单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 709 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-07 |
Integrated Systems Analysis of the Murine and Human Pancreatic Cancer Glycomes Reveals a Tumor-Promoting Role for ST6GAL1
2021, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2021.100160
PMID:34634466
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研究论文 | 本文通过系统方法整合了KC小鼠和人类胰腺癌患者的糖组分析，识别了在癌症形成中可能起作用的糖类 | 创建了一种新型小鼠模型，通过胰腺特异性遗传删除ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 1酶，研究其对胰腺癌的影响 | 某些人类糖组变化在KC小鼠模型中未观察到 | 识别在胰腺癌形成中起作用的糖类，并开发针对这些糖类的治疗方法 | 小鼠和人类胰腺癌样本的糖组 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 糖组分析 | NA | 序列数据 | 包括KC小鼠模型和人类胰腺癌患者样本 |
| 162 | 2024-08-07 |
Deep Parallel Characterization of AAV Tropism and AAV-Mediated Transcriptional Changes via Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.730825
PMID:34759919
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研究论文 | 本文开发了一种实验和计算相结合的单细胞RNA测序（scRNA-seq）流程，用于高分辨率地表征编码rAAV池的趋向性和响应 | 首次采用scRNA-seq技术并行表征AAV的趋向性和转录变化，发现了未被识别的AAV衣壳靶向偏差和细胞类型特异性的短暂反应 | NA | 旨在开发安全且精确的基因递送载体，并展示在单细胞水平上理解基因疗法响应的重要性 | 重组腺相关病毒（rAAV）的趋向性和转录变化 | 基因疗法 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及多种细胞和组织类型 |
| 163 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Identifies Phagocytosis-Related Dual-Feature Cells in A Model of Acute Otitis Media in Rats
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.760954
PMID:34759932
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，在急性中耳炎的大鼠模型中识别出与吞噬作用相关的双特征细胞 | 首次在急性中耳炎模型中发现具有吞噬作用相关双特征的稀有细胞群，并揭示了巨噬细胞在炎症反应中的关键作用 | NA | 探究急性中耳炎发展的分子机制及多细胞生态系统中的细胞间对话 | 大鼠急性中耳炎模型中的中耳黏膜细胞 | 数字病理学 | 耳部疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 共测序了来自炎症中耳黏膜的7023个细胞和健康中耳黏膜的5258个细胞 |
| 164 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals B Cells Are Important Regulators in Fracture Healing
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.666140
PMID:34819916
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，揭示了B细胞在骨折愈合过程中的重要作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了骨折愈合过程中B细胞的数量变化及其对骨形成和吸收活动的影响 | 研究主要集中在小鼠模型上，对人类骨折愈合过程中B细胞的作用描述较少 | 探讨B细胞在骨折愈合中的作用及其机制 | 骨折组织中的免疫细胞，特别是B细胞 | 数字病理学 | 骨折 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括中性粒细胞、单核细胞、T细胞、B细胞和浆细胞等多种免疫细胞 |
| 165 | 2024-08-07 |
Cellinker: a platform of ligand-receptor interactions for intercellular communication analysis
2021-Jan-20, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab036
PMID:33471060
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研究论文 | 本文开发了Cellinker平台，一个用于细胞间通信分析的配体-受体相互作用资源 | Cellinker提供了超过3,700个人类和3,200个鼠类配体-受体蛋白-蛋白相互作用以及400多个内源性小分子相关的配体-受体相互作用，并特别收集了与冠状病毒感染相关的16个配体-受体相互作用信息 | NA | 提供一个全面的、高可信度的资源，用于检索配体-受体相互作用，以研究细胞间通信的功能效应 | 配体-受体相互作用及其在细胞间通信中的作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质-蛋白相互作用数据 | 超过3,700个人类和3,200个鼠类配体-受体相互作用，以及400多个内源性小分子相关的相互作用 |
| 166 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics analysis of mild cognitive impairment in World Trade Center disaster responders
2021, Alzheimer's & dementia (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1002/dad2.12154
PMID:33665344
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析，研究了世界贸易中心灾难响应者中轻度认知障碍的分子复杂性。 | 本文首次使用CITE-Seq技术在单细胞分辨率下对世界贸易中心响应者的血液进行转录组学分析，揭示了与轻度认知障碍相关的基因表达差异。 | 研究仅限于男性世界贸易中心响应者，且样本量相对较小。 | 通过基因表达谱分析，深入理解轻度认知障碍的分子机制。 | 世界贸易中心灾难响应者中的轻度认知障碍。 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | CITE-Seq | NA | 基因表达数据 | 40名男性世界贸易中心响应者，分为两组（发现组：9名MCI和9名对照；复制组：11名MCI和11名对照） |
| 167 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of Schistosoma mansoni identifies a conserved genetic program controlling germline stem cell fate
2021-01-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20794-w
PMID:33473133
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了血吸虫的生殖干细胞命运调控的遗传程序 | 首次揭示了血吸虫生殖干细胞增殖与分化的遗传调控机制，并发现该机制在扁形动物中具有保守性 | NA | 研究血吸虫生殖干细胞的分子调控机制 | 血吸虫的生殖干细胞 | 分子生物学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 168 | 2024-08-07 |
Machine learning identifies novel blood protein predictors of penetrating and stricturing complications in newly diagnosed paediatric Crohn's disease
2021-01, Alimentary pharmacology & therapeutics
IF:6.6Q1
DOI:10.1111/apt.16136
PMID:33131065
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法，识别出与新诊断的儿童克罗恩病穿透性和狭窄并发症相关的新型血液蛋白质预测因子。 | 本研究首次识别出与儿童克罗恩病进展相关的特定血液蛋白质标记物，这些标记物在肠道和血液中的细胞表达有显著差异。 | 研究样本量相对较小，且仅限于儿童克罗恩病患者，可能限制了结果的普遍性。 | 旨在识别与克罗恩病并发症相关的新型血液蛋白质生物标志物。 | 新诊断的儿童克罗恩病患者及其穿透性和狭窄并发症。 | 机器学习 | 克罗恩病 | 近端延伸分析（Olink Proteomics） | 随机生存森林（RSF） | 蛋白质 | 265名患者，平均年龄11.6岁，其中73名患者出现狭窄并发症，34名患者出现穿透并发症。 |
| 169 | 2024-08-07 |
Single-Cell Analysis of Hematopoietic Stem Cells
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1425-9_22
PMID:34057731
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研究论文 | 本文描述了一种全面的单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析小鼠骨髓的协议，使用基于板（低通量）和基于液滴（高通量）的方法 | 结合单细胞转录组分析与分子扰动，允许对基因调控网络中的单个因子进行功能分析，并更好地理解恶性转化的最早阶段 | NA | 研究造血干细胞的单细胞分析 | 小鼠骨髓中的造血干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 170 | 2024-08-07 |
Tuning MPL signaling to influence hematopoietic stem cell differentiation and inhibit essential thrombocythemia progenitors
2021-01-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2017849118
PMID:33384332
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研究论文 | 本文开发了一系列用于TPO-R的替代蛋白配体，即二聚体（DBs），通过调节TPO-R信号传导来影响造血干细胞的分化和抑制原发性血小板增多症祖细胞 | 开发了能够调节TPO-R信号传导的替代蛋白配体，这些配体能够通过不同的几何结构调节下游信号响应，从而实现对TPO/TPO-R双重功能的解耦 | NA | 探索通过调节TPO-R信号传导来影响造血干细胞的分化和抑制原发性血小板增多症祖细胞的方法 | 造血干细胞和原发性血小板增多症祖细胞 | NA | 原发性血小板增多症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 171 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis of CAR T-cell products reveals subpopulations, stimulation, and exhaustion signatures
2021-01-06, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2020.1866287
PMID:33489472
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研究论文 | 本研究利用流式细胞术和单细胞转录组测序技术，分析了3名健康供体的CAR T细胞产品，揭示了细胞亚群、刺激反应和耗竭标志物 | 首次详细描述了CAR T细胞在抗原特异性刺激下的转录组变化，并发现了与T细胞耗竭相关的新基因 | 研究仅限于3名健康供体，样本量较小 | 探究CAR T细胞疗法中细胞激活的分子机制 | CAR T细胞产品及其在抗原特异性刺激下的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 53,191个单细胞转录组，来自3名健康供体 |
| 172 | 2024-08-07 |
Tumor-intrinsic and -extrinsic determinants of response to blinatumomab in adults with B-ALL
2021-01-28, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020006287
PMID:32881995
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研究论文 | 研究了44名复发或难治性B-ALL成年患者在接受blinatumomab治疗后的肿瘤内在和外在反应决定因素 | 发现了CD19 ex2part剪接变体作为预测blinatumomab治疗失败的新的生物标志物 | NA | 确定blinatumomab治疗B-ALL的肿瘤内在和外在反应决定因素 | 复发或难治性B-ALL成年患者 | NA | B-ALL | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 44名患者 |
| 173 | 2024-08-07 |
A spatially resolved brain region- and cell type-specific isoform atlas of the postnatal mouse brain
2021-01-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20343-5
PMID:33469025
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研究论文 | 本文通过单细胞长读序技术研究了小鼠海马体和前额叶皮层在出生后第7天的45种细胞类型中不同脑区间差异性剪接变体的表达 | 本文首次在单细胞分辨率下展示了脑区间剪接变体的差异表达，并发现这些差异与功能上不同的蛋白质变体相对应 | NA | 研究脑区间和细胞类型特异性的剪接变体表达差异 | 小鼠海马体和前额叶皮层在出生后第7天的45种细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞长读序技术 | NA | 转录组数据 | 小鼠海马体和前额叶皮层的45种细胞类型 |
| 174 | 2024-08-07 |
scRNA-Seq Reveals New Enteric Nervous System Roles for GDNF, NRTN, and TBX3
2021, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2020.12.014
PMID:33444816
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研究论文 | 本研究通过单核和单细胞RNA测序技术，揭示了GDNF、NRTN和TBX3在肠神经系统中的新作用 | 首次通过单细胞分析定义了肠神经系统中不同神经元亚型的差异表达基因，并发现了TBX3、GDNF和NRTN的新作用 | NA | 旨在通过定义神经元亚型的基因表达，促进针对肠神经病变的新型治疗策略的开发，并深入了解肠神经系统功能 | 成年小鼠和人类结肠的肠神经元亚型 | 数字病理学 | 肠神经病变 | 单核RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 635个成年小鼠结肠肠神经元和707个E17.5小鼠肠神经元，以及48个人类结肠肠神经元和其他细胞类型 |
| 175 | 2024-08-07 |
Single-Cell Sequencing of Brain Cell Transcriptomes and Epigenomes
2021-01-06, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2020.12.010
PMID:33412093
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research paper | 本文讨论了单细胞转录组和表观基因组测序的基本原理、数据的整合计算分析以及在神经科学中的关键应用 | 单细胞测序技术通过直接测量数千到数百万个单个细胞中的多种分子特征，全面表征了脑细胞类型的多样性，揭示了塑造细胞身份的基因调控机制 | NA | 深入理解神经回路的细胞构成，揭示脑细胞群体之间的发育和进化关系 | 脑细胞的转录组和表观基因组 | digital pathology | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组和表观基因组数据 | 数千到数百万个单个细胞 |
| 176 | 2024-08-07 |
Genomic Profiling of Virulence in the Soybean Cyst Nematode Using Single-Nematode Sequencing
2021-Jan, Phytopathology
IF:2.6Q2
DOI:10.1094/PHYTO-08-20-0348-FI
PMID:33100145
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研究论文 | 本研究使用单个线虫的单细胞RNA测序方法，分析了豆杆囊线虫（SCN）的基因组特征，以识别可能参与抗性基因突破的SCN基因 | 首次建立了单个SCN个体的完整转录组，并识别出一系列针对主要SCN抗性源的假定毒力基因 | NA | 旨在揭示豆杆囊线虫克服抗性基因的机制 | 豆杆囊线虫（SCN）及其在抗性大豆品种上的毒力基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单个SCN个体 |
| 177 | 2024-08-07 |
Pattern Recognition Receptors (PRRs) in Macrophages Possess Prognosis and Immunotherapy Potential for Melanoma
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.765615
PMID:34858419
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研究论文 | 本研究分析了20种典型的模式识别受体（PRRs）在9502名患者33种肿瘤样本中的表达，并构建了基于PRRs表达的皮肤黑色素瘤（SKCM）预后模型，探讨了PRRs在黑色素瘤中的预后潜力和免疫治疗价值。 | 首次全面评估了PRRs家族在不同癌症临床预后中的意义，并发现PRRs在黑色素瘤中的表达与预后呈显著正相关，且PRR-based Cox模型比单一PRR具有更好的预后潜力。 | 研究主要集中在皮肤黑色素瘤，对其他肿瘤类型的PRRs预后潜力分析较少。 | 探讨PRRs在黑色素瘤中的预后潜力和免疫治疗价值。 | 分析PRRs在不同肿瘤中的表达及其对预后和免疫治疗的影响。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序 | Cox预后模型 | 基因表达数据 | 9502名患者的肿瘤样本 |
| 178 | 2024-08-07 |
Neurodevelopmental disorders: 2021 update
2021-Jan, Free neuropathology
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综述 | 本文综述了神经发育障碍（NDDs）的最新研究进展，包括其遗传结构、分子机制及模型工具的应用 | 介绍了通过大规模测序研究揭示的从独特的基因组DNA甲基化模式到高度多基因条件的机制，以及体细胞突变对神经发育疾病的影响 | 从遗传发现到潜在神经病理机制的进展面临挑战，主要是由于分子和遗传检测的分辨率提高 | 探讨神经发育障碍的病因和风险因素，并揭示其遗传和分子机制 | 神经发育障碍，包括自闭症谱系障碍（ASD）、发育迟缓、智力障碍（ID）和注意力缺陷/多动障碍（ADHD） | NA | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据 | 大规模样本 |
| 179 | 2024-08-08 |
Advances in understanding the formation and fate of B-cell memory in response to immunization or infection
2021, Oxford open immunology
DOI:10.1093/oxfimm/iqab018
PMID:36845573
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综述 | 本文综述了近年来在理解免疫接种或感染后B细胞记忆形成和命运方面的进展 | 利用单细胞测序技术和其他尖端技术，提高了对生发中心内B细胞命运决策的研究分辨率和准确性 | NA | 探讨免疫记忆的形成机制及其对新病原体如严重急性呼吸综合征冠状病毒2的持久免疫潜力 | B细胞记忆的形成和命运 | 免疫学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 细胞 | NA |
| 180 | 2024-08-08 |
satuRn: Scalable analysis of differential transcript usage for bulk and single-cell RNA-sequencing applications
2021, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.51749.2
PMID:36762203
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research paper | 介绍了一种名为satuRn的快速灵活的准二项式广义线性建模框架，用于分析差异转录本使用情况 | satuRn框架在性能上与最佳的差异转录本使用分析方法相当，同时提供了良好的错误发现率控制，能够处理复杂的实验设计，并适用于大规模单细胞转录组测序数据 | NA | 开发一种能够分析差异转录本使用情况的新工具，适用于批量和单细胞RNA测序应用 | 差异转录本使用分析工具的性能、复杂实验设计的处理能力以及大规模单细胞转录组测序数据的适用性 | RNA-seq | NA | RNA-seq | 准二项式广义线性模型 | 转录组数据 | NA |