单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 709 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-07 |
Aging Atlas: a multi-omics database for aging biology
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa894
PMID:33119753
|
research paper | 本文介绍了Aging Atlas数据库，这是一个多组学数据库，旨在支持衰老生物学研究。 | Aging Atlas数据库整合了多种高通量组学技术产生的基因表达和调控数据，为衰老研究提供了前所未有的详细和多维度的数据资源。 | NA | 本文的研究目的是建立一个开放且集成的数据库，以支持广泛的衰老生物学研究。 | 研究对象包括基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学和药物基因组学等多组学数据。 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, scRNA-seq, ChIP-seq, 蛋白质-蛋白质相互作用分析, 药物保护化合物分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 162 | 2024-08-07 |
A cell atlas of the chick retina based on single-cell transcriptomics
2021-01-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.63907
PMID:33393903
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了鸡视网膜的细胞图谱 | 首次在鸟类中进行分子层面的视网膜细胞类型鉴定，并比较了鸡、鼠和灵长类视网膜细胞类群和类型的关系 | NA | 揭示鸡视网膜的细胞结构和功能，并为鸟类视觉系统的解剖学、生理学、进化和发育研究提供基础 | 鸡视网膜的细胞类型及其分布 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 136种细胞类型及14种位置或发育中间体 | NA | NA | NA | NA |
| 163 | 2024-08-07 |
scMC learns biological variation through the alignment of multiple single-cell genomics datasets
2021-01-04, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02238-2
PMID:33397454
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scMC的方法，用于在整合和比较不同实验的单细胞基因组数据集时，区分并保留生物学变异，同时去除技术变异 | scMC方法通过方差分析学习生物学变异，以无监督方式推断并去除技术变异，从而能够准确对齐并检测共享和特定上下文的生物信号 | NA | 开发一种方法，能够在整合单细胞基因组数据时，有效区分并保留生物学变异，去除技术变异 | 单细胞RNA测序和ATAC测序实验的数据集 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq）和ATAC测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 164 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome profiling of the vaginal wall in women with severe anterior vaginal prolapse
2021-01-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20358-y
PMID:33397933
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术构建了前阴道壁的转录组图谱，并分析了前阴道脱垂（AVP）中的细胞类型和基因表达异常 | 首次构建了前阴道壁的单细胞转录组图谱，并揭示了AVP中的细胞异质性和分子机制 | NA | 揭示前阴道脱垂（AVP）的细胞异质性和分子机制 | 前阴道壁的单细胞转录组 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 81,026个单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 165 | 2024-08-07 |
Transcriptional and morphological profiling of parvalbumin interneuron subpopulations in the mouse hippocampus
2021-01-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20328-4
PMID:33398060
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对形态学上已鉴定的小鼠海马体中的parvalbumin中间神经元（PV-INs）进行了转录组状态的分析 | 研究首次结合形态学信息和转录组数据，探讨了PV-INs在形态学、生理学和发展领域的转录组状态 | 研究主要集中在PV-INs的转录组分析，未涉及其他神经元类型的比较 | 探讨神经元身份是否可以从遗传信息中推断出来，并分析PV-INs的转录组和形态学特征 | 小鼠海马体中的parvalbumin中间神经元（PV-INs） | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 166 | 2024-08-07 |
The scRNA-seq Expression Profiling of the Receptor ACE2 and the Cellular Protease TMPRSS2 Reveals Human Organs Susceptible to SARS-CoV-2 Infection
2021-01-02, International journal of environmental research and public health
DOI:10.3390/ijerph18010284
PMID:33401657
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析了31个器官中ACE2和TMPRSS2的表达水平，评估了SARS-CoV-2感染的风险 | 首次发现胆囊和输卵管易受SARS-CoV-2感染，并对易感器官进行了风险分级 | NA | 深入理解SARS-CoV-2的病理机制 | 31个器官中ACE2和TMPRSS2的表达水平 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 31个器官的细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 167 | 2024-08-07 |
Statistical and Bioinformatics Analysis of Data from Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Experiments
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0849-4_9
PMID:32926366
|
review | 本文综述了在处理、质量控制和分析批量及单细胞RNA测序数据时使用的各种生物信息学和统计方法 | NA | NA | 探讨高吞吐量测序技术在研究人类转录组，特别是与癌症相关的应用 | 批量和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 癌症 | RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 168 | 2024-08-07 |
KLF4 (Kruppel-Like Factor 4)-Dependent Perivascular Plasticity Contributes to Adipose Tissue inflammation
2021-01, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.120.314703
PMID:33054397
|
研究论文 | 研究探讨了KLF4依赖的周围血管可塑性对脂肪组织炎症的贡献 | 首次揭示了KLF4在周围血管细胞中的作用，及其对饮食诱导肥胖相关脂肪组织炎症和代谢功能障碍的影响 | 研究使用了特定的转基因小鼠模型，结果的普遍性和适用性可能受限 | 验证周围血管细胞在KLF4依赖性条件下转化为类似巨噬细胞的细胞，从而加剧脂肪组织炎症和代谢功能障碍的假设 | 周围血管细胞、脂肪组织炎症、代谢功能障碍 | NA | 肥胖 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用了Myh11-CreERT2 eYFP小鼠和Myh11-DreERT2tdTomato小鼠进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 169 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis of small and large wounds reveals the distinct spatial organization of regenerative fibroblasts
2021-01, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.14244
PMID:33237598
|
研究论文 | 本文通过比较小疤痕伤口和大再生伤口的单细胞转录组数据，揭示了再生纤维母细胞在伤口诱导的毛囊新生中的不同空间组织。 | 发现了在再生伤口条件下过度表达Crabp1蛋白的新型上部伤口纤维母细胞，并提供了计算测试来映射这些细胞在大伤口中的空间位置。 | NA | 研究大伤口中更具再生能力的真皮细胞和分子成分，以及纤维母细胞系在伤口诱导的毛囊新生中的作用。 | 小疤痕伤口和大再生伤口的单细胞转录组数据。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 170 | 2024-08-07 |
Transcript assembly improves expression quantification of transposable elements in single-cell RNA-seq data
2021-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.265173.120
PMID:33355230
|
研究论文 | 本文建立了一个适用于多种技术平台生成的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的转座元件（TE）表达定量流程 | 首次开发了针对TE的scRNA-seq定量工具，提高了TE表达量测定的准确性 | NA | 解决目前缺乏针对TE的scRNA-seq定量工具的问题，以解析单细胞分辨率的TE表达动态 | 转座元件（TE）及其在单细胞RNA测序数据中的表达 | RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 包括小鼠胚胎干细胞和早期胚胎发育阶段的scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 171 | 2024-08-07 |
Fibrinolysis influences SARS-CoV-2 infection in ciliated cells
2021-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2021.01.07.425801
PMID:33442688
|
研究论文 | 研究分析了单细胞RNA测序数据，探讨了纤溶酶在SARS-CoV-2感染纤毛细胞中的作用及其与ENaC蛋白的相互作用 | 首次揭示了SARS-CoV-2通过与ENaC纤溶酶网络相互作用，加速病毒侵入易感细胞，并可能导致与ENaC相关的肺水肿呼吸状况 | NA | 探讨SARS-CoV-2感染纤毛细胞的机制及其与ENaC蛋白的相互作用 | 纤溶酶、ENaC蛋白、SARS-CoV-2受体ACE2在不同细胞类型中的表达 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及不同类型的上皮细胞和白细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 172 | 2024-08-07 |
Co-stimulation with opposing macrophage polarization cues leads to orthogonal secretion programs in individual cells
2021-01-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20540-2
PMID:33436596
|
research paper | 本研究使用单细胞RNA测序探索在同时刺激炎症因子LPS和IFN-γ以及解决性细胞因子IL-4的情况下，单个巨噬细胞的响应机制 | 研究发现，负交叉调控导致单个共刺激巨噬细胞中T细胞极化细胞因子基因Il6和Il12b与IL-4相关因子Arg1和Chil3的互斥表达 | NA | 探讨巨噬细胞在同时接受不同刺激信号时的转录响应和功能多样性 | 巨噬细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个单个巨噬细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 173 | 2024-08-07 |
Cardiomyocytes stimulate angiogenesis after ischemic injury in a ZEB2-dependent manner
2021-01-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20361-3
PMID:33398012
|
研究论文 | 本文研究了转录因子ZEB2在心肌细胞中的作用，特别是在缺血损伤后促进血管生成的能力 | 首次揭示了ZEB2在心肌细胞中的增加及其通过调节心肌细胞与内皮细胞间的对话来增强缺血后血管生成的机制 | NA | 探索增强心脏修复和恢复血管网络的因素 | 心肌细胞中的转录因子ZEB2及其在缺血损伤后的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 174 | 2024-08-07 |
Cholesterol-Induced Phenotypic Modulation of Smooth Muscle Cells to Macrophage/Fibroblast-like Cells Is Driven by an Unfolded Protein Response
2021-01, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.120.315164
PMID:33028096
|
research paper | 研究胆固醇诱导的血管平滑肌细胞向巨噬细胞/成纤维细胞样细胞表型转变的分子途径 | 揭示了未折叠蛋白反应（UPR）在胆固醇诱导的血管平滑肌细胞表型转变中的必要性和充分性 | NA | 探究胆固醇诱导血管平滑肌细胞表型转变的分子机制 | 血管平滑肌细胞（SMCs）及其在胆固醇暴露下的表型变化 | NA | 心血管疾病 | NA | NA | RNA sequencing | NA | NA | NA | NA | NA |
| 175 | 2024-08-07 |
Ndufs1 Deficiency Aggravates the Mitochondrial Membrane Potential Dysfunction in Pressure Overload-Induced Myocardial Hypertrophy
2021, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2021/5545261
PMID:33763166
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析scRNA-seq和微阵列数据，探讨了Ndufs1缺乏在压力超负荷诱导的心肌肥大中的作用及其机制。 | 首次揭示了Ndufs1在压力超负荷诱导的心肌肥大中的关键作用，并通过动物实验和细胞模型验证了其对线粒体功能的影响。 | 研究主要集中在细胞和动物模型上，尚未在人体中进行验证。 | 探讨Ndufs1缺乏在压力超负荷诱导的心肌肥大中的作用及其机制。 | Ndufs1在心肌肥大中的作用及其对线粒体功能的影响。 | NA | 心血管疾病 | scRNA-seq, 微阵列 | NA | 基因表达数据 | 使用TAC小鼠模型和Ang II诱导的心肌细胞模型进行研究。 | NA | NA | NA | NA |
| 176 | 2024-08-07 |
Loss of Claudin-3 Impairs Hepatic Metabolism, Biliary Barrier Function, and Cell Proliferation in the Murine Liver
2021, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.04.003
PMID:33866021
|
研究论文 | 本文研究了紧密连接蛋白claudin-3在小鼠肝脏中的细胞类型特异性表达及其对肝脏代谢、屏障功能和细胞增殖的影响 | 首次探讨了claudin-3在肝脏代谢、屏障功能和细胞增殖中的具体作用 | NA | 探究紧密连接蛋白claudin-3在肝脏中的功能及其对代谢和屏障功能的影响 | 小鼠肝脏中的紧密连接蛋白claudin-3及其相关代谢和屏障功能 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | Cldn3-/-和Cldn3+/+小鼠的肝脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 177 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Immunological Profiles of Renal Allograft Rejection in Mice
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.693608
PMID:34367152
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了小鼠肾移植排斥模型中的免疫细胞特征 | 首次揭示了从小鼠急性排斥到慢性排斥过程中免疫细胞类型的变化及其对排斥过程的影响 | NA | 研究肾移植排斥过程中的免疫细胞特征及其变化 | 小鼠肾移植排斥模型中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10,921个白细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 178 | 2024-08-07 |
Integrated Systems Analysis of the Murine and Human Pancreatic Cancer Glycomes Reveals a Tumor-Promoting Role for ST6GAL1
2021, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2021.100160
PMID:34634466
|
研究论文 | 本文通过系统方法整合了KC小鼠和人类胰腺癌患者的糖组分析，识别了在癌症形成中可能起作用的糖类 | 创建了一种新型小鼠模型，通过胰腺特异性遗传删除ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 1酶，研究其对胰腺癌的影响 | 某些人类糖组变化在KC小鼠模型中未观察到 | 识别在胰腺癌形成中起作用的糖类，并开发针对这些糖类的治疗方法 | 小鼠和人类胰腺癌样本的糖组 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 糖组分析 | NA | 序列数据 | 包括KC小鼠模型和人类胰腺癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 179 | 2024-08-07 |
Deep Parallel Characterization of AAV Tropism and AAV-Mediated Transcriptional Changes via Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.730825
PMID:34759919
|
研究论文 | 本文开发了一种实验和计算相结合的单细胞RNA测序（scRNA-seq）流程，用于高分辨率地表征编码rAAV池的趋向性和响应 | 首次采用scRNA-seq技术并行表征AAV的趋向性和转录变化，发现了未被识别的AAV衣壳靶向偏差和细胞类型特异性的短暂反应 | NA | 旨在开发安全且精确的基因递送载体，并展示在单细胞水平上理解基因疗法响应的重要性 | 重组腺相关病毒（rAAV）的趋向性和转录变化 | 基因疗法 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及多种细胞和组织类型 | NA | NA | NA | NA |
| 180 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Identifies Phagocytosis-Related Dual-Feature Cells in A Model of Acute Otitis Media in Rats
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.760954
PMID:34759932
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，在急性中耳炎的大鼠模型中识别出与吞噬作用相关的双特征细胞 | 首次在急性中耳炎模型中发现具有吞噬作用相关双特征的稀有细胞群，并揭示了巨噬细胞在炎症反应中的关键作用 | NA | 探究急性中耳炎发展的分子机制及多细胞生态系统中的细胞间对话 | 大鼠急性中耳炎模型中的中耳黏膜细胞 | 数字病理学 | 耳部疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 共测序了来自炎症中耳黏膜的7023个细胞和健康中耳黏膜的5258个细胞 | NA | NA | NA | NA |