单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-16 |
Transcriptional and functional divergence in lateral hypothalamic glutamate neurons projecting to the lateral habenula and ventral tegmental area
2021-12-01, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2021.09.020
PMID:34624220
|
研究论文 | 系统比较外侧下丘脑投射至外侧缰核和腹侧被盖区的谷氨酸能神经元在转录、电生理和功能上的差异 | 结合病毒示踪、单细胞测序、电生理和体内钙成像技术，首次系统解析了外侧下丘脑不同投射路径神经元的分子和功能异质性 | 未明确神经元亚型对摄食和奖赏行为的具体因果作用，且仅聚焦两条投射通路 | 揭示外侧下丘脑谷氨酸能神经元投射至外侧缰核和腹侧被盖区的功能差异 | 小鼠外侧下丘脑投射至外侧缰核和腹侧被盖区的谷氨酸能神经元 | 神经科学 | NA | 病毒示踪、单细胞测序、电生理记录、体内钙成像 | NA | 电生理数据、单细胞转录组数据、钙成像视频 | 小鼠（数量未在摘要中明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-05-16 |
The AIM2 inflammasome exacerbates atherosclerosis in clonal haematopoiesis
2021-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03341-5
PMID:33731931
|
研究论文 | 本研究揭示AIM2炎症小体在克隆性造血相关动脉粥样硬化中的恶化作用 | 首次阐明JAK2突变通过DNA复制应激激活AIM2炎症小体加剧动脉粥样硬化的机制 | 未提及具体局限性 | 探究克隆性造血相关基因突变（JAK2）促进动脉粥样硬化的分子机制 | 携带JAK2突变的巨噬细胞和模拟克隆性造血的嵌合小鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 3 | 2026-05-16 |
Resolving cellular systems by ultra-sensitive and economical single-cell transcriptome filtering
2021-Mar-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102147
PMID:33665566
|
研究论文 | 本文介绍了Constellation-Seq，一种超灵敏且经济的单细胞转录组过滤技术，能显著提高灵敏度并降低成本 | 实现两个数量级的灵敏度提升，通过最大化读取利用率减少数据稀疏性和测序成本 | 仅展示了在外周血单核细胞样本中的应用，未提及对多种复杂组织的验证 | 开发一种超灵敏且经济的单细胞转录组过滤方法，用于稀缺转录本识别和下游分析 | 外周血单核细胞样本中的稀有树突状细胞群体 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，Constellation-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | 外周血单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-05-16 |
Input-output signal processing plasticity of vagal motor neurons in response to cardiac ischemic injury
2021-Mar-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102143
PMID:33665562
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示迷走神经背侧运动核神经元在心脏缺血损伤中的输入-输出信号处理可塑性 | 首次揭示稳态下DMV神经元可组织为可区分的输入-输出信号处理单元，并发现远程缺血预适应和慢性心脏缺血损伤诱导的神经元状态转变及其相关的调控microRNA变化 | 研究仅限于DMV神经元，且样本量可能有限，未能涵盖所有相关脑区或长期动态变化 | 探索DMV神经元的分子表型及其在心脏缺血损伤中的可塑性，为生物电子医学提供新靶点 | 数百个DMV神经元（稳态及生理扰动后） | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 数百个DMV神经元（稳态及生理扰动后） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-05-16 |
Isolation of human ESC-derived cardiac derivatives and embryonic heart cells for population and single-cell RNA-seq analysis
2021-03-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100339
PMID:33644774
|
protocol | 描述了一种结合人口和单细胞RNA测序分析，从人胚胎干细胞分化和发育组织中分离心脏衍生物和胚胎心脏细胞的方法 | 结合群体和单细胞RNA测序分析，利用hESC分化和发育组织建立器官特异性细胞和分子图谱 | NA | 建立人胚胎发生中器官特异性细胞和分子图谱 | 人胚胎干细胞分化的心脏衍生物和人类胚胎心脏细胞 | NA | NA | RNA-seq, Smart-seq2 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 群体RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-05-16 |
Spatiotemporal analysis of human intestinal development at single-cell resolution
2021-02-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.12.016
PMID:33406409
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，在单细胞分辨率下描绘人类肠道发育的时空图谱 | 首次在单细胞水平系统性地构建人类肠道发育的时空图谱，揭示肠道形成的动态过程及多种细胞类型的分化层次 | 研究仅基于胎儿组织样本，可能无法完全代表出生后肠道发育的完整过程 | 解析人类肠道发育过程中的细胞组成、基因表达动态和空间组织规律 | 人类胎儿肠道组织的发育阶段（不同时间点的样本） | 数字病理学 | 罕见肠道发育障碍 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，空间转录组数据 | 未具体说明样本数量，涉及多个时间点的人类胎儿肠道组织 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium进行单细胞RNA测序，10x Visium进行空间转录组学分析 |
| 7 | 2026-05-16 |
Directed induction of alveolar type I cells derived from pluripotent stem cells via Wnt signaling inhibition
2021-02, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.3302
PMID:33241896
|
研究论文 | 通过Wnt信号抑制诱导多能干细胞来源的肺泡I型细胞分化 | 首次利用单细胞RNA测序鉴定出诱导多能干细胞来源的肺泡I型细胞，并证明XAV-939通过抑制经典Wnt信号通路促进其分化 | 未明确说明局限性（原文未提及） | 研究肺泡I型细胞的分化机制 | 人诱导多能干细胞来源的肺泡上皮细胞和胎儿肺成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量（涉及成纤维细胞依赖的肺泡类器官） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 8 | 2026-05-16 |
Neurological Manifestations of COVID-19 Feature T Cell Exhaustion and Dedifferentiated Monocytes in Cerebrospinal Fluid
2021-01-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.12.011
PMID:33382973
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析COVID-19神经系统并发症患者脑脊液中的免疫细胞图谱，发现去分化单核细胞和耗竭CD4 T细胞的特征性变化 | 首次在脑脊液水平揭示COVID-19神经系统并发症患者存在T细胞耗竭和单核细胞去分化现象，并系统性比较不同类型神经系统疾病的免疫特征差异 | 样本量较小（具体数量未说明），且未阐明脑脊液免疫改变与临床预后的直接因果关系 | 探究COVID-19患者神经系统并发症的免疫学发病机制 | COVID-19神经系统并发症患者（Neuro-COVID）、非炎症性神经系统疾病、自身免疫性神经系统疾病及病毒性脑炎患者 | 单细胞免疫学、神经系统疾病 | 神经系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 脑脊液免疫细胞单细胞转录组数据 | 多组患者脑脊液样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞5'基因表达与免疫谱分析 |
| 9 | 2026-05-16 |
High levels of soluble CD25 in COVID-19 severity suggest a divergence between anti-viral and pro-inflammatory T-cell responses
2021, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.1251
PMID:33614032
|
研究论文 | 本研究探讨COVID-19患者中可溶性CD25水平与疾病严重程度的关系，提示抗病毒与促炎T细胞反应之间的分歧 | 首次发现可溶性CD25是COVID-19严重程度的独立危险因素，并与病毒脱落时间正相关，揭示CD25+CD8+ T细胞扩增对促炎反应的贡献 | 基于单中心研究，小鼠模型与人类COVID-19的病理差异可能影响结论普适性，且未深入验证sCD25作为治疗靶点的可行性 | 解析COVID-19患者T细胞功能缺陷与过度激活并存现象背后的免疫机制 | COVID-19住院患者及淋巴细胞脉络丛脑膜炎病毒（LCMV）感染的小鼠模型 | 免疫学 | COVID-19 | 细胞因子检测、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 临床数据、小鼠模型实验数据、单细胞RNA测序数据 | 280例COVID-19住院患者及LCMV感染小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 支气管肺泡灌洗液（BALF）中免疫细胞的单细胞RNA测序 |
| 10 | 2026-05-16 |
Transcriptional profiling of pediatric cholestatic livers identifies three distinct macrophage populations
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0244743
PMID:33411796
|
研究论文 | 对儿童胆汁淤积性肝脏进行转录组分析，识别出三种不同的巨噬细胞群体 | 首次对人类儿童胆汁淤积性肝脏进行单细胞RNA测序，识别出与健康肝脏巨噬细胞转录特征不同的三种巨噬细胞亚群 | 未完全确定这些巨噬细胞亚群在不同病因的胆汁淤积性肝病中的异同 | 进一步表征儿童胆汁淤积性肝病中巨噬细胞的转录谱 | 儿童胆汁淤积性肝病患者（胆道闭锁和Alagille综合征）的肝脏免疫细胞 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序，流式细胞荧光分选，免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 胆道闭锁患者6例，Alagille综合征患者6例 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 11 | 2026-05-11 |
Single-cell RNA-sequencing analyses identify heterogeneity of CD8+ T cell subpopulations and novel therapy targets in melanoma
2021-Mar-26, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2020.12.003
PMID:33575475
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析黑色素瘤中CD8+ T细胞亚群的异质性，并识别潜在治疗靶点 | 首次在黑色素瘤中系统描述了7个CD8+ T细胞亚群的异质性，并发现耗竭性CD8+ T细胞亚群2中的三个过表达基因（、、）可作为新型治疗靶点 | 研究基于已发表数据，未涉及实验验证；样本量可能有限；靶点的临床前验证尚未进行 | 探索黑色素瘤中CD8+ T细胞亚群的异质性及其对预后和免疫治疗的影响 | 黑色素瘤样本中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-05-11 |
Single-cell RNA-seq dissects the intratumoral heterogeneity of triple-negative breast cancer based on gene regulatory networks
2021-Mar-05, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2020.12.018
PMID:33575114
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序数据构建基因调控网络，解析三阴性乳腺癌的瘤内异质性 | 通过整合基因共表达和转录因子结合基序富集分析，为每个亚型构建基因调控网络，并基于中心性指标识别关键基因 | 未提及样本量大小及其他潜在局限性 | 利用单细胞RNA测序数据构建基因调控网络，以解析三阴性乳腺癌的瘤内异质性并识别关键基因 | 三阴性乳腺癌患者的恶性细胞亚型 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | PAM50分型模型 | 单细胞转录组数据 | 未提供具体样本量 | 双歧杆菌 | 单细胞RNA测序 | 双歧杆菌 | 双歧杆菌 |
| 13 | 2026-05-11 |
Systemic transcriptome comparison between early- And late-onset pre-eclampsia shows distinct pathology and novel biomarkers
2021-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.12968
PMID:33332660
|
研究论文 | 比较早发型和晚发型子痫前期的全身转录组，揭示其病理差异并发现新型生物标志物 | 首次整合胎盘和外周血转录组与母胎界面单细胞转录组，系统比较早发型和晚发型子痫前期的病理差异，并发现各自特异的新型生物标志物 | 需要更大样本量验证新标志物的临床适用性，且单细胞数据整合分析的深度有限 | 阐明早发型和晚发型子痫前期的病理差异并发现新型诊断生物标志物 | 子痫前期患者（早发型和晚发型）的胎盘和外周血样本 | 数字病理学 | 子痫前期 | 转录组测序、单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据、单细胞转录组数据 | 包含早发型和晚发型子痫前期患者及对照组的胎盘和外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 整合了母胎界面的单细胞转录组数据 |
| 14 | 2026-05-11 |
Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneity and differential expression of decidual tissues during the peripartum period
2021-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.12967
PMID:33300223
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析围产期蜕膜组织的异质性和差异表达基因 | 首次在单细胞分辨率下揭示围产期蜕膜中多种细胞亚型的动态变化及其功能，包括蜕膜基质细胞、绒毛外滋养细胞和T细胞的激活状态 | 未提及具体局限性 | 研究围产期蜕膜组织的细胞异质性和转录组变化，以理解其在分娩启动中的作用 | 分娩前后的蜕膜细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 29,231个蜕膜细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-05-11 |
TransSynW: A single-cell RNA-sequencing based web application to guide cell conversion experiments
2021-02, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/sctm.20-0227
PMID:33125830
|
研究论文 | TransSynW是一个基于单细胞RNA测序数据的网络应用程序，用于指导细胞转化实验 | 首次开发基于单细胞RNA测序数据的网络应用来预测细胞转化转录因子，并优先识别先驱因子以促进染色质开放 | 需进一步验证预测结果的实验可行性，且可能受限于单细胞数据的质量和细胞类型的代表性 | 开发计算工具预测细胞转化所需的转录因子，推动干细胞研究和再生医学中的细胞疗法 | 用户指定的细胞群体及其转化过程中涉及的转录因子 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-05-11 |
Cell-Type-Specific Immune Dysregulation in Severely Ill COVID-19 Patients
2021-01-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108590
PMID:33357411
|
研究论文 | 使用单细胞RNA测序分析重症COVID-19患者外周血单核细胞的免疫失调特征 | 揭示了ARDS患者单核细胞中抗原呈递和干扰素反应缺陷，而淋巴细胞中干扰素信号反应增强，以及细胞毒性活性和B细胞激活抑制的免疫失衡状态 | NA | 探究重症COVID-19患者的细胞类型特异性免疫失调机制 | 健康志愿者、中度COVID-19患者、急性呼吸窘迫综合征患者以及从ARDS恢复的患者的外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | COVID-19, 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3名健康人、5名中度患者、6名ARDS患者、6名恢复期患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2024-08-08 |
Using advanced spatial and single-cell transcriptomics to characterize the human endometrium
2021-12, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-021-00982-0
PMID:34857955
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2026-05-04 |
Single-cell sequencing of rotavirus-infected intestinal epithelium reveals cell-type specific epithelial repair and tuft cell infection
2021-11-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2112814118
PMID:34732579
|
研究论文 | 利用单细胞测序技术探究轮状病毒感染后肠道上皮的细胞特异性修复机制及簇细胞的感染情况 | 首次发现轮状病毒感染可感染簇细胞，并揭示簇细胞通过干扰素相关通路应对病毒感染；同时发现特定细胞亚群增殖频率增加并伴随隐窝扩张和不成熟肠细胞增多 | 未阐明簇细胞感染在肠道修复中的具体功能角色，且仅基于轮状病毒模型，其他病原体相关修复机制需进一步验证 | 在单细胞水平上探索轮状病毒引起的肠道上皮损伤后再生修复的转录反应 | 轮状病毒感染的肠道上皮细胞（包括簇细胞、肠干细胞、不成熟肠细胞等特定亚群） | 数字病理学 | 轮状病毒感染相关肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 轮状病毒感染小鼠的肠道上皮细胞样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 19 | 2026-05-02 |
A comprehensive prognostic signature for glioblastoma patients based on transcriptomics and single cell sequencing
2021-Aug, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-021-00612-1
PMID:34142341
|
研究论文 | 基于转录组学和单细胞测序构建胶质母细胞瘤综合预后标志物 | 结合TCGA和CGGA数据库筛选出七种差异表达基因作为预后标志物，并利用单细胞测序分析这些基因在肿瘤细胞增殖和进展中的功能，最终构建了综合临床特征和基因谱的预后模型 | 模型主要基于公共数据集，可能在外部验证数据中表现待进一步确认，且老年患者亚组的特异性表现需更多研究支持 | 揭示胶质母细胞瘤的潜在预后标志基因并构建有效的预后模型 | 胶质母细胞瘤患者 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq, 单细胞测序, 实时定量PCR | 预后风险评分模型 | 转录组数据, 单细胞测序数据 | TCGA和CGGA数据库中的胶质母细胞瘤患者样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-05-02 |
1p/19q co-deletion status is associated with distinct tumor-associated macrophage infiltration in IDH mutated lower-grade gliomas
2021-Feb, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-020-00561-1
PMID:32915415
|
研究论文 | 本研究探讨1p/19q共缺失状态对IDH突变低级别胶质瘤中肿瘤相关巨噬细胞浸润的影响 | 首次揭示1p/19q共缺失状态与IDH突变低级别胶质瘤中TAM表型及浸润程度的关联，并发现M-CSF和TGFβ1信号通路可能介导这一过程 | 研究主要依赖TCGA转录组数据和有限样本的免疫染色，小鼠模型可能无法完全模拟人类疾病 | 确定1p/19q共缺失状态是否影响IDH突变低级别胶质瘤中TAM的表型或浸润程度 | IDH突变低级别胶质瘤中的肿瘤相关巨噬细胞 | 机器学习 | 脑胶质瘤 | RNA-seq、单细胞RNA测序、免疫染色、小分子抑制剂 | NA | 转录组数据、单细胞测序数据、组织样本图像 | 230个TCGA样本及IDH突变LGG原代样本 | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |