单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 2141 - 2160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2141 | 2024-08-09 |
LGR6 marks nephron progenitor cells
2021-11, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.346
PMID:33848015
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研究论文 | 本文识别了LGR6作为肾元前体细胞（NPCs）的标记物，并探讨了其在胚胎肾发生中的多重命运及其潜在的再生能力 | 首次鉴定LGR6为正在进行间充质向上皮转变（MET）的NPCs的标记物 | NA | 研究LGR6在肾元前体细胞分化和胚胎肾发生中的作用 | 肾元前体细胞（NPCs）及其在胚胎和出生后肾发生中的作用 | NA | NA | 共聚焦成像、单细胞RNA测序 | NA | 图像、RNA序列 | 胚胎移植体 |
| 2142 | 2024-08-09 |
Identification of a novel subset of alveolar type 2 cells enriched in PD-L1 and expanded following pneumonectomy
2021-10, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.04168-2020
PMID:33863742
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术、定量PCR、ATAC-seq、基因阵列、肺切除术和精确切割肺切片培养等方法，鉴定了在小鼠中存在一种新的肺泡II型细胞亚群，该亚群在肺切除术后扩增并表达PD-L1。 | 本研究首次鉴定了在小鼠中存在一种新的肺泡II型细胞亚群，该亚群在肺切除术后扩增并表达PD-L1，并提供了人类中存在此类细胞的证据。 | NA | 鉴定新的肺泡II型细胞亚群并研究其在肺再生中的作用。 | 小鼠和人类的肺泡II型细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、ATAC-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠和人类肺组织样本 |
| 2143 | 2024-08-09 |
Elucidating transcriptomic profiles from single-cell RNA sequencing data using nature-inspired compressed sensing
2021-09-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab125
PMID:33855366
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研究论文 | 本文介绍并比较了四种基于自然启发优化算法的压缩感知框架，以提高单细胞RNA测序数据中转录组剖面的质量 | 提出了四种新的压缩感知框架（CSCS, ABCCS, BACS 和 FACS），并通过实验证明了FACS方法在多个数据集上的优越性能 | 未明确提及 | 改进单细胞RNA测序数据处理中的压缩感知技术 | 单细胞RNA测序数据中的转录组剖面 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 压缩感知 | 基因表达数据 | 九个不同的数据集 |
| 2144 | 2024-08-09 |
Deep learning of gene relationships from single cell time-course expression data
2021-09-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab142
PMID:33876191
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研究论文 | 本文利用单细胞时间序列表达数据，开发了一种新的深度学习方法来推断基因间的调控和信号关系 | 提出了一种新的单细胞RNA测序（scRNA-Seq）表达数据编码方法，并在此基础上开发了用于时间序列数据交互预测的深度学习模型 | NA | 开发新的计算方法来分析单细胞时间序列基因表达数据，以推断基因间的相互作用 | 单细胞时间序列基因表达数据 | 机器学习 | NA | scRNA-Seq | 卷积神经网络（CNN）和循环神经网络（RNN） | 时间序列数据 | 五种不同的单细胞时间序列scRNA-Seq数据集 |
| 2145 | 2024-08-09 |
Determinants of Response and Intrinsic Resistance to PD-1 Blockade in Microsatellite Instability-High Gastric Cancer
2021-09, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-21-0219
PMID:33846173
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研究论文 | 本研究探讨了微卫星不稳定性高（MSI-H）胃癌对PD-1抑制剂反应的决定因素和内在抵抗机制 | 通过结合全外显子测序和单细胞RNA测序，识别了肿瘤动态进化和T细胞受体多样性与治疗反应的关系 | 研究仅限于MSI-H胃癌患者，且为单臂II期试验，需要进一步验证和扩展 | 揭示MSI-H胃癌对PD-1抑制剂的反应异质性，并探索提高反应性的策略 | MSI-H胃癌患者及其肿瘤和血液样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 全外显子测序（WES），单细胞RNA测序 | NA | 组织样本，血液样本 | 包括多个MSI-H胃癌患者的组织和血液样本 |
| 2146 | 2024-08-09 |
Downregulation of TGR5 (GPBAR1) in biliary epithelial cells contributes to the pathogenesis of sclerosing cholangitis
2021-09, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2021.03.029
PMID:33872692
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研究论文 | 本文研究了胆管上皮细胞中TGR5（GPBAR1）表达下调对硬化性胆管炎发病机制的影响 | 发现TGR5在胆管上皮细胞中的表达减少促进了反应性胆管上皮细胞表型的形成，加重了胆管损伤，并揭示了norUDCA恢复胆管TGR5表达水平的新机制 | NA | 探讨TGR5表达变化在原发性硬化性胆管炎发病机制中的作用 | 胆管上皮细胞中的TGR5表达及其在原发性硬化性胆管炎中的作用 | NA | 硬化性胆管炎 | 单细胞转录组学（scRNA-seq） | NA | mRNA和蛋白质水平 | 使用了来自不同小鼠模型的胆管上皮细胞和肝脏组织样本 |
| 2147 | 2024-08-09 |
A comprehensive transcriptome signature of murine hematopoietic stem cell aging
2021-08-12, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020009729
PMID:33876187
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研究论文 | 本研究通过分析16个已发表和未发表的数据集，探讨了衰老小鼠造血干细胞（HSC）中是否存在一致的转录失调模式 | 发现了核心且稳健的HSC衰老标志，并揭示了失调的衰老基因主要由膜相关转录本组成，包括许多先前未与HSC生物学相关联的细胞表面分子 | 研究中存在显著的个体研究间异质性 | 确定衰老小鼠造血干细胞中是否存在一致的转录失调模式 | 衰老小鼠的造血干细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 16个数据集 |
| 2148 | 2024-08-09 |
Spatial tissue profiling by imaging-free molecular tomography
2021-08, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-00879-7
PMID:33875865
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研究论文 | 本文介绍了一种无需成像的分子断层扫描框架，通过将样本切成薄条并进行后续图像重建，实现组织内高通量读数的空间定位 | 提出了一种无需成像的空间转录组学技术（STRP-seq），并成功应用于小鼠大脑和澳大利亚鬃狮蜥大脑的空间转录组分析 | NA | 开发一种新的空间解析组学分析技术，无需特定检测策略或专业仪器 | 小鼠大脑和澳大利亚鬃狮蜥大脑的空间转录组 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠大脑和澳大利亚鬃狮蜥大脑样本 |
| 2149 | 2024-08-09 |
Tenascin-C-mediated suppression of extracellular matrix adhesion force promotes entheseal new bone formation through activation of Hippo signalling in ankylosing spondylitis
2021-07, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-220002
PMID:33858850
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研究论文 | 本研究旨在探讨tenascin-C（TNC）在附着点新骨形成中的作用及其分子机制 | 首次揭示了TNC通过抑制细胞外基质（ECM）的粘附力并激活Hippo信号通路，促进附着点新骨形成 | NA | 识别tenascin-C在附着点新骨形成中的作用及其分子机制 | 来自强直性脊柱炎患者的韧带组织样本及动物模型 | NA | 强直性脊柱炎 | 免疫组织化学染色、单细胞RNA测序、原子力显微镜 | NA | 组织样本、RNA序列 | 来自强直性脊柱炎患者的韧带组织样本及DBA/1模型动物 |
| 2150 | 2024-08-09 |
Novel antigens of CAR T cell therapy: New roads; old destination
2021-Jul, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2021.101079
PMID:33862524
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综述 | 本文综述了针对新型肿瘤抗原的CAR-T细胞疗法的最新进展及其在临床上的抗肿瘤成就 | 利用生物信息学和细胞生物学的新技术，如单细胞RNA测序，发现新的肿瘤抗原，为CAR-T疗法在实体瘤治疗中提供新的靶点 | CAR-T疗法在实体瘤治疗中仍面临肿瘤抗原不明确、免疫抑制性肿瘤微环境和CAR-T细胞浸润不良等挑战 | 探讨和总结针对新型肿瘤抗原的CAR-T疗法的开发及其临床应用 | CAR-T细胞疗法及其在治疗复发/难治性B细胞急性淋巴细胞白血病、弥漫大B细胞淋巴瘤、多发性骨髓瘤和套细胞淋巴瘤中的应用 | 免疫治疗 | 血液肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 2151 | 2024-08-09 |
A single cell atlas of human cornea that defines its development, limbal progenitor cells and their interactions with the immune cells
2021-07, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2021.03.010
PMID:33865984
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研究论文 | 本文通过单细胞分析技术，构建了人类角膜从胚胎到成年的全面单细胞图谱，并揭示了角膜发育、边缘祖细胞及其与免疫细胞的相互作用。 | 首次通过单细胞RNA测序和ATAC测序技术，详细描绘了人类角膜及其相邻结膜细胞类型的发育过程，并发现了一种新的边缘祖细胞表面标记物GPHA2。 | NA | 旨在通过单细胞分析技术，深入理解角膜发育过程及其与免疫细胞的相互作用，为眼表疾病的诊断和治疗提供新的见解。 | 人类角膜及其相邻结膜的细胞类型，特别是边缘祖细胞和免疫细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和ATAC测序 | UMAP和Seurat图谱聚类 | 细胞 | 21,343个细胞来自四个成年人类角膜和相邻结膜，89,897个细胞来自胚胎和胎儿角膜 |
| 2152 | 2024-08-09 |
Activation of Sympathetic Signaling in Macrophages Blocks Systemic Inflammation and Protects against Renal Ischemia-Reperfusion Injury
2021-Jul, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020121723
PMID:33875568
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研究论文 | 本研究探讨了交感神经系统信号在巨噬细胞中的激活对LPS诱导的脓毒症和肾脏缺血再灌注损伤的影响 | 发现β2-肾上腺素能受体信号在巨噬细胞中的激活通过诱导Tim3表达，引起抗炎表型改变，从而保护肾脏免受缺血再灌注损伤 | NA | 研究交感神经系统信号在巨噬细胞中的作用及其对炎症性疾病的影响 | 巨噬细胞中的交感神经系统信号、LPS诱导的脓毒症、肾脏缺血再灌注损伤 | NA | 肾脏疾病 | RNA测序 | NA | RNA | 使用小鼠巨噬细胞系进行实验 |
| 2153 | 2024-08-09 |
Spatial transcriptomics of the nematode Caenorhabditis elegans using RNA tomography
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100411
PMID:33870220
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研究论文 | 本文介绍了使用RNA断层扫描技术对线虫秀丽隐杆线虫进行空间转录组学分析的方法 | 结合mRNA测序和冷冻切片技术，实现了基因表达的空间解析 | NA | 开发适用于线虫的近细胞分辨率的前后基因表达图谱 | 线虫秀丽隐杆线虫的基因表达 | 数字病理学 | NA | RNA断层扫描（tomo-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2154 | 2024-08-09 |
Gene expression profiling of α-gustducin-expressing taste cells in mouse fungiform and circumvallate papillae
2021-06-11, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2021.04.022
PMID:33872990
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序结合荧光激活细胞分选技术，分析了在小鼠菌状乳头和轮廓乳头中表达α-gustducin的味觉细胞的基因表达谱 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了α-gustducin表达细胞在菌状乳头和轮廓乳头中的基因表达差异，特别是鉴定了galectin-3作为差异表达基因 | NA | 旨在理解类型II细胞的遗传异质性，并揭示菌状乳头和轮廓乳头味觉细胞的差异特征 | 小鼠菌状乳头和轮廓乳头中表达α-gustducin的味觉细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 2155 | 2024-08-09 |
Human KIT+ myeloid cells facilitate visceral metastasis by melanoma
2021-06-07, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20182163
PMID:33857287
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研究论文 | 本文研究了人类KIT+髓系细胞在黑色素瘤内脏转移中的作用 | 发现人类CD33+CD11b+CD117+髓系细胞是黑色素瘤内脏转移的关键因素，为新的生物标志物和治疗靶点 | NA | 探讨黑色素瘤内脏转移的机制并寻找潜在的治疗靶点 | 人类KIT+髓系细胞在黑色素瘤内脏转移中的作用 | NA | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及患者和hNSG-SGM3小鼠的样本 |
| 2156 | 2024-08-09 |
Rescue of maternal immune activation-induced behavioral abnormalities in adult mouse offspring by pathogen-activated maternal Treg cells
2021-06, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-021-00837-1
PMID:33859437
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研究论文 | 本研究探讨了母体免疫激活对成年小鼠后代行为异常的影响，并发现母体Treg细胞的转移可以有效逆转这些异常 | 首次使用Toxoplasma gondii的可溶性速殖子抗原诱导母体免疫激活，并展示了母体Treg细胞转移在治疗与免疫改变相关的神经精神障碍中的潜在疗效 | NA | 研究母体免疫激活对后代行为和免疫状态的影响，并探索Treg细胞转移的治疗潜力 | 小鼠后代的行为异常和免疫状态 | NA | 神经精神障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 2157 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing links multiregional immune landscapes and tissue-resident T cells in ccRCC to tumor topology and therapy efficacy
2021-05-10, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2021.03.007
PMID:33861994
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA和T细胞受体测序，分析了167,283个细胞，来自多个肿瘤区域、淋巴结、正常肾脏和外周血，以绘制透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的免疫景观，并探讨了免疫异质性对临床结果的影响 | 首次通过单细胞测序技术，结合T细胞受体测序，全面描绘了ccRCC的免疫景观，并揭示了组织驻留T细胞和肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）与免疫检查点阻断（ICB）治疗反应的关联 | 研究样本仅来自六名患者，可能不足以代表所有ccRCC患者的免疫特征 | 探讨透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的免疫异质性及其对治疗效果的影响 | ccRCC患者的肿瘤区域、淋巴结、正常肾脏和外周血中的细胞 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA）和T细胞受体（TCR）测序 | NA | 细胞 | 167,283个细胞，来自六名患者 |
| 2158 | 2024-08-09 |
Early stem cell aging in the mature brain
2021-05-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.03.018
PMID:33848469
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研究论文 | 本文研究了成年海马体中神经干细胞（NSC）行为受多种因素干扰的情况，并探讨了NSC老化机制及潜在干预措施。 | 首次揭示了短期NSC（ST-NSC）和长期NSC（LT-NSC）的不同老化模式，并识别了酪氨酸蛋白激酶Abl1作为NSC老化因子。 | NA | 旨在识别影响神经干细胞行为的早期机制，以促进生命后期组织功能的维持。 | 成年海马体中的神经干细胞（NSC）及其老化机制。 | NA | NA | 克隆追踪、单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2159 | 2024-08-09 |
Irx3 and Irx5 in Ins2-Cre+ cells regulate hypothalamic postnatal neurogenesis and leptin response
2021-05, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-021-00382-y
PMID:33859429
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研究论文 | 研究探讨了Irx3和Irx5基因在Ins2-Cre+细胞中的作用，以及它们如何影响下丘脑的产后神经发生和瘦素反应 | 发现了早期产后下丘脑中表达Irx3和Irx5的高水平放射状胶质样神经干细胞群，并证明了Irx3和Irx5的减少剂量促进产后下丘脑的神经发生 | NA | 探究Irx3和Irx5基因如何通过改变食物摄入量来影响肥胖 | Irx3和Irx5基因在Ins2-Cre+细胞中的作用 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Irx3和Irx5基因突变的双重杂合子小鼠 |
| 2160 | 2024-08-09 |
Applications of single-cell and bulk RNA sequencing in onco-immunology
2021-05, European journal of cancer (Oxford, England : 1990)
DOI:10.1016/j.ejca.2021.03.005
PMID:33866228
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综述 | 本文综述了单细胞和常规（bulk）RNA测序在肿瘤免疫学中的应用，介绍了数据预处理、统计分析方法以及相关的计算挑战 | 提供了基因表达分析的实例，如差异表达分析、降维、聚类和富集分析，并展示了如何使用去卷积算法从bulk或单细胞RNA-seq中识别和量化多种免疫亚群 | 讨论了单细胞和bulk RNA-seq在临床应用中的优缺点 | 探讨RNA测序技术在肿瘤免疫学中的应用潜力，特别是在免疫治疗反应中的分子机制识别 | 单细胞和bulk RNA-seq技术在肿瘤免疫学中的应用 | NA | NA | RNA测序（RNA-seq） | 机器学习和深度学习模型 | RNA-seq数据 | 使用公开数据集进行示例分析 |