单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 709 篇文献，本页显示第 581 - 600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2024-08-09 |
Novel Biomarkers for Lupus Nephritis in the "OMICS" Era
2021, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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综述 | 本文综述了在精准医学时代，利用基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学技术开发的狼疮性肾炎（LN）新型生物标志物的最新数据 | 综述了多种组学技术在LN诊断和监测中的应用，提供了更深入的疾病发病机制理解，并可能改变未来LN病例的管理方式 | NA | 总结和评估在精准医学时代开发的新型生物标志物，以改善LN的诊断和监测 | 狼疮性肾炎（LN）及其相关生物标志物 | NA | 自身免疫性疾病 | 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 基因数据、转录数据、蛋白质数据、代谢数据 | NA |
| 582 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomic Reveals Dual and Multi-Transmitter Use in Neurons Across Metazoans
2021, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2021.623148
PMID:33597849
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学研究，探讨了跨门动物神经元中双或多神经递质的使用情况 | 挑战了传统的Dale原则，即一个神经元只表达一种神经递质，提供了证据支持一个神经元可以表达多种神经递质 | NA | 研究神经元中神经递质的表达模式，特别是在单细胞水平上 | 跨门动物的神经元 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多个动物物种的神经元 |
| 583 | 2024-08-09 |
Systems biology analysis identifies TNFRSF9 as a functional marker of tumor-infiltrating regulatory T-cell enabling clinical outcome prediction in lung cancer
2021, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2021.01.025
PMID:33598101
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研究论文 | 本文通过系统生物学方法识别肿瘤浸润调节性T细胞（TI-Tregs）的功能性细胞表面标记物TNFRSF9，并探讨其在非小细胞肺癌（NSCLC）患者临床结果预测中的应用 | 本文首次通过综合转录组和网络分析，识别出TNFRSF9作为TI-Tregs的高功能重要性标记物，并发现其在Tregs中的低表达与NSCLC患者更好的总体生存率和抗PD-1免疫治疗反应相关 | NA | 识别肿瘤特异性免疫细胞的功能标记物，以开发新的治疗靶点和增强癌症免疫治疗的生物标志物 | 肿瘤浸润调节性T细胞（TI-Tregs）的细胞表面标记物 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用来自小鼠肺癌模型和非小细胞肺癌患者的bulk RNA-seq和单细胞转录组数据 |
| 584 | 2024-08-09 |
Development of a program for in silico optimized selection of oligonucleotide-based molecular barcodes
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0246354
PMID:33600481
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研究论文 | 本文介绍了一种用于选择最佳分子条形码子集的工具，该工具考虑了GC含量、同聚物、简单重复序列、汉明距离和条形码间的互补性等五个因素 | 该工具通过随机生成初始集和迭代替换的方法选择最佳条形码，具有快速性能和灵活性 | NA | 开发一种用于选择最佳分子条形码子集的工具，以提高实验的准确性和效率 | 分子条形码的选择和优化 | 生物信息学 | NA | 分子条形码技术 | NA | DNA序列 | 在多次测试中生成100000个长度为12个核苷酸的条形码 |
| 585 | 2024-08-09 |
Identification of Novel Population-Specific Cell Subsets in Chinese Ulcerative Colitis Patients Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.01.020
PMID:33545427
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了中国汉族溃疡性结肠炎患者的结肠黏膜细胞，识别出新的特定人群细胞亚群 | 本研究首次在中国汉族溃疡性结肠炎患者中识别出两个新的浆细胞亚群，并发现Th17激活在溃疡性结肠炎患者中表现为系统性免疫活动变化 | 研究样本仅来自中国汉族人群，可能限制了结果的普遍性 | 旨在识别溃疡性结肠炎患者结肠黏膜中的关键基因和细胞类型 | 中国汉族溃疡性结肠炎患者的结肠黏膜细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 12个溃疡性结肠炎患者和健康对照的结肠活检样本 |
| 586 | 2024-08-09 |
Hematopoietic Stem Cell Niche During Homeostasis, Malignancy, and Bone Marrow Transplantation
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.621214
PMID:33553181
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综述 | 本文综述了骨髓微环境中造血干细胞（HSC）的自我更新和多向分化如何受到严格调控，并探讨了骨髓微环境在白血病和造血干细胞移植（HSCT）后的变化 | 利用单细胞测序和成像技术研究骨髓微环境在血液恶性肿瘤和HSCT后的情况 | NA | 探讨骨髓微环境的不同组成部分如何调节正常造血，以及在白血病和HSCT后的变化 | 骨髓微环境中的造血干细胞及其在白血病和HSCT后的调控机制 | NA | 白血病 | 单细胞测序和成像 | NA | NA | NA |
| 587 | 2024-08-09 |
mRNA-1273 efficacy in a severe COVID-19 model: attenuated activation of pulmonary immune cells after challenge
2021-Jan-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2021.01.25.428136
PMID:33532780
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研究论文 | 本文研究了mRNA-1273疫苗在严重COVID-19模型中的效果，发现该疫苗能减轻肺部免疫细胞的激活 | 使用单细胞RNA测序技术分析了接种mRNA-1273疫苗的仓鼠肺组织，提供了人类接种疫苗后肺部潜在反应的见解 | 研究仅限于仓鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 评估mRNA-1273疫苗在严重COVID-19模型中的效果 | mRNA-1273疫苗在仓鼠模型中的免疫反应和保护效果 | 疫苗学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 仓鼠 |
| 588 | 2024-08-09 |
Tb3+-doped fluorescent glass for biology
2021-01, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abd2529
PMID:33523970
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研究论文 | 介绍了一种含稀土离子铽(III)的新型硼硅酸盐玻璃材料，该材料在蓝光激发下发出绿色荧光，适用于常规生物研究环境 | 开发了一种新型Tb3+掺杂荧光玻璃，可用于单细胞电穿孔、单细胞转录组分析和活体神经元在线光学定位 | NA | 探索Tb3+掺杂荧光玻璃在生物实验中的应用 | Tb3+掺杂荧光玻璃及其在生物实验中的应用 | 生物技术 | NA | 荧光显微镜控制下的单细胞电穿孔、单细胞转录组分析和膜片钳记录 | NA | 荧光信号 | NA |
| 589 | 2024-08-09 |
Identification of the Different Gene Expression Characteristics from Liver Cirrhosis to Hepatocellular Carcinoma Using Single-Cell Sequencing Analyses
2021, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2021/6619302
PMID:33532508
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研究论文 | 利用单细胞测序技术分析从肝硬化到肝细胞癌的基因表达特征 | 首次在单细胞分辨率下分析肝细胞癌和肝硬化组织的转录组比较，并发现了与患者生存率相关的特定基因 | 研究依赖于已发表的单细胞测序数据库，可能限制了结果的全面性 | 深入理解肝细胞癌的分子生物学机制 | 肝细胞癌和肝硬化组织的基因表达特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序技术（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 590 | 2024-08-09 |
Application of Microfluidics in Single-cell Manipulation, Omics and Drug Development
2021, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本文综述了微流控技术在单细胞操作、组学和药物开发中的应用 | 微流控技术为单细胞研究提供了一个灵活、精确的工具，能够揭示细胞异质性并应用于药物开发 | NA | 总结和介绍微流控技术在单细胞分离和操作、单细胞组学以及药物开发中的应用 | 微流控技术在单细胞层面的应用 | 生物技术 | NA | 微流控技术 | NA | 细胞 | NA |
| 591 | 2024-08-09 |
DOCK11 and DENND2A play pivotal roles in the maintenance of hepatitis B virus in host cells
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0246313
PMID:33539396
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了DOCK11和DENND2A在维持HBV在宿主细胞中潜伏状态的关键作用 | 首次发现DOCK11和DENND2A基因在维持HBV潜伏状态中的作用 | 研究仅限于肝细胞系和初级人肝细胞，可能需要进一步在更广泛的细胞类型中验证 | 探究HBV在宿主细胞中维持潜伏状态的机制 | DOCK11和DENND2A基因在HBV感染中的作用 | NA | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 肝细胞系和初级人肝细胞 |
| 592 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals transcriptomic heterogeneity mediated by host-pathogen dynamics in lymphoblastoid cell lines
2021-01-27, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.62586
PMID:33501914
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了五个淋巴母细胞样细胞系的转录组特征，并使用离散时间模拟探索了随机性对细胞克隆进化的影响 | 首次揭示了淋巴母细胞样细胞系中由宿主-病原体动态介导的转录组异质性，并通过模拟展示了初始细胞异质性、随机抽样等因素对细胞群体动态多样性的影响 | NA | 探索淋巴母细胞样细胞系中的转录组异质性及其影响因素 | 淋巴母细胞样细胞系及其转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 五个淋巴母细胞样细胞系 |
| 593 | 2024-08-09 |
Time-course single-cell RNA sequencing reveals transcriptional dynamics and heterogeneity of limbal stem cells derived from human pluripotent stem cells
2021-Jan-23, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-021-00541-4
PMID:33485387
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研究论文 | 本文通过时间进程单细胞RNA测序研究了从人类胚胎干细胞衍生的角膜缘干细胞的转录异质性和表达变化 | 揭示了人类胚胎干细胞衍生的角膜缘干细胞在体外分化过程中的时间进程表达变化和显著的转录异质性，并发现了新的候选标记物 | NA | 探索人类胚胎干细胞衍生的角膜缘干细胞的发育轨迹和身份 | 从人类胚胎干细胞衍生的角膜缘干细胞及其后代细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 594 | 2024-08-09 |
Phenotypically supervised single-cell sequencing parses within-cell-type heterogeneity
2021-Jan-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101991
PMID:33490901
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研究论文 | 本文探讨了在细胞类型内部功能异质性的分子机制，通过使用表型监督的单细胞RNA测序（pheno-scRNAseq）分析，比较了其与无监督scRNAseq在乳腺癌模型中的应用效果 | 提出了一种表型监督的单细胞RNA测序分析方法（pheno-scRNAseq），能够更深入地解析细胞行为异质性 | NA | 揭示细胞类型内部功能异质性的分子机制 | 乳腺癌细胞的侵袭性和非侵袭性细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 595 | 2024-08-09 |
High expression of ACE2 and TMPRSS2 and clinical characteristics of COVID-19 in colorectal cancer patients
2021-Jan-21, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-020-00139-y
PMID:33479506
|
研究论文 | 研究了COVID-19患者中结直肠癌患者的ACE2和TMPRSS2表达模式及其临床特征 | 首次探讨了结直肠癌患者中ACE2和TMPRSS2的高表达及其对COVID-19临床特征的影响 | 需要进一步的机制研究来支持发现 | 探讨结直肠癌患者中ACE2和TMPRSS2的表达模式及COVID-19的临床特征 | 结直肠癌患者中的ACE2和TMPRSS2表达及COVID-19的临床表现 | NA | 结直肠癌 | bulk和单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 |
| 596 | 2024-08-09 |
The BMP signaling gradient is interpreted through concentration thresholds in dorsal-ventral axial patterning
2021-01, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001059
PMID:33481775
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研究论文 | 本文研究了斑马鱼胚胎中BMP信号梯度如何通过浓度阈值转化为背腹轴模式化的不同基因激活 | 本文发现细胞通过响应BMP信号的三种不同活动水平来激活和定位目标基因表达，而不是通过BMP信号梯度斜率或BMP暴露持续时间 | NA | 确定BMP形态发生素在斑马鱼胚胎中的解释机制 | BMP信号如何沿背腹轴解释并转化为不同的基因激活 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 57个直接由BMP信号激活的基因 |
| 597 | 2024-08-09 |
Neuregulin-4 Is Required for Maintaining Soma Size of Pyramidal Neurons in the Motor Cortex
2021 Jan-Feb, eNeuro
IF:2.7Q3
DOI:10.1523/ENEURO.0288-20.2021
PMID:33495243
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研究论文 | 本研究探讨了缺乏neuregulin-4（NRG4）对运动皮层锥体神经元胞体大小的影响 | 首次揭示了NRG4在维持运动皮层锥体神经元胞体大小中的作用，并通过NRG处理恢复了这一表型 | 研究仅限于特定年龄段的小鼠和特定的神经元类型，可能无法全面反映NRG4在所有神经元中的作用 | 研究NRG4在维持运动皮层锥体神经元形态中的作用 | 运动皮层L2/3和L5层的锥体神经元及部分多极中间神经元 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 包括P10、P30和P60的小鼠 |
| 598 | 2024-08-09 |
MUC1-C integrates activation of the IFN-γ pathway with suppression of the tumor immune microenvironment in triple-negative breast cancer
2021-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2020-002115
PMID:33495298
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研究论文 | 本文研究了MUC1-C在三阴性乳腺癌（TNBC）中通过激活免疫抑制性IFN-γ通路及抑制肿瘤免疫微环境的作用。 | 首次揭示了MUC1-C在TNBC中作为主调控因子，通过STAT1和IRF1诱导基因表达，激活免疫抑制性的IFN-γ通路。 | 研究主要基于小鼠模型和人类TNBC细胞系，尚未在临床试验中验证MUC1-C作为治疗靶点的有效性。 | 探讨MUC1-C在TNBC中的免疫逃逸机制及其作为治疗靶点的潜力。 | 三阴性乳腺癌细胞及肿瘤免疫微环境。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA干扰技术（shRNAs）、基因集富集分析（GSEA）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及人类TNBC细胞系和肿瘤样本 |
| 599 | 2024-08-09 |
Mesenchymal stem cell-mediated immunomodulation of recruited mononuclear phagocytes during acute lung injury: a high-dimensional analysis study
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.52514
PMID:33500722
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研究论文 | 本研究调查了急性肺损伤（ALI）中招募的单核吞噬细胞的类型以及同种异体间充质干细胞（MSCs）的免疫治疗效果 | 本研究通过高维分析技术精确识别了八种招募到LPS诱导的肺损伤中的单核吞噬细胞亚群，并揭示了MSCs在ALI中的治疗效果 | NA | 研究急性肺损伤中招募的单核吞噬细胞的功能和间充质干细胞的免疫调节作用 | 小鼠模型中的单核吞噬细胞和间充质干细胞 | NA | 急性肺损伤 | 流式细胞术，质谱细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | C57BL/6小鼠 |
| 600 | 2024-08-09 |
Vitamin D sufficiency enhances differentiation of patient-derived prostate epithelial organoids
2021-Jan-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101974
PMID:33458620
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研究论文 | 研究探讨了维生素D充足对患者来源的前列腺上皮类器官分化的影响 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学验证了维生素D充足通过抑制Wnt信号通路和下调DKK3促进前列腺上皮类器官的生长和分化 | NA | 研究维生素D对前列腺上皮分化的调控作用 | 患者来源的前列腺上皮类器官 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 类器官, 组织切片 | 未具体说明样本数量 |