单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 2161 - 2180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2161 | 2024-08-09 |
Author Correction to: Single-cell RNA-seq reveals a concomitant delay in differentiation and cell cycle of aged hematopoietic stem cells
2021-Apr-16, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-021-01005-4
PMID:33863333
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2162 | 2024-08-09 |
Rituximab-resistant splenic memory B cells and newly engaged naive B cells fuel relapses in patients with immune thrombocytopenia
2021-04-14, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abc3961
PMID:33853929
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研究论文 | 研究揭示了在免疫性血小板减少症患者中，利妥昔单抗治疗后复发的细胞基础，特别是涉及记忆B细胞和新生幼稚B细胞的作用。 | 通过单细胞RNA测序分析，识别出一种特殊的静息状态脾记忆B细胞，这些细胞具有独特的、可逆的利妥昔单抗耐药表型，为治疗提供了新的靶点。 | NA | 探究利妥昔单抗治疗后免疫性血小板减少症患者复发的细胞机制。 | 免疫性血小板减少症患者中的记忆B细胞和幼稚B细胞。 | 免疫学 | 免疫性血小板减少症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 2163 | 2024-08-09 |
Prediction of single-cell mechanisms for disease progression in hypertrophic remodelling by a trans-omics approach
2021-04-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-86821-y
PMID:33854108
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研究论文 | 本研究提出了一种跨组学方法，通过整合单细胞RNA测序、ChIP-seq和基因相互作用组数据，预测心力衰竭的分子病理机制并识别区分异质表型的标记基因 | 本研究首次采用跨组学方法，结合多种组学数据，揭示了心力衰竭中Nppa表达水平与线粒体电子传递系统相关基因的负相关性 | NA | 预测心力衰竭的分子病理机制并识别标记基因 | 心力衰竭的分子机制和标记基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, ChIP-seq | NA | 基因相互作用组数据 | NA |
| 2164 | 2024-08-09 |
Mouse aging cell atlas analysis reveals global and cell type-specific aging signatures
2021-04-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.62293
PMID:33847263
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研究论文 | 本研究利用Tabula Muris Senis单细胞RNA测序数据集，系统地描述了小鼠中多种细胞类型在衰老过程中的基因表达变化。 | 研究发现了衰老相关的基因在多个组织细胞类型中表达变化的一致性，表明了生物体水平的协调性衰老行为，并能够从转录组角度对比不同组织和细胞类型的衰老状态。 | NA | 系统地描述小鼠中多种细胞类型在衰老过程中的基因表达变化。 | 小鼠的76种组织细胞类型在衰老过程中的基因表达变化。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 76种组织细胞类型来自23种组织 |
| 2165 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics reveals involution mimicry during the specification of the basal breast cancer subtype
2021-04-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.108945
PMID:33852842
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研究论文 | 本研究利用无偏倚的液滴单细胞RNA测序技术，揭示了在乳腺基底癌亚型分化过程中肿瘤进展的细胞基础 | 发现基底样癌细胞模仿怀孕后指定的乳腺小叶系，并包含异常的断奶后发育程序，触发肿瘤微环境重塑和转移扩散 | NA | 阐明乳腺基底癌亚型分化过程中的肿瘤进展机制 | 乳腺基底癌亚型的肿瘤进展 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 使用MMTV-PyMT乳腺肿瘤模型 |
| 2166 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics identifies gene expression networks driving differentiation and tumorigenesis in the human fallopian tube
2021-04-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.108978
PMID:33852846
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了12个正常输卵管样本中的约53,000个细胞，揭示了输卵管上皮的细胞组成和分化轨迹，并识别出高级别浆液性卵巢癌的可能前体细胞状态 | 首次详细描绘了人类输卵管的细胞组成和上皮细胞的分化轨迹，并确定了高级别浆液性卵巢癌的一个潜在前体细胞状态 | NA | 揭示人类输卵管的细胞组成和上皮细胞的分化过程，并探索高级别浆液性卵巢癌的细胞起源 | 人类输卵管的细胞组成和上皮细胞的分化过程 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 约53,000个细胞来自12个正常输卵管样本 |
| 2167 | 2024-08-09 |
Complement C5a promotes antigen cross-presentation by Peyer's patch monocyte-derived dendritic cells and drives a protective CD8+ T cell response
2021-04-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.108995
PMID:33852847
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研究论文 | 本研究探讨了补体片段C5a在Peyer's patch中通过单核细胞衍生的树突状细胞促进抗原交叉呈递，并驱动保护性CD8+ T细胞反应的机制 | 首次揭示了C5a通过C5aR LysoDCs增加活性氧水平，从而有效促进抗原交叉呈递和特异性CD8 T细胞反应 | NA | 探索C5a在黏膜适应性免疫诱导中的作用及其调控CD8 T细胞反应的机制 | Peyer's patch中的C5aR LysoDCs及其在CD8 T细胞免疫诱导中的作用 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | C5缺陷小鼠 |
| 2168 | 2024-08-09 |
Uncovering transcriptional dark matter via gene annotation independent single-cell RNA sequencing analysis
2021-04-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-22496-3
PMID:33846360
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研究论文 | 本文介绍了一种新的单细胞RNA测序分析方法，该方法能够在缺乏高质量基因组注释的情况下，发现生物学上相关的转录活性区域 | 开发了一种新的单细胞RNA测序分析流程，能够识别并注释基因组注释范围之外的转录活性区域，从而揭示传统方法无法检测到的生物学信息 | NA | 克服基因组注释不完整的问题，发现新的转录活性区域 | 人类、小鼠、鸡、鼹鼠、狐猴和海胆的基因组 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种生物样本，包括人类、小鼠、鸡、鼹鼠、狐猴和海胆 |
| 2169 | 2024-08-09 |
A flexible microfluidic system for single-cell transcriptome profiling elucidates phased transcriptional regulators of cell cycle
2021-04-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-86070-z
PMID:33846365
|
研究论文 | 本文介绍了一种灵活、成本效益高且用户友好的基于液滴的微流控系统，名为Nadia Instrument，用于单细胞转录组分析，能够在一个运行中捕获约50,000个单细胞或单个细胞核的3' mRNA。 | 该系统展示了高度可重复的液滴大小、低双峰率和高的mRNA捕获效率，并且通过与Nadia Innovate结合，可以转变为一个适应性强的设置，使用不同的缓冲液和条形码珠配置，以促进多样化的应用。 | NA | 展示该系统在不同细胞周期阶段对人和小鼠细胞进行3' mRNA分析的能力，以区分不同的细胞群体并推断潜在的转录调控网络。 | 单细胞转录组分析 | 生物技术 | NA | 微流控技术 | NA | 转录组数据 | 约50,000个单细胞或单个细胞核 |
| 2170 | 2024-08-09 |
Investigating Mechanisms of Response or Resistance to Immune Checkpoint Inhibitors by Analyzing Cell-Cell Communications in Tumors Before and After Programmed Cell Death-1 (PD-1) Targeted Therapy: An Integrative Analysis Using Single-cell RNA and Bulk-RNA Sequencing Data
2021-04-02, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2021.1908010
PMID:33868792
|
研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，探讨了程序性细胞死亡-1（PD-1）靶向治疗前后肿瘤细胞间通讯的差异，以揭示抗PD-1治疗的响应和耐药机制 | 研究揭示了抗PD-1治疗响应的机制，并提供了改善免疫治疗的潜在策略 | NA | 探讨抗PD-1治疗的响应和耐药机制 | 肿瘤细胞在抗PD-1治疗前后的细胞间通讯 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 治疗前后的样本 |
| 2171 | 2024-08-09 |
Vascular smooth muscle-derived Trpv1+ progenitors are a source of cold-induced thermogenic adipocytes
2021-04, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-021-00373-z
PMID:33846638
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研究论文 | 本文识别了Trpv1血管平滑肌细胞作为先前未被发现的产热脂肪细胞前体细胞，并展示了其在冷暴露下增殖和分化为高度产热脂肪细胞的过程。 | 本文首次发现并证明了Trpv1血管平滑肌细胞作为产热脂肪细胞的新来源。 | NA | 研究冷诱导产热脂肪细胞的确切来源。 | 棕色脂肪组织（BAT）和米色脂肪中的Trpv1血管平滑肌细胞。 | NA | 肥胖和代谢紊乱 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 2172 | 2024-08-09 |
CytoTalk: De novo construction of signal transduction networks using single-cell transcriptomic data
2021-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abf1356
PMID:33853780
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CytoTalk的方法，用于利用单细胞转录组数据从头构建细胞类型特异性的信号传导网络 | CytoTalk通过集成细胞内和细胞间基因网络，并使用奖赏收集Steiner森林算法识别候选路径，相比现有算法有显著改进 | NA | 旨在通过单细胞技术提高信号传导研究的分辨率，并探索信号网络在不同组织和发育阶段的可塑性 | 单细胞转录组数据，特别是巨噬细胞和内皮细胞在人类成体和胎儿组织中的信号传导网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 奖赏收集Steiner森林算法 | 转录组数据 | 涉及人类成体和胎儿组织的巨噬细胞和内皮细胞 |
| 2173 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics and In Situ Morphological Analyses Reveal Microglia Heterogeneity Across the Nigrostriatal Pathway
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.639613
PMID:33854507
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和免疫荧光分析，揭示了黑质纹状体通路中微胶质细胞的异质性 | 发现了在黑质中主要存在的一种微胶质细胞亚群，显示出内在的转录免疫警戒特征，并与炎症诱导的微胶质细胞共享特征 | NA | 旨在研究帕金森病易感脑区黑质纹状体通路中微胶质细胞的异质性 | 微胶质细胞在黑质纹状体通路中的异质性 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用小鼠黑质纹状体通路样本 |
| 2174 | 2024-08-09 |
Unraveling Heterogeneity of Tumor Cells and Microenvironment and Its Clinical Implications for Triple Negative Breast Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.557477
PMID:33854958
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研究论文 | 本研究旨在系统地表征三阴性乳腺癌（TNBC）的肿瘤异质性，通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析肿瘤细胞及其微环境的异质性，并探讨其临床意义。 | 本研究通过整合两个数据集并使用Seurat包进行细胞聚类分析，揭示了TNBC中五种细胞类型的功能异质性及其在细胞间通讯网络中的作用，特别是免疫细胞在TNBC中的异质性及其与临床特征的相关性。 | NA | 系统表征三阴性乳腺癌的肿瘤异质性及其临床意义 | 三阴性乳腺癌（TNBC）的肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Seurat包 | RNA-seq数据 | 58个正常邻近组织和101个TNBC组织 |
| 2175 | 2024-08-09 |
Transcriptome Profiling of the Ovarian Cells at the Single-Cell Resolution in Adult Asian Seabass
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.647892
PMID:33855024
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了成年亚洲海鲈卵巢中几种不同细胞群体的分子特征 | 首次在性逆转鱼类物种中对卵巢细胞进行单细胞RNA测序分析，并比较了果蝇、哺乳动物和鱼类的转录组特征，揭示了卵巢发育中分子机制的保守性和差异性 | NA | 研究鱼类配子发生和性腺发育的分子机制 | 亚洲海鲈成年卵巢细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 几种不同细胞群体的成年亚洲海鲈卵巢细胞 |
| 2176 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic profiling provides insights into the toxic effects of Zearalenone exposure on primordial follicle assembly
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.58433
PMID:33859742
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，探讨了玉米赤霉烯酮（ZEN）暴露对小鼠原始卵泡组装的影响 | 首次在单细胞水平上揭示了ZEN暴露对原始卵泡形成过程中细胞发育轨迹和细胞间通信网络的扰动，特别是Hippo信号通路的影响 | NA | 研究ZEN暴露对小鼠原始卵泡组装的影响及其分子机制 | 小鼠的原始卵泡组装 | 数字病理学 | 生殖健康 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 从16.5天交配后（dpc）到出生后第3天（PD3）的小鼠卵巢组织 |
| 2177 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing Reveals the Transcriptome and TCR Characteristics of pTregs and in vitro Expanded iTregs
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.619932
PMID:33868236
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了pTregs和体外扩增的iTregs的转录组和TCR特征 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了pTregs和iTregs的转录组和TCR特征，并揭示了它们在功能和表型上的差异 | 研究主要集中在体外扩增的Tregs，未来需要进一步验证这些发现在体内的有效性和安全性 | 探索调节性T细胞（Tregs）的转录组和TCR特征，以及它们在免疫耐受和肿瘤逃避中的作用 | 调节性T细胞（Tregs），包括pTregs和iTregs | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 从结直肠癌患者中扩增的CD4+CD25+CD127细胞 |
| 2178 | 2024-08-09 |
Cells of the Immune System in Cardiac Remodeling: Main Players in Resolution of Inflammation and Repair After Myocardial Infarction
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.664457
PMID:33868315
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综述 | 本文综述了免疫系统细胞在心肌梗死后心脏修复和炎症消退过程中的作用 | 介绍了基于单细胞RNA测序的新型细胞表型分类方法，有助于更好地理解参与炎症消退的细胞表型 | 文章提出了一些未解决的问题，需要进一步研究以将免疫细胞在心肌梗死后组织修复中的作用知识应用于实践 | 总结不同免疫系统细胞在心肌梗死后心脏修复过程中的作用，并讨论免疫介导疗法在急性心肌梗死患者中的可能前景 | 免疫系统细胞在心肌梗死后心脏修复和炎症消退中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 2179 | 2024-08-09 |
Leveraging Single-Cell Sequencing for Chimeric Antigen Receptor T Cell Therapies
2021-12, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2021.03.005
PMID:33832782
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研究论文 | 本文探讨了如何利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术来分析嵌合抗原受体（CAR）-T细胞疗法的基因表达特征，以优化CAR设计、生产条件、治疗组合及疾病结果 | 本文首次详细描述了单细胞RNA测序在CAR-T细胞疗法中的应用，为该疗法的发展和临床监测提供了新的工具 | NA | 提高CAR-T细胞疗法对癌症的治疗效果 | CAR-T细胞的基因表达特征及其在治疗中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2180 | 2024-08-09 |
Mutations in BRCA1 and BRCA2 differentially affect the tumor microenvironment and response to checkpoint blockade immunotherapy
2021-12, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-020-00139-8
PMID:33834176
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研究论文 | 本文研究了BRCA1和BRCA2基因突变对肿瘤微环境和免疫检查点阻断疗法反应的差异性影响 | 首次报道了BRCA1和BRCA2基因突变在鼠和人类肿瘤中对免疫检查点阻断疗法反应的差异性影响，并发现BRCA2截断突变相较于BRCA1突变更能增强对免疫疗法的反应 | NA | 探究BRCA1和BRCA2基因突变对免疫检查点阻断疗法反应的影响及其机制 | BRCA1和BRCA2基因突变对肿瘤微环境和免疫疗法反应的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |