单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 709 篇文献，本页显示第 661 - 680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2024-08-09 |
Tutorial: guidelines for the computational analysis of single-cell RNA sequencing data
2021-01, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-020-00409-w
PMID:33288955
|
教程 | 本文介绍了单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的计算分析流程 | 提供了最佳实践指南和实用指南 | NA | 为实验人员提供数据分析指南，为生物信息学家提供新计算方法的概述 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 大量单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 662 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Workflow for Splenic Myeloid-Derived Suppressor Cells from Murine Breast Cancer Models
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1060-2_14
PMID:33237548
|
研究论文 | 本文提供了一种使用单细胞RNA测序（scRNAseq）探索乳腺癌模型中脾脏髓系来源抑制细胞（MDSCs）的详细流程 | 利用单细胞转录组学技术，深入研究了以往未被充分认识的细胞异质性，特别是免疫细胞亚群中的MDSCs | NA | 定义乳腺癌模型中脾脏髓系细胞的独特分子特征 | 乳腺癌模型中的脾脏髓系来源抑制细胞（MDSCs） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组 | 涉及乳腺癌模型小鼠和野生型对照小鼠的脾脏髓系细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 663 | 2024-08-09 |
Identification and characterization of distinct brown adipocyte subtypes in C57BL/6J mice
2021-01, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202000924
PMID:33257475
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析C57BL/6J小鼠棕色脂肪组织中的基质血管部分，鉴定并表征了不同的棕色脂肪细胞亚型 | 首次研究了棕色脂肪细胞亚型的发育起源，并确认了区分棕色脂肪细胞亚型的标记物 | NA | 深入了解棕色前脂肪细胞的异质性 | C57BL/6J小鼠的棕色脂肪组织 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | C57/BL6小鼠的棕色脂肪组织基质血管部分 | NA | NA | NA | NA |
| 664 | 2024-08-09 |
Guidelines for Setting Up a mRNA Sequencing Experiment and Best Practices for Bioinformatic Data Analysis
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1201-9_10
PMID:33263908
|
研究论文 | 本文回顾了转录组分析的关键发展，并详细介绍了mRNA测序实验设计和数据处理的工作流程，以及基于Illumina技术的最佳实践建议 | 讨论了单细胞RNA测序和长读长技术测序的新前沿 | NA | 提供mRNA测序实验设置和生物信息学数据分析的最佳实践指南 | mRNA测序实验和数据分析 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 665 | 2024-08-09 |
Systems analysis of hematopoiesis using single-cell lineage tracing
2021-01, Current opinion in hematology
IF:3.1Q2
DOI:10.1097/MOH.0000000000000624
PMID:33264223
|
研究论文 | 本文综述了单细胞谱系追踪技术在血液生成系统分析中的应用及其最新发现 | 结合单细胞基因组学分析，这些研究允许对小鼠和人类的血液生成进行系统级描述 | 需要进一步研究以完全理解这些技术在人类生物学和疾病中的应用 | 探讨单细胞谱系追踪技术在血液生成研究中的优势、不足以及未来的发展方向 | 血液生成过程中的细胞行为和动态发展过程 | 数字病理学 | NA | 下一代测序 | NA | 单细胞RNA测序 | 数千个造血祖细胞在单个小鼠中 | NA | NA | NA | NA |
| 666 | 2024-08-09 |
Next-Generation Lineage Tracing and Fate Mapping to Interrogate Development
2021-01-11, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.10.021
PMID:33217333
|
review | 本文广泛回顾了命运图谱和谱系追踪方法的起源，并重点介绍了单细胞基因组学进展所允许的谱系追踪的最新发展 | 本文探讨了利用新技术合成高分辨率命运图谱的当前潜力，并讨论了它们在深入探究发育过程中的潜力 | NA | 回顾并探讨命运图谱和谱系追踪技术在发育生物学中的应用 | 命运图谱和谱系追踪技术 | NA | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 667 | 2024-08-09 |
CSEA-DB: an omnibus for human complex trait and cell type associations
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa1064
PMID:33211888
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为CSEA-DB的数据库，用于分析人类复杂性状和细胞类型之间的关联 | 首次提供了一个包含5120个GWAS总结统计数据和超过90万个细胞的综合数据库，通过deTS算法进行了10,250,480次性状-细胞类型关联分析 | NA | 构建一个用于研究人类复杂性状及其潜在细胞类型关联的参考数据库 | 人类复杂性状和细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞技术 | deTS算法 | 基因组数据 | 5120个GWAS总结统计数据，超过90万个细胞，包括752种组织细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 668 | 2024-08-09 |
Lnc2Cancer 3.0: an updated resource for experimentally supported lncRNA/circRNA cancer associations and web tools based on RNA-seq and scRNA-seq data
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa1006
PMID:33219685
|
研究论文 | 本文介绍了Lnc2Cancer 3.0数据库的更新，该数据库包含与人类癌症相关的实验支持的长非编码RNA（lncRNA）和环状RNA（circRNA）的全面数据，并描述了基于RNA测序和单细胞RNA测序的lncRNA表达分析的网络工具。 | Lnc2Cancer 3.0新增了多个功能，包括增加癌症相关lncRNA条目、新增实验支持的circRNA-癌症关联、包含癌症相关lncRNA和circRNA的实验支持的调控机制和生物学功能，以及实验支持的临床相关性。此外，还开发了两个灵活的在线工具，用于快速和自定义分析及可视化癌症中的lncRNA。 | NA | 旨在阐明lncRNA、circRNA与癌症之间的关联 | 长非编码RNA（lncRNA）和环状RNA（circRNA）与人类癌症的关联 | 生物信息学 | 癌症 | RNA测序（RNA-seq）和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 文本 | 当前版本包括9254个lncRNA-癌症关联，涉及2659个lncRNA和216个癌症亚型；新增1049个实验支持的circRNA-癌症关联，涉及743个circRNA和70个癌症亚型 | NA | NA | NA | NA |
| 669 | 2024-08-09 |
A `one-two punch' therapy strategy to target chemoresistance in estrogen receptor positive breast cancer
2021-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2020.100946
PMID:33221681
|
研究论文 | 本研究探讨了在雌激素受体阳性（ER+）转移性乳腺癌中，化疗后出现的耐药亚克隆中癌症干细胞样（CSL）细胞的增加情况，并研究了组蛋白去乙酰化酶（HDAC）抑制剂在逆转这种耐药性中的作用 | 本研究首次展示了HDAC抑制剂在阻止化疗诱导的耐药性表型中的作用，并提出了‘一石二鸟’的治疗策略 | NA | 研究HDAC抑制剂在逆转ER+乳腺癌化疗耐药性中的作用 | 雌激素受体阳性（ER+）转移性乳腺癌细胞 | NA | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 670 | 2024-08-09 |
TISCH: a comprehensive web resource enabling interactive single-cell transcriptome visualization of tumor microenvironment
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa1020
PMID:33179754
|
research paper | 本文介绍了Tumor Immune Single Cell Hub (TISCH)，一个大规模的单细胞转录组数据库，整合了来自27种癌症类型的近200万个细胞的单细胞转录组数据。 | TISCH提供了一个用户友好的界面，用于系统地可视化、搜索和下载肿瘤微环境中的基因表达图谱，支持跨多个数据集的单细胞或集群级别的交互式基因表达可视化。 | NA | 旨在通过整合和利用大量已发表的单细胞RNA-seq数据集，为免疫治疗提供信息支持。 | 肿瘤微环境中的免疫系统异质性。 | digital pathology | NA | single-cell RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 近200万个细胞，来自76个高质量肿瘤数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 671 | 2024-08-09 |
Spatiotemporal sequence of mesoderm and endoderm lineage segregation during mouse gastrulation
2021-01-07, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.193789
PMID:33199445
|
研究论文 | 本文研究了小鼠原条期间中胚层和内胚层谱系分离的时空序列 | 结合遗传命运标记和成像方法与单细胞RNA测序(scRNA-seq)来追踪转录身份并定义细胞类型的谱系轨迹 | NA | 探索小鼠胚胎原条期间中胚层和内胚层谱系分离的精确时空模式和分子细节 | 小鼠胚胎中的中胚层和内胚层谱系 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 672 | 2024-08-09 |
VEGF-B Promotes Endocardium-Derived Coronary Vessel Development and Cardiac Regeneration
2021-01-05, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本文研究了血管内皮生长因子B（VEGF-B）在心脏中促进源自心内膜的冠状血管发育和心脏再生的作用。 | VEGF-B在心脏发育期间促进源自心内膜的冠状血管形成，并在成年小鼠中促进心内膜下心肌的血管内皮细胞增殖，以及心肌梗死后心脏组织的结构和功能恢复。 | NA | 研究VEGF-B在心脏中对冠状血管发育和心脏再生的影响。 | VEGF-B在心脏中的作用及其对冠状血管发育和心脏再生的影响。 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 基因转移，细胞周期标记，流式细胞术，组织学，免疫组织化学，生物化学方法，单细胞RNA测序，生物信息学分析，微型计算机断层扫描，荧光和示踪剂介导的血管灌注成像分析。 | NA | 图像 | 使用表达VEGF-B转基因的小鼠和大鼠，VEGF-B基因敲除的小鼠和大鼠，以及成年小鼠中的病毒载体介导的VEGF-B基因转移。 | NA | NA | NA | NA |
| 673 | 2024-08-09 |
Sharing and Helping: Regularity and Characteristics of Pathogenesis of a Widely Used Transgene Initiated Murine Acute Promyelocytic Leukemia Model
2021-01-01, Stem cells and development
IF:2.5Q2
DOI:10.1089/scd.2020.0125
PMID:33176587
|
研究论文 | 本文通过改进的急性早幼粒细胞白血病（APL）小鼠模型，补充了该模型发病规律和特征的数据 | 本文填补了现有文献中关于该模型发病规律和特征数据的空白 | NA | 旨在补充和完善APL小鼠模型的发病规律和特征数据 | APL小鼠模型的发病时间、潜伏期、发病率、寿命及APL细胞在外周血、脾脏、骨髓中的比例等 | NA | 急性早幼粒细胞白血病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 674 | 2024-08-09 |
Clonal Hematopoiesis-Driver DNMT3A Mutations Alter Immune Cells in Heart Failure
2021-01-22, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.120.317104
PMID:33155517
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了携带DNMT3A突变的慢性心力衰竭患者的外周血单个核细胞的转录组特征 | 首次在人类中定义了由DNMT3A克隆性造血驱动突变介导的炎症免疫细胞亚群 | 样本量较小，需要进一步的大规模研究验证 | 探讨DNMT3A突变在慢性心力衰竭患者中对免疫细胞的影响 | 慢性心力衰竭患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6名携带DNMT3A突变的慢性心力衰竭患者和4名无DNMT3A突变的慢性心力衰竭患者 | NA | NA | NA | NA |
| 675 | 2024-08-09 |
Dynamic single-cell RNA sequencing identifies immunotherapy persister cells following PD-1 blockade
2021-01-19, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI135038
PMID:33151910
|
研究论文 | 本研究通过动态单细胞RNA测序技术，在PD-1阻断治疗的小鼠肿瘤球体中识别出免疫治疗持久细胞（IPCs） | 首次通过动态单细胞RNA测序技术识别出PD-1阻断后的免疫治疗持久细胞，并揭示了其特征和潜在的治疗靶点 | 研究主要在小鼠模型中进行，需要进一步在人体中验证其有效性和安全性 | 揭示PD-1阻断治疗中免疫逃逸的基本机制，并寻找新的治疗靶点 | 小鼠肿瘤球体中的免疫治疗持久细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠肿瘤球体 | NA | NA | NA | NA |
| 676 | 2024-08-09 |
GRNdb: decoding the gene regulatory networks in diverse human and mouse conditions
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa995
PMID:33151298
|
研究论文 | 本文介绍了GRNdb数据库，该数据库系统预测了人类和小鼠在184种不同生理和病理条件下涉及超过633,000个细胞和27,700个批量样本的基因调控网络（GRNs），并提供了一个用户友好的平台用于搜索、比较、浏览、可视化和下载相关信息。 | GRNdb是首个提供全面的人类和小鼠在单细胞水平上不同正常组织和疾病基因调控网络信息的数据库。 | NA | 开发一个全面的数据库，用于解析在多种条件下基因表达调控的功能和机制。 | 人类和小鼠的基因调控网络及其在不同生理和病理条件下的变化。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及超过633,000个细胞和27,700个批量样本 | NA | NA | NA | NA |
| 677 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis in Plants: Advances and Challenges
2021-01-04, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2020.10.012
PMID:33152518
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在植物科学中的应用进展和面临的挑战 | scRNA-seq技术能够以前所未有的分辨率和规模研究植物发育和生理，揭示细胞间的异质性 | 植物科学中单细胞转录组分析仍处于早期阶段，有许多挑战需要克服 | 探讨scRNA-seq技术在植物研究中的应用，并提出未来研究方向 | 使用拟南芥根模型进行的研究，以及新的单细胞分析工具 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 678 | 2024-08-09 |
Enhanced Efficacy of Simultaneous PD-1 and PD-L1 Immune Checkpoint Blockade in High-Grade Serous Ovarian Cancer
2021-01-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-1674
PMID:33158814
|
research paper | 本研究通过免疫功能和单细胞RNA测序转录组分析，探讨了双特异性抗PD-1/PD-L1抗体在高度浆液性卵巢癌中的作用机制 | 首次揭示了双特异性抗体诱导NK细胞和部分CD8 T细胞状态转变，增强免疫检查点阻断疗法在高度浆液性卵巢癌中的疗效 | NA | 研究双特异性抗PD-1/PD-L1抗体在高度浆液性卵巢癌中的免疫治疗效果及其作用机制 | 高度浆液性卵巢癌的肿瘤细胞与免疫细胞共培养模型 | NA | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 679 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing Reveals Clonal Architecture of Myeloid Cancers
2021-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-RW2020-163
PMID:33158845
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序技术揭示了髓系癌症的克隆结构 | 首次使用单细胞测序技术来解析髓系癌症的克隆结构 | NA | 探究髓系癌症的克隆结构 | 急性髓系白血病的克隆结构 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 680 | 2024-08-09 |
Chitinase 3-like 1 and neurofilament light chain in CSF and CNS atrophy in MS
2021-01, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000000906
PMID:33172960
|
研究论文 | 研究脑脊液中神经丝轻链（NfL）和新兴标记物壳多糖酶3样蛋白1（CHI3L1）与多发性硬化症（MS）患者脑和脊髓萎缩的横断面关联 | 首次探讨了CHI3L1和NfL在MS患者脑脊液中的水平与脑和脊髓萎缩的关系，并评估了CHI3L1在不同细胞类型中的表达 | 研究为单中心研究，样本量有限，可能影响结果的普遍性 | 探讨CHI3L1和NfL在MS患者中的表达与脑和脊髓萎缩的关系，以及CHI3L1在不同细胞类型中的表达 | 多发性硬化症患者（复发缓解型MS和进行性MS）及健康对照组的脑脊液中NfL和CHI3L1水平 | NA | 多发性硬化症 | MRI | NA | 脑脊液 | 131名MS患者（42名复发缓解型MS和89名进行性MS）及42名匹配的健康对照 | NA | NA | NA | NA |