单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 709 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-05 |
A novel Oct4/Pou5f1-like non-coding RNA controls neural maturation and mediates developmental effects of ethanol
2021 Jan-Feb, Neurotoxicology and teratology
IF:2.6Q3
DOI:10.1016/j.ntt.2020.106943
PMID:33221301
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研究论文 | 这篇文章研究了一种新的非编码RNA如何影响神经元成熟和乙醇的发育效应。 | 发现了一种新的与Oct4/Pou5f1相关的非编码RNA mOct4pg9，它在神经干细胞的自我更新和乙醇暴露的影响中扮演了重要角色。 | 在研究中未详细阐述mOct4pg9的具体机制及其在不同发展阶段的作用 | 探讨乙醇暴露如何导致神经干细胞的丧失及其相关机制 | 小鼠胚胎皮质来源的神经干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | RNA | NA |
| 62 | 2024-08-05 |
No detectable alloreactive transcriptional responses under standard sample preparation conditions during donor-multiplexed single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells
2021-01-20, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-020-00941-x
PMID:33472616
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研究论文 | 这篇文章探讨在标准样本制备条件下，混合来自无关供体的外周血单核细胞是否会引起可检测的异体反应。 | 首次评估在标准scRNA-seq样本制备条件下，混合外周血单核细胞是否导致显著的基因表达变化。 | 未考虑在其他样本制备条件下的潜在异体反应。 | 确定在单细胞RNA测序中的样本混合是否引起异体反应。 | 外周血单核细胞（PBMCs）来自无关供体。 | 数字病理学 | NA | 10x Genomics scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 一个供体的PBMCs，与无关供体的PBMCs混合 |
| 63 | 2024-08-05 |
Intratumoral injection of caerin 1.1 and 1.9 peptides increases the efficacy of vaccinated TC-1 tumor-bearing mice with PD-1 blockade by modulating macrophage heterogeneity and the activation of CD8+ T cells in the tumor microenvironment
2021, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.1335
PMID:34429969
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研究论文 | 本文展示了结合E7抗原特异性免疫疗法及IL-10和PD-1阻断剂，局部注射caerin 1.1/1.9肽能增强TC-1肿瘤微环境的免疫活性 | 首次展示了caerin 1.1/1.9肽在结合抗PD-1治疗下对肿瘤免疫细胞类型的影响 | 该研究未详细探讨不同剂量的caerin肽对免疫反应的影响 | 改善临床免疫疗法对肿瘤的响应 | 接种E7抗原的TC-1肿瘤小鼠 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术、单细胞转录组学与蛋白质组学 | NA | 细胞, 蛋白质 | 受试者为接种E7抗原的TC-1肿瘤小鼠 |
| 64 | 2024-08-05 |
XIAP Knockdown in Alcohol-Associated Liver Disease Models Exhibits Divergent in vitro and in vivo Phenotypes Owing to a Potential Zonal Inhibitory Role of SMAC
2021, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2021.664222
PMID:34025452
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研究论文 | 研究了XIAP在酒精相关肝病模型中的功能及其相应表型差异 | 提出了SMAC在不同区域的抑制作用可能解释了XIAP缺失小鼠未出现疾病加重表型的机制 | 缺乏对XIAP缺失导致炎症反应机制的全面理解 | 探讨XIAP在酒精相关肝病发生中的作用 | 小鼠模型中XIAP基因缺失对肝脏细胞的影响 | 数字病理学 | 肝病 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 使用了多种小鼠模型 |
| 65 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq unravels tumour heterogeneity plus M2-like tumour-associated macrophage infiltration and aggressiveness in TNBC
2021-Jan, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-020-02669-7
PMID:32681241
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研究论文 | 本研究分析了三阴性乳腺癌中的肿瘤异质性和M2型肿瘤相关巨噬细胞浸润及其侵袭性 | 结合单细胞和整体组织转录组分析揭示了肿瘤异质性和免疫微环境与临床结果之间的关联 | 研究的局限性未在摘要中明确提及 | 探索三阴性乳腺癌中肿瘤异质性及M2型肿瘤相关巨噬细胞的作用 | 三阴性乳腺癌患者的肿瘤细胞和肿瘤浸润的免疫细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序和整体RNA测序 | 随机森林和支持向量机（SVM），深度学习神经网络 | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 66 | 2024-08-07 |
Deconvolution Tactics and Normalization in Renal Spatial Transcriptomics
2021, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2021.812947
PMID:35095570
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综述 | 本文综述了2021年印第安纳州O'Brien显微镜中心研讨会上讨论的各种去卷积策略，并探讨了肾空间转录组学中的归一化和批次效应校正应用。 | 介绍了Seurat转移评分方法、SPOTlight、鲁棒细胞类型分解和BayesSpace等独特的去卷积技术。 | 文中提到的空间基因表达平台尚未达到单细胞分辨率。 | 探讨肾空间转录组学中的去卷积策略和归一化方法。 | 肾组织中的异质细胞群及其在空间转录组学中的表达特征。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | NA |
| 67 | 2024-08-07 |
Disparate Interferon Signaling and Shared Aberrant Basaloid Cells in Single-Cell Profiling of Idiopathic Pulmonary Fibrosis and Systemic Sclerosis-Associated Interstitial Lung Disease
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.595811
PMID:33859634
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了特发性肺纤维化（IPF）和系统性硬化症相关间质性肺病（SSc-ILD）患者的肺组织样本，以分析细胞类型特异性转录组的共性和差异 | 首次在SSc-ILD中鉴定出表现出细胞衰老和上皮-间质转化标志的异常基底样细胞 | NA | 探讨IPF和SSc-ILD之间细胞类型和信号通路的差异，以及这些差异在两种疾病中的作用 | IPF和SSc-ILD患者的肺组织样本 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 21个移植肺组织样本 |
| 68 | 2024-08-07 |
PNOC Expressed by B Cells in Cholangiocarcinoma Was Survival Related and LAIR2 Could Be a T Cell Exhaustion Biomarker in Tumor Microenvironment: Characterization of Immune Microenvironment Combining Single-Cell and Bulk Sequencing Technology
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.647209
PMID:33841428
|
研究论文 | 本研究通过结合批量测序和单细胞测序技术，探讨了胆管癌中的免疫浸润相关基因，特别是PNOC和LAIR2的作用 | 首次通过单细胞和批量测序技术结合，揭示了PNOC和LAIR2在胆管癌免疫浸润中的作用及其与患者生存的关系 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据，可能存在样本选择偏倚；未涉及临床干预性试验 | 探索胆管癌中的免疫浸润相关基因及其对患者生存的影响 | 胆管癌患者的免疫浸润状态及相关基因PNOC和LAIR2的表达 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞测序和批量测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了TCGA CHOL, GSE32225, GSE26566和GSE138709的数据集 |
| 69 | 2024-08-07 |
The Physiology of Reproduction - Quo vadis?
2021, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2021.650550
PMID:33859571
|
研究论文 | 本文探讨了男性和女性生殖系统的生理动态性，并强调了当前对这一系统理解的不完整性 | 文章提出了微流控技术、干细胞生物学和单细胞转录组学与组织动态的整合作为解决当前理解不足的可能方法 | 尽管分子科学的进步有助于更详细地描述生殖系统的组成部分，但这些组件如何在时间和空间维度上相互作用和功能仍不清楚 | 旨在深入理解生殖系统的正常功能以及其在疾病、环境内分泌干扰物影响和衰老中的作用 | 研究对象包括生殖系统的生理动态性、信息网络和过程的质与量维度，以及其在整个生命周期中的作用 | NA | NA | 微流控技术、干细胞生物学、单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-08-07 |
Single-Cell Analysis of Antigen-Specific CD8+ T-Cell Transcripts Reveals Profiles Specific to mRNA or Adjuvanted Protein Vaccines
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.757151
PMID:34777370
|
研究论文 | 本研究使用单细胞分析技术，通过小鼠模型研究了针对核酸和蛋白质基流感疫苗候选物的免疫优势血凝素（HA）特异性CD8+ T细胞反应 | 本研究通过单细胞转录组分析，发现了独特的CD8+ T细胞亚群，这些细胞在接种疫苗后共表达细胞毒性基因，并揭示了先前未检测到的抗原特异性CD8+ T细胞 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现 | 深入理解T细胞分化的分子机制，并探索单细胞分析在免疫反应研究中的应用 | CD8+ T细胞在接种核酸和蛋白质基流感疫苗后的反应 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 |
| 71 | 2024-08-07 |
scNetViz: from single cells to networks using Cytoscape
2021, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.52460.1
PMID:34912541
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为scNetViz的Cytoscape应用程序，用于通过网络分析帮助解释scRNA-seq数据中的细胞集群 | scNetViz通过计算每个基因在集群间的差异表达，并创建集群特异性的基因功能交互网络，为scRNA-seq数据分析提供了新的工具 | NA | 开发一个工具，通过网络生物学方法分析scRNA-seq数据，以深入理解驱动组织细胞类型异质性的基因 | scRNA-seq数据中的细胞集群及其基因表达模式 | 分子生物学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 72 | 2024-08-07 |
Loss of Adam10 Disrupts Ion Transport in Immortalized Kidney Collecting Duct Cells
2021, Function (Oxford, England)
DOI:10.1093/function/zqab024
PMID:34131651
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研究论文 | 研究通过CRISPR-Cas9技术敲除mCCD细胞中的Adam10基因，观察其对钠转运能力和醛固酮反应的影响 | 首次揭示了Adam10基因敲除对肾皮质集合管细胞中钠转运和细胞标记物分布的影响 | 仅限于mCCD细胞系和特定基因敲除，可能不完全代表体内情况 | 探讨Adam10基因在肾皮质集合管细胞中的功能及其对离子转运的影响 | 自永生化的肾皮质集合管细胞系mCCD | NA | NA | CRISPR-Cas9技术，单细胞RNA测序，免疫染色 | NA | 单细胞RNA测序数据，免疫染色图像 | 多个独立的mCCD细胞克隆 |
| 73 | 2024-08-07 |
Single-Cell Sequencing of Hepatocellular Carcinoma Reveals Cell Interactions and Cell Heterogeneity in the Microenvironment
2021, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S338090
PMID:34992435
|
研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析了肝细胞癌（HCC）样本和正常肝组织样本，揭示了微环境中的细胞相互作用和细胞异质性 | 本研究通过单细胞测序数据识别了新的HCC预后标志物，包括ALDOB, APOC3, APOH等10个关键基因 | NA | 旨在基于单细胞测序数据识别肝细胞癌的新预后标志物 | 肝细胞癌（HCC）样本和正常肝组织样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 21个HCC样本和256个正常肝组织样本 |
| 74 | 2024-08-07 |
A Single-Cell Transcriptome Profiling of Anterior Kidney Leukocytes From Nile Tilapia (Oreochromis niloticus)
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.783196
PMID:35027916
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术，对尼罗罗非鱼前肾中的白细胞进行了转录模式分析 | 首次使用单细胞转录组测序技术研究尼罗罗非鱼前肾白细胞的异质性，并识别出多种免疫细胞亚群 | 未能根据已知的特定标记物更详细地识别髓系细胞亚群 | 揭示尼罗罗非鱼前肾白细胞的亚群及其潜在标记物 | 尼罗罗非鱼前肾中的白细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 11,388个前肾白细胞 |
| 75 | 2024-08-07 |
Natural Barcodes for Longitudinal Single Cell Tracking of Leukemic and Immune Cell Dynamics
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.788891
PMID:35046946
|
review | 本文综述了利用染色体拷贝数变化、体细胞核和线粒体DNA突变、单核苷酸多态性以及T和B细胞受体序列作为个人自然条形码，在单细胞分析工作流程中的技术实现及其应用 | 介绍了多模态单细胞测序技术的新平台，以及如何利用分子事件作为条形码追踪恶性细胞和免疫细胞群体随时间的变化 | NA | 探讨血液恶性肿瘤治疗瓶颈后疾病演变的纵向追踪以及抗肿瘤免疫变化监测的新方法 | 血液恶性肿瘤中的恶性细胞和免疫细胞动态 | digital pathology | 血液恶性肿瘤 | multi-modal single-cell sequencing | NA | DNA 和 RNA 序列 | NA |
| 76 | 2024-08-07 |
Deciphering the Immune-Tumor Interplay During Early-Stage Lung Cancer Development via Single-Cell Technology
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.716042
PMID:35047383
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研究论文 | 本研究利用单细胞技术解码早期肺癌发展过程中的免疫-肿瘤相互作用 | 利用单细胞测序技术探索早期肺癌中肿瘤免疫微环境的详细机制 | 目前主要集中在肿瘤临床可检测的“逃逸”阶段，早期阶段的机制尚不明确 | 深入理解早期肺癌发展过程中免疫反应及其动态变化 | 早期肺癌的免疫-肿瘤相互作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞数据 | 未具体说明 |
| 77 | 2024-08-07 |
Principles of Spatial Transcriptomics Analysis: A Practical Walk-Through in Kidney Tissue
2021, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2021.809346
PMID:35069263
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review | 本文综述了空间转录组技术及其在肾脏组织中的应用，特别是Slide-seqV2技术的使用 | 介绍了Slide-seqV2技术在近单细胞分辨率下收集空间转录组数据的能力 | NA | 探讨空间转录组技术在肾脏组织中的应用，并展示如何通过这些技术进行细胞类型映射和空间细胞类型及转录组特征分析 | 肾脏组织及其空间结构中的细胞和基因表达特征 | digital pathology | NA | Slide-seqV2 | NA | 转录组数据 | NA |
| 78 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Cellular and Transcriptional Changes Associated With M1 Macrophage Polarization in Hidradenitis Suppurativa
2021, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2021.665873
PMID:34504848
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和蛋白质分析等转录组学方法，揭示了化脓性汗腺炎病变中与M1巨噬细胞极化相关的细胞和转录变化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了化脓性汗腺炎中巨噬细胞向M1型极化的现象，并识别了STAT1/IFN信号轴及其相关基因在巨噬细胞功能失调中的关键作用 | NA | 研究化脓性汗腺炎病变中的先天性炎症景观，并探索巨噬细胞在疾病发病机制中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 化脓性汗腺炎病变中的巨噬细胞极化和相关基因表达 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自化脓性汗腺炎皮肤、糖尿病足溃疡和正常愈合伤口炎症阶段的多个数据集 |
| 79 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing (scRNA-seq) in Cardiac Tissue: Applications and Limitations
2021, Vascular health and risk management
IF:2.6Q2
DOI:10.2147/VHRM.S288090
PMID:34629873
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在心血管疾病（CVDs）研究中的应用及其局限性 | scRNA-seq技术通过识别罕见的心脏细胞类型、推断轨迹树、估计RNA速度、阐明细胞间通信以及比较健康和病理心脏样本，为CVDs提供了新的见解 | 本文讨论了scRNA-seq技术的局限性，并展望了其在心血管研究中的未来应用 | 总结scRNA-seq平台和已发表的单细胞数据集在心血管领域的应用，并探讨其局限性和未来发展方向 | 心血管疾病中的心脏组织和细胞类型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 80 | 2024-08-07 |
Single-Cell Analysis Revealed the Role of CD8+ Effector T Cells in Preventing Cardioprotective Macrophage Differentiation in the Early Phase of Heart Failure
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.763647
PMID:34745139
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，揭示了CD8+效应T细胞在心力衰竭早期阶段阻止心脏保护性巨噬细胞分化的作用 | 首次详细描述了CD8+效应T细胞在心力衰竭早期阶段对心脏保护性巨噬细胞分化的调控作用 | NA | 探讨CD8+效应T细胞在心力衰竭早期阶段的作用及其对心脏保护性巨噬细胞分化的影响 | CD8+效应T细胞和心脏保护性巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |