单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-10-06 |
Interactions between cancer cells and immune cells drive transitions to mesenchymal-like states in glioblastoma
2021-06-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2021.05.002
PMID:34087162
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验揭示了巨噬细胞通过分泌oncostatin M诱导胶质母细胞瘤细胞向间充质样状态转变的机制 | 首次系统阐明巨噬细胞通过OSM-STAT3信号通路驱动胶质母细胞瘤细胞向间充质亚型转变的细胞间相互作用机制 | 研究主要关注巨噬细胞与肿瘤细胞的相互作用，对其他免疫细胞类型的影响可能未完全阐明 | 解析胶质母细胞瘤中间充质亚型的形成机制及其与肿瘤微环境的相互作用 | 人类胶质母细胞瘤肿瘤样本和模型系统中的癌细胞与免疫细胞 | 单细胞测序分析 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 体外和体内功能实验 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 222 | 2025-10-06 |
Longitudinal Single-Cell Transcriptomics Reveals a Role for Serpina3n-Mediated Resolution of Inflammation in a Mouse Colitis Model
2021, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.04.004
PMID:33862275
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了小鼠结肠炎模型中炎症消退的细胞动态变化机制 | 首次在单细胞水平上系统描绘结肠炎炎症消退过程中的细胞动态变化，发现Serpina3n在基质细胞中的特异性表达及其促进炎症消退的新功能 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 阐明结肠炎炎症消退过程中的细胞类型变化和相互作用机制 | 化学诱导结肠炎小鼠模型 | 单细胞生物学 | 结肠炎 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 223 | 2025-10-06 |
Molecular mapping of interstitial lung disease reveals a phenotypically distinct senescent basal epithelial cell population
2021-04-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.143626
PMID:33705361
|
研究论文 | 本研究通过分子图谱分析揭示了间质性肺病中表型独特的衰老基底上皮细胞群体 | 首次在ILD中识别出具有独特表型的衰老基底上皮细胞群体，并建立了肺上皮细胞特异性衰老转录特征 | 缺乏功能性研究验证，人类肺组织样本中环境特异性细胞衰老特征分析工具不足 | 阐明间质性肺病中衰老细胞的起源和特征 | 特发性肺纤维化(IPF)和系统性硬化相关间质性肺病(SSc-ILD)的肺组织 | 数字病理学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序,体外模型 | NA | 基因表达数据,组织图像 | 对照、IPF和SSc-ILD肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 224 | 2025-10-07 |
The molecular landscape of neural differentiation in the developing Drosophila brain revealed by targeted scRNA-seq and multi-informatic analysis
2021-04-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109039
PMID:33909998
|
研究论文 | 通过靶向单细胞RNA测序和多信息学分析揭示果蝇大脑发育过程中的神经分化分子图谱 | 首次在果蝇II型神经母细胞谱系中应用靶向scRNA-seq技术，结合计算分析和原位验证，从单一发育时间点解析分子景观 | 研究仅基于三龄幼虫大脑的单一发育时间点，缺乏时间序列动态观察 | 研究果蝇大脑发育过程中的神经分化分子机制 | 果蝇三龄幼虫大脑中的II型神经母细胞谱系 | 单细胞基因组学 | NA | 靶向单细胞mRNA测序, 多信息学分析, 原位验证 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 果蝇三龄幼虫大脑细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 225 | 2025-10-07 |
Rapid microfluidic isolation of virally infected primary bronchial epithelial cells for single-cell RNA sequencing
2021-07-16, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.2144/btn-2021-0020
PMID:34269076
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研究论文 | 介绍了一种使用微流控设备快速分离病毒感染的原代支气管上皮细胞用于单细胞RNA测序的优化方法 | 开发了可在生物安全柜内操作、使用常规实验室设备即可快速分离病毒感染细胞的微流控方法 | NA | 建立病毒感染支气管上皮细胞的高效分离方法以促进单细胞RNA测序研究 | 病毒感染的原代支气管上皮细胞和细胞系 | 单细胞测序技术 | 呼吸道病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 226 | 2025-10-07 |
Deep learning and alignment of spatially resolved single-cell transcriptomes with Tangram
2021-11, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01264-7
PMID:34711971
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研究论文 | 提出Tangram方法，将单细胞转录组数据与空间数据对齐，构建全基因组单细胞分辨率空间图谱 | 开发了能够将多种单细胞RNA测序数据与不同形式空间数据（包括MERFISH、STARmap、smFISH、空间转录组学和组织学图像）对齐的首个通用方法 | NA | 解决单细胞测序技术丢失空间信息与空间转录组技术分辨率有限的问题 | 健康小鼠脑组织视觉和体感运动区域 | 空间转录组学 | NA | scRNA-seq, snRNA-seq, MERFISH, STARmap, smFISH, SHARE-seq | 深度学习 | 单细胞转录组数据，空间转录组数据，多模态数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | 10x Visium | 空间转录组学技术 |
| 227 | 2025-10-07 |
A comprehensive survey of regulatory network inference methods using single cell RNA sequencing data
2021-05-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa190
PMID:34020546
|
综述 | 本文系统回顾了15种利用单细胞RNA测序数据推断基因调控网络的计算方法 | 首次对单细胞RNA测序数据下的调控网络推断方法进行全面比较分析，包括模拟评估方法的性能、对dropout的敏感性和时间复杂性 | 仅涵盖15种方法，可能未包含该领域所有最新进展；基于模拟数据的评估可能与真实生物系统存在差异 | 帮助生命科学家选择适合其数据和分析目的的方法，并为计算科学家开发新方法提供参考 | 基因调控网络推断方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 228 | 2025-10-07 |
The Nuclear Receptor ESRRA Protects from Kidney Disease by Coupling Metabolism and Differentiation
2021-02-02, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2020.11.011
PMID:33301705
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示肾脏疾病中细胞多样性变化，发现近端小管细胞是易感细胞类型，并阐明代谢与细胞分化通过核受体ESRRA和PPARA耦合的机制 | 首次在单细胞水平系统揭示肾脏疾病中细胞特异性变化轨迹，发现代谢与细胞分化的耦合机制及核受体ESRRA的保护作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证尚不充分 | 探究肾脏疾病的细胞分子机制及保护性因子 | 小鼠肾脏疾病模型和患者样本 | 单细胞生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 细胞轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 小鼠疾病模型和患者样本（具体数量未明确） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 229 | 2025-10-07 |
Neurodevelopmental disorders: 2021 update
2021-Jan, Free neuropathology
|
综述 | 本文总结了2021年神经发育障碍研究领域的最新进展，重点关注遗传学发现和新兴研究技术 | 揭示了神经发育障碍的遗传结构特征，包括独特的基因组DNA甲基化模式和体细胞突变的作用，并介绍了多基因编辑与单细胞RNA测序相结合的新研究范式 | 从遗传学发现到神经病理学机制的转化研究仍面临挑战 | 探讨神经发育障碍的病因学和风险因素 | 神经发育障碍，包括自闭症谱系障碍、发育迟缓、智力残疾和注意力缺陷多动障碍 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序，基因组DNA甲基化分析，多基因编辑 | NA | 基因组数据，表观遗传数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 230 | 2025-10-07 |
Single-cell profiling reveals the trajectories of natural killer cell differentiation in bone marrow and a stress signature induced by acute myeloid leukemia
2021-05, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-020-00574-8
PMID:33239726
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示骨髓中自然杀伤细胞的分化轨迹及急性髓系白血病诱导的应激特征 | 首次在人类骨髓中发现NK0细胞作为NK1样和NK2样细胞的前体，并揭示AML对NK细胞异质性的深远影响 | 样本来源仅限于人类骨髓和脾脏，未涉及其他组织或更大规模验证 | 探究骨髓中自然杀伤细胞的分化轨迹及急性髓系白血病对其功能的影响 | 人类骨髓和脾脏中的自然杀伤细胞，包括健康个体和急性髓系白血病患者 | 单细胞生物学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 人类骨髓和脾脏NK细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 231 | 2025-10-07 |
Multiomics: unraveling the panoramic landscapes of SARS-CoV-2 infection
2021-10, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-021-00754-0
PMID:34471261
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综述 | 本文系统回顾了通过多组学技术研究SARS-CoV-2感染在病毒学、免疫学和致病机制方面的主要进展 | 整合多种组学技术（基因组学、蛋白质组学、代谢组学、单细胞转录组学）实现对病原体和疾病的全景式快速解析 | 基于已建立队列的研究，需要更多验证性研究支持 | 快速识别和理解新兴传染病的病原体、风险因素、宿主免疫反应和致病机制 | SARS-CoV-2病毒及其引起的COVID-19疾病 | 多组学分析 | COVID-19 | 多组学技术，包括基因组学、蛋白质组学、代谢组学、单细胞转录组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 232 | 2024-08-08 |
Using advanced spatial and single-cell transcriptomics to characterize the human endometrium
2021-12, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-021-00982-0
PMID:34857955
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 233 | 2025-10-07 |
Natural genetic variation determines microglia heterogeneity in wild-derived mouse models of Alzheimer's disease
2021-02-09, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.108739
PMID:33567283
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究野生来源小鼠品系中小胶质细胞在阿尔茨海默病模型中的遗传变异影响 | 首次在野生来源小鼠品系中系统分析遗传多样性对小胶质细胞异质性和阿尔茨海默病反应的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探索遗传变异如何影响阿尔茨海默病中小胶质细胞的异质性和功能 | C57BL/6J和野生来源小鼠品系（WSB/EiJ、CAST/EiJ、PWK/PhJ）的小胶质细胞 | 单细胞基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | APP/PS1小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 四个小鼠品系（包括APP/PS1转基因和对照） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 234 | 2025-10-07 |
An N-Cadherin 2 expressing epithelial cell subpopulation predicts response to surgery, chemotherapy and immunotherapy in bladder cancer
2021-08-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25103-7
PMID:34385456
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研究论文 | 通过单细胞多组学技术鉴定膀胱癌中表达N-Cadherin 2的上皮细胞亚群及其对治疗反应的预测价值 | 首次发现CDH12富集肿瘤对手术/化疗与免疫治疗呈现相反疗效反应，提供优于现有分型的预测标志物 | 需进一步验证临床实用性及机制研究 | 开发膀胱癌治疗反应预测生物标志物 | 人类膀胱癌组织样本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单核RNA测序, 空间转录组, 单细胞空间蛋白质组 | NA | 单细胞RNA序列, 空间转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 235 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA transcriptome landscape of hepatocytes and non-parenchymal cells in healthy and NAFLD mouse liver
2021-Nov-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103233
PMID:34755088
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了健康和非酒精性脂肪肝小鼠肝脏中肝细胞及非实质细胞的转录组景观 | 发现了肝星状细胞在基因表达调控和向肌成纤维细胞转分化中的双重作用，识别了三种嵌合型非实质细胞 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究非酒精性脂肪肝发病机制的细胞分子基础 | 健康和非酒精性脂肪肝小鼠肝脏中的肝细胞及非实质细胞 | 单细胞组学 | 非酒精性脂肪肝 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 82,168个单细胞转录组，涵盖不同NAFLD阶段 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 236 | 2025-10-07 |
Processing single-cell RNA-seq data for dimension reduction-based analyses using open-source tools
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100450
PMID:33982010
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研究论文 | 介绍使用开源工具构建单细胞RNA测序数据处理流程，用于降维分析 | 提出模块化开源软件构建的完整数据分析流程，强调流程灵活性优于商业平台 | 未提及具体性能指标或与其他方法的对比验证 | 开发灵活的单细胞RNA测序数据处理流程 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 237 | 2025-10-07 |
Cobolt: integrative analysis of multimodal single-cell sequencing data
2021-12-28, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02556-z
PMID:34963480
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研究论文 | 提出Cobolt方法用于整合分析多模态单细胞测序数据 | 不仅能分析联合模态平台的数据，还提供了整合不同模态测量的多个数据集的一致框架 | NA | 开发多模态单细胞测序数据的整合分析方法 | 单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 多组学单细胞测序 | NA | NA |
| 238 | 2025-10-07 |
Isolation of Endothelial Cells from the Lumen of Mouse Carotid Arteries for Single-cell Multi-omics Experiments
2021-10-04, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/63128
PMID:34661575
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研究论文 | 开发从小鼠颈动脉管腔分离内皮细胞的方法用于单细胞多组学研究 | 建立了通过管腔消化法富集动脉内皮细胞的新方法，解决了内皮细胞在动脉壁细胞中占比低的技术难题 | 方法中仍存在平滑肌细胞、成纤维细胞和免疫细胞等污染，且尚未在人类动脉样本中验证 | 研究血流动力学对内皮细胞转录组和表观基因组的影响 | 小鼠颈动脉内皮细胞 | 单细胞多组学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 小鼠部分颈动脉结扎模型，左颈动脉为实验组，右颈动脉为对照组 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Genomics微流体系统 |
| 239 | 2025-10-07 |
Ex vivo mass cytometry analysis reveals a profound myeloid proinflammatory signature in psoriatic arthritis synovial fluid
2021-12, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-220280
PMID:34226188
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研究论文 | 本研究通过质谱流式细胞术和多组学分析揭示了银屑病关节炎滑液中髓系细胞的显著促炎特征 | 首次在无体外刺激条件下发现银屑病关节炎滑液中的经典单核细胞、中间单核细胞和巨噬细胞自发产生高水平骨桥蛋白和CCL2等促炎介质 | 研究样本量有限，且主要关注髓系细胞而T细胞自发细胞因子产生较少 | 识别银屑病关节炎滑液和血液中淋巴细胞和髓系细胞在无刺激条件下的细胞因子产生情况 | 银屑病关节炎患者的滑液和配对血液白细胞 | 免疫学 | 银屑病关节炎 | 质谱流式细胞术, 转录组分析, 单细胞RNA测序, ELISA, LEGENDplex分析 | NA | 细胞表型数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 | 银屑病关节炎患者的滑液和配对血液样本 | NA | 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序, 基因芯片, 蛋白质检测 | NA | NA |
| 240 | 2024-08-09 |
Single cell and spatial transcriptomics in human tendon disease indicate dysregulated immune homeostasis
2021-11, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-220256
PMID:34001518
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |