单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 2886 篇文献,本页显示第 201 - 220 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
201 2025-10-06
The NF-κB regulator Bcl-3 restricts terminal differentiation and promotes memory cell formation of CD8+ T cells during viral infection
2021-01, PLoS pathogens IF:5.5Q1
研究论文 本研究揭示了Bcl-3在CD8+ T细胞分化过程中的细胞自主性作用,通过调控终末效应细胞与记忆前体效应细胞之间的平衡来影响抗病毒免疫记忆形成 首次明确Bcl-3在CD8+ T细胞中的细胞自主性功能,证明其通过调节NF-κB信号通路控制T细胞分化命运 研究主要基于淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒感染模型,在其他病原体感染或疾病背景下的普适性需进一步验证 阐明Bcl-3在CD8+ T细胞分化过程中的分子机制及其对免疫记忆形成的影响 CD8+ T细胞,特别是病毒特异性CD8+ T细胞 免疫学 病毒感染 单细胞RNA测序,流式细胞术,转基因技术 NA 基因表达数据,蛋白质表达数据 Bcl3-/-小鼠和转基因CD8+ T细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
202 2025-10-06
How Do Uterine Natural Killer and Innate Lymphoid Cells Contribute to Successful Pregnancy?
2021, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 总结子宫先天淋巴细胞在妊娠过程中的表型和功能多样性研究进展 整合单细胞RNA测序和高维流式/质谱细胞术对子宫先天淋巴细胞群体进行详细表征 由于子宫组织在月经周期和妊娠期间快速变化的特性,确定各细胞亚群的具体功能具有固有挑战性 探讨子宫自然杀伤细胞和先天淋巴细胞如何促进成功妊娠 人类和小鼠的子宫先天淋巴细胞(uILCs) 免疫学 妊娠相关疾病 单细胞RNA测序(scRNAseq),高维流式细胞术,质谱细胞术 NA 单细胞转录组数据,细胞表型数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
203 2025-10-06
The T-box transcription factor Eomesodermin governs haemogenic competence of yolk sac mesodermal progenitors
2021-01, Nature cell biology IF:17.3Q1
研究论文 本研究揭示T-box转录因子Eomesodermin在调控卵黄囊中胚层祖细胞造血能力中的关键作用 首次证明Eomes通过调控增强子可及性决定中胚层祖细胞的造血能力,将Eomes置于早期血液形成转录层级的顶端 使用胚胎干细胞模型进行研究,可能与体内真实发育环境存在差异 探究卵黄囊中胚层祖细胞向造血命运定向的分子机制 胚胎干细胞模型、卵黄囊中胚层祖细胞 发育生物学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
204 2025-10-06
Single-Cell Analysis of Hematopoietic Stem Cells
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 介绍小鼠骨髓单细胞RNA测序分析的完整实验方案 结合Smart-Seq2和mcSCRB-Seq协议优化出板式单细胞分析方法,并整合液滴式高通量方法 主要针对小鼠骨髓样本,未涉及其他组织或物种 建立造血干细胞单细胞转录组分析的标准实验流程 小鼠骨髓造血祖细胞 单细胞组学 血液系统疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Genomics单细胞测序平台
205 2025-10-06
Exploiting Single-Cell Tools in Gene and Cell Therapy
2021, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了单细胞工具在基因和细胞治疗领域的应用与发展 整合单细胞多组学与功能数据,结合空间转录组/蛋白质组学和CRISPR技术推动细胞与基因治疗 NA 探讨单细胞技术在基因和细胞治疗中的临床应用 单细胞分子特征(基因组、转录组、表观基因组、蛋白质组) 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 空间蛋白质组学, CRISPR技术, 碱基编辑 NA 单细胞分子数据, 功能数据, 空间定位数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 NA NA
206 2025-10-06
Automated methods for cell type annotation on scRNA-seq data
2021, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2
综述 本文综述了单细胞RNA测序数据中自动细胞类型注释的可用工具和基础方法 系统总结和比较了基于标记基因数据库、参考表达数据相关性和监督分类标签转移等不同策略的自动化细胞类型注释方法 NA 概述单细胞RNA测序数据中自动细胞类型注释的工具和方法 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 监督分类 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
207 2025-10-06
Space-time logic of liver gene expression at sub-lobular scale
2021-01, Nature metabolism IF:18.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肝脏基因在亚小叶尺度上的时空表达逻辑 首次在单细胞水平分析肝脏分区与昼夜节律的相互作用,发现基因表达具有乘性时空效应 研究主要基于单细胞RNA测序数据,需要进一步实验验证机制 探究肝脏基因在空间分区和时间节律维度上的调控机制 小鼠肝脏细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序, smFISH 混合效应模型 单细胞基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
208 2025-10-06
Diversification of molecularly defined myenteric neuron classes revealed by single-cell RNA sequencing
2021-01, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序技术揭示了小鼠小肠肌间神经丛中12种神经元类群的分子分类体系 发现了神经元多样化的新机制——两个神经元类群通过二元神经源性分支产生,其他身份通过有丝分裂后分化形成 研究仅限于小鼠小肠肌间神经丛,人类或其他肠道区域的适用性尚待验证 建立肠道神经系统神经元的分子分类体系并解析其发育机制 小鼠小肠肌间神经丛神经元 单细胞测序 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
209 2025-10-06
Loss of function of the mitochondrial peptidase PITRM1 induces proteotoxic stress and Alzheimer's disease-like pathology in human cerebral organoids
2021-10, Molecular psychiatry IF:9.6Q1
研究论文 本研究通过PITRM1基因敲除的人源诱导多能干细胞衍生的脑类器官,揭示了线粒体肽酶功能缺失导致蛋白质毒性应激和阿尔茨海默病样病理的机制 首次在人类脑类器官模型中证明PITRM1缺陷通过激活线粒体未折叠蛋白反应和线粒体清除机制,自发诱导阿尔茨海默病病理特征 研究主要基于体外类器官模型,未在完整生物体中进行验证 探究线粒体前序列加工缺陷的致病机制及其与神经退行性疾病的关系 PITRM1敲除的人源诱导多能干细胞衍生的皮质神经元和脑类器官 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序,基因敲除技术 脑类器官模型 基因表达数据,蛋白质检测数据 未明确指定具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
210 2025-10-06
A review of computational strategies for denoising and imputation of single-cell transcriptomic data
2021-07-20, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
综述 对单细胞转录组数据去噪和插补的计算方法进行全面分析比较 首次对19种单细胞转录组数据去噪和插补方法进行系统性定量评估,涵盖多种实验场景和性能指标 未提供定量基准测试标准,仅对现有方法进行比较分析 评估单细胞转录组数据去噪和插补计算方法的性能 19种单细胞转录组数据去噪和插补计算方法 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 模拟数据集和真实数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
211 2025-10-06
Single-cell molecular profiling provides a high-resolution map of basophil and mast cell development
2021-06, Allergy IF:12.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞分子分析绘制了嗜碱性粒细胞和肥大细胞发育的高分辨率图谱 首次在单细胞水平揭示了嗜碱性粒细胞和肥大细胞的分化轨迹,发现了一个先前未表征的腹膜嗜碱性粒细胞-肥大细胞双能祖细胞群 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 绘制嗜碱性粒细胞和肥大细胞的发育分化路径 小鼠骨髓和腹膜细胞 单细胞生物学 过敏性疾病 多色流式细胞术,单细胞RNA测序,细胞命运测定 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据 小鼠骨髓和腹膜细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA 高覆盖度单细胞RNA测序分析
212 2025-10-06
Deconvolution of monocyte responses in inflammatory bowel disease reveals an IL-1 cytokine network that regulates IL-23 in genetic and acquired IL-10 resistance
2021-06, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了炎症性肠病中单核细胞IL-23表达的调控机制,发现IL-1和IL-10信号通路是关键调节因子 首次在遗传性和获得性IL-10抵抗背景下系统解析单核细胞IL-23表达调控网络,并区分稳态与疾病相关的IL-23产生特征 研究主要聚焦单核细胞,其他免疫细胞类型的贡献可能未完全阐明 阐明炎症性肠病中单核细胞IL-23表达的调控机制及其在疾病分型和治疗反应预测中的作用 健康个体和炎症性肠病患者的单核吞噬细胞及外周血单个核细胞 单细胞生物学 炎症性肠病 单细胞RNA测序, 转录组分析, 基因网络相关性分析 NA 单细胞转录组数据, 患者活检样本 健康个体和IBD患者的单核细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
213 2025-10-06
Neuronal activity increases translocator protein (TSPO) levels
2021-06, Molecular psychiatry IF:9.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和共聚焦显微镜技术,揭示了神经元活动可增加成年中枢神经系统中转位蛋白(TSPO)的表达水平 首次证明神经元活动可直接调控TSPO表达,挑战了TSPO仅作为神经炎症生物标志物的传统认知 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类样本中验证;未探讨TSPO功能改变的具体分子机制 探究神经元活动是否影响成年中枢神经系统中TSPO的表达水平 成年C57BL6/N小鼠的海马体和大脑皮层区域 神经科学 NA 单细胞RNA测序, 共聚焦激光扫描显微镜 NA 基因表达数据, 蛋白质成像数据 12周龄C57BL6/N小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
214 2025-10-06
ILoReg: a tool for high-resolution cell population identification from single-cell RNA-seq data
2021-05-23, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 介绍了一个用于从单细胞RNA-seq数据中高分辨率识别细胞群体的R工具包ILoReg 提出了一种新的概率特征提取方法,通过迭代聚类投影(ICP)算法结合逻辑回归和聚类相似性比较,能够识别转录组差异细微的细胞亚群 NA 开发一种改进的单细胞RNA-seq数据分析方法,提高细胞群体识别的分辨率 单细胞RNA-seq数据中的细胞群体 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 逻辑回归, 聚类算法 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
215 2025-10-06
Ileal Transcriptomic Analysis in Paediatric Crohn's Disease Reveals IL17- and NOD-signalling Expression Signatures in Treatment-naïve Patients and Identifies Epithelial Cells Driving Differentially Expressed Genes
2021-May-04, Journal of Crohn's & colitis
研究论文 通过回肠转录组分析揭示儿童克罗恩病初治患者的IL17和NOD信号通路表达特征,并识别驱动差异表达基因的上皮细胞 首次在儿童克罗恩病初治患者中发现31个基因特征,识别表达抗菌基因转录本的特殊上皮细胞亚群驱动IL17和NOD信号通路上调 样本量有限(共70例),部分相关性分析p值未达到显著水平(如复发时间相关性p=0.07) 确定儿童克罗恩病中激活的信号通路和驱动细胞类型 儿童克罗恩病患者和对照组的回肠组织 数字病理学 克罗恩病 RNA测序, 单细胞测序, 加权基因共表达网络分析 WGCNA 基因表达数据, 单细胞数据 27例初治克罗恩病, 26例确诊克罗恩病, 17例对照 NA 单细胞RNA测序, 靶向自身免疫RNA测序 NA NA
216 2025-10-06
Cellular heterogeneity and microenvironmental control of skin cancer
2021-05, Journal of internal medicine IF:9.0Q1
综述 探讨皮肤组织中细胞异质性及微环境对携带致癌突变细胞的调控机制 整合体内功能研究与单细胞转录组分析,揭示表皮干细胞及其微环境在癌症预防与促进中的双重作用 NA 阐明微环境如何调控携带突变细胞的恶性进展机制 皮肤组织中的表皮干细胞、成纤维细胞和免疫细胞亚群 单细胞生物学 皮肤癌 单细胞转录组分析 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
217 2025-10-06
The epigenetic basis of cellular heterogeneity
2021-04, Nature reviews. Genetics
综述 探讨表观遗传机制在细胞异质性形成中的基础作用 系统阐述单细胞表观基因组分析技术如何揭示染色质状态对基因表达异质性的贡献机制 NA 研究表观遗传特征与细胞异质性之间的关联机制 染色质可及性、核小体定位、组蛋白尾修饰和增强子-启动子相互作用等表观遗传特征 表观遗传学 癌症 单细胞测序 NA 表观基因组数据 NA NA 单细胞表观基因组分析 NA NA
218 2025-10-06
Single-cell RNA sequencing reveals cell type- and artery type-specific vascular remodelling in male spontaneously hypertensive rats
2021-03-21, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示雄性自发性高血压大鼠血管重塑的细胞类型和动脉类型特异性特征 首次在高血压动物模型中系统描绘了抵抗性和传导性动脉的细胞图谱,并以无偏倚方式揭示了动脉类型和细胞类型特异性的基因表达失调 研究仅使用雄性自发性高血压大鼠,未涉及雌性模型或人类样本 系统表征高血压相关的血管重塑机制 自发性高血压大鼠的肠系膜动脉和主动脉 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 超过20,000个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
219 2025-10-06
Congenital heart disease risk loci identified by genome-wide association study in European patients
2021-01-19, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 通过欧洲患者全基因组关联研究识别先天性心脏病的风险基因位点 首次在欧洲人群中通过大规模GWAS识别出与先天性心脏病相关的多个新风险基因位点,并进行了功能验证 研究仅限于欧洲白人群体,样本多样性不足 识别先天性心脏病的遗传风险因素并进行功能分析 4034名白人先天性心脏病患者和8486名健康对照 基因组学 先天性心脏病 GWAS, 单细胞RNA测序, 干细胞分化 NA 基因组数据, 基因表达数据 4034例患者和8486例对照 NA 单细胞RNA-seq, 全基因组关联分析 NA NA
220 2025-10-06
Glycolytic metabolism of pathogenic T cells enables early detection of GVHD by 13C-MRI
2021-01-07, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过13C-MRI代谢成像技术无创检测GVHD早期病理变化 首次利用超极化13C-丙酮酸磁共振成像技术检测GVHD早期T细胞糖酵解代谢活性变化 研究主要基于小鼠模型,临床样本数据仅为初步结果 开发GVHD早期无创诊断方法 同种异体造血干细胞移植后的GVHD病理过程 医学影像 移植物抗宿主病 13C-MRI,单细胞测序,转录组分析,代谢活性分析 NA 影像数据,转录组数据,代谢数据 慢性GVHD小鼠模型及AHSCT患者初步样本 NA 单细胞RNA测序,代谢成像 NA NA
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