单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 709 篇文献，本页显示第 601 - 620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2024-08-09 |
Time-course single-cell RNA sequencing reveals transcriptional dynamics and heterogeneity of limbal stem cells derived from human pluripotent stem cells
2021-Jan-23, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-021-00541-4
PMID:33485387
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研究论文 | 本文通过时间进程单细胞RNA测序研究了从人类胚胎干细胞衍生的角膜缘干细胞的转录异质性和表达变化 | 揭示了人类胚胎干细胞衍生的角膜缘干细胞在体外分化过程中的时间进程表达变化和显著的转录异质性，并发现了新的候选标记物 | NA | 探索人类胚胎干细胞衍生的角膜缘干细胞的发育轨迹和身份 | 从人类胚胎干细胞衍生的角膜缘干细胞及其后代细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 602 | 2024-08-09 |
Phenotypically supervised single-cell sequencing parses within-cell-type heterogeneity
2021-Jan-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101991
PMID:33490901
|
研究论文 | 本文探讨了在细胞类型内部功能异质性的分子机制，通过使用表型监督的单细胞RNA测序（pheno-scRNAseq）分析，比较了其与无监督scRNAseq在乳腺癌模型中的应用效果 | 提出了一种表型监督的单细胞RNA测序分析方法（pheno-scRNAseq），能够更深入地解析细胞行为异质性 | NA | 揭示细胞类型内部功能异质性的分子机制 | 乳腺癌细胞的侵袭性和非侵袭性细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 603 | 2024-08-09 |
High expression of ACE2 and TMPRSS2 and clinical characteristics of COVID-19 in colorectal cancer patients
2021-Jan-21, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-020-00139-y
PMID:33479506
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研究论文 | 研究了COVID-19患者中结直肠癌患者的ACE2和TMPRSS2表达模式及其临床特征 | 首次探讨了结直肠癌患者中ACE2和TMPRSS2的高表达及其对COVID-19临床特征的影响 | 需要进一步的机制研究来支持发现 | 探讨结直肠癌患者中ACE2和TMPRSS2的表达模式及COVID-19的临床特征 | 结直肠癌患者中的ACE2和TMPRSS2表达及COVID-19的临床表现 | NA | 结直肠癌 | bulk和单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 604 | 2024-08-09 |
The BMP signaling gradient is interpreted through concentration thresholds in dorsal-ventral axial patterning
2021-01, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001059
PMID:33481775
|
研究论文 | 本文研究了斑马鱼胚胎中BMP信号梯度如何通过浓度阈值转化为背腹轴模式化的不同基因激活 | 本文发现细胞通过响应BMP信号的三种不同活动水平来激活和定位目标基因表达，而不是通过BMP信号梯度斜率或BMP暴露持续时间 | NA | 确定BMP形态发生素在斑马鱼胚胎中的解释机制 | BMP信号如何沿背腹轴解释并转化为不同的基因激活 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 57个直接由BMP信号激活的基因 | NA | NA | NA | NA |
| 605 | 2024-08-09 |
Neuregulin-4 Is Required for Maintaining Soma Size of Pyramidal Neurons in the Motor Cortex
2021 Jan-Feb, eNeuro
IF:2.7Q3
DOI:10.1523/ENEURO.0288-20.2021
PMID:33495243
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研究论文 | 本研究探讨了缺乏neuregulin-4（NRG4）对运动皮层锥体神经元胞体大小的影响 | 首次揭示了NRG4在维持运动皮层锥体神经元胞体大小中的作用，并通过NRG处理恢复了这一表型 | 研究仅限于特定年龄段的小鼠和特定的神经元类型，可能无法全面反映NRG4在所有神经元中的作用 | 研究NRG4在维持运动皮层锥体神经元形态中的作用 | 运动皮层L2/3和L5层的锥体神经元及部分多极中间神经元 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 包括P10、P30和P60的小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 606 | 2024-08-09 |
Mesenchymal stem cell-mediated immunomodulation of recruited mononuclear phagocytes during acute lung injury: a high-dimensional analysis study
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.52514
PMID:33500722
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研究论文 | 本研究调查了急性肺损伤（ALI）中招募的单核吞噬细胞的类型以及同种异体间充质干细胞（MSCs）的免疫治疗效果 | 本研究通过高维分析技术精确识别了八种招募到LPS诱导的肺损伤中的单核吞噬细胞亚群，并揭示了MSCs在ALI中的治疗效果 | NA | 研究急性肺损伤中招募的单核吞噬细胞的功能和间充质干细胞的免疫调节作用 | 小鼠模型中的单核吞噬细胞和间充质干细胞 | NA | 急性肺损伤 | 流式细胞术，质谱细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | C57BL/6小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 607 | 2024-08-09 |
Vitamin D sufficiency enhances differentiation of patient-derived prostate epithelial organoids
2021-Jan-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101974
PMID:33458620
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研究论文 | 研究探讨了维生素D充足对患者来源的前列腺上皮类器官分化的影响 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学验证了维生素D充足通过抑制Wnt信号通路和下调DKK3促进前列腺上皮类器官的生长和分化 | NA | 研究维生素D对前列腺上皮分化的调控作用 | 患者来源的前列腺上皮类器官 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 类器官, 组织切片 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 608 | 2024-08-09 |
Comparison of induced neurons reveals slower structural and functional maturation in humans than in apes
2021-01-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.59323
PMID:33470930
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研究论文 | 通过表达转录因子神经调节蛋白2（NGN2）从黑猩猩、倭黑猩猩和人类干细胞中生成诱导兴奋性神经元（iNeurons），并比较了这些神经元在结构和功能成熟上的差异 | 首次通过单细胞RNA测序和电生理分析，揭示了人类神经元在结构和功能成熟上比黑猩猩和倭黑猩猩神经元发展得更慢 | 研究仅限于实验室条件下生成的诱导神经元，可能与自然条件下成熟的神经元存在差异 | 探究人类与黑猩猩、倭黑猩猩神经元在结构和功能成熟上的差异 | 黑猩猩、倭黑猩猩和人类的诱导兴奋性神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 黑猩猩、倭黑猩猩和人类的干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 609 | 2024-08-09 |
Early T follicular helper cell activity accelerates hepatitis C virus-specific B cell expansion
2021-01-19, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI140590
PMID:33463551
|
研究论文 | 研究分析了早期T滤泡辅助细胞活性如何加速丙型肝炎病毒特异性B细胞的扩张，并探讨了这一过程与病毒自发清除的关系 | 首次详细描述了早期T滤泡辅助细胞活性对丙型肝炎病毒特异性B细胞扩张的影响，并揭示了这一过程与病毒自发清除的可能关联 | 研究主要集中在急性感染后的早期阶段，对于长期慢性感染的影响分析较少 | 探讨早期T滤泡辅助细胞活性对丙型肝炎病毒特异性B细胞扩张的影响及其与病毒清除的关系 | 丙型肝炎病毒特异性记忆B细胞及T滤泡辅助细胞 | NA | 丙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 多个自发清除急性丙型肝炎病毒感染或进展为慢性感染的受试者 | NA | NA | NA | NA |
| 610 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis reveals the intra-tumor heterogeneity and identifies MLXIPL as a biomarker in the cellular trajectory of hepatocellular carcinoma
2021-Jan-18, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-021-00403-5
PMID:33462196
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肝细胞癌（HCC）肿瘤及癌旁组织的基因表达，揭示了HCC的细胞异质性，并发现MLXIPL可能作为HCC的治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了HCC的基因表达特征，并识别出HCC组织中的异质性亚克隆，发现MLXIPL在HCC中的上调与不良生存率相关 | NA | 探索肝细胞癌的基因表达特征及细胞异质性，寻找潜在的治疗靶点 | 肝细胞癌（HCC）肿瘤及癌旁组织的单细胞基因表达 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自人类HCC肿瘤和癌旁组织的单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 611 | 2024-08-09 |
Bi-fated tendon-to-bone attachment cells are regulated by shared enhancers and KLF transcription factors
2021-01-15, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.55361
PMID:33448926
|
研究论文 | 本文研究了小鼠肌腱与骨附着细胞的双重命运，揭示了这些细胞在共享增强子和Krüppel样因子（KLFs）调控下激活软骨细胞和肌腱细胞转录组的现象。 | 通过高通量批量和单细胞RNA测序，结合ATAC测序和表观基因组分析，验证了附着细胞中数百个软骨生成和肌生成基因的表达，并确认了这些细胞共享可访问的基因间染色质区域。 | NA | 探讨肌腱与骨附着细胞的双重命运及其调控机制。 | 小鼠肌腱与骨附着细胞。 | 生物学 | NA | RNA测序, ATAC测序, 单分子ISH, 表观基因组分析 | NA | RNA, 染色质可访问性 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 612 | 2024-08-09 |
Myocyte-specific enhancer factor 2c triggers transdifferentiation of adipose tissue-derived stromal cells into spontaneously beating cardiomyocyte-like cells
2021-01-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-80848-3
PMID:33452355
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研究论文 | 研究通过简单的培养协议，使成年小鼠腹股沟脂肪组织来源的间质血管部分（Ad-SVF）可重复地向自发跳动的心肌细胞样细胞（跳动CMs）转化，并鉴定了关键的转录因子Mef2c在转化中的作用 | 首次鉴定出Mef2c是Ad-SVF向跳动CMs转化的关键基因，并展示了通过基因修饰的Ad-SVF细胞在心脏再生疗法中的应用潜力 | NA | 探讨脂肪组织来源的间质细胞向心肌细胞样细胞的转化机制及其在心脏再生疗法中的应用 | 成年小鼠腹股沟脂肪组织来源的间质血管部分（Ad-SVF）及其转化后的心肌细胞样细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 491个差异表达的转录因子 | NA | NA | NA | NA |
| 613 | 2024-08-09 |
Multiregion single-cell sequencing reveals the transcriptional landscape of the immune microenvironment of colorectal cancer
2021-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.253
PMID:33463049
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研究论文 | 本研究利用两种单细胞RNA测序技术（Smart-seq2和DNBelab C4），对18名结直肠癌（CRC）患者原发肿瘤和肝转移瘤中的15,115个免疫和非免疫细胞进行了图谱分析 | 发现了早期和晚期CRC肿瘤中B细胞的不同特征，以及IgA IGLC2浆细胞与CRC不良预后的关联，揭示了B细胞和髓系细胞信号之间的显著相互作用 | NA | 深入了解结直肠癌中的免疫浸润情况，并为未来的CRC免疫治疗研究提供新视角 | 结直肠癌患者的原发肿瘤和肝转移瘤中的免疫和非免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 18名结直肠癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 614 | 2024-08-09 |
Droplet-based mRNA sequencing of fixed and permeabilized cells by CLInt-seq allows for antigen-specific TCR cloning
2021-01-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2021190118
PMID:33431692
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research paper | 本文介绍了一种基于液滴的mRNA测序方法CLInt-Seq，用于固定和通透化细胞中抗原特异性TCR的克隆 | CLInt-Seq方法能够高效恢复抗原特异性TCR，并实现高通量识别和分离低频TCR | NA | 开发一种高效的技术用于分离和鉴定响应感兴趣抗原的稀有TCR序列 | T细胞受体（TCRs）及其对抗原的反应性 | digital pathology | NA | mRNA sequencing | NA | text | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 615 | 2024-08-09 |
A transcriptomic taxonomy of Drosophila circadian neurons around the clock
2021-01-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.63056
PMID:33438579
|
研究论文 | 本研究通过优化单细胞RNA测序方法，对果蝇昼夜节律神经元的基因表达进行了全天候分析，以全面表征并确定75对昼夜节律神经元的细胞身份。 | 本研究识别出至少17种昼夜节律神经元类别，并发现显著的空间基因表达调控。转录因子调控显著，可能有助于许多转录本的强健昼夜振荡。 | NA | 全面表征和确定果蝇昼夜节律神经元的细胞身份。 | 果蝇的75对昼夜节律神经元。 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 75对昼夜节律神经元 | NA | NA | NA | NA |
| 616 | 2024-08-09 |
Spatiotemporal single-cell profiling reveals that invasive and tissue-resident memory donor CD8+ T cells drive gastrointestinal acute graft-versus-host disease
2021-01-13, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abc0227
PMID:33441422
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研究论文 | 本文通过结合连续血管内染色技术和单细胞RNA测序，解析了猕猴异基因造血干细胞移植模型中供体T细胞浸润组织并建立致病性组织居留程序的过程，揭示了胃肠急性移植物抗宿主病（aGVHD）中供体CD8+ T细胞的时空转录程序。 | 本文创新性地利用单细胞RNA测序技术，揭示了供体CD8 T细胞在胃肠aGVHD中的浸润和组织侵袭的转录特征。 | NA | 研究供体T细胞在急性移植物抗宿主病中的作用及其转录调控机制。 | 供体CD8+ T细胞在胃肠急性移植物抗宿主病中的浸润和组织侵袭。 | 数字病理学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 猕猴异基因造血干细胞移植模型 | NA | NA | NA | NA |
| 617 | 2024-08-09 |
Comprehensive analysis of metastatic gastric cancer tumour cells using single-cell RNA-seq
2021-01-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-80881-2
PMID:33441952
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术对三名原发性胃癌及配对转移性淋巴结癌组织的患者进行了单细胞水平分析，以揭示胃癌淋巴结转移的机制 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了胃癌淋巴结转移的详细细胞异质性和转移过程中的过渡状态 | 研究样本仅限于三名患者，可能不足以代表所有胃癌患者的情况 | 揭示胃癌淋巴结转移的机制并发现相关的标志基因 | 胃癌患者的原发性肿瘤和转移性淋巴结组织 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 三名胃癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 618 | 2024-08-09 |
Cellular and molecular landscape of mammalian sinoatrial node revealed by single-cell RNA sequencing
2021-01-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20448-x
PMID:33436583
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示了哺乳动物窦房结的细胞和分子景观 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了窦房结的四个不同的转录簇，并发现了Vsnl1作为潜在的窦房结标记物 | NA | 揭示窦房结的分子和细胞特征，以理解其在心脏中的关键功能 | 哺乳动物的窦房结 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠、兔子和食蟹猴的窦房结细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 619 | 2024-08-09 |
Taa Cells and Granzyme K: Old Players with New Tricks
2021-01-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.12.008
PMID:33440137
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、流式细胞术和质谱流式细胞术研究了与年龄相关的免疫系统变化，特别是与炎症老化相关的T细胞积累。 | 首次详细描述了年龄相关T细胞在炎症老化中的作用。 | NA | 探索与年龄相关的免疫系统变化及其在慢性疾病中的作用。 | 年龄相关T细胞及其在炎症老化中的作用。 | 免疫学 | 慢性疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 620 | 2024-08-09 |
JOINT for large-scale single-cell RNA-sequencing analysis via soft-clustering and parallel computing
2021-Jan-11, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07302-6
PMID:33430769
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研究论文 | 本文提出了一种名为JOINT的广义零膨胀负二项混合模型，用于大规模单细胞RNA测序数据的分析，通过软聚类和并行计算提高数据处理的准确性、鲁棒性和速度 | JOINT模型能够同时进行基于概率的细胞类型发现和差异表达基因分析，无需插补，并通过软聚类方法，每个细胞可以属于多个细胞类型，这与现有的硬聚类方法有显著不同 | NA | 提高单细胞RNA测序数据处理的准确性、鲁棒性和速度 | 大规模单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 零膨胀负二项混合模型 | 基因表达数据 | 大规模单细胞数据 | NA | NA | NA | NA |