单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 2221 - 2240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2221 | 2024-08-09 |
Correction to: Single-Cell RNA Sequencing of the Adult Mammalian Heart - State of the Art and Future Perspectives
2021-Dec, Current heart failure reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1007/s11897-021-00507-0
PMID:33797708
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2222 | 2024-08-09 |
Fast identification of differential distributions in single-cell RNA-sequencing data with waddR
2021-Oct-11, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab226
PMID:33792651
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research paper | 本文提出了一种基于2-Wasserstein距离的快速差异分布检测方法，用于单细胞RNA测序数据中的基因表达分布差异识别 | 该方法能够检测任意类型的分布差异，并通过分解2-Wasserstein距离来解释差异的来源，包括均值、方差和形状的变化 | NA | 开发一种新的方法来识别单细胞RNA测序数据中的复杂分布差异 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达分布差异 | bioinformatics | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2223 | 2024-08-09 |
Transcriptome Regulation by Oncogenic ALK Pathway in Mammalian Cortical Development Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2021-07-05, Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991)
DOI:10.1093/cercor/bhab058
PMID:33791755
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了致癌ALK通路在哺乳动物大脑皮质发育中的转录组调控作用 | 首次揭示了ALK在哺乳动物大脑发育中的作用，并识别了由ALK调控的不同发育阶段的不同表达基因（DEGs） | NA | 探讨致癌ALK通路在神经发育中的关键作用及其对细胞类型特异性转录组的调控 | ALK在哺乳动物大脑发育中的作用及其对神经细胞的影响 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用人脑类器官进行scRNA-seq分析 |
| 2224 | 2024-08-09 |
Human Primary Airway Basal Cells Display a Continuum of Molecular Phases from Health to Disease in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2021-07, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2020-0464OC
PMID:33789072
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研究论文 | 本研究优化了基于流式细胞术的细胞分选协议，用于分离人类气道基底细胞，并通过单细胞RNA测序揭示了从健康到慢性阻塞性肺病（COPD）不同阶段的基底细胞分子特征。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了健康与COPD患者气道基底细胞的分子连续性，并识别了可能指示COPD的上调基因。 | 研究主要集中在COPD晚期阶段，可能需要进一步研究其他疾病阶段以获得更全面的理解。 | 揭示气道基底细胞在COPD和其他肺部疾病中的作用，并发现新的治疗靶点。 | 人类气道基底细胞及其在健康和COPD中的分子特征。 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自健康捐赠者和COPD IV期患者的气道基底细胞 |
| 2225 | 2024-08-09 |
Modelling hereditary diffuse gastric cancer initiation using transgenic mouse-derived gastric organoids and single-cell sequencing
2021-07, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.5675
PMID:33797756
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研究论文 | 本研究利用转基因小鼠衍生的胃类器官和单细胞测序技术，模拟遗传性弥漫性胃癌（HDGC）的初始阶段。 | 首次通过单细胞RNA测序探索了HDGC小鼠类器官模型中的转录组景观，揭示了CDH1缺失在早期肿瘤发生中的影响。 | NA | 研究CDH1基因缺失如何启动遗传性弥漫性胃癌的机制。 | 遗传性弥漫性胃癌（HDGC）的初始阶段。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2226 | 2024-08-09 |
Single-cell data clustering based on sparse optimization and low-rank matrix factorization
2021-06-17, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkab098
PMID:33787873
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研究论文 | 本文提出了一种基于稀疏优化和低秩矩阵分解的单细胞RNA测序数据聚类新算法scSO | scSO算法能够准确预测细胞聚类数量，并正确分类大多数细胞 | NA | 开发一种有效的单细胞RNA测序数据聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 稀疏优化和低秩矩阵分解 | 基因表达数据 | 多个基准数据集 |
| 2227 | 2024-08-09 |
Female Immunity Protects from Cutaneous Squamous Cell Carcinoma
2021-06-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-20-4261
PMID:33795258
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研究论文 | 研究探讨了性别差异对皮肤鳞状细胞癌（cSCC）的影响，发现女性免疫系统在cSCC中提供了更强的保护作用 | 首次展示了女性免疫系统在cSCC中的保护作用，以及性别对癌症免疫相关表达途径和T细胞浸润的影响 | 研究主要集中在免疫功能正常和免疫抑制的患者以及小鼠模型上，可能需要更多样化的样本和模型来验证结果 | 探讨性别差异在皮肤鳞状细胞癌中的影响及其分子机制 | 免疫功能正常和免疫抑制的皮肤鳞状细胞癌患者，以及FVB/N小鼠和人类角质形成细胞 | 数字病理学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 全外显子测序、批量RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 738名免疫功能正常的cSCC患者，160名免疫抑制的cSCC患者，63名晚期cSCC患者，20名晚期cSCC患者，以及FVB/N小鼠和人类角质形成细胞 |
| 2228 | 2024-08-09 |
Somatic mutations in lymphocytes in patients with immune-mediated aplastic anemia
2021-05, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-021-01231-3
PMID:33785863
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研究论文 | 研究了免疫介导性再生障碍性贫血（AA）患者淋巴细胞中的体细胞突变情况 | 首次详细描述了非白血病T细胞中的体细胞突变及其在AA发病机制中的作用 | 样本量相对较小，需要进一步的大规模研究来验证结果 | 探讨体细胞突变在免疫介导性再生障碍性贫血发病机制中的作用 | AA患者的CD4+和CD8+ T细胞 | NA | 再生障碍性贫血 | 定制的2533基因面板测序、T细胞受体beta测序、单细胞测序 | NA | 基因序列 | 24名AA患者和20名健康对照 |
| 2229 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics trajectory and molecular convergence of clinically relevant mutations in Brugada syndrome
2021-05-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00061.2021
PMID:33797273
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，探讨了Brugada综合征中临床相关突变的分子汇聚及其与心脏发育细胞类型的关联 | 首次通过单细胞转录组学分析，揭示了Brugada综合征中临床相关突变在离子运输域的富集，并识别了与该综合征病因相关的心脏发育细胞类型 | NA | 评估Brugada综合征中临床相关突变的分子汇聚，并识别与该综合征病因相关的心脏发育细胞类型 | Brugada综合征中的临床相关突变及其在心脏发育中的影响 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 733个突变，涉及16个与Brugada综合征相关的钠、钙、钾通道及调控和结构基因 |
| 2230 | 2024-08-09 |
Independence of chromatin conformation and gene regulation during Drosophila dorsoventral patterning
2021-04, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-021-00799-x
PMID:33795866
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研究论文 | 本文研究了果蝇胚胎背腹模式形成过程中染色质结构与基因调控的独立性 | 提供了染色质组织与背腹基因表达独立性的证据，并发现组织特异性染色质状态和基因表达下，染色质组织在组织间基本保持不变 | 未明确说明基因表达和染色质状态是否驱动染色质组织，或染色质组织变化是否促进细胞类型特异性基因表达激活 | 探究染色质组织与基因调控之间的关系 | 果蝇胚胎的背腹模式形成 | 基因调控 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 未明确说明具体样本数量 |
| 2231 | 2024-08-09 |
New dog, old tricks: Developmental programs resurface in inflammation
2021-04-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.03.007
PMID:33798418
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组学技术研究人类皮肤中的细胞状态和基因程序，揭示了皮肤病中可能促进炎症病理的胎儿程序 | 首次在人类皮肤中发现并定义了与皮肤病相关的胎儿基因程序 | NA | 研究人类皮肤中的细胞状态和基因程序，特别是在皮肤病中的表现 | 人类皮肤细胞及其在皮肤病中的基因表达 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 2232 | 2024-08-09 |
Macrophages in SHH subgroup medulloblastoma display dynamic heterogeneity that varies with treatment modality
2021-03-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.108917
PMID:33789113
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研究论文 | 研究探讨了SHH亚组髓母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的动态异质性及其在不同治疗方式下的变化 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示了TAM在不同治疗方式下的显著异质性，并识别了不同TAM亚群的标志物 | NA | 研究SHH亚组髓母细胞瘤中TAM的异质性及其对治疗方式的响应 | SHH亚组髓母细胞瘤中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 儿童脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 自发性小鼠SHH亚组髓母细胞瘤样本 |
| 2233 | 2024-08-09 |
Dynamic Expression of Imprinted Genes in the Developing and Postnatal Pituitary Gland
2021-03-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12040509
PMID:33808370
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研究论文 | 研究了印记基因在发育和产后垂体中的动态表达 | 首次尝试将印记基因的表达与垂体的形成和功能联系起来，并利用高灵敏度RNA测序和单细胞RNA测序数据描述了垂体的印记转录组 | 由于垂体在发育期间的小尺寸和成熟细胞的复杂性，获取有用的转录组数据存在技术困难 | 探讨印记基因在垂体发育和功能中的作用及其与印记疾病的关联 | 印记基因在垂体中的表达及其对垂体发育和功能的影响 | NA | 印记疾病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2234 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing Confirms Transcripts and VHDJH Rearrangements of Immunoglobulin Genes in Human Podocytes
2021-03-25, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12040472
PMID:33806147
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和嵌套PCR结合Sanger测序，证实了人类足细胞中免疫球蛋白基因的转录本和VHDJH重排 | 首次在单细胞水平上证实了足细胞中免疫球蛋白基因的转录本和重排，并揭示了在病理情况下足细胞表达的免疫球蛋白多样性增加 | NA | 确认足细胞中免疫球蛋白基因的转录本并表征其重排谱 | 人类足细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，嵌套PCR，Sanger测序 | NA | RNA序列 | 360个足细胞用于单细胞RNA测序，48个单足细胞用于嵌套PCR和Sanger测序 |
| 2235 | 2024-08-09 |
Novel Gene Regulation in Normal and Abnormal Spermatogenesis
2021-03-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10030666
PMID:33802813
|
综述 | 本文综述了新型基因在正常与异常精子发生中的调控作用及其机制 | 利用单细胞RNA测序等新技术，识别了更多与精子发生相关的调控基因 | NA | 探讨新型基因在正常与异常精子发生中的调控作用及其机制 | 啮齿动物和人类精原干细胞的增殖、分化和凋亡，以及精母细胞和其他生殖细胞的减数分裂 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 2236 | 2024-08-09 |
Single-Cell Expression Landscape of SARS-CoV-2 Receptor ACE2 and Host Proteases in Normal and Malignant Lung Tissues from Pulmonary Adenocarcinoma Patients
2021-Mar-12, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13061250
PMID:33809063
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研究论文 | 本研究探讨了肺腺癌患者正常和恶性肺组织中SARS-CoV-2受体ACE2及相关基因的单细胞表达谱 | 首次揭示了肺腺癌患者肺组织中SARS-CoV-2受体ACE2及相关基因的单细胞表达谱 | NA | 阐明肺腺癌患者肺组织中SARS-CoV-2受体ACE2及相关基因的单细胞表达谱 | 肺腺癌患者的正常和恶性肺组织 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 5个肺腺癌组织和14个匹配的正常组织，共186,916个细胞 |
| 2237 | 2024-08-09 |
Advancing Drug Discovery for Neurological Disorders Using iPSC-Derived Neural Organoids
2021-Mar-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22052659
PMID:33800815
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研究论文 | 本文探讨了利用诱导多能干细胞衍生的神经类器官在神经退行性疾病药物发现中的应用 | 文章介绍了使用CRISPR创建同基因模型、单细胞RNA测序和机器学习分析复杂数据集等技术解决方案，以扩大类器官在药物发现中的应用 | 类器官技术在工业界大规模药物筛选中的应用受到可重复性、可扩展性和向人类疾病转化的挑战 | 推动类器官技术在神经退行性疾病大规模药物筛选中的应用 | 诱导多能干细胞衍生的神经类器官及其在神经退行性疾病模型中的应用 | 生物技术 | 神经退行性疾病 | CRISPR, 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 图像, 文本 | NA |
| 2238 | 2024-08-09 |
Spinal Inhibitory Interneurons: Gatekeepers of Sensorimotor Pathways
2021-Mar-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22052667
PMID:33800863
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综述 | 本文综述了脊髓抑制性中间神经元在感觉运动通路中的作用及其在脊髓微环路中的组织和功能 | 通过转基因操作、神经化学分析和单细胞转录组学等方法，识别出表达一系列遗传和/或神经化学标记的抑制性中间神经元群体，构成功能性微环路 | NA | 探讨抑制性中间神经元在脊髓中的组织方式及其在感觉运动通路中的调控作用，为治疗与抑制功能缺陷相关的病理状况提供潜在的治疗靶点 | 脊髓抑制性中间神经元及其在感觉运动通路中的作用 | 神经科学 | 感觉和运动障碍 | 转基因操作、神经化学分析、单细胞转录组学 | NA | 基因和神经化学标记 | NA |
| 2239 | 2024-08-09 |
The transcriptional landscape of Venezuelan equine encephalitis virus (TC-83) infection
2021-03, PLoS neglected tropical diseases
IF:3.4Q1
DOI:10.1371/journal.pntd.0009306
PMID:33788849
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了委内瑞拉马脑炎病毒（TC-83株）感染人星形胶质细胞后的宿主转录组和病毒RNA | 首次在单细胞水平上同时分析宿主转录组和病毒RNA，揭示了病毒感染过程中的细胞间异质性，并识别了抗病毒治疗的潜在靶点 | NA | 研究委内瑞拉马脑炎病毒与宿主细胞的相互作用，寻找抗病毒治疗的潜在靶点 | 委内瑞拉马脑炎病毒（TC-83株）感染的人星形胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数千个单细胞 |
| 2240 | 2024-08-09 |
The Role of Diagnostic Biomarkers, Omics Strategies, and Single-Cell Sequencing for Nonalcoholic Fatty Liver Disease in Severely Obese Patients
2021-Mar-01, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm10050930
PMID:33804302
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研究论文 | 本文探讨了诊断生物标志物、组学策略和单细胞测序在严重肥胖患者非酒精性脂肪肝病中的作用 | 文章介绍了组学技术和单细胞测序在发现生物标志物和增加对非酒精性肝病及脂肪性肝炎病理生理学理解方面的最新进展 | 当前诊断工具如弹性成像在设备和测量质量方面存在局限，尤其是在腹部周长大和皮下脂肪多的患者中 | 旨在发现新的生物标志物，并加深对健康和受损肝脏中个体细胞类型生物学功能的理解 | 严重肥胖患者的非酒精性脂肪肝病 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞测序 | NA | 基因组学、转录组学和蛋白质组学数据 | NA |