单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-12-17 |
Single-Cell Transcriptomic Heterogeneity in Invasive Ductal and Lobular Breast Cancer Cells
2021-01-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-0696
PMID:33148662
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了浸润性导管癌和浸润性小叶癌细胞的转录组异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了浸润性小叶癌与浸润性导管癌在转录组水平上的异质性，并探讨了E-钙粘蛋白缺失对浸润性小叶癌分子特征的影响 | 研究主要基于细胞系，可能无法完全反映患者体内的复杂情况 | 揭示乳腺癌细胞的单细胞转录组异质性，并探讨E-钙粘蛋白缺失对浸润性小叶癌分子特征的影响 | 浸润性导管癌和浸润性小叶癌细胞系，以及通过CRISPR-Cas9技术敲除E-钙粘蛋白的T47D细胞系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个浸润性导管癌和浸润性小叶癌细胞系，以及一个E-钙粘蛋白敲除的T47D细胞系 |
| 2 | 2024-12-12 |
Rare variants in the endocytic pathway are associated with Alzheimer's disease, its related phenotypes, and functional consequences
2021-09, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009772
PMID:34516545
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研究论文 | 本研究探讨了内吞途径中的罕见变异与阿尔茨海默病及其相关表型和功能后果的关联 | 首次系统研究了内吞途径中的罕见变异对阿尔茨海默病的贡献，并通过全基因组测序数据验证了其关联性 | 研究样本主要来自欧洲血统个体，可能限制了结果的普适性 | 探讨内吞途径中的罕见变异对阿尔茨海默病风险和进展的影响 | 内吞途径中的罕见变异及其与阿尔茨海默病、神经纤维缠结和年龄相关表型的关联 | NA | 阿尔茨海默病 | 全基因组测序 (WGS), 批量RNA测序 (RNA-Seq), 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 超过3000名欧洲血统个体, 600多个脑组织样本, 48个死后脑样本 |
| 3 | 2024-12-12 |
Maternal respiratory SARS-CoV-2 infection in pregnancy is associated with a robust inflammatory response at the maternal-fetal interface
2021-05-14, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2021.04.016
PMID:33969332
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研究论文 | 研究了孕妇在妊娠晚期感染SARS-CoV-2后，母胎界面发生的炎症反应 | 首次揭示了妊娠晚期SARS-CoV-2感染在母胎界面引起的免疫激活，即使在没有检测到局部病毒入侵的情况下 | 研究样本量较小，且仅限于妊娠晚期的孕妇 | 探讨孕妇感染SARS-CoV-2后母胎界面的病理生理机制及其对胎儿的潜在影响 | 妊娠晚期感染SARS-CoV-2的孕妇及其胎盘组织 | NA | COVID-19 | 免疫组织化学、单细胞转录组学 | NA | 组织、细胞 | 15例妊娠晚期孕妇的胎盘组织 |
| 4 | 2024-12-11 |
SARS-CoV-2 exacerbates proinflammatory responses in myeloid cells through C-type lectin receptors and Tweety family member 2
2021-06-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.05.006
PMID:34048708
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研究论文 | 研究探讨了SARS-CoV-2通过C型凝集素受体和Tweety家族成员2在髓系细胞中加剧促炎反应的机制 | 首次识别出SARS-CoV-2刺突蛋白的多个C型凝集素受体和TTYH2作为糖依赖性结合伙伴，并发现这些受体在髓系细胞中的表达与COVID-19严重程度相关 | 研究主要集中在髓系细胞的受体上，未涵盖其他免疫细胞类型 | 探讨SARS-CoV-2如何通过特定受体在髓系细胞中引发促炎反应，并寻找潜在的治疗靶点 | SARS-CoV-2刺突蛋白与髓系细胞受体的相互作用及其引发的炎症反应 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自COVID-19患者的肺部细胞 |
| 5 | 2024-12-08 |
Gut-licensed IFNγ+ NK cells drive LAMP1+TRAIL+ anti-inflammatory astrocytes
2021-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-03116-4
PMID:33408417
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研究论文 | 研究通过高通量流式细胞术筛选、单细胞RNA测序和CRISPR-Cas9介导的细胞特异性体内遗传扰动，鉴定出表达LAMP1和TRAIL的星形胶质细胞亚群，并探讨其在中枢神经系统炎症中的作用 | 首次揭示了LAMP1TRAIL星形胶质细胞通过TRAIL-DR5信号诱导T细胞凋亡来限制中枢神经系统炎症，并发现这种星形胶质细胞亚群由肠道微生物群调节的IFNγ NK细胞维持 | 研究主要在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨星形胶质细胞在中枢神经系统炎症中的抗炎作用及其调控机制 | 星形胶质细胞、NK细胞、肠道微生物群 | 神经科学 | NA | 高通量流式细胞术、单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9 | NA | RNA | 小鼠 |
| 6 | 2024-12-06 |
Single-cell RNA sequencing of blood antigen-presenting cells in severe COVID-19 reveals multi-process defects in antiviral immunity
2021-05, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-021-00681-2
PMID:33972731
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了重症COVID-19患者血液抗原呈递细胞的免疫缺陷 | 揭示了重症COVID-19患者抗原呈递细胞中抗病毒免疫防御的多重缺陷机制 | 研究样本量较小，仅包括15名患者和4名健康对照 | 探讨重症COVID-19患者抗原呈递细胞的免疫缺陷机制 | 重症COVID-19患者的血液抗原呈递细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 15名重症COVID-19患者和4名健康对照 |
| 7 | 2024-12-01 |
A clinically applicable integrative molecular classification of meningiomas
2021-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03850-3
PMID:34433969
|
研究论文 | 本文介绍了一种临床适用的脑膜瘤整合分子分类方法 | 通过结合DNA体细胞拷贝数异常、DNA体细胞点突变、DNA甲基化和信使RNA丰度，提出了四种共识分子组，这些分子组比现有分类方案更准确地预测临床结果 | NA | 开发一种能够可靠反映肿瘤行为并指导治疗的脑膜瘤分子分类方法 | 脑膜瘤 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | DNA甲基化测序、RNA测序 | NA | DNA、RNA | NA |
| 8 | 2024-11-30 |
RNA timestamps identify the age of single molecules in RNA sequencing
2021-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0704-z
PMID:33077959
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研究论文 | 本文介绍了一种名为RNA时间戳的方法，用于通过RNA编辑推断RNA测序数据中单个RNA的年龄 | 提出了RNA时间戳方法，通过RNA编辑推断RNA的年龄，并能够推断多个过去的转录事件的时间 | NA | 开发一种新的方法来推断RNA测序数据中单个RNA的年龄，并结合时间信息进行单细胞聚类 | 单细胞RNA测序数据中的单个RNA | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 9 | 2024-11-20 |
A cell-type-specific atlas of the inner ear transcriptional response to acoustic trauma
2021-09-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109758
PMID:34592158
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研究论文 | 研究了噪音诱导听力损失（NIHL）后小鼠内耳细胞类型的转录组变化 | 首次使用RiboTag和单细胞RNA测序技术，系统地分析了噪音创伤前后小鼠内耳细胞类型的分子景观 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨噪音诱导听力损失后内耳细胞类型的转录组响应 | 小鼠内耳的细胞类型及其在噪音创伤前后的转录组变化 | 数字病理学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 噪音创伤前后的多个小鼠内耳样本 |
| 10 | 2024-11-20 |
Differential Expression Levels of Sox9 in Early Neocortical Radial Glial Cells Regulate the Decision between Stem Cell Maintenance and Differentiation
2021-08-18, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2905-20.2021
PMID:34266896
|
研究论文 | 研究早期新皮质放射状胶质细胞中Sox9的不同表达水平如何调节干细胞维持与分化的决策 | 首次揭示了Sox9在早期新皮质放射状胶质细胞中的不同表达水平对干细胞维持与分化决策的影响 | 仅在胚胎小鼠中进行了实验，未涉及其他物种 | 探讨早期新皮质放射状胶质细胞中Sox9的表达差异及其对神经发生行为的影响 | 早期新皮质放射状胶质细胞及其亚群 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 胚胎小鼠 |
| 11 | 2024-11-17 |
Genetic demultiplexing of pooled single-cell RNA-sequencing samples in cancer facilitates effective experimental design
2021-09-22, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giab062
PMID:34553212
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研究论文 | 本文评估了在癌症样本中使用遗传变异进行单细胞RNA测序样本的计算解复用工具的有效性 | 首次在癌症样本中评估了基于遗传变异的计算解复用工具，并提供了开源代码和可重复的工作流程 | 高比例的细胞碎片中的环境RNA降低了工具的性能 | 评估在癌症样本中使用遗传变异进行单细胞RNA测序样本的解复用工具的有效性 | 高级别浆液性卵巢癌和肺腺癌的单细胞RNA测序样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个高级别浆液性卵巢癌和肺腺癌样本的单细胞RNA测序数据 |
| 12 | 2024-11-18 |
C1QL3 promotes cell-cell adhesion by mediating complex formation between ADGRB3/BAI3 and neuronal pentraxins
2021-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202000351RR
PMID:33337553
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研究论文 | 研究探讨了C1QL3蛋白通过介导ADGRB3和神经元五聚素形成细胞间粘附复合物的作用 | 发现了C1QL3介导的新型细胞间粘附复合物，涉及ADGRB3和两种神经元五聚素NPTX1及NPTXR | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和体外实验，缺乏体内功能验证 | 探究C1QL蛋白在神经元突触组织中的作用及其分子机制 | C1QL3蛋白、ADGRB3受体、神经元五聚素NPTX1和NPTXR | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大鼠大脑皮层的单细胞RNA测序数据 |
| 13 | 2024-11-17 |
The rise of single-cell proteomics
2021-Apr, Analytical science advances
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/ansa.202000152
PMID:38716457
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研究论文 | 本文讨论了单细胞蛋白质组学的最新进展及其在生物学研究中的应用 | 本文介绍了单细胞蛋白质组学领域的最新技术进展，包括样品制备流程和质谱仪器的改进，能够从单个细胞中定量超过1000种蛋白质 | 目前单细胞蛋白质组学研究的数据通量和可靠性仍需进一步提高 | 旨在通过生成单个细胞的蛋白质表达谱，补充转录组和基因组数据，以更好地理解细胞功能和身份 | 单细胞蛋白质组学技术及其在生物学研究中的应用 | 蛋白质组学 | NA | 质谱(MS) | NA | 蛋白质表达谱 | 数千个细胞 |
| 14 | 2024-11-14 |
SCDC: bulk gene expression deconvolution by multiple single-cell RNA sequencing references
2021-01-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbz166
PMID:31925417
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研究论文 | 提出了一种名为SCDC的批量基因表达反卷积方法，利用多个单细胞RNA测序参考数据集进行细胞类型特异性基因表达分析 | SCDC采用ENSEMBLE方法整合来自不同实验室和时间的单细胞RNA测序数据，解决了批次效应问题，并在细胞类型分解的准确性上优于现有方法 | NA | 开发一种新的反卷积方法，以提高批量RNA测序数据中细胞类型分解的准确性 | 批量RNA测序数据和多个单细胞RNA测序参考数据集 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（RNA-seq） | ENSEMBLE方法 | 基因表达数据 | 包括人工合成的伪批量样本和实验混合的细胞系，以及人类胰腺胰岛和老鼠乳腺腺体数据集 |
| 15 | 2024-11-11 |
Pan-Cancer Drivers Are Recurrent Transcriptional Regulatory Heterogeneities in Early-Stage Luminal Breast Cancer
2021-04-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-1034
PMID:33531373
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研究论文 | 本文研究了早期腔内乳腺癌中的异质性转录调控，并识别出跨癌症类型的复发性基因异质性 | 本文改进了随机波动分析方法，结合10细胞RNA测序技术，识别出早期腔内乳腺癌中的复发性基因异质性，并发现这些基因与跨癌症类型的驱动基因有关 | 本文方法在敏感性、噪声和样本处理方面存在局限性 | 研究早期腔内乳腺癌中的异质性转录调控，并识别出跨癌症类型的复发性基因异质性 | 早期腔内乳腺癌中的异质性转录调控 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 晚期发病、早期腔内乳腺癌患者 |
| 16 | 2024-11-07 |
NF-κB activation in cardiac fibroblasts results in the recruitment of inflammatory Ly6Chi monocytes in pressure-overloaded hearts
2021-Oct-12, Science signaling
IF:6.7Q1
DOI:10.1126/scisignal.abe4932
PMID:34637330
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研究论文 | 研究揭示了心脏纤维母细胞在压力超负荷下通过NF-κB激活招募炎症性Ly6C单核细胞的机制 | 首次揭示了心脏纤维母细胞在压力超负荷下通过NF-κB激活招募炎症性Ly6C单核细胞的机制 | 研究仅在老鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨心脏纤维母细胞在压力超负荷下招募炎症性Ly6C单核细胞的机制 | 心脏纤维母细胞和Ly6C单核细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序分析 | NA | 基因表达数据 | 老鼠模型 |
| 17 | 2024-11-07 |
Control of the Anterior Pituitary Cell Lineage Regulator POU1F1 by the Stem Cell Determinant Musashi
2021-03-01, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqaa245
PMID:33373440
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研究论文 | 本文研究了脂肪因子瘦素通过调节前垂体细胞系调控因子POU1F1的表达，影响能量稳态的机制 | 首次报道了干细胞标志物Musashi1对POU1F1 mRNA翻译的抑制作用，并揭示了瘦素信号通过逆转Musashi介导的POU1F1 mRNA翻译调控，协调前垂体生长激素细胞功能与代谢状态的机制 | NA | 探讨瘦素信号对前垂体细胞系调控因子POU1F1表达的调控机制 | 前垂体生长激素细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 来自对照雌性小鼠的垂体细胞 |
| 18 | 2024-10-26 |
Combinatorial transcription factor profiles predict mature and functional human islet α and β cells
2021-09-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.151621
PMID:34428183
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了正常人胰岛细胞中转录因子的表达异质性，并基于组合转录因子表达对α和β细胞进行分层 | 首次通过组合转录因子表达预测了高度功能性和成熟的胰岛α和β细胞亚群 | 研究仅限于正常人胰岛细胞，未涉及糖尿病或其他疾病状态 | 定义胰岛细胞中转录因子表达的异质性及其对细胞功能的影响 | 人胰岛α和β细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过40,000个正常人胰岛细胞 |
| 19 | 2024-10-26 |
Targeting In Vivo Metabolic Vulnerabilities of Th2 and Th17 Cells Reduces Airway Inflammation
2021-03-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2001029
PMID:33558372
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研究论文 | 研究探讨了Th2和Th17细胞在哮喘患者中的代谢脆弱性及其对气道炎症的影响 | 首次揭示了葡萄糖和谷氨酰胺代谢在过敏性气道炎症中的作用，并证明了靶向这些代谢途径可以减轻炎症 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体中验证 | 探讨Th2和Th17细胞在哮喘中的代谢依赖性及其对气道炎症的影响 | 哮喘患者的支气管肺泡灌洗液和外周血T细胞 | NA | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质表达数据 | 小鼠模型和哮喘患者样本 |
| 20 | 2024-10-26 |
Age-determined expression of priming protease TMPRSS2 and localization of SARS-CoV-2 in lung epithelium
2021-01-04, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI140766
PMID:33180746
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研究论文 | 研究了SARS-CoV-2在肺上皮细胞中的表达及其与年龄相关的TMPRSS2蛋白酶的表达 | 首次揭示了TMPRSS2在不同年龄段小鼠和人类肺组织中的表达变化，并发现TMPRSS2表达与SARS-CoV-2感染细胞的共定位 | 研究主要基于小鼠和人类肺组织的单细胞RNA测序和免疫荧光分析，缺乏更大规模的临床数据支持 | 探讨SARS-CoV-2在肺上皮细胞中的表达及其与年龄相关的TMPRSS2蛋白酶的表达 | SARS-CoV-2在肺上皮细胞中的表达及TMPRSS2蛋白酶的年龄相关性表达 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和免疫荧光 | NA | RNA | 小鼠和人类肺组织样本 |