单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 2381 - 2400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2381 | 2024-08-09 |
Complete Freund's adjuvant-induced decrement of pruriceptor-mediated suppression of itch
2021-Apr-15, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.1093/abbs/gmab027
PMID:33693534
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研究论文 | 本研究探讨了完全弗氏佐剂（CFA）对瘙痒感受器介导的瘙痒抑制的影响 | 首次揭示了CFA处理后瘙痒感受器的综合抑制作用，以及这种抑制如何影响瘙痒感知 | 研究主要集中在瘙痒感受器的基因表达变化，未深入探讨CFA处理后瘙痒抑制的具体神经机制 | 探究CFA处理对瘙痒感知的影响及其可能的细胞机制 | 瘙痒行为测试、钙成像、单细胞RNA测序和实时PCR | 神经科学 | NA | 钙成像、单细胞RNA测序、实时PCR | NA | 基因表达数据 | 涉及多种瘙痒感受器相关的DRG神经元 |
| 2382 | 2024-08-09 |
Modeling expression ranks for noise-tolerant differential expression analysis of scRNA-seq data
2021-04, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.267070.120
PMID:33674351
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研究论文 | 本文探讨了使用离散广义贝塔分布（DGBD）模型表达秩作为转录本丰度的稳健替代品，用于单细胞RNA-seq数据的差异表达分析 | 提出了ROSeq方法，该方法在表达噪声下表现出色，并能快速适应增加的样本大小 | NA | 旨在提高单细胞RNA-seq数据差异表达分析的准确性和鲁棒性 | 单细胞RNA-seq数据的基因表达模型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 离散广义贝塔分布（DGBD） | 基因表达数据 | 涉及两个表型差异显著的单细胞群体 |
| 2383 | 2024-08-09 |
c-CSN: Single-cell RNA Sequencing Data Analysis by Conditional Cell-specific Network
2021-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.05.005
PMID:33684532
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研究论文 | 本文提出了一种名为c-CSN的方法，用于构建条件细胞特异性网络（CCSN），以测量单细胞RNA测序数据中基因之间的直接关联 | c-CSN方法通过消除间接关联，能够准确测量基因之间的直接关联，并可用于细胞聚类和基于网络的维度降低 | NA | 克服单细胞RNA测序数据中的高噪声和低覆盖问题，提高基因关联分析的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的基因关联 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 条件细胞特异性网络（CCSN） | 基因表达矩阵 | 多个单细胞RNA测序数据集 |
| 2384 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis reveals the origins and intrahepatic development of liver-resident IFN-γ-producing γδ T cells
2021-04, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-021-00656-1
PMID:33692482
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，全面分析了小鼠肝脏和胸腺中γδ T细胞的异质性，揭示了γδ T细胞的发育轨迹及其在肝脏中的起源和发展 | 首次系统地阐明了γδ T细胞在肝脏中的起源和非胸腺依赖的发育途径 | NA | 探究γδ T细胞在肝脏中的起源及其非胸腺依赖的发育途径 | 小鼠肝脏和胸腺中的γδ T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠肝脏和胸腺样本 |
| 2385 | 2024-08-09 |
Input-output signal processing plasticity of vagal motor neurons in response to cardiac ischemic injury
2021-Mar-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102143
PMID:33665562
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研究论文 | 研究了迷走神经运动神经元在心脏缺血损伤下的输入输出信号处理可塑性 | 开发了一种中尺度单细胞转录组学数据，揭示了迷走神经背侧运动核（DMV）神经元在稳态和生理扰动后的状态变化 | NA | 探索迷走神经背侧运动核（DMV）神经元的分子表型，以利用DMV的可塑性进行治疗干预 | 迷走神经背侧运动核（DMV）神经元 | 生物电子医学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 数百个DMV神经元 |
| 2386 | 2024-08-09 |
Single cell transcriptomic analysis of murine lung development on hyperoxia-induced damage
2021-03-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21865-2
PMID:33692365
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研究论文 | 本研究利用MULTI-seq技术对36只小鼠的66,000多个细胞进行单细胞RNA测序，分析了正常和因高氧导致的肺发育受损情况下的细胞动态变化 | 首次使用单细胞RNA测序技术详细分析了高氧环境下小鼠肺发育的细胞组成变化，并验证了部分结果在BPD患者肺中的应用 | NA | 探究高氧环境下小鼠肺发育的细胞动态变化及其与BPD的关系 | 小鼠肺细胞在高氧环境下的发育情况 | 数字病理学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 66,000多个细胞来自36只小鼠 |
| 2387 | 2024-08-09 |
Complexity and graded regulation of neuronal cell-type-specific alternative splicing revealed by single-cell RNA sequencing
2021-03-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2013056118
PMID:33674385
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研究论文 | 本研究利用深度单细胞RNA测序数据，系统地研究了成年小鼠皮质中超过100种转录组定义的神经元类型的可变剪接（AS）调控 | 发现了谷氨酸能和GABA能神经元之间以及每个神经元类别内子类之间的独特剪接程序，并揭示了RNA结合蛋白（RBPs）在不同神经元类型中的特异性表达和活性 | NA | 探讨可变剪接在神经元细胞类型分子多样性中的贡献 | 成年小鼠皮质中的神经元类型 | 基因调控 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过100种转录组定义的神经元类型 |
| 2388 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome profiling reveals β cell maturation in stem cell-derived islets after transplantation
2021-Mar-09, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.108850
PMID:33691098
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2389 | 2024-08-09 |
Multiple sclerosis risk gene Mertk is required for microglial activation and subsequent remyelination
2021-03-09, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.108835
PMID:33691116
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研究论文 | 本文研究了多发性硬化症风险基因Mertk在微胶质细胞激活及随后的髓鞘再生中的作用 | 首次证明了Mertk基因在髓鞘再生中的关键作用，并揭示了其在微胶质细胞激活、吞噬和迁移中的具体机制 | NA | 探讨Mertk基因在多发性硬化症髓鞘再生中的作用及其机制 | Mertk基因敲除小鼠与野生型小鼠在髓鞘再生过程中的差异 | 神经科学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Mertk基因敲除小鼠与野生型小鼠 |
| 2390 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic analysis of eutopic endometrium and ectopic lesions of adenomyosis
2021-Mar-08, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-021-00562-z
PMID:33685511
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了异位子宫内膜和腺肌症异位病变的基因表达模式变化，并探讨了腺肌症潜在的新发病机制 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了腺肌症异位病变与正常子宫内膜之间基因表达模式的差异，并发现了具有肿瘤样特征的高拷贝数变异细胞亚群 | 研究样本量较小，仅包括一个对照组和一个腺肌症患者样本，可能影响结果的普遍性和可靠性 | 揭示腺肌症的精确发病机制，并探索潜在的治疗策略 | 异位子宫内膜和腺肌症异位病变的细胞 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1个对照组样本，1个腺肌症患者样本，3个平滑肌瘤样本，3个腺肌症样本 |
| 2391 | 2024-08-09 |
Immune cell profiling of the cerebrospinal fluid enables the characterization of the brain metastasis microenvironment
2021-03-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21789-x
PMID:33686071
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序结合T细胞受体基因分型，研究了脑转移瘤和匹配的脑脊液中的免疫细胞特征 | 首次通过分析脑脊液中的免疫细胞，提供了一种非侵入性的方法来预测免疫检查点抑制剂的反应，并识别脑转移瘤中的T细胞受体克隆型 | NA | 研究脑转移瘤微环境中的免疫细胞特征，并探索预测免疫检查点抑制剂反应的新方法 | 脑转移瘤和脑脊液中的免疫细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 2392 | 2024-08-09 |
Dynamic blood single-cell immune responses in patients with COVID-19
2021-03-06, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-021-00526-2
PMID:33677468
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研究论文 | 研究通过单细胞分辨率下的5'基因表达、T细胞受体（TCR）和B细胞受体（BCR）V(D)J转录组分析，探讨了COVID-19患者在不同阶段血液免疫反应的动态变化。 | 本研究首次详细描述了COVID-19患者血液中免疫细胞的动态变化，并揭示了特定免疫反应对SARS-CoV-2抗原的作用。 | 研究样本量相对较小，可能需要更大规模的研究来验证这些发现。 | 揭示SARS-CoV-2感染后人体血液免疫反应的动态变化，为治疗COVID-19提供潜在的治疗线索。 | COVID-19患者的血液免疫反应。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 341,420个外周血单个核细胞（PBMCs），185,430个克隆型T细胞和28,802个克隆型B细胞，来自16名COVID-19患者的25个样本。 |
| 2393 | 2024-08-09 |
Single cell eQTL analysis identifies cell type-specific genetic control of gene expression in fibroblasts and reprogrammed induced pluripotent stem cells
2021-03-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02293-3
PMID:33673841
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和群体遗传学，研究了遗传变异对不同细胞亚型基因表达的影响 | 首次在单细胞水平上评估了遗传变异对重编程细胞系基因表达的影响，并揭示了细胞类型特异性的表达数量性状位点（eQTLs） | NA | 研究遗传变异如何影响不同细胞亚型的基因表达 | 纤维母细胞和重编程诱导的多能干细胞 | 群体遗传学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 64,018个纤维母细胞来自79个供体，19,967个重编程诱导的多能干细胞来自31个重编程供体线 |
| 2394 | 2024-08-09 |
Deciphering the state of immune silence in fatal COVID-19 patients
2021-03-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21702-6
PMID:33674591
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研究论文 | 研究通过整合单细胞RNA测序分析血液样本和支气管肺泡灌洗液与临床、免疫学和体外功能数据，揭示了与COVID-19严重程度相关的免疫特征 | 首次揭示了COVID-19患者中由髓系细胞驱动的免疫抑制现象，并强调了单核细胞中精氨酸酶-1表达的免疫调节特征 | NA | 解析致命性COVID-19患者中的免疫沉默状态 | COVID-19患者的免疫特征和临床结果 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 血液样本和支气管肺泡灌洗液 |
| 2395 | 2024-08-09 |
Identifying transposable element expression dynamics and heterogeneity during development at the single-cell level with a processing pipeline scTE
2021-03-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21808-x
PMID:33674594
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research paper | 本文开发了一种名为scTE的单细胞转座子处理流程，用于研究不同生物背景下单细胞中转座子的表达情况 | 首次开发了针对单细胞转座子表达分析的scTE处理流程，并展示了其在多种生物过程中的应用 | NA | 研究转座子在单细胞水平上的表达动态及其对细胞异质性的贡献 | 转座子在单细胞中的表达及其在细胞异质性和生物过程中的作用 | NA | NA | single-cell sequencing | NA | single-cell ATAC-seq data | 涉及多种生物背景下的单细胞样本 |
| 2396 | 2024-08-09 |
Evaluation of Ranzoni et al.: Integrative Single-Cell RNA-Seq and ATAC-Seq Analysis of Human Developmental Hematopoiesis
2021-03-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.02.020
PMID:33667351
|
评论 | 本文展示了“人类发育性造血的综合单细胞RNA测序和ATAC测序分析”（Ranzoni等人，2021年）的同行评审过程示例 | NA | NA | 展示同行评审过程 | 人类发育性造血的综合单细胞RNA测序和ATAC测序分析 | NA | NA | 单细胞RNA测序和ATAC测序 | NA | RNA-Seq和ATAC-Seq数据 | NA |
| 2397 | 2024-08-09 |
An Outline of the Outset of Thrombopoiesis in Human Embryos At Last
2021-03-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.02.007
PMID:33667354
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析人卵黄囊和胎肝，追踪了巨核细胞分化的两条替代途径 | 揭示了巨核细胞具有止血和造血干细胞支持功能，并发现人胚胎干细胞衍生的血小板反应蛋白1阳性内皮细胞能在体外产生巨核细胞 | NA | 探究人类胚胎中血栓形成过程的起点 | 人卵黄囊和胎肝中的巨核细胞分化 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2398 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing: one step closer to the clinic
2021-03, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01276-y
PMID:33664491
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2399 | 2024-08-09 |
A multiscale model via single-cell transcriptomics reveals robust patterning mechanisms during early mammalian embryo development
2021-03, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1008571
PMID:33684098
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研究论文 | 本文构建了一个多尺度的三维模型，用于重现从受精卵到晚期囊胚的哺乳动物胚胎发育过程，并探讨了形成Epi/PE层的两个关键过程 | 本文通过整合多个单细胞转录组数据集的时空信息，提出了一种选择性的细胞间粘附机制和细胞信号的时间衰减机制 | NA | 研究早期哺乳动物胚胎发育中形成Epi/PE层的稳健模式机制 | 哺乳动物胚胎的早期发育过程 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | 三维模型 | 基因表达数据 | 多个单细胞转录组数据集 |
| 2400 | 2024-08-09 |
Spatial profiling technologies and applications for brain cancers
2021-Mar, Expert review of molecular diagnostics
IF:3.9Q1
DOI:10.1080/14737159.2021.1900735
PMID:33685321
|
综述 | 本文综述了空间转录组学技术及其在脑癌研究中的应用 | 介绍了下一代成像和多组学技术如何为精细表征脑肿瘤组织生物学提供工具 | NA | 旨在提高对脑肿瘤微环境细胞组成的理解，并探索有效的治疗策略 | 脑癌及其微环境 | 数字病理学 | 脑癌 | 空间转录组学 | NA | 蛋白质/mRNA | NA |