报道了通过手术病理、单细胞RNA测序和成像质谱流式技术证实的新辅助免疫化疗假进展病例 | NA | 探讨新辅助免疫化疗后肿瘤微环境的变化 | 一例56岁男性非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、成像质谱流式技术 | NA | RNA序列、图像 | 单个病例 |
2405 | 2024-08-09 |
SSRP1 Is a Prognostic Biomarker Correlated with CD8+ T Cell Infiltration in Hepatocellular Carcinoma (HCC)
2021, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2021/9409836
PMID:33688504
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研究论文 | 研究探讨了结构特异性识别蛋白1(SSRP1)在肝细胞癌(HCC)中的表达及其作为预后生物标志物的潜力 | 发现SSRP1与CD8+ T细胞浸润水平呈正相关,尤其是在耗竭的CD8+ T细胞中,这为HCC的免疫治疗提供了新的见解 | NA | 探索SSRP1在HCC中的作用及其作为预后标志物的潜力 | SSRP1在HCC中的表达及其与临床特征和免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | NA | NA | 基因表达数据 | 使用多个数据库(HCCDB, Oncomine, HPA等)进行分析 |
2406 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing With Combined Use of Bulk RNA Sequencing to Reveal Cell Heterogeneity and Molecular Changes at Acute Stage of Ischemic Stroke in Mouse Cortex Penumbra Area
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.624711
PMID:33692998
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序结合批量RNA测序技术,探讨了小鼠大脑皮质缺血性卒中半暗带区域在急性期的细胞异质性和分子变化 | 本研究首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序技术,揭示了缺血性卒中急性期半暗带区域的细胞异质性和分子变化,为早期治疗提供了潜在靶点 | NA | 研究缺血性卒中急性期半暗带区域的细胞异质性和分子变化,寻找早期治疗靶点 | 小鼠大脑皮质缺血性卒中半暗带区域的细胞和分子变化 | 数字病理学 | 卒中 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | RNA | 小鼠大脑皮质缺血性卒中半暗带区域的细胞样本 |
2407 | 2024-08-09 |
Inter and intra-tumoral heterogeneity as a platform for personalized therapies in medulloblastoma
2021-12, Pharmacology & therapeutics
IF:12.0Q1
DOI:10.1016/j.pharmthera.2021.107828
PMID:33662447
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综述 | 本文综述了髓母细胞瘤的肿瘤间和肿瘤内异质性,并探讨了这些异质性如何为个性化治疗提供平台 | 讨论了基于特定分子缺陷的新型疗法的潜力,以及单细胞测序方法的应用前景 | 当前方法在罕见疾病应用中的局限性 | 探讨髓母细胞瘤的异质性及其对个性化治疗的影响 | 髓母细胞瘤的肿瘤间和肿瘤内异质性 | 数字病理学 | 儿童常见恶性CNS肿瘤 | 下一代测序(NGS)、单细胞测序 | NA | 组织样本 | 每年美国约350名患者 |
2408 | 2024-08-09 |
BET proteolysis targeted chimera-based therapy of novel models of Richter Transformation-diffuse large B-cell lymphoma
2021-09, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-021-01181-w
PMID:33654205
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研究论文 | 本文报道了三种新建立的患者源性异种移植(PDX)模型中RT-DLBCL的遗传改变、染色质可及性、活性增强子、基因表达及抗淋巴瘤药物敏感性的特征 | 首次使用CRISPR敲除IRF4并结合BET抑制剂和BET-PROTAC与ibrutinib或venetoclax的联合治疗,显著减少了淋巴瘤负担并提高了免疫缺陷小鼠的生存率 | NA | 开发针对Richter Transformation-diffuse large B-cell lymphoma的新疗法 | RT-DLBCL的遗传特征及药物敏感性 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | CRISPR, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三种患者源性异种移植模型 |
2409 | 2024-08-09 |
Anatomy, Endocrine Regulation, and Embryonic Development of the Rete Testis
2021-06-01, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqab046
PMID:33661305
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综述 | 本文综述了哺乳动物睾丸网(rete testis)的解剖结构、内分泌调控及其胚胎发育,重点探讨了其分子调控机制的最新发现 | 利用现代分子方法如全局RNA测序揭示了睾丸网细胞前体的转录特征,指出其与Sertoli细胞至少有部分共同起源 | 睾丸网发育的胚胎起源和分子调控机制仍了解不足,缺乏独特的分子标记 | 旨在填补对睾丸网发育分子调控机制的知识空白,并确定未来研究方向 | 睾丸网的解剖结构、内分泌调控及其胚胎发育 | NA | NA | 全局RNA测序(RNA-seq) | NA | RNA | NA |
2410 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing: An overview for the ophthalmologist
2021-May-19, Seminars in ophthalmology
IF:1.9Q2
DOI:10.1080/08820538.2021.1889615
PMID:33635751
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review | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNAseq)技术在眼科领域的应用及其对疾病分子机制理解的重要性 | scRNAseq技术相较于传统的混合RNA分析,能够识别组织中细胞的组成和异质性,为新发现提供了新的机会 | NA | 探讨scRNAseq技术在眼科疾病研究中的应用及其对疾病病理生理机制理解的影响 | 眼科疾病相关的病理组织 | digital pathology | NA | scRNAseq | NA | RNA | 数千个细胞 |
2411 | 2024-08-09 |
Targeted Therapy Given after Anti-PD-1 Leads to Prolonged Responses in Mouse Melanoma Models through Sustained Antitumor Immunity
2021-05, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-20-0905
PMID:33653716
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研究论文 | 研究探讨了免疫疗法(anti-PD-1)后给予靶向疗法(ceritinib-trametinib或dabrafenib-trametinib)在鼠黑色素瘤模型中通过持续抗肿瘤免疫延长反应的效果 | 首次研究了免疫疗法后靶向疗法的顺序对鼠黑色素瘤模型的抗肿瘤反应的影响,并发现这种顺序能调节免疫环境,增加T细胞、单核细胞、树突状细胞和自然杀伤细胞的浸润,减少肿瘤相关巨噬细胞、髓源性抑制细胞和调节性T细胞的数量 | 研究仅限于鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 研究免疫疗法与靶向疗法组合在鼠黑色素瘤模型中的效果及机制 | 鼠黑色素瘤模型 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),反向相位蛋白分析(RPPA) | NA | 单细胞RNA测序数据,蛋白分析数据 | 使用了携带突变(SW1)或突变(SM1)的鼠黑色素瘤模型 |
2412 | 2024-08-09 |
Insights Gained from Single-Cell Analysis of Immune Cells in the Tumor Microenvironment
2021-04-26, Annual review of immunology
IF:26.9Q1
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综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)在多种人类肿瘤中对肿瘤免疫微环境的研究进展 | 利用scRNA-seq技术深入解析了肿瘤浸润免疫细胞的异质性、动态变化及其在疾病进展和免疫治疗反应中的潜在作用 | NA | 旨在理解肿瘤免疫微环境,以识别癌症进展的免疫调节因子并开发癌症免疫疗法 | 肿瘤免疫微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 涉及多种类型的人类肿瘤样本 |
2413 | 2024-08-09 |
Formation and integration of new neurons in the adult hippocampus
2021-04, Nature reviews. Neuroscience
DOI:10.1038/s41583-021-00433-z
PMID:33633402
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综述 | 本文综述了啮齿动物海马神经发生领域的最新进展,重点介绍了新技术(包括单细胞RNA测序、活体成像和行为中新生细胞的功能观察)以及从干细胞激活到新生神经元整合到现有回路的不同发育步骤 | 采用了新技术如单细胞RNA测序、活体成像和行为中新生细胞的功能观察 | NA | 提高对成年神经发生机制和功能后果的理解,并探讨该领域如何在急性与慢性神经损伤和基于干细胞的脑修复中更具转化相关性 | 成年海马神经发生的过程及其对脑功能的影响 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序、活体成像 | NA | 细胞 | NA |
2414 | 2024-08-09 |
SSRE: Cell Type Detection Based on Sparse Subspace Representation and Similarity Enhancement
2021-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.09.004
PMID:33647482
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研究论文 | 本文提出了一种基于稀疏子空间表示和相似性增强的单细胞聚类框架SSRE,用于提高细胞类型识别的准确性 | SSRE通过子空间假设建模细胞间关系,并生成细胞间相似性的稀疏表示,同时结合基因选择和增强策略提高相似性度量的有效性 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 稀疏子空间表示 | 基因表达数据 | 测试了十个真实单细胞RNA测序数据集和五个模拟数据集 |
2415 | 2024-08-09 |
Cellular plasticity balances the metabolic and proliferation dynamics of a regenerating liver
2021-04, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.267013.120
PMID:33649154
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研究论文 | 本文通过部分肝切除术(PHx)结合单细胞转录组学,追踪了小鼠肝脏再生过程中约22,000个肝细胞的细胞转变和异质性 | 研究发现,在PHx后,一部分肝细胞暂时重新激活早期新生儿样的基因表达程序以增殖,而另一部分代谢高度活跃的细胞似乎补偿了肝脏功能的任何暂时性缺陷 | NA | 探讨成年肝脏在再生过程中如何维持其特化功能 | 小鼠肝脏再生过程中的细胞转变和异质性 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 约22,000个肝细胞 |
2416 | 2024-08-09 |
COVID-19 immune features revealed by a large-scale single-cell transcriptome atlas
2021-04-01, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.01.053
PMID:33657410
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research paper | 本文通过大规模单细胞转录组图谱揭示了COVID-19患者的免疫特征 | 首次应用单细胞RNA测序技术分析了大量COVID-19患者样本,构建了详细的免疫景观图谱 | NA | 深入理解COVID-19的病理机制并开发有效的治疗策略 | COVID-19患者的免疫细胞及其转录组变化 | digital pathology | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 284个样本,来自196名COVID-19患者和对照组 |
2417 | 2024-08-09 |
Direct Comparative Analyses of 10X Genomics Chromium and Smart-seq2
2021-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.02.005
PMID:33662621
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研究论文 | 本文通过比较10X Genomics Chromium和Smart-seq2两种单细胞RNA测序平台在相同CD45细胞样本上的数据,系统评估了它们的特点 | 首次系统比较了10X Genomics Chromium和Smart-seq2两种单细胞RNA测序平台的优势和局限性 | 研究仅限于CD45细胞样本,可能无法完全代表所有细胞类型的表现 | 旨在深入理解10X Genomics Chromium和Smart-seq2两种单细胞RNA测序平台的特点,并为选择合适的平台提供依据 | 10X Genomics Chromium和Smart-seq2两种单细胞RNA测序平台 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 相同CD45细胞样本 |
2418 | 2024-08-09 |
Isolation of human ESC-derived cardiac derivatives and embryonic heart cells for population and single-cell RNA-seq analysis
2021-03-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100339
PMID:33644774
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研究论文 | 本文描述了从人胚胎干细胞(hESC)分化的心脏衍生物和胚胎心脏细胞中分离细胞,并进行群体和单细胞RNA测序分析的方法 | 结合群体和单细胞RNA测序分析,揭示人类胚胎发生中的器官特异性细胞和分子图谱 | NA | 阐明人类胚胎发生中的器官特异性细胞和分子图谱 | 人胚胎干细胞分化的心脏衍生物和胚胎心脏细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | NA |
2419 | 2024-08-09 |
Progenitor cell diversity in the developing mouse neocortex
2021-03-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2018866118
PMID:33649223
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了发育中的小鼠新皮质中的神经前体细胞,揭示了神经前体细胞的多样性及其与神经元类型指定相关的基因表达模式。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了神经前体细胞在不同发育阶段的基因表达动态变化,以及这些变化与神经元身份基因表达的关系。 | NA | 确定神经前体细胞中的时间基因表达是否与神经元类型指定相关。 | 发育中的小鼠新皮质中的神经前体细胞。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | 多个神经前体细胞样本 |
2420 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals that targeting HSP90 suppresses PDAC progression by restraining mitochondrial bioenergetics
2021-Mar-03, Oncogenesis
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s41389-021-00311-4
PMID:33658487
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了通过靶向HSP90抑制胰腺导管腺癌(PDAC)进展的机制 | 首次揭示了HSP90抑制通过破坏HSP90与OPA1的相互作用,减少线粒体嵴数量和能量产生,从而抑制PDAC进展 | NA | 开发针对胰腺导管腺癌的新治疗策略 | 胰腺导管腺癌(PDAC)及其细胞亚群 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | KPC小鼠的PDAC肿瘤样本 |