单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 2341 - 2360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2341 | 2024-08-09 |
Computational modeling of malignant ascites reveals CCL5-SDC4 interaction in the immune microenvironment of ovarian cancer
2021-05, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23289
PMID:33721368
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了卵巢癌患者的腹水细胞，揭示了CCL5-SDC4相互作用在卵巢癌免疫微环境中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序和NicheNet分析预测了卵巢癌中免疫细胞与癌细胞之间的通信，并发现了CCL5-SDC4相互作用在卵巢癌细胞生存中的潜在作用 | 研究样本量较小，仅基于五个患者的腹水细胞进行分析 | 探究卵巢癌患者腹水中细胞类型及其相互作用，寻找潜在的预后标志物 | 卵巢癌患者的腹水细胞及其在免疫微环境中的相互作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NicheNet | 细胞 | 五个卵巢癌患者的腹水细胞 |
| 2342 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics as a building block for determining mechanistic insight of abdominal aortic aneurysm formation
2021-04-23, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvab083
PMID:33723571
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2343 | 2024-08-09 |
Methods and tools for spatial mapping of single-cell RNAseq clusters in Drosophila
2021-04-15, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyab019
PMID:33713129
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review | 本文综述了在果蝇中进行单细胞RNA测序（scRNAseq）簇空间映射的方法和工具 | 讨论了多重基因表达原位检测的需求、可用方法和试剂，以及利用现有数据集和新技术进行高分辨率空间映射的可能性 | 需要额外的验证来精确映射簇中细胞的空间位置 | 探讨如何将scRNAseq簇映射到果蝇的具体解剖区域 | 单细胞RNA测序实验中识别的细胞簇 | digital pathology | NA | scRNAseq | NA | text | NA |
| 2344 | 2024-08-09 |
Decoding Neuronal Diversification by Multiplexed Single-cell RNA-Seq
2021-04-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.02.006
PMID:33711266
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研究论文 | 本文通过多重单细胞RNA测序技术，研究了人类皮肤成纤维细胞中20种促进神经元转录因子的异位表达，揭示了神经元多样化的分子机制 | 本文采用多重单细胞RNA测序技术，首次展示了神经元多样化的广泛性和特异性，并揭示了神经元谱系特异性的关键决定因素和调控逻辑 | NA | 探索细胞类型特化和多样化的调控逻辑 | 人类皮肤成纤维细胞中的神经元多样化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 20种促进神经元的转录因子 |
| 2345 | 2024-08-09 |
Topoisomerase IIβ immunoreactivity (IR) co-localizes with neuronal marker-IR but not glial fibrillary acidic protein-IR in GLI3-positive medulloblastomas: an immunohistochemical analysis of 124 medulloblastomas from the Japan Children's Cancer Group
2021-Apr, Brain tumor pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s10014-021-00396-0
PMID:33704596
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研究论文 | 本研究探讨了拓扑异构酶IIβ（TOP2β）在表达神经元标记物（NM）和胶质纤维酸性蛋白（GFAP）的成神经管细胞瘤中的作用，并分析了GLI3、NM、GFAP和TOP2β表达的病理角色。 | 研究首次揭示了TOP2β免疫反应性与神经元标记物共定位，而非与胶质纤维酸性蛋白共定位，这一发现有助于理解成神经管细胞瘤的神经分化调控机制。 | 研究主要基于免疫组织化学分析和单细胞RNA测序数据，可能需要更多类型的实验验证和更大样本量的研究来进一步确认结果。 | 旨在探讨TOP2β在成神经管细胞瘤中的作用及其与神经元分化相关标记物的关系。 | 研究对象为124例成神经管细胞瘤样本，分为NM-/GFAP-、NM+/GFAP-和GFAP+三组。 | 数字病理学 | 成神经管细胞瘤 | 免疫组织化学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 124例成神经管细胞瘤样本 |
| 2346 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing redefines the mesenchymal cell landscape of mouse endometrium
2021-04, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202002123R
PMID:33710643
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术重新定义了小鼠子宫内膜的间充质细胞景观 | 首次明确分析了成年小鼠子宫内膜中的间充质细胞，并识别出五个亚群，为比较子宫内膜与其他易发生纤维化的成年组织中的间充质细胞提供了平台 | NA | 重新定义小鼠子宫内膜的间充质细胞景观 | 小鼠子宫内膜的间充质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五个亚群的细胞 |
| 2347 | 2024-08-09 |
Ethylene glycol butyl ether deteriorates oocyte quality via impairing mitochondrial function
2021-04, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202002157R
PMID:33710673
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研究论文 | 研究报告了乙烯乙二醇丁醚（EGBE）通过损害线粒体功能影响卵母细胞质量 | 首次详细探讨了EGBE对女性生殖系统特别是卵母细胞质量的影响，并揭示了其通过线粒体功能障碍导致卵母细胞质量下降的机制 | 研究主要集中在实验室条件下，未来需要更多的临床和环境暴露研究来验证这些发现 | 探讨EGBE对卵母细胞质量的影响及其机制 | 乙烯乙二醇丁醚（EGBE）对卵母细胞质量的影响 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 2348 | 2024-08-09 |
Phosphatidylinositol-3 kinase signaling controls survival and stemness of hematopoietic stem and progenitor cells
2021-04, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-021-01733-5
PMID:33714985
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研究论文 | 研究探讨了磷脂酰肌醇-3激酶（PI3K）信号通路在调控造血干细胞和祖细胞（HSPCs）存活和干细胞特性中的作用 | 发现PI3K信号通路在调控HSPCs存活和干细胞特性中的关键作用，以及在pten突变胚胎中PI3K抑制剂的挽救效应 | NA | 研究PI3K信号通路在HSPCs存活和干细胞特性调控中的作用 | 造血干细胞和祖细胞（HSPCs） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用突变斑马鱼胚胎进行体内活体成像研究 |
| 2349 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq analysis reveals compartment-specific heterogeneity and plasticity of microglia
2021-Mar-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102186
PMID:33718838
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了大脑皮层和脊髓中微胶质细胞的亚型及其异质性和可塑性 | 首次揭示了大脑皮层和脊髓中微胶质细胞在不同区域的异质性和可塑性差异 | NA | 探究微胶质细胞在不同中枢神经系统区域的异质性和可塑性 | 大脑皮层和脊髓中的微胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | C57/BL和HIV gp120转基因小鼠的样本，年龄分别为两个月、四个月和八个月 |
| 2350 | 2024-08-09 |
Age-related changes in polycomb gene regulation disrupt lineage fidelity in intestinal stem cells
2021-03-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.62250
PMID:33724181
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研究论文 | 本文通过全基因组染色质可及性和转录组分析以及单细胞RNA测序，探讨了衰老肠道中干细胞内在变化对谱系决策的影响。 | 首次揭示了衰老过程中肠道干细胞中Polycomb（Pc）基因调控的变化，及其对肠内分泌（EE）细胞分化和谱系特异性的影响。 | 研究主要集中在果蝇模型上，可能需要进一步在哺乳动物模型中验证这些发现。 | 探究衰老过程中肠道干细胞谱系忠诚度的变化及其机制。 | 衰老肠道中的干细胞及其谱系特异性。 | NA | NA | 全基因组染色质可及性分析、转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 2351 | 2024-08-09 |
Mapping the immune microenvironment for mandibular alveolar bone homeostasis at single-cell resolution
2021-Mar-15, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-021-00141-5
PMID:33723232
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了小鼠下颌牙槽骨的单细胞图谱，揭示了牙槽骨中更为活跃的免疫微环境 | 首次系统性地解释了牙槽骨在单细胞水平上的免疫微环境，发现牙槽骨中成熟的免疫细胞比例高于长骨，并且单核/巨噬细胞亚群与间充质干细胞亚群之间的相互作用更为活跃 | NA | 揭示牙槽骨独特的免疫微环境，为口腔疾病的免疫调节治疗提供精确靶点 | 小鼠下颌牙槽骨的免疫微环境 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠下颌牙槽骨样本 |
| 2352 | 2024-08-09 |
Targeting Erbin in B cells for therapy of lung metastasis of colorectal cancer
2021-03-12, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-021-00501-x
PMID:33707428
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和临床样本分析，揭示了Erbin在B细胞中的作用及其在结直肠癌肺转移中的机制 | 首次发现Erbin在B细胞中的表达与结直肠癌肺转移有关，并证实通过靶向Erbin可以抑制肿瘤的肺转移 | 研究主要在动物模型中进行，需要进一步的临床试验验证其治疗效果 | 探究结直肠癌肺转移的机制及潜在治疗策略 | 结直肠癌肺转移中的B细胞和Erbin的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自结直肠癌肺转移患者的临床样本 |
| 2353 | 2024-08-09 |
Understanding Heart Field Progenitor Cells for Modeling Congenital Heart Diseases
2021-03-11, Current cardiology reports
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s11886-021-01468-5
PMID:33694131
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综述 | 本文综述了心脏发育过程中涉及的两个不同心脏前体细胞群体（第一和第二心脏场）的信号通路和转录因子，以及它们与先天性心脏病的关联 | 单细胞转录组学、谱系追踪小鼠模型和基于干细胞的心脏发生体外模型显著改善了心脏前体细胞的时空特征化。此外，新的功能基因组学研究已经将更多的遗传变异与先天性心脏病联系起来 | NA | 旨在描述连接心脏场发育和先天性心脏病的信号通路和转录因子 | 心脏前体细胞及其在心脏发育中的作用 | NA | 先天性心脏病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 2354 | 2024-08-09 |
DeepTCR is a deep learning framework for revealing sequence concepts within T-cell repertoires
2021-03-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21879-w
PMID:33707415
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research paper | 本文介绍了一种名为DeepTCR的深度学习框架，用于揭示T细胞受体（TCR）序列中的概念 | DeepTCR通过学习TCR的CDR3序列和V/D/J基因使用的联合表示，能够建模高度复杂的TCR测序数据 | NA | 利用深度学习算法提高模式识别任务的性能，并在免疫基因组学领域中应用 | T细胞受体（TCR）序列数据 | machine learning | NA | 深度学习 | 深度神经网络 | 序列数据 | 涉及多个人类和鼠类数据集 |
| 2355 | 2024-08-09 |
Atoh7-independent specification of retinal ganglion cell identity
2021-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abe4983
PMID:33712461
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research paper | 研究探讨了Atoh7在视网膜神经节细胞（RGCs）身份指定中的作用，发现存在Atoh7依赖和非依赖的RGC指定机制 | 揭示了Atoh7在RGC生存中的关键作用，并证明了Atoh7依赖和非依赖的RGC指定机制 | NA | 探究Atoh7在视网膜神经节细胞身份指定中的作用 | 视网膜神经节细胞（RGCs）及其在视网膜神经发生中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2356 | 2024-08-09 |
Single Cell RNA-Seq and Machine Learning Reveal Novel Subpopulations in Low-Grade Inflammatory Monocytes With Unique Regulatory Circuits
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.627036
PMID:33708217
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习方法，揭示了低级别炎症单核细胞中的新型亚群及其独特的调控网络 | 开发了一种机器学习方法，结合单细胞RNA测序、ATAC-seq和结合基序，有效识别和表征了细胞亚群的基因调控网络 | NA | 旨在理解低级别炎症激活单核细胞的基因调控网络，并探索潜在的治疗化合物 | 低级别炎症激活的单核细胞及其在炎症疾病中的作用 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | 从处理过的鼠单核细胞中生成了单细胞RNA测序数据，并识别出11个新型细胞簇 |
| 2357 | 2024-08-09 |
In silico Analyses of Immune System Protein Interactome Network, Single-Cell RNA Sequencing of Human Tissues, and Artificial Neural Networks Reveal Potential Therapeutic Targets for Drug Repurposing Against COVID-19
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.598925
PMID:33716737
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研究论文 | 本研究通过分析免疫系统蛋白质相互作用网络、单细胞RNA测序以及人工神经网络，揭示了针对COVID-19药物再利用的潜在治疗靶点 | 本研究结合了多种先进技术，包括免疫系统蛋白质相互作用网络分析、单细胞RNA测序和深度神经网络，以发现新的治疗靶点和药物 | 研究结果需要通过临床试验进一步验证，以确定其在实际治疗中的有效性 | 旨在发现和验证针对COVID-19的有效治疗靶点和药物 | 研究对象包括免疫系统蛋白质、单细胞RNA测序数据以及多种药物 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 蛋白质相互作用网络数据、RNA测序数据 | 1,584个高置信度免疫系统蛋白质，10,672种药物 |
| 2358 | 2024-08-09 |
Using Single-Cell RNA-Seq Data to Trace Tissue Cells Responsive to Thyroid Hormones
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.609308
PMID:33716967
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序数据追踪对甲状腺激素有反应的组织细胞 | 首次利用Tabula Muris Consortium生成的单细胞转录组图谱，通过计算不同细胞类型的Thra和Thrb表达能力，识别对甲状腺激素调节敏感的细胞类型 | 本文的计算预测结果需要通过实验室实验进一步验证 | 理解甲状腺激素在细胞水平上的调节机制 | 追踪对甲状腺激素有反应的组织细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 细胞聚类算法 | 基因表达数据 | 23种组织和器官的数据 |
| 2359 | 2024-08-09 |
Epigenetic Landscapes of Single-Cell Chromatin Accessibility and Transcriptomic Immune Profiles of T Cells in COVID-19 Patients
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.625881
PMID:33717140
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研究论文 | 本研究通过单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了COVID-19患者外周血单个核细胞（PBMCs）的染色质可及性和转录组免疫特征 | 首次综合利用scATAC-seq和scRNA-seq技术，深入解析了COVID-19患者T细胞的表观遗传状态和转录组免疫特征，提供了比单纯scRNA-seq分析更高分辨率的细胞特征 | NA | 揭示T细胞在COVID-19中的作用机制 | COVID-19重症/危重症患者、中度患者和健康志愿者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞数据 | 76,570和107,862个单细胞分别用于染色质可及性和转录组免疫特征分析 |
| 2360 | 2024-08-09 |
Spontaneously Resolved Atopic Dermatitis Shows Melanocyte and Immune Cell Activation Distinct From Healthy Control Skin
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.630892
PMID:33717163
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研究论文 | 研究探讨了自愈型特应性皮炎（AD）患者皮肤中黑素细胞和免疫细胞的激活情况，并与健康对照皮肤和慢性活动性AD皮肤进行了比较 | 发现自愈型AD皮肤中的黑素细胞和常规T细胞可能贡献了特定的调节环境，其细胞组成和蛋白质组学特征与健康对照皮肤相似，未上调典型的AD活动标志物 | 仅限于对自愈型AD成年患者的皮肤样本进行研究，未涉及其他年龄段或不同病程的患者 | 探究特应性皮炎自然病程中的因素 | 自愈型AD患者的皮肤细胞和组织液 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序和蛋白质组多重检测 | NA | 细胞和组织液 | 成年自愈型AD患者和健康对照的皮肤样本 |