单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-14 |
Microbial single-cell RNA sequencing by split-pool barcoding
2021-02-19, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aba5257
PMID:33335020
|
研究论文 | 本文介绍了微SPLiT方法，一种针对革兰氏阴性和阳性细菌的高通量单细胞RNA测序技术，可解析异质性转录状态 | 首次开发适用于细菌的单细胞RNA测序方法微SPLiT，通过分裂池条形码技术克服了现有方法与细菌不兼容的限制 | 未提及具体局限性，但可能包括对细菌细胞壁处理的要求及对稀有转录状态的检测灵敏度限制 | 开发一种高通量细菌单细胞RNA测序方法，用于解析细菌群落中的异质性基因表达 | 超过25,000个不同生长阶段的细菌细胞 | 机器学习 | NA | RNA-seq，单细胞RNA测序，分裂池条形码技术 | NA | 基因表达数据，转录组数据 | 超过25,000个细菌细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 微SPLiT（微生物分裂池连接转录组学）方法 |
| 2 | 2026-07-10 |
Isolation of myeloid cells from mouse brain tumors for single-cell RNA-seq analysis
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100957
PMID:34825218
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研究论文 | 描述了一种从小鼠脑肿瘤中快速分离髓系细胞用于单细胞RNA测序分析的方案 | 无需细胞分选即可快速分离髓系细胞，减少细胞损伤，提高稀有细胞类型的检测分辨率 | 当前scRNA-seq协议受限于可同时测序的细胞数量，限制了稀有细胞类型异质性的解析能力 | 开发一种高效分离小鼠脑肿瘤髓系细胞的方法，用于单细胞RNA测序分析 | 小鼠脑肿瘤中的髓系细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠脑肿瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'试剂盒 |
| 3 | 2026-07-10 |
Optimized protocol for isolation of high-quality single cells from the female mouse reproductive tract tissues for single-cell RNA sequencing
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100970
PMID:34841281
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研究论文 | 描述了一种优化的方案，用于从雌性小鼠生殖道组织中分离高质量的单细胞，以进行单细胞RNA测序 | 针对雌性生殖道不同区域（子宫颈内口和外口）开发了专门的高活力单细胞制备方案，以构建完整的分子细胞图谱 | NA | 为单细胞RNA测序提供优化的细胞分离和制备方案，以研究正常生理和疾病状态下的分子细胞图谱 | 雌性小鼠生殖道组织（包括子宫颈内口和外口） | 单细胞测序, 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-07-10 |
Deletion of pancreas-specific miR-216a reduces beta-cell mass and inhibits pancreatic cancer progression in mice
2021-11-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100434
PMID:34841287
|
研究论文 | 该研究揭示了胰腺特异性miR-216a在调节β细胞质量和胰腺癌进展中的关键作用 | 首次发现miR-216a作为胰腺特异性miRNA，同时调控胰岛和腺泡细胞功能，并揭示其在胰腺癌诊断中的潜在生物标志物价值 | 未说明 | 探究胰腺特异性miR-216a在β细胞质量和胰腺癌进展中的功能 | 胰腺miR-216a基因敲除小鼠和胰腺癌易感小鼠模型 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基因敲除小鼠和胰腺癌模型小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 5 | 2026-07-10 |
Molecular diversity of diencephalic astrocytes reveals adult astrogenesis regulated by Smad4
2021-11-02, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2020107532
PMID:34549820
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研究论文 | 通过单细胞RNA-seq揭示成年小鼠间脑星形胶质细胞的分子多样性，并发现Smad4调控成年星形胶质细胞生成 | 首次在单细胞水平揭示间脑星形胶质细胞的分子异质性，并发现成年间脑存在低水平星形胶质细胞生成，且由Smad4调控 | 未提及 | 探索星形胶质细胞在单细胞水平上的一般功能与区域特异性功能的协调机制 | 成年小鼠间脑星形胶质细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq，ACSA-2介导的磁性活化细胞分选（MACS） | NA | 单细胞基因表达数据 | 成年小鼠间脑星形胶质细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 6 | 2026-07-10 |
Deciphering mouse uterine receptivity for embryo implantation at single-cell resolution
2021-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13128
PMID:34558134
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序解析小鼠子宫接受性胚胎植入的细胞和分子机制 | 首次以单细胞分辨率揭示小鼠子宫接受期与非接受期的细胞类型多样性及基因表达变化，并预测细胞间信号互作 | 未提供具体局限性信息，可能包括单细胞数据验证范围有限、未涉及人类子宫直接比较等 | 在单细胞水平阐明小鼠子宫接受胚胎植入的分子机制 | 小鼠子宫（接受期和非接受期） | 机器学习 | 不孕症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠子宫样本（具体数量未说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 7 | 2026-07-10 |
Single-cell transcriptome analysis reveals defective decidua stromal niche attributes to recurrent spontaneous abortion
2021-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13125
PMID:34546587
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示蜕膜基质微环境缺陷导致复发性流产 | 首次在单细胞水平揭示蜕膜基质细胞的异质性及其在复发性流产中的关键作用，发现TWEAK和FASLG信号通路过度激活与基质细胞死亡及妊娠失败密切相关 | 未明确说明研究限制 | 探究母体蜕膜细胞异质性在复发性流产中的作用机制 | 复发性流产患者和健康对照的蜕膜组织 | 计算机视觉 | 复发性流产 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 66,078个单细胞，来自复发性流产患者和健康对照的蜕膜样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 8 | 2026-07-10 |
Multi-omic evaluation of metabolic alterations in multiple sclerosis identifies shifts in aromatic amino acid metabolism
2021-10-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100424
PMID:34755135
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研究论文 | 通过对多发性硬化症患者和健康对照的代谢组学分析，发现芳香族氨基酸代谢异常与疾病进展和免疫细胞功能改变相关 | 首次在多发性硬化症中系统揭示芳香族氨基酸代谢途径的整体变化，并整合单细胞转录组数据验证代谢异常与免疫细胞基因表达的相关性 | 研究样本来自单一队列，且代谢组学数据与单细胞转录组数据来自不同来源，可能影响数据整合的准确性 | 探究多发性硬化症患者循环代谢组的变化及其与残疾程度的关联，并验证代谢改变对免疫细胞功能的影响 | 多发性硬化症患者和健康对照人群的血液样本及公开的单细胞RNA测序数据中的脑脊液和血液单核细胞群体 | 机器学习和生物信息学 | 多发性硬化症 | 代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | 代谢组学数据、单细胞转录组数据 | 多发性硬化症患者637份样本，健康对照317份样本 | NA | 代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-07-10 |
Hedgehog interacting protein-expressing lung fibroblasts suppress lymphocytic inflammation in mice
2021-09-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.144575
PMID:34375314
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示HHIP基因表达肺成纤维细胞在COPD中抑制淋巴细胞炎症的机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示HHIP基因在肺成纤维细胞亚群中调控CD8+ T细胞炎症反应的具体机制 | 研究基于小鼠模型，其与人类COPD的异同需进一步验证 | 探究HHIP基因在慢性阻塞性肺疾病炎症中的作用机制 | Hhip+/-小鼠和Hhip+/+小鼠的肺组织及肺成纤维细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同年龄小鼠的完整肺组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 10 | 2026-07-07 |
RNA-binding protein ELAVL2 plays post-transcriptional roles in the regulation of spermatogonia proliferation and apoptosis
2021-Sep, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13098
PMID:34296486
|
研究论文 | 识别保守且富集于精原干细胞的RNA结合蛋白ELAVL2，并验证其在精原细胞增殖和凋亡中的转录后调控功能 | 首次从单细胞测序数据中鉴定出保守且富集于精原干细胞的RNA结合蛋白ELAVL2，并揭示其通过激活ERK和AKT通路促进增殖、抑制凋亡的转录后调控机制 | NA | 阐明RNA结合蛋白ELAVL2在精原干细胞增殖和凋亡中的功能及分子机制 | 人类和小鼠睾丸组织、C18-4和TCam-2细胞系 | 机器学习 | 非梗阻性无精子症 | 单细胞测序、RNA免疫沉淀测序、免疫沉淀-质谱分析 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-07-01 |
CXCR6 is required for antitumor efficacy of intratumoral CD8+ T cell
2021-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003100
PMID:34462326
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转基因小鼠模型，发现CXCR6特异性表达于瘤内CD8+ T细胞，并证实其对抗肿瘤免疫效应和PD-1阻断治疗响应至关重要 | 首次明确CXCR6在瘤内CD8+ T细胞中的独特表达及其对抗肿瘤免疫的必要性，揭示其表达主要由肿瘤组织诱导而非配体趋化，为联合免疫治疗设计提供新靶点 | 未阐明CXCR6在人体肿瘤中的具体调控机制及长期治疗效果，且Cxcr6-/-小鼠模型与人体免疫系统的差异可能限制临床转化 | 探究瘤内CD8+ T细胞中CXCR6的表达特征及其在抗肿瘤免疫和免疫检查点治疗中的作用 | 瘤内CD8+ T细胞及CXCR6分子 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及Cxcr6-/-小鼠、转基因OT-I小鼠及骨髓嵌合体模型，具体样本数量未说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 12 | 2026-06-19 |
Single-cell nucleic acid profiling in droplets (SNAPD) enables high-throughput analysis of heterogeneous cell populations
2021-10-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab577
PMID:34233007
|
研究论文 | 介绍了一种名为SNAPD的液滴单细胞核酸分析方法，用于高通量分析异质细胞群体 | 开发了SNAPD技术，能够在液滴中分析单个细胞的RNA标志物，通过分子逻辑电路对细胞进行分类，每小时可分析超过10万个细胞 | 未提及具体局限性 | 开发一种快速、简单、高通量的单细胞分析方法，基于RNA标志物对细胞样本进行计数和分类 | 哺乳动物单细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞核酸分析，液滴微流控 | NA | 单细胞RNA表达数据 | 超过10万个细胞（每小时） | NA | 单细胞RNA分析 | NA | 微流控芯片液滴系统 |
| 13 | 2026-06-19 |
Type I Interferon signaling controls the accumulation and transcriptomes of monocytes in the aged lung
2021-10, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13470
PMID:34547174
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研究论文 | 研究发现衰老导致肺部干扰素信号增强和单核细胞浸润，并通过单细胞RNA测序鉴定出一种依赖I型干扰素信号的新型单核细胞亚群 | 首次通过scRNA-seq鉴定出衰老肺部中一种依赖I型干扰素信号的新型单核细胞亚群（MO-ifn），该亚群表达的IFNAR1上调且转录组变化更显著 | 未详细说明抗IFNAR1抗体治疗的长期效果及潜在副作用，也未探讨其他免疫细胞类型在衰老肺部炎症中的作用 | 研究衰老过程中肺部免疫细胞机制，特别是I型干扰素信号对单核细胞积累和转录组的影响 | 衰老小鼠肺部的单核细胞及I型干扰素信号通路 | 机器学习 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量，但涉及年轻与年老小鼠的肺部组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-06-19 |
Th1 polarization defines the synovial fluid T cell compartment in oligoarticular juvenile idiopathic arthritis
2021-09-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.149185
PMID:34403374
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研究论文 | 通过免疫表型分析、转录组测序和表观遗传学方法，揭示少关节型幼年特发性关节炎滑液中T细胞以Th1极化为特征，而Th17细胞并未富集 | 首次在单细胞水平揭示少关节型JIA滑液中Th1极化涵盖Treg细胞，且这些Th1样Treg仍保持调节功能和表观遗传特征，挑战了传统认为Treg在炎症环境中功能不稳定的观点 | 未提及具体限制 | 阐明少关节型幼年特发性关节炎滑液中T细胞免疫应答的特征 | 少关节型幼年特发性关节炎患者的滑液T细胞（CD4+、CD8+、γδ T细胞及Treg细胞） | 免疫学 | 幼年特发性关节炎 | 流式细胞术、批量RNA测序、单细胞RNA测序、DNA甲基化分析、Treg抑制实验 | NA | RNA测序数据、甲基化数据、流式细胞术数据 | 未明确说明样本量（涉及少关节型JIA患者滑液样本） | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-06-19 |
IFN-γ is essential for alveolar macrophage-driven pulmonary inflammation in macrophage activation syndrome
2021-09-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.147593
PMID:34314387
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研究论文 | 探讨IFN-γ在巨噬细胞活化综合征肺泡巨噬细胞介导的肺部炎症中的关键作用 | 首次在TLR9小鼠模型中明确IFN-γ驱动MAS相关肺部炎症的机制，并发现复发MAS可重置肺泡巨噬细胞极化状态 | 基于小鼠模型，可能无法完全模拟人类SJIA-LD的复杂性 | 阐明MAS模型中肺部炎症的免疫病理机制 | TLR9小鼠MAS模型中的肺部炎症和肺泡巨噬细胞 | 免疫学 | 巨噬细胞活化综合征、全身性幼年特发性关节炎相关肺病 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-06-18 |
Intra-heterogeneity in transcription and chemoresistant property of leukemia-initiating cells in murine Setd2-/- acute myeloid leukemia
2021-09, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12189
PMID:34196511
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研究论文 | 该研究在Setd2基因敲除的小鼠急性髓系白血病模型中鉴定出两种具有不同转录组和耐药特性的白血病起始细胞亚群 | 首次在Setd2敲除AML模型中揭示了共存白血病起始细胞在转录组和化疗响应方面的异质性，并发现RAS通路激活与阿霉素耐药性相关 | 研究仅基于单一小鼠模型（Setd2-/-），未在人类AML样本中验证，且未深入探讨两种LIC亚群之间的相互作用机制 | 阐明白血病起始细胞在同一个体中的功能异质性，特别是药物响应的差异 | Setd2基因敲除小鼠急性髓系白血病模型中的白血病起始细胞（LICs） | 机器学习 | 急性髓系白血病 | RNA-seq,全基因组测序,流式细胞术 | NA | 转录组数据（bulk和单细胞）,基因组数据（全基因组测序） | 原代Setd2-/- AML小鼠脾细胞移植到C57BL/6受体小鼠，具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-06-07 |
Longitudinal Single-Cell Transcriptomics Reveals a Role for Serpina3n-Mediated Resolution of Inflammation in a Mouse Colitis Model
2021, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.04.004
PMID:33862275
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研究论文 | 利用单细胞转录组学阐明小鼠结肠炎模型中炎症消退的动态机制，发现Serpina3n在基质细胞中特异性表达并促进炎症消退 | 首次通过单细胞转录组学揭示基质细胞在结肠炎症消退中的关键作用，并发现Serpina3n作为丝氨酸蛋白酶抑制剂能通过靶向弹性蛋白酶促进炎症消退，提供了新的治疗靶点 | 研究基于化学诱导小鼠模型，可能无法完全代表人类炎症性肠病的复杂性；仅验证了Serpina3n的短期作用，长期效果尚需进一步研究 | 阐明结肠炎症过程中不同细胞类型及其相互作用的动态变化，探索炎症消退的潜在机制 | 化学诱导结肠炎小鼠模型的结肠组织细胞（包括基质细胞、免疫细胞等） | 生物信息学, 单细胞基因组学 | 炎症性肠病（结肠炎） | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA表达数据 | 小鼠结肠炎模型样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-06-02 |
Transfer learning between preclinical models and human tumors identifies a conserved NK cell activation signature in anti-CTLA-4 responsive tumors
2021-08-11, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-021-00944-5
PMID:34376232
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研究论文 | 通过迁移学习比较临床前模型与人类肿瘤，发现抗CTLA-4响应肿瘤中保守的NK细胞激活特征 | 首次利用迁移学习方法（projectR）鉴定出抗CTLA-4治疗中保守的NK细胞激活特征，该特征与患者生存期延长和对ipilimumab治疗的响应性相关 | 临床前模型中的治疗机制未能完全转化为人类疾病，限制了提高免疫检查点抑制剂疗效的转化研究 | 识别肿瘤微环境中免疫细胞状态对免疫检查点抑制剂响应的保守转录变化，以发现新的作用机制并提高疗效 | 小鼠和人类肿瘤中的NK细胞、T细胞及其他免疫细胞 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、质谱流式细胞术 | 迁移学习算法（projectR） | 单细胞转录组数据、bulk转录组数据、质谱流式细胞数据 | 涉及小鼠模型和人类转移性黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 19 | 2026-06-02 |
Spinal Inhibitory Interneurons: Gatekeepers of Sensorimotor Pathways
2021-Mar-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22052667
PMID:33800863
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综述 | 综述脊髓抑制性中间神经元在感觉运动通路中的门控作用及其在疾病中的潜在治疗靶点 | 通过转基因操作、神经化学分析和单细胞转录组学等方法，识别出构成功能性微环路的抑制性中间神经元的不同亚群 | 未提及具体局限性 | 理解抑制性中间神经元在脊髓中的组织方式和功能，为治疗感觉和运动障碍提供潜在靶点 | 脊髓抑制性中间神经元 | 神经科学 | 感觉障碍、运动障碍 | 单细胞转录组学、转基因操作 | NA | 文献综述 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-05-31 |
Transcriptional and functional divergence in lateral hypothalamic glutamate neurons projecting to the lateral habenula and ventral tegmental area
2021-12-01, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2021.09.020
PMID:34624220
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研究论文 | 该研究通过病毒示踪、单细胞测序、电生理和体内钙成像等方法，系统比较了外侧下丘脑（LHA）中投射至外侧缰核（LHb）和腹侧被盖区（VTA）的谷氨酸能神经元的转录组和功能差异 | 首次系统揭示了LHA中投射至不同脑区（LHb和VTA）的谷氨酸能神经元在解剖、转录、电生理和功能上的显著差异，并发现投射至LHb的神经元对饱腹状态和进食激素特别敏感 | 未明确提及局限性 | 解析LHA中不同投射特异性神经元群体的功能异质性 | 小鼠LHA中投射至LHb和VTA的谷氨酸能神经元 | 神经科学 | NA | 病毒示踪, 单细胞测序, 电生理记录, 体内钙成像 | NA | 神经元投射数据, 单细胞转录组数据, 电生理数据, 钙成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |