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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2281 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing, an Advanced Technology in Lung Cancer Research
2021, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S295102
PMID:33758510
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在肺癌研究中的应用及其研究成果 | 单细胞测序技术具有前所未有的高分辨率,为癌症研究提供了先进的技术手段 | NA | 进一步理解肺癌的异质性、转移、耐药性、肿瘤微环境等问题 | 肺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
2282 | 2024-08-09 |
Altered Monocyte Subsets in Kawasaki Disease Revealed by Single-cell RNA-Sequencing
2021, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S293993
PMID:33758528
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了健康婴儿与川崎病婴儿中不同单核细胞亚群的异质性及其在疾病中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面描绘了健康与川崎病婴儿中单核细胞的异质性,并揭示了川崎病中特定单核细胞亚群的变化 | 研究样本量较小,仅包括两名健康婴儿和两名川崎病婴儿 | 旨在全面描绘健康与川崎病婴儿中单核细胞的异质性,并揭示川崎病的潜在机制 | 健康婴儿和川崎病婴儿的外周单核细胞 | 数字病理学 | 川崎病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两名健康婴儿和两名川崎病婴儿的外周血样本 |
2283 | 2024-08-09 |
Function of Macrophages in Disease: Current Understanding on Molecular Mechanisms
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.620510
PMID:33763066
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综述 | 本文综述了组织驻留巨噬细胞(TRMs)在疾病中的作用及其分子机制的最新理解 | 探讨了较少为人知的分子及已知分子的新功能,这些分子可能成为新的巨噬细胞介导治疗或诊断方法的潜在标志物 | NA | 旨在理解这些分子在巨噬细胞中的机制,以开发新的巨噬细胞介导的治疗或诊断方法 | 组织驻留巨噬细胞及其在疾病中的作用和分子机制 | NA | NA | 命运图谱和单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
2284 | 2024-08-09 |
Leveraging Single-Cell RNA-seq Data to Uncover the Association Between Cell Type and Chronic Liver Diseases
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.637322
PMID:33763117
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研究论文 | 本文通过综合分析慢性肝病(CLD)的GWAS和单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,揭示了与CLD相关的细胞类型 | 利用scRNA-seq技术以高分辨率探索肝脏组织的细胞多样性和功能,并结合GWAS数据进行综合分析 | 在特异性分析中未发现与肝细胞癌(HCC)显著相关的细胞类型,且未发现与肝硬化显著相关的细胞类型 | 揭示慢性肝病的病理机制,特别是与特定细胞类型的关联 | 慢性肝病及其相关细胞类型 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据 | 约19,002-32,200个细胞,识别出10-17种细胞类型 |
2285 | 2024-08-09 |
Deciphering Tumor Heterogeneity in Hepatocellular Carcinoma (HCC)-Multi-Omic and Singulomic Approaches
2021-01, Seminars in liver disease
IF:4.3Q1
DOI:10.1055/s-0040-1722261
PMID:33764481
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综述 | 本文综述了多组学和单细胞测序技术在解析肝细胞癌(HCC)肿瘤异质性方面的进展 | 结合多区域靶向采样策略与深度测序技术,揭示了HCC肿瘤起始和进展的新机制,并展示了液体活检在避免组织采样需求方面的潜力 | NA | 探讨多组学和单细胞测序技术如何增进我们对HCC肿瘤异质性的理解 | 肝细胞癌(HCC)的肿瘤异质性 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 下一代测序 | NA | 基因组、转录组、表观基因组和蛋白质组数据 | NA |
2286 | 2024-08-09 |
Slowpoke functions in circadian output cells to regulate rest:activity rhythms
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0249215
PMID:33765072
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和细胞特异性RNA干扰技术,探讨了果蝇间脑(PI)细胞中slowpoke钾通道在调节昼夜节律行为中的作用 | 首次揭示了slowpoke钾通道在非中枢时钟细胞中的表达对于昼夜节律行为的重要性,并提出了其在多个昼夜节律回路组件中发挥作用的可能性 | 研究主要集中在果蝇模型上,可能需要进一步的人类或其他动物模型验证 | 探究昼夜节律系统中输出途径的细胞和分子机制 | 果蝇的间脑(PI)细胞和slowpoke钾通道 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | RNA | 约40个候选基因在PI细胞子集中进行RNAi敲降 |
2287 | 2024-08-09 |
In vitro and ex vivo functional characterization of human HLA-DRB1∗04 restricted T cell receptors
2021, Journal of translational autoimmunity
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.jtauto.2021.100087
PMID:33768201
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研究论文 | 本文介绍了一种生成'人工'T细胞的流程,用于研究特定抗原和患者来源的免疫反应 | 开发了一种新的方法来验证和表征患者来源的TCR数据,并建立了相关的模型系统以支持开发诱导抗原特异性耐受的药物 | NA | 验证和表征患者来源的TCR数据,并开发支持抗原特异性耐受诱导药物的模型系统 | 人HLA-DRB1*04限制的T细胞受体 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞测序技术 | NA | TCR序列 | 涉及人类HLA-DRB1*04:01限制的TCR序列,特定于I型糖尿病相关GAD肽和流感衍生HA肽 |
2288 | 2024-08-09 |
Deciphering the Prognostic Implications of the Components and Signatures in the Immune Microenvironment of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.648917
PMID:33777046
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和批量测序数据,系统探讨了胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤微环境中各组分对预后的影响 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了PDAC肿瘤微环境中不同细胞类型及其分子标志物与患者生存期的关联 | 研究主要基于现有数据集进行分析,未来需要更多的临床试验来验证这些发现 | 探讨胰腺导管腺癌肿瘤微环境中各组分对患者预后的影响 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 基因集变异分析(GSVA)算法 | 基因表达数据 | 883名PDAC患者 |
2289 | 2024-08-09 |
NPC2 as a Prognostic Biomarker for Glioblastoma Based on Integrated Bioinformatics Analysis and Cytological Experiments
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.611442
PMID:33777094
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析和细胞学实验,探讨了NPC2蛋白作为胶质母细胞瘤(GBM)的预后生物标志物的潜力 | 首次研究了NPC2与GBM的预后价值,并证实了其在GBM进展中的重要作用 | NA | 旨在通过生物信息学分析和细胞学实验,识别具有临床和预后意义的潜在基因 | 胶质母细胞瘤(GBM)及其预后生物标志物NPC2 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 包括H3K27M-胶质瘤细胞、U87-MG和U251细胞系 |
2290 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Identifies Ligand-Receptor Pairs Associated With BCP-ALL Prognosis
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.639013
PMID:33777800
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序数据分析,识别了与B细胞前体急性淋巴细胞白血病(BCP-ALL)预后相关的配体-受体对 | 本研究首次整合了单细胞和批量RNA测序数据,发现了影响BCP-ALL患者生存结果的配体-受体对,并构建了一个基于LASSO的评分模型 | 研究样本数量有限,且依赖于公共数据库的数据,可能存在数据偏差 | 旨在识别与BCP-ALL预后相关的配体-受体对,并构建预测模型 | B细胞前体急性淋巴细胞白血病(BCP-ALL)患者的预后 | 数字病理学 | 血液癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO | RNA测序数据 | 7个BCP-ALL样本和4个健康样本 |
2291 | 2024-08-09 |
Next-Generation Sequencing Reveals the Progression of COVID-19
2021, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2021.632490
PMID:33777844
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研究论文 | 本文总结了基于下一代测序(NGS)分析的SARS-CoV-2起源和人类传播的当前知识,并探讨了其在COVID-19诊断和治疗目标发现中的应用。 | 本文通过NGS技术分析了SARS-CoV-2的ACE2表达水平、肠道微生物失调和COVID-19患者的免疫遗传学,为寻找新的中间宿主和阻断跨物种传播提供了新的见解。 | NA | 探讨SARS-CoV-2的起源、传播机制及其在COVID-19诊断和治疗中的应用。 | SARS-CoV-2病毒及其在人类中的传播机制。 | 数字病理学 | COVID-19 | 下一代测序(NGS) | NA | 基因组数据 | NA |
2292 | 2024-08-09 |
Connecting the Dots: Resolving the Bone Marrow Niche Heterogeneity
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.622519
PMID:33777933
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综述 | 本文综述了利用单细胞测序技术研究骨髓微环境异质性的最新进展 | 整合了多个研究报告的数据集,提供了一个全面的骨髓微环境结构概述 | 不同研究之间在代表性和命名法上的不一致性阻碍了对这一研究领域的全面理解 | 深入理解骨髓微环境的异质性 | 骨髓微环境在稳态、化疗后、白血病发作和衰老等不同条件下的结构 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 数据集 | NA |
2293 | 2024-08-09 |
CXCL11 Correlates With Antitumor Immunity and an Improved Prognosis in Colon Cancer
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.646252
PMID:33777950
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研究论文 | 本研究评估了CXCL11在结直肠癌(CRC)中的预后价值及其潜在机制 | 发现CXCL11在结直肠癌中表达上调与更好的预后相关,并能促进抗肿瘤免疫 | 研究仅初步评估了CXCL11的预后价值和机制,需要进一步深入研究 | 探讨CXCL11在结直肠癌中的生物学作用及其预后价值 | CXCL11在结直肠癌中的表达及其对患者预后的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | mRNA相关分析、单细胞RNA测序、免疫组织化学 | NA | mRNA、单细胞RNA测序数据、免疫组织化学数据 | TCGA数据集451例,GEO单细胞RNA测序数据集GSE146771和GSE132465,Yijishan医院队列108例 |
2294 | 2024-08-09 |
Combining bulk and single-cell RNA-sequencing data to reveal gene expression pattern of chondrocytes in the osteoarthritic knee
2021-12, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2021.1903207
PMID:33749514
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研究论文 | 本文结合批量和单细胞RNA测序数据,揭示了骨关节炎膝关节软骨细胞的基因表达模式 | 本研究通过整合批量和单细胞RNA测序数据,发现了271个在两种数据类型中同时提示的基因,并识别了14个转录因子和8个长非编码RNA,这些可能与骨关节炎的疼痛和血管化有关 | NA | 旨在通过分析批量和单细胞RNA测序数据,更全面地理解骨关节炎 | 骨关节炎膝关节软骨细胞的基因表达模式 | 数字病理学 | 骨关节炎 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用了GSE114007和GSE104782两个数据集 |
2295 | 2024-08-09 |
Mixed Distribution Models Based on Single-Cell RNA Sequencing Data
2021-Sep, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-021-00427-6
PMID:33754241
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研究论文 | 本文分析了结直肠癌(CRC)的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,构建了混合稳定-正态分布(MSND)模型和混合稳定-指数分布(MSED)模型来拟合基因表达差异(GED)数据,并通过比较均方根误差和卡方拟合优度检验,发现MSED和MSND的拟合效果优于稳定分布和柯西分布 | 提出了混合稳定-正态分布(MSND)模型和混合稳定-指数分布(MSED)模型来拟合基因表达差异数据,并能有效识别与肿瘤高度相关的基因 | NA | 研究基因表达差异数据的分布规律,并识别与肿瘤高度相关的基因 | 结直肠癌(CRC)的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 混合稳定-正态分布(MSND)模型和混合稳定-指数分布(MSED)模型 | 基因表达差异数据 | NA |
2296 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing: A new opportunity for retinal research
2021-09, Wiley interdisciplinary reviews. RNA
DOI:10.1002/wrna.1652
PMID:33754496
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在视网膜研究中的应用 | scRNA-seq技术能够深入分析多种视网膜细胞类型的基因表达特征,揭示细胞异质性 | NA | 研究视网膜细胞异质性,以更好地理解视网膜疾病 | 视网膜细胞及其在疾病和发育中的作用 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA |
2297 | 2024-08-09 |
Exploring the human lacrimal gland using organoids and single-cell sequencing
2021-07-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.02.024
PMID:33730555
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研究论文 | 本文描述了使用3D器官培养条件和单细胞测序技术探索人类泪腺的研究 | 建立了长期3D器官培养条件,并使用CRISPR-Cas9介导的基因编辑揭示了泪腺细胞分化的主要调控因子 | NA | 研究泪腺的(病)生理学 | 人类和鼠类的泪腺 | NA | NA | 单细胞测序 | CRISPR-Cas9 | 器官 | NA |
2298 | 2024-08-09 |
Advances and Opportunities in Single-Cell Transcriptomics for Plant Research
2021-06-17, Annual review of plant biology
IF:21.3Q1
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综述 | 本文综述了近年来植物单细胞转录组学的主要进展,并提供了一个从样本准备到数据分析的全面指南 | 介绍了单细胞转录组学在植物生物学领域的最新技术和应用 | NA | 探讨单细胞转录组学如何影响和加速植物特定研究 | 植物生物学中的单细胞转录组学技术 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
2299 | 2024-08-09 |
Mouse multipotent progenitor 5 cells are located at the interphase between hematopoietic stem and progenitor cells
2021-06-10, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020007876
PMID:33754628
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研究论文 | 本研究通过表型定义和功能特征化MPP5细胞,并使用RNA测序分析来全面分析LSK细胞室,重点关注新定义的MPP5亚群的功能和分子特性 | 首次定义和功能特征化MPP5细胞,并展示了其在造血干细胞和多能祖细胞网络中的动态和多功能性 | NA | 研究造血干细胞和多能祖细胞的特性和功能 | MPP5细胞及其在造血干细胞和多能祖细胞网络中的作用 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | LSK细胞 |
2300 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Uncovers Paracrine Functions of the Epicardial-Derived Cells in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2021-06, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了心外膜来源细胞在心律失常性心肌病中的旁分泌功能 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了心外膜来源细胞在心律失常性心肌病中的旁分泌作用,特别是TGFβ1和成纤维细胞生长因子的表达 | 研究仅在特定的小鼠模型中进行,结果的普遍性和临床相关性需要进一步验证 | 探讨心外膜在心律失常性心肌病发病机制中的作用 | 心外膜来源细胞及其在心律失常性心肌病中的功能 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 约18,000个增强绿色荧光蛋白标记的心外膜来源细胞 |