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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2301 | 2024-08-09 |
TCF7 is not essential for glucose homeostasis in mice
2021-06, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2021.101213
PMID:33741532
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子TCF7在小鼠肝细胞和胰岛β细胞中的表达对葡萄糖稳态的相对代谢重要性 | 发现TCF7表达并非小鼠葡萄糖稳态的关键决定因素,且胰岛中TCF7的表达主要来自与胰岛相关的免疫细胞而非β细胞 | NA | 研究TCF7在肝细胞和胰岛β细胞中的表达对小鼠葡萄糖稳态的影响 | 小鼠的肝细胞和胰岛β细胞 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 使用不同饮食的小鼠进行实验,包括常规饮食和高脂饮食的小鼠 |
2302 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Cellular Origin and Evolution of Breast Cancer in BRCA1 Mutation Carriers
2021-05-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-2123
PMID:33727227
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了BRCA1突变携带者中乳腺癌的细胞起源和发展 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了BRCA1突变携带者中乳腺癌的细胞起源,特别是雌激素受体阳性乳腺癌的起源 | 研究样本量相对较小,可能需要进一步扩大样本以验证结果的普遍性 | 探究BRCA1突变携带者中乳腺癌的细胞起源和发展 | BRCA1突变携带者的乳腺癌组织及其邻近或预防性正常乳腺组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 82,122个细胞,来自4名BRCA1突变携带者和3名非携带者 |
2303 | 2024-08-09 |
Ex utero mouse embryogenesis from pre-gastrulation to late organogenesis
2021-05, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03416-3
PMID:33731940
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研究论文 | 本文介绍了一种高效的体外培养系统,用于从原肠胚形成前到晚期器官发生阶段的鼠胚胎发育 | 该系统能够精确模拟体内发育过程,并适用于引入各种胚胎扰动和微操作 | NA | 研究胚胎发育过程,特别是后植入期的形态发生和人工胚胎发生 | 鼠胚胎从原肠胚形成前到晚期器官发生阶段的发育过程 | NA | NA | 三维旋转瓶培养技术,单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
2304 | 2024-08-09 |
Angiodiversity and organotypic functions of sinusoidal endothelial cells
2021-05, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-021-09780-y
PMID:33745018
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综述 | 本文综述了血管多样性及器官特异性功能在肝窦内皮细胞(LSEC)中的表现 | 近年来,通过细胞分离和批量转录组学或单细胞RNA测序技术,识别了LSEC的分子程序和亚群,并发现了LSEC衍生的血管内分泌信号在肝脏稳态和疾病发病机制中的重要作用 | NA | 总结近年来对肝脏血管多样性的理解及其功能后果 | 肝窦内皮细胞(LSEC)及其在肝脏中的功能 | NA | NA | 电子显微镜、细胞分离技术、批量转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
2305 | 2024-08-09 |
Single-cell mRNA profiling reveals changes in solute carrier expression and suggests a metabolic switch during zebrafish pronephros development
2021-05-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00610.2020
PMID:33749326
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了斑马鱼前肾在发育过程中溶质载体表达的变化,揭示了代谢转换的机制 | 首次揭示了斑马鱼胚胎肾脏在发育过程中葡萄糖转运能力的变化,以及后期对单羧酸和氨基酸转运能力的增强 | NA | 探究斑马鱼前肾在发育过程中如何响应过滤底物和内在能量需求的变化 | 斑马鱼前肾的溶质载体表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 斑马鱼前肾的细胞 |
2306 | 2024-08-09 |
A single-cell survey of the human glomerulonephritis
2021-05, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.16407
PMID:33754492
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)分析了人类肾小球肾炎的细胞基因表达谱 | 首次定义了肾小球肾炎的足细胞标记物,并在细胞水平上发现了IgA、膜性肾病和狼疮性肾炎的特异性标记物 | 研究样本数量有限,可能影响结果的普遍性 | 揭示肾小球肾炎的细胞基因表达谱,以更好地理解其病理过程 | 人类肾移植供体样本、肾小球肾炎样本、恶性高血压样本和慢性间质性肾炎样本 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 共分析了8个样本,包括2个肾移植供体样本、4个肾小球肾炎样本、1个恶性高血压样本和1个慢性间质性肾炎样本 |
2307 | 2024-08-09 |
Correction for New perspectives of the cardiac cellular landscape: mapping cellular mediators of cardiac fibrosis using single-cell transcriptomics
2021-04-30, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST-2019-1255C_COR
PMID:33729456
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2308 | 2024-08-09 |
Obesity results in adipose tissue T cell exhaustion
2021-04-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.139793
PMID:33724954
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研究论文 | 研究探讨了肥胖如何影响脂肪组织T细胞的功能,发现肥胖的脂肪组织T细胞表现出炎症特性受损和T细胞耗竭的特征。 | 首次揭示了肥胖脂肪组织T细胞的功能特异性,以及肥胖通过环境因素和细胞内在因素导致T细胞功能障碍的机制。 | 研究主要集中在小鼠和人类样本上,可能需要进一步的临床研究来验证这些发现。 | 旨在理解肥胖如何影响适应性免疫系统,特别是脂肪组织T细胞的功能。 | 研究对象包括小鼠和人类的脂肪组织T细胞及其在肥胖状态下的功能变化。 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括小鼠和人类的脂肪组织样本 |
2309 | 2024-08-09 |
A single-cell analysis of the Arabidopsis vegetative shoot apex
2021-04-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2021.02.021
PMID:33725481
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术,对拟南芥营养茎顶端进行了转录组水平的细胞分类学分析 | 本文首次在单细胞分辨率下定义了拟南芥营养茎顶端的细胞分类学,并揭示了表皮细胞、维管组织和叶肉细胞的细胞周期连续性和发育轨迹 | NA | 研究植物细胞分裂和分化的基本原理 | 拟南芥营养茎顶端的细胞 | 植物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 7个广泛细胞群体和23个转录上不同的细胞集群 |
2310 | 2024-08-09 |
The AIM2 inflammasome exacerbates atherosclerosis in clonal haematopoiesis
2021-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03341-5
PMID:33731931
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研究论文 | 本文研究了AIM2炎症小体在克隆性造血引起的动脉粥样硬化中的作用 | 首次揭示了AIM2炎症小体在JAK2突变导致的动脉粥样硬化中的作用,并提出针对特定炎症小体和白细胞介素-1β的治疗策略 | NA | 探讨AIM2炎症小体在克隆性造血相关动脉粥样硬化中的作用及其机制 | 小鼠模型中的动脉粥样硬化病变 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
2311 | 2024-08-09 |
B cell-specific XIST complex enforces X-inactivation and restrains atypical B cells
2021-04-01, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.02.015
PMID:33735607
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研究论文 | 本文研究了长链非编码RNA XIST在成人B细胞中维持X染色体失活的作用,并揭示了其在特定B细胞类型中的功能和调节机制。 | 发现了XIST在成人B细胞中持续需要以沉默某些X连锁免疫基因,如TLR7,并揭示了XIST依赖的基因缺乏启动子DNA甲基化,需要持续的XIST依赖的组蛋白去乙酰化。 | NA | 探讨XIST在成人B细胞中的持续作用及其在特定细胞类型中的功能和调节机制。 | 长链非编码RNA XIST及其在B细胞中的作用。 | NA | NA | 单细胞转录组测序,CRISPRi筛选 | NA | 转录组数据 | 女性系统性红斑狼疮或COVID-19感染患者的单细胞转录组数据 |
2312 | 2024-08-09 |
Alignment of single-cell RNA-seq samples without overcorrection using kernel density matching
2021-04, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.261115.120
PMID:33741686
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Dmatch的方法,利用人类初级细胞的外部表达图谱和核密度匹配来对齐多个单细胞RNA测序实验,以便进行下游生物学分析 | Dmatch方法在模拟中与其他对齐方法相比,在减少样本特定聚类和避免过度校正方面表现更优 | NA | 开发一种新的方法来对齐单细胞RNA测序数据,以消除批次效应并促进跨多个实验的整合和比较 | 单细胞RNA测序数据,特别是来自健康个体和自身免疫疾病患者的临床样本 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | 核密度匹配 | 基因表达数据 | 来自健康个体和五名自身免疫疾病患者的样本 |
2313 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics reveal temporal dynamics of critical regulators of germ cell fate during mouse sex determination
2021-04, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202002420R
PMID:33749946
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了小鼠胚胎期9.0至16.5天的14,914个XX和XY生殖细胞的基因表达动态变化,揭示了性别决定过程中关键调控因子的时序动态 | 首次全面描述了小鼠性别决定过程中生殖细胞分化的基因表达动态,并识别了性别特异性的关键调控基因序列 | NA | 探究小鼠性别决定过程中生殖细胞分化的基因网络 | 小鼠胚胎期9.0至16.5天的XX和XY生殖细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 14,914个XX和XY小鼠生殖细胞 |
2314 | 2024-08-09 |
Epiregulin confers EGFR-TKI resistance via EGFR/ErbB2 heterodimer in non-small cell lung cancer
2021-04, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-021-01734-4
PMID:33750895
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研究论文 | 研究分析了七种EGFR配体对NSCLC细胞和患者EGFR-TKI敏感性的影响 | 发现Epiregulin通过诱导EGFR/ErbB2异二聚体形成,减少细胞对TKIs的敏感性,并揭示了肿瘤微环境中由巨噬细胞产生的Epiregulin作为EGFR-TKI治疗的新型调节因子和生物标志物 | 研究中Epiregulin在癌细胞中的过表达或敲低对TKI敏感性的影响较小 | 分析EGFR配体对NSCLC细胞EGFR-TKI敏感性的影响及其机制 | NSCLC细胞和患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 免疫荧光实验 | NA | 基因表达数据 | 涉及NSCLC细胞和患者的数据 |
2315 | 2024-08-09 |
PPARγ marks splenic precursors of multiple nonlymphoid-tissue Treg compartments
2021-03-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2025197118
PMID:33753509
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研究论文 | 本文探讨了表达低水平转录因子PPARγ的脾脏Treg细胞作为多个非淋巴组织Treg细胞前体的发现及其功能 | 发现脾脏中表达低水平PPARγ的Treg细胞群是多个非淋巴组织Treg细胞的前体,这一发现为实验或治疗调控非淋巴组织Treg细胞的产生提供了可能 | NA | 研究脾脏Treg细胞在非淋巴组织中的前体作用及其转录异质性 | 脾脏Treg细胞及其在非淋巴组织中的前体作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
2316 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics of the Drosophila wing disc reveals instructive epithelium-to-myoblast interactions
2021-03-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.61276
PMID:33749594
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组学技术,研究了果蝇翅盘发育过程中的上皮细胞与肌细胞前体之间的相互作用。 | 本文首次生成了翅盘的时序细胞图谱,并识别了介导上皮细胞与成年肌肉前体细胞信号传导的配体-受体对。 | NA | 探讨上皮细胞与肌细胞前体在果蝇翅盘发育中的相互作用。 | 果蝇翅盘的上皮细胞与肌细胞前体。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 两个发育时间点的翅盘样本 |
2317 | 2024-08-09 |
Hedgehog-induced PD-L1 on tumor-associated macrophages is critical for suppression of tumor-infiltrating CD8+ T cell function
2021-03-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.146707
PMID:33749663
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研究论文 | 本研究使用髓系特异性Pdl1敲除小鼠模型,证明了肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)上PD-L1的表达对抑制肿瘤内CD8+ T细胞功能至关重要 | 首次报道了Sonic hedgehog(Shh)通过信号转导子和转录激活子3依赖的途径上调TAMs中PD-L1的表达,从而抑制肿瘤浸润CD8+ T细胞功能 | NA | 探讨肿瘤微环境中肿瘤相关巨噬细胞上PD-L1表达在抑制抗肿瘤免疫中的精确作用 | 肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)和肿瘤内CD8+ T细胞 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类肝细胞癌样本 |
2318 | 2024-08-09 |
The migratory pathways of the cells that form the endocardium, dorsal aortae, and head vasculature in the mouse embryo
2021-03-22, BMC developmental biology
DOI:10.1186/s12861-021-00239-3
PMID:33752600
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研究论文 | 本文研究了小鼠胚胎中形成心内膜、背主动脉和头部血管的细胞的迁移路径 | 利用新开发的成像技术和Tal1及Flk1报告小鼠系,直接观察并可视化了细胞的三维迁移轨迹 | NA | 探究小鼠胚胎中主要胚胎血管形成的细胞来源及其迁移路径 | 小鼠胚胎中的心内膜、背主动脉和头部血管的细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学和成像技术 | NA | 图像 | NA |
2319 | 2024-08-09 |
WASP: a versatile, web-accessible single cell RNA-Seq processing platform
2021-Mar-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-021-07469-6
PMID:33736596
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研究论文 | 本文介绍了一种名为WASP的软件平台,用于处理基于Drop-Seq的单细胞RNA测序(scRNA-Seq)数据 | WASP是目前唯一一个免费且结合了ddSEQ和10x数据预处理和后处理的软件包 | NA | 开发一个直观且易于使用的工具来处理和探索scRNA-seq数据 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达矩阵 | NA |
2320 | 2024-08-09 |
Noise regularization removes correlation artifacts in single-cell RNA-seq data preprocessing
2021-Mar-12, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2021.100211
PMID:33748795
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研究论文 | 本研究评估了五种代表性的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据标准化/插补方法对人类细胞图谱骨髓数据中基因-基因关联推断的影响,并提出了一种模型无关的噪声正则化方法来消除相关性伪影 | 提出了一种模型无关的噪声正则化方法,有效消除了数据预处理步骤中引入的虚假相关性 | NA | 评估scRNA-seq数据预处理方法对基因-基因关联推断的影响,并提出改进方法 | scRNA-seq数据预处理方法及其对基因-基因关联的影响 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 模型无关 | 基因表达数据 | 人类细胞图谱骨髓数据 |