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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2024-08-09 |
The prospects of tumor chemosensitivity testing at the single-cell level
2021-01, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2020.100741
PMID:33387814
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综述 | 本文综述了单细胞水平肿瘤化疗敏感性测试(SCC-DST)的发展及其在克服传统药物筛选方法障碍中的应用 | SCC-DST通过微流控芯片技术集成多种分析方法,提高了对个体患者药物敏感性测试的预测能力 | NA | 探讨SCC-DST如何克服传统药物筛选方法的障碍,并展望其与单细胞RNA测序和人工智能结合的可能性 | 单细胞水平肿瘤化疗敏感性测试技术及其应用 | NA | 癌症 | 微流控芯片技术 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 642 | 2024-08-09 |
Specific MiRNAs in naïve T cells associated with Hepatitis C Virus-induced Hepatocellular Carcinoma
2021, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.49594
PMID:33391397
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研究论文 | 本研究通过结合HCV诱导的肝细胞癌(HCC)组织中的bulk mRNA和miRNA测序数据以及T细胞的单细胞RNA测序数据,探讨了T细胞与miRNAs在HCV-HCC中的关联 | 本研究利用去卷积的bulk RNA-seq数据和miRNA图谱,识别了与幼稚CD4+ T细胞相关的miRNAs,有助于阐明抗HCV免疫反应的潜在机制 | NA | 确定T细胞与miRNAs在HCV诱导的肝细胞癌(HCC)中的关联 | HCV诱导的肝细胞癌(HCC)组织中的T细胞和miRNAs | NA | 肝细胞癌 | RNA测序 | NA | mRNA和miRNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 643 | 2024-08-09 |
Macrophage imaging and subset analysis using single-cell RNA sequencing
2021, Nanotheranostics
DOI:10.7150/ntno.50185
PMID:33391974
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术进行巨噬细胞成像和亚群分析,以支持个性化患者治疗策略的可能性 | 介绍了纳米颗粒基对比剂在巨噬细胞成像中的应用,以及单细胞RNA测序技术在解析特定细胞亚群及其在药物反应或抗药性中的机制作用 | 当前临床成像技术在量化广泛分子程序方面的能力有限,无法解释特定成像剂标记的细胞亚群及其在药物反应或抗药性中的作用 | 探讨巨噬细胞成像作为伴随诊断工具,以指导个性化患者治疗策略 | 巨噬细胞及其在药物反应和抗药性中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 644 | 2024-08-09 |
Integrative single-cell transcriptome analysis reveals a subpopulation of fibroblasts associated with favorable prognosis of liver cancer patients
2021-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2020.100981
PMID:33395744
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研究论文 | 本文通过综合单细胞转录组分析,揭示了与肝癌患者良好预后相关的成纤维细胞亚群 | 首次在单细胞水平上描述了肝癌与正常肝脏在细胞和分子成分上的变化,并发现了一种与减少血管侵袭和延长肝癌患者生存期相关的成纤维细胞亚群 | NA | 研究肝癌发展中的细胞类型特异性分子改变,并探索与肝癌预后相关的成纤维细胞亚群 | 肝癌和正常肝脏组织的单细胞转录组 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组分析 | 主成分分析 | 转录组数据 | 肝癌和正常肝脏组织的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 645 | 2024-08-09 |
Single-cell dissection of intratumoral heterogeneity and lineage diversity in metastatic gastric adenocarcinoma
2021-01, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-1125-8
PMID:33398161
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术,分析了15名胃腺癌患者的腹膜癌病(PC)细胞,构建了45,048个PC细胞的地图,并探讨了肿瘤细胞群体的转录组状态及其与患者生存的关系 | 本文首次揭示了肿瘤细胞系/状态组成的多样性是腹膜癌病(PC)细胞内异质性的关键贡献因素,并开发了一个12基因的预后标志物,用于胃腺癌的预后评估和患者分层 | NA | 探索胃腺癌腹膜癌病(PC)细胞的内异质性及其与患者生存的关系 | 胃腺癌患者的腹膜癌病(PC)细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 15名胃腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 646 | 2024-08-09 |
Six Novel Biomarkers for Diagnosis and Prognosis of Esophageal squamous cell carcinoma: validated by scRNA-seq and qPCR
2021, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.50443
PMID:33403046
|
研究论文 | 本研究通过分析六个GEO和TCGA的ESCC数据集,筛选出六个新的生物标志物,并通过scRNA-seq和qPCR验证其在食管鳞状细胞癌中的表达和预后价值 | 首次鉴定并验证了PBK, KIF2C, NUF2, KIF20A, RAD51AP1和DEPDC1作为食管鳞状细胞癌的诊断和预后生物标志物 | NA | 鉴定新的食管鳞状细胞癌生物标志物 | 食管鳞状细胞癌的生物标志物 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | scRNA-seq, qPCR | NA | 基因表达数据 | 六个GEO和TCGA的ESCC数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 647 | 2024-08-09 |
Imaging atherosclerotic plaques by targeting Galectin-3 and activated macrophages using (89Zr)-DFO- Galectin3-F(ab')2 mAb
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.50247
PMID:33408786
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研究论文 | 本研究探索了通过靶向Galectin-3(Gal3)在斑块中的表达来追踪动脉粥样硬化的可行性,使用(89Zr)-DFO-Galectin3-F(ab')2 mAb进行PET成像。 | 本研究首次使用(89Zr)-DFO-Galectin3-F(ab')2 mAb进行PET/CT成像,以追踪动脉粥样硬化斑块,为个体化干预提供了新的工具。 | NA | 探索通过靶向Galectin-3在斑块中的表达来追踪动脉粥样硬化的可行性。 | 动脉粥样硬化斑块中的Galectin-3表达。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | PET/CT成像 | NA | 图像 | 使用了ApoE-KO小鼠和人类斑块样本。 | NA | NA | NA | NA |
| 648 | 2024-08-09 |
Differences in TCR repertoire and T cell activation underlie the divergent outcomes of antitumor immune responses in tumor-eradicating versus tumor-progressing hosts
2021-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2020-001615
PMID:33414263
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研究论文 | 本文开发了一种独特的HNSCC小鼠模型,通过单细胞TCR测序和单细胞RNA测序,研究了TCR谱和T细胞活化状态在肿瘤清除与肿瘤进展宿主中的差异,揭示了异质性抗肿瘤免疫反应的潜在机制。 | 首次通过单细胞TCR测序和单细胞RNA测序技术,揭示了TCR谱和T细胞活化状态在不同宿主抗肿瘤免疫反应中的差异。 | NA | 研究抗肿瘤免疫反应在不同宿主中的异质性机制,为个性化癌症免疫治疗提供理论基础。 | HNSCC小鼠模型中的TCR谱和T细胞活化状态。 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞TCR测序,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 100%的受体小鼠中肿瘤初始生长,约25%的小鼠无干预下肿瘤清除 | NA | NA | NA | NA |
| 649 | 2024-08-09 |
Neurological Manifestations of COVID-19 Feature T Cell Exhaustion and Dedifferentiated Monocytes in Cerebrospinal Fluid
2021-01-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.12.011
PMID:33382973
|
研究论文 | 研究COVID-19患者的神经后遗症,特别是通过单细胞测序分析脑脊液中的免疫细胞特征 | 首次详细描述了COVID-19患者脑脊液中分化程度降低的单核细胞和耗竭的CD4 T细胞的扩增 | 研究仅限于特定的患者群体,可能无法完全代表所有COVID-19患者的神经后遗症情况 | 探究COVID-19患者神经后遗症的病因 | COVID-19患者的脑脊液免疫细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | 免疫细胞数据 | 涉及COVID-19患者与其他神经系统疾病患者的脑脊液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 650 | 2024-08-09 |
Cell-Type-Specific Immune Dysregulation in Severely Ill COVID-19 Patients
2021-01-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108590
PMID:33357411
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了健康个体和不同程度COVID-19患者的外周血单个核细胞的转录组,揭示了ARDS患者中免疫调节失调的细胞类型特异性特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了COVID-19患者中ARDS相关的免疫失调机制 | 样本量较小,可能影响结果的普遍性 | 探究COVID-19患者中ARDS相关的免疫失调机制 | 健康个体和不同程度COVID-19患者的外周血单个核细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康个体3例,中度COVID-19患者5例,ARDS患者6例,恢复期ARDS患者6例 | NA | NA | NA | NA |
| 651 | 2024-08-09 |
QRICH1 dictates the outcome of ER stress through transcriptional control of proteostasis
2021-01-01, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abb6896
PMID:33384352
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和基因组规模的CRISPR筛选,研究了QRICH1在ER应激反应中的作用及其对细胞命运的影响 | 首次揭示了QRICH1作为PERK-eIF2α轴的关键效应因子,调控ER应激下的转录程序 | NA | 探讨QRICH1在ER应激反应中的功能及其对细胞命运的影响 | QRICH1在ER应激反应中的作用 | NA | 炎症病理 | 单细胞RNA测序, CRISPR筛选 | NA | RNA | 小鼠肠道上皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 652 | 2024-08-09 |
PD-1 blockade restores helper activity of tumor-infiltrating, exhausted PD-1hiCD39+ CD4 T cells
2021-01-25, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.142513
PMID:33332284
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研究论文 | 本文通过表型、转录组和功能方法研究了头颈、宫颈和卵巢癌患者的CD4 T细胞耗竭情况,并探讨了PD-1阻断对这些细胞辅助活性的恢复作用 | 首次详细描述了CD4 T细胞在肿瘤微环境中的耗竭状态,并证明了PD-1阻断可以恢复其辅助活性 | NA | 研究CD4 T细胞在肿瘤微环境中的耗竭状态及其对免疫检查点阻断的响应 | 头颈、宫颈和卵巢癌患者的CD4 T细胞 | 免疫学 | 头颈癌、宫颈癌、卵巢癌 | scRNA-Seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 653 | 2024-08-09 |
The autotaxin-lysophosphatidic acid pathway mediates mesenchymal cell recruitment and fibrotic contraction in lung transplant fibrosis
2021-01, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2020.10.005
PMID:33339555
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研究论文 | 本文研究了自噬素-溶血磷脂酸途径在肺移植纤维化中的间充质细胞招募和纤维化收缩的作用 | 首次展示了肺移植受者BAL液对人类肺组织衍生MSC的强烈趋化作用,并诱导收缩表型,通过LPA阻断完全消除了BAL介导的MSC趋化和胶原凝胶收缩 | NA | 识别诱导肺组织间充质干细胞迁移和收缩分化的介质 | 肺移植受者的间充质干细胞和肺移植纤维化机制 | NA | 肺纤维化 | 酶联免疫吸附试验,液相色谱-串联质谱法,单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 7名健康对照和21名肺移植受者的BAL液,7名健康对照和31名肺移植受者的BAL液,1名CLAD肺移植受者的BAL细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 654 | 2024-08-09 |
A road map from single-cell transcriptome to patient classification for the immune response to trauma
2021-01-25, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.145108
PMID:33320841
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了创伤后小鼠和创伤患者的循环及骨髓单核细胞,揭示了创伤诱导的免疫反应及其对患者分类的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细解析了创伤后免疫反应的细胞层面变化,并据此定义了两种创伤患者亚型 | 研究主要集中在小鼠模型和创伤患者,未来研究需要扩展到其他类型的炎症疾病和危重病患 | 解析创伤后的免疫反应,并基于此进行患者分类 | 创伤后的小鼠和创伤患者的循环及骨髓单核细胞 | 数字病理学 | 创伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及受伤小鼠和创伤患者的循环单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 655 | 2024-08-09 |
High-Throughput Monitoring of Bacterial Cell Density in Nanoliter Droplets: Label-Free Detection of Unmodified Gram-Positive and Gram-Negative Bacteria
2021-01-19, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.0c03408
PMID:33301291
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研究论文 | 本文介绍了一种高吞吐量、无标记的方法,用于在纳升液滴中检测未修饰的革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌的细胞密度 | 该方法利用纳升液滴中散射光的快速测量,实现了对细菌增殖的可靠检测,无需基因改造或添加化学代谢标记 | NA | 开发一种高吞吐量、无标记的细菌检测方法,以促进微流控液滴技术在分析微生物学中的广泛应用 | 革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌 | 分析生物学 | NA | 微流控液滴技术 | NA | 散射光信号 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 656 | 2024-08-09 |
A microfluidics-based stem cell model of early post-implantation human development
2021-01, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-020-00417-w
PMID:33311712
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研究论文 | 本文详细介绍了设计和实现一种基于微流控技术的设备,用于模拟人类胚胎植入后早期发育过程 | 该研究开发了一种微流控设备,能够模拟人类胚胎植入后早期的分子和细胞特征,这在技术上是一个创新 | NA | 研究目的是为不孕症和毒理学研究提供一个合适的人类胚胎发育模型 | 研究对象是人类多能干细胞(hPSCs)及其在微流控设备中的发育过程 | 生物技术 | 不孕症 | 微流控技术 | 微流控人类胚胎模型 | 细胞 | 使用人类多能干细胞(hPSCs)进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 657 | 2024-08-09 |
Gene Regulatory Network Analysis and Engineering Directs Development and Vascularization of Multilineage Human Liver Organoids
2021-01-20, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2020.11.002
PMID:33290741
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研究论文 | 本文展示了通过整合分析和工程化基因调控网络(GRNs)在多谱系人肝类器官中指导成熟和血管形态发生的方法 | 通过过表达PROX1和ATF5,结合靶向CRISPR介导的转录激活内源性CYP3A4,重新编程组织GRN,改善了原生肝功能 | NA | 研究如何通过基因调控网络的分析和工程化促进人肝类器官的发育和血管化 | 多谱系人肝类器官 | NA | NA | CRISPR | NA | RNA-seq | NA | NA | NA | NA | NA |
| 658 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing of human breast tumour-infiltrating immune cells reveals a γδ T-cell subtype associated with good clinical outcome
2021-01, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202000680
PMID:33268347
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人类乳腺癌肿瘤浸润性免疫细胞中的γδ T细胞亚型,发现一种与良好临床结果相关的γδ T细胞亚型 | 本研究首次在乳腺癌肿瘤中鉴定出一种与改善总体癌症生存率相关的γδ T细胞亚型 | NA | 探索γδ T细胞在癌症免疫治疗中的潜在应用 | 人类乳腺癌肿瘤浸润性γδ T细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 健康成人供体的外周血γδ T细胞和乳腺癌患者的肿瘤活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 659 | 2024-08-09 |
Analysis of canine myeloid-derived suppressor cells (MDSCs) utilizing fluorescence-activated cell sorting, RNA protection mediums to yield quality RNA for single-cell RNA sequencing
2021-Jan, Veterinary immunology and immunopathology
IF:1.4Q2
DOI:10.1016/j.vetimm.2020.110144
PMID:33278779
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研究论文 | 本研究通过荧光激活细胞分选(FACS)和RNA保护介质优化犬类髓源抑制细胞(MDSC)的单细胞RNA测序 | 本研究优化了MDSC的FACS分选策略,并使用了RiboLock™和RNAlater™来保护RNA质量,提高了RNA完整性,从而改善了单细胞RNA测序的数据质量 | 由于正常样本中细胞数量较少,未进行进一步的通路分析 | 优化犬类MDSC的FACS分选和RNA保护方法,以提高单细胞RNA测序的数据质量 | 犬类髓源抑制细胞(MDSC) | 数字病理学 | 口腔黑色素瘤 | 荧光激活细胞分选(FACS),单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 两个样本,一个来自正常犬,另一个来自未治疗的口腔黑色素瘤犬 | NA | NA | NA | NA |
| 660 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis reveals the purification and maturation effects of glucose starvation in hiPSC-CMs
2021-01-01, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2020.11.076
PMID:33279112
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了葡萄糖饥饿对人类诱导多能干细胞衍生的心肌细胞(hiPSC-CMs)纯化和成熟的影响。 | 首次全面评估了葡萄糖饥饿对hiPSC-CMs转录异质性的影响,并揭示了其对心肌细胞纯化和成熟的作用。 | NA | 探讨葡萄糖饥饿处理对hiPSC-CMs纯化和成熟的影响。 | 人类诱导多能干细胞衍生的心肌细胞(hiPSC-CMs)。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |