单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-08-07 |
MYC Promotes Bone Marrow Stem Cell Dysfunction in Fanconi Anemia
2021-01-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.09.004
PMID:32997960
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了范可尼贫血患者的造血干细胞和祖细胞，发现MYC的高表达与骨髓衰竭相关，并探讨了MYC抑制剂对FA患者造血干细胞的影响 | 首次揭示了MYC在范可尼贫血骨髓衰竭中的作用，并通过实验验证了MYC抑制剂对FA患者造血干细胞的潜在治疗效果 | 研究主要集中在细胞和动物模型上，尚未进行临床试验验证MYC抑制剂的临床应用效果 | 探讨范可尼贫血患者骨髓衰竭的分子机制及潜在治疗策略 | 范可尼贫血患者的造血干细胞和祖细胞 | NA | 范可尼贫血 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 来自范可尼贫血患者的造血干细胞和祖细胞样本 |
| 222 | 2024-08-07 |
Bi-FoRe: an efficient bidirectional knockin strategy to generate pairwise conditional alleles with fluorescent indicators
2021-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-020-00747-1
PMID:32681448
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Bi-FoRe的高效双向敲入策略，用于生成带有荧光指示器的成对条件性等位基因 | 首次报道了通过单一供体生成具有条件性和基因标记双重功能的成对双功能敲入等位基因 | NA | 开发一种新的策略，用于基因表达标记和基因功能的条件性调控 | zebrafish中的sox10和isl1基因座 | 基因工程 | NA | CRISPR/Cas系统 | NA | 基因组数据 | NA |
| 223 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies macrophage transcriptional heterogeneities in granulomatous diseases
2021-06, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.03794-2020
PMID:33602861
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 224 | 2024-08-05 |
Airspace Macrophages and Monocytes Exist in Transcriptionally Distinct Subsets in Healthy Adults
2021-04-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202005-1989OC
PMID:33079572
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研究论文 | 本文揭示了健康成年人肺泡和小气道中存在的转录性不同的巨噬细胞亚群 | 首次描述了健康状态下肺间隙免疫细胞的保守异质性，并识别了两种新型巨噬细胞亚群 | 样本仅限于十名健康成年人，可能不具备广泛适用性 | 理解健康状态下肺间隙巨噬细胞的转录异质性 | 健康成年人气道灌洗液中获取的人类细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 十名健康成年人 |
| 225 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling and the use of AID deficient mice reveal that B cell activation combined with antibody class switch recombination and somatic hypermutation do not benefit the control of experimental trypanosomosis
2021-11, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1010026
PMID:34762705
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研究论文 | 本文研究了在AID缺失小鼠中B细胞活化与抗体类别转换和体细胞高突变对实验性锥虫病控制的影响 | 首次在锥虫感染小鼠的脾细胞上应用scRNA-seq分析，揭示了自然IgM在抗锥虫感染中的独特作用 | 研究主要集中在鼠模型中，可能无法完全反映人类感染的复杂性 | 探讨锥虫感染中B细胞的作用及其对宿主免疫反应的影响 | 锥虫感染的小鼠脾细胞及其B细胞反应 | 数字病理学 | 锥虫病 | scRNA-seq、流式细胞术、ELISA | NA | 细胞 | 锥虫感染的老鼠脾细胞 |
| 226 | 2024-08-05 |
In silico analysis suggests disruption of interactions between HAMP from hepatocytes and SLC40A1 from macrophages in hepatocellular carcinoma
2021-May-17, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-021-00977-0
PMID:34001107
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研究论文 | 本研究通过分析HCC微环境中的细胞之间的相互作用，探讨肝癌的增殖机制 | 首次揭示了HAMP与SLC40A1之间的相互作用在肝细胞癌异常增殖中的重要性 | 尚需通过湿实验进行进一步验证 | 识别肝细胞癌及其旁癌组织中的增殖性肝细胞，并探讨其异常增殖的潜在作用 | 增殖性肝细胞及其在HCC和旁癌组织中的基因表达特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了来自HCC及其旁癌组织的单细胞样本 |
| 227 | 2024-08-05 |
Taming human brain organoids one cell at a time
2021-03, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2020.05.022
PMID:32718852
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review | 本综述总结了单细胞转录组技术在解析人脑类器官复杂性方面的最新方法、进展和挑战 | 文章创新在于整合了单细胞转录组学和新兴技术，以深入研究人脑发展和疾病特征 | 文章没有讨论具体的应用案例和局限性 | 研究人脑类器官的复杂性及其在发育过程中的基因调控 | 人脑类器官，特别是它们的细胞组成和发育起源 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 228 | 2024-08-05 |
Novel method to repair articular cartilage by direct reprograming of prechondrogenic mesenchymal stem cells
2021-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2021.174416
PMID:34606836
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研究论文 | 本研究提出了一种通过直接重编程前软骨源间充质干细胞来修复关节软骨的新方法 | 本研究创新性地利用外部电场促进前软骨形成，而无需基因修饰或外源性因子 | 本研究未提到对动物模型的长期应用效果 | 旨在提高用于修复软骨缺损的软骨细胞的生成效率 | 使用犬的脂肪来源间充质干细胞（ADSCs）作为研究对象 | 数字病理学 | NA | 电刺激（ES） | NA | 单细胞RNA测序分析 | 犬的ADSC微团 |
| 229 | 2024-08-05 |
Significance and limitations of the use of next-generation sequencing technologies for detecting mutational signatures
2021-Nov, DNA repair
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.dnarep.2021.103200
PMID:34411908
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综述 | 本文探讨了不同的下一代测序技术在检测突变特征中的重要性和限制 | 文章总结了多种下一代测序技术的应用及其固有的测序偏见与技术伪影 | 每种测序技术都有其固有的偏见和可能产生的技术伪影，这可能影响突变特征的可靠提取 | 研究不同下一代测序技术检测突变模式及解读突变特征的相关性和前景 | 聚焦于人类癌症的突变特征及其与环境因素和DNA修复通路的关系 | 数字病理学 | 肿瘤 | 下一代测序技术（NGS） | NA | 基因组数据 | NA |
| 230 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome atlas of the leaf and root of rice seedlings
2021-Oct-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2021.06.001
PMID:34340913
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了水稻幼苗的叶子和根部的转录组特征 | 首次构建了水稻幼苗的单细胞转录组图谱，并揭示了细胞类型特异的转录响应与环境刺激之间的关系 | 目前的研究仅关注于特定的环境胁迫下的转录组特征，可能未涵盖所有可能的应激条件 | 研究水稻幼苗在不同环境刺激下的单细胞转录组特征及其细胞特异性响应 | 水稻幼苗的237,431个个体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 237,431个个体细胞 |
| 231 | 2024-08-05 |
Tissue-specific smooth muscle cell subtypes identified by transcriptional profiling
2021-Oct, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2021.106055
PMID:34411694
|
研究论文 | 本文研究了不同组织中特定平滑肌细胞(SMCs)的转录组特征 | 识别了平滑肌细胞的新亚型并揭示其在不同组织内的功能多样性 | 研究基于小鼠数据，可能不完全适用于人类 | 探讨特定平滑肌细胞的转录组特征及其适应性 | 提取了来源于八种小鼠组织的平滑肌细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 八种小鼠组织的平滑肌细胞样本 |
| 232 | 2024-08-05 |
Implication of specific retinal cell-type involvement and gene expression changes in AMD progression using integrative analysis of single-cell and bulk RNA-seq profiling
2021-Aug-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-95122-3
PMID:34341398
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研究论文 | 本研究分析了与年龄相关性黄斑变性（AMD）进展相关的特定视网膜细胞类型及基因表达变化 | 本研究首次结合单细胞RNA测序和大量RNA测序深入探讨了视网膜疾病的分子机制，识别了267个细胞类型特异基因 | 研究对象仅包括两名成人供体的视网膜细胞，样本限制可能影响结果的广泛适用性 | 探讨AMD进展过程中的细胞类型组成和基因表达变化 | 来自两名成人供体的视网膜细胞及十五名成人供体的RNA样本 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序和大规模RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约93,000个细胞和15名成人供体的样本 |
| 233 | 2024-08-05 |
XenoCell: classification of cellular barcodes in single cell experiments from xenograft samples
2021-Jan-29, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-021-00872-8
PMID:33514375
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研究论文 | 本文开发了XenoCell，一个用于单细胞实验的细胞条形码分类工具 | XenoCell是第一个独立的预处理工具，能够快速可靠地分类来自宿主和移植物的细胞条形码 | 在处理混合物种细胞实验时可能仍存在一定的挑战，尤其在高复杂性的样本中 | 研究旨在提高在异种移植样本中准确区分宿主与移植物的细胞序列读取的能力 | 研究对象为来自患者衍生活检的异种移植样本的单细胞序列数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | 在10× Genomics平台的混合物种50:50细胞系实验和公开的PDX数据集中使用 |
| 234 | 2024-08-05 |
The Nereid on the rise: Platynereis as a model system
2021-Sep-27, EvoDevo
IF:4.1Q1
DOI:10.1186/s13227-021-00180-3
PMID:34579780
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研究论文 | 该文章概述了海洋环节动物Platynereis dumerilii作为模型系统的最新研究进展和方法论 | 强调了Nereid幼虫在全身体积电子显微镜和单细胞测序中的独特优势 | 未提及具体的限制因素 | 旨在激发对Platynereis模型的进一步兴趣，并扩展活跃的研究社区 | 研究对象为Nereid Platynereis dumerilii及其相关生物学特征 | 生态毒理学 | NA | 全身体积电子显微镜、单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 235 | 2024-08-05 |
Multifunctional barcoding with ClonMapper enables high-resolution study of clonal dynamics during tumor evolution and treatment
2021-07, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-021-00222-8
PMID:34939038
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研究论文 | 本文开发了一个功能化的谱系追踪系统ClonMapper，可以综合表征异质性人群中的数千个克隆。 | ClonMapper整合了DNA条形码与单细胞RNA测序及克隆分离，实现了高分辨率的克隆动态研究。 | NA | 研究肿瘤进展和治疗反应中的复杂克隆动态。 | 慢性淋巴细胞白血病细胞系及其克隆亚群体。 | 数字病理学 | 淋巴癌 | 单细胞RNA测序、DNA条形码技术 | NA | 细胞、RNA | 数千个克隆 |
| 236 | 2024-08-05 |
A multicenter study benchmarking single-cell RNA sequencing technologies using reference samples
2021-09, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-00748-9
PMID:33349700
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研究论文 | 本文比较了不同技术和实验室生成的单细胞RNA测序数据集 | 提出了在选择算法以实现准确生物解释方面的指导 | 尽管结果具有较高的可重复性，但可能在不同平台的算法选择上仍存在挑战 | 旨在优化单细胞RNA测序研究中的平台和软件选择 | 使用乳腺癌细胞和B细胞作为参考样本进行比较 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个来源的细胞样本，包括乳腺癌细胞和B细胞 |
| 237 | 2024-08-05 |
Gene Deconvolution Reveals Aberrant Liver Regeneration and Immune Cell Infiltration in Alcohol-Associated Hepatitis
2021-08, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.31759
PMID:33619773
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研究论文 | 本文通过基因解卷积揭示了与酒精相关性肝炎中异常的肝脏再生和免疫细胞浸润 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了慢性肝病中细胞组成的显著变化，尤其是在严重急性肝炎患者中 | 样本数量有限，可能影响结果的广泛性和适用性 | 探讨慢性肝病中肝细胞再生和免疫细胞浸润的差异性贡献 | 健康肝脏和慢性肝病患者的肝细胞及免疫细胞 | 数字病理学 | 酒精相关性肝炎 | RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 有限数量的慢性肝病患者样本 |
| 238 | 2024-08-05 |
Impaired immune signaling and changes in the lung microbiome precede secondary bacterial pneumonia in COVID-19
2021-Nov-30, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2021.03.23.21253487
PMID:33791731
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研究论文 | 本文评估了COVID-19患者肺部免疫反应和微生物组动态，特别是与继发性细菌肺炎的关系 | 研究发现COVID-19患者在继发性细菌感染前的免疫信号受损，以及微生物组组成的变化 | 样本量相对较小，仅包括23名COVID-19患者 | 探讨COVID-19患者免疫信号失调如何导致继发性细菌肺炎 | 23名COVID-19患者及8名重症未感染对照 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 23名COVID-19患者和8名重症未感染对照 |
| 239 | 2024-08-05 |
A Spatial Quantitative Systems Pharmacology Platform spQSP-IO for Simulations of Tumor-Immune Interactions and Effects of Checkpoint Inhibitor Immunotherapy
2021-Jul-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13153751
PMID:34359653
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研究论文 | 本文开发了一个混合计算模型平台 spQSP-IO，用于研究肿瘤-免疫相互作用及检查点抑制免疫疗法的效果 | 本研究创新性地结合了空间解析的基于代理的模型与QSP模型，增强了其预测能力 | 目前尚未明确提及具体的限制 | 研究肿瘤微环境与癌症-免疫细胞相互作用对肿瘤发展的影响 | 非小细胞肺癌模型的虚拟患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 成像技术，空间转录组学 | 基于代理的模型（ABM） | 空间数据 | 虚拟患者的模拟模型 |
| 240 | 2024-08-07 |
Author Correction: A yeast-optimized single-cell transcriptomics platform elucidates how mycophenolic acid and guanine alter global mRNA levels
2021-Jul-13, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02420-7
PMID:34257405
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |