单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-08-11 |
Applications of Single-Cell Sequencing in Dermatology
2021-May-20, Medical science monitor : international medical journal of experimental and clinical research
IF:2.2Q3
DOI:10.12659/MSM.931862
PMID:34011922
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在皮肤病学领域的应用进展 | 单细胞测序技术能够在单细胞水平上评估基因组学、转录组学、表观遗传学等多组学信息，揭示疾病的病理机制和药物抵抗性，并能识别新的细胞类型和分化轨迹 | NA | 总结单细胞测序技术在皮肤病学中的应用 | 单细胞测序技术在皮肤病学中的应用 | NA | 皮肤病 | 单细胞测序 | NA | 基因组学、转录组学、表观遗传学等多组学数据 | NA |
| 182 | 2024-08-11 |
Identification of EMT signaling cross-talk and gene regulatory networks by single-cell RNA sequencing
2021-05-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2102050118
PMID:33941680
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了MCF10A细胞在TGF-β1刺激下经历上皮间质转化（EMT）的过程 | 揭示了EMT过程中信号通路的顺序和平行激活，以及过渡细胞状态的存在，并确定了驱动EMT的关键调控信号节点和微小RNA及转录因子的表达 | NA | 探究上皮间质转化（EMT）过程中的信号交叉对话和基因调控网络 | MCF10A细胞在TGF-β1刺激下的EMT过程 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | MCF10A细胞 |
| 183 | 2024-08-11 |
Concurrent X chromosome inactivation and upregulation during non-human primate preimplantation development revealed by single-cell RNA-sequencing
2021-05-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-89175-7
PMID:33953270
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了非人类灵长类动物（绒猴）胚胎植入前发育阶段的X染色体失活和上调现象 | 首次在绒猴胚胎中观察到XIST的上调以及X染色体单等位基因表达的增加，表明X染色体失活的存在 | 研究仅限于绒猴胚胎，未涉及其他非人类灵长类动物或人类胚胎 | 阐明非人类灵长类动物X染色体剂量补偿机制 | 绒猴胚胎植入前发育阶段的X染色体 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 多个绒猴胚胎 |
| 184 | 2024-08-11 |
Single-cell multi-omics analysis of the immune response in COVID-19
2021-05, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01329-2
PMID:33879890
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析，探讨了COVID-19患者免疫反应的特征 | 首次对COVID-19患者进行了大规模的单细胞转录组、表面蛋白组及T和B淋巴细胞抗原受体分析，揭示了免疫细胞在疾病中的具体变化 | 研究仅基于横断面队列，未涉及纵向数据分析 | 探究COVID-19患者免疫系统的响应机制及其对疾病发展的影响 | COVID-19患者的免疫细胞及其在疾病中的变化 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组、表面蛋白组分析 | NA | 细胞数据 | 130名不同严重程度的COVID-19患者，共780,000个外周血单个核细胞 |
| 185 | 2024-08-11 |
Single-cell transcriptome analysis of the heterogeneous effects of differential expression of tumor PD-L1 on responding TCR-T cells
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.55075
PMID:33754038
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研究论文 | 研究分析了肿瘤PD-L1表达差异对TCR-T细胞功能的影响 | 首次深入评估了肿瘤PD-L1表达差异如何影响T细胞功能，并揭示了PD-L1表达增加对不同抑制检查点分子的不同影响 | 研究中肿瘤细胞和T细胞死亡信号富集与肿瘤PD-L1表达增加之间的相关性有限 | 探究肿瘤PD-L1表达差异对TCR-T细胞功能的影响 | TCR-T细胞在不同PD-L1表达水平的肿瘤环境中的反应 | 数字病理学 | 恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 使用MART-1特异性TCR-T细胞与表达不同比例PD-L1的MEL-526肿瘤细胞进行实验 |
| 186 | 2024-08-11 |
A Cancer Cell Cluster Marked by LincRNA MEG3 Leads Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Metastasis
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.656564
PMID:34055623
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了胰腺导管腺癌（PDAC）原发和转移组织的基因表达差异，发现了一个由长链非编码RNA MEG3标记的癌症细胞亚群，该亚群与PDAC的转移密切相关 | 首次揭示了由LincRNA MEG3标记的PDAC癌症细胞亚群在肿瘤转移中的关键作用 | NA | 探索驱动胰腺导管腺癌细胞转移的基因程序和核心调控因子 | 胰腺导管腺癌的原发和转移组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 187 | 2024-08-10 |
A Comprehensive Survey of Statistical Approaches for Differential Expression Analysis in Single-Cell RNA Sequencing Studies
2021-12-02, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12121947
PMID:34946896
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序研究中差异表达分析的统计方法，并对19种常用方法在11个真实数据集上的表现进行了评估 | 本文首次全面评估了从批量RNA测序实践中改编的方法以及专门为单细胞RNA测序设计的方法，并提供了选择适当工具的指导 | 难以通过单一性能标准确定全局最佳表现的方法 | 为单细胞RNA测序中的差异表达分析选择合适的工具提供指导 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达分析方法 | RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 11个真实单细胞RNA测序数据集 |
| 188 | 2024-08-10 |
Transfer learning between preclinical models and human tumors identifies a conserved NK cell activation signature in anti-CTLA-4 responsive tumors
2021-08-11, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-021-00944-5
PMID:34376232
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研究论文 | 本文通过计算转移学习方法projectR，在鼠和人的抗CTLA-4反应性肿瘤中识别出保守的NK细胞激活特征，并探讨了其在转移性黑色素瘤中的临床相关性 | 本文首次应用转移学习方法在临床前模型和人类肿瘤之间识别出保守的NK细胞激活特征，为癌症治疗提供了新的理解 | 目前的方法在临床前模型中识别的治疗机制未能完全转化为人类疾病，限制了转化研究的进展 | 通过转移学习方法识别肿瘤微环境中免疫细胞的保守转录变化，以提高免疫检查点抑制剂的疗效 | 研究对象包括鼠和人的抗CTLA-4反应性肿瘤，以及转移性黑色素瘤中的NK细胞激活特征 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 转移学习 | 单细胞RNA测序数据 | 涉及鼠和人的肿瘤样本，具体数量未在摘要中提及 |
| 189 | 2024-08-10 |
Transcriptional profiling of mouse peripheral nerves to the single-cell level to build a sciatic nerve ATlas (SNAT)
2021-04-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.58591
PMID:33890853
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研究论文 | 本文通过单细胞水平的转录组分析，构建了小鼠坐骨神经的转录组图谱（SNAT） | 首次结合了发育中的坐骨神经的批量RNA测序和Schwann细胞的批量及单细胞RNA测序，以及全坐骨神经的单细胞转录组分析 | NA | 促进对外周神经基本理解的研究 | 小鼠坐骨神经中的各种细胞类型 | NA | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括发育中的坐骨神经和成年坐骨神经的多个样本 |
| 190 | 2024-08-10 |
A single-cell genomics pipeline for environmental microbial eukaryotes
2021-Apr-23, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102290
PMID:33870123
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研究论文 | 本文描述了一种针对环境中低丰度未培养真核微生物的单细胞基因组学流程 | 该流程整合了先进的单细胞基因组学工具和优化协议，旨在提高低成本下基因组质量 | NA | 开发和评估一种针对环境中低丰度未培养真核微生物的单细胞基因组学流程 | 环境中低丰度未培养的真核微生物 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 环境样本和早期分化线菌及Chromista/SAR培养物 |
| 191 | 2024-08-10 |
Applications of brain organoids in neurodevelopment and neurological diseases
2021-Apr-22, Journal of biomedical science
IF:9.0Q1
DOI:10.1186/s12929-021-00728-4
PMID:33888112
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综述 | 本文综述了脑类器官在神经发育和神经系统疾病中的应用现状 | 介绍了脑类器官与免疫染色和单细胞测序技术的结合，以及其在模拟早期脑发育和建模人类脑部疾病中的应用 | 讨论了该技术的挑战和未来展望 | 介绍脑类器官分化策略的现状，总结其在医学领域的进展和应用 | 脑类器官及其在神经发育和神经系统疾病中的应用 | NA | 神经系统疾病 | 免疫染色技术，单细胞测序技术 | NA | 组织 | NA |
| 192 | 2024-08-10 |
The long noncoding RNA lnc-HLX-2-7 is oncogenic in Group 3 medulloblastomas
2021-04-12, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaa235
PMID:33844835
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研究论文 | 本文报道了一种新的长链非编码RNA lnc-HLX-2-7，作为第三组髓母细胞瘤的潜在分子标记和治疗靶点 | 首次发现lnc-HLX-2-7在第三组髓母细胞瘤中高度上调，并证实其作为治疗靶点的潜力 | NA | 研究lnc-HLX-2-7在髓母细胞瘤中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | lnc-HLX-2-7在第三组髓母细胞瘤中的表达和功能 | 数字病理学 | 儿童肿瘤 | RNA测序（RNA-seq） | CRISPR/Cas9 | RNA | 175名髓母细胞瘤患者 |
| 193 | 2024-08-10 |
Colorectal Cancer Stem Cell States Uncovered by Simultaneous Single-Cell Analysis of Transcriptome and Telomeres
2021-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202004320
PMID:33898197
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研究论文 | 本文通过同时分析单细胞转录组和端粒长度，揭示了结直肠癌干细胞的状态 | 首次实现同时测量单细胞中的端粒长度和转录组，系统评估了结直肠癌干细胞 | NA | 揭示结直肠癌干细胞的特征及其与肿瘤进展和药物抵抗的关系 | 结直肠癌干细胞及其在肿瘤中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | SMART-seq2, 10 × Genomics | NA | 转录组数据 | NA |
| 194 | 2024-08-10 |
A fish with no sex: gonadal and adrenal functions partition between zebrafish NR5A1 co-orthologs
2021-02-09, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyaa030
PMID:33724412
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研究论文 | 本研究通过敲除斑马鱼中的nr5a1a和nr5a1b基因，探讨NR5A1同源基因在性腺和肾上腺功能中的祖先角色。 | 首次揭示了斑马鱼中nr5a1a和nr5a1b基因在性腺和肾上腺功能中的分工，以及这种分工对性发育差异的影响。 | 研究主要集中在斑马鱼模型上，可能需要进一步在其他物种中验证这些发现。 | 探索NR5A1同源基因在性腺和肾上腺功能中的祖先角色及其对性发育的影响。 | 斑马鱼的nr5a1a和nr5a1b基因及其在性腺和肾上腺中的功能。 | 遗传学 | NA | 单细胞RNA测序，RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括1天和2天龄的斑马鱼胚胎以及成年斑马鱼。 |
| 195 | 2024-08-09 |
Research Techniques Made Simple: Use of Imaging Mass Cytometry for Dermatological Research and Clinical Applications
2021-04, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2020.12.008
PMID:33752807
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研究论文 | 本文介绍了成像质谱流式细胞术（IMC）在皮肤病学研究和临床应用中的潜力 | IMC技术能够同时分析多达40种蛋白质标记物，生成高维图像，保留组织结构和细胞间空间关系 | NA | 强调IMC在皮肤病学研究和临床应用中的潜在用途 | 皮肤病学领域的组织和细胞 | 数字病理学 | NA | 成像质谱流式细胞术（IMC） | NA | 图像 | NA |
| 196 | 2024-08-09 |
Leukocyte dynamics after intracerebral hemorrhage in a living patient reveal rapid adaptations to tissue milieu
2021-03-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.145857
PMID:33749664
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，对一名参与微创手术联合溶栓治疗脑内出血试验的患者进行了血液和脑血肿流出物的纵向分析，揭示了脑内出血后白细胞的动态适应性变化 | 首次在单细胞分辨率下描述了活体患者脑内出血期间的局部细胞反应 | 仅基于单一病例的研究，可能缺乏普遍性 | 探索脑内出血后脑部免疫反应的动态变化 | 脑内出血患者的血液和脑血肿流出物 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 单一病例 |
| 197 | 2024-08-09 |
Single-cell immunophenotyping of the fetal immune response to maternal SARS-CoV-2 infection in late gestation
2021-Mar-16, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-311000/v1
PMID:33758834
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研究论文 | 研究旨在描述母体SARS-CoV-2感染对胎儿免疫反应的影响 | 首次通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序分析了母体SARS-CoV-2感染对胎儿免疫系统的调节作用 | 研究仅限于第三孕期的新生儿，且未观察到垂直传播 | 探究母体SARS-CoV-2感染对胎儿及儿童健康的潜在影响 | 母体SARS-CoV-2感染的第三孕期新生儿及其脐带血单个核细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序 | NA | RNA | 母体感染SARS-CoV-2的新生儿脐带血单个核细胞 |
| 198 | 2024-08-09 |
Microglia Diversity in Healthy and Diseased Brain: Insights from Single-Cell Omics
2021-Mar-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22063027
PMID:33809675
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研究论文 | 本文通过单细胞组学技术研究了健康和疾病状态下大脑中微胶质细胞的多样性 | 利用单细胞RNA测序和质谱流式细胞术等技术，揭示了微胶质细胞在生理和病理条件下的未被发现的异质性 | NA | 总结单细胞组学研究在微胶质细胞功能多样性方面的发现，并探讨其在未来免疫调节治疗设计中的重要性 | 大脑中的微胶质细胞及其在健康和疾病状态下的多样性 | NA | 神经退行性疾病，中风，抑郁症，脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），质谱流式细胞术（CyTOF） | NA | 单细胞数据 | 数千个单个细胞 |
| 199 | 2024-08-09 |
Efficient IL-2R signaling differentially affects the stability, function, and composition of the regulatory T-cell pool
2021-02, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-020-00599-z
PMID:33408345
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研究论文 | 研究通过分析一种自发突变小鼠品系，探讨了IL-2R信号在调节Treg细胞稳定性、功能及其组成中的作用 | 首次揭示了IL-2R信号的部分丧失如何影响Treg细胞池的维持、异质性和抑制功能 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨IL-2R信号在不同条件下对Treg细胞稳态、谱系稳定性和功能的影响 | Treg细胞及其在非炎症和炎症环境下的功能 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及Cd25小鼠的Treg细胞 |
| 200 | 2024-08-09 |
Cell type prioritization in single-cell data
2021-01, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0605-1
PMID:32690972
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Augur的方法，用于在单细胞数据中优先考虑对生物扰动最敏感的细胞类型 | Augur采用机器学习框架量化高维空间中扰动和未扰动细胞的可分离性，并在单细胞RNA测序、染色质可及性和成像转录组学数据集上验证了其方法，显示出优于基于差异基因表达的现有方法 | NA | 开发和验证一种新的方法来优先考虑单细胞数据中对生物扰动最敏感的细胞类型 | 单细胞RNA测序、染色质可及性和成像转录组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习框架 | 单细胞数据 | 涉及小鼠脊髓神经刺激后的神经回路样本 |