单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 2241 - 2260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2241 | 2024-08-09 |
Transcriptional Profiling Reveals Kidney Neutrophil Heterogeneity in Both Healthy People and ccRCC Patients
2021, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2021/5598627
PMID:33791390
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了健康人群和ccRCC患者肾脏中的中性粒细胞异质性 | 首次揭示了ccRCC患者肾脏中中性粒细胞的六个亚群，并探讨了其在肿瘤病理和自身免疫中的作用 | NA | 探讨中性粒细胞在肾脏疾病中的异质性和病理意义 | 健康人群和ccRCC患者的肾脏组织 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康捐赠者和ccRCC患者的肾脏活检组织 |
| 2242 | 2024-08-09 |
A Role for Vasoactive Intestinal Peptide Interneurons in Neurodevelopmental Disorders
2021, Developmental neuroscience
IF:2.3Q3
DOI:10.1159/000515264
PMID:33794534
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综述 | 本文综述了表达血管活性肠肽（VIP-INs）的大脑皮质GABA能抑制性中间神经元在神经发育障碍（NDDs）中的作用 | 强调了VIP-INs在多个大脑皮质区域的重复电路模式，并探讨了它们如何影响感觉输入、发育和行为 | NA | 探讨VIP-INs在神经发育障碍中的作用机制 | VIP-INs及其相关基因在神经发育障碍中的作用 | NA | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2243 | 2024-08-09 |
Bioconductor toolchain for reproducible bioinformatics pipelines using Rcwl and RcwlPipelines
2021-Oct-11, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab208
PMID:33772584
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研究论文 | 本文介绍了Rcwl和RcwlPipelines工具链，用于在R环境中开发、使用和维护基于Common Workflow Language (CWL)的可重复生物信息学工作流程 | 开发了Rcwl，一个连接R与CWL的接口，并收集了超过100个预构建的工具和管道在RcwlPipelines中，便于研究人员查询和使用 | NA | 提供便携和可重复的数据分析工作流程 | 生物信息学工具和管道 | 生物信息学 | NA | Common Workflow Language (CWL) | NA | NA | NA |
| 2244 | 2024-08-09 |
ShinyCell: simple and sharable visualization of single-cell gene expression data
2021-Oct-11, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab209
PMID:33774659
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研究论文 | 本文介绍了ShinyCell，一个用于将单细胞RNA测序数据转换为可探索和可共享的交互界面的R包 | ShinyCell提供了一个简单易用的工具，使非计算生物学研究人员也能轻松探索和共享单细胞RNA测序数据 | NA | 开发一个工具，使单细胞RNA测序数据更易于非专业人士探索和共享 | 单细胞RNA测序数据的可视化和共享 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2245 | 2024-08-09 |
Macrophage phenotypes in tissue repair and the foreign body response: Implications for biomaterial-based regenerative medicine strategies
2021-10-01, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2021.03.038
PMID:33775905
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综述 | 本文综述了巨噬细胞表型在组织修复和异物反应中的作用，以及对基于生物材料的再生医学策略的潜在影响 | 本文总结了近期关于髓系细胞在生物材料微环境中的异质性的新见解，并讨论了单细胞水平上解析细胞异质性的新工具 | NA | 探讨巨噬细胞异质性对组织修复和异物反应过程的影响，以及对生物材料导向的再生医学应用的潜在意义 | 巨噬细胞表型及其在组织修复和异物反应中的功能特性 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 2246 | 2024-08-09 |
Advances in bulk and single-cell multi-omics approaches for systems biology and precision medicine
2021-09-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab024
PMID:33778867
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综述 | 本文综述了批量和单细胞多组学方法在系统生物学和精准医学中的进展 | 单细胞方法能够解析细胞动态和异质性，而传统的批量技术则局限于个体/群体层面的研究 | 文章讨论了多组学发展面临的挑战和展望 | 总结批量和单细胞多组学数据生成技术，调查批量和单细胞多模态数据的综合分析方法，并讨论多组学在精准医学中的应用 | 批量和单细胞多组学技术及其在系统生物学和精准医学中的应用 | 系统生物学 | NA | 多组学技术 | NA | 多模态数据 | NA |
| 2247 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome profiling reveals molecular heterogeneity in human umbilical cord tissue and culture-expanded mesenchymal stem cells
2021-09, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.15834
PMID:33763993
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，揭示了人类脐带组织及其体外培养的间充质干细胞的分子异质性 | 首次在单细胞分辨率下分析了脐带组织和培养扩增的间充质干细胞的转录组特征，并识别了可能的新转录因子及细胞间相互作用 | NA | 深入理解脐带组织及其培养扩增的间充质干细胞的细胞异质性，为基于间充质干细胞的细胞疗法提供基础生物学见解 | 人类脐带组织及其体外培养的间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 2248 | 2024-08-09 |
A Beautiful Day in the Neighborhood: Application of Single-Cell Transcriptomics to Unravel Liver Cell Heterogeneity in Diseased Human Livers
2021-08, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.31827
PMID:33756021
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2249 | 2024-08-09 |
From Bite to Byte: Dental Structures Resolved at a Single-Cell Resolution
2021-08, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345211001848
PMID:33764175
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）解析哺乳动物牙齿细胞组成的最新研究成果 | 揭示了小鼠门齿中前所未有的细胞类型目录，并发现了牙齿上皮和间质中的新型细胞类型及已知细胞类型的新标记物 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在牙科研究和牙科学中的潜在未来应用 | 哺乳动物牙齿的细胞组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 数千个单个细胞 |
| 2250 | 2024-08-09 |
Characterization of highly proliferative decidual precursor cells during the window of implantation in human endometrium
2021-08, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.3367
PMID:33764639
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研究论文 | 本文研究了人类子宫内膜中高度增殖的间质前体细胞在胚胎植入窗口期的特征 | 发现了高度增殖的间质细胞（hPMC）作为新的蜕膜前体细胞，这些细胞可能来源于循环骨髓来源的间质干细胞/间质细胞，并在妊娠中对蜕膜的可塑性起关键作用 | NA | 研究人类子宫内膜中高度增殖的间质前体细胞在胚胎植入窗口期的特征及其在妊娠中的作用 | 人类子宫内膜中的高度增殖间质细胞（hPMC）及其在胚胎植入和妊娠中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2251 | 2024-08-09 |
Biomarker Technologies to Support Early Clinical Immuno-oncology Development: Advances and Interpretation
2021-08-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-20-2345
PMID:33766813
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综述 | 本文综述了支持早期临床免疫肿瘤学发展的生物标志物技术及其在临床中的应用 | 利用单细胞空间转录组学、高级组织组织学方法和新分子免疫分析工具等技术，提供肿瘤环境的分子细节，支持药物开发中的决策 | NA | 探讨生物标志物技术在临床中如何应用于揭示患者肿瘤-免疫生物学，并深入理解癌症对免疫肿瘤治疗的反应 | 癌症免疫治疗及其与宿主免疫系统的复杂相互作用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2252 | 2024-08-09 |
Single-cell atlas of hepatic T cells reveals expansion of liver-resident naive-like CD4+ T cells in primary sclerosing cholangitis
2021-08, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2021.03.016
PMID:33774059
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和计算分析，构建了原发性硬化性胆管炎（PSC）患者肝脏内T细胞的图谱，并发现了一种新的肝脏驻留型幼稚样CD4+ T细胞群。 | 首次构建了PSC患者肝脏内T细胞的图谱，并发现了一种新的肝脏驻留型幼稚样CD4+ T细胞群，这些细胞在PSC患者中显著扩增。 | NA | 旨在构建原发性硬化性胆管炎患者肝脏内T细胞的图谱，并深入研究这些细胞在疾病发病机制中的作用。 | 原发性硬化性胆管炎（PSC）患者和健康捐献者的肝脏内T细胞。 | 数字病理学 | 原发性硬化性胆管炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | PSC患者11例，健康捐献者4例，以及24例PSC患者和其他肝脏疾病对照组。 |
| 2253 | 2024-08-09 |
Wake-up alarm: virtual time-lapse gene expression landscape illuminates mechanisms underlying dormancy breaking of germinating spores
2021-Aug, Current genetics
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s00294-021-01177-0
PMID:33782714
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综述 | 本文综述了真菌孢子萌发过程中休眠打破的机制，并通过单细胞基因表达分析方法，探讨了基因表达随时间的变化 | 引入了单细胞RNA测序技术来分析孢子在休眠和萌发过程中的基因表达变化 | NA | 探讨孢子萌发过程中休眠打破的机制，并扩展对S. pombe萌发的研究 | 真菌孢子的萌发过程及其基因表达 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个单孢子细胞 |
| 2254 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics dissects hematopoietic cell destruction and T-cell engagement in aplastic anemia
2021-07-08, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020008966
PMID:33763704
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，揭示了再生障碍性贫血中造血干细胞和祖细胞（HSPCs）与T细胞之间的分子相互作用 | 首次在单细胞水平上解析了再生障碍性贫血中HSPCs和T细胞的转录组变化，并识别了细胞类型特异性的配体-受体相互作用 | 研究主要受限于技术手段和骨髓衰竭背景下HSPCs的稀少性 | 探究再生障碍性贫血中HSPCs与T细胞的复杂关系及其分子机制 | 再生障碍性贫血患者的残留HSPCs和T细胞 | 数字病理学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 2255 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing technology in tumor research
2021-Jul, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2021.03.013
PMID:33766554
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用及其在肿瘤诊断和临床治疗中的重要性 | 单细胞测序技术解决了传统批量组织测序无法揭示稀有细胞独特基因表达的问题 | NA | 探讨单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用及其对肿瘤诊断和治疗的贡献 | 肿瘤细胞的异质性及其在分子层面的复杂变化 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序（SCS） | NA | 基因组、转录组和表观基因组数据 | NA |
| 2256 | 2024-08-09 |
Robust integration of multiple single-cell RNA sequencing datasets using a single reference space
2021-07, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-00859-x
PMID:33767393
|
research paper | 本文介绍了一种使用参考数据集的基因特征向量来建立全局框架的算法，用于整合多个单细胞RNA测序数据集 | 提出了Reference Principal Component Integration (RPCI)方法，该方法通过使用参考数据集的基因特征向量来建立全局框架，以实现多个单细胞RNA测序数据集的整合 | NA | 开发一种新的算法，用于更准确地整合多个单细胞RNA测序数据集 | 单细胞RNA测序数据集的整合方法 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了模拟数据集和真实数据集进行验证 |
| 2257 | 2024-08-09 |
Inhibition of macrophage histone demethylase JMJD3 protects against abdominal aortic aneurysms
2021-06-07, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20201839
PMID:33779682
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研究论文 | 本研究探讨了抑制巨噬细胞组蛋白去甲基酶JMJD3对腹主动脉瘤的保护作用 | 首次揭示了JMJD3在腹主动脉瘤形成中的作用，并提出了针对JMJD3的细胞特异性药物治疗可能是一种有效的干预方法 | NA | 研究JMJD3在腹主动脉瘤形成中的作用及潜在的治疗策略 | 腹主动脉瘤中的巨噬细胞和JMJD3酶 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用人类腹主动脉瘤组织进行研究 |
| 2258 | 2024-08-09 |
Combining segmental bulk- and single-cell RNA-sequencing to define the chondrocyte gene expression signature in the murine knee joint
2021-06, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2021.03.007
PMID:33762205
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研究论文 | 本研究通过结合批量RNA测序和单细胞RNA测序技术，定义了小鼠膝关节软骨细胞的基因表达特征 | 提出了一种新的实用方法，通过结合批量RNA测序和单细胞RNA测序来解决从小鼠膝关节中提取软骨细胞转录组的技术难题 | NA | 精确描绘软骨细胞的转录组，并研究未来小鼠OA模型中软骨细胞的疾病表型 | 小鼠膝关节软骨细胞的基因表达特征 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 批量RNA测序分析了不同段，单细胞RNA测序分析了包含主要软骨细胞的131个细胞簇 |
| 2259 | 2024-08-09 |
Regenerative cross talk between cardiac cells and macrophages
2021-06-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00056.2021
PMID:33769920
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研究论文 | 本文通过分析多个RNA测序数据集，研究了心肌细胞和巨噬细胞之间的再生交叉对话，以及这种对话如何随着年龄变化影响心脏的再生能力 | 首次详细探讨了巨噬细胞在心脏再生中的作用及其随年龄变化的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类 | 揭示心脏再生过程中心肌细胞与巨噬细胞之间的交叉对话及其分子机制 | 心肌细胞和巨噬细胞 | NA | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 多个小鼠心脏样本 |
| 2260 | 2024-08-09 |
Comprehensive analysis of radiosensitivity in head and neck squamous cell carcinoma
2021-06, Radiotherapy and oncology : journal of the European Society for Therapeutic Radiology and Oncology
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.radonc.2021.03.017
PMID:33775714
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序数据、大量组织测序数据和反卷积数据，全面分析了头颈鳞状细胞癌（HNSCC）的放射敏感性 | 发现了HNSCC细胞的放射敏感性聚类与分子分型高度一致，并开发了一种放射抗性评分，识别了可能从联合放疗和免疫检查点阻断中受益的HNSCC群体 | NA | 全面探讨HNSCC的放射抗性，并提出新的治疗靶点 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）的放射敏感性 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞测序, RNA-seq, DNA甲基化测序 | NA | 单细胞转录组数据, 大量组织测序数据 | 1388个原发性癌细胞, 499个原发性HNSCC样本 |