单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-08-07 |
Runx2-Twist1 interaction coordinates cranial neural crest guidance of soft palate myogenesis
2021-01-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.62387
PMID:33482080
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研究论文 | 本研究使用小鼠软腭作为模型，通过单细胞RNA测序分析探讨了颅神经嵴衍生物在颅面肌肉发育中的异质性和谱系承诺 | 揭示了Runx2和Twist1在调控颅神经嵴衍生物命运中的新作用，以及它们通过细胞间相互作用指导颅面肌肉发育的机制 | NA | 研究颅神经嵴细胞在颅面肌肉发育中的作用及其调控机制 | 颅神经嵴细胞及其在颅面肌肉发育中的衍生物 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠软腭样本 |
| 182 | 2024-08-07 |
A High-Dimensional Window into the Micro-Environment of Triple Negative Breast Cancer
2021-Jan-16, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13020316
PMID:33467084
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综述 | 本文综述了三阴性乳腺癌（TNBC）微环境中淋巴细胞、髓系细胞和基质细胞的细胞表型和空间模式，并探讨了将这些特征映射到肿瘤细胞基因型的潜在价值 | 利用多种高维度技术（如单细胞RNA测序、空间转录组学、T细胞受体分析、高级流式细胞术、成像质谱细胞术及其整合）来定义细胞表型 | NA | 深入理解三阴性乳腺癌患者的肿瘤微环境组成，以提供有效的个性化免疫治疗 | 三阴性乳腺癌的肿瘤细胞和非肿瘤成分的异质性及其随时间的变化 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、T细胞受体分析、高级流式细胞术、成像质谱细胞术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 183 | 2024-08-07 |
Single-Cell Profiling of Coding and Noncoding Genes in Human Dopamine Neuron Differentiation
2021-01-12, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10010137
PMID:33445654
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术对人类多巴胺神经元分化过程中的编码和非编码基因进行了高吞吐量转录组分析 | 开发了一种生物信息学管道，提供了基于时间和细胞类型特异性的长非编码RNA全景图，有助于揭示多巴胺神经元分化中编码和非编码基因的复杂调控网络 | NA | 评估干细胞培养作为人类多巴胺神经发生体外模型系统的实用性，并揭示人类多巴胺神经元的发育、成熟和功能的分子步骤 | 人类多能干细胞衍生的多巴胺神经元及其分化过程中的编码和非编码基因 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约20,000个腹侧中脑模式化的干细胞 |
| 184 | 2024-08-07 |
Systematic comparison of high-throughput single-cell RNA-seq methods for immune cell profiling
2021-Jan-20, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07358-4
PMID:33472597
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研究论文 | 本文系统比较了七种高通量单细胞RNA测序方法在免疫细胞分析中的应用 | 展示了10x Genomics 5' v1和3' v3方法在mRNA检测灵敏度上的优势，减少了dropout事件，有助于识别差异表达基因和提高单细胞与免疫bulk RNA-seq特征的一致性 | 单细胞方法在恢复完整转录组方面存在固有限制，由于细胞和转录dropout事件的普遍性，以及样本可用性和异质性先验知识的限制，可能导致数据解释的混淆 | 评估不同高通量单细胞RNA测序方法在免疫细胞分析中的性能 | 七种高通量单细胞RNA测序方法在模拟免疫细胞类型和细胞大小异质性的混合样本中的表现 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 21个库，包含两个人类和小鼠淋巴细胞细胞系的混合样本 |
| 185 | 2024-08-07 |
STAB: a spatio-temporal cell atlas of the human brain
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa762
PMID:32976581
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研究论文 | 本文介绍了一个名为STAB的时空细胞图谱数据库，该数据库包含人类大脑多个区域和发育时期的单细胞转录组数据 | STAB数据库提供了人类大脑在生命周期中动态细胞组成和分子特征的全面数据，填补了现有研究的空白 | NA | 旨在阐明大脑的细胞和转录组结构，以理解大脑功能和脑部疾病 | 人类大脑的细胞组成和转录组结构 | 数字病理学 | 神经精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包含42种细胞亚型，跨越20个大脑区域和11个发育时期 |
| 186 | 2024-08-07 |
MYC Promotes Bone Marrow Stem Cell Dysfunction in Fanconi Anemia
2021-01-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.09.004
PMID:32997960
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了范可尼贫血患者的造血干细胞和祖细胞，发现MYC的高表达与骨髓衰竭相关，并探讨了MYC抑制剂对FA患者造血干细胞的影响 | 首次揭示了MYC在范可尼贫血骨髓衰竭中的作用，并通过实验验证了MYC抑制剂对FA患者造血干细胞的潜在治疗效果 | 研究主要集中在细胞和动物模型上，尚未进行临床试验验证MYC抑制剂的临床应用效果 | 探讨范可尼贫血患者骨髓衰竭的分子机制及潜在治疗策略 | 范可尼贫血患者的造血干细胞和祖细胞 | NA | 范可尼贫血 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 来自范可尼贫血患者的造血干细胞和祖细胞样本 |
| 187 | 2024-08-07 |
Bi-FoRe: an efficient bidirectional knockin strategy to generate pairwise conditional alleles with fluorescent indicators
2021-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-020-00747-1
PMID:32681448
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Bi-FoRe的高效双向敲入策略，用于生成带有荧光指示器的成对条件性等位基因 | 首次报道了通过单一供体生成具有条件性和基因标记双重功能的成对双功能敲入等位基因 | NA | 开发一种新的策略，用于基因表达标记和基因功能的条件性调控 | zebrafish中的sox10和isl1基因座 | 基因工程 | NA | CRISPR/Cas系统 | NA | 基因组数据 | NA |
| 188 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies macrophage transcriptional heterogeneities in granulomatous diseases
2021-06, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.03794-2020
PMID:33602861
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 189 | 2024-08-05 |
Airspace Macrophages and Monocytes Exist in Transcriptionally Distinct Subsets in Healthy Adults
2021-04-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202005-1989OC
PMID:33079572
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研究论文 | 本文揭示了健康成年人肺泡和小气道中存在的转录性不同的巨噬细胞亚群 | 首次描述了健康状态下肺间隙免疫细胞的保守异质性，并识别了两种新型巨噬细胞亚群 | 样本仅限于十名健康成年人，可能不具备广泛适用性 | 理解健康状态下肺间隙巨噬细胞的转录异质性 | 健康成年人气道灌洗液中获取的人类细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 十名健康成年人 |
| 190 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling and the use of AID deficient mice reveal that B cell activation combined with antibody class switch recombination and somatic hypermutation do not benefit the control of experimental trypanosomosis
2021-11, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1010026
PMID:34762705
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研究论文 | 本文研究了在AID缺失小鼠中B细胞活化与抗体类别转换和体细胞高突变对实验性锥虫病控制的影响 | 首次在锥虫感染小鼠的脾细胞上应用scRNA-seq分析，揭示了自然IgM在抗锥虫感染中的独特作用 | 研究主要集中在鼠模型中，可能无法完全反映人类感染的复杂性 | 探讨锥虫感染中B细胞的作用及其对宿主免疫反应的影响 | 锥虫感染的小鼠脾细胞及其B细胞反应 | 数字病理学 | 锥虫病 | scRNA-seq、流式细胞术、ELISA | NA | 细胞 | 锥虫感染的老鼠脾细胞 |
| 191 | 2024-08-05 |
In silico analysis suggests disruption of interactions between HAMP from hepatocytes and SLC40A1 from macrophages in hepatocellular carcinoma
2021-May-17, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-021-00977-0
PMID:34001107
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研究论文 | 本研究通过分析HCC微环境中的细胞之间的相互作用，探讨肝癌的增殖机制 | 首次揭示了HAMP与SLC40A1之间的相互作用在肝细胞癌异常增殖中的重要性 | 尚需通过湿实验进行进一步验证 | 识别肝细胞癌及其旁癌组织中的增殖性肝细胞，并探讨其异常增殖的潜在作用 | 增殖性肝细胞及其在HCC和旁癌组织中的基因表达特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了来自HCC及其旁癌组织的单细胞样本 |
| 192 | 2024-08-05 |
Taming human brain organoids one cell at a time
2021-03, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2020.05.022
PMID:32718852
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review | 本综述总结了单细胞转录组技术在解析人脑类器官复杂性方面的最新方法、进展和挑战 | 文章创新在于整合了单细胞转录组学和新兴技术，以深入研究人脑发展和疾病特征 | 文章没有讨论具体的应用案例和局限性 | 研究人脑类器官的复杂性及其在发育过程中的基因调控 | 人脑类器官，特别是它们的细胞组成和发育起源 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 193 | 2024-08-05 |
Novel method to repair articular cartilage by direct reprograming of prechondrogenic mesenchymal stem cells
2021-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2021.174416
PMID:34606836
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研究论文 | 本研究提出了一种通过直接重编程前软骨源间充质干细胞来修复关节软骨的新方法 | 本研究创新性地利用外部电场促进前软骨形成，而无需基因修饰或外源性因子 | 本研究未提到对动物模型的长期应用效果 | 旨在提高用于修复软骨缺损的软骨细胞的生成效率 | 使用犬的脂肪来源间充质干细胞（ADSCs）作为研究对象 | 数字病理学 | NA | 电刺激（ES） | NA | 单细胞RNA测序分析 | 犬的ADSC微团 |
| 194 | 2024-08-05 |
Significance and limitations of the use of next-generation sequencing technologies for detecting mutational signatures
2021-Nov, DNA repair
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.dnarep.2021.103200
PMID:34411908
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综述 | 本文探讨了不同的下一代测序技术在检测突变特征中的重要性和限制 | 文章总结了多种下一代测序技术的应用及其固有的测序偏见与技术伪影 | 每种测序技术都有其固有的偏见和可能产生的技术伪影，这可能影响突变特征的可靠提取 | 研究不同下一代测序技术检测突变模式及解读突变特征的相关性和前景 | 聚焦于人类癌症的突变特征及其与环境因素和DNA修复通路的关系 | 数字病理学 | 肿瘤 | 下一代测序技术（NGS） | NA | 基因组数据 | NA |
| 195 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome atlas of the leaf and root of rice seedlings
2021-Oct-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2021.06.001
PMID:34340913
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了水稻幼苗的叶子和根部的转录组特征 | 首次构建了水稻幼苗的单细胞转录组图谱，并揭示了细胞类型特异的转录响应与环境刺激之间的关系 | 目前的研究仅关注于特定的环境胁迫下的转录组特征，可能未涵盖所有可能的应激条件 | 研究水稻幼苗在不同环境刺激下的单细胞转录组特征及其细胞特异性响应 | 水稻幼苗的237,431个个体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 237,431个个体细胞 |
| 196 | 2024-08-05 |
Tissue-specific smooth muscle cell subtypes identified by transcriptional profiling
2021-Oct, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2021.106055
PMID:34411694
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研究论文 | 本文研究了不同组织中特定平滑肌细胞(SMCs)的转录组特征 | 识别了平滑肌细胞的新亚型并揭示其在不同组织内的功能多样性 | 研究基于小鼠数据，可能不完全适用于人类 | 探讨特定平滑肌细胞的转录组特征及其适应性 | 提取了来源于八种小鼠组织的平滑肌细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 八种小鼠组织的平滑肌细胞样本 |
| 197 | 2024-08-05 |
Implication of specific retinal cell-type involvement and gene expression changes in AMD progression using integrative analysis of single-cell and bulk RNA-seq profiling
2021-Aug-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-95122-3
PMID:34341398
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研究论文 | 本研究分析了与年龄相关性黄斑变性（AMD）进展相关的特定视网膜细胞类型及基因表达变化 | 本研究首次结合单细胞RNA测序和大量RNA测序深入探讨了视网膜疾病的分子机制，识别了267个细胞类型特异基因 | 研究对象仅包括两名成人供体的视网膜细胞，样本限制可能影响结果的广泛适用性 | 探讨AMD进展过程中的细胞类型组成和基因表达变化 | 来自两名成人供体的视网膜细胞及十五名成人供体的RNA样本 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序和大规模RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约93,000个细胞和15名成人供体的样本 |
| 198 | 2024-08-05 |
XenoCell: classification of cellular barcodes in single cell experiments from xenograft samples
2021-Jan-29, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-021-00872-8
PMID:33514375
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研究论文 | 本文开发了XenoCell，一个用于单细胞实验的细胞条形码分类工具 | XenoCell是第一个独立的预处理工具，能够快速可靠地分类来自宿主和移植物的细胞条形码 | 在处理混合物种细胞实验时可能仍存在一定的挑战，尤其在高复杂性的样本中 | 研究旨在提高在异种移植样本中准确区分宿主与移植物的细胞序列读取的能力 | 研究对象为来自患者衍生活检的异种移植样本的单细胞序列数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | 在10× Genomics平台的混合物种50:50细胞系实验和公开的PDX数据集中使用 |
| 199 | 2024-08-05 |
The Nereid on the rise: Platynereis as a model system
2021-Sep-27, EvoDevo
IF:4.1Q1
DOI:10.1186/s13227-021-00180-3
PMID:34579780
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研究论文 | 该文章概述了海洋环节动物Platynereis dumerilii作为模型系统的最新研究进展和方法论 | 强调了Nereid幼虫在全身体积电子显微镜和单细胞测序中的独特优势 | 未提及具体的限制因素 | 旨在激发对Platynereis模型的进一步兴趣，并扩展活跃的研究社区 | 研究对象为Nereid Platynereis dumerilii及其相关生物学特征 | 生态毒理学 | NA | 全身体积电子显微镜、单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 200 | 2024-08-05 |
Multifunctional barcoding with ClonMapper enables high-resolution study of clonal dynamics during tumor evolution and treatment
2021-07, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-021-00222-8
PMID:34939038
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研究论文 | 本文开发了一个功能化的谱系追踪系统ClonMapper，可以综合表征异质性人群中的数千个克隆。 | ClonMapper整合了DNA条形码与单细胞RNA测序及克隆分离，实现了高分辨率的克隆动态研究。 | NA | 研究肿瘤进展和治疗反应中的复杂克隆动态。 | 慢性淋巴细胞白血病细胞系及其克隆亚群体。 | 数字病理学 | 淋巴癌 | 单细胞RNA测序、DNA条形码技术 | NA | 细胞、RNA | 数千个克隆 |