单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2024-08-08 |
Transcriptomic profiling of SARS-CoV-2 infected human cell lines identifies HSP90 as target for COVID-19 therapy
2021-Mar-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102151
PMID:33585804
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研究论文 | 研究报道了SARS-CoV-2感染的人类细胞系的基因表达谱，并识别出HSP90作为COVID-19治疗的目标 | 首次揭示了SARS-CoV-2在人类上皮细胞系Calu-3中引发的大约两倍于SARS-CoV的固有免疫反应刺激，并通过单细胞RNA测序分析了病毒感染细胞的基因表达模式 | NA | 深入了解SARS-CoV-2感染的分子生物学机制，包括病毒复制、宿主反应和疾病进展 | SARS-CoV和SARS-CoV-2感染的人类细胞系，以及HSP90在感染中的作用 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三个SARS-CoV和SARS-CoV-2感染的人类细胞系 |
| 202 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptional changes associated with drug tolerance and response to combination therapies in cancer
2021-03-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21884-z
PMID:33712615
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，研究了癌症细胞在药物耐受和联合治疗反应中的转录变化 | 首次展示了癌症细胞系、异种移植瘤和患者肿瘤中存在的多种癌症细胞亚群，并揭示了这些亚群的表观遗传变化和治疗敏感性的差异 | NA | 研究癌症细胞在药物耐受和联合治疗反应中的转录变化 | 癌症细胞的亚群及其对药物的耐受性和敏感性 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及细胞系、异种移植瘤和患者肿瘤中的多种癌症细胞亚群 |
| 203 | 2024-08-08 |
Urinary Single-Cell Profiling Captures the Cellular Diversity of the Kidney
2021-03, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020050757
PMID:33531352
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析技术，对17份尿液样本中的23,082个细胞进行了分析，揭示了尿液中细胞的多样性及其与肾脏和膀胱细胞的相似性和差异性 | 首次通过单细胞转录组分析技术全面地描述了尿液中细胞的类型和特征 | NA | 生成人类尿液中细胞的参考数据集，并探索尿液中细胞与肾脏和膀胱细胞的关系 | 尿液中的单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 17份尿液样本，来自5名受试者在不同时间的收集 |
| 204 | 2024-08-08 |
Single-cell lineage mapping of a diverse virus-specific naive CD4 T cell repertoire
2021-03-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20200650
PMID:33201171
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研究论文 | 本文利用单细胞测序技术追踪了病毒特异性CD4 T细胞在淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒（LCMV）感染下的克隆扩增、分化轨迹和谱系选择 | 首次实现了对自然TCR库中单个初始T细胞克隆扩增、分化和谱系选择的追踪 | NA | 研究病毒特异性CD4 T细胞在感染过程中的克隆扩增、分化和谱系选择 | 病毒特异性CD4 T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 序列数据 | NA |
| 205 | 2024-08-07 |
CD11c+CD88+CD317+ myeloid cells are critical mediators of persistent CNS autoimmunity
2021-04-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2014492118
PMID:33785592
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研究论文 | 研究通过选择性删除CD11c细胞中的α4-整合素，探讨其在中枢神经系统（CNS）自身免疫中的作用 | 首次展示了CD11c+CD88+CD317+髓系细胞在持续性CNS自身免疫中的关键作用，并通过单细胞RNA测序进行了详细分析 | 研究主要在实验小鼠模型中进行，可能与人类疾病存在差异 | 探讨CD11c+CD88+CD317+髓系细胞在多发性硬化症（MS）中的作用及机制 | CD11c.Cre小鼠和野生型（WT）小鼠 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及CD11c.Cre小鼠和WT小鼠，以及人类脑脊液样本 |
| 206 | 2024-08-07 |
Identification and Characterization of Zebrafish Tlr4 Coreceptor Md-2
2021-03-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.1901288
PMID:33472906
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和功能实验，鉴定并表征了斑马鱼中的Tlr4共受体Md-2，揭示了其在先天免疫系统中的作用 | 首次在斑马鱼中发现并验证了Md-2的存在，并证明其与Tlr4形成复合体响应LPS，挑战了之前认为斑马鱼缺乏Md-2的观点 | 文章中提到的功能丧失突变对LPS毒性的保护作用有限，表明可能存在其他未知的免疫机制 | 探究斑马鱼中Tlr4共受体Md-2的鉴定与功能，以及其在先天免疫系统中的作用 | 斑马鱼中的Tlr4共受体Md-2及其在先天免疫系统中的作用 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及11种有颌脊椎动物的基因组分析 |
| 207 | 2024-08-07 |
Entropy subspace separation-based clustering for noise reduction (ENCORE) of scRNA-seq data
2021-02-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa1157
PMID:33305325
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研究论文 | 本文提出了一种基于熵子空间分离的聚类算法ENCORE，用于减少单细胞RNA测序数据中的噪声 | ENCORE算法通过集成熵子空间分离策略和共识聚类方法，能够有效区分信息特征与噪声，提高细胞聚类的准确性和可视化分辨率 | NA | 研究旨在提高单细胞RNA测序数据分析的准确性和分辨率，以更好地研究细胞异质性和发现群体标记 | 单细胞RNA测序数据中的细胞聚类、标记识别和可视化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 共识聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | 12个标准数据集 |
| 208 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing and lipidomics reveal cell and lipid dynamics of fat infiltration in skeletal muscle
2021-02, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.12643
PMID:33244879
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和脂质组学分析，揭示了骨骼肌中脂肪浸润的细胞和脂质动态变化 | 首次通过单细胞RNA测序和脂质组学技术，详细解析了骨骼肌脂肪浸润过程中的细胞起源和脂质及转录组变化 | 研究主要集中在短期内的细胞和脂质变化，长期影响及机制尚需进一步研究 | 探究骨骼肌中脂肪浸润的细胞起源和脂质及转录组变化 | 骨骼肌中的脂肪浸润现象 | 数字病理学 | 肌肉疾病 | 单细胞RNA测序, 脂质组学 | NA | RNA, 脂质 | GLY注射后的骨骼肌样本 |
| 209 | 2024-08-07 |
Runx2-Twist1 interaction coordinates cranial neural crest guidance of soft palate myogenesis
2021-01-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.62387
PMID:33482080
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研究论文 | 本研究使用小鼠软腭作为模型，通过单细胞RNA测序分析探讨了颅神经嵴衍生物在颅面肌肉发育中的异质性和谱系承诺 | 揭示了Runx2和Twist1在调控颅神经嵴衍生物命运中的新作用，以及它们通过细胞间相互作用指导颅面肌肉发育的机制 | NA | 研究颅神经嵴细胞在颅面肌肉发育中的作用及其调控机制 | 颅神经嵴细胞及其在颅面肌肉发育中的衍生物 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠软腭样本 |
| 210 | 2024-08-07 |
A High-Dimensional Window into the Micro-Environment of Triple Negative Breast Cancer
2021-Jan-16, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13020316
PMID:33467084
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综述 | 本文综述了三阴性乳腺癌（TNBC）微环境中淋巴细胞、髓系细胞和基质细胞的细胞表型和空间模式，并探讨了将这些特征映射到肿瘤细胞基因型的潜在价值 | 利用多种高维度技术（如单细胞RNA测序、空间转录组学、T细胞受体分析、高级流式细胞术、成像质谱细胞术及其整合）来定义细胞表型 | NA | 深入理解三阴性乳腺癌患者的肿瘤微环境组成，以提供有效的个性化免疫治疗 | 三阴性乳腺癌的肿瘤细胞和非肿瘤成分的异质性及其随时间的变化 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、T细胞受体分析、高级流式细胞术、成像质谱细胞术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 211 | 2024-08-07 |
Single-Cell Profiling of Coding and Noncoding Genes in Human Dopamine Neuron Differentiation
2021-01-12, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10010137
PMID:33445654
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术对人类多巴胺神经元分化过程中的编码和非编码基因进行了高吞吐量转录组分析 | 开发了一种生物信息学管道，提供了基于时间和细胞类型特异性的长非编码RNA全景图，有助于揭示多巴胺神经元分化中编码和非编码基因的复杂调控网络 | NA | 评估干细胞培养作为人类多巴胺神经发生体外模型系统的实用性，并揭示人类多巴胺神经元的发育、成熟和功能的分子步骤 | 人类多能干细胞衍生的多巴胺神经元及其分化过程中的编码和非编码基因 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约20,000个腹侧中脑模式化的干细胞 |
| 212 | 2024-08-07 |
Systematic comparison of high-throughput single-cell RNA-seq methods for immune cell profiling
2021-Jan-20, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07358-4
PMID:33472597
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研究论文 | 本文系统比较了七种高通量单细胞RNA测序方法在免疫细胞分析中的应用 | 展示了10x Genomics 5' v1和3' v3方法在mRNA检测灵敏度上的优势，减少了dropout事件，有助于识别差异表达基因和提高单细胞与免疫bulk RNA-seq特征的一致性 | 单细胞方法在恢复完整转录组方面存在固有限制，由于细胞和转录dropout事件的普遍性，以及样本可用性和异质性先验知识的限制，可能导致数据解释的混淆 | 评估不同高通量单细胞RNA测序方法在免疫细胞分析中的性能 | 七种高通量单细胞RNA测序方法在模拟免疫细胞类型和细胞大小异质性的混合样本中的表现 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 21个库，包含两个人类和小鼠淋巴细胞细胞系的混合样本 |
| 213 | 2024-08-07 |
STAB: a spatio-temporal cell atlas of the human brain
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa762
PMID:32976581
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研究论文 | 本文介绍了一个名为STAB的时空细胞图谱数据库，该数据库包含人类大脑多个区域和发育时期的单细胞转录组数据 | STAB数据库提供了人类大脑在生命周期中动态细胞组成和分子特征的全面数据，填补了现有研究的空白 | NA | 旨在阐明大脑的细胞和转录组结构，以理解大脑功能和脑部疾病 | 人类大脑的细胞组成和转录组结构 | 数字病理学 | 神经精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包含42种细胞亚型，跨越20个大脑区域和11个发育时期 |
| 214 | 2024-08-07 |
MYC Promotes Bone Marrow Stem Cell Dysfunction in Fanconi Anemia
2021-01-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.09.004
PMID:32997960
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了范可尼贫血患者的造血干细胞和祖细胞，发现MYC的高表达与骨髓衰竭相关，并探讨了MYC抑制剂对FA患者造血干细胞的影响 | 首次揭示了MYC在范可尼贫血骨髓衰竭中的作用，并通过实验验证了MYC抑制剂对FA患者造血干细胞的潜在治疗效果 | 研究主要集中在细胞和动物模型上，尚未进行临床试验验证MYC抑制剂的临床应用效果 | 探讨范可尼贫血患者骨髓衰竭的分子机制及潜在治疗策略 | 范可尼贫血患者的造血干细胞和祖细胞 | NA | 范可尼贫血 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 来自范可尼贫血患者的造血干细胞和祖细胞样本 |
| 215 | 2024-08-07 |
Bi-FoRe: an efficient bidirectional knockin strategy to generate pairwise conditional alleles with fluorescent indicators
2021-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-020-00747-1
PMID:32681448
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Bi-FoRe的高效双向敲入策略，用于生成带有荧光指示器的成对条件性等位基因 | 首次报道了通过单一供体生成具有条件性和基因标记双重功能的成对双功能敲入等位基因 | NA | 开发一种新的策略，用于基因表达标记和基因功能的条件性调控 | zebrafish中的sox10和isl1基因座 | 基因工程 | NA | CRISPR/Cas系统 | NA | 基因组数据 | NA |
| 216 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies macrophage transcriptional heterogeneities in granulomatous diseases
2021-06, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.03794-2020
PMID:33602861
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 217 | 2024-08-05 |
Airspace Macrophages and Monocytes Exist in Transcriptionally Distinct Subsets in Healthy Adults
2021-04-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202005-1989OC
PMID:33079572
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研究论文 | 本文揭示了健康成年人肺泡和小气道中存在的转录性不同的巨噬细胞亚群 | 首次描述了健康状态下肺间隙免疫细胞的保守异质性，并识别了两种新型巨噬细胞亚群 | 样本仅限于十名健康成年人，可能不具备广泛适用性 | 理解健康状态下肺间隙巨噬细胞的转录异质性 | 健康成年人气道灌洗液中获取的人类细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 十名健康成年人 |
| 218 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling and the use of AID deficient mice reveal that B cell activation combined with antibody class switch recombination and somatic hypermutation do not benefit the control of experimental trypanosomosis
2021-11, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1010026
PMID:34762705
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研究论文 | 本文研究了在AID缺失小鼠中B细胞活化与抗体类别转换和体细胞高突变对实验性锥虫病控制的影响 | 首次在锥虫感染小鼠的脾细胞上应用scRNA-seq分析，揭示了自然IgM在抗锥虫感染中的独特作用 | 研究主要集中在鼠模型中，可能无法完全反映人类感染的复杂性 | 探讨锥虫感染中B细胞的作用及其对宿主免疫反应的影响 | 锥虫感染的小鼠脾细胞及其B细胞反应 | 数字病理学 | 锥虫病 | scRNA-seq、流式细胞术、ELISA | NA | 细胞 | 锥虫感染的老鼠脾细胞 |
| 219 | 2024-08-05 |
In silico analysis suggests disruption of interactions between HAMP from hepatocytes and SLC40A1 from macrophages in hepatocellular carcinoma
2021-May-17, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-021-00977-0
PMID:34001107
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研究论文 | 本研究通过分析HCC微环境中的细胞之间的相互作用，探讨肝癌的增殖机制 | 首次揭示了HAMP与SLC40A1之间的相互作用在肝细胞癌异常增殖中的重要性 | 尚需通过湿实验进行进一步验证 | 识别肝细胞癌及其旁癌组织中的增殖性肝细胞，并探讨其异常增殖的潜在作用 | 增殖性肝细胞及其在HCC和旁癌组织中的基因表达特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了来自HCC及其旁癌组织的单细胞样本 |
| 220 | 2024-08-05 |
Taming human brain organoids one cell at a time
2021-03, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2020.05.022
PMID:32718852
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review | 本综述总结了单细胞转录组技术在解析人脑类器官复杂性方面的最新方法、进展和挑战 | 文章创新在于整合了单细胞转录组学和新兴技术，以深入研究人脑发展和疾病特征 | 文章没有讨论具体的应用案例和局限性 | 研究人脑类器官的复杂性及其在发育过程中的基因调控 | 人脑类器官，特别是它们的细胞组成和发育起源 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |