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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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681 | 2024-08-09 |
Toxicity in hematopoietic stem cells from bone marrow and peripheral blood in mice after benzene exposure: Single-cell transcriptome sequencing analysis
2021-Jan-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2020.111490
PMID:33120278
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研究论文 | 本研究使用Smart-seq2单细胞转录组测序技术,分析了苯暴露后小鼠骨髓和外周血造血干细胞的转录组变化 | 首次报道了苯暴露后造血干细胞的转录组特征,并通过加权基因共表达网络分析揭示了关键的生物学途径 | NA | 探究苯暴露对造血干细胞的毒性作用及其分子机制 | 小鼠骨髓和外周血中的造血干细胞 | 数字病理学 | 白血病 | Smart-seq2单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 使用了苯处理的C57B/6雄性小鼠的骨髓和外周血造血干细胞样本 |
682 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis of tumor-infiltrating B cells reveals their clinical implications in non-small cell lung cancer
2021-01, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.13719
PMID:33124202
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
683 | 2024-08-09 |
New insights into macrophage heterogeneity in rheumatoid arthritis
2021-01, Joint bone spine
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jbspin.2020.105091
PMID:33130232
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综述 | 本文综述了类风湿性关节炎中巨噬细胞异质性的最新研究进展 | 应用单细胞RNA测序技术深入研究了巨噬细胞亚群及其在人和小鼠滑膜关节组织中的潜在功能 | NA | 旨在识别可能放大炎症反应或促进组织稳态恢复的滑膜巨噬细胞亚群 | 类风湿性关节炎中的巨噬细胞亚群及其功能 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
684 | 2024-08-09 |
There and back again: The mechanisms of differentiation and transdifferentiation in Drosophila blood cells
2021-01-01, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2020.10.006
PMID:33131706
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研究论文 | 本文总结了果蝇血细胞中浆细胞向包囊细胞转分化的现有数据,并尝试将其与基于转录组的血细胞聚类相结合,以更好地理解果蝇中转分化的机制。 | 利用最新的单细胞测序方法对果蝇幼虫中的吞噬血细胞进行聚类分析,以研究转分化的机制。 | NA | 研究果蝇血细胞中转分化的机制。 | 果蝇血细胞中的浆细胞和包囊细胞。 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |
685 | 2024-08-09 |
In silico analysis of inner ear development using public whole embryonic body single-cell RNA-sequencing data
2021-01-01, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2020.10.009
PMID:33131705
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研究论文 | 本研究利用公共的全胚胎单细胞RNA测序数据,通过计算机模拟分析早期内耳发育中的谱系特异性基因 | 本研究首次利用单细胞RNA测序数据,识别并分类了内耳早期发育中的15个细胞簇,并鉴定了多个谱系特异性基因候选 | NA | 旨在识别早期内耳发育中的谱系特异性基因 | 内耳的四个上皮域及其亚区域 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 5000个单细胞转录组数据 |
686 | 2024-08-09 |
PlacentaCellEnrich: A tool to characterize gene sets using placenta cell-specific gene enrichment analysis
2021-01-01, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2020.10.029
PMID:33137644
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研究论文 | 开发了一个名为PlacentaCellEnrich的工具,用于分析基因集在胎盘细胞特异性表达模式中的富集情况 | 利用单细胞RNA测序(scRNA-Seq)数据,开发了一个新的工具PlacentaCellEnrich,用于分析基因集在胎盘细胞特异性表达模式中的富集情况 | NA | 旨在开发一个工具,帮助理解模型系统中的表达模式与人类胎盘早期表达模式的对应关系 | 人类胎盘的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | NA |
687 | 2024-08-09 |
Neuroblastoma and Stem Cell Therapy: An Updated Review
2021, CNS & neurological disorders drug targets
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综述 | 本文综述了神经母细胞瘤的发病机制及干细胞疗法在治疗神经母细胞瘤中的应用 | 探讨了通过单细胞RNA测序技术和计算方法揭示神经母细胞瘤异质性的新途径 | 目前研究主要基于大量细胞分析,对细胞群体信息提供有限 | 讨论神经母细胞瘤的发病机制及干细胞疗法的应用 | 神经母细胞瘤及其治疗 | NA | 儿童癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
688 | 2024-08-09 |
Intravenous nanoparticle vaccination generates stem-like TCF1+ neoantigen-specific CD8+ T cells
2021-01, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-00810-3
PMID:33139915
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研究论文 | 研究通过静脉注射纳米颗粒疫苗诱导肿瘤新抗原特异性CD8+ T细胞,并探讨了不同接种途径对T细胞数量和质量的影响 | 首次展示了静脉注射纳米颗粒疫苗能诱导产生干细胞样TCF1+新抗原特异性CD8+ T细胞,并在治疗模型中显示出优越的抗肿瘤反应 | NA | 优化抗肿瘤免疫反应,通过调节疫苗参数生成特定类型的CD8 T细胞 | 肿瘤新抗原特异性CD8+ T细胞的生成和功能 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
689 | 2024-08-09 |
Lung megakaryocytes are immune modulatory cells
2021-01-04, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI137377
PMID:33079726
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研究论文 | 本文研究了肺巨核细胞(MkL)的免疫调节功能 | 首次发现肺巨核细胞具有类似于抗原呈递细胞的基因表达模式,并能内化和处理抗原蛋白及细菌病原体 | NA | 探讨肺巨核细胞的免疫功能 | 肺巨核细胞(MkL)及其免疫调节作用 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
690 | 2024-08-09 |
Defining circulating mononuclear cells in heart failure through single-cell RNA sequencing: new insights for an old disease
2021-01-21, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaa156
PMID:33049776
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
691 | 2024-08-09 |
Integrated bulk and single-cell RNA-sequencing identified disease-relevant monocytes and a gene network module underlying systemic sclerosis
2021-01, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2020.102547
PMID:33039247
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研究论文 | 本研究通过综合分析批量和单细胞RNA测序数据,识别了与系统性硬化症(SSc)相关的单核细胞群和一个基因网络模块 | 首次通过综合批量和单细胞RNA测序分析,揭示了与SSc病理生理相关的炎症基因模块和单核细胞群 | 研究样本仅限于日本SSc患者,可能限制了结果的普遍性 | 评估系统性硬化症中免疫细胞亚群的转录组扰动,并鉴定与疾病相关的基因网络模块和免疫细胞簇 | 系统性硬化症患者和健康对照者的免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | RNA测序 | 随机森林分析 | RNA | 21名系统性硬化症患者和13名年龄性别匹配的健康对照者 |
692 | 2024-08-09 |
Fixed single-cell RNA sequencing for understanding virus infection and host response
2021-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2020.09.17.302232
PMID:32995793
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FD-seq的高通量方法,用于对甲醛固定的、染色和分选的单细胞进行基于液滴的RNA测序,以理解病毒感染和宿主反应 | FD-seq方法在固定和随后的细胞回收过程中保持了mRNA的完整性和相对丰度,并且检测到的基因和转录本数量比甲醇固定更多 | NA | 研究病毒感染和宿主反应 | 单细胞RNA测序技术 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 文本 | NA |
693 | 2024-08-09 |
SC2disease: a manually curated database of single-cell transcriptome for human diseases
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa838
PMID:33010177
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research paper | SC2disease是一个人工 curated 的数据库,旨在为不同疾病提供各种细胞类型的基因表达谱的综合和准确资源 | SC2disease数据库汇总了使用scRNA-seq技术研究人类疾病的文献数据,提供了系统性、层次化和大规模的细胞水平基因表达谱 | NA | 开发一个全面且准确的数据库,用于汇总和比较不同疾病、组织和细胞类型的基因表达谱 | 人类疾病的细胞类型特异性基因表达谱 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达矩阵 | 946,481个条目,对应341种细胞类型、29种组织和25种疾病 |
694 | 2024-08-09 |
Specimen Preparation for Single-Cell Sequencing Analysis of Skeletal Cells
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0989-7_7
PMID:32979200
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研究论文 | 本文描述了一种从骨骼组织中制备单细胞悬液的方法,以便进行单细胞测序研究 | 介绍了用于骨骼细胞的荧光激活细胞分选(FACS)的附加步骤,使后续的单细胞RNA测序研究能够聚焦于特定的感兴趣群体 | NA | 开发一种有效的方法来制备骨骼细胞的单细胞悬液,以进行单细胞测序分析 | 骨骼细胞及其生物学功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | NA |
695 | 2024-08-09 |
A reliable strategy for single-cell RNA sequencing analysis using cryoconserved primary cortical cells
2021-01-01, Journal of neuroscience methods
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.jneumeth.2020.108960
PMID:32987100
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研究论文 | 本文介绍了一种新的策略,使用冷冻保存的初级皮质细胞进行单细胞RNA测序分析 | 首次展示了在离线设置中使用初级皮质细胞进行单细胞RNA测序实验的可能性,确保了细胞的完整性和多样性 | NA | 验证一种新的策略,使用冷冻保存的初级皮质细胞进行单细胞RNA测序研究 | 从E15.5小鼠胚胎中分离的冷冻保存的初级皮质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNASeq) | NA | RNA | 35,763个冷冻保存的单细胞 |
696 | 2024-08-09 |
Methodologies for Following EMT In Vivo at Single Cell Resolution
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0779-4_23
PMID:32939729
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研究论文 | 本文介绍了一种在单细胞分辨率下研究活体中上皮-间质转化(EMT)的方法,重点是通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术研究特定细胞在EMT过程中的基因表达。 | 本文采用单细胞RNA测序技术,能够在不受到其他细胞群体背景噪声干扰的情况下,研究海胆骨骼细胞在EMT过程中的基因表达。 | 该方法虽然有所改进,但并非完美,仍需进一步优化。 | 旨在开发一种新的方法,以便在单细胞水平上详细研究活体中的EMT过程。 | 研究对象为海胆胚胎中的骨骼细胞,这些细胞在EMT过程中仅占胚胎总细胞数的5%。 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 海胆胚胎中的骨骼细胞,占总细胞数的5% |
697 | 2024-08-09 |
Serial single-cell profiling analysis of metastatic TNBC during Nab-paclitaxel and pembrolizumab treatment
2021-Jan, Breast cancer research and treatment
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10549-020-05936-4
PMID:32949350
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了转移性三阴性乳腺癌患者在接受白蛋白结合型紫杉醇和派姆单抗治疗过程中的肿瘤免疫微环境变化 | 首次在治疗过程中对肿瘤样本进行连续单细胞RNA测序,揭示了化疗和免疫治疗对肿瘤微环境的调节作用 | 研究样本仅限于两名患者,可能无法全面代表所有三阴性乳腺癌患者的治疗反应 | 开发预测性生物标志物并提高化疗与免疫治疗组合的疗效 | 转移性三阴性乳腺癌患者在接受白蛋白结合型紫杉醇和派姆单抗治疗过程中的肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 两名患者 |
698 | 2024-08-09 |
Cell fate specification and differentiation in the adult mammalian intestine
2021-01, Nature reviews. Molecular cell biology
DOI:10.1038/s41580-020-0278-0
PMID:32958874
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研究论文 | 本文探讨了成年哺乳动物肠道中干细胞命运决定和分化的机制 | 利用单细胞转录组学和类器官模型,揭示了指导干细胞后代进入六种肠道细胞谱系的信号 | NA | 研究肠道干细胞的调控和命运决定,以开发利用肠道再生能力和功能的疗法 | 成年哺乳动物肠道中的干细胞及其后代细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学 | 类器官模型 | 转录组数据 | NA |
699 | 2024-08-09 |
Use of Chlamydial Elementary Bodies as Probes to Isolate Pathogen-Specific Human Monoclonal Antibodies
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0795-4_3
PMID:32959238
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研究论文 | 本文介绍了一种利用荧光标记的完整细菌通过流式细胞术从冷冻保存的人外周血单个核细胞样本中识别和分离特定于衣原体的记忆B细胞的新方法 | 该方法允许对活单细胞进行排序,用于细胞培养、体外检测、单细胞RNA测序以及重组单克隆抗体的重链和轻链克隆 | NA | 研究衣原体特异性抗体在预防和清除感染中的作用 | 衣原体特异性记忆B细胞 | NA | 性传播疾病 | 流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
700 | 2024-08-09 |
Human kidney organoids produce functional renin
2021-01, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2020.08.008
PMID:32918942
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研究论文 | 本文利用人诱导多能干细胞衍生的肾脏类器官研究了肾素及其在肾脏中的作用 | 首次展示了人肾脏类器官能够产生功能性肾素,并探讨了其在再生医学中的应用潜力 | NA | 开发用于研究肾素调节及其对肾脏生理学意义的人类模型 | 人诱导多能干细胞衍生的肾脏类器官 | 再生医学 | NA | 单细胞测序、免疫组化、功能性检测 | NA | 细胞 | NA |