单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
641	2024-08-09	Imaging atherosclerotic plaques by targeting Galectin-3 and activated macrophages using (89Zr)-DFO- Galectin3-F(ab')2 mAb 2021, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.50247 PMID:33408786	研究论文	本研究探索了通过靶向Galectin-3（Gal3）在斑块中的表达来追踪动脉粥样硬化的可行性，使用(89Zr)-DFO-Galectin3-F(ab')2 mAb进行PET成像。	本研究首次使用(89Zr)-DFO-Galectin3-F(ab')2 mAb进行PET/CT成像，以追踪动脉粥样硬化斑块，为个体化干预提供了新的工具。	NA	探索通过靶向Galectin-3在斑块中的表达来追踪动脉粥样硬化的可行性。	动脉粥样硬化斑块中的Galectin-3表达。	数字病理学	心血管疾病	PET/CT成像	NA	图像	使用了ApoE-KO小鼠和人类斑块样本。
642	2024-08-09	Transcriptional profiling of pediatric cholestatic livers identifies three distinct macrophage populations 2021, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0244743 PMID:33411796	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光技术，对患有胆汁淤积性肝病的儿童肝脏中的巨噬细胞进行了转录组特征分析，并识别出三种不同的巨噬细胞亚群	首次在人类儿童胆汁淤积性肝病中进行单细胞RNA测序，并识别出三种具有独特转录特征的巨噬细胞亚群	NA	进一步阐明儿童胆汁淤积性肝病中巨噬细胞的转录组特征	儿童胆汁淤积性肝病中的巨噬细胞	NA	肝病	单细胞RNA测序	NA	RNA	胆道闭锁（BA）患者6例，Alagille综合征（ALGS）患者6例
643	2024-08-09	Differences in TCR repertoire and T cell activation underlie the divergent outcomes of antitumor immune responses in tumor-eradicating versus tumor-progressing hosts 2021-01, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2020-001615 PMID:33414263	研究论文	本文开发了一种独特的HNSCC小鼠模型，通过单细胞TCR测序和单细胞RNA测序，研究了TCR谱和T细胞活化状态在肿瘤清除与肿瘤进展宿主中的差异，揭示了异质性抗肿瘤免疫反应的潜在机制。	首次通过单细胞TCR测序和单细胞RNA测序技术，揭示了TCR谱和T细胞活化状态在不同宿主抗肿瘤免疫反应中的差异。	NA	研究抗肿瘤免疫反应在不同宿主中的异质性机制，为个性化癌症免疫治疗提供理论基础。	HNSCC小鼠模型中的TCR谱和T细胞活化状态。	数字病理学	头颈部鳞状细胞癌	单细胞TCR测序，单细胞RNA测序	NA	单细胞数据	100%的受体小鼠中肿瘤初始生长，约25%的小鼠无干预下肿瘤清除
644	2024-08-09	Neurological Manifestations of COVID-19 Feature T Cell Exhaustion and Dedifferentiated Monocytes in Cerebrospinal Fluid 2021-01-12, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2020.12.011 PMID:33382973	研究论文	研究COVID-19患者的神经后遗症，特别是通过单细胞测序分析脑脊液中的免疫细胞特征	首次详细描述了COVID-19患者脑脊液中分化程度降低的单核细胞和耗竭的CD4 T细胞的扩增	研究仅限于特定的患者群体，可能无法完全代表所有COVID-19患者的神经后遗症情况	探究COVID-19患者神经后遗症的病因	COVID-19患者的脑脊液免疫细胞	NA	COVID-19	单细胞测序	NA	免疫细胞数据	涉及COVID-19患者与其他神经系统疾病患者的脑脊液样本
645	2024-08-09	Cell-Type-Specific Immune Dysregulation in Severely Ill COVID-19 Patients 2021-01-05, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2020.108590 PMID:33357411	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了健康个体和不同程度COVID-19患者的外周血单个核细胞的转录组，揭示了ARDS患者中免疫调节失调的细胞类型特异性特征	首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了COVID-19患者中ARDS相关的免疫失调机制	样本量较小，可能影响结果的普遍性	探究COVID-19患者中ARDS相关的免疫失调机制	健康个体和不同程度COVID-19患者的外周血单个核细胞	NA	COVID-19	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	健康个体3例，中度COVID-19患者5例，ARDS患者6例，恢复期ARDS患者6例
646	2024-08-09	QRICH1 dictates the outcome of ER stress through transcriptional control of proteostasis 2021-01-01, Science (New York, N.Y.) DOI:10.1126/science.abb6896 PMID:33384352	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和基因组规模的CRISPR筛选，研究了QRICH1在ER应激反应中的作用及其对细胞命运的影响	首次揭示了QRICH1作为PERK-eIF2α轴的关键效应因子，调控ER应激下的转录程序	NA	探讨QRICH1在ER应激反应中的功能及其对细胞命运的影响	QRICH1在ER应激反应中的作用	NA	炎症病理	单细胞RNA测序, CRISPR筛选	NA	RNA	小鼠肠道上皮细胞
647	2024-08-09	PD-1 blockade restores helper activity of tumor-infiltrating, exhausted PD-1hiCD39+ CD4 T cells 2021-01-25, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.142513 PMID:33332284	研究论文	本文通过表型、转录组和功能方法研究了头颈、宫颈和卵巢癌患者的CD4 T细胞耗竭情况，并探讨了PD-1阻断对这些细胞辅助活性的恢复作用	首次详细描述了CD4 T细胞在肿瘤微环境中的耗竭状态，并证明了PD-1阻断可以恢复其辅助活性	NA	研究CD4 T细胞在肿瘤微环境中的耗竭状态及其对免疫检查点阻断的响应	头颈、宫颈和卵巢癌患者的CD4 T细胞	免疫学	头颈癌、宫颈癌、卵巢癌	scRNA-Seq	NA	转录组数据	NA
648	2024-08-09	The autotaxin-lysophosphatidic acid pathway mediates mesenchymal cell recruitment and fibrotic contraction in lung transplant fibrosis 2021-01, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation DOI:10.1016/j.healun.2020.10.005 PMID:33339555	研究论文	本文研究了自噬素-溶血磷脂酸途径在肺移植纤维化中的间充质细胞招募和纤维化收缩的作用	首次展示了肺移植受者BAL液对人类肺组织衍生MSC的强烈趋化作用，并诱导收缩表型，通过LPA阻断完全消除了BAL介导的MSC趋化和胶原凝胶收缩	NA	识别诱导肺组织间充质干细胞迁移和收缩分化的介质	肺移植受者的间充质干细胞和肺移植纤维化机制	NA	肺纤维化	酶联免疫吸附试验，液相色谱-串联质谱法，单细胞RNA测序	NA	细胞	7名健康对照和21名肺移植受者的BAL液，7名健康对照和31名肺移植受者的BAL液，1名CLAD肺移植受者的BAL细胞
649	2024-08-09	A road map from single-cell transcriptome to patient classification for the immune response to trauma 2021-01-25, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.145108 PMID:33320841	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了创伤后小鼠和创伤患者的循环及骨髓单核细胞，揭示了创伤诱导的免疫反应及其对患者分类的影响	首次通过单细胞RNA测序技术详细解析了创伤后免疫反应的细胞层面变化，并据此定义了两种创伤患者亚型	研究主要集中在小鼠模型和创伤患者，未来研究需要扩展到其他类型的炎症疾病和危重病患	解析创伤后的免疫反应，并基于此进行患者分类	创伤后的小鼠和创伤患者的循环及骨髓单核细胞	数字病理学	创伤	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	涉及受伤小鼠和创伤患者的循环单核细胞
650	2024-08-09	High-Throughput Monitoring of Bacterial Cell Density in Nanoliter Droplets: Label-Free Detection of Unmodified Gram-Positive and Gram-Negative Bacteria 2021-01-19, Analytical chemistry IF:6.7Q1 DOI:10.1021/acs.analchem.0c03408 PMID:33301291	研究论文	本文介绍了一种高吞吐量、无标记的方法，用于在纳升液滴中检测未修饰的革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌的细胞密度	该方法利用纳升液滴中散射光的快速测量，实现了对细菌增殖的可靠检测，无需基因改造或添加化学代谢标记	NA	开发一种高吞吐量、无标记的细菌检测方法，以促进微流控液滴技术在分析微生物学中的广泛应用	革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌	分析生物学	NA	微流控液滴技术	NA	散射光信号	NA
651	2024-08-09	A microfluidics-based stem cell model of early post-implantation human development 2021-01, Nature protocols IF:13.1Q1 DOI:10.1038/s41596-020-00417-w PMID:33311712	研究论文	本文详细介绍了设计和实现一种基于微流控技术的设备，用于模拟人类胚胎植入后早期发育过程	该研究开发了一种微流控设备，能够模拟人类胚胎植入后早期的分子和细胞特征，这在技术上是一个创新	NA	研究目的是为不孕症和毒理学研究提供一个合适的人类胚胎发育模型	研究对象是人类多能干细胞（hPSCs）及其在微流控设备中的发育过程	生物技术	不孕症	微流控技术	微流控人类胚胎模型	细胞	使用人类多能干细胞（hPSCs）进行实验
652	2024-08-09	Gene Regulatory Network Analysis and Engineering Directs Development and Vascularization of Multilineage Human Liver Organoids 2021-01-20, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2020.11.002 PMID:33290741	研究论文	本文展示了通过整合分析和工程化基因调控网络（GRNs）在多谱系人肝类器官中指导成熟和血管形态发生的方法	通过过表达PROX1和ATF5，结合靶向CRISPR介导的转录激活内源性CYP3A4，重新编程组织GRN，改善了原生肝功能	NA	研究如何通过基因调控网络的分析和工程化促进人肝类器官的发育和血管化	多谱系人肝类器官	NA	NA	CRISPR	NA	RNA-seq	NA
653	2024-08-09	Single-cell RNA sequencing of human breast tumour-infiltrating immune cells reveals a γδ T-cell subtype associated with good clinical outcome 2021-01, Life science alliance IF:3.3Q1 DOI:10.26508/lsa.202000680 PMID:33268347	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人类乳腺癌肿瘤浸润性免疫细胞中的γδ T细胞亚型，发现一种与良好临床结果相关的γδ T细胞亚型	本研究首次在乳腺癌肿瘤中鉴定出一种与改善总体癌症生存率相关的γδ T细胞亚型	NA	探索γδ T细胞在癌症免疫治疗中的潜在应用	人类乳腺癌肿瘤浸润性γδ T细胞	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	健康成人供体的外周血γδ T细胞和乳腺癌患者的肿瘤活检样本
654	2024-08-09	Analysis of canine myeloid-derived suppressor cells (MDSCs) utilizing fluorescence-activated cell sorting, RNA protection mediums to yield quality RNA for single-cell RNA sequencing 2021-Jan, Veterinary immunology and immunopathology IF:1.4Q2 DOI:10.1016/j.vetimm.2020.110144 PMID:33278779	研究论文	本研究通过荧光激活细胞分选（FACS）和RNA保护介质优化犬类髓源抑制细胞（MDSC）的单细胞RNA测序	本研究优化了MDSC的FACS分选策略，并使用了RiboLock™和RNAlater™来保护RNA质量，提高了RNA完整性，从而改善了单细胞RNA测序的数据质量	由于正常样本中细胞数量较少，未进行进一步的通路分析	优化犬类MDSC的FACS分选和RNA保护方法，以提高单细胞RNA测序的数据质量	犬类髓源抑制细胞（MDSC）	数字病理学	口腔黑色素瘤	荧光激活细胞分选（FACS），单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	两个样本，一个来自正常犬，另一个来自未治疗的口腔黑色素瘤犬
655	2024-08-09	Single-cell analysis reveals the purification and maturation effects of glucose starvation in hiPSC-CMs 2021-01-01, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2020.11.076 PMID:33279112	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了葡萄糖饥饿对人类诱导多能干细胞衍生的心肌细胞（hiPSC-CMs）纯化和成熟的影响。	首次全面评估了葡萄糖饥饿对hiPSC-CMs转录异质性的影响，并揭示了其对心肌细胞纯化和成熟的作用。	NA	探讨葡萄糖饥饿处理对hiPSC-CMs纯化和成熟的影响。	人类诱导多能干细胞衍生的心肌细胞（hiPSC-CMs）。	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	NA
656	2024-08-09	Diversification of molecularly defined myenteric neuron classes revealed by single-cell RNA sequencing 2021-01, Nature neuroscience IF:21.2Q1 DOI:10.1038/s41593-020-00736-x PMID:33288908	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，在小鼠小肠的肠神经系统（ENS）中定义了12种肠神经元类别的分子分类	揭示了神经元多样化的一个新原理，即通过二元神经发生分支和随后的有丝分裂后分化产生不同神经元类别	NA	探索肠神经系统中神经元类型的多样性及其在发育过程中的形成机制	小鼠小肠的肠神经系统中的神经元	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA序列	NA
657	2024-08-09	Tutorial: guidelines for the computational analysis of single-cell RNA sequencing data 2021-01, Nature protocols IF:13.1Q1 DOI:10.1038/s41596-020-00409-w PMID:33288955	教程	本文介绍了单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的计算分析流程	提供了最佳实践指南和实用指南	NA	为实验人员提供数据分析指南，为生物信息学家提供新计算方法的概述	单细胞RNA测序数据	生物信息学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	大量单个细胞
658	2024-08-09	Single-Cell Transcriptome Analysis Workflow for Splenic Myeloid-Derived Suppressor Cells from Murine Breast Cancer Models 2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-1060-2_14 PMID:33237548	研究论文	本文提供了一种使用单细胞RNA测序（scRNAseq）探索乳腺癌模型中脾脏髓系来源抑制细胞（MDSCs）的详细流程	利用单细胞转录组学技术，深入研究了以往未被充分认识的细胞异质性，特别是免疫细胞亚群中的MDSCs	NA	定义乳腺癌模型中脾脏髓系细胞的独特分子特征	乳腺癌模型中的脾脏髓系来源抑制细胞（MDSCs）	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNAseq）	NA	转录组	涉及乳腺癌模型小鼠和野生型对照小鼠的脾脏髓系细胞
659	2024-08-09	Identification and characterization of distinct brown adipocyte subtypes in C57BL/6J mice 2021-01, Life science alliance IF:3.3Q1 DOI:10.26508/lsa.202000924 PMID:33257475	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术分析C57BL/6J小鼠棕色脂肪组织中的基质血管部分，鉴定并表征了不同的棕色脂肪细胞亚型	首次研究了棕色脂肪细胞亚型的发育起源，并确认了区分棕色脂肪细胞亚型的标记物	NA	深入了解棕色前脂肪细胞的异质性	C57BL/6J小鼠的棕色脂肪组织	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	C57/BL6小鼠的棕色脂肪组织基质血管部分
660	2024-08-09	Guidelines for Setting Up a mRNA Sequencing Experiment and Best Practices for Bioinformatic Data Analysis 2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-1201-9_10 PMID:33263908	研究论文	本文回顾了转录组分析的关键发展，并详细介绍了mRNA测序实验设计和数据处理的工作流程，以及基于Illumina技术的最佳实践建议	讨论了单细胞RNA测序和长读长技术测序的新前沿	NA	提供mRNA测序实验设置和生物信息学数据分析的最佳实践指南	mRNA测序实验和数据分析	生物信息学	NA	RNA-seq	NA	文本	NA