单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
701	2024-08-09	Investigating Inter- and Intrasample Diversity of Single-Cell RNA Sequencing Datasets 2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-0849-4_10 PMID:32926367	研究论文	本文提供了一个实用指南，用于计算单细胞RNA测序数据集的样本间和样本内多样性指标	将统计学和生态学中常用的多样性指标应用于单细胞分辨率下样本异质性的量化和比较	NA	探讨肿瘤异质性的来源及其对不良结果的影响	单细胞RNA测序数据集的样本间和样本内多样性	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	多个不同样本
702	2024-08-09	Reinvigorating exhausted CD8+ cytotoxic T lymphocytes in the tumor microenvironment and current strategies in cancer immunotherapy 2021-01, Medicinal research reviews IF:10.9Q1 DOI:10.1002/med.21727 PMID:32844499	综述	本文综述了肿瘤微环境中耗竭的CD8+细胞毒性T淋巴细胞的激活以及当前癌症免疫治疗策略	探讨了CD8 T细胞耗竭的内在和外在机制，并利用单细胞RNA测序或质谱流式细胞术（CyTOF）描绘了转录和表观遗传景观	尽管免疫治疗在癌症患者中显示出益处，但仍需努力完全规避耗竭T细胞在治疗中的局限性	旨在探讨和描述基于免疫治疗激活耗竭CD8 T细胞的假设性治疗途径	肿瘤微环境中耗竭的CD8+细胞毒性T淋巴细胞	免疫治疗	癌症	单细胞RNA测序，质谱流式细胞术（CyTOF）	NA	转录和表观遗传数据	NA
703	2024-08-09	Cell Surface Protein mRNAs Show Differential Transcription in Pyramidal and Fast-Spiking Cells as Revealed by Single-Cell Sequencing 2021-01-05, Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991) DOI:10.1093/cercor/bhaa195 PMID:32710103	研究论文	本研究通过单细胞mRNA测序技术，揭示了前额叶皮层中锥体细胞和快速放电细胞表面蛋白mRNA的差异转录	首次通过单细胞测序技术，识别了前额叶皮层中锥体细胞和快速放电细胞的特定表达转录本，并将其与精神疾病相关的细胞机制联系起来	研究仅限于小鼠前额叶皮层的急性脑切片，未来研究需扩展到更多物种和更广泛的脑区	扩展药物治疗的可能性，并更好地理解临床使用药物的细胞和网络效应	前额叶皮层中的锥体细胞和快速放电细胞	神经科学	精神疾病	单细胞mRNA测序	NA	mRNA	19,685个转录本
704	2024-08-09	Interactions of Hematopoietic Stem Cells with Bone Marrow Niche 2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/7651_2020_298 PMID:32504296	研究论文	本文探讨了造血干细胞（HSCs）与骨髓微环境（niche）的相互作用	应用小鼠模型、高级成像技术、高通量单细胞RNA测序和单细胞质谱流式技术深入研究了HSCs与niche细胞的通信	NA	研究HSCs与骨髓微环境中三种重要细胞类型的相互作用	造血干细胞（HSCs）与骨髓微环境中的间充质干细胞（MSCs）、成骨细胞（OBs）和内皮细胞（ECs）	NA	NA	流式细胞术、单细胞RNA测序、单细胞质谱流式技术	NA	细胞	使用C57BL/6小鼠的股骨和胫骨中的骨髓
705	2024-08-09	Targeting dual signalling pathways in concert with immune checkpoints for the treatment of pancreatic cancer 2021-01, Gut IF:23.0Q1 DOI:10.1136/gutjnl-2020-321000 PMID:32424005	研究论文	本研究利用分子靶向治疗与免疫检查点抑制的交叉点，探索治疗胰腺癌的新方法	发现MEK和CDK4/6抑制剂联合治疗在多种PDX模型中有效延缓肿瘤进展，并能增强T细胞浸润和改变骨髓细胞群，与免疫检查点抑制剂协同作用	NA	定义治疗胰腺癌的新方法	患者来源的细胞系和异种移植模型	NA	胰腺癌	单细胞RNA测序和多光谱成像	NA	细胞系和异种移植模型	多种PDX模型
706	2024-08-09	SCCLRR: A Robust Computational Method for Accurate Clustering Single Cell RNA-Seq Data 2021-01, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1 DOI:10.1109/JBHI.2020.2991172 PMID:32356764	研究论文	本文提出了一种名为SCCLRR的新型细胞类型检测方法，通过学习一个稳健且准确的相似矩阵来识别单细胞RNA测序数据中的子群体	SCCLRR方法结合了低秩表示框架，同时捕捉数据的全局和局部内在属性，并使用归一化欧氏距离和余弦相似度来平衡数据的线性和非线性流形	NA	开发一种新的计算方法，用于准确和稳健地聚类单细胞RNA测序数据	单细胞RNA测序数据	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	低秩表示框架	RNA测序数据	九个真实的单细胞RNA测序数据集
707	2024-08-09	YAP1 mediates gastric adenocarcinoma peritoneal metastases that are attenuated by YAP1 inhibition 2021-01, Gut IF:23.0Q1 DOI:10.1136/gutjnl-2019-319748 PMID:32345613	研究论文	本研究探讨了YAP1在胃腺癌腹膜转移中的作用及其作为治疗靶点的潜力	首次揭示了YAP1在腹膜癌病中的重要作用，并证明了YAP1抑制剂在治疗中的有效性	NA	研究YAP1在胃腺癌腹膜转移中的作用及其作为治疗靶点的潜力	患者来源的腹膜癌细胞、患者来源的异种移植模型和患者来源的原位模型	数字病理学	胃癌	免疫荧光染色、免疫组织化学染色、RNA测序（RNA-Seq）和单细胞RNA测序（sc-RNA-Seq）	NA	细胞	约45%的晚期胃腺癌患者
708	2024-08-09	The quiescent fraction of chronic myeloid leukemic stem cells depends on BMPR1B, Stat3 and BMP4-niche signals to persist in patients in remission 2021-01-01, Haematologica IF:8.2Q1 DOI:10.3324/haematol.2019.232793 PMID:32001529	研究论文	本文研究了BMP信号通路在慢性髓性白血病（CML）患者骨髓中残留白血病干细胞持续存在中的作用	首次揭示了BMPR1B+细胞在粘附于基质细胞时表现出静止状态，并且这种静止状态是由治疗诱导的	NA	探讨BMP信号通路在CML患者治疗后残留白血病干细胞持续存在中的作用	慢性髓性白血病患者的白血病干细胞	NA	白血病	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
709	2024-08-09	Evaluating genetic causes of azoospermia: What can we learn from a complex cellular structure and single-cell transcriptomics of the human testis? 2021-Jan, Human genetics IF:3.8Q2 DOI:10.1007/s00439-020-02116-8 PMID:31950241	综述	本文综述了无精症的遗传原因，并探讨了人类睾丸的复杂细胞结构和单细胞转录组学在不同类型无精症中的应用	利用下一代测序技术，通过单细胞RNA测序获得了详细的细胞类型特异性表达模式，并结合现有数据集进行综合分析	需要对高度复杂的数据处理和可视化方法有深入了解才能正确解读单细胞RNA测序数据	探讨无精症的遗传原因及其对睾丸病理的影响	人类睾丸的细胞结构和单细胞转录组学	数字病理学	男性不育症	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	62,751个睾丸细胞，每个细胞中位数为2637个转录本