单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2024-08-05 |
A multicenter study benchmarking single-cell RNA sequencing technologies using reference samples
2021-09, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-00748-9
PMID:33349700
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研究论文 | 本文比较了不同技术和实验室生成的单细胞RNA测序数据集 | 提出了在选择算法以实现准确生物解释方面的指导 | 尽管结果具有较高的可重复性，但可能在不同平台的算法选择上仍存在挑战 | 旨在优化单细胞RNA测序研究中的平台和软件选择 | 使用乳腺癌细胞和B细胞作为参考样本进行比较 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个来源的细胞样本，包括乳腺癌细胞和B细胞 |
| 202 | 2024-08-05 |
Gene Deconvolution Reveals Aberrant Liver Regeneration and Immune Cell Infiltration in Alcohol-Associated Hepatitis
2021-08, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.31759
PMID:33619773
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研究论文 | 本文通过基因解卷积揭示了与酒精相关性肝炎中异常的肝脏再生和免疫细胞浸润 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了慢性肝病中细胞组成的显著变化，尤其是在严重急性肝炎患者中 | 样本数量有限，可能影响结果的广泛性和适用性 | 探讨慢性肝病中肝细胞再生和免疫细胞浸润的差异性贡献 | 健康肝脏和慢性肝病患者的肝细胞及免疫细胞 | 数字病理学 | 酒精相关性肝炎 | RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 有限数量的慢性肝病患者样本 |
| 203 | 2024-08-05 |
Impaired immune signaling and changes in the lung microbiome precede secondary bacterial pneumonia in COVID-19
2021-Nov-30, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2021.03.23.21253487
PMID:33791731
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研究论文 | 本文评估了COVID-19患者肺部免疫反应和微生物组动态，特别是与继发性细菌肺炎的关系 | 研究发现COVID-19患者在继发性细菌感染前的免疫信号受损，以及微生物组组成的变化 | 样本量相对较小，仅包括23名COVID-19患者 | 探讨COVID-19患者免疫信号失调如何导致继发性细菌肺炎 | 23名COVID-19患者及8名重症未感染对照 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 23名COVID-19患者和8名重症未感染对照 |
| 204 | 2024-08-05 |
A Spatial Quantitative Systems Pharmacology Platform spQSP-IO for Simulations of Tumor-Immune Interactions and Effects of Checkpoint Inhibitor Immunotherapy
2021-Jul-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13153751
PMID:34359653
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研究论文 | 本文开发了一个混合计算模型平台 spQSP-IO，用于研究肿瘤-免疫相互作用及检查点抑制免疫疗法的效果 | 本研究创新性地结合了空间解析的基于代理的模型与QSP模型，增强了其预测能力 | 目前尚未明确提及具体的限制 | 研究肿瘤微环境与癌症-免疫细胞相互作用对肿瘤发展的影响 | 非小细胞肺癌模型的虚拟患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 成像技术，空间转录组学 | 基于代理的模型（ABM） | 空间数据 | 虚拟患者的模拟模型 |
| 205 | 2024-08-07 |
Author Correction: A yeast-optimized single-cell transcriptomics platform elucidates how mycophenolic acid and guanine alter global mRNA levels
2021-Jul-13, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02420-7
PMID:34257405
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 206 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA Sequencing Reveals Sexually Dimorphic Transcriptome and Type 2 Diabetes Genes in Mouse Islet β Cells
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2021.07.004
PMID:34571259
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研究论文 | 本文探讨了小鼠胰腺β细胞中的性别差异转录组和2型糖尿病基因 | 首次揭示了小鼠β细胞中的性别差异转录组，并识别出与性别相关的2型糖尿病基因 | 研究局限于小鼠模型，结果可能无法直接应用于人类 | 探究性别在2型糖尿病发病机制中的作用 | 小鼠胰腺β细胞和与高脂饮食诱导的2型糖尿病相关的基因 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用高脂饮食诱导的2型糖尿病小鼠模型 |
| 207 | 2024-08-05 |
The Rhesus Macaque Serves As a Model for Human Lateral Branch Nephrogenesis
2021-05-03, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020101459
PMID:33789950
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研究论文 | 本研究表明猕猴是人类侧支肾发生的有效模型。 | 首次确认猕猴作为真实侧支肾发生的模型，促进了对人类晚期妊娠肾发生的分子研究。 | 该研究未能详细探讨不同妊娠阶段的细胞变化。 | 研究大三分支肾发生的分子机制。 | 129-131天妊娠期的猕猴胎儿肾脏。 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 4个猕猴胎儿肾脏样本 |
| 208 | 2024-08-05 |
C5aR1-positive neutrophils promote breast cancer glycolysis through WTAP-dependent m6A methylation of ENO1
2021-07-26, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-021-04028-5
PMID:34312368
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研究论文 | 本文探讨了C5aR1阳性中性粒细胞如何通过WTAP依赖性m6A甲基化促进乳腺癌的糖酵解。 | 识别出一种新类型的C5aR1阳性中性粒细胞，与乳腺癌进展和不良预后相关。 | 当前对中性粒细胞在乳腺癌进展中的作用尚不明确，仍需进一步研究。 | 研究C5aR1阳性中性粒细胞在乳腺癌进展中的作用及其机制。 | C5aR1阳性中性粒细胞及其在乳腺癌中的作用。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 临床乳腺癌样本及单细胞数据 |
| 209 | 2024-08-05 |
Phospholipids of APOE lipoproteins activate microglia in an isoform-specific manner in preclinical models of Alzheimer's disease
2021-06-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-23762-0
PMID:34099706
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研究论文 | 本研究探讨了APOE脂蛋白的磷脂如何以同种型特异性影响阿尔茨海默病中微胶质细胞的反应。 | 发现人类APOEε3和APOEε4在阿尔茨海默病大脑中存在特异性的磷脂特征，并揭示了APOE3脂蛋白与APOE4在微胶质细胞响应Aβ方面的显著差异 | 尚需进一步研究以明确APOE和TREM2在真实生物体中的复杂相互作用 | 阐明APOE同种型在阿尔茨海默病微胶质细胞反应中的作用 | 使用预临床阿尔茨海默病鼠模型研究APOE3和APOE4对微胶质细胞的影响 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | RNA-seq | NA | RNA数据 | 使用APOE3和APOE4小鼠的脂蛋白和微胶质细胞样本 |
| 210 | 2024-08-05 |
The Distinct Immune Nature of the Fetal Inflammatory Response Syndrome Type I and Type II
2021-09-14, ImmunoHorizons
DOI:10.4049/immunohorizons.2100047
PMID:34521696
|
研究论文 | 本研究揭示了胎儿炎症反应综合征I型和II型的不同免疫特性 | 首次明确了FIRS I型和II型的免疫机制差异，揭示了它们在免疫反应中的不同角色 | 由于FIRS的低发病率和产后诊断困难，分子机制仍未完全理解 | 探讨胎儿炎症反应综合征(I型和II型)的免疫机制 | 来自早产儿的脐血样本，诊断为FIRS I型或II型 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 人类脐血样本来自早产儿 |
| 211 | 2024-08-05 |
People critically ill with COVID-19 exhibit peripheral immune profiles predictive of mortality and reflective of SARS-CoV-2 lung viral burden
2021-12-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100476
PMID:34873589
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研究论文 | 本文研究了COVID-19重症患者的外周免疫状态与死亡率之间的关联 | 采用单细胞RNA测序对免疫状态进行高维剖析，揭示了与COVID-19死亡率相关的细胞分子特征 | 可能未能考虑所有潜在的免疫细胞状态和不同的临床变量 | 旨在阐明重症COVID-19患者的免疫细胞状态与死亡的关系 | 重症COVID-19患者的血液和呼吸样本 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA-seq | NA | 血液和呼吸样本 | 重症COVID-19患者的高维样本 |
| 212 | 2024-08-05 |
A biomechanical switch regulates the transition towards homeostasis in oesophageal epithelium
2021-05, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-021-00679-w
PMID:33972733
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研究论文 | 这篇文章探讨了机械应力如何调节食管上皮向稳态过渡的机制 | 揭示了机械应力对KLF4细胞群体的影响，从而平衡细胞增殖并标志着稳态的过渡 | 目前尚未完全了解调控细胞决策的所有过程 | 研究食管上皮细胞在后出生阶段如何响应机械应力以达到稳态 | 小鼠食管上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | NA |
| 213 | 2024-08-05 |
TWO-SIGMA: A novel two-component single cell model-based association method for single-cell RNA-seq data
2021-03, Genetic epidemiology
IF:1.7Q3
DOI:10.1002/gepi.22361
PMID:32989764
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研究论文 | 本文开发了TWO-SIGMA，一种基于单细胞模型的关联方法，用于单细胞RNA-seq数据的差异表达分析 | TWO-SIGMA是唯一一种能够同时具备多项灵活特性的scRNA-seq数据分析方法 | NA | 旨在改进单细胞RNA-seq数据的差异表达分析方法 | 单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 混合效应回归模型 | 数据计数 | 使用胰腺胰岛单细胞的实证分析 |
| 214 | 2024-08-05 |
Identification and Characterization of Antigen-Specific CD8+ T Cells Using Surface-Trapped TNF-α and Single-Cell Sequencing
2021-12-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100535
PMID:34810222
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研究论文 | 本研究介绍了一种快速识别和表征抗原特异性CD8 T细胞的新系统 | 该系统利用表面捕获的TNF-α和单细胞测序的重大进展，构建了几乎无限的实验试剂 | 实验方法依然受到初级细胞数量的限制，且MHC结合肽/TCR相互作用的高度变异性仍然是挑战 | 研究抗原特异性CD8 T细胞的识别和表征，促进疾病研究和治疗开发 | 来自猕猴和HIV感染供体的抗原特异性CD8 T细胞 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 来自猕猴的CMV特异性CD8 T细胞和HIV感染供体的样本 |
| 215 | 2024-08-05 |
TNF plays a crucial role in inflammation by signaling via T cell TNFR2
2021-12-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2109972118
PMID:34873037
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研究论文 | 这篇文章探讨了TNF在炎症中的关键角色及其通过T细胞TNFR2信号传导的机制 | 该研究首次阐明了TNF不仅作为效应因子，还作为炎症Th分化的启动因子 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类疾病状态中验证 | 研究TNF在调节炎症和Th细胞分化中的作用 | 小鼠CD4 T细胞及其在实验性自体免疫性脑脊髓炎中的表现 | 免疫学 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠CD4 T细胞和来自多发性硬化患者的脑脊液浸润CD4 T细胞 |
| 216 | 2024-08-05 |
Alternative poly-adenylation modulates α1-antitrypsin expression in chronic obstructive pulmonary disease
2021-11, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009912
PMID:34784346
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研究论文 | 该研究探讨了α1-抗胰蛋白酶在慢性阻塞性肺病（COPD）中的表达与选择性聚腺苷酸化之间的关系 | 本研究揭示了影响SERPINA1 mRNA翻译的多种RNA结合蛋白，并确定了QKI作为一种调节剂的作用 | 本研究的局限性在于只在特定样本中进行观察，无法广泛推广这些发现 | 研究α1-抗胰蛋白酶在非缺乏个体中的作用及其在COPD中的调控机制 | 该研究对象包括82例COPD患者和64名对照组，以及独立验证的376例COPD患者和267名对照组 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | RNA-seq | NA | RNA | 82例COPD患者和64名对照组，及独立研究中的376例COPD患者和267名对照组 |
| 217 | 2024-08-05 |
Identification of cell-type-specific marker genes from co-expression patterns in tissue samples
2021-Oct-11, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab257
PMID:33904573
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研究论文 | 本文提出了一种新算法，通过分析组织样本中的共表达模式来识别细胞特异性标志基因 | 提出了一种半监督算法，结合已知标志基因的信息和大规模转录组数据来精确识别标志基因 | 研究依赖于已发表的可能标志基因的信息，可能影响算法的准确性 | 识别组织样本中特定细胞类型的标志基因 | 组织样本中的细胞类型标志基因 | 数字病理学 | NA | 转录组测序 | 半监督算法 | 大规模转录组数据 | 多个组织样本 |
| 218 | 2024-08-05 |
Pulmonary Aerosol Delivery of Let-7b microRNA Confers a Striking Inhibitory Effect on Lung Carcinogenesis through Targeting the Tumor Immune Microenvironment
2021-09, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202100629
PMID:34236760
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研究论文 | 本研究探讨了气雾化的let-7b微RNA在肺癌预防中的有效性 | 首次提出通过气雾方式递送let-7b微RNA来促进抗肿瘤免疫 | 缺乏针对系统性暴露的高效递送系统 | 研究气雾化let-7b微RNA治疗在肺癌预防中的效力 | 调查气雾状let-7b对肺腺瘤和肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA |
| 219 | 2024-08-05 |
Improved integration of single-cell transcriptome and surface protein expression by LinQ-View
2021-08-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2021.100056
PMID:35475142
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研究论文 | 提出了一种名为LinQ-View的工具包，用于单细胞数据的多模态可视化和分析 | LinQ-View能够整合转录组和细胞表面蛋白表达数据，提供量化的群体纯度评估指标 | 目前数据的应用主要集中在CITE-seq数据上，可能限制了其广泛适用性 | 研究单细胞转录组与表面蛋白表达的集成分析 | 针对受SARS-CoV-2感染患者的单细胞转录组和蛋白表达数据 | 数字病理学 | NA | CITE-seq | NA | 单细胞转录组与蛋白表达数据 | 多个公共CITE-seq数据集 |
| 220 | 2024-08-05 |
Distinct populations of antigen-specific tissue-resident CD8+ T cells in human cervix mucosa
2021-08-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.149950
PMID:34156975
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研究论文 | 研究了人类宫颈黏膜中抗原特异性组织驻留CD8+ T细胞的不同群体 | 首次通过单细胞RNA测序定义了人类宫颈中组织驻留记忆T细胞的表型和TCR克隆型 | 缺乏广泛关于人类FRT中T细胞受体库的全面知识 | 研究人类宫颈中组织驻留记忆T细胞的特征及其与特定病毒抗原的关系 | 主要研究人类宫颈黏膜中的CD8+ T细胞亚群 | 数字病理学 | 性传播感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | HSV-2血清阳性个体中的Cervical CD8+ TRM克隆型，具体数量未提供 |